A degradao dos aminocidos pode ser definida como a remoo do grupo amino e a oxidao da cadeia carbnica remanescente.

Esse grupo amino vai ser convertido a uria e as 20 cadeias carbnicas restantes so convertidas a piruvato, acetil-coa e intermedirios do ciclo de Krebs. O grupo amino da maioria dos aminocidos retirado por um processo que consiste na transferncia deste para o a-cetoglutarato, formando assim o glutamato; a cadeia carbnica vai ser convertida ao respectivo a-cetocido. Essas reaes so catalisadas por transaminases, tambm chamadas de aminotransferases, que so encontradas no citossol e mitocndria. Na grande maioria das vezes o a-cetoglutarato que utilizado como o aceptor do grupo amino. O glutamato portanto, um produto comum s reaes de transaminao, constituindo assim um reservatrio temporrio de grupos amino, provenientes de diferentes aminocidos. O glutamato formado vai ser consumido em duas reaes, uma transaminao e uma desaminao. A nova transaminao s possvel porque as reaes catalisadas pelas transaminases so reversveis. Pela ao da apsparto aminotransferase o grupo amino do glutamato transferido para o oxaloacetato, formando assim o aspartato. O glutamato pode ainda ser desaminado (grupo amino liberado como amnia). A desaminao catalisada pela glutamato desidrogenase.