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Metabolismo.bactéria

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Metabolismo Bacteriano

Produção de Energia e Biossíntese

Estas notas de aula tem por objetivo o direcionamento dos estudos em sala de aula, não substituindo livros sobre o tema. O aluno deve utilizar as fontes bibliográficas indicadas pela professora e registrada no plano de ensino da disciplina de Microbiologia e Imunologia.

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1. Introdução
Diversidade de habitats = Diversidade metabólica

Metabolismo = “Reações bioquímicas que ocorrem na célula, para que ocorra produção de estruturas celulares, crescimento, reprodução, reparar danos, locomoção, armazenar nutrientes,etc.”
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Requerimentos de energia:

2. Tipos de Nutrientes
macronutrientes - carbono, oxigênio, nitrogênio, enxofre, fósforo e hidrogênio micronutrientes - ferro, zinco, manganês , cálcio, potássio, sódio, cobre, cloro, cobalto, molibidênio, selênio, magnésio, etc

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anaeróbias obrigatórias (morrem na presença de oxigênio), anaeróbias facultativas (suportam bem a ausência ou a presença de oxigênio) ou

3. Presença de O no Metabolismo

aeróbias obrigatórias (só sobrevivem se houver oxigênio).

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4. Tipos de reação metabólica:

2 tipos:  aquelas que liberam E = exergônicas ou catabólicas (degradação)
aquelas que utilizam E = endergônicas ou

anabólicas (biossíntese)

Crescimento celular, reprodução, manutenção e movimento

Componentes celulares como proteínas (enzimas), DNA, RNA, carboidratos, lipídeos, etc.

calor

calor
Síntese
Compostos e estruturas

Degradação
E requerida
Sistema de armazenamento e transferência de E

E liberada
Quebra de substratos ou nutrientes

anabolismo
Produtos da degradação servem como unidades para a produção de compostos celulares

catabolismo

Biossíntese

Energia necessária para a síntese de compostos celulares: ácidos nucléicos (DNA, RNA), substâncias nitrogenadas (aa, enzimas, proteínas), carboidratos (peptidoglicano), lipídeos, etc. ATP armazena energia das reações catabólicas e libera para reações anabólicas e também para processos como divisão celular, mobilidade, transporte ativo de nutrientes, etc.

Compostos ricos em energia: armazenamento e transferência de energia (imediata)

ATP = adenosina trifosfato ADP = adenosina difosfato Fosfoenolpiruvato Glicose-6-fosfato

Coenzimas: Acetil CoA, NAD, NADH, NADPH

Armazenamento de energia

ADP

Ligacoes tioéster

Compostos ricos em energia: armazenamento e transferência de energia (a longo prazo)

Procariotos:
 Glicogenio  Poli-β-hidroxibutirato

 Poli-idroxialcanoatos
 S (elementar)

Eucariotos
 Poliglicose na forma de amido  Lipídeos na forma de gorduras

5.Tipos de energia utilizada
 Energia

química – energia contida em ligações químicas das moléculas radiante (energia da luz) – deve ser convertida em energia química

 Energia

Energia = capacidade de realizar trabalho

Classificação dos microrganismos de acordo com a fonte de energia e carbono

Classificação dos microrganismos de acordo com a fonte de energia e carbono

6. Enzimas
•São catalisadores das reações • Aumentam as velocidades de reação de 108 a 1020 vezes • Tem sítios ativos de ligação do substrato do tipo chave-fechadura • Terminação ase ao seu substrato • Celulase: degradam celulose • Glicose-oxidase: catalisa a oxidação da glicose • Ribonuclease: decompõe acido ribonucleico • Lisozima: cliva o peptideoglicano •Reação ocorre mais rápido com menos energia de ativação

enzimas
Energia de ativação = energia necessária para que a reação comece, como o calor

Enzimas são catalisadores biológicos que diminuem a energia de ativação necessária para que a reação aconteça

NAD+ e NADP = apoenzima FAD e FMN, CoA = coenzima

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COMPLEXO ENZIMA-SUBSTRATO

Maior parte > 50ºC desnatura

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Inibição por competição ou alteração do sítio ativo penicilina atua na enzima que participa da formação da parede celular Sulafanilamida age na enzima do metabolismo da substãncia PABA  venenos enzimáticos: Cianeto, arsênio e mercúrio

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As reações de oxi-redução (redox) Oxidação Redução
E liberado toda de uma vez danifica a célula, para armazenar passam elétron de um composto para outro. Um composto se torna oxidado quando: •Perde elétrons Um composto se torna reduzido quando: •Ganha elétrons Ex: C6H12O6 altamente energético

RESPIRAÇÃ O
C6H12O6 + 6O2→ 6CO2 + 6H2O + energia

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RESPIRAÇÃ O
1) Glicose (6C) Oxida em Ácido Pirúvico (3C) 2) ciclo de Krebs • Tranf. Ac. Cítrico (6C) em • ac. Oxalacético (4C) • Oxidação libera CO2 • NADH e FADH reduz produzindo ATP

3C

2C

3) Cadeia de elétrons – aceptor final O2 ou compostos inorgânicos (nitrato, sulfato)
Enzima que atua na respiração são as desidrogenases (retiram H) que tem como coenzimas as NAD e FAD

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FERMENTAÇÃO

C6H12O6 → 2CO2 + 2C2H5OH + energia

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FERMENTAÇÃO

reduz

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Os principais tipos são: - Fermentação Alcoólica: e realizado principalmente em bactérias e leveduras( fungos microscópicos) e são utilizados na indústria para produção de vinhos e cerveja - Fermentação Láctica: é realizada por algumas bactérias, alguns protozoários e fungos e por células do tecido muscular humano. são utilizados na indústria para a produção de vários alimentos como queijos, coalhadas e iogurtes.
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Matéria extra pra aprofundamento

1ª etapa: Piruvato (via glicolítica)
É considerada a via metabólica mais primitiva, presente em todas as formas de vida atuais. Ocorre no citoplasma das células.

Características: 1. Oxidação parcial da glicose a piruvato 2. Pequena quantidade de ATP é gerada (produção líquida de 2 ATP) 3. Pequena quantidade de NAD é reduzida a NADH

2ª etapa: Ciclo de Krebs
Ocorre no citoplasma (procariotos) e nas mitocôndrias (eucariotos).

Reações preparatórias: formação de composto chave do processo

Produção direta de 1 GTP guanosina trifosfato (equivalente ao ATP)

Além do papel-chave nas reações catabólicas, é importante nas reações biossintéticas. Os intermediários são desviados para vias biossintéticas quando necessário:

Exemplos: Oxalacetato: precursor de aminoácidos Succinil-CoA: formação de citocromos e da clorofila, entre outros Acetil-CoA: biossíntese de ácidos graxos

3ª etapa: Cadeia respiratória (sistema de transporte de elétrons)
Ocorre ao nível da membrana das mitocôndrias (eucariotos) e na membrana citoplasmática (procariotos)

Os prótons e elétrons recolhidos na glicólise pelo NAD e no Ciclo de Krebs pelo NAD e FAD são transportados ao longo de uma cadeia de citocromos em níveis sucessivamente mais baixos de energia de modo que seja melhor aproveitada na formação de ATP.

Fosforilação oxidativa
Geração da força protomotiva

As 3 etapas da via respiratória

Síntese da respiração aeróbia
• • • •

Reações de oxidação e redução em presença de um aceptor de elétrons externo, o O2 A molécula inteira do substrato é oxidada até CO2 Alto potencial de energia Grande quantidade de ATP pode ser gerada: teoricamente até 38 ATPs

Produção de ATP:

Na cadeia respiratória:
4 NADH formados na glicólise geram 6 NADH formados no ciclo de Krebs geram 2 FADH formados no ciclo de Krebs geram Formação direta na Glicólise Formação direta no Ciclo de Krebs 12 ATP 18 ATP 4 ATP 2 ATP 2 GTP

Total de até .................................................... 38 ATP

1b) Respiração anaeróbia

 É uma variação alternativa da respiração aeróbia: o aceptor de elétrons não é o
oxigênio. • Uma implicação é o rendimento energético inferior: nenhum aceptor alternativo apresenta potencial tão oxidante quanto O2. • • O uso de aceptores alternativos permitem os microrganismos respirarem em ambientes sem oxigênio, sendo de extrema importância ecológica. Oxidação de substratos orgânicos ou inorgânicos:

C6H12O6 + 12 NO3-  6CO2 + 6H2O + 12NO22 lactato + SO4= + 4H+  2 acetato + 2CO2 + S= + H2O • Quantidade de energia produzida é menor

2. Fermentação (também é uma forma de respiração anaeróbia. Ocorre no citossol)
Reação de oxidação-redução internamente balanceada. Ausência de aceptores externos.

A concentração de NAD+ nas células é baixo, precisando ser reoxidado para não cessar a via glicolítica. A redução do piruvato a etanol ou outros produtos restabelece o NAD e permite a continuidade da glicólise .

Produção líquida de apenas
2 ATP.

Características da Fermentação:

 Ácido pirúvico é reduzido a ácidos orgânicos e álcoois  NADH é oxidado a forma NAD: essencial para operação continuada da via glicolítica

 O2 não é necessário
 Não há obtenção adicional de ATP.

 Gases (CO2 e/ou H2) podem ser produzidos

Produtos da fermentação
Espécie microbiana Principal produto da fermentação

Acetivibrio cellulolyticus
Actinomyces bovis

Ácido acético
Ácidos acético, fórmico, láctico, etc.

Clostridium acetobutylicum Acetona, butanol, etanol, ácido fórmico, etc. Enterobacter aerogenes Escherichia coli Lactobacillus brevis Streptococcus lactis Succinimonas amylolytica Etanol, ácido fórmico, CO2, etc. Etanol, ácidos láctico, acético, fórmico, succínico, etc. Etanol, glicerol, CO2, ácidos láctico, acético, etc. Ácido láctico Ácidos acético e succínico

Fototropia
A utilização da energia da luz - Fotossíntese

a) Fotossíntese oxigênica

Presente nas cianobactérias e nos cloroplastos dos

Cloroplasto de eucariotos

eucariontes (algas por ex.)
Doador de elétrons é H2O: sua oxidação gera o O2
 

Dois fotossistemas: PSI e PSII Maior função é produzir ATP e NADPH para a

fixação de carbono.

Cianobactérias
Fotossistemas em lamelas

Fotossíntese oxigênica

Cianobactérias

Fotofosforilação
A energia da luz é utilizada para a síntese de ATP

O NADPH é utilizado para reduzir o CO2 no processo de fixação do carbono

b) Fotossíntese anoxigênica

Doadores de elétrons variam:  H2S or So nas bactérias verdes e púrpuras sulfurosas  H2 ou compostos orgânicos em bactérias verdes e púrpuras não sulfurosas Apenas um fotossistema  Bactérias verdes tem foto-sistema semelhante ao PSI  Bactérias púrpuras tem foto-sistema semelhante ao PSII Principal função é produzir ATP via fotofosforilação

Biossíntese de Compostos Nitrogenados
N2 N inorgânico (NH3+)

Aminoácidos

Arranjo de aminoácidos

Proteínas/enzimas

Purinas e pirimidinas Nucleotídeos

Ácidos nucléicos (DNA, RNA)

Fornecimento de precursores de aminoácidos

(Madigan et al., 2004)

Biossíntese de nucleotídeos e ácidos nucléicos
 Nucleotídeo = base nitrogenada-pentose-fosfato

ribose = ribonucleotídeos (RNA)

desoxirribose = desoxirribonucleotídeos (DNA)
 Ativação dos nucleotídeos (ATP)  Síntese de ácidos nucléicos a partir de nucleotídeos ativados

Biossíntese de nucleotídeos e ácidos nucléicos

(Madigan et al., 2004)

Biossíntese de carboidratos
CO2

Triose

Pentoses e hexoses

Nucleotídeos

(peptidoglicano, celulose, amido, etc.)

Polissacarídeos

RNA e DNA

Biossíntese de ácidos graxos
Glicose Glicólise Ácido pirúvico

Acetil CoA e Malonil CoA

Ácidos graxos de cadeia longa

Fosfolipídios

Glicerol fosfato

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