ALIRAN INFORMASI PD BAKTERI

Apakah unit fungsional informasi yang dialirkan secara turun temurun pada makhluk hidup? Bagaimana aliran informasi tsb terjadi?

Proses makromolekul apa saja yang terlibat dalam aliran informasi? Adakah perbedaan makromolekul yang terlibat pada proses aliran informasi antara sel Eukariot dan Bakteri?

STRUKTUR DASAR SEL BAKTERI

SUBSTANSI MAKROMOLEKUL DALAM SITOPLASMA BAKTERI

DNA SIRKULER PLASMID RNA DAN RIBOSOME (20.000 PER SEL) GLIKOGEN POLIMER METAFOSFAT LIPID

Genom Bakteri

KROMOSOM
Molekol DNA tunggal (haploid) sirkuler panjang + 1 mm berat 2-3% berat kering satu sel tersusun 4.000.000 kpb DNA bentuk superkoil

PLASMID
Ekstra kromosomal, Berat 1-3% dp kromosom tersusun + 100 kpb Bebas dlm sitoplasma Dpt berpindah dari satu sp -> sp Dapat mereplikasi sendiri Jumlah 30 atau lebih

GEN BAKTERI

Plasmid

PLASMID

PERBEDAAN MATERI GENETIK pada ORGANISME

Eukaryotik (Komposit)

Sel
Kromosom
Inti Sel

Prokaryota

Kromosom
Mitokondria

Plasmid

Plasmid
(fungi dan protozoa)

Virus
Extrachromosomal DNA
Kloroplas

DNA RNA

Copyright The McGraw-Hill Companies, Inc. Permission required for reproduction or display.

GEN
Tiga Kategori
Struktural Pengaturan (Regulasi) Pengkode RNA

Phenotype
Ekspresi dari genotipe

Genotype
Kumpulan semua tipe Gen.

DNA
Struktur kimia

- Pyrimidin (T = tymin, C = cytosin)

Terdiri 3 komponen dasar: (deoksiribosa, pospat dan basa N)

- purin (G = guanin, A = adenin)

Basa N

ALIRAN INFORMASI PADA BAKTERI

Dibagi 3 tahap:
REPLIKASI TRANSKRIPSI TRANSLASI

DOGMA SENTRAL
replikasi

DNA
reverse transkripsi

RNA
translasi

PROTEIN

TAHAPAN TRANSKRIPSI

Pengenalan promotor
Inisiasi

Elongasi
Terminasi

Pada Escherichia coli

hanya 1 tipe mRNA, tRNA dan rRNA

7000 molekul RNA polimerase Holoenzim, 480KDa
Terdiri dari 2 inisiasi 2 core-enzim elongasi

Macam faktor sigma E. coli

Pengenalan Promotor

Start poin Upstream start point

Daerah terkonservasi

Terminasi

T rho

independent

T rho dependent

Sintesis Protein Eukaryota vs Prokariot

RESUME PERBEDAAN

EUKARIOT
REPLIKASI TRANSKRIPSI Inisiasi

PROKARIOT
ds DNA ds DNA Lac (buble transkripsi) RNA polimerase = faktor sigma ( )

Elongasi

transkripsi 1 gen --------- 2,5 + 0,5 mRNA protein

Terminasi

RESUME PERBEDAAN

EUKARIOT
RIBOSOM 80S (SVEDBERG) 40S dan 60S tRNA INISIASI metionin Proses translasi Eritrosit, 2 a amino/detik

PROKARIOT
RIBOSOM 70S 30S dan 50S tRNA INISIASI formyl metionin =mitokondria Proses translasi Bakteri pd suhu 37oC, 300 aa/20detik ( 15 aa/detik)

RESUME PERBEDAAN

EUKARIOT
Translasi Start : Metionin Mitokondria, dan kloroplast 70 S

PROKARIOT
Formil metionin Polisom : 10 ribosom

REKOMBINASI
Pemindahan atau penggabungan bagian dari genom

Konjugasi

Transformasi

Transduksi

Transposisi

peleburan materi inti antara 2 bakteri melalui kontak fisik.

perpindahan DNA telanjang

perpindahan DNA melalui virus (phage).

loncatan sebagian kecil DNA (transposon) dari lokasi genom dan di antara plasmid. Disebut juga "jumping genes."

KONJUGASI
Pemindahan DNA plasmid sel F+ (F factor) ke sel F-

Bakteri F+ membentuk fila atau penguhubung (pilus) Pilus menempel pada sel penerima dan membentuk pori di dalamnya untuk transfer DNA

KONJUGASI

KONJUGASI

KONJUGASI

TRANSFORMASI
Diterimanya DNA bebas oleh sel secara nonspesifik (misal fragmen DNA, plasmids)

DNA dapat menyisip pada kromosom

Sel Competent dapat dengan mudah menerima DNA

TRANSFORMASI

TRANSDUKSI
Bakteriofage yang menginfeksi sel
Pemindahan material genetik dari sel donor (pemberi) ke sel resipien (penerima)

TRANSPOSON
Gen Loncat / Element Loncat
Terdapat di dalam plasmid dan kromosom Mengandung gen yang mengkode enzim untuk memindahkan dan menintegrasikan transposon Transposon kecil disebut sebagai insertion elements

Perpindahan transposon dapat terjadi dalam plasmid dan kromosom

PENGHAMBAT SINTESIS PROTEIN OLEH ANTIBIOTIK

Rifampisin : mengikat pada enzim transcriptase bakteri dan menghambat mRNA Eritromisin dan Azitromisin : mengikat pada ribosome bakteri, dan menghambat pelekatan pada mRNA. Tetrasiklin : mengikat pada ribosome bakteri, dan menghambat translasi mRNA