Noes de biologia molecular

mcarazzo@lge.ibi.unicamp.br Marcelo Falsarella Carazzolle

23/07/2012

Watson and Crick: molecular structure of nucleic acids (Nature 737, 4356 (1953))

Como DN arma!ena e transfere a informa"#o $

Quantidade de informao numa molcula de DNA formada por n nucleotdeos = 4n

http://www.nature.com/scitable/topicpage/discovery-of-dna-structure-and-function-watson-397

%ransfer&ncia da informa"#o ' re(lica"#o

Filme replicao

)strutura do *ene

campo1-campo2-campo3-... <inicio>campo1</inicio> <inicio>campo2</inicio> <inicio>campo3</inicio>

)strutura do *ene: (rocariotos

Do*ma central da +iolo*ia molecular

%radu"#o do c,di*o *en-tico

.a/uinaria de tradu"#o

Filme traduo

Conceito de 012 (0(en 1ead 2rame)

Tamanho mnimo das ORFs =>

~7 x 10-5
para L=50aa

)strutura do *ene: eucariotos

3(licin* alternati4o

fun"#o das (rote5nas est6 na estrutura tridimensional

Protenas so caracterizadas de acordo com a sua funo: enzimas, transporte, estrutural, regulatrias, ...

.eta+olismo

.eta+olismo com(leto

.ani(ulando o DN

Ligase, enzima que liga o DNA

Endonuclease, enzima que corta o DNA em stios especficos

7nserindo *enes em outros or*anismos

1atos fluorescentes

Diferentes omicas

8en9mica

%ranscri(t9mica

)strat-*ias de se/uenciamento
- DNA Shotgun de genoma inteiro Shotgun em pedaos do genoma clonados em BACs - cDNA mRNA oriundos de diferentes tecidos ou condies

Diferen"as entre as metodolo*ias

- Sequenciamento de DNA, feito de forma aleatria, fornece :

- Informaes sobre regies codantes (genes) e promotores. - Mas gera sequncias em regies inter-gnicas (a princpio sem nenhuma funo) - Sequenciamento de mRNA fornece : - Informao direta sobre os genes e tambm sobre a expresso gnica. - Mas genes pouco expressos so mais raros de serem sequenciados por essa tcnica - A situao ideal para um projeto genoma sequenciar ambos DNA e mRNA

3:ot*un do *enoma inteiro

DNA genmico Quebrar em pedaos aleatrios ~2000pb (shotgun)

sequenciamento

1econstru"#o do DN ori*inal (or so+re(osi"#o (clusteri!a"#o)

reads Sequncia consensu (DNA original)

A reconstruo feita a partir de sobreposio dos fragmentos

7dentificando os *enes no *enoma

FIM