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David,
D id L.
L Nelson,
N l Mi h l M.
Michael M Cox.
C Lehninger
L h i P i i l off
Principles
Biochemistry. 2000. Third Edition. Worth Publishers.
ALTO GRADO DE ESPECIFICIDAD Y EFICIENCIA
ENZIMAS. Características
I. ALTA ESPICIFICIDAD.
• Especificidad de sustrato. El sustrato (S) es la
molécula sobre la que la enzima ejerce su acción
catalítica.
• Especificidad
p de acción. Cada reacción está
catalizada por una enzima específica.
I
I. ALTA EFICIENCIA
Las enzimas aceleran las reacciones multiplicando su
velocidad por un millón de veces e incluso más.
más
Carboxipeptidasa A –9 578 11
3,0 X 10 1,9X 10
AMP nucleosidasa –11
11 60 12
1 0 X 10
1,0 6 0 X 10
6,0
La disponibilidad
p de catalizadores ppoderosos
específicos para cada reacción hace posible la
sinfonía compleja que llamamos vida.
ENZIMAS PM entre 12.000 y un millón.
Iones inorgánicos
COFACTOR M lé l orgánica
Molécula á i = Coenzima
C i
Apoenzima:
p Parte pprotéica de una enzima sin su coenzima u iones
SITIO ACTIVO
Sustrato (S)
I. Ajuste inducido
T , 1atm ⎡ H + ⎤ ≠ 1M , o, pH ≅ 7,0
⎢⎣ ⎥⎦
E =q+w
}−
+
ΔE = E final − Einicial
H = q p =cte
La primera ley de la termodinámica no puede usarse para predecir
Si una reacción ocurre espontáneamente
p
}−
+ Endotérmico
ΔH = H final − H inicial Exotérmico
Segunda ley de la termodinámica
Un proceso tiene lugar espontaneámente si aumenta la suma de la
entropía
p del sistema y de su entorno.
(ΔS sistema − ΔSentorno )〉 0, espontáneo
La entropía
L í es una medida
did del
d l grado
d de
d desorden
d d . Positiva
P i i cuando
d
aumenta el desorden.
Energía
g libre de Gibbs ((G):
)
ΔG = ΔH − T ΔS
El cambio de volumen es pequeño de manera que
ΔH = ΔE + PΔV
ΔG ≅ ΔE − T ΔS
ΔH = ΔE
ΔG = G productos − Greactivos
+ La reacción no ocurre.
ΔG = - La reacción puede ocurrir espontáneamente.
0 La reacción esta en el equilibrio.
El cambio de energía
g libre estándar de una reacción está directamente
relacionado con la constante de equilibrio
+ La reacción no ocurre.
ΔG = - La reacción puede ocurrir espontáneamente.
0 La reacción esta en el equilibrio.
q
A+ B R C + D
[C ][ D]
ΔG = ΔG '0 + RT ln
[ A][ B]
[C ][ D]
0 = ΔG + RT ln
'0
[ A][ B]
El cambio de energía
g libre estándar de una reacción está directamente
relacionado con la constante de equilibrio
ΔG = − RT ln K
0 '
eq
ΔG ' = −2,303
0
2 303RT log K '
eq
−3
R = 1,98
1 98 x10 kcal / mol , T = 298 K
−ΔG ' 0 /(1,336)
K = 10
'
eq
( )
ΔG = ΔG + RT ln
'0 [C ][ D]
[ A][ B]
CATÁLISIS
Á Á
ÁCIDO - BÁSICA
Á
34
CATÁLISIS ION METAL
Los iones metálicos desempeñan un papel en la catálisis
estabilizando cargas negativas.
k1 k2
E+S ES E+P
k −1 k−2
Turnover Number. The h rate constant (First
( i order)) for
f the
h
breakdown of the [ES] complex, kcat (k2), is also known as the
number that is the maximum number of substrate
turnover number,
molecules processed/active site (moles substrate/mole active site):
kcat=Vmax / [E]total.
[ ]
EFECTO DE LA CONCENTRACIÓN DE SUSTRATO
1 E+S
k1
ES
k2
E+P
Vmáx
2 k −1 k−2
V0 = k 2 [ES ]
Velocid
Vmáx [S ]
V0 =
k máx + [S ]
La relación entre la [S ] y V0 puede ser representada por la ecuación
d Michaelis-Menten.
de Mi h li M t E Esta
t ecuación
ió fue
f derivada
d i d partiendo
ti d ded la
l
hipótesis que el paso limitante en las reacciones enzimáticas es la
ruptura del complejo ES a P y E libre.
k1 k2
E+S ES E+P
k −1 k−2
45
TRANSFORMACIONES DE LA ECUACIÓN DE
MICHAELIS-MENTEN
Vmáx [S ]
V0 =
K m + [S ]
1 K m + [S ]
=
V0 Vmáx [S ]
1
=
Km
+
[S]
V0 Vmáx [S ] Vmáx [S ] 48
EXPRESIÓN CUANTITATIVA DE LA RELACIÓN ENTRE
CONCENTRACIÓN DE SUSTRATO Y VELOCIDAD
DE REACCIÓN
Vmáx [S ] V0 = Vmáx
V0 = [ES ]
Km
Estado estacionario
µM/min))
1
Vmáx Vmáx [S ] Un aumento en
2 V0 = la [S ] no afecta
Vo ( µ
k máx + [S ] la velocidad de
la reacción.
reacción
Km [S ]((mM )
Km = [S ] en la que V 0 es 1 Vmáx 49
2
ANÁLISIS DE LA CONSTANTE DE MICHAELIS
MICHAELIS-
MENTEN
Km
1
[S ], en la que V0 = Vmáx
2
k2 + k−1
Km =
k1 Medida de la disociación de ES
k−1
Si k2 <<<< k−1 ⇒ K m = = Kd
k1
ANÁLISIS DE LA VELOCIDAD MÁXIMA
Vmax
V max= k2 [Et ] kcat = k2
kcat [Et ][S ]
V0 =
K m + [S ]
k1 k2 k3
E+S ES EP E+P
k −1 k−2
K catt = Vmáx
á / Etotal
t t l
Regulación de la actividad enzimática
La inhibición de la actividad
enzimática
i á i por moléculas
lé l
específicas pequeñas y por iones es
importante porque constituye el
principal mecanismo de control en
los sistemas biológicos.
Muchos
M h fá fármacos y agentes tóxicos
ó i
actúan inhibiendo a las enzimas.
58
INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
Competitivos
1
1. INHIBIDORES REVERSIBLES No competitivos
Acompetitivos
2. INHIBIDORES IRREVERSIBLES 59
Inhibición enzimática
• No competitiva:
N titi El I se fija
fij a la
l enzima
i en un sitio
iti de
d la
l
molécula diferente al sitio activo.
Una tterapia
U i médica
édi basada
b d en ell conocimiento
i i t deld l mecanismo
i
de inhibición competitiva es el tratamiento de la intoxicación
con metanol.
Al h l ddeshidrogenasa
Alcohol hid + Metanol
M l F
Formaldehído
ld híd
CEGUERA
Alcohol deshidrogenasa
g + Etanol Acetaldehído
66
1 ⎛ Km ⎞ 1 α'
= ⎜⎜ ⎟⎟ +
V0 ⎝ Vmáx ⎠ [S ] Vmáx
INHIBICIÓN NO COMPETITIVA
E+S ES E+P
+
I
'
kI
ESI
'
k I es la constante de enlazamiento del inhibidor al complejo
p j ES.
71
Vmáx
Competitivo Acompetitivo Mezclado No competitivo
Proteólisis: zimógenos (pepsinógeno, quimotripsinógeno,
tripsinógeno)
ENZIMAS SENCILLAS tienen un sitio activo
La conversión de L-treonina a
L-isoleucina es catalizada por una secuencia
d enzimas
de i (E1 a E5).
E5)