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APLICACIONES EXITOSAS DEL DISEO DE FRMACO UTILIZANDO MTODOS

COMPUTACIONALES.

Los frmacos actan produciendo cambios en algn proceso o funcin
fisiolgica. Cuando se realiza la investigacin de nuevos frmacos o existentes
modificados, primero se recopila toda la informacin posible sobre todos los
procesos biolgicos asociados a la enfermedad bajo estudio. Al uso de la
informacin estructural del blanco molecular para disear frmacos se le llama
diseo de frmacos basado en la estructura del receptor. Los programas
computacionales permiten no solamente visualizar las estructuras de
macromolculas sino tambin hacer clculos tericos y predicciones de la
afinidad que tendr una molcula. Uno de los aspectos ms importantes del
diseo basado en la estructura del receptor busca mejorar las interacciones que
ocurren entre una molcula y su blanco molecular. Con este propsito se recurre
a uno de los mtodos computacionales ms usados en este campo
acoplamiento molecular automatizado. Este mtodo consiste en calcular con
la computadora cul es la posicin ms favorable que tendra una molcula con
el blanco molecular. A partir del resultado se proponen modificaciones a la
estructura de la molcula. Otros aspectos del diseo basado en la estructura del
receptor es disear, desde cero, una molcula que tendr interacciones
favorables con el blanco molecular. En diversas ocasiones los clculos
computacionales han tenido un papel muy importante en la investigacin de
molculas que se unen a estos blancos y que actualmente se encuentran en uso
clnico. Por ejemplo, el diseo de frmacos asistido por computadora ya ha
tenido contribuciones notables en el tratamiento del sndrome de la
inmunodeficiencia adquirida. Las computadoras se han convertido en una
poderosa herramienta para generar modelos de frmacos interactuando con
biomolculas. Estos modelos ayudan a entender el mecanismo de accin de los
frmacos, proponer modificaciones para mejorar su efecto teraputico y disear
nuevas molculas.

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