Analisis de Componentes Pples Biología

ANLISIS DE COMPONENTES PRINCIPALES
Qu es el Anlisis de componentes principales (ACP)?

Es una tcnica estadstica multivariada cuyo objetivo es el anlisis de la informacin contenida en una tabla
del tipo Xn, k, donde:
n: son las filas (individuos).
k: son las columnas (variables de tipo cuantitativo).
xi, j: valor para el individuo i de la variable j.
Las variables de tipo cuantitativo son aquellas que se miden, tal como el peso, la talla, el nmero de
individuos, etc.
Individuo
1
2
3
.
.
.
V1
X11
X21
X31
.
.
.
V2
X12
X22
X32
.
.
.
.
.
.
Vk
X1k
X2k
X3k
.
.
.
Xn1
Xn2
Xnk
Media
x.1
x.2
x.k
DesvEst
s.1
s.2
s.k
Qu se busca con un anlisis de componentes principales (ACP)?

1.
2.
Evaluar la semejanza de los individuos a travs de las variables consideradas.

Existen tipos de individuos semejantes?
Se observa una tipologa de individuos?
Evaluar la relacin existente entre las variables
Existen grupos de variables correlacionadas?
Se observa una tipologa de variables?
Introduccin al ACP.
Inicialmente se pretende entender el concepto de anlisis multivariado, para ello se plantea el siguiente
ejercicio:
Ejercicio 1.
a)
Se desea conocer qu individuos son ms semejantes entre ellos, de acuerdo a la variable Edad. Para lo
que se dispone de la tabla 1:
Tabla 1. Edad (aos)

Individuo Pedro Juan Mara Gonzalo Luca Gloria Ins lvaro Eduardo Hernando Anita Mariana David Pablo
Edad
(aos)
20
15
18
17
29
58
59
55
15
53
23
24
28
29
Se observa que Eduardo y Pedro son ms parecidos en cuanto a la edad, que Pedro y Luca (figura 1).
15
17 18
20
23 24
28 29
53
Edad (aos)
Eduardo
Pedro
Hernando
Luca
Figura 1. Edad
En este caso la relacin entre los individuos se determin a travs de una lnea recta (espacio R 1).
b) Si desea conocer qu individuos son ms semejantes entre ellos, de acuerdo a las variables Edad (aos) y
Estatura (cm): tabla 2.
Tabla 2. Edad (aos) y Estatura (cm)

Individ Pedro Juan Mara Gonzalo Luca Gloria Ins lvaro Eduard Hernand Anita Marian David Pablo
Edad
Estatura
20
170
15
160
18
181
17
145
29
160
58
156
59
172
55
186
15
175
53
178
23
157
24
160
28
169
29
170
Es claro que Mara y Eduardo son ms parecidos en cuanto a la edad y a la estatura, que Mara e Ins
(figura 2).
200
190
Mara
180
Eduardo
Ins
Estatura (cm)
170
160
150
140
130
120
110
100
0
10
20
30
40
Edad (aos)
50
60
70
Figura 2. Edad (aos) vs. Estatura (cm)

La relacin entre los individuos se determin a travs de un plano (espacio R 2).
c)
Se desea conocer qu individuos son ms semejantes entre ellos, de acuerdo a las variables Edad (aos),
Peso (kg) y Estatura (cm): Tabla 3.
Tabla 3. Edad (aos), Estatura (cm) y Peso (kg)

Individ Pedro Juan Mara Gonzalo Luca Gloria Ins lvaro Eduard Hernand Anita Marian David Pablo
20
15
18
17
29
58
59
55
15
53
23
24
28
29
Edad
145
160
156 172 186
175
178
157
160
169
170
Estatura 170 160 181
63
65
71
51
55
54
71
81
78
90
61
64
75
68
Peso
NOMBRE
Anita
David
Eduardo
Gloria
Gonzalo
65
Hernando
EDAD
55
Ins
45
Juan
35
Luca
25
15
51
61
71
PESO
81
91
190
180
170
160
150
140 ESTAT
Mariana
Mara
Pablo
Pedro
lvaro
Figura 3. Edad, Peso y Estatura

La relacin entre los individuos se determina a travs de un espacio en R 3, y se observa por ejemplo que Anita
y Luca son ms parecidos en cuanto a la edad, peso y estatura, que Juan e Ins (figura 3).
d) Qu ocurre cuando se desea conocer la cercana entre individuos o la correlacin entre variables y se tiene
k de estas ltimas, k > 3?
Note en la figura 3 que si tomsemos una fotografa del plano edad vs estatura, Ins, lvaro y Hernando
apareceran muy cercanos, pero si tal fotografa fuera del plano peso vs. edad, se hace evidente que Ins y
lvaro no son tan similares en estas variables, como Hernando y lvaro.
Se recomienda entonces, acudir al ACP, para encontrar la mejor fotografa o fotografas en R 2, que
permitan analizar en la prctica tales cercanas o correlaciones.
Despus de tener la matriz de individuos y variables cuantitativas, Qu sigue?
Se obtienen los valores y vectores propios de la matriz de correlaciones; posteriormente, al graficar los
vectores propios, se llega al grafico de sedimentacin o al histograma de valores propios (figuras 4 y 5), los
que permiten seleccionar aquellos valores propios mayores a la unidad, en este caso nicamente el primero
(pero dejaremos los dos primeros para al menos tener un plano xy).
Tales valores propios explican el 94.97% de la variacin total de los datos y generan dos vectores propios
(factores) que producen un plano xy.
En el histograma de valores propios se analiza la tendencia de tal histograma para seleccionar el nmero de
valores propios a retener.
Scree Plot
Eigenvalue
2.4
2
1.6
1.2
0.8
0.4
0
0
0.5
1.5
2.5
Component
Figura 4. Grfico de sedimentacin
VALEURS PROPRES
APERCU DE LA PRECISION DES CALCULS : TRACE AVANT DIAGONALISATION ..
3.0000
SOMME DES VALEURS PROPRES ....
3.0000
HISTOGRAMME DES 3 PREMIERES VALEURS PROPRES
+--------+------------+----------+----------+---------------------------------------------------------------------------------| NUMERO |
VALEUR
| POURCENT.| POURCENT.|
|
|
PROPRE
|
| CUMULE |
+--------+------------+----------+----------+---------------------------------------------------------------------------------|
1
|
2.0295
|
67.65 |
67.65 | ********************************************************************************
|
2
|
0.8196
|
27.32 |
94.97 | *********************************
|
3
|
0.1509
|
5.03 | 100.00 | ******
+--------+------------+----------+----------+----------------------------------------------------------------------------------
Figura 5. Histograma de valores propios
Los 3 valores propios se asocian a 3 vectores propios, los que generan el nuevo sistema (xyz) donde se ubican
los puntos individuos y variables (figura 6).
COORDONNEES DES VARIABLES SUR LES AXES 1 A 3

VARIABLES ACTIVES
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+----------------------------VARIABLES
|
COORDONNEES
| CORRELATIONS VARIABLE-FACTEUR |
ANCIENS AXES UNITAIRES
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+----------------------------IDEN - LIBELLE COURT
|
1
2
3
0
0
|
1
2
3
0
0 |
1
2
3
0
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+----------------------------EDAD - edad
- 0.55
0.84
PESO - peso
-0.93
- 0.25
ESTA - estat
-0.93
-0.25
0.00
0.00
0.00 | -0.55
0.84
0.00
0.00
0.00 | -0.39
0.92
0.00
0.00
0.27
0.00
0.00 | -0.93 -0.25
0.27
0.00
0.00 | -0.65 -0.27
0.71
0.00
- 0.27
0.00
0.00 | -0.93 -0.25 -0.27
0.00
0.00 | -0.65 -0.27 -0.71
0.00
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+-----------------------------
Vectores propios
Figura 6. Coordenadas de las variables en el nuevo sistema coordenado
La figura 6 permite:
a) Definir los 3 componentes principales (factores) que son:
C1 =
0.38614*EDAD +
0.652431*PESO+
0.652096*TALLA
C2 =
-0.92244*EDAD+
0.271918*PESO+
0.274166*TALLA
C3 =
0.001558*EDAD
-0.70739*PESO+
0.706826*TALLA
La media de los componentes es cero, sus varianzas son los autovalores y no son correlacionados.
b) Establecer las coordenadas de los individuos en el nuevo sistema coordenado:
Al reemplazar Edad (X), Peso (Y) y Talla (Z), por los valores de las variables en la matriz centrada y
estandarizada, obtenemos las coordenadas de cada individuo en el nuevo sistema de ejes (figuras 7, 8 y 9 y
tabla 4).
Tabla 4. Coordenadas de los individuos en el nuevo sistema de coordenadas

Individuo
Pedro
Juan
Mara Gonzal Luca
Gloria
Ins
Coordenad
Compon 1
-0,37
-0,95
0,70
-2,60
Coordenad
Compon 2
0,59
0,67
1,17
Coordenad
Compon 3
0,48
-0,28
0,66
lvaro Eduard Hernan Anita Marian David
Pablo
-1,22
-0,85
1,11
2,43
0,69
2,45
-1,18
-0,80
0,47
0,13
-0,15
-0,34
-2,05
-1,29
-0,49
1,36
-0,35
0,06
0,16
0,43
0,22
-0,32
0,37
0,18
0,10
0,33
-0,17
-0,75
-0,21
-0,21
-0,35
0,16
PCOMP_3
NOMBRE
Anita
Plot of PCOMP_3 vs PCOMP_1 and PCOMP_2
David
Eduardo
Gloria
Gonzalo
0.7
Hernando
0.4
Ins
0.1
Juan
Luca
-0.2
Mariana
-0.5
1.9
Mara
0.9
-0.8
-0.1
Pablo
-1.1
-2.7 -1.7 -0.7
0.3 1.3 2.3 3.3 -2.1 PCOMP_2
Pedro
PCOMP_1
lvaro
Figura 7. Representacin de los puntos individuos en el espacio de componentes
Plot of PCOMP_2 vs PCOMP_1
PCOMP_2
1.9
Eduardo
Mara
0.9
Juan
Pedro
David
Gonzalo
Anita
-0.1
Mariana
Pablo
Hernando
Luca
Alvaro
-1.1
Ins
Gloria
-2.1
-2.7
-1.7
-0.7
0.3
1.3
PCOMP_1
2.3
3.3
NOMBRE
Anita
David
Eduardo
Gloria
Gonzalo
Hernando
Ins
Juan
Luca
Mariana
Mara
Pablo
Pedro
lvaro
Figura 8. Representacin de los puntos individuos en el espacio de los dos primeros componentes
Figura 9. Representacin de los puntos individuos en el espacio de los dos primeros componentes
d) Con las coordenadas de los individuos se encuentra la calidad de representacin de los mismos y su
contribucin al nuevo sistema coordenado (figura 10).
COORDONNEES, CONTRIBUTIONS ET COSINUS CARRES DES INDIVIDUS
AXES 1 A 3
+---------------------------------------+-------------------------------+--------------------------+--------------------------+
|
INDIVIDUS
|
COORDONNEES
|
CONTRIBUTIONS
|
COSINUS CARRES
|
|---------------------------------------+-------------------------------+--------------------------+--------------------------|
| IDENTIFICATEUR
P.REL DISTO |
1
2
3
0
0
|
1
2
3
0
0 |
1
2
3
0
0 |
+---------------------------------------+-------------------------------+--------------------------+--------------------------+
| Pedro
7.14
0.78 | 0.39 -0.62 -0.50 0.00 0.00 | 0.5 3.3 11.8 0.0 0.0 | 0.19 0.49 0.32 0.00 0.00 |
| Juan
7.14
1.54 | 0.98 -0.70 0.29 0.00 0.00 | 3.4 4.2 3.9 0.0 0.0 | 0.63 0.32 0.05 0.00 0.00 |
| Mara
7.14
2.46 | -0.72 -1.21 -0.68 0.00 0.00 | 1.8 12.8 22.1 0.0 0.0 | 0.21 0.60 0.19 0.00 0.00 |
| Gonzalo
7.14
7.44 | 2.70 0.15 0.33 0.00 0.00 | 25.7 0.2 5.2 0.0 0.0 | 0.98 0.00 0.01 0.00 0.00 |
| Luca
7.14
1.88 | 1.27 0.35 -0.38 0.00 0.00 | 5.7 1.1 6.9 0.0 0.0 | 0.86 0.07 0.08 0.00 0.00 |
| Gloria
7.14
5.34 | 0.88 2.13 -0.19 0.00 0.00 | 2.7 39.4 1.7 0.0 0.0 | 0.15 0.85 0.01 0.00 0.00 |
| Ins
7.14
3.14 | -1.15 1.34 -0.10 0.00 0.00 | 4.7 15.7 0.5 0.0 0.0 | 0.42 0.57 0.00 0.00 0.00 |
| lvaro
7.14
6.71 | -2.52 0.50 -0.35 0.00 0.00 | 22.3 2.2 5.7 0.0 0.0 | 0.94 0.04 0.02 0.00 0.00 |
| Eduardo
7.14
2.54 | -0.72 -1.41 0.18 0.00 0.00 | 1.8 17.4 1.5 0.0 0.0 | 0.20 0.78 0.01 0.00 0.00 |
| Hernando
7.14
7.20 | -2.54 0.36 0.78 0.00 0.00 | 22.8 1.1 28.6 0.0 0.0 | 0.90 0.02 0.08 0.00 0.00 |
| Anita
7.14
1.54 | 1.22 -0.07 0.21 0.00 0.00 | 5.2 0.0 2.2 0.0 0.0 | 0.97 0.00 0.03 0.00 0.00 |
| Mariana
7.14
0.77 | 0.83 -0.16 0.22 0.00 0.00 | 2.4 0.2 2.3 0.0 0.0 | 0.90 0.03 0.06 0.00 0.00 |
| David
7.14
0.56 | -0.48 -0.44 0.37 0.00 0.00 | 0.8 1.7 6.3 0.0 0.0 | 0.41 0.35 0.24 0.00 0.00 |
| Pablo
7.14
0.10 | -0.14 -0.23 -0.17 0.00 0.00 | 0.1 0.5 1.3 0.0 0.0 | 0.18 0.54 0.28 0.00 0.00 |
+--------------------------------------+-------------------------------+--------------------------+--------------------------+
Figura 10. Coordenadas, contribuciones y calidad de la representacin (coseno cuadrado) de los puntos
individuos al nuevo sistema coordenado
La calidad de la representacin (coseno cuadrado) de los individuos en cada eje factorial, estar dada
por:
Para Pedro en el eje1 = (coordenada en el factor 1)2 = 0,19
((-0,37)2+(0,59)2+(0,48)2)
Para Pedro en el eje 2 = (coordenada en el factor 2)2 = 0,49
((-0,37)2+(0,59)2+(0,48)2)
Para Pedro en el eje 3 = (coordenada en el factor 3)2 = 0,32

((-0,37)2+(0,59)2+(0,48)2)
Lo que indica que Pedro est mejor representado en el plano YZ que en el plano XY.
Note que la suma del coseno cuadrado en los tres ejes debe ser la unidad.
La contribucin de cada individuo al nuevo sistema coordenado, estar dado por la norma de cada
vector individuo (coordenada del individuo en cada factor), con relacin a la norma total (suma de
normas para todos los individuos).
e) Las coordenadas de las variables peso, estatura y talla en el nuevo sistema, estarn dadas por la
correlacin de cada una de ellas con cada uno de los componentes:
n
( peso, componente1)
( z peso x )( ycomponente1 y )
i 1
( z peso x )
i 1
( ycomponente1 y )
i 1
(z
i 1
peso
* ycomponente1 )
n
( z peso ) ( ycomponente1 )
2
i 1
Entonces, se obtiene:
Coordenada 1 Coordenada 2 Coordenada 3
Edad
-0,550093867
0,8351
-0,000605
Peso
-0,929450873
-0,246173
0,27481
Talla
-0,928973477
-0,248208
-0,274592
i 1
Figura 11. Variables activas e individuos en el Primer plano factorial
La calidad de la representacin de las variables se observa de acuerdo a la proximidad de la norma del vector
a la unidad (figura 11), donde la Edad est mejor representada en el plano que las variables peso y estatura.
Se observa que las coordenadas de las variables Edad, Peso y Talla (figura 6), son iguales a las correlaciones,
pues se trabaj con la matriz centrada y estandarizada.
Conclusiones.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
La variable Peso y estatura se encuentran correlacionadas de manera directa, la Edad es independiente de

ellas.
Ins es de las mayores y tiene un peso alto y estatura alta.
Cecilia es de las mayores y tiene un peso alto y estatura baja.
lvaro y Hernando son de los mayores y tiene un peso alto y estatura muy altos.
Gonzalo es el que menos pesa y el ms pequeo.
Luca tiene una edad promedio, pero un peso y una estatura por debajo de la media.
Mara y Eduardo son jvenes, pero tienen peso y estatura por encima de la media.
EDAD
z1
65
55
45
35
25
15
c1
z3
c2
z2
51
61
c3
71
PESO
81
91
NOMBRE
Anita
David
Eduardo
Gloria
Gonzalo
Hernando
Ins
Juan
Luca
Mariana
190 Mara
180
170
160
Pablo
150
140 ESTAT
Pedro
lvaro
Ejercicio 2
Variables nominales: si a una modalidad de una variable categrica le corresponde un valor test superior en
valor absoluto 1.98, sobre un factor s, se debe rechazar la hiptesis nula (o sea que la modalidad est bien
representada sobre ese eje).
La Federacin de Cafeteros realiz un estudio comparativo de 35 marcas de caf que actualmente se venden
en Europa, a fin de seleccionar aquellos que presentan la relacin calidad/precio ms favorable.
La calidad del caf vara fundamentalmente en funcin del % de orgnicos utilizados en su proceso de cultivo
y el tiempo de fermentacin. Es por ello que estos elementos son argumentos de publicidad de las marcas de
categora superior. Pero, dos marcas de caf con esas variables similares, pueden sinembargo, ser de calidad
muy diferente en razn de sus procesos de recoleccin, molienda, tostado, etc.
Por ello, se decidi medir la calidad del caf mediante tres descriptores: el % de orgnicos, el tiempo de
fermentacin y una nota de calidad global atribuida por un panel de expertos catadores.
El objetivo de este estudio es seleccionar las marcas de caf que presentan en Europa, la relacin
calidad/precio ms favorable para el consumidor final.
La Categora, figura obligatoriamente en la etiqueta del caf y juega un papel muy importante en las
campaas publicitarias de las marcas, puede ser excelso (3), de lujo (2) y estndar (1).
Caf No.
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
Precio de la libra (centavos

de euro)
70
60
65
74
70
73
70
55
77
93
82
73
62
87
78
73
87
80
85
87
80
83
90
110
87
113
96
82
127
160
90
86
100
100
95
% Orgnicos
utilizados
20
20
20
25
25
30
30
30
30
30
30
33
33
33
35
40
40
40
40
40
40
40
40
40
40
45
45
45
100
100
100
100
100
100
100
Categor
a
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
3
3
3
3
3
3
Tiempo de fermentacin
(horas)
5
5
7.5
12
12
5
8
5
5.5
12
12
6.5
8
12
10
10.5
8.5
8.5
9.5
8.5
9.5
9.5
12.5
12
5.5
12
12
12
8.5
12
12
12
10
11
12
Calific por
expertos
3
2
2
2
3
0
0
2
0
0
2
1
3
3
2
4
2
2
2
4
2
1
2
3
2
4
3
3
4
3
4
2
3
3
0
a) Cules son las 3 marcas de caf ms caras? Y las ms baratas?

b) Cul es el valor medio, mediano y el coeficiente de variacin del tiempo de fermentacin de las marcas
estudiadas?
c) Cul es la distribucin de las marcas de caf segn las categoras de las mismas?
d) La variable Categora es una variable continua? Por qu debe ser definida como variable
suplementaria?
e)
f)
g)
h)
i)
j)
k)
l)
m)
n)
o)
p)
q)
r)
s)
Qu tipo de anlisis de componentes principales sugiere usted en este caso, el de descomposicin

factorial de la matriz de correlaciones o el de descomposicin factorial de la matriz de
varianzas/covarianzas?
Cuntos ejes factoriales deben ser conservados en la interpretacin del anlisis?
Cules son las marcas de caf que son poco contributivas a la inercia proyectada sobre el primer plano y
que estn mal representadas en dicho plano?
Cules son las caractersticas comunes de las marcas 16, 20 y 26?
Por qu el primer plano factorial permite ver que las variables Precio, % de orgnicos y Tiempo de
fermentacin, presentan correlaciones positivas y relativamente altas entre ellas?
Por qu el primer plano factorial permite ver que la variable Calificacin presenta correlaciones
positiva, pero no muy alta con las variables Precio, % de orgnicos y Tiempo de fermentacin?
Podemos considerar que el primer eje es una buena combinacin lineal de las cuatro variables activas?
Cules son las variables mejor correlacionadas con el segundo eje factorial?
Cules son las marcas de caf que presentan una relacin calidad/precio ms interesante para el
consumidor?
Cules son las marcas de caf que presentan una relacin calidad/precio menos interesante para el
consumidor?
Comprara usted el caf No. 32?
Qu relacin observa entre la calidad del caf y la categora anunciada en el empaque?
Ejercicio 3. SITUACION SOCIO-ECONMICA EN LATINO AMRICA

1. OBJETIVOS
Determinar si el ndice de desarrollo Humano (IDH), es un ndice adecuado para representar la situacin socio
econmica de un pas.
2. DATOS
Se dispone de un conjunto de indicadores generales en el sector de la salud y de la economa para 10 pases de
Amrica Latina a 1990. Tambin se tiene informacin demogrfica. Las variables disponibles son las siguientes:
Variabl
1e
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
Descripcin de la variable
No
EV
Esperanza de vida (aos)
mb
TM
Tiempo medio de escolarizacin (aos)
re
PIB
Producto interior bruto, per capita (US$)
E
Var
ID
ndice de Desarrollo Humano
PN
Producto nacional bruto, per capita (US$)
iabl
H
GPI
Gasto pbl. En la instruccin (en % del PNB)
Be
AC
Aporte calrico cotidiano (%de las necesidades normalizadas)
T_
Tasa de mortalidad en menores de 15 aos (por 1000 nacidos vivos)
C
T_
MO Tasa de alfabetizacin de las mujeres (%poblacin femenina mayor de 15
PR
Poblacin rural (% aos)
del total de la poblacin)
AL
RT
HM
Cantidad de habitantes por mdico
F
CT
Cantidad de telfonos por 1000 habitantes
TF
Tasa de fertilidad
DE
Monto de la deuda total (% del PNB)
CA
UD Importancia de la carga de la deuda (% de las exportaciones y bienes de
ESS
Empleados del sectorservicios)
servicios (%Poblacin activa)
RG
A
Los datos se muestran adelante.

a) Cules son los 3 pases con mayor tasa de mortalidad infantil?
b) Cul es el valor medio, mediano y el coeficiente de variacin de la esperanza de vida?
c) Cul es la distribucin del IDH?
d) Qu tipo de anlisis de componentes principales sugiere usted en este caso, el de descomposicin
factorial de la matriz de correlaciones o el de descomposicin factorial de la matriz de
varianzas/covarianzas?
e) Cuntos ejes factoriales deben ser conservados en la interpretacin del anlisis?
f) Cules son los pases que son poco contributivas a la inercia proyectada sobre el primer plano y que
estn mal representadas en dicho plano?
g) Cules son las caractersticas comunes de Ecuador y Paragay?
h) Cules son las caractersticas comunes de Bolivia y Per?
i) Cules son las caractersticas comunes de Venezuela, Colombia y Urugay?
j) Cules son las caractersticas comunes de Argentina y Chile?
k) Qu variables estn correlacionadas en el primer plano factorial?
l) Cul es la variable que presenta menor correlacin con las dems en el primer plano factorial?
m) Podemos considerar que el primer eje es una buena combinacin lineal de las variables activas?
n) Cmo definira a Colombia de acuerdo al primer plano factorial?
o) Cmo define a Bolivia de acuerdo con el primer plano factorial?
p) El IDH es un ndice adecuado para representar la situacin socio econmica de un pas?
Pas
EV TME PIB
IDH
PNB GPI ACC T_MORT T_ALF PR
HM
CT TF DEUD CARGA ESS
URU 72,2
7,8
5916 0,881 2620
3,3
101
21
96
14
510
163 2,4
47
41
67
CHI 71,8
7,5
5099 0,864 1950
2,9
102
17
93
14
1230
68
2,7
74
26
52
ARG
71
8,7
4295 0,832 2380
1,5
131
30
95
14
370
115 2,8
62
34
53
VEN
70
6,3
6169 0,824 2560
4,1
99
34
90
700
92
3,2
71
21
56
COL 68,8
7,1
4237
0,77
1260
2,9
106
38
86
30
1230
81
2,7
45
39
68
BRA 65,6
3,9
4718
0,73
2680
3,9
114
59
80
25
1080
96
2,9
25
21
47
5,6
3074 0,646
960
2,7
105
59
84
44
820
36
3,8
121
33
46
4,9
2790 0,641 1090
116
48
88
52
1460
27
4,4
41
11
31
6,4
2622 0,592 1100
3,5
87
80
79
30
1040
31
3,7
59
11
53
1572 0,398
2,4
84
89
71
49
1530
29
4,7
101
40
34
EQU
66
PAR 67,1
PER
63
BOL 54,5
630
Ejercicio 4. En un estudio sobre sobrevivencia del ms fuerte, se trabaj con 49 gorriones hembras que
fueron encontradas despus de una tormenta. Entre otras variables se les midi la longitud total, extensin de las
alas, longitud pico-cabeza, longitud del hmero y la longitud de la quilla (esternn o pecho); todas en milmetros. Adems
se observ si el animal sobrevivi o no (tomado de Multivariate Statistical Methods A Primer, Third Edition - Bryan F.J.
Manly, 2005).
No
Longitud Extensin alas Long pico-cabeza Long hmero Long quilla
Estado
156
245
31,6
18,5
20,5
Sobreviv
154
240
30,4
17,9
19,6
Sobreviv
153
240
31
18,4
20,6
Sobreviv
153
236
30,9
17,7
20,2
Sobreviv
155
243
31,5
18,6
20,3
Sobreviv
163
247
32
19
20,9
Sobreviv
157
238
30,9
18,4
20,2
Sobreviv
155
239
32,8
18,6
21,2
Sobreviv
164
248
32,7
19,1
21,1
Sobreviv
10
158
238
31
18,8
22
Sobreviv
11
158
240
31,3
18,6
22
Sobreviv
12
160
244
31,1
18,6
20,5
Sobreviv
13
161
246
32,3
19,3
21,8
Sobreviv
14
157
245
32
19,1
20
Sobreviv
15
157
235
31,5
18,1
19,8
Sobreviv
16
156
237
30,9
18
20,3
Sobreviv
17
158
244
31,4
18,5
21,6
Sobreviv
18
153
238
30,5
18,2
20,9
Sobreviv
19
155
236
30,3
18,5
20,1
Sobreviv
20
163
246
32,5
18,6
21,9
Sobreviv
21
159
236
31,5
18
21,5
Sobreviv
22
155
240
31,4
18
20,7
Muri
23
156
240
31,5
18,2
20,6
Muri
24
160
242
32,6
18,8
21,7
Muri
25
152
232
30,3
17,2
19,8
Muri
26
160
250
31,7
18,8
22,5
Muri
27
155
237
31
18,5
20
Muri
28
157
245
32,2
19,5
21,4
Muri
29
165
245
33,1
19,8
22,7
Muri
30
153
231
30,1
17,3
19,8
Muri
31
162
239
30,3
18
23,1
Muri
32
162
243
31,6
18,8
21,3
Muri
33
159
245
31,8
18,5
21,7
Muri
34
159
247
30,9
18,1
19
Muri
35
155
243
30,9
18,5
21,3
Muri
36
162
252
30,9
19,1
22,2
Muri
a)
b)
c)
d)
e)
f)
g)
h)
i)
j)
k)
37
152
230
30,4
17,3
18,6
Muri
38
159
242
30,8
18,2
20,5
Muri
39
155
238
31,2
17,9
19,3
Muri
40
163
249
33,4
19,5
22,8
Muri
41
163
242
31
18,1
20,7
Muri
42
156
237
31,7
18,2
20,3
Muri
43
159
238
31,5
18,4
20,3
Muri
44
161
245
32,1
19,1
20,8
Muri
45
155
235
30,7
17,7
19,6
Muri
46
162
247
30,9
19,1
20,4
Muri
47
153
237
30,6
18,6
20,4
Muri
48
162
245
32,5
18,5
21,1
Muri
49
164
248
32,3
18,8
20,9
Muri
Determine el nmero de ejes a retener.

Qu concluye de la matriz de correlaciones?
Qu variables constituyen el eje 1?
Qu variables constituyen el eje 2?
Qu aves estn bien representadas en el eje1?
Considera usted que todos los individuos estn bien representados en el primer plano factorial?
Considera usted que todas las variables estn bien representadas en el primer plano factorial?
Qu caractersticas comunes presentan las aves 10 y 11?
Qu caractersticas comunes presentan las aves 39 y 34?
Qu variables se muestran independientes?
Influye las mediciones realizadas en la sobrevivencia del animal?
PRINCIPAL COMPONENTS ANALYSIS

SUMMARY STATISTICS OF CONTINUOUS VARIABLES
TOTAL COUNT
:
49
TOTAL WEIGHT
:
49.00
+-------------------------------------------------------+----------------------+----------------------+
| NUM . IDEN - LABEL
COUNT
WEIGHT |
MEAN STD.DEV. |
MINIMUM
MAXIMUM |
+-------------------------------------------------------+----------------------+----------------------+
|
1 . Long - Longitud
49
49.00 |
157.98
3.62 |
152.00
165.00 |
|
2 . Exte - Extensin alas
49
49.00 |
241.33
5.02 |
230.00
252.00 |
|
3 . Long - Long pico-cabeza
49
49.00 |
31.42
0.79 |
30.10
33.40 |
|
4 . Long - Long hmero
49
49.00 |
18.47
0.56 |
17.20
19.80 |
|
5 . Long - Long quilla
49
49.00 |
20.83
0.98 |
18.60
23.10 |
+-------------------------------------------------------+----------------------+----------------------+
CORRELATION MATRIX
|
Long
Exte
Long
Long
Long
-----+----------------------------------Long |
1.00
Exte |
0.73
1.00
Long |
0.60
0.59
1.00
Long |
0.65
0.77
0.70
1.00
Long |
0.61
0.53
0.50
0.61
1.00
-----+----------------------------------|
Long
Exte
Long
Long
Long
TEST-VALUES MATRIX
|
Long
Exte
Long
Long
Long
-----+----------------------------------Long | 99.99
Exte |
6.58 99.99
Long |
4.88
4.72 99.99
Long |
5.37
7.12
6.11 99.99
Long |
4.91
4.12
3.84
4.93 99.99
-----+----------------------------------|
Long
Exte
Long
Long
Long
EIGENVALUES
COMPUTATIONS PRECISION SUMMARY : TRACE BEFORE DIAGONALISATION..
5.0000
SUM OF EIGENVALUES............
5.0000
HISTOGRAM OF THE FIRST
5 EIGENVALUES
+--------+------------+-------------+-------------+----------------------------------------------------------------------------------+
| NUMBER | EIGENVALUE | PERCENTAGE | CUMULATED |
|
|
|
|
| PERCENTAGE |
|
+--------+------------+-------------+-------------+----------------------------------------------------------------------------------+
|
1
|
3.5227
|
70.45
|
70.45
| ******************************************************************************** |
|
2
|
0.5255
|
10.51
|
80.96
| ************
|
|
3
|
0.4480
|
8.96
|
89.92
| ***********
|
|
4
|
0.3355
|
6.71
|
96.63
| ********
|
|
5
|
0.1683
|
3.37
|
100.00
| ****
|
+--------+------------+-------------+-------------+----------------------------------------------------------------------------------+
COORDINATES OF VARIABLES ON AXES 1 TO 5
ACTIVE VARIABLES
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+-------------------------------
VARIABLES
|
COORDINATES
| VARIABLE-FACTOR CORRELATIONS |
NORMED EIGENVECTORS
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+------------------------------IDEN - SHORT LABEL
|
1
2
3
4
5
|
1
2
3
4
5 |
1
2
3
4
5
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+------------------------------Long - Longitud
|
0.86 -0.07
0.29 -0.39 -0.15 | 0.86 -0.07 0.29 -0.39 -0.15 | 0.46 -0.09 0.43 -0.67 -0.37
Exte - Extensin alas
|
0.87
0.16
0.36
0.17
0.25 | 0.87 0.16 0.36 0.17 0.25 | 0.46 0.22 0.53 0.29 0.61
Long - Long pico-cabeza
|
0.81
0.31 -0.45 -0.20
0.11 | 0.81 0.31 -0.45 -0.20 0.11 | 0.43 0.43 -0.67 -0.34 0.26
Long - Long hmero
|
0.89
0.14 -0.07
0.34 -0.26 | 0.89 0.14 -0.07 0.34 -0.26 | 0.48 0.20 -0.10 0.58 -0.62
Long - Long quilla
|
0.76 -0.61 -0.18
0.07
0.08 | 0.76 -0.61 -0.18 0.07 0.08 | 0.41 -0.84 -0.27 0.11 0.19
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+------------------------------FACTOR SCORES, CONTRIBUTIONS AND SQUARED COSINES OF CASES
AXES 1 TO 5
+---------------------------------------+-------------------------------+--------------------------+--------------------------+
|
CASES
|
FACTOR SCORES
|
CONTRIBUTIONS
|
SQUARED COSINES
|
|---------------------------------------+-------------------------------+--------------------------+--------------------------|
| IDENTIFIER
REL.WT. DISTO |
1
2
3
4
5
|
1
2
3
4
5 |
1
2
3
4
5 |
+---------------------------------------+-------------------------------+--------------------------+--------------------------+
| 1
2.04
1.00 | 0.08 0.61 0.08 0.50 0.61 | 0.0 1.4 0.0 1.5 4.6 | 0.01 0.37 0.01 0.25 0.37 |
| 2
2.04
5.55 | -2.17 0.34 0.69 0.37 0.32 | 2.7 0.4 2.1 0.8 1.3 | 0.85 0.02 0.08 0.03 0.02 |
| 3
2.04
2.32 | -1.13 0.01 -0.31 0.94 0.25 | 0.7 0.0 0.4 5.3 0.8 | 0.55 0.00 0.04 0.38 0.03 |
| 4
2.04
5.76 | -2.32 -0.13 -0.41 -0.02 0.44 | 3.1 0.1 0.8 0.0 2.4 | 0.93 0.00 0.03 0.00 0.03 |
| 5
2.04
1.14 | -0.28 0.70 -0.13 0.69 0.29 | 0.0 1.9 0.1 2.9 1.0 | 0.07 0.42 0.01 0.42 0.07 |
| 6
2.04
4.66 | 1.96 0.57 0.60 -0.30 -0.22 | 2.2 1.3 1.6 0.6 0.6 | 0.82 0.07 0.08 0.02 0.01 |
| 7
2.04
1.37 | -1.03 0.11 0.15 0.07 -0.51 | 0.6 0.0 0.1 0.0 3.2 | 0.78 0.01 0.02 0.00 0.19 |
| 8
2.04
4.16 | 0.43 0.45 -1.90 0.01 0.40 | 0.1 0.8 16.4 0.0 2.0 | 0.04 0.05 0.87 0.00 0.04 |
| 9
2.04
8.53 | 2.73 0.84 0.16 -0.61 -0.05 | 4.3 2.7 0.1 2.2 0.0 | 0.87 0.08 0.00 0.04 0.00 |
| 10
2.04
2.50 | 0.23 -1.27 -0.38 0.46 -0.69 | 0.0 6.3 0.7 1.3 5.7 | 0.02 0.65 0.06 0.09 0.19 |
| 11
2.04
1.58 | 0.41 -1.09 -0.39 0.24 -0.12 | 0.1 4.6 0.7 0.4 0.2 | 0.11 0.75 0.09 0.04 0.01 |
| 12
2.04
0.92 | 0.30 0.22 0.86 0.01 -0.20 | 0.1 0.2 3.4 0.0 0.5 | 0.10 0.05 0.80 0.00 0.04 |
| 13
2.04
6.01 | 2.40 0.08 -0.30 0.30 -0.20 | 3.4 0.0 0.4 0.5 0.5 | 0.96 0.00 0.02 0.01 0.01 |
| 14
2.04
3.14 | 0.73 1.45 -0.10 0.70 -0.13 | 0.3 8.1 0.0 3.0 0.2 | 0.17 0.67 0.00 0.16 0.01 |
| 15
2.04
3.21 | -1.40 0.54 -0.51 -0.71 -0.42 | 1.1 1.1 1.2 3.1 2.1 | 0.61 0.09 0.08 0.16 0.06 |
| 16
2.04
2.47 | -1.55 -0.14 -0.03 -0.20 -0.06 | 1.4 0.1 0.0 0.2 0.0 | 0.97 0.01 0.00 0.02 0.00 |
| 17
2.04
0.91 | 0.59 -0.55 0.08 0.28 0.43 | 0.2 1.2 0.0 0.5 2.2 | 0.38 0.33 0.01 0.08 0.20 |
| 18
2.04
3.93 | -1.64 -0.69 -0.14 0.86 0.13 | 1.6 1.8 0.1 4.5 0.2 | 0.68 0.12 0.01 0.19 0.00 |
| 19
2.04
4.37 | -1.75 -0.14 0.22 0.68 -0.87 | 1.8 0.1 0.2 2.8 9.3 | 0.70 0.00 0.01 0.11 0.17 |
| 20
2.04
5.93 | 2.21 -0.20 -0.14 -0.88 0.46 | 2.8 0.2 0.1 4.7 2.5 | 0.83 0.01 0.00 0.13 0.04 |
| 21
2.04
2.40 | -0.44 -0.97 -0.62 -0.94 -0.07 | 0.1 3.6 1.7 5.4 0.1 | 0.08 0.39 0.16 0.37 0.00 |
| 22
2.04
1.47 | -0.96 -0.05 -0.36 -0.01 0.64 | 0.5 0.0 0.6 0.0 5.0 | 0.63 0.00 0.09 0.00 0.28 |
| 23
2.04
0.67 | -0.65 0.13 -0.34 -0.05 0.33 | 0.2 0.1 0.5 0.0 1.3 | 0.64 0.03 0.17 0.00 0.16 |
| 24
2.04
3.72 | 1.61 -0.01 -0.99 -0.40 0.06 | 1.5 0.0 4.4 1.0 0.0 | 0.69 0.00 0.26 0.04 0.00 |
| 25
2.04 14.46 | -3.73 -0.45 -0.25 -0.37 0.35 | 8.1 0.8 0.3 0.8 1.5 | 0.96 0.01 0.00 0.01 0.01 |
| 26
2.04
6.69 | 2.18 -0.83 0.40 0.53 0.88 | 2.8 2.7 0.7 1.7 9.4 | 0.71 0.10 0.02 0.04 0.12 |
| 27
2.04
2.42 | -1.32 0.37 -0.24 0.42 -0.54 | 1.0 0.5 0.3 1.1 3.6 | 0.72 0.06 0.02 0.07 0.12 |
| 28
2.04
5.34 | 1.76 0.49 -0.73 1.19 -0.24 | 1.8 0.9 2.4 8.6 0.7 | 0.58 0.05 0.10 0.27 0.01 |
| 29
2.04 18.17 | 4.05 -0.23 -0.95 -0.23 -0.86 | 9.5 0.2 4.1 0.3 9.0 | 0.90 0.00 0.05 0.00 0.04 |
| 30
2.04 14.41 | -3.72 -0.59 -0.09 -0.43 -0.05 | 8.0 1.4 0.0 1.1 0.0 | 0.96 0.02 0.00 0.01 0.00 |
| 31
2.04
9.54 | 0.22 -2.95 0.64 -0.63 -0.11 | 0.0 33.7 1.8 2.4 0.1 | 0.01 0.91 0.04 0.04 0.00 |
| 32
2.04
1.98 | 1.24 -0.22 0.32 -0.34 -0.43 | 0.9 0.2 0.5 0.7 2.3 | 0.77 0.02 0.05 0.06 0.10 |
| 33
2.04
1.65 | 1.06 -0.39 -0.06 -0.01 0.60 | 0.7 0.6 0.0 0.0 4.3 | 0.69 0.09 0.00 0.00 0.22 |
| 34
2.04
5.69 | -0.70 1.38 1.73 -0.24 0.48 | 0.3 7.4 13.7 0.3 2.7 | 0.09 0.34 0.53 0.01 0.04 |
| 35
2.04
1.46 | -0.28 -0.53 0.12 0.96 0.40 | 0.0 1.1 0.1 5.6 1.9 | 0.05 0.19 0.01 0.63 0.11 |
| 36
2.04
9.43 | 2.32 -0.87 1.56 0.89 0.26 | 3.1 2.9 11.1 4.9 0.8 | 0.57 0.08 0.26 0.08 0.01 |
| 37
2.04 19.03 | -4.28 0.58 -0.23 -0.56 -0.20 | 10.6 1.3 0.2 1.9 0.5 | 0.96 0.02 0.00 0.02 0.00 |
| 38
2.04
1.06 | -0.51 -0.15 0.86 -0.20 0.01 | 0.2 0.1 3.3 0.3 0.0 | 0.25 0.02 0.69 0.04 0.00 |
| 39
2.04
4.65 | -1.92 0.92 0.00 -0.31 0.18 | 2.1 3.3 0.0 0.6 0.4 | 0.79 0.18 0.00 0.02 0.01 |
| 40
2.04 18.03 | 4.12 -0.03 -0.99 -0.05 0.28 | 9.8 0.0 4.5 0.0 1.0 | 0.94 0.00 0.05 0.00 0.00 |
| 41
2.04
2.68 | 0.10 -0.35 1.13 -1.12 -0.19 | 0.0 0.5 5.8 7.6 0.4 | 0.00 0.05 0.47 0.46 0.01 |
| 42
2.04
1.69 | -0.94 0.37 -0.74 -0.34 -0.03 | 0.5 0.5 2.5 0.7 0.0 | 0.53 0.08 0.33 0.07 0.00 |
| 43
2.04
0.83 | -0.41 0.30 -0.14 -0.55 -0.50 | 0.1 0.3 0.1 1.8 3.1 | 0.20 0.11 0.02 0.36 0.31 |
| 44
2.04
3.26 | 1.62 0.71 0.07 0.00 -0.36 | 1.5 2.0 0.0 0.0 1.5 | 0.80 0.15 0.00 0.00 0.04 |
| 45
2.04
6.56 | -2.52 0.18 0.05 -0.44 -0.07 | 3.7 0.1 0.0 1.2 0.1 | 0.97 0.00 0.00 0.03 0.00 |
| 46
2.04
4.41 | 1.11 0.46 1.53 0.40 -0.69 | 0.7 0.8 10.6 1.0 5.7 | 0.28 0.05 0.53 0.04 0.11 |
| 47
2.04
3.96 | -1.54 -0.10 -0.27 1.12 -0.50 | 1.4 0.0 0.3 7.6 3.1 | 0.60 0.00 0.02 0.32 0.06 |
| 48
2.04
3.73 | 1.58 0.43 -0.13 -0.94 0.40 | 1.4 0.7 0.1 5.4 1.9 | 0.67 0.05 0.00 0.24 0.04 |
| 49
2.04
6.15 | 2.17 0.69 0.60 -0.77 0.12 | 2.7 1.8 1.7 3.6 0.2 | 0.77 0.08 0.06 0.10 0.00 |
+---------------------------------------+-------------------------------+--------------------------+--------------------------+
COORDINATES AND TEST-VALUES OF CATEGORIES
AXES 1 TO 5
+---------------------------------------------+-------------------------------+------------------------------------+----------+
|
CATEGORIES
|
TEST-VALUES
|
COORDINATES
|
|
|---------------------------------------------|-------------------------------|------------------------------------|----------|
| IDEN - LABEL
COUNT
ABS.WT |
1
2
3
4
5
|
1
2
3
4
5
| DISTO. |
+---------------------------------------------+-------------------------------+------------------------------------+----------+
|
6 . Estado
|
| m1
- Muri
28
28.00 |
0.3 -0.3
1.1 -1.2
0.1 |
0.06 -0.03
0.09 -0.09
0.01 |
0.02 |
| m2
- Sobreviv
21
21.00 | -0.3
0.3 -1.1
1.2 -0.1 | -0.08
0.03 -0.12
0.12 -0.01 |
0.04 |
+---------------------------------------------+-------------------------------+------------------------------------+----------+
Anlisis de clasificacin jerrquica
Hier ar chi cal Cluster Anal ysis ( on factors)
35
14
34
46
12
38
41
17
33
11
10
21
31
26
36
28
13
44
32
49
24
48
20
40
29
23
22
43
42
15
16
27
18
47
19
39
45
DESCRIPTION AND CHARACTERISATION OF PARTITIONS

DESCRIPTION OF: CUT "a" OF THE TREE INTO
2 CLUSTER
CLUSTERS CHARACTERISATION BY CATEGORIES
CLUSTERS CHARACTERISATION BY CONTINUOUS VARIABLES
CHARACTERISATION BY CATEGORIES OF CLUSTERS OR CATEGORIES
OF CUT "a" OF THE TREE INTO
2 CLUSTERS
Cluster 1 / 2
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------T.VALUE PROB. ---- PERCENTAGES ---- CHARACTERISTIC
IDEN WEIGHT
GRP/CAT CAT/GRP GLOBAL CATEGORIES
OF VARIABLES
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------Cluster 2 / 2
IDEN WEIGHT
OF VARIABLES
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CHARACTERISATION BY CONTINUOUS VARIABLES OF CLUSTERS OR CATEGORIES
2 CLUSTERS
Cluster 1 / 2
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
| T.VALUE| PROB. |
MEANS
|
STD. DEVIATION |
CHARACTERISTIC VARIABLES
|
|
|
|
GROUP
OVERALL |
GROUP OVERALL | NUM.LABEL
IDEN |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
|
Cluster 1 / 2
( WEIGHT =
25.00
COUNT =
25 )
aa1a |
|
|
|
5.12 | 0.000 |
160.60
157.98 |
2.67
3.62 |
1.Longitud
Long |
|
4.84 | 0.000 |
244.76
241.33 |
3.39
5.02 |
2.Extensin alas
Exte |
|
4.74 | 0.000 |
18.84
18.47 |
0.42
0.56 |
4.Long hmero
Long |
|
4.65 | 0.000 |
21.47
20.83 |
0.79
0.98 |
5.Long quilla
Long |
|
4.18 | 0.000 |
31.88
31.42 |
0.76
0.79 |
3.Long pico-cabeza
Long |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
Cluster 2 / 2
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
| T.VALUE| PROB. |
MEANS
|
STD. DEVIATION |
|
|
|
|
GROUP
OVERALL |
IDEN |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
|
Cluster 2 / 2
( WEIGHT =
24.00
COUNT =
24 )
aa2a |
37
25
30
|
|
|
|
|
|
|
|
| -4.18 | 0.000 |
30.93
31.42 |
0.45
0.79 |
3.Long pico-cabeza
Long |
| -4.65 | 0.000 |
20.15
20.83 |
0.65
0.98 |
5.Long quilla
Long |
| -4.74 | 0.000 |
18.08
18.47 |
0.40
0.56 |
4.Long hmero
Long |
| -4.84 | 0.000 |
237.75
241.33 |
3.79
5.02 |
2.Extensin alas
Exte |
| -5.12 | 0.000 |
155.25
157.98 |
2.17
3.62 |
1.Longitud
Long |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
DESCRIPTION OF: CUT "b" OF THE TREE INTO
3 CLUSTER
CLUSTERS CHARACTERISATION BY CATEGORIES
CHARACTERISATION BY CATEGORIES OF CLUSTERS OR CATEGORIES
OF CUT "b" OF THE TREE INTO
3 CLUSTERS
Cluster 1 / 3
IDEN WEIGHT
OF VARIABLES
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------Cluster 2 / 3
IDEN WEIGHT
OF VARIABLES
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------Cluster 3 / 3
IDEN WEIGHT
OF VARIABLES
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CHARACTERISATION BY CONTINUOUS VARIABLES OF CLUSTERS OR CATEGORIES
3 CLUSTERS
Cluster 1 / 3
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
| T.VALUE| PROB. |
MEANS
|
STD. DEVIATION |
|
|
|
|
GROUP
OVERALL |
IDEN |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
Cluster 2 / 3
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
| T.VALUE| PROB. |
MEANS
|
STD. DEVIATION |
|
|
|
|
GROUP
OVERALL |
IDEN |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
|
Cluster 2 / 3
( WEIGHT =
13.00
COUNT =
13 )
bb2b |
|
|
|
4.82 | 0.000 |
32.33
31.42 |
0.60
0.79 |
3.Long pico-cabeza
Long |
|
4.54 | 0.000 |
161.92
157.98 |
2.06
3.62 |
1.Longitud
Long |
|
4.52 | 0.000 |
246.77
241.33 |
2.52
5.02 |
2.Extensin alas
Exte |
|
4.47 | 0.000 |
19.07
18.47 |
0.36
0.56 |
4.Long hmero
Long |
|
3.61 | 0.000 |
21.68
20.83 |
0.68
0.98 |
5.Long quilla
Long |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
Cluster 3 / 3
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
| T.VALUE| PROB. |
MEANS
|
STD. DEVIATION |
|
|
|
|
GROUP
OVERALL |
IDEN |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
|
Cluster 3 / 3
( WEIGHT =
17.00
COUNT =
17 )
bb3b |
|
|
|
|
|
|
|
|
| -3.88 | 0.000 |
30.81
31.42 |
0.45
0.79 |
3.Long pico-cabeza
Long |
| -4.19 | 0.000 |
20.01
20.83 |
0.54
0.98 |
5.Long quilla
Long |
| -4.30 | 0.000 |
17.99
18.47 |
0.43
0.56 |
4.Long hmero
Long |
| -5.06 | 0.000 |
154.35
157.98 |
1.57
3.62 |
1.Longitud
Long |
| -5.07 | 0.000 |
236.29
241.33 |
2.89
5.02 |
2.Extensin alas
Exte |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
Ejercicio 5. Los siguientes datos (Manly, 1986, pg 165) corresponden a mediciones

hechas sobre 16 colonias de mariposas Euphydryaus edita (Porc gen mov: porcentaje de
genes con movilidad 0,4; 0,6; 0,8; 1,0; 1,16 y 1,30). Se pretende explorar la posible
asociacin entre los factores ambientales y las caractersticas genticas presentes en estos
insectos.
Altitud
Colonia (pies)
Temp
mx
anual
(F)
Precip
anual
(pulg)
Temp
mn
anual
(F)
Porc gen
mov 0,4
Porc gen
mov 0,6
Porc gen
mov 0,8
Porc gen
mov 1,0
Porc gen Porc gen

mov 1,16 mov 1,30
SS
500
43
98
17
22
57
17
SB
800
20
92
32
16
20
38
13
13
WSB
570
28
98
26
28
46
17
JRC
550
28
98
26
19
47
27
JRH
550
28
98
26
50
35
SJ
380
15
99
28
19
44
32
CR
930
21
99
28
15
50
27
UO
650
10
101
27
10
21
40
25
LO
600
10
101
27
14
26
32
28
DP
1500
19
99
23
80
12
PZ
1750
22
101
27
34
33
22
MC
2000
58
100
18
14
66
13
IF
2500
34
102
16
15
47
21
AF
2000
21
105
20
17
32
27
14
GH
7850
42
84
84
GL
10500
50
81
-12
92
PRINCIPAL COMPONENTS ANALYSIS

SUMMARY STATISTICS OF CONTINUOUS VARIABLES
TOTAL COUNT
:
16
TOTAL WEIGHT
:
16.00
+-------------------------------------------------------+----------------------+----------------------+
| NUM . IDEN - LABEL
COUNT
WEIGHT |
MEAN STD.DEV. |
MINIMUM
MAXIMUM |
+-------------------------------------------------------+----------------------+----------------------+
|
1 . Alti - Altitud (pies)
16
16.00 |
2101.88
2787.93 |
380.00 10500.00 |
|
2 . Prec - Precip anual (pulg)
16
16.00 |
28.06
13.55 |
10.00
58.00 |
|
3 . Temp - Temp mx anual (F)
16
16.00 |
97.25
6.18 |
81.00
105.00 |
|
4 . Temp - Temp mn anual (F)
16
16.00 |
20.88
10.61 |
-12.00
32.00 |
|-------------------------------------------------------|----------------------|----------------------|
5 . Porc - Porc gen mov 0,4
16
16.00 |
1.75
4.01 |
0.00
14.00 |
|
16
16.00 |
7.19
7.26 |
0.00
26.00 |
|
16
16.00 |
18.56
10.43 |
1.00
40.00 |
|
16
16.00 |
51.19
19.43 |
25.00
92.00 |
|
16
16.00 |
17.19
10.44 |
0.00
35.00 |
| 10 . Porc - Porc gen mov 1,30
16
16.00 |
4.13
4.48 |
0.00
14.00 |
+-------------------------------------------------------+----------------------+----------------------+
CORRELATION MATRIX
|
Alti
Prec
Temp
Temp
-----+---------------------------Alti |
1.00
Prec |
0.57
1.00
Temp | -0.83 -0.48
1.00
Temp | -0.94 -0.70
0.72
1.00
-----+---------------------------|
Alti
Prec
Temp
Temp
TEST-VALUES MATRIX
|
Alti
Prec
Temp
Temp
-----+---------------------------Alti | 99.99
Prec |
2.58 99.99
Temp | -4.72 -2.09 99.99
Temp | -6.82 -3.51
3.62 99.99
-----+---------------------------|
Alti
Prec
Temp
Temp
EIGENVALUES
COMPUTATIONS PRECISION SUMMARY : TRACE BEFORE DIAGONALISATION..
4.0000
SUM OF EIGENVALUES............
4.0000
HISTOGRAM OF THE FIRST
4 EIGENVALUES
+--------+------------+-------------+-------------+----------------------------------------------------------------------------------+
| NUMBER | EIGENVALUE | PERCENTAGE | CUMULATED |
|
|
|
|
| PERCENTAGE |
|
+--------+------------+-------------+-------------+----------------------------------------------------------------------------------+
|
1
|
3.1394
|
78.49
|
78.49
| ******************************************************************************** |
|
2
|
0.5752
|
14.38
|
92.87
| ***************
|
|
3
|
0.2533
|
6.33
|
99.20
| *******
|
|
4
|
0.0321
|
0.80
|
100.00
| *
|
+--------+------------+-------------+-------------+----------------------------------------------------------------------------------+
ANDERSON'S LAPLACE INTERVALS
WITH 0.95 THRESHOLD
+--------+--------------------------------------------------------+
| NUMBER |
LOWER LIMIT
EIGENVALUE
UPPER LIMIT
|
+--------+--------------------------------------------------------+
|
1
|
0.8926
3.1394
5.3863
|
|
2
|
0.1635
0.5752
0.9868
|
|
3
|
0.0720
0.2533
0.4346
|
|
4
|
0.0091
0.0321
0.0551
|
+--------+--------------------------------------------------------+
LENGTH AND RELATIVE POSITION OF INTERVALS
1 . . . . . . . . . . .*----------------------------------------------------+-----------------------------------------------------*
2 . .*---------+---------*. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
3 .*---+----* . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
4 +*. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
COORDINATES OF VARIABLES ON AXES 1 TO 4
ACTIVE VARIABLES
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+------------------------------VARIABLES
|
COORDINATES
NORMED EIGENVECTORS
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+------------------------------IDEN - SHORT LABEL
|
1
2
3
4
0
|
1
2
3
4
0 |
1
2
3
4
0
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+------------------------------Alti - Altitud (pies)
| -0.95 -0.21
0.18
0.13
0.00 | -0.95 -0.21 0.18 0.13 0.00 | -0.54 -0.27 0.36 0.71 0.00
Prec - Precip anual (pulg) | -0.76
0.63 -0.16
0.03
0.00 | -0.76 0.63 -0.16 0.03 0.00 | -0.43 0.83 -0.32 0.16 0.00
Temp - Temp mx anual (F) |
0.86
0.37
0.35
0.04
0.00 | 0.86 0.37 0.35 0.04 0.00 | 0.49 0.48 0.70 0.20 0.00
Temp - Temp mn anual (F) |
0.96 -0.04 -0.27
0.12
0.00 | 0.96 -0.04 -0.27 0.12 0.00 | 0.54 -0.05 -0.53 0.65 0.00
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+------------------------------SUPPLEMENTARY VARIABLES
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+------------------------------VARIABLES
|
COORDINATES
NORMED EIGENVECTORS
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+------------------------------IDEN - SHORT LABEL
|
1
2
3
4
0
|
1
2
3
4
0 |
1
2
3
4
0
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+------------------------------Porc - Porc gen mov 0,4
|
0.34 -0.33
0.37 -0.13
0.00 | 0.34 -0.33 0.37 -0.13 0.00 |
Porc - Porc gen mov 0,6
|
0.28 -0.28
0.11 -0.02
0.00 | 0.28 -0.28 0.11 -0.02 0.00 |
|
0.63 -0.09
0.07
0.01
0.00 | 0.63 -0.09 0.07 0.01 0.00 |
| -0.82
0.09 -0.13 -0.07
0.00 | -0.82 0.09 -0.13 -0.07 0.00 |
|
0.42
0.27 -0.06
0.06
0.00 | 0.42 0.27 -0.06 0.06 0.00 |
|
0.34 -0.06
0.04
0.32
0.00 | 0.34 -0.06 0.04 0.32 0.00 |
----------------------------+------------------------------------+-------------------------------+-------------------------------
Hier ar chi cal Cluster Anal ysis ( on factors)

GL
GH
UO
LO
SJ
SB
JRC
JRH
WSB
CR
PZ
DP
AF
IF
MC
SS
DESCRIPTION AND CHARACTERISATION OF PARTITIONS

DESCRIPTION OF: CUT "a" OF THE TREE INTO
2 CLUSTER
CHARACTERISATION BY CONTINUOUS VARIABLES OF CLUSTERS OR CATEGORIES
2 CLUSTERS
Cluster 1 / 2
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
| T.VALUE| PROB. |
MEANS
|
STD. DEVIATION |
|
|
|
|
GROUP
OVERALL |
IDEN |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
|
Cluster 1 / 2
( WEIGHT =
14.00
COUNT =
14 )
aa1a |
|
|
|
3.49 | 0.000 |
99.36
97.25 |
2.79
6.18 |
3.Temp mx anual (F)
Temp |
|
3.36 | 0.000 |
24.36
20.88 |
4.62
10.61 |
4.Temp mn anual (F)
Temp |
|
2.04 | 0.021 |
20.64
18.56 |
9.41
10.43 |
7.Porc gen mov 0,8
Porc |
|
|
|
|
|
|
| -2.77 | 0.003 |
45.93
51.19 |
14.41
19.43 |
8.Porc gen mov 1,0
Porc |
| -3.71 | 0.000 | 1091.43 2101.88 |
681.24 2787.93 |
1.Altitud (pies)
Alti |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
Cluster 2 / 2
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
| T.VALUE| PROB. |
MEANS
|
STD. DEVIATION |
|
|
|
|
GROUP
OVERALL |
IDEN |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
|
Cluster 2 / 2
( WEIGHT =
2.00
COUNT =
2 )
aa2a |
|
|
|
3.71 | 0.000 | 9175.00 2101.88 | 1325.00 2787.93 |
1.Altitud (pies)
Alti |
|
2.77 | 0.003 |
88.00
51.19 |
4.00
19.43 |
8.Porc gen mov 1,0
Porc |
|
|
|
|
|
|
| -2.04 | 0.021 |
4.00
18.56 |
3.00
10.43 |
7.Porc gen mov 0,8
Porc |
| -3.36 | 0.000 |
-3.50
20.88 |
8.50
10.61 |
4.Temp mn anual (F)
Temp |
| -3.49 | 0.000 |
82.50
97.25 |
1.50
6.18 |
3.Temp mx anual (F)
Temp |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
DESCRIPTION OF: CUT "b" OF THE TREE INTO
3 CLUSTER
CHARACTERISATION BY CONTINUOUS VARIABLES OF CLUSTERS OR CATEGORIES
3 CLUSTERS
Cluster 1 / 3
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
| T.VALUE| PROB. |
MEANS
|
STD. DEVIATION |
|
|
|
|
GROUP
OVERALL |
IDEN |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
|
Cluster 1 / 3
( WEIGHT =
3.00
COUNT =
3 )
bb1b |
|
|
|
2.33 | 0.010 |
45.00
28.06 |
9.90
13.55 |
2.Precip anual (pulg)
Prec |
|
|
|
|
|
|
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
Cluster 2 / 3
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
| T.VALUE| PROB. |
MEANS
|
STD. DEVIATION |
|
|
|
|
GROUP
OVERALL |
IDEN |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
|
Cluster 2 / 3
( WEIGHT =
11.00
COUNT =
11 )
bb2b |
|
|
|
2.97 | 0.001 |
26.36
20.88 |
2.87
10.61 |
4.Temp mn anual (F)
Temp |
|
|
|
|
|
|
| -2.41 | 0.008 |
934.55 2101.88 |
528.04 2787.93 |
1.Altitud (pies)
Alti |
| -2.42 | 0.008 |
43.00
51.19 |
14.42
19.43 |
8.Porc gen mov 1,0
Porc |
| -3.34 | 0.000 |
20.18
28.06 |
6.21
13.55 |
2.Precip anual (pulg)
Prec |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
Cluster 3 / 3
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
| T.VALUE| PROB. |
MEANS
|
STD. DEVIATION |
|
|
|
|
GROUP
OVERALL |
IDEN |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
|
Cluster 3 / 3
( WEIGHT =
2.00
COUNT =
2 )
bb3b |
|
|
|
3.71 | 0.000 | 9175.00 2101.88 | 1325.00 2787.93 |
1.Altitud (pies)
Alti |
|
2.77 | 0.003 |
88.00
51.19 |
4.00
19.43 |
8.Porc gen mov 1,0
Porc |
|
|
|
|
|
|
| -2.04 | 0.021 |
4.00
18.56 |
3.00
10.43 |
7.Porc gen mov 0,8
Porc |
| -3.36 | 0.000 |
-3.50
20.88 |
8.50
10.61 |
4.Temp mn anual (F)
Temp |
| -3.49 | 0.000 |
82.50
97.25 |
1.50
6.18 |
3.Temp mx anual (F)
Temp |
+--------+-------+-------------------+-------------------+-----------------------------------------------------------------------+
BUILDING UP PARTITIONS
CUT "a" OF THE TREE INTO
2 CLUSTERS
CLUSTERS FORMATION (ON ACTIVE CASES)
SUMMARY DESCRIPTION
+---------+----------+------------+------------+
| CLUSTER | COUNT
|
WEIGHT
|
CONTENT |
+---------+----------+------------+------------+
|
aa1a |
14
|
14.00
|
1 TO 14 |
|
aa2a |
2
|
2.00
| 15 TO 16 |
+---------+----------+------------+------------+
COORDINATES AND TEST-VALUES BEFORE CONSOLIDATION
AXES 1 A 4
+---------------------------------------------+-------------------------------+------------------------------------+----------+
|
CLUSTERS
|
TEST-VALUES
|
COORDINATES
|
|
|---------------------------------------------|-------------------------------|------------------------------------|----------|
| IDEN - LABEL
COUNT ABS.WT. |
1
2
3
4
0
|
1
2
3
4
0
| DISTO. |
+---------------------------------------------+-------------------------------+------------------------------------+----------+
|
2 CLUSTERS
|
|
|
| aa1a - Cluster 1 / 2
14
14.00 |
3.6
1.2 -0.1 -0.3
0.0 |
0.62
0.09
0.00
0.00
0.00 |
0.39 |
2
2.00 | -3.6 -1.2
0.1
0.3
0.0 | -4.33 -0.64
0.03
0.03
0.00 |
19.16 |
+---------------------------------------------+-------------------------------+------------------------------------+----------+
CLUSTERING CONSOLIDATION
AROUND CENTERS OF THE
2 CLUSTERS ACHIEVED BY 10 ITERATIONS WITH MOVING CENTERS
INTER-CLUSTER INERTIA INCREASE
+-----------+---------------+---------------+---------------+
| ITERATION | TOTAL INERTIA | INTER-CLUSTER |
RATIO
|
|
|
|
INERTIA
|
|
+-----------+---------------+---------------+---------------+
|
0
|
4.00000 |
2.73755 |
0.68439 |
|
1
|
4.00000 |
2.73755 |
0.68439 |
|
2
|
4.00000 |
2.73755 |
0.68439 |
+-----------+---------------+---------------+---------------+
STOP AFTER ITERATION 2. RELATIVE INCREASE OF INTER-CLUSTER INERTIA
WITH RESPECT TO THE PREVIOUS ITERATION IS ONLY 0.000 %.
INERTIA DECOMPOSITION
COMPUTED ON
4 AXES.
+------------------+-----------------+-------------+-------------------+-----------------+
|
|
INERTIAS
|
COUNTS
|
WEIGHTS
|
DISTANCES
|
| INERTIAS
| BEFORE
AFTER |BEFORE AFTER | BEFORE
AFTER | BEFORE
AFTER |
+------------------+-----------------+-------------+-------------------+-----------------+
|
|
|
|
|
|
| INTER-CLUSTER
| 2.7376
2.7376 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| INTRA-CLUSTER
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| CLUSTER
1 / 2 | 1.1358
1.1358 |
14
14 |
14.00
14.00 | 0.3911
0.3911 |
| CLUSTER
2 / 2 | 0.1267
0.1267 |
2
2 |
2.00
2.00 |19.1629 19.1629 |
|
|
|
|
|
|
| TOTAL INERTIA
| 4.0000
4.0000 |
|
|
|
+------------------+-----------------+-------------+-------------------+-----------------+
RATIO INTER INERTIA / TOTAL INERTIA) : BEFORE .. 0.6844
AFTER .. 0.6844
COORDINATES AND TEST-VALUES AFTER CONSOLIDATION
AXES 1 A 4
+---------------------------------------------+-------------------------------+------------------------------------+----------+
|
CLUSTERS
|
TEST-VALUES
|
COORDINATES
|
|
|---------------------------------------------|-------------------------------|------------------------------------|----------|
| IDEN - LABEL
COUNT ABS.WT. |
1
2
3
4
0
|
1
2
3
4
0
| DISTO. |
+---------------------------------------------+-------------------------------+------------------------------------+----------+
|
2 CLUSTERS
|
|
|
14
14.00 |
3.6
1.2 -0.1 -0.3
0.0 |
0.62
0.09
0.00
0.00
0.00 |
0.39 |
2
2.00 | -3.6 -1.2
0.1
0.3
0.0 | -4.33 -0.64
0.03
0.03
0.00 |
19.16 |
+---------------------------------------------+-------------------------------+------------------------------------+----------+
COMPOSITION OF: CUT "a" OF THE TREE INTO
2 CLUSTERS
Cluster 1 / 2
SS
SB
WSB
JRC
JRH
SJ
CR
UO
LO
DP
PZ
MC
IF
AF
Cluster 2 / 2
GH
GL
BUILDING UP PARTITIONS
3 CLUSTERS
CLUSTERS FORMATION (ON ACTIVE CASES)
SUMMARY DESCRIPTION
+---------+----------+------------+------------+
| CLUSTER | COUNT
|
WEIGHT
|
CONTENT |
+---------+----------+------------+------------+
|
aa1a |
2
|
2.00
|
1 TO
2 |
|
aa2a |
12
|
12.00
|
3 TO 14 |
|
aa3a |
2
|
2.00
| 15 TO 16 |
+---------+----------+------------+------------+
COORDINATES AND TEST-VALUES BEFORE CONSOLIDATION
AXES 1 A 4
+---------------------------------------------+-------------------------------+------------------------------------+----------+
|
CLUSTERS
|
TEST-VALUES
|
COORDINATES
|
|
|---------------------------------------------|-------------------------------|------------------------------------|----------|
| IDEN - LABEL
COUNT ABS.WT. |
1
2
3
4
0
|
1
2
3
4
0
| DISTO. |
+---------------------------------------------+-------------------------------+------------------------------------+----------+
|
3 CLUSTERS
|
|
|
2
2.00 | -0.5
3.1 -0.8 -0.9
0.0 | -0.58
1.61 -0.28 -0.11
0.00 |
3.02 |
12
12.00 |
3.1 -1.4
0.6
0.5
0.0 |
0.82 -0.16
0.04
0.01
0.00 |
0.70 |
2
2.00 | -3.6 -1.2
0.1
0.3
0.0 | -4.33 -0.64
0.03
0.03
0.00 |
19.16 |
+---------------------------------------------+-------------------------------+------------------------------------+----------+
CLUSTERING CONSOLIDATION
AROUND CENTERS OF THE
3 CLUSTERS ACHIEVED BY 10 ITERATIONS WITH MOVING CENTERS
INTER-CLUSTER INERTIA INCREASE
+-----------+---------------+---------------+---------------+
| ITERATION | TOTAL INERTIA | INTER-CLUSTER |
RATIO
|
|
|
|
INERTIA
|
|
+-----------+---------------+---------------+---------------+
|
0
|
4.00000 |
3.29595 |
0.82399 |
|
1
|
4.00000 |
3.35934 |
0.83984 |
|
2
|
4.00000 |
3.35934 |
0.83984 |
|
3
|
4.00000 |
3.35934 |
0.83984 |
+-----------+---------------+---------------+---------------+
STOP AFTER ITERATION 3. RELATIVE INCREASE OF INTER-CLUSTER INERTIA
WITH RESPECT TO THE PREVIOUS ITERATION IS ONLY 0.000 %.
INERTIA DECOMPOSITION
COMPUTED ON
4 AXES.
+------------------+-----------------+-------------+-------------------+-----------------+
|
|
INERTIAS
|
COUNTS
|
WEIGHTS
|
DISTANCES
|
| INERTIAS
| BEFORE
AFTER |BEFORE AFTER | BEFORE
AFTER | BEFORE
AFTER |
+------------------+-----------------+-------------+-------------------+-----------------+
|
|
|
|
|
|
| INTER-CLUSTER
| 3.2960
3.3593 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| INTRA-CLUSTER
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| CLUSTER
1 / 3 | 0.0509
0.1317 |
2
3 |
2.00
3.00 | 3.0174
1.9186 |
| CLUSTER
2 / 3 | 0.5265
0.3822 |
12
11 |
12.00
11.00 | 0.6979
0.8789 |
| CLUSTER
3 / 3 | 0.1267
0.1267 |
2
2 |
2.00
2.00 |19.1629 19.1629 |
|
|
|
|
|
|
| TOTAL INERTIA
| 4.0000
4.0000 |
|
|
|
+------------------+-----------------+-------------+-------------------+-----------------+
RATIO INTER INERTIA / TOTAL INERTIA) : BEFORE .. 0.8240
AFTER .. 0.8398
COORDINATES AND TEST-VALUES AFTER CONSOLIDATION
AXES 1 A 4
+---------------------------------------------+-------------------------------+------------------------------------+----------+
|
CLUSTERS
|
TEST-VALUES
|
COORDINATES
|
|
|---------------------------------------------|-------------------------------|------------------------------------|----------|
| IDEN - LABEL
COUNT ABS.WT. |
1
2
3
4
0
|
1
2
3
4
0
| DISTO. |
+---------------------------------------------+-------------------------------+------------------------------------+----------+
|
3 CLUSTERS
|
|
|
3
3.00 | -0.5
3.2
0.2 -0.7
0.0 | -0.43
1.31
0.05 -0.06
0.00 |
1.92 |
11
11.00 |
2.9 -1.8 -0.2
0.4
0.0 |
0.91 -0.24 -0.02
0.01
0.00 |
0.88 |
2
2.00 | -3.6 -1.2
0.1
0.3
0.0 | -4.33 -0.64
0.03
0.03
0.00 |
19.16 |
+---------------------------------------------+-------------------------------+------------------------------------+----------+
COMPOSITION OF: CUT "a" OF THE TREE INTO
3 CLUSTERS
Cluster 1 / 3
SS
MC
IF
Cluster 2 / 3
SB
WSB
JRC
JRH
SJ
CR
UO
LO
DP
PZ
AF
Cluster 3 / 3
GH
GL
MEMBERSHIP OF EACH CASE TO : CUT "a" OF THE TREE INTO
3 CLUSTERS
SS
: 1 SB
: 2 WSB : 2 JRC : 2 JRH : 2 SJ
: 2
CR
: 2 UO
: 2 LO
: 2 DP
: 2 PZ
: 2 MC
: 1
IF
: 1 AF
: 2 GH
: 3 GL
: 3
CLUSTERS REPRESENTATIVES
CLUSTER
1/ 3
COUNT:
3
-----------------------------------------------------------------------------|RK | DISTANCE | IDENT.
|
+---+-----------+------------------------------------------------------------+
| 1|
0.30166|SS
|
| 2|
0.86216|IF
|
| 3|
0.94386|MC
|
+---+-----------+------------------------------------------------------------+
CLUSTER
2/ 3
COUNT:
11
------------------------------------------------------------------------------
|RK | DISTANCE | IDENT.

|
+---+-----------+------------------------------------------------------------+
| 1|
0.02829|CR
|
| 2|
0.15008|DP
|
| 3|
0.19373|PZ
|
| 4|
0.21049|SJ
|
| 5|
0.38784|WSB
|
| 6|
0.38977|JRC
|
| 7|
0.38977|JRH
|
| 8|
0.66536|UO
|
| 9|
0.66934|LO
|
| 10|
1.39576|AF
|
+---+-----------+------------------------------------------------------------+
CLUSTER
3/ 3
COUNT:
2
-----------------------------------------------------------------------------|RK | DISTANCE | IDENT.
|
+---+-----------+------------------------------------------------------------+
| 1|
1.01356|GH
|
| 2|
1.01356|GL
|
+---+-----------+------------------------------------------------------------+
DISTANCE'S MATRIX BETWEEN CLUSTERS
|
1
2
3
-----+--------------------------1 |
0.000
2 |
2.054
0.000
3 |
4.360
5.251
0.000
-----+--------------------------|
1
2
3

Analisis de Componentes Pples Biología

Enviado por

Dados do documento

Título original

Direitos autorais

Formatos disponíveis

Compartilhar este documento

Compartilhar ou incorporar documento

Opções de compartilhamento

Você considera este documento útil?

Este conteúdo é inapropriado?

Direitos autorais:

Formatos disponíveis

Analisis de Componentes Pples Biología

Enviado por

Direitos autorais:

Formatos disponíveis

ANLISIS DE COMPONENTES PRINCIPALES

Qu es el Anlisis de componentes principales (ACP)?

Qu se busca con un anlisis de componentes principales (ACP)?

Evaluar la semejanza de los individuos a travs de las variables consideradas.

Tabla 1. Edad (aos)

Tabla 2. Edad (aos) y Estatura (cm)

Figura 2. Edad (aos) vs. Estatura (cm)

Tabla 3. Edad (aos), Estatura (cm) y Peso (kg)

Figura 3. Edad, Peso y Estatura

Figura 5. Histograma de valores propios

COORDONNEES DES VARIABLES SUR LES AXES 1 A 3

0.00 | -0.93 -0.25

0.00 | -0.65 -0.27

0.00 | -0.93 -0.25 -0.27

0.00 | -0.65 -0.27 -0.71

Tabla 4. Coordenadas de los individuos en el nuevo sistema de coordenadas

Mara Gonzal Luca

lvaro Eduard Hernan Anita Marian David

Figura 7. Representacin de los puntos individuos en el espacio de componentes

Plot of PCOMP_2 vs PCOMP_1

Para Pedro en el eje 3 = (coordenada en el factor 3)2 = 0,32

Figura 11. Variables activas e individuos en el Primer plano factorial

La variable Peso y estatura se encuentran correlacionadas de manera directa, la Edad es independiente de

Precio de la libra (centavos

a) Cules son las 3 marcas de caf ms caras? Y las ms baratas?

Qu tipo de anlisis de componentes principales sugiere usted en este caso, el de descomposicin

Ejercicio 3. SITUACION SOCIO-ECONMICA EN LATINO AMRICA

Los datos se muestran adelante.

PNB GPI ACC T_MORT T_ALF PR

CT TF DEUD CARGA ESS

5916 0,881 2620

5099 0,864 1950

4295 0,832 2380

6169 0,824 2560

2790 0,641 1090

2622 0,592 1100

Longitud Extensin alas Long pico-cabeza Long hmero Long quilla

Determine el nmero de ejes a retener.

PRINCIPAL COMPONENTS ANALYSIS

Anlisis de clasificacin jerrquica

Hier ar chi cal Cluster Anal ysis ( on factors)

DESCRIPTION AND CHARACTERISATION OF PARTITIONS

Ejercicio 5. Los siguientes datos (Manly, 1986, pg 165) corresponden a mediciones

Porc gen Porc gen

PRINCIPAL COMPONENTS ANALYSIS

Hier ar chi cal Cluster Anal ysis ( on factors)

DESCRIPTION AND CHARACTERISATION OF PARTITIONS

|RK | DISTANCE | IDENT.

Você também pode gostar