Escolar Documentos
Profissional Documentos
Cultura Documentos
Biodegradação Por Bactérias
Biodegradação Por Bactérias
Belo Horizonte
2007
em
Microbiologia
Ambiental
Industrial.
Belo Horizonte
2007
AGRADECIMENTOS
Agradeo primeiramente a Deus por sempre iluminar meus caminhos e pela proteo nos
momentos difceis.
A minha me Neuza, meu pai Welington e irmzinha Dani, por todo apoio, carinho e amor de
uma vida. Sem eles, nada disso teria sido possvel. Aos avs, padrinhos, tios e primos, por
sempre terem acreditado em mim e por todo o amor e mimo de sempre.
Ao Lorenzo e s amigas queridas, Taty, Carolinas (Little e Degols), Fabi, Nana, Bia, pelo
amor e compreenso, principalmente nos momentos de ausncia, pela fora, nos momentos
mais difceis. Obrigada por fazerem minha vida mais repleta de alegria.
A minha orientadora, Profa. Vera Lcia dos Santos, agradeo pela orientao e incentivo a
percorrer novos caminhos, e aos demais professores do curso de Especializao, pela
contribuio para minha formao, pela pacincia e dedicao.
A todos os colegas do curso de Especializao, em especial, Lcia, Clber, Vivi e Lo, por
terem tornado as sextas e sbados de estudo momentos menos rduos. Obrigado pela tima
convivncia, amizade e cooperao.
Aos colegas do Laboratrio de Sade Pblica / gua e do FAS, pela alegria do dia-a-dia e
pela compreenso e apoio nos momentos de sufoco.
A Universidade Federal de Minas Gerais pela bolsa de estudo, tornando possvel a
concretizao de mais uma etapa da minha vida profissional.
A todos que de alguma forma contriburam para que este momento fosse possvel, meu muito
obrigado.
RESUMO
RESENDE, A.A. (2007) Mecanismos gerais de degradao bacteriana dos compostos
hidrocarbonetos monoaromticos: benzeno, tolueno, etilbenzeno e xileno (BTEX). Belo
Horizonte, 2007. Monografia (Especializao), Departamento de Microbiologia do Instituto
de Cincias Biolgicas, Universidade Federal de Minas Gerais.
SUMRIO
1 INTRODUO ............................................................................................................. 01
2 DESENVOLVIMENTO ............................................................................................. 03
2.1 Os BTEX e suas principais fontes .................................................................................. 03
2.2 Tratamento de stios contaminados ............................................................................... 06
2.2 A BIODEGRADAO DOS COMPOSTOS BTEX ................................................................... 08
2.2.1 As bactrias como agentes da degradao dos compostos BTEX ..................... 08
2.2.2 As vias de degradao bacteriana dos BTEX ...................................................... 12
2.2.2.1 Vias aerbias de biodegradao do BTEX ..................................................... 13
2.2.2.1.1 Etapas iniciais de degradao aerbia dos BTEX ..................................... 14
2.2.2.1.2 Oxidao dos intermedirios centrais da degradao aerbia dos BTEX ..19
2.2.2.2 Vias anaerbias de biodegradao do BTEX .................................................. 21
2.2.2.2.1 Etapas iniciais de degradao anaerbia dos BTEX ................................. 23
2.2.2.2.2 Oxidao dos intermedirios centrais da degradao anaerbia dos BTEX
................................................................................................................................... 28
2.2.3 Mecanismos de regulao enzimtica das vias catablicas relacionadas
degradao bacteriana dos BTEX ................................................................................ 29
2.3 A
BIORREMEDIAO
COMO
ALTERNATIVA PARA
TRATAMENTO
DE
REAS
3 CONCLUSO ............................................................................................................... 44
4 REFERNCIAS BIBLIOGRFICAS ................................................................. 46
LISTA DE FIGURAS
LISTA DE TABELAS
Tabela
Parmetros fsico-qumicos de
importncia
para
mobilidade
de
hidrocarbonetos........................................................................................................................ 06
Tabela 2 Principais grupos de bactrias envolvidas na degradao dos hidrocarbonetos
monoaromticos do grupo BTEX ........................................................................................... 10
Tabela 3 Protenas regulatrias representativas envolvidas no metabolismo dos
BTEX....................................................................................................................................... 31
1 INTRODUO
de
biorremediao.
biorremediao
fundamenta-se
na
utilizao
de
2 DESENVOLVIMENTO
(b)
(c)
CH3
CH2 CH3
Benzeno
Tolueno
Etilbenzeno
(d)
(e)
(f)
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
orto-xileno
meta-xileno
para-xileno
Figura 1 Estruturas qumicas das molculas dos compostos BTEX. (a) Benzeno, (b) tolueno,
(c) etilbenzeno (d) orto-xileno, (e) meta-xileno e (f) para-xileno.
Log Kaow
2,12
2,73
2,95-3,26
4,67
6,69
7,24
depressores do sistema nervoso central, podendo levar a alteraes nas capacidades motoras e
neurolgicas, bem como alteraes nos sistemas endcrinos e enzimticos (revisado por
TIBURTIUS et al., 2004).
No apenas o contato direto com os hidrocarbonetos monoaromticos prejudicial sade do
homem. Organismos aquticos (flora e fauna) so capazes de absorver ou ingerir tais
compostos, armazenando os mesmos em suas molculas proticas e reservas lipdicas. No
tecido adiposo, os hidrocarbonetos encontram-se inalterados, levando a um processo de
transferncia na cadeia alimentar, at atingir o homem. A ingesto e acmulo de
hidrocarbonetos em doses muitas vezes pequenas podem acarretar em processos de
intoxicao crnica, trazendo srias implicaes para a pesca, sade pblica e meio ambiente
(SILVA et al., 2002).
O tratamento desses poluentes pode ser realizado atravs de processos fsicos, qumicos e
biolgicos. s vezes, o tratamento exige a remoo do solo ou gua contaminados, podendo
ser realizado, em outras circunstncias, no prprio local.
O carvo ativado muito utilizado para remoo de contaminantes orgnicos, por meio do
processo de adsoro. Outro processo utilizado para remoo de compostos orgnicos pouco
polares, chamado air striping, consiste na injeo de ar dentro do aqfero contaminado, a
transferncia dos contaminantes volteis para a fase gasosa e sua separao por um sistema de
extrao de vapor. Esses processos so eficientes, entretanto, no so destrutivos. O carvo
ativado gera fases slidas saturadas com contaminantes, enquanto o air striping libera gases
txicos (TIBURTIUS et al., 2004).
Um processo qumico muito usado a oxidao cataltica, em que o ar aquecido a 300500C por um tempo curto. Esse processo dispendioso pelo alto gasto de energia e uso de
catalisadores de elevado custo, como a platina (KIM, 2002). Entre outros processos fsicos e
qumicos existentes, podemos citar: a utilizao de radiao, como microondas (CHIH-JU &
TAI, 1998); e o emprego de radicais livres hidroxilas (OH) em processos oxidativos
avanados, utilizando oznio, perxido de hidrognio, semicondutores, reagente de Fenton e
radiao ultravioleta (FREIRE et al., 2000; WATTS et al., 2000).
Devido s limitaes dos diferentes mtodos citados anteriormente, para que a remoo seja
efetiva, vrios processos devem ser usados em conjunto, o que acaba elevando o custo e
tempo do tratamento. Uma alternativa promissora aos processos citados anteriormente a
degradao biolgica dos contaminantes, chamada de biorremediao. Segundo Tiburtius et
al. (2004), a biorremediao um dos processos mais utilizados para a remoo dos BTEX e
fundamenta-se na utilizao de microrganismos capazes de degradar os compostos orgnicos,
decompondo os mesmos em molculas mais simples como CO2, CH4 e H2O (mineralizao).
um processo de custo relativamente baixo e alta eficincia.
A biorremediao s possvel graas versatilidade microbiana, no que diz respeito s vias
catablicas, enzimas envolvidas e capacidade de adaptao. As principais vias catablicas de
degradao dos compostos BTEX por bactrias sero abordadas nos captulos posteriores. No
captulo 3 tambm ser abordado o tema da biorremediao com maior ateno.
Durante a primeira metade do sculo XX, um extenso nmero de vias bioqumicas, tanto de
biossntese quanto de degradao, foi elucidado, e os microrganismos se tornaram exemplos
primos da versatilidade da vida. Apenas entre estes seres vivos podem ser observados
exemplos de tolerncia a ambientes extremos, cujas temperaturas beiram as de congelamento
e ebulio da gua, ou cujos valores de pH so capazes de ir de um ponto extremo a outro na
escala.
No apenas a capacidade de sobreviver em ambientes extremos ilustra a versatilidade
microbiana, mas tambm a rapidez com a qual os microrganismos so capazes de se adaptar e
modificar seu aparato enzimtico face s novas mudanas ambientais, produzindo uma larga
variedade de tipos fisiolgicos conhecidos hoje (PALLERONI, 1995). Somente entre os
microrganismos, possvel encontrar atividades catablicas de grande interesse, que
permitam, por exemplo, atividades como a biorremediao de ambientes altamente
contaminados por compostos orgnicos recalcitrantes que so txicos para outras formas de
vida superiores.
Desde 1945, Claude Zobell j afirmava que os mltiplos efeitos das bactrias na formao e
transformao dos hidrocarbonetos do petrleo seriam uma nova fronteira de conhecimento
(revisado por CHAKRABORTY & COATES, 2004). Hoje, de conhecimento que grande
parte das modificaes na composio dos compostos orgnicos presentes no ambiente,
incluindo componentes do petrleo e produtos de seu processamento, acontece devido
atividade microbiana. Em geral, os hidrocarbonetos do petrleo so degradados na seguinte
ordem: n-alcanos > alcanos monocclicos > alquil benzenos > alcanos isoprenides > alquil
naftalenos > alcanos bicclicos > esteranos > hopanos (SUN et al., 2005). Essa alterao pode
dar-se em espaos de tempo relativamente curtos, desde alguns meses at alguns anos
(JOVANCICEVIC et al., 2005).
Diversos estudos tm relatado os processos de biodegradao de hidrocarbonetos aromticos e
os microrganismos envolvidos na degradao desses compostos sob condies ambientais
diversas, tais como: ambientes marinhos (HARAYAMA et al., 2004; COHEN, 2002; HEAD
& SWANNELL, 1999) e continentais, guas de superfcie (ANTIC et al., 2006) e
subterrneas, solos e sedimentos (CAVALCA et al., 2000; PHELPS & YOUNG, 1999),
condies aerbias e anaerbias (ZHANG & BENNETT, 2005; CHAKRABORTY &
COATES, 2004; HOLLIGER & ZEHNDER, 1996), ambientes extremos (MARGESIN &
SCHINNER a,b, 2001).
As bactrias possuem uma ampla capacidade de degradar os hidrocarbonetos aromticos do
grupo BTEX. Muitos outros microrganismos apresentam a capacidade de degradao desses
compostos, entre eles organismos eucariotos como fungos, algas, entre outros, que tambm
tm um papel importante nos processos de detoxificao de ambientes contaminados. Devido
s facilidades de estudo sob condies laboratoriais das propriedades bioqumicas e genticas
nas bactrias, grande parte das vias foram elucidadas atravs de investigaes utilizando esse
grupo de microrganismo. Alm disso, as alteraes genticas so rapidamente expressas nos
procariotos, devido natureza haplide de seus genomas. Essa caracterstica favorece a
realizao de testes genticos, com a finalidade de elucidar a funo de genes e protenas
envolvidas nas vias de degradao bacteriana (PALLERONI, 1995).
Na literatura, encontram-se descritos vrios processos de degradao utilizando bactrias em
culturas puras ou em consrcios. Os consrcios bacterianos tm especial importncia na
degradao de compostos aromticos considerados recalcitrantes, na detoxificao de stios
contaminados por vrios compostos diferentes (misturas) e na degradao de contaminantes
em ambientes adversos (ZHANG & BENNETT, 2005). Isso porque, muitas vezes, uma nica
espcie no possui todo o aparato enzimtico capaz de promover a degradao completa do
composto orgnico, gerando intermedirios que so metabolizados por outras espcies.
A Tabela 2 traz alguns exemplos de bactrias que, em cultura pura, foram capazes de
metabolizar alguns dos compostos BTEX. Algumas delas apresentaram a capacidade de
metabolizar at mais de um composto.
Como ser observado posteriormente, grande parte das vias de degradao aerbia dos
compostos BTEX foram elucidadas atravs de investigaes utilizando as bactrias do gnero
Pseudomonas, que acabaram se tornando modelos de estudo. As bactrias desse gnero
apresentam grande versatilidade metablica relatada na literatura desde o incio do sculo,
podendo utilizar at 100 diferentes fontes de carbono, incluindo hidrocarbonetos alifticos,
Condies
Anaerbia Nitrato
redutoras
Aerbia
Aerbia
Aerbia
Referncia
Coates et al (2001)
Alvarez & Vogel (1991)
Kukor & Olsen (1996)
Li et al. (2006)
Aerbia
Aerbia
Aerbia
Aerbia
Aerbia
Aerbia
Aerbia
Anaerbia Fe(III)
redutora
Anaerbia Fe(III) e
nitrato redutoras
Anaerbia Fe(III) e
sulfato redutoras
Anaerbia Fe(III)
redutora
Anaerbia Nitrato
redutoras
Etilbenzeno
Linhagens EbN1 e EB1,
relacionadas ao gnero
Thauera
Proteobacteria marinha,
linhagem EbS7
Pseudomonas sp. NBM21
Anaerbia Sulfato
redutoras
Aerbia
Xilenos
Linhagem oXyS1, relacionadas
s espcies Desulfobacterium
acetonicum e
Desulfosarcina variabilis
Linhagem mXyS1, do grupo
Proteobacteria
Thauera spp. e Azoarcus spp.
Pseudomonas sp. NBM21
Anaerbia Sulfato
redutoras
Anaerbia Nitrato
redutoras
Aerbia
molecular atua no apenas como um aceptor de eltrons na cadeia respiratria, mas tambm
como um agente reativo na oxidao da molcula (BOSSERT & COMPEAU, 1995). Por
outro lado, os processos de degradao de hidrocarbonetos em condies anaerbias tm
grande importncia, principalmente em ambientes contaminados, com depleo de oxignio.
Nos itens a seguir, sero descritas as principais vias de degradao dos hidrocarbonetos
aromticos BTEX, em ambas as condies: aerbia e anaerbia.
O2
H2 O
H2 O
O
NADH
NAD +
Benzeno
OH
H
xido Areno
O2
(b)
Benzeno
NAD +
NAD
NADH
OH
H
Cis-dihidrodiol
OH
Catecol
Trans-dihidrodiol
OH
OH
NADH
OH
OH
H
NAD
NADH
OH
Catecol
Figura 2 Ataque inicial do benzeno por oxigenases. (a) A reao catalisada por uma
monooxigenase, que introduz um tomo de oxignio no anel aromtico, produzindo um xido
areno, que, atravs de uma hidratao, forma um trans-dihidrodiol, convertido posteriormente
a catecol. (b) A reao catalisada por uma dioxigenase, que introduz dois tomos de
oxignio no anel, formando diretamente o cis-dihidrodiol, convertido por uma desidrogenao
a catecol. As molculas de catecol produzidas so degradadas pelas vias de orto e meta
clivagem.
CHO
CH2OH
COO
COO OH
OH
H
OH
(a)
Benzillcool
TOL
Benzaldedo
Benzoato
Cis-benzoato
dihidrodiol
H
OH
(b)
OH
OH
Cis-tolueno
dihidrodiol
3-M etilcatecol
CH3
OH
TOM
OH
(c)
3-M etilcatecol
Tolueno
CH3
CH3
OH
(d)
m-cresol
T4MO
CH3
Metaclivagem
OH
o-cresol
TBU
Metaclivagem
OH
CH3
CH3
OH
CH3
CH3
TOD
Catecol
Metaclivagem
OH
Metaclivagem
OH
3-M etilcatecol
CH2OH
CHO
COO
COOH
Ortoclivagem
(e)
OH
OH
p-cresol
OH
p -Hidroxi
benzil lcool
OH
p-Hidroxi
benzaldedo
OH
p-Hidroxi
benzoato
OH
Protocatecuato
Figura 3 Reaes envolvidas na primeira etapa das vias de degradao aerbia de tolueno.
(a) A via TOL tem como produto inicial um benzil lcool, que aps oxidao a cido
benzico, convertido a dihidrodiol e consecutivamente, a catecol. As via TOD (b), TOM (c)
e TBU (c) so iniciadas pela oxidao direta do anel, formando produtos convertidos
posteriormente a 3-metilcatecol. Tambm a via T4MO (e) iniciada por hidroxilao do anel,
formando, no entanto, uma molcula de protocatecuato. As molculas de catecol, 3metilcatecol e protocatecuato so metabolizadas por meta ou orto clivagem, produzindo
intermedirios centrais do ciclo de Krebs (Modificada de GLENSOY & ALVAREZ, 1999).
Nas vias descritas a seguir, a degradao do tolueno iniciada pela hidroxilao do anel
aromtico, levando formao dos intermedirios centrais 3-metilcatecol (vias TOD, TOM e
TBU), degradado posteriormente pela via de meta clivagem, e protocatecuato (via T4MO)
degradado pela via de orto clivagem.
A via catablica TOD, descoberta na bactria P. putida F1, inclui a enzima tolueno
dioxigenase, que adiciona dois tomos de oxignio ao anel benznico. Essa reao leva
formao do cis-tolueno dihidrodiol, que convertido a 3-metilcatecol por uma reao de
desidrogenao (GIBSON et al., 1968) (Figura 3b).
A via catablica TOM foi elucidada em Burkholdderia cepacia G4 (inicialmente denominada
P. cepacia G4), que utiliza a enzima tolueno orto-monooxigenase no ataque inicial da
molcula, originando um o-cresol (SHIELDS et al., 1989) (Figura 3c). De forma similar, na
via catablica TBU, descrita em B. pickettii PK01 (inicialmente denominada P. pickettii
PK01), esta etapa catalisada pela enzima tolueno meta-monooxigenase para formar um mcresol (KUKOR & OLSEN, 1996) (Figura 3d).
Finalmente, a via catablica T4MO ocorre em P. mendocina KR1, que utiliza a enzima
tolueno para-monoxigenase para formar um p-cresol (WHITED & GIBSON, 1991) (Figura
3e). O p-cresol convertido a p-hidroxibenzil lcool, que, assim como na via TOL, oxidado
a p-hidroxi benzoato. Essa molcula convertida posteriormente a protocatecuato.
Alquil benzenos maiores como o etilbenzeno, isopropil, n-butil, entre outros, so degradados
por Pseudomonas putida atravs da oxidao do anel benznico. Em geral, esse processo
lento, e os produtos formados inicialmente so cis-dihidrodiis, como descrito na via TOD de
degradao de tolueno. No caso do etilbenzeno, o produto da primeira etapa da via o
etilcatecol, metabolizado pela via de meta clivagem (WRENN, 1998) (Figura 4).
Quanto aos benzenos dialquil substitudos, como os xilenos, existem algumas diferenas
quanto degradao de seus ismeros orto, meta e para. As molculas de m-xileno e p-xileno
so convertidas a dimetilcatecis, que no so clivados pela catecol 2,3 dioxigenase de P.
putida, e, portanto, no so metabolizados pela via de meta clivagem. J a Nocardia corallina
capaz de metabolizar pela via de orto clivagem o produto inicial da degradao do p-xileno,
o 3,6-dimetilcatecol. Entretanto, apresenta como produto final da via o 2,5-dimetil-cis,ciscido mucnico, no atingindo a mineralizao do composto aromtico (JAMISON et al,
1969).
CH2CH3
CH2CH3
CH2CH3
H
OH
OH
Metaclivagem
OH
OH
H
Cis-etilbenzeno
dihidrodiol
Etilbenzeno
3-etilcatecol
Nocardia sp. capaz de crescer em o-xileno, degradando inicialmente esse composto atravs
da hidroxilao do anel, produzindo 3,4-dimetilcatecol. Essa bactria capaz de oxidar o 3,4dimetilcatecol pela via de meta-clivagem, formando cido actico, propionaldedo e piruvato.
Entretanto, esta bactria uma exceo tanto em relao sua capacidade de oxidao de
dimetilcatecis pela via de meta-clivagem, quanto capacidade de crescer em o-xilenos
(WRENN, 1998).
Quanto degradao dos meta e para xilenos, a primeira etapa da via de degradao
compreende a oxidao do grupo metil, produzindo 3-metil benzoato, e a conseguinte
oxidao do anel aromtico, mecanismo semelhante ao observado na via TOL de degradao
do tolueno. A insero do oxignio ocorre no tomo de carbono ligado ao grupo carboxila. As
reaes de descarboxilao e desidrogenao que se seguem, transformam o diol em
metilcatecol (RIBBONS & EATON, 1982) (Figura 5).
CH2OH
CH3
CH3
m-xileno
CHO
CH3
CH3
3-metil benzil
lcool
COO
3-metil
benzaldedo
COO OH
CH3
3-metil
benzoato
OH
H
OH
CH3
OH
3-metil
cis-benzoato
dihidrodiol
Metaclivagem
CH3
3-metilcatecol
OH
(a)
Catecol 1,2dioxigenase
ORTOCLIVAGEM
Catecol 2,3dioxigenase
OH
COOH
(b)
CHO
COOH
Catecol
O2
O2
METACLIVAGEM
COOH
OH
Cis,cis-muconato
2-hidroximucnico
semialdedo
H2O
O
COOH
HCOOH
C O
COOH
Muconolactona
O
2-oxipenta-4-enoato
COOH
H2O
3-oxoadipato enol-lactona
COOH
O
HO
COOH
4-hidroxi-2-oxi-valerato
COOH
3-oxoadipato
COOH
CH2
COOH
Succinato
CH3
Acetaldedo
CO
SCoA
COOH
O
Piruvato
Acetil-CoA
Figura 6 Degradao do catecol, intermedirio comum das vias de degradao dos BTEX,
pelas vias de orto e meta clivagem. (a) Na via de orto-clivagem, a quebra do catecol se d
entre as hidroxilas do catecol, enquanto na via de meta clivagem (b), a quebra do anel se d
prximo s duas hidroxilas do anel aromtico, sendo as reaes subsequentes ditadas pela
natureza do produto da fisso do anel.
solos,
sedimentos e
biorreatores,
entre
outros
Respirao
Processo
aerbio
O2
Potencial
redox (mV)
Energia
G0 (kJ)
H2O
Aerbia
(Pseudomonas)
+ 800
- 3174,4
Desnitrificao
(Azoarcus)
+ 430
- 2977,3
Reduo Fe (III)
(Geobacter)
+ 100
- 3043,3
Reduo Sulfato
(Dessulfobacterium)
- 270
- 185,4
Metanognese
(Methanospirillium)
- 400
- 124,3
CO2
Massa celular
Processo
anaerbio
NO3
NO2 (N2)
CO2
Massa celular
3+
Fe
Hidrocarbonetos
aromticos
2+
Fe
CO2
Massa celular
SO4
Compostos
orgnicos
H2S
CO2
Massa celular
Massa celular
+
Fermentao
2-
H , CO2
H2, CH4
cidos orgnicos
(ex. acetato)
CO2
Massa celular
COO
COO
2[H]
Succinato
COOH
CO
CoA
Fumarato
CH3
COO
COO
2[H]
COOH
Tolueno
COOH
Fenilitaconato
Belzilsuccinato
CO
CoA
H2O
COO
Succinil-CoA
CoA
CO
CoA
CO
HS
CoA
HO
COO
CO2
Benzoil-CoA
2[H]
2-carboximetil3-hidroxifenilpropionil-CoA
(a)
OH
O
OH
SCoA
SCoA
CO 2
H2O 2[H]
(b)
COO
benzoil
acetil-CoA
benzoil acetato
acetofenona
(S)-(-)-1-feniletanol
etilbenzeno
Acetil-CoA
CO 2
2[H]
COO
HSCoA
COO
etilbenzeno
COO
COO
SCoA
2-(fenilpropil)
malonil-CoA
succinil-CoA
CO 2
SCoA
degradao
posterior
O
2-fenilpropionil-CoA
Ciclo
de
Krebs
SCoA
O
1-(feniletil) O
fumarato
COO
Rearranjo
1-(feniletil)
succinato
Benzoil-CoA
HSCoA
SCoA
O
3-oxo-4-fenilpentanoil-CoA
H2O
SCoA
O
2[H]
2[H]
4-fenilpentanoil-CoA
SCoA
acetil-CoA
Figura 10 Etapas iniciais da via de degradao anaerbia do etilbenzeno. (a) Via proposta
para degradao anaerbia sob condies denitrificantes. (b) Via proposta para degradao
anaerbia sob condies sulfato redutoras. Figura modificada de Harayama et al. (2004).
anteriormente, pode ser justificada pela diferena entre os potenciais de redox dos respectivos
aceptores de eltrons nitrato e sulfato (Figura 7) (KNIEMEYER et al., 2003).
A degradao anaerbia dos trs ismeros estruturais do dimetilbenzeno (meta, orto e para
xilenos) tem sido predominantemente estudada sob condies nitrato e sulfato redutoras. A
completa mineralizao por culturas microbianas tem sido relatada para todos os xilenos, com
exceo do p-xileno, cujos estudos de biodegradao na ausncia de oxignio esto
relacionados a consrcios bacterianos (ZHANG & BENNETT, 2005).
As reaes iniciais envolvidas na oxidao anaerbia do m-xileno so similares s de
degradao do tolueno e envolvem a adio inicial de uma molcula de fumarato em um dos
grupos metil para formar 3-metilbenzilsuccinato, que posteriormente oxidado a 3metilbenzoato (Figura 11). A adio do fumarato catalisada pela enzima 3metilbenzilsuccinato sintase, que, assim como a benzilsuccinato sintase (degradao do
tolueno), retm um tomo de hidrognio do grupo metil durante a reao. De forma
semelhante o o-xileno oxidado (Figura 11) (KRIEGER, 1999).
-
OOC
CH
CH2
COO
fumarato
CH3
OOC
CH
COO
CH
CH3
CH2
CH3
3-metilbenzilsuccinato
m-xileno
-
OOC
CH
CH2
CH2
COO
fumarato
CH3
OOC
CH
CH
CH3
o-xileno
COO
CH3
2-metilbenzilsuccinato
Figura 11 Etapas iniciais das vias de degradao das molculas m-xileno e o-xileno. A
degradao dos xilenos ocorre inicialmente atravs da reao de adio do fumarato a um dos
grupos metil, produzindo o metilbenzilsuccinato correspondente. A formao do
intermedirio benzoil-CoA, a partir dessa molcula, semelhante ao ocorrido na via de
degradao anaerbia do tolueno (Figura 9).
2.2.2.2.2 OXIDAO
BTEX
O produto intermedirio comum das vias de degradao anaerbia dos BTEX o benzoilCoA. O anel aromtico do benzoil-CoA reduzido pela benzoil-CoA redutase e,
posteriormente, clivado por hidrlise (HARAYAMA et al., 2004). A molcula formada
degradada por -oxidao, produzindo trs moles de acetil-CoA, um metablito central do
ciclo de Krebs, e um mol de CO2 para cada mol de hidrocarboneto, como mostrado na Figura
12 (HOLLIGER & ZEHNDER, 1996).
SCoA
SCoA
C
SCoA
SCoA
C
C
O
COOH
3 Acetil-CoA
+ CO
2
Benzoil-CoA
4e
REDUO
H2O
HIDRLISE
-OXIDAO
Via de degradao
Bactria/Plasmdeo
Referncia
54
Famlia -dependente
TbuT
TouR
Tolueno
Tolueno
XylR
Tolueno/xileno
R. pickettii PKO1
P. stutzeri OX1
P. putida mt-2 (TOL
pWW0)
P. putida F1
TodS/
TodT
Tolueno
PobC
XylS
4-Hidroxibenzoato
BenR
Benzoato
P. putida WCS358
P. putida mt-2 (TOL
pWW0)
P. putida
Catecol
P. putida
Tolueno
Famlia LysR
CatR
R. Ralstonia e P. Pseudomonas
(MAcGREGOR et al., 1991). Morales et al. (2004) demonstrou que a protena Crc
(catabolite repression control), a primeira descrita, est envolvida no apenas no controle da
expresso de genes implicados no metabolismo de alguns acares e compostos nitrogenados,
mas tambm na expresso de genes pertencentes a vias centrais relacionadas com o
metabolismo de compostos aromticos. Entre os genes modulados negativamente pelo Crc
esto alguns requeridos para assimilao do benzoato, pela via do catecol, e do 4-OHbenzoato, pela via do protocatecuato.
Alm dos mecanismos de resposta especfica e global, Shingler (2003) relata um terceiro
nvel de regulao em que os compostos aromticos podem impactar o desempenho do
catabolismo provocando respostas comportamentais. Respostas quimiotticas presena de
compostos aromticos tm sido descritas sendo induzidas coordenadamente com os genes
relacionados ao seu catabolismo, sugerindo uma estratgia bacteriana integrada para se
locomover em direo aos compostos aromticos e degrad-los (Figura 13) (PANDEY &
JAIN, 2002, PARALES & HARWOOD, 2002).
O mecanismo da quimiotaxia complexo e envolve muitas protenas. As bactrias empregam
um tipo de sistema de dois componentes para detectar as alteraes na concentrao de um
agente qumico, regulando assim, a movimentao flagelar. No sistema de dois componentes,
o sinal externo no diretamente transmitido protena regulatria, sendo detectado
primeiramente por uma protena sensora especfica e, ento, transmitido de forma alterada a
uma protena reguladora de resposta (MADIGAN et al., 2004).
As protenas sensoras envolvidas no mecanismo da quimiotaxia so denominadas protenas
quimiotticas aceptoras de metil (PQM), sendo todas protenas transmembranas. A
maquinaria quimiottica de algumas bactrias envolve vrias protenas: em P. putida j foram
relatadas 25 ou mais PQMs, em comparao com as cinco enzimas relatadas em E. coli
(PARALES & HARWOOD, 2002). As enzimas PQMs esto em contato com as protenas
citoplasmticas, CheA e CheW. Ao se ligar a um agente qumico, as PQMs transmitem o sinal
detectado, juntamente com CheW, atravs de mudanas conformacionais para a protena
citoplasmtica CheA, uma enzima histidina autoquinase que atua como doadora do grupo
fosforil para outras protenas reguladoras de resposta, que atravs de uma cascata de
fosforilao, afetam o movimento de rotao flagelar (MADIGAN et al., 2004).
Em alguns casos, os componentes sensoriais de resposta a compostos aromticos so cotranscritos com os genes requeridos para o seu catabolismo. Esse o caso do componente
sensorial NahY PQM-similar, relacionado ao sistema de quimiotaxia de P. putida direcionada
ao naftaleno. Em P. putida F1, o tolueno foi capaz de induzir respostas quimiotticas a uma
larga variedade de compostos, inclusive alguns no metabolizados pela via TOD. Nesse
sistema, mutantes defeituosos quanto ao catabolismo do tolueno retiveram a resposta
quimiottica, enquanto a inativao de sistema regulatrio TodS/TodT abolia a resposta
quimiottica (revisado por PARALES & HARWOOD, 2002, SHINGLER, 2003).
Existem vrios trabalhos e revises que tratam dos mecanismos de regulao das vias de
degradao de compostos aromticos (TROPEL & VAN DER MEYER, 2004, MORALES et
al., 2004, PRIETO et al., 2004, SHINGLER, 2003). Trabalhos experimentais de investigao
da capacidade catablica de microrganismos especficos ou grupos de microrganismos
relatam interaes entre substratos aromticos, capazes de aumentar ou diminuir a capacidade
metablica de uma linhagem.
Glensoy & Alvarez (1999) relataram a ocorrncia de interaes benficas ao testar a
capacidade de degradao de BTEX de 55 linhagens de bactrias. Esses autores observaram
que muitas linhagens apresentavam-se incapazes de degradar alguns desses compostos
quando eles estavam isolados no meio, apresentando tal capacidade apenas quando os
mesmos encontravam-se concomitantes, indicando a interao benfica entre os substratos.
As interaes benficas entre substratos podem aumentar a capacidade catablica de diversas
linhagens, possivelmente induzindo enzimas das vias de degradao ou por mecanismos de
co-oxidao. A molcula de tolueno , em geral, um bom indutor de enzimas, sendo capaz de
promover a degradao de outros BTEXs em condies aerbias e desnitrificantes.
Entretanto, j foi reportado que o tolueno, em alguns casos pode ser um inibidor competitivo
da degradao do benzeno (revisado por GLENSOY & ALVAREZ, 1999).
O conhecimento dos mecanismos regulatrios que controlam a expresso das vias catablicas
relacionadas degradao bacteriana dos BTEX de grande importncia para aplicao
desses microrganismos em processos de biorremediao. O entendimento desses mecanismos
permite a obteno de mutantes que perderam a capacidade de inibir a sntese de
determinadas protenas reguladoras e, portanto, que sejam capazes de produzir as enzimas das
2.3 A
BIORREMEDIAO
COMO
ALTERNATIVA PARA
TRATAMENTO
DE
REAS
Por fim, a microbiota disponvel deve apresentar resistncia aos compostos contaminantes e
possuir as vias metablicas para degradao dos mesmos. Todos os fatores citados
anteriormente devem ser analisados em conjunto a fim de decidir se o tratamento dos resduos
deve ocorrer in situ ou ex situ (ex. biorreator), alm de auxiliar na escolha do tipo de
estratgia adotada para o processo de biorremediao (bioestimulao, bioaumentao,
condies aerbias ou anaerbias etc).
A pesquisa de microrganismos com potencial de degradao dos BTEX e das vias
metablicas envolvidas de alta relevncia no apenas para a compreenso dos processos de
biorremediao, mas tambm para a obteno de microrganismos, que podem ser utilizados
como inoculantes, com alto potencial de degradao e caractersticas de adaptabilidade. Alm
disso, o estudo de interferentes dos processos de alta relevncia, visto que o uso dessa
microbiota potencialmente degradadora de hidrocarbonetos requer o entendimento de todos os
aspectos fisiolgicos, microbiolgicos, ecolgicos e bioqumicos envolvidos na transformao
dos poluentes. Assim, possvel desenvolver tcnicas que permitam o uso eficiente desses
microrganismos no campo.
2.3.1 TCNICAS
PROCESSOS DE BIORREMEDIAO
preferencialmente
meios
de
cultura
oligotrficos
para
crescimento
de
0,1%). Wang et al. (1996) isolou a bactria oligotrfica Cycloclasticus oligotrophus capaz de
degradar hidrocarbonetos aromticos, utilizando a mesma tcnica.
Uma segunda explicao da incapacidade de serem cultivados poderia estar relacionada com
o fato de tais microrganismos no serem capazes de crescer em culturas puras, considerando
que requerem para seu crescimento substncias produzidas por outros microrganismos. Alm
desses dois fatores, muitos outros tm sido apontados como interferentes, entre eles a ausncia
de fatores de crescimento, danos por estresses oxidativos e induo da ao de fagos
lisognicos durante perodos de inanio (revisado por HARAYAMA et al., 2004).
Uma variedade de metodologias foi desenvolvida nos ltimos anos para o estudo da estrutura
da comunidade microbiana, dentre outras, a anlise de atividade enzimtica; a anlise de perfil
de protenas celulares, de componentes da parede celular ou da cadeia respiratria, como a
anlise de cidos graxos metil-ester e cidos graxos fosfolipdicos (RAJENDRAN et al.,
1992); e anlise de cidos nuclicos, DNA total ou RNA ribossomal da comunidade
(ANDERSON & CAIRNEY, 2004).
As tcnicas de Biologia Molecular tm permitido uma melhor estimativa da diversidade
microbiana nos ambientes, o que no foi possvel durante muito tempo utilizando apenas as
tcnicas tradicionais de cultivo. Vrias tcnicas moleculares que tm como alvo o estudo do
gene da subunidade 16S do RNA ribossomal (rDNA) de bactrias vm sendo utilizadas.
Os mtodos para a anlise comparativa de seqncias de rDNA incluem, geralmente, etapas
de extrao de DNA da amostra e amplificao das seqncias de interesse pela reao em
cadeia polimerase (PCR), utilizando iniciadores com a especificidade desejada. As seqncias
amplificadas podem ser clonadas e seqenciadas ou analisadas com base em seus perfis
eletroforticos. Por sua vez, os principais mtodos usados para a obteno de perfis
eletroforticos relacionados com a filogenia so a ARDRA ("Amplified rDNA restriction
analysis"), que se baseia no princpio de que os stios de restrio no operon do rRNA so
conservados; a DGGE/TGGE ("Denaturing or temperature gradient gel electrophoresis"), que
fornece informaes sobre a variao na seqncia em uma mistura de fragmentos de PCR de
comprimento idntico com base na mobilidade diferencial em um gel de acrilamida com
gradiente de desnaturante crescente ou de temperatura crescente (EICHNER et al., 1999); a
anlise de polimorfismo de conformao das fitas simples do DNA amplificado (SSCP), que
se baseia na mobilidade eletrofortica diferenciada das estruturas dobradas do ssDNA
2.3.2 EXEMPLOS
2.4 PERSPECTIVAS
3 CONCLUSO
4 REFERNCIAS BIBLIOGRFICAS
ALVAREZ, P.J.J., & VOGEL, T.M. Substrate interactions of benzene, toluene, and paraxielene during microbial degradation by pure cultures and mixed culture aquifer slurries.
Appl. Environm. Microbiol. v. 57, p. 2981-2985, 1991.
ANDERS, H., KAETZKE, A., KAEMPFER, P., LUDWIG, W., FUCHS, G., Taxonomic
position of aromatic-degrading denitrifying pseudomonad strains K-172 and KB740 and their
description as new members of the genera Thauera, as Thauera aromatic sp. nov., and
Azoarcus, as Azoarcus evansii sp. nov., respectively members of the betasubclass of the
Proteobacteria. Int. J. Syst. Bacteriol. v. 45, p. 327-333, 1995.
ANDERSON IC, CAIRNEY JW.
P.M.,
CHAPELLE,
F.H.,
Rapid
toluene
mineralization
by
aquifer
(PtbuA1) in the expression of its cognate activator, TbuT. J. Bacteriol. v. 178, p. 63276337,
1996.
CALDWELL, M.E., SUFLITA, J.M., Detection of phenol and benzoate as intermediates of
anaerobic benzene biodegradation under differente terminal electron-accepting conditions.
Environ. Sci. Technol. v. 34, p. 1216-1220, 2000.
CAVALCA, L., GENNARO, P. COLOMBO, M., ANDREONI, V., BERNASCONI, S.,
RONCO, I., BESTETTI, G. Distribution of catabolic pathways in some hydrocarbondegrading bacteria from a subsurface polluted soil. Res. Microbiol. v. 151, p. 877887, 2000.
CHAKRABORTY, R. & COATES, J.D., Anaerobic degradation of monoaromatic
hydrocarbons. Appl. Microbiol. Biotechnol. v. 64, p. 437-446, 2004.
CHIH-JU, G.J. & TAI, H.S. Application of granulated activated carbon packed-bed reactor in
microwave radiation field to treat BTX. Chemosphere. v. 37, p. 685-698, 1998.
COATES, J.D., CHAKRABORTY, R. LACK, J.G, O CONNOR, S.M., COLE, K.A.,
BENDER, K.S., ACHENBACH, L.A.,
J.D.,
CHAKRABORTY,
R.,
MCINERNEY,
M.J.
Anaerobic
benzene
COWLES, C.E., NICHOLS, N.N., HARWOOD, C.S. BenR, a XylS homologue, regulates
three different pathways of aromatic acid degradation in Pseudomonas putida. J. Bacteriol. v.
182, p. 63396346, 2000.
CUNHA, C. D., ROSADO, A. S., SEBSTIAN, G.V., SELDIN, L. VON DER WEID, I. Oil
biodegradation by Bacillus strains isolated from the rock of an oil reservoir located in a deepwater production basin in Brazil. Appl. Microb. Biotech. v.73, n. 4, p. 949-959, 2006.
DAGLEY, S.W., EVANS, W.C., RIBBONS, D.W. New pathways in the oxidative
metabolism of aromatic compounds by microorganisms. Nature, v.188, p.560-566, 1960.
DAZ, E. Bacterial degradation of aromatic pollutants: a paradigm of metabolic versatility.
Int. Microbiol. v. 7, p. 173-180, 2004.
DAZ, E., FERRNDEZ, A., PRIETO, M.A., GRCIA, J.L. Biodegradation of aromatic
compounds by Escherichia coli. Microbiol. Mol. Biol. Ver. v. 65, n. 4, p. 523-569, 2001.
DUETZ, W.A., MARQUES, S., JONG, C., RAMOS, J.L., ANDEL, J.G. Inducibility of the
TOL catabolic pathways in Pseudomonas putida (pWWO) growing on succinate in
continuous culture: evidence of carbon catabolte repression control. J. Bacteriol. v.176,
p.2354-2361, 1994.
DYKSTERHOUSE SE, GRAY JP, HERWIG RP, LARA JC, STALEY JT.
Cycloclasticus
pugetii gen. nov., sp. nov., an aromatic hydrocarbon-degrading bacterium from marine
sediments. Int J Syst Bacteriol. v. 45, n. 1, p. 116-123, 1995.
EICHNER CA, ERB RW, TIMMIS KN, WAGNER-DOBLER I.
FURTHORPE, R. A., WYNDHAM, R.C. Transfer and expression of the catabolic plasmid
pBRC60 in wild bacterial recipients in a freshwater ecosystem. Appl. Environ. Microbiol.,
v.57, p.1546-1553, 1991.
GIBSON, D.T, ZYLSTRA, G.I., CHAUHAN, S., Biotransformations catalized by toluene
dioxygenase
(ed) Pseudomonas:
LAU, P.C., WANG, Y., PATEL, A., LABBE, D., BERGERON, H., BROUSSEAU, R. A
bacterial basic region leucine zipper histidine kinase regulating toluene degradation. Proc
Natl Acad Sci USA, v. 94 p. 14531458, 1997.
LEUTWEIN, C., HEIDER, J. Anaerobic toluene-catabolic pathway in denitrifying Thauera
aromtica: activation and beta-oxidation of the first intermediary, (R)-(+)-benzylsuccinate.
Microbiology, v. 145, p. 3265-3271, 1999.
LI H, LIU YH, LUO N, ZHANG XY, LUAN TG, HU JM, WANG ZY, WU PC, CHEN MJ,
LU JQ. Biodegradation of benzene and its derivatives by a psychrotolerant and moderately
haloalkaliphilic Planococcus sp. strain ZD22. Res Microbiol. v.157, n. 7, p. 629-636, 2006.
LOVLEY, D.R., BAEDECKER, N.J., LONERGAN, D.J., COZZARELLI, I.N., PHILIPS,
E.J.P., SIEGEL, B.I, Oxidation of aromatic contaminants coupled to microbial iron reduction.
Nature, v. 339, p. 297-299. 1989.
MAcGREGOR, C.H., WOLFF, J.A., ARORA, S.K., PHIBBS, P.V. Cloning of a catabolic
repression control (crc) gene from Pseudomonas aeruginosa, expression of the gene in
Escherichia coli, and identification of the gene product in Pseudomonas aeruginosa. J.
Bacteriol., v. 173, p.7204-7212, 1991.
MADIGAN, M.T., MARTINKO, J.M., PARKER, J. Regulao da expresso gnica. In:
MADIGAN et al., Microbiologia de Brock. (Trad. KIAW, C.M.), 10 edio, So Paulo:
Pearson Education do Brasil, 2004. Cap. 8, p. 193-215.
MARGESIN, R. & SCHINNER, F. (a) Biodegradation and bioremediation of hydrocarbons
of hydrocarbons in extreme environments. Appl. Microbiol. Biotechnol. v. 56, p. 650-663,
2001.
MARGESIN, R. & SCHINNER, F. (b) Potencial of halotolerant and halophilic
microorganisms for biotechnology. Extremophiles, 5, p. 73-83, 2001.
MORALES, G., LINARES, J.F., BELOSO, A., ALBAR, J.P., MARTNEZ, J.L., ROJO, F.
The Pseudomonas putida Crc global regulator controls the expression of genes from several
chromosomal catabolic pathways for aromatic compounds. J. Bacteriol. v. 186, n.5, p. 13371344, 2004.
PRIETO, M.A., GLAN, B., TORRES, B., FERRNDEZ, A., FERNNDEZ, C.,
MINAMBRES, B., GARCA, J.L., DAZ, E. Aromatic metabolism versus carbon
availability: the regulatory network that controls catabolism of less-preferred carbon sources
in Escherichia coli. FEMS Microbiol. Rev. v. 28, p. 503-518, 2004.
QUENTMEIER, A. & FRIEDRICH, C.G, Transfer and expression of degradative and
antibiotic resistence plasmids in acidophilic bactria. Appl. Environ. Microbiol. v. 60, p.
973-978, 1994.
RABUS R, KUBE M, BECK A, WIDDEL F, REINHARDT R. Genes involved in the
anaerobic degradation of ethylbenzene in a denitrifying bacterium, strain EbN1. Arch
Microbiol. v. 178, n. 6, p. 506-516, 2002.
RABUS, R. & WIDEL, F., Anaerobic degradation of ethylbenzene and aromatic
hydrocarbons by new denitrifying bactria. Arch Microbiol. v. 163, p. 96-103, 1995.
RABUS, R., NORDHAUS, R., LUDWIG, W., WIDDEL, F., Complete oxidation of toluene
under strictly anoxic conditions by a new sulfate-reducing bacerium. Appl. Environ.
Microbiol. v. 59, p. 1444-1451, 1993.
RAJENDRAN N, MATSUDA O, IMAMURA N, URUSHIGAWA Y. Variation in Microbial
Biomass and Community Structure in Sediments of Eutrophic Bays as Determined by
Phospholipid Ester-Linked Fatty Acids. Appl Environ Microbiol. v. 58, n. 2, p. 562-571,
1992.
ROTHMEL, R.K., ALDRICH, T.L., HOUGHTON, J.E., COCO, W.M., ORNSTON, L.N.,
CHAKRABORTY, A.M., Nucleotide sequencing and characterization of Pseudomonas
putida catR: a positive regulator of the catBC operon is a member of the LysR family. J
Bacteriol, v. 172, p. 922931, 1990.
SALA-TREPAT, J. M., EVANS, W. C. The meta-cleavage of catechol by Azotobacter
species. 4-oxalocrotonato pathway. Eur. J. Biochem., v.20, p.400-413, 1971.
SHIELDS, M.S., MONTGOMERY, S.S., CHAPMANN, P.J, CUSKEY, S.M &
PRITCHARD, P.H., Novel pathway of toluene catabolism in the trichloroethylene-degrading
bacterium G4. Appl. Environ. Microbiol. v. 55, p. 1624-1629, 1989.
WATTS, R.J., HALLER, D.R, JONES, A.P., TELL, A.L. A foundation for the risk-based
treatment of gasoline-contaminated soils using modified Fenton's reactions. J. Hazard.
Mater. v.76, p.73, 2000.
WEINER, J., LOVLEY, D.R., Anaerobic benzene degradation in petroleum-contaminated
sediments after inoculation with a benzene-oxidizing enrichment. Appl. Environ. Microbiol.
v. 64, p. 775-778, 1998.
WHITED, G.M., & GIBSON, D.T, Toluene-4-monooxygenase, a three-component enzyme
system that catalyses the oxidation of toluene to p-cresol in Pseudomonas mendoncina KR1.
J. Bacteriol. v. 173, p. 3010-3016, 991.
WILLIAMS,, P.A. & MURRAY, K., Metabolismo f benzoate nd methylbenzoates by
Pseudomonas putida (arvilla) mt-2: evidence for the existence of a TOL plasmid. J. Bacterol.
120, p. 416-423, 1974.
WRENN, A.B., Biodegradation of aromatic hydrocarbons. Revisado por SWARD, R.E. em
abril, 1998. Disponvel em: <http://www.cee.umd.edu/~eseagren/bioAHC97.htm> Acesso em
02 de fevereiro de 2007.
WYNDHAM, R.C., NAKATSU, C.H., FULTHORPE, R.R., HOLLAND, B.A., PEEL, M.C.
The phylogenetic distribution of transposable dioxygenase genes. In: Progress in Microbial
Ecology. Martins, M.T (eds). Brazilian Society for Microbiology, 1997.
ZHANG, C. & BENNETT, G.N. Biodegradation of xenobiotics by anaerobic bacteria. Appl.
Microbiol. Biotechnol. v. 67, p. 600-618, 2005.
ZOBELL, C.E., The role of bactria in the formation and transformation of petroleum
hydrocarbons. Science, v. 102, p. 364-369, 1945.