BIOKIMIA

PENDAHULUAN

Sukarti Moeljopawiro
Laboratorium Biokimia
Fakultas Biologi UGM

BIOKIMIA: Definisi

Ilmu yang mempelajari hidup pada tingkat

molekular

Ilmu yang mempelajari proses kimia di dalam

kehidupan (Mertz)

Ilmu yang mempelajari organisme hidup pada

tingkat molekular (Wood et al.)

Ilmu yang mempelajari dasar molekular

kehidupan (Stryer)

Ilmu-ilmu yang mendasari Biokimia:

Biologi Umum
Kimia Anorganik
Kimia Organik

Kimia Analitik
Kimia Fisika

Ilmu pengetahuan dasar lain yang membantu

mengembangkan biokimia:
Mikrobiologi
Fisiologi Tumbuhan
Genetika

Fisiologi Hewan
Biofisika

CIRI-CIRI BENDA HIDUP

Struktur benda hidup sangat kompleks dan

terorganisir sangat canggih. Mempunyai
struktur internal yang sangat ruwet dan berisi
berbagai macam molekul kompleks.
Benda mati terdiri atas campuran senyawa
sederhana (misal tanah, pasir, batu).

CIRI-CIRI BENDA HIDUP (lanjt.)

Benda hidup dapat mengambil / menggali,

mengubah dan menggunakan tenaga dari
sekitarnya dalam bentuk nutrien atau sinar
matahari:
Tenaga ini dipakai untuk mempertahankan
struktur yang kompleks dan ruwet serta
aktifitas hidupnya.
Benda mati tidak menggunakan tenaga untuk
mempertahankan strukturnya, benda mati
akan rusak dan seimbang dengan sekitarnya.

CIRI-CIRI BENDA HIDUP (lanjt.)

Benda hidup dapat memperbanyak diri persis

seperti dirinya (self replication) sedangkan
benda mati tidak mampu tumbuh dan
memperbanyak diri.

Tiap komponen benda hidup mempunyai

fungsi sendiri-sendiri yang sangat spesifik.

BIOELEMENTS

Elemen pembentuk senyawa organik

Carbon (C)
Nitrogen (N)
Hydrogen (H)
Phosphorus (P)
Oxygen (O)
Sulphur (S)

Elemen terdapat dalam bentuk ion

Sodium (Na+)
Calcium (Ca2+)
Pottasium (K+)
Chlorin (Cl-)
Magnesium (Mg2+)

Trace elements
Fe Co
Ni
Cu I
Ct
Zn Mo
F
Mn V
Se

Si
Sn
B
As

DELAPAN ELEMEN PENYUSUN KERAK

BUMI DAN TUBUH MANUSIA
No.

KERAK BUMI

TUBUH MANUSIA

Elemen

(%)

Elemen

(%)

1.

47

63

2.

Si

28

25.5

3.

Al

7.9

9.5

4.

Fe

4.5

1.4

5.

Ca

3.5

Ca

0.31

6.

Na

2.5

0.22

7.

2.5

Cl

0.08

8.

Mg

2.2

0.06

HIERARKI STRUKTUR BIOLOGIS

Organisme
Organ
Jaringan
Sel
Multienzim kompleks, ribosom, kromosom,
membran, elemen struktural

BM 106-1010
Makro Molekul
104-109

Protein

Unit monomer
100-800
BM 100-250

BM 18-44

Asam amino

Asam nukleat

Polisakarida
Fosfolipid

Nukleotida
Basa aromatik,
ribosa

Glukosa

CO2, H2O, N2

Palmitat, gliserol,
kolesterol

HIERARKI STRUKTUR BIOLOGIS

HIERARKI STRUKTUR BIOLOGIS

SEL EUKARYOTIK:
Sel Hewan dan Sel
Tumbuhan

SEL:
Sel Hewan, Tumbuhan
dan Prokaryotik

ORGANISME DI DUNIA ADALAH

UNIVERSAL

Struktur makromolekul biologi dasarnya sederhana

Semua organisme terbentuk dari molekul bahan
dasar yang sama
Spesies / organisme yang satu dan yang lain berbeda
karena perbedaan susunan asam nukleat dan protein
Semua biomolekul mempunyai fungsi spesifik di
dalam sel
Protein semua organisme (mikrobia, tumbuhan,
hewan) terbentuk dari 20 macam asam amino dasar

ORGANISME DI DUNIA ADALAH

UNIVERSAL (lanjt.)

Asam nukleat terbentuk dari 5 macam basa N

Purin
Pirimidin

: Adenin, Guanin
: Cytosin, Thimin dan Uracil

Bentuk senyawa pemindah tenaga: ATP

Dogma sentral biologi
DNA

Transkripsi
Transkripsi Balik

Replikasi

RNA

Translasi

Protein

BIOKIMIA AKAN MENJAWAB

Bagaimana beribu macam biomolekul yang
terbentuk dari bermacam-macam elemen
tersebut berinteraksi dan menjadikan suatu
kehidupan

MENGAPA BIDANG BIOKIMIA SANGAT

MENARIK ?

Dapat diketahui dasar kimia proses

kehidupan

Ditemukannya struktur double-helix DNA

Diketahuinya alur informasi dari gen menjadi
protein
Determinasi struktur 3 dimensi protein dan
mekanisme tindakan molekular protein
Juga perkembangan teknologi DNA rekombinan

MENGAPA BIDANG BIOKIMIA SANGAT

MENARIK ? (lanjt.)

Ternyata pola dan prinsip molekul yang

mendasari hidup sama pada semua
kehidupan

Semua organisme menggunakan bahan yang

sama untuk membentuk macam molekul
Alur informasi genetik dari DNA RNA Protein
sama pada semua organisme
Adenosin triphosphat (ATP) merupakan pemindah
tenaga universal pada sistem biologi yang
dibentuk dengan cara yang sama pada setiap
kehidupan

MENGAPA BIDANG BIOKIMIA SANGAT

MENARIK ? (lanjt.)

Biokimia sangat berperan dalam

pengembangan pengobatan
(Enzim, DNA rekombinan)

Cepatnya perkembangan ilmu biokimia dapat

mengatasi masalah dalam bidang hayati /
biologi (Strayer, 1988)

BUKU ACUAN / PEGANGAN

Horton, H.R., Moran, L.A., Rawn, J.D., and Scrimgeor,
K.G. 1996. Principles of Biochemistry. 2nd Ed. PrenticeHall International, Inc.
Lehninger, A.L., Nelson, D.L., Cox, M.M. 2000. Principles
of Biochemistry. 3rd Ed. Worth Publisher, Inc.
Nelson, D.L. and Cox, M.M. 2000. Lehninger Principles of
Biochemistry. 3rd Ed. Worth Publisher.
Stryer, L. 1995. Biochemistry. 4th Ed. WH Freeman and
Co.

Terima
Kasih

KROMOSOM DNA

KROMOSOM DNA

KROMOSOM DNA

SIKLUS OKSIGEN - KARBON

SIKLUS KARBON DIOKSIDA

SIKLUS NITROGEN

SIKLUS FOSFOR

FOTOSINTESIS

RESPIRASI AEROBIK