PRINCIPIOS DE

ECOLOGA MICROBIANA

NIVELES DE ORGANIZACIN DE LA BIOSFERA

ECOSISTEMAS:

Los organismos que viven en un rea

determinada mas el ambiente fsico que
interacta con esos organismos (auto
sostenible y funcional).

COMUNIDADES:

Grupo ecolgicamente integrado de especies

de animales, plantas y microorganismos que
habitan un rea dada (interacciones)

POBLACIONES:

Grupos de organismos
de la misma especie
que coexisten
en el tiempo y
espacio

INDIVIDUOS

GLOSARIO :
Hbitat: sitio donde especficamente pueden vivir ciertos organismos.
Nicho ecolgico: funcin de un organismo en un ecosistema (hbitat + funcin +
interacciones).
Guild (gremio): poblaciones de una comunidad que utilizan los mismos recursos
(ej. Sulfato-reductoras, fijadoras de N).
Fitness : alto grado de adaptacin que mejora la competitividad .
Dinmica: cambios temporales en la composicin de una comunidad.
Sucesin: sustitucin de unas poblaciones por otras ms adaptadas para ocupar un
nicho ecolgico.

Microorganismos en suelo y sistemas

acuosos
DOMINIO
virus

TAMAO

MOVILIDAD

FUENTE ENERGA

-------

0,01- 0,1

------

parsitos

bacterias

procariotas

0,5 -2.0

luz, comp. orgnicos,

comp. inorgnicos

hongos

eucariotas

2 - 200

(-)

comp. orgnicos

protozoarios

eucariotas

2 - 200

comp. orgnicos

algas

eucariotas

2 - 200

(+)

luz, comp. orgnicos

Microorganismos ms importantes por hbitat

Los microorganismos en la naturaleza

Se encuentran en todos los ambientes

Acuticos

Terrestres

Atmosfera

Factores que afectan el crecimiento y distribucin de los

microorganismos:
- factores fsicos
- disponibilidad de nutrientes
- caractersticas de los propios microorganismos
- interacciones con otros microorganismos
- interacciones con otros organismos superiores: plantas, animales

Funciones generales de los microorganismos en

el ecosistema
Transformacin de nutrientes:
Descomponen materia orgnica.
Modifican sustancias para que otros
organismos las puedan utilizar
(Biorremediacin).
Son fuente de energa y de nutrientes
para otros organismos
(Quimiohetrtrofos).
Modifican el estado de algunos
compuestos importantes que pasan
de una fase a otra (ej: gaseosa a
acuosa)

Interacciones con otros organismos:

Producen compuestos inhibidores o
promotores del crecimiento
Compiten por nutrientes

MICROORGANISMOS DEL
SUELO

Composicin fsico-qumica del suelo

Horizontes del suelo

Horizonte A:

Capa superior del suelo

La regin ms superficial y de
mayor actividad fsica qumica
y biolgica.

Contiene la mayor parte del

material orgnico del suelo, vivo o
muerto:

Grandes cantidades de partes

de plantas y hojas muertas.

Insectos y otros artrpodos

pequeos.

Lombrices de tierra.

Organismos descomponedores.

Nemtodos.

O2, N2, CO2

Desechos
orgnicos

Lluvia

O2, NH3,
CH4, H2S

Inorgnicos

granulados.
Residuos

Suelo: Horizonte A
Rocas, silicatos

orgnicos,

humus.
Agua

(inundado,
mojado).
Gases

(disueltos y
difusos).

Capa de agua

Sistemas

biolgicos
(races, insectos,
microobios).

En un gramo de suelo del horizante A

pueden haber:
2500 millones de bacterias
+
medio milln de hongos
+
50 000 algas
+
30 000 protozoos

Horizonte B:

Regin de
acumulacin

Mara Cecilia Arango Jaramillo

El horizonte B:

Contiene mucho menos

material orgnico y est
menos meteorizado que
el horizonte superior.
Hay pocos
microorganismos

Algunos materiales del horizonte A,

llegan al B por filtracin del agua a
travs del suelo:

xido de hierro.

Partculas arcillosas.

Pequeas cantidades de
material orgnico.

Horizonte B

Horizonte C:
Los microorganismos son
escasos.

Compuesto por rocas y

minerales
fragmentados y
meteorizados de los
cuales se ha formado
el suelo verdadero de
los horizontes
superiores.

Factores externos que determinan que un

microorganismo sobreviva en un ambiente.

Disponibilidad de agua
Nutrientes
Concentracin de oxgeno
pH
Temperatura
Presin osmtica (Concentracin
de sales, azcares)
Presin hidrosttica
Radiacin

Interacciones con otros organismos

Positivas: simbiosis, mutualismo,
sintrofismo, etc.
Negativas: competencia, antagonismo,
predacin, etc

Factores que
afectan el nmero y
la diversidad de
los organismos en
el suelo

3. Profundidad del perfil: determina

nutrientes (materia orgnica y O2 )

4. Contaminacin del suelo:

Txicos.
Inhibidores del crecimiento
microbiano

1. Propiedades fsicas y qumicas del suelo:

Disponibilidad de agua.
Textura,
Contenido de materia orgnica, etc.

2. Tratamiento del suelo

Labranzas: Aereacin/compactacin,
Distribucin de la materia orgnica.
Disponibilidad de agua.
Aplicacin de productos:
Naturales (abonos vegetales o animales)
Agroqumicos
Tipo y manejo de cultivo

Los microorganismos son indicadores de

calidad de
suelo y de la sustentabilidad del manejo

Nutrientes necesarios para el

crecimiento microbiano

Fuente de Energa
luz (Fottrofo)
qumica (Quimitrofo).
Fuente de Carbono
Comp. orgnicos (Organtrofo)
Comp. inorgnicos (Auttrofo).
Fuente de Nitrgeno.
Fuente de Fsforo.
Fuente de Azufre.
Elementos minerales traza.
Vitaminas.

El principal nutriente
es la fuente de energa
En organismos
quimioorgantrofos
(hetertrofos) la fuente
de energa y de carbono
son el mismo compuesto

Los microorganismos en
el suelo

Contribuyen a la formacin
de materia orgnica

la convierten en cido
carbnico o cidos
orgnicos

disuelven rocas.

Controlan la
disponibilidad de
muchos nutrientes
importantes para las
plantas

Hongos
Dominantes en la superficie de ecosistemas terrestres.
Constituyen del 70-80 % de la biomasa microbiana total del suelo, especialmente en suelos ricos
en materia orgnica, bien aireados y con pH cidos
Funcin principal: Degradadores de polmeros vegetales
(hetertrofos)
Caractersticas:
No crecen en condiciones extremas pero las toleran.
Alta capacidad de dispersin por la formacin de esporas.
Interacciones con las plantas.
Beneficio:
Capturan nutrientes y los hacen disponibles.
Pueden controlar hongos patgenos, nemtodos e insectos.
Perjuicio:
Patgenos

Bacterias
Importantes en suelo en cualquier condicin
Funciones:
- Recicladores de los principales elementos de la
naturaleza.
- Productores primarios en ambientes extremos.
Caractersticas:
Ubicuidad y diversidad metablica:
Sobreviven a escasez de nutrientes y
toleran txicos.
Tamao pequeo y generalmente
mviles
Pueden adherirse a superficies
Gran plasticidad gentica y alta
velocidad de crecimiento para
adaptarse a condiciones ambientales
adversas.

Beneficio:
Antagonistas de patgenos.
Productores de promotores del crecimiento
vegetal.
Responsables nicos de la fijacin biolgica
de nitrgeno gaseoso.
Capturan nutrientes y los hacen disponibles.
Pueden controlar hongos patgenos,
nemtodos e insectos.
Perjuicio:
Patgenos.

Protozoarios
Se desarrollan en suelos con pH neutro y elevada humedad
Funciones principales:
Predadores de bacterias, algas y otros protozoarios.
Mineralizadores.
Implicancias de la predacin de bacterias:
Recirculacin de nutrientes: relacin C:N mayor que en bacterias
No extinguen poblaciones bacterianas: crecimiento depende del
N de bacterias:
Caractersticas:
Diversidad en tamao.
Son Hetertrofos (algunos fotosintticos), la mayora requiere
oxgeno.
No sobreviven a 50 C.
Formas de resistencia (cistos) si hay escasez de nutrientes.

ROL DE LOS MICROORGANISMOS

EN EL SUELO

Mineralizacin de la materia orgnica

Descomposicin de hojas (Sucesin)
Tiempo (las fases pueden ser simultneas)

Hongos:
glucfilos
utilizacin de
las sustancias
hidrosolubles

Hongos
celulolticos:
metabolismo
de la celulosa

Hongos
lignolticos :
degradacin de
la lignina

Bacterias: transforman residuos fngicos y

productos no consumidos
por las hifas.
Mara Cecilia Arango Jaramillo

Proteccin de los microorganismos ante

desequilibrios ambientales

Cuando se aade materia orgnica a los suelos

agrcolas, las bacterias consumen todo el carbono
disponible.
Consecuencia: rarefaccin, e incluso desaparicin de
los microorganismos.
Naturaleza

Sistemas de proteccin para los microorganismos

sobrevivan
Mara Cecilia Arango Jaramillo

Estructuras de proteccin de los hongos

Clamidospora:
Clula latente, con pared gruesa
y cuyo contenido es rico en
reservas.

Clamidospora de Fusarium

Esclerote:
Esfera cuyo envoltorio externo est
constituido de hifas muertas de
pared gruesa, y el centro de
filamentos vivos ricos en
reservas, en estado latente.

Aspergillus sclerotium

Estructuras de proteccin delas bacterias

Las (Gram+) forman
endosporas.
Capaces de sobrevivir
muchos aos en condiciones

Las Gram- estn

desprovistas de mecanismos
de resistencia

Forman agregados
biolgicos cuando las
condiciones son
desfavorables

La actividad celular y las

divisiones, se hacen ms
lentas.

desfavorables.

Bacillus anthrascis

FACTORES LIMITANTES DEL

CRECIMIENTO
MICROBIANO

1. Competencia entre los microorganismos

Existe competencia
entre los
microorganismos por
utilizacin de los
nutrientes orgnicos e
inorgnicos.
En el suelo la materia
orgnica fcilmente
utilizable es reducida, lo
que limita su
velocidad de
multiplicacin.

Al aadir al suelo materiales

frescos, estircol o desechos
vegetales

el nmero de
microorganismos aumenta
rpidamente

los nutrientes se agotan

poblacin de microorganismos
vuelva nivel anterior.

Los auttrofos no compiten por nutrientes

orgnicos con otros microorganismos.
Slo compiten por luz

Nitrosomonas y Nitrosobacter
Su desarrollo est limitado por compuestos
nitrogenados apropiados.

2. Oxgeno

Mara Cecilia Arango Jaramillo

Importante:
El oxigeno es escencial
Microorganismos
fijadores
de NITRGENO

En suelos poco aireados hay

competencia por el O2 disponible.
Esto puede llevar a un descenso de
la poblacin de m.o. aerobios.
Consecuencia:
Disminuye la fijacin de nitrgeno y
degradacin de la materia orgnica.

Anaerobios
facultativos

Presencia de oxgeno:
Degradacin completa de polisacridos,
descomponindolo hasta CO2 y agua
con alta liberacin de energa
Ausencia de oxgeno:
Fermentacin: degradacin parcial de
polisacridos y poca liberacin de
energa

3. pH

4. Agua

Importante:
DISPONIBILIDAD DE AGUA
Potencial osmtico
alto
(suelos salinizados)

Agua poco asequible a los m.o.

Consecuencia:
Se inhibe el crecimiento de la
mayora de los m.o. y races.
Solo sobreviven los halfilos

Exceso de agua
(suelos inundados)

Produce prdida de oxigeno en

los capilares del suelo.
Consecuencia:
Disminuyen los microorganismos
aerobios y aumentan los
anaerobios