A partir da imagem fornecida pelo PoseView (Figura 1), pode-se analisar o ligante e

suas principais interaes com alguns resduos da protena. Observa-se ento que A Dxilose (C5 H12 O5) realiza ligaes de hidrognio com os terminais Glu181A (cido
glutmico), His54A (Histidina), Asp287A (cido asprtico), Lys183A (Lisina),
His220A (Histidina) e tambm com o on de magnsio. As distncias entre essas
interaes foram calculadas a partir do programa Chimera e esto dispostas na tabela a
seguir:

Figura1: Interaes entre ligantes e resduos da protena

His54A
2.782
Distncia/

ASP287A GLU181A
LIS183A
2.801
2.553
3.009
3.016
3.024
3.116
Tabela 1: Distncia de interaes

HIS220A

Diferente do esperado a partir da imagem fornecida pelo PoseView, alguns resduos no

apresentaram o mesmo comportamento ema realizao de Ligaes de Hidrognio a
partir do software Chimera. O resduo ASP28.A diferente do esperado realizando trs
diferentes ligaes de hidrognio, enquanto o resduo HIS220.A no apresentou
nenhuma interao apontada.
Coma utilizao do Chimera tambm foi possvel elaborado um mapa de potencial
eletrosttico. Observando a imagem a seguir (Figura 2), observa-se a alta polaridade no
stio ativo da protena o que concorda com o tipo de interao intermolecular realizada.

Figura 2: Mapa de Potencial eletrosttico e stio ativo.

Utilizando o ArgusLab foi desenhada e otimizada a estrutura do ligante D-Xilose

(C5 H12 O5) e buscou-se analisar as diferentes conformaes do ligante no stio ativo da
protena com a estrutura otimizada. A seguir temos a transcrio das estruturas para a
projeo de Newman (Figura 3), a partir das projees realizadas entre todos os
carbonos de cada configurao, onde 1) representa a conformao do ligante e 2) a
conformao optimizada, observa-se uma que as configuraes C1-C2 e C3-C4
apresentam uma diferena de estabilidade. No primeiro caso h uma maior energia
potencial no ligante uma vez que encontra-se na conformao gauche, ou seja, os
grupos de maior densidade eletrnica esto muito prximos, diferente da geometria
otimizada encontra-se alternada. Na terceira projeo temos um caso semelhante onde
todos os grupos de maior densidade eletrnica encontram-se prximos.
1)

2)

Figura 3- Projeo de Newman D-xilose

Nem sempre o ligante de maior estabilidade apresenta

uma maior atividade. Processos como este apresentam
uma grande interao seletiva com uma determinada
biomacromolcula alvo. Alm de sua estereoqumica
especfica a D-xilose apresenta uma contribuio em
sua estabilidade atravs de interao intra-molecular.

Figura4: Interao intra-