Escolar Documentos
Profissional Documentos
Cultura Documentos
AMINOKISELINE
PROTEINA
- ugljenikov atom
karboksilna grupa
amino grupa
primarni amin
NH3+
R
C COO H
NH3+
R
C COO H
Aromatina R grupa
Osobine aminokiselina
NaOH
CH
COO- Na+
NH2
R
CH COOH
NH2
HCl
CH COOH ClNH3+
H3N
CH
COOH
katjonski oblik
H
+H
H3N
CH
COO
H
+H
H2N
CH
COO
bipolarni jon
anjonski oblik
pI
pH
jako bazna sredina
Glutaminska kiselina
pI za
glutaminsku
kiselinu je 3,22
Ona sadri dve
-COOH grupe
pI je srednja
vrednost pK1 i
pKR
Histidin
pI za histidin
je 7,59
Sadri dve
bazne grupe i
pI je srednja
vrednost pKR
i pK2
PROTEINI
POLIMERI AMINOKISELINA
TA SU PROTEINI?
Proteini ili belanevine su
visokomolekulska jedinjenja koja sadre
azot i predstavljaju polimere
aminokiselina.
Ugljenik
50 55
Vodonik
6,5 7.3
Kiseonik
19 24
Azot
15 18
Sumpor
0 2,4
POLIPEPTIDI
Metinske grupe CH
Peptidna veza
H2N CH CO NH CH CO NH CH CO
R1
amino - zavretak
N - kraj
N - terminalna
aminokiselina
R2
Bocni nizovi
R3
NH
CH COOH
Rn
karboksilni kraj
C - kraj
C - terminalna
aminokiselina
PREDSTAVLJANJE POLIPEPTIDA
N-terminalna aminokiselina se stavlja sa leve strane a C-terminalna
aminokiselina sa desne strane
Peptidi se imenuju direktno. Polazei od N-kraja, imena ostataka se
povezuju u niz a svaki se smatra supstituentom sledee aminokiseline i
zavrava se C-krajem
H2N CH
CO
HN CH
H2N CH
COOH
Alanilglicin
Ala-Gly
Glicilalanin
Gly-Ala
CO
HN CH
CH 3
CH 3
H2N CH
CO
HN
CH
CH
CH 2
CH 3 CH 3
OH
CO
Valilserilfenilalanin
Val-Ser-Phe
HN CH
CH 2
COOH
COOH
PRIMARNA STRUKTURA
Redosled
vezivanja
aminokiselina u
polipeptidnom
lancu
SEKUNDARNA STRUKTURA
Obrazuje se uglavnom na bazi stvaranja
vodoninih veza izmeu atoma koji se nalaze u
sastavu peptidne veze koji se nalaze relativno
blizu u polipeptidnom lancu.
Vodonine veze se grade izmeu karbonilnog
kiseonikovog atoma svakog prvog ostataka
aminokiseline u nizu i atoma vodonika iz NHgrupe svakog petog ostataka.
Glavni vidovi sekundarne strukture su -spirala
(-heliks) i - nabrana struktura.
ALFA SPIRALA
TERCIJERNA STRUKTURA
Polipeptidni lanac, koji u sebi ve sadri
delove sa sekundarnom strukturom, je
sposoban da se u celini izuvija u prostoru i
zauzme poloaj koji odgovara najstabilnijoj
konformaciji, pri datim uslovima, koji se naziva
tercijerna struktura.
u interakciju stupaju boni nizovi ostataka
aminokiselina koji su u polipeptidnom lancu
dosta udaljeni jedan od drugoga
Elektrostatike interakcije
Hidrofobne interakcije
Kovalentne veze (disulfidne veze)
VODONINE VEZE
O
N C C
H CH2
C C N C
...
..
CH2
..O
.
H
C
O
H CH2
H CH2
N C C
N C C
N C C
CH2
CH3
NH
C
H2 N
CH3
NH2
N C C
H CH2
N C C
O
hidrofobna
elektrostaticka
interakcija
DISULFIDNE VEZE
O
N C C
N C C
H CH2
SH
SH
H CH2
S
H CH2
oksidacija
redukcija
N C C
H CH2
N C C
DISULFIDNI MOST
DENATURISANA RIBONUKLEAZA
RENATURACIJA RIBONUKLEAZE
KVATERNERNA STRUKTURA
Nekoliko polipeptidnih lanaca se mogu meusobno
povezati gradei pri tome kvatenernu strukturu,
tako dobijene strukture se nazivaju kompleksi ili
agregati
U okviru tog kompleksa, svaki polipeptidni lanac
predstavlja jednu podjedinicu
podjedinica ima ouvanu primarnu, sekundarnu i
tercijernu strukturu
stabilizovana je uglavnom vodoninim vezama i
hidrofobnim intrakcijama izmeu polipeptinih lanaca
koje predstavljaju podjedinice
mogue su sve vrste interakcija koje stabilizuju
tercijernu strukturu
HEMOGLOBIN