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Cinética Química 1
Cinética Química 1
Experimentos Cinticos estudam a velocidade na qual as reaes ocorrem, quer dizer como
a concentrao de algumas espcies molecular muda em funo do tempo. Numa plotagem
de concentrao versus tempo, a velocidade da reao simplesmente a inclinao. No
experimento cintico mostrado abaixo, a velocidade da reao decresce medida que a
reao ocorre.
O caminho exato pelo qual a velocidade muda em funo do tempo e como esta velocidade
varia com a concentrao dos reagentes, depende do mecanismo de ao. Estudos cinticos
podem ser usados, entretanto, para testar mecanismos propostos.
Equaes de velocidade ou leis de velocidade mostram a variao na concentrao de uma
espcie molecular em relao ao tempo (a velocidade) como uma funo matemtica da
constante de velocidade ou da constante cintica, especificada por k, e a concentrao de
cada espcie molecular que participa da reao.
Os exemplos mostrados abaixo so equaes de velocidade para reaes que ocorrem em
uma nica direo (isto , a reao reversa no considerada). Em alguma destas, a
velocidade deve ser ajustada para ser consistente com a estequiometria da reao. Assim
para 2 A ! A 2 , a concentrao do monmero varia duas vezes tanto quanto a
concentrao do dmero.
rxn (1)
U ! N
veloc= -d[U]/dt = d[N]/dt = k[U]
rxn (2)
AB! A + B
rxn (3)
A + B ! AB
rxn (4) 2 A ! A 2
Isto mostra a relao entre a constante de velocidade e a constante de equilbrio para uma
reao de dissociao bi molecular. Para uma reao unimolecular como
dobramento/desdobramento de uma protena no equilbrio,
N < == > U
A ! B
-d[A]/dt = k[A]
d[A]/[A] = -k .dt
ln [A] = -kt + ln [Ao ]
[A] = [Ao ] e -kt
Uma boa relao linear para dados de experimentos cinticos plotados com ln [reagentes]
versus tempo fornece uma evidncia que a reao de primeira ordem ou de pseudoprimeira
ordem (veja abaixo)
A meia vida (t1/2 ) para a reao o tempo requerido para que a metade dos reagentes seja
convertida em produtos. Para uma reao de primeira ordem, t1/2 uma constante e pode ser
calculado a partir da constante de velocidade como:
t1/2 = -ln(0.5)/k = 0.693/k
No experimento mostrado acima, a meia vida 6,9 segundos. A relao recproca entre meia
vida e a constante de velocidade uma forma para se ter uma idia do tempo em que a
reao ocorre. Assim, para k= 0,01 seg 1 , a meia vida aproximadamente 70 segundos.
para k= 10 seg-1 , a meia vida seria cerca de 0,07 segundos ou 70 mili-segundos. A meiavida para reaes de primeira ordem, tambm independente do ponto de partida. Se ela
demora 20 seg. para que a primeira metade das molculas reaja, ela tambm vai levar 20
segundos para que a outra metade das molculas reajam, e assim sucessivamente. O fato de
que a meia vida constante durante uma reao de primeira ordem, significa que , a
qualquer tempo uma frao constante de molculas reagentes tem energia suficiente para
atravessar a barreira cintica e assim se torne produto. Isto faz sentido por que a energia de
uma populao de molculas distribuda randomicamente de acordo com a distribuio de
Boltzmann.
2A ! A2
- d[A]/dt = k[A]2
d[A]/[A]2 = -k .dt
1/[A] = k (t) + 1/[A0 ]
[A] = A0 /(A0 kt + 1)
Reao:
A+B
Equao de velocidade :
Observe que esta expresso de velocidade agora tem a mesma forma e a mesma
soluo integrada do que uma reao de primeira ordem. Poderamos agora plotar ln [B] vs.
tempo e obter uma linha reta com uma inclinao igual a k [A0]. Pela manipulao das
concentraes iniciais, ns transformamos uma reao bi-molecular em uma reao de
pseudoprimeira-ordem. Ao contrario de uma reao de primeira ordem real, entretanto,
no obtemos o mesmo valor de k aparente nos experimentos realizados com diferentes
concentraes iniciais de [A0].
Testando Mecanismos de reao: Um dos usos da cintica em bioqumica estabelecer
qual o modelo que melhor representa a reao de interesse. Por exemplo, temos uma
interao monomrica de uma protena ligadora de DNA (R) que liga a um fragmento de 20
pares de bases (D) mas no sabemos se a protena liga como um monmero ou um dmero.
Se medirmos a velocidade inicial da reao de associao e encontrarmos que varia
linearmente com [R], ento o modelo preferencial seria:
R + D ! RD
desde que
d[R]/dt = -k[R][D]
2R + D ! RD + R ! R2D
Tais espcies poderiam ser formadas mas no ter relevncia no caminho de associao. Se
as espcies R2 e RD apresentarem estruturas mais razoveis como
ento isto indicaria a possibilidade de que elas foram associadas como intermedirios,
porm no necessariamente seja uma garantia disso.
A regra da significncia cintica afirma que para uma espcie ser um autntico
intermedirio numa reao, ela deve se formar e desaparecer numa velocidade maior do que
a do produto final. Assim, se as espcies R2 ou RD forem detectadas na reao mas
aparecem numa velocidade menor do que a formao de R2D, ento isto as excluiria como
intermedirios significantes no caminho da associao. De forma semelhante, se R2 for um
autentico intermedirio, ento a adio de D a R2 purificado resultar na formao de R2D a
uma velocidade muito mais rpida do que seria com 2R e D.
Quando escrevemos reaes como acima, sem reaes reversas, estamos assumindo que a
constante de velocidade para estas reaes reversas muito pequena em relao a constante
de velocidade para as reaes de avano. Se, neste modelo, iniciarmos a reao com A puro,
o que acontecer? A rapidamente ser convertido em B, mas como B convertido em C
mais lentamente, a concentrao de B ir aumentar, como mostrado abaixo, e C aparecer
com uma cintica muito menor.
Aqui, B est de acordo com a lei de significao cintica, uma vez que se forma e
desaparece mais rapidamente que C aparece. Observe tambm que a formao de C ocorre
com uma meia vida de 0,7 segundos e a velocidade de 1 seg 1 , a magnitude da constante
de velocidade para o passo elementar e mais lento.
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Nesta reao, B forma-se mais rpido do que C no incio da reao (satisfazendo a regra da
significncia cintica) mas pode ser difcil de mostrar experimentalmente a menos que se
utilize um mtodo extremamente sensvel para medir pequenas quantidades de B e C.
Novamente, observe que a formao de C ocorre com uma meia vida de 0,7 segundos e a
velocidade aproximadamente de 1 seg 1 , o qual a constante de velocidade para o passo
elementar e mais lento.
Neste caso, uma vez que uma molcula de B formada ela pode formar C ou se converter
novamente em A . Com as constantes de velocidades mostradas, deveria estar claro que a
maioria de B seria revertido em A por que a constante de velocidade para este passo 10
vezes maior do que a constante de velocidade para a converso de B! C. Assim, deveria
demorar 10 vezes mais, para formar tanta quantidade de C neste modelo, do que no modelo
onde no temos a converso de B! A.
Nestes sistemas, A e B efetivamente se equilibram.
-1
-1
Kab = [A]/[B] = (200 s )/(1 s ) = 200.
assim B nunca ser maior do que A . A velocidade de formao de C apenas 20 s-1 [B].
Substituindo [B] temos
d[C]/dt = (20 s-1)/(200) [A] = 0.1 s-1 [A]
Assim a meia vida de formao de C aproximadamente de 7 segundos, considerando que
era de 0,7 segundos quando a converso de B! A no ocorria. Este o mesmo resultado
que chegamos acima apenas considerando a velocidade em que B se forma como
intermedirio entre A e C . Observe que neste caso, a reao global mais lenta do que
qualquer outro passo.
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Neste tipo de reao, se k-1 >> k2 (B forma A muito mais rapidamente do que forma C),
ento existir um pr-equilibrio velocidade limitante e a velocidade de formao de C ser
dependente das trs constantes de velocidade.
d[C]/dt = (k1 k2)/(k-1) [A]
equao 3.1
Se, entretanto, assumirmos que k2 >> k-1 (B forma C muito mais rapidamente do que forma
A), ento podemos efetivamente ignorar a reao reversa de B ! A e a nica questo ser
se k1 ou k2 o passo velocidade limitante.
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Aproximao do equilbrio estacionrio: A cintica de reao deste tipo tambm pode ser
analisada escrevendo a expresso global para a variao de B e ajustando esta como
sendo zero. Fazendo isto, estamos assumindo que a concentrao de B rapidamente atinge
uma constante, um equilbrio estacionrio cujo valor no muda apreciavelmente durante a
reao.
d[B]/dt = k1[A] - k-1[B] - k2[B] = k1[A] - (k-1+k2)[B] = 0
(k-1+k2)[B] = k1[A]
[B] = (k1)/(k-1 + k2) [A]
substituindo d[C]/dt = k2[B] temos:
d[C]/dt = (k1k2)/(k-1 + k2) [A]
agora se, k-1 >> k2
d[C]/dt (k1 k2)/(k-1) [A]
equao: 3.2
A equao 3.2 equivalente a se dizer que o passo k-1 o passo velocidade limitante de
todo o processo.
A aproximao do estado de equilbrio estacionrio para um intermedirio no se aplica se
o intermedirio formado a uma velocidade muito maior do que sua quebra. Por exemplo,
com as constantes de velocidade mostradas abaixo:
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Veremos expresses como esta ltima em alguns tipos de reaes catalisadas por enzimas.
Novamente, supomos o estado de equilbrio estacionrio para analisar o processo global,
onde a velocidade de formao de AB muito mais rpida do que sua quebra.
Quando os intermedirios no podem ser determinados diretamente: Algumas vezes os
intermedirios numa determinada reao no podem ser isolados como espcies moleculares
distintas ou caracterizadas diretamente. Nestes casos, a existncia de intermedirios,
muitas vezes derivada da passagem da fase de cintica lenta para a de grande acelerao, ou
de outros comportamentos multifsicos (p.ex. quando se observa o aparecimento de duas
fases exponenciais para uma reao unimolecular)
Entretanto, mesmo quando a cintica de uma reao unimolecular mostra uma nica
fase exponencial, a ausncia de intermedirios detectveis no pode ser usada como prova
de estes no existam. Isso quer dizer que, se os intermedirios existem, eles devem
desaparecer a velocidade significantemente mais rpida do que eles so formados. Isto, por
sua vez, geralmente significa so relativamente mais instveis do que os reagentes e/ou os
produtos. Por exemplo, durante o processo de dobramento protico s so detectadas
espcies moleculares que esto totalmente desnaturadas ou totalmente na forma nativa.
Neste caso, parece improvvel que uma cadeia polipeptdica desordenada possa adquirir a
conformao nativa atravs de um simples passo, uma vez que isto implicaria no ajuste
simultneo de centenas de ngulos de ligao simultaneamente. Este provavelmente um
caso no qual quaisquer que sejam os intermedirios eles so instveis e no se acumulam
durante o curso da reao.
Diagramas das reaes coordenadas para reaes com intermedirios: Conforme
observado acima, quando se escreve uma reao com mltiplos passos que ocorre em uma
nica direo, simplesmente ignoramos as reaes reversas o que justificado se estas
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reaes ocorrem a uma constante de velocidade muito menor do que as que ocorrem no
sentido do avano da reao. O diagrama da reao coordenada para este tipo de situao
tem uma representao conforme mostrado abaixo:
Observe que a energia livre de A maior do que a de B a qual maior do que para C. A
reao ocorre no sentido decrescente. Tambm, a barreira energtica a ser vencida entre B e
C maior indicando que este o passo mais lento. Finalmente, B est localizado no fundo
de um "vale" profundo de baixa energia indicando que ele deve se acumular.
No prximo diagrama de reao coordenada, a primeira barreira a ser ultrapassada a
maior, e assim correspondendo ao passo mais lento na reao. B agora est num "vale"
muito mais raso do que no exemplo anterior e dessa forma vai se acumular menos .
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A primeira barreira ainda corresponde ao passo mais lento por que, distncia de A
para ultrapassar a primeira barreira, representa a maior variao de energia livre. B,
entretanto, agora menos estvel (tem maior energia livre) do que A . Uma vez que B
produzido, a reao reversa para A cinticamente mais favorvel do que a reao de
avano at C uma vez que a barreira energtica no sentido reverso menor do que no
sentido do avano. Em casos como este, onde existe um passo velocidade limitante prequilbrio, o ponto de maior diferena de energia livre (agora o pico entre B e C) no
representa o passo mais lento, mas representa o passo velocidade limitante ou velocidade
determinante da reao global.
Considere, por exemplo, o que aconteceria se a constante de velocidade para a converso de
B ! C fosse 100 vezes maior:
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