Federico Rivadeneira

CAPÍTULO XI
SÍNTESIS DE RNA Y PROTEÍNAS
La síntesis de proteínas es un proceso vital para la célula. Dentro de los 100.000 genes existentes
podemos diferenciar los genes housekeeping que son aquellos que codifican proteínas necesarias para el
metabolismo celular de los genes que intervienen en el desarrollo regulando la diferenciación celular.

TRANSCRIPCIÓN DEL DNA

El proceso de transcripción es aquel a partir del cual se forma una molécula de RNA a partir de una
molécula molde de DNA mediante RNA polimerasas que polimerizan los ribonucleósidos trifosfato y otros
factores. Por esto mismo se dice que la RNA polimerasa es una holoenzima por el hecho de que actúa como
un complejo enzimático.

Existen tres tipos de RNA polimerasas:

1. RNA Pol I: síntesis de rRNA 45S

2. RNA Pol II: Síntesis de mRNA, snRNA
3. RNA Pol III: Síntesis de tRNA y rRNA 5S

El ribonucleósido trifosfato entrante es correctamente apareado según los apareamientos de

Watson-Crick, en caso de ser el correcto la holoenzima cataliza la formación de un enlace fosfodiéster con el
3’OH de la cadena de RNA naciente con el fosfato α liberando un pirofosfato.

Por convención el primer nucleótido del transcripto que es donde comienza el gen se indica como el
+1 y se coloca a la derecha en el diagrama del mismo. La polimerización es en el sentido 5’3’ por lo que la
lectura del DNA es en la dirección 3’5’.

MECANISMO DE INICIACIÓN EN LA TRANSCRIPCIÓN

La RNA Pol II es la mejor estudiada y cuando inicia lo hace en la forma de un complejo de iniciación
donde RNA Pol II se une a determinados factores de transcripción proteicos que se hayan altamente
conservados. El inicio de la transcripción está regulado por señales internas que modifican el funcionamiento
del complejo de iniciación, en caso de ser una señal positiva, el mismo se une a un sitio promotor para iniciar
la transcripción.

FACTORES MOLECULARES INVOLUCRADOS EN LA TRANSCRIPCIÓN

La regulación se lleva a cabo por factores externos al gen y también por factores inherentes al
mismo. Los factores externos pueden ser factores de transcripción basales o factores reguladores específicos
del tejido. Los factores internos pueden ser secuencias nucleotídicas promotoras o sino reguladoras.

Los promotores son secuencias de 25-30 bp que se hayan usualmente antes del inicio de
transcripción, son secuencias altamente conservadas y se las denomina cajas como la TATA, CAAT y GC.

En cambio, los reguladores son secuencias cortas capaces de estimular o inhibir la transcripción y
pueden ser tanto posteriores como anteriores al inicio. Secuencias importantes son las potenciadoras y
todas estas son las que se unen a proteínas que regulan la transcripción.

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Los factores transcripcionales o reguladores a los que se une la RNA Pol II son los siguientes:

1. Factores de transcripción basales: Son proteínas que se unen a Pol II sin necesidad de
reguladores provocando la transcripción basales de genes de la clase II.
2. Factores activadores: Proteínas que se unen al sitio promotor estimulando la transcripción
basal, están presentes en casi todas las células eucariotas y existen algunos factores específicos
de tejido.
3. Coactivadores: No se unen a sitios de DNA pero interconectan los activadores con el complejo
de iniciación modificando su actividad.
4. Factores represores: Bloquean la unión de factores transcripcionales o activadores del
promotor.

FORMACIÓN DEL COMPLEJO DE INICIACIÓN DE LA TRANSCRIPCIÓN

1. TBP (proteína que reconoce la caja TATA) con TAFs (TBP associated factors) se unen conformado
el TFIID y se unen a la caja TATA cambiando la conformación espacial del promotor y reclutando
los TFIIs
2. La RNA Pol II se une al TFIIF colocando una de las subunidades del último con actividad helicasa
en el DNA.

Aunque los TF’s son muchos, la alta especificidad se logra mediante la combinación de los mismos.

MECANISMO DE ACTIVACIÓN

La transcripción basal es común a toda célula pero la diferenciación se logra mediante los factores
activadores y coactivadores que actúan sobre los TF’s basales. Así mismo, los TF’s basales son comunes a
todas las células y su actividad diferencial de un tipo celular a otro depende de los factores antedichos. Los
factores activadores funcionan bajo tres posibles mecanismos básicos.

1. Incrementando el índice de transcripción.

2. Inhibiendo la represión de los factores basales.
3. Actuando sobre factores represores y sobre histonas.

INTERACCIÓN ENTRE FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN Y DNA

La interacción entre ambos es de tipo estructural (nucleótido-aminoácido) y se da usualmente en el

surco mayor de la doble hélice sin ruptura de enlaces. Muchos factores presentan estructuras diméricas y
simétricas que permiten unirse a dos surcos contiguos del DNA debido a que las secuencias repetidas le dan
simetría al DNA también. Las estructuras adoptadas por los TF’s son las siguientes:

1. (Hélice vuelta hélice)2: Son estructuras diméricas que poseen una hélice lectora que reconoce la
secuencia reguladora y la otra que mantiene a la lectora en su posición.
2. (Dedos de Zinc)2: El dedo de zinc es una proyección de la proteína donde el Zn2+ posee un índice
cuatro de coordinación uniéndose a dos pares de cisteínas o a un par de cisteína y un par de
histidina. Existiendo más de un par de dedos usualmente por molécula. Son las más comunes.
3. (Cremallera de leucinas)2: Formada por una estructura proteica doble que cada siete
aminoácidos posee una leucina proyectada hacia dentro formando la cremallera y en su extremo

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posee dos hélices helicoidales que poseen dos sitios, uno de unión a DNA y otro que interacciona
con la otra hélice manteniendo la estructura

PROCESAMIENTO DEL RNA

La modificación del transcripto primario ocurre en tres zonas diferentes de la molécula y son:

1. Capuchón 5’: Su función es prevenir la hidrólisis por parte de las nucleasas y participa en la
remoción de intrones y en la unión del mRNA a los rRNA. Consiste en una reacción enzimática
donde una 7-metilguanosina trifosfato se une al extremo 5’ de la cadena naciente formando un
enlace trifosfato 5’,5’.
2. Poliadenilación 3’: Protege la hidrólisis enzimática e interviene en la exportación del mRNA. El
agregado del extremo 5’ Poli A (250 A) ocurre luego de la acción de una endonucleasa que
reconoce la secuencia AAUA-AA y corta la molécula unos 20 nucleótidos después permitiendo la
acción de la Poli A polimerasa.
3. Remoción de intrones: El proceso de remoción de intrones y empalme de exones está regulado
en principio por pequeñas ribonúcleoproteínas nucleares (snRNP) compuestas por snRNA rico en
uridinas y proteínas. Existen diversas RNP’s clasificadas como (U1, U2,...) donde su combinación
da lugar a un complejo denominado espliceosoma que reconocerá ciertas secuencias en los
extremos 5’ y 3’ de intrones dando lugar al corte y empalme.

TRADUCCIÓN DEL mRNA

Las etapas son activación, iniciación, elongación y terminación.

tRNA:

Los tRNA son moléculas adaptadoras de aminoácidos implicadas en el proceso de traducción. Los
tRNA poseen cerca de 70-90 nucleótidos y su etapa última de procesamiento constituye el reemplazo de una
secuencia terminal 3’AAA por una secuencia CCA. El proceso de unión del aminoácido a su tRNA constituye
dos pasos analíticos, el primero, el reconocimiento y unión del aminoácido al extremo 3’ del tRNA y el
segundo la activación del aminoácido permitiendo así el enlace peptídico.

La unión del aminoácido al tRNA es una reacción en dos pasos catalizada por las aminoacil tRNA
sintetasas dando lugar a un aminoacil-tRNA. El primer paso consiste en el ataque al fósforo α del ATP por
parte del grupo carboxilato del aminoácido liberando pirofosfato y formando el aminoacil-adenilato. El
segundo consiste en la transferencia del grupo aminoacil al tRNA.

RIBOSOMAS

El ribosoma eucariota está compuesto por dos subunidades, la 40S y la 60S que juntas conforman la
80S. La 40S está conformada por rRNA 18S más 33 proteínas y la 60S por los rRNA 28S, 5,8S y 5S más 50
proteínas.

Las subunidades 28, 18S y 5,8S parten de una subunidad 45S que es procesada y codificada por un
gen que posee unas 200 copias en el genoma separadas por espaciadoras en los cromosomas 13-15 y 21,22
donde el proceso de transcripción y procesamiento ocurre en el nucléolo. Un caso diferente lo da la
subunidad 5S que se sintetiza fuera del nucléolo pero luego ingresa al mismo para asociarse a proteínas.

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ETAPAS DE LA SÍNTESIS PROTEICA

1. Iniciación: Se reconoce una secuencia vecina al extremo 5’ del RNA donde se une el IF-4 y el
fMet-tRNAfMet se une a la 40S mediante el IF-2 y GTP. Entonces, finalmente se une el mRNA
mediante el IF-3 a la 40S reconociendo el codón AUG del mRNA. Finalmente su une la 60S
formando el denominado complejo de iniciación.
2. Elongación: El ribosoma 80S posee dos sitios activos, el sitio A (aminoacílico) y el sitio P
(peptídilico) donde los aminoacil tRNA se van ubicando alternadamente. Cuando el aminoacil-
tRNA está en el sitio A se le une un factor de elongación unido a GTP llamado Tu-GTP. Luego, se
forma una unión peptídica mediante el ataque del sitio A sobre el P en un C=O mediante la
peptidil transferasa ubicada en la 60S. Entonces el ribosoma se mueve un codón en dirección 3’
del mRNA mediante un factor de elongación llamado EF-2.