Bioinformática

Marco Regalia
marcoregalia@hotmail.com
Bioinformatics For Dummies 2nd Edition
Carpeta fotocopias #243

INTRODUCCIÓN A LA BIOINFORMÁTICA
Introducción al curso
Que es la bioinformática
Aplicaciones de la bioinformática
1 Desarrollos y desafíos futuros
Bases de química
Bases de biología
Bases de genética
NCBI Entrez
SECUENCIAS DE ADN
Bases de datos de secuencias de ADN
Formatos de secuencias
2 Programación dinámica
Algoritmos de búsqueda de ADN
Algoritmo BLAST
Herramientas BLAST en línea
ALINEAMIENTO DE SECUENCIAS Y PROTEÍNAS
Alineamiento de secuencias
ClustalW y JalView
4 Proteínas y proteómica
Análisis comparativa de proteínas
Bases de datos de familias de proteínas
PROSITE, PRINTS, Pfam, BLOCKS
BASES DE DATOS
Datos biológicos
Definición de bases de datos
Modelos de bases de datos
5 Estructura de bases de datos relacionales
Normalización
Interfaz
Bases de datos biológicos

ESTRUCTURAS BIOLÓGICAS
GENES
Estructura de ADN
El código genético
Estructura de ARN
Open Reading Frames (ORF)
Estructura de proteínas
Búsqueda de ORF
3 NCBI ORF Finder
6 Protein Data Bank
Folding de proteínas
Modelos estocásticos
Alineamiento de estructuras
GENSCAN
Blog bioinformática en Colombia
Protein-BLAST
Opiniones/sugerencias sobre curso

Marco teórico T 1er parcial 35%

L Programa 1er laboratorio
Análisis y resultados E 2do parcial
A Conclusiones 2do laboratorio
35%
S
B Bibliografía
Examen final 30%
Presentación en clase T