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Segue um arquivo com extenso .doc, contendo duas estruturas qumicas: a) Calix[4]arene b) calix[4]resorcinarenes. Na estrutura (a) em posio para as hidroxilas use o radical terbutil. Otimize sua geometria de duas formas: com e sem pontes de hidrognio. Usando duas molculas (a), inverta uma delas de modo a montar um dmero, unido apenas por pontes de hidrognio. No segundo caso, a estrutura de menor energia ser diferente da geometria que lhe encaminhei. Obtenha essa estrutura (a) otimizada. Calcule os seus volume, altura e largura em angstrom. Calcule o dimetro do crculo circunscrito as quatros hidroxilas (sem pontes) e aos quatros radicas terbutilas do lado oposto.Para (b) faa a mesma coisa considerando os R = Me e radical terbutila. Faa um tabela contendo, para as molculas, calculadas o seguinte: Calor de formao, estiramento e intensidade das ligaes O-H e O-C , na regio do infravermelho. Energia HOMO e LUMO. Energia da ligao da pontes H, tanto para o monmero com para o dmero.
1- Monmero Calex[4]areno
Dmero Calex[4] Resorcinareno com grupo t-butila - Estrutura molecular e diagrama de potencial eletrosttico -
Calex[4]areno monmero
Parmetro Volume rea Superficial Massa Calor de Formao Momento dipolar Energia de Ligao Energia Eletrnica Energia Nuclear Energia Total Energia de Hidratao Energia das hidroxilas no I.V. = 223,72 cm-1 A = 10,816 = 1514,79 cm-1 A = 67,984 = 3421,32 cm-1 A = 28,937 = 3431,89 cm-1 A = 34,807 Valor Calculado 1777,22 A3 843,32 A2 648,93 u.m.a. -169,2648773 Kcal/Mol 2,842 D -10844,37305 Kcal/Mol -2232144,7500 Kcal/Mol 2054834,8750 Kcal/Mol -177309,7344 Kcal/Mol -2,13 Kcal/Mol Tipo de Vibrao Vibrao angular na horizontal ( wagging) Vibrao angular na vertical ( rocking) Estiramento linear simtrico ( stretching) Estiramento linear simtrico ( stretching) Mtodo QSAR-AM1 QSAR AM1 QSAR-AM1 AM1-MP AM1 -MP AM1 -MP AM1-MP AM1-MP AM1- MP AM1-MP Mtodo AM1AM1AM1AM1-
Energia da ligao -(C-O) = 822,50 cm-1 A= 9,558 = 1472,64 cm-1 A = 23,692 = 1680,28 cm-1 A = 6,504
Tipo de Vibrao
Vibrao angular na horizontal ( rocking ) Vibrao de estiramento linear (stretching) -(C-O)-H Vibrao de Estiramento linear A vibrao se estende ao anel aromtico Vibrao de Estiramento linear
Mtodo
AM1AM1AM1AM1-
Tipo de Vibrao
Vibrao angular na vertical da ligao (-C ) (rocking) Vibrao angular dos grupos metila ( rocking) e vibrao de estiramento linear da ligao ( C-C ) dos radicais t-butila Estiramento (C-H) dos grupos metila dos radicais t-butila
Mtodo
AM1 AM1AM1-
= 3154,40 cm-1 A = 0,264 = 3169,74 cm-1 A = 11,992 = 3080,98 cm-1 A = 14,28 = 1375,35 cm-1 = 569,93 cm-1 = 4,320 cm-1 A = 3,812 A = 6,641 A = 0,009
Outras vibraes
Tipo
Estiramento H de anel aromtico Estiramento assimtrico da ligao carbonohidrognio em [ -( H-C-H )-] localizada entre os anis aromticos Vibrao dos anis aromticos Vibrao do anel aromtico Vibrao angular das 4 subunidades aromticas presentes na molcula 4,4365 A 11,8501 A 7,53003 A 12,19345 A 8,146245 A -2,50097 Kcal / Mol -1,250485 Kcal / Mol 1,55 A3 -54,6024704 Kcal / Mol -260,2968 Kcal / Mol -23193 Kcal / Mol
Mtodo
AM1AM1AM1AM1AM1-
Dimetro do circulo circunscrito as hidroxilas (media ) Dimetro do circulo circunscrito aos radicais t-butila (media) Altura Largura Media (mx.) Dimetro mdio ( ( D(OH) + D(t-but) / 2) Energia das ligaes de Hidrognio Energia de cada Ligao de Hidrognio
Diferena de volume entre a estrutura sem e com ligaes de hidrognio ( V )
Diferena de calores de formao - Estrutura com e sem ligaes de hidrognio ( Hf ) Diferena de energia total entre as estruturas com e sem ligaes de hidrognio( ET ). Diferena de Energia eletrnica entre as estruturas com e sem ligao de hidrognio ( EEl )
Simulated Annealing
Temperatura ( K ) 75,155 ( inicial ) 75,155 ( inicial ) 405,662 (final ) 405,662 (final) Energia Cintica Potencial Cintica Potencial Valor Calculado ( Kcal / Mol ) 23,29811 16,5431 125,7559 116,0040
Mtodo
Molecular Dynamics Averages ( AM1-Hyper NDO ) Molecular Dynamics Averages ( AM1-Hyper NDO ) Molecular Dynamics Averages ( AM1-Hyper NDO ) Molecular Dynamics Averages AM1-Hyper NDO )
T = 330,507 K
Estrutura sem ligaes de hidrognio entre os grupos hidroxila Energia Orbital ( HOMO (-) ) Energia ( eV ) Mtodo Orbital : 0 Simetria : 128 A -8,727874 AM1 Semi emprico (hyper NDO) Energia Orbital ( LUMO (+) ) Energia ( eV ) Mtodo Orbital : 0 Simetria : 129 A 0,2688762 AM1 Semi emprico (hyper NDO) 8,9967502 | (H-L ) GAP | Estrutura com ligaes de hidrognio entre os grupos hidroxila Energia Orbital ( HOMO (-) ) Energia ( eV ) Mtodo AM1 Semi emprico (hyper NDO) -8,712570 Orbital : 0 Simetria : 128 A Energia Orbital ( LUMO (+) ) Energia ( eV ) Mtodo AM1 Semi emprico (hyper NDO) 0,2547511 Orbital : 0 Simetria : 129 A 8,9673211 | (H-L ) GAP | Diferena de (H-L)GAP entre as Estruturas 0,0294291
com e sem ligaes de hidrognio
Mtodo
Molecular Dynamics Averages ( AM1-Hyper NDO ) Molecular Dynamics Averages Molecular Dynamics Averages Molecular Dynamics Averages ( AM1-Hyper NDO ) ( AM1-Hyper NDO ) ( AM1-Hyper NDO )
4,2684911 -11154,63 170,897 -10894,06 Valor Calculado 739,42 A2 862,51 A2 0,6351 D -206823,4219 Kcal / Mol -11199,73242 Kcal /Mol -286,3881226 Kcal /Mol -2648836,25 Kcal / Mol 2442012,75 Kcal / Mol Energia -8,56962 e.V. 0,22874 e.V. 8,79836 e.V. 0,36785291 e.V. -3,905461 Kcal / Mol -3,90527 Kcal / Mol
1770,52 A3
Parmetro
Volume
Mtodo
AM1
rea Superficial ( aprox ) rea Superficial ( grid ) Momento Dipolar Energia Total Energia de Ligao Calor de Formao ( Hf ) Energia eletrnica Energia Nuclear Orbital HOMO (-) Nvel : 0 Simetria :141A LUMO (+) Nvel : 0 Simetria :140 A | ( H-L ) gap |
Diferena de | (H-L)gap | entre a estrutura com e sem ligaes de hidrognio Diferena de Hf entre as estruturas com e sem ligaes de hidrognio Energia total das ligaes de Hidrognio
AM1 AM1 AM1 AM1 AM1 AM1 AM1 AM1 Mtodo AM1( hyper NDO) AM1( hyper NDO)
Potencial Eletrosttico
HOMO ( nvel : 0 )
E = -8,686122 eV
752,13 A2 861,49 A2 3,685 D -206819,5156 Kcal/Mol -17,25 Kcal/Mol -11195,82715 Kcal /Mol -282,4826965 Kcal /Mol -2648143,75 Kcal/Mol 2441324,25 Kcal/Mol Energia -8,42543 e.V. 0,00507709 e.V. 8,43050709 e.V. Vibraes Moleculares no Infra Vermelho
Tipo de Vibrao
Mtodo
AM1( hyper NDO) AM1( hyper NDO)
Mtodo
Energia da ligao -(C-O) = 554,51 cm-1 = 1717,24 cm-1 = 230,57 cm-1 = 541,15cm-1 A = 3,249 A = 170,603
Tipo de Vibrao
Deformao rotacional dos grupos CH3 do grupamento t-butila Estiramento linear da ligao ( carbono aliftico carbono do grupamento t-butila )
= 2896,72 cm-1
Outras vibraes
Tipo de Vibrao
Estiramento linear da ligao (C-H ) da cadeia aliftica.
Valor Calculado
1328,58 A3 696,64 A2
Mtodo
QSAR QSAR QSAR QSAR AM1 AM1 AM1 AM1 AM1
544,60 u.m.a. 2,046 D -28,22 Kcal /mol ( sem ligao hidrognio ) -31,34 Kcal /mol ( com ligao de Hidrognio ) -163764,5938 Kcal /mol -7881,828125 Kcal /mol -269,6122742 Kcal /mol -1627178,75 Kcal/ mol 1463414,125 Kcal / mol -0,524414 Kcal / mol -0,1311035 Kcal / mol Energia ( e.V.) -8,52765000 e.V. -0,04162084 e.V. 8,48602916 e.V. -8,65231900 e.V. 0,19099260 e.V. 8,8433116 e.V.
Tipo de Vibrao Estiramento linear da ligao ( O-H ) Vibrao angular da ligao (O-H )
Mtodo
AM1 - Semi emprico
(hyper NDO)
Mtodo
= 365,80 cm-1 A = 5,540 -1 = 1707,83 cm A = 119,495 Outras vibraes moleculares I.V. = 260,61 cm-1 A = 0,124 = 1085,56 cm-1 A = 0,039 deg. = 1 = 3052,66 cm-1 A = 0,851 deg. = 3 = 930,21 cm-1 A = 12,525 = 1438,46 cm-1 A = 53,825
Dimetro mdio do circulo circunscrito as hidroxilas
Energia ( e.V.) Vibrao angular da ligao ( C-O ) Estiramento linear da ligao ( C-O )
Tipo de Vibrao
Altura aproximada Dimetro mdio do circulo circunscrito aos (-CH3 ) Diferena de Hf relativo as ligaes de hidrognio | (H-L)gap | ( em relao as ligaes de hidrognio)
Valor Calculado
No calculado corretamente ( provvel bug ) 1297,86 u.m.a. 0,1198 D -354629,875 Kcal/ mol -21699,13477 Kcal / mol -348,9185181 Kcal /mol -6739441 Kcal / mol 6384811 Kcal/ mol -19,72 Kcal / mol
Mtodo
AM1 AM1 AM1 AM1 AM1 AM1 AM1
Orbital
HOMO (-) Nvel : 0 Simetria : 256 A LUMO (+) Nvel : 0 Simetria : 257 A | ( H-L )gap |
| ( H-L )GAP | referente as ligaes de hidrognio
Dimetro mdio do circulo circunscrito as hidroxilas Dimetro Mdio do circulo circuscrito aos radicais t-butila Comprimento mdio das Ligaes de Hidrognio
Energia ( e.V. )
-8,6014800 0,3482997 8,9497797 0,2383233 e.V. 4,810876 A 15,40760 A 2,225953 A -6,61914 Kcal/ mol -1,654785 Kcal /mol -6,6180725 Kcal /mol
Tipo de Vibrao Estiramento Linear da ligao ( O-H ) Deformao angular no plano da ligao ( O-H ) Deformao angular fora do plano da ligao ( O-H ) Estiramento linear das ligaes (O-H ) Deformao angular fora do plano da ligao ( O-H ) Deformao angular da ligao ( C-O ) no plano Estiramento Linear da Ligao ( C-O ) Deformao angular fora do plano da ligao ( C-O ) Estiramento linear da ligao (C-O ) e deformao angular da cadeia aliftica lateral Estiramento Linear da ligao ( C-H ) aromtico
Mtodo
AM1 Semi emprico (hyper NDO ) AM1 Semi emprico (hyper NDO )
Energia das ligaes de hidrognio Energia de cada ligao de Hidrognio Hf referente as ligaes de hidrognio
Energia das hidroxilas no I.V. = 3431,56 cm-1 A = 93,566 deg. = 1 Sim. = 618 A = 1552,52 cm-1 A = 49,291 deg. = 1 = 429,40 cm A = 13,787 = 3404,85 cm-1 A = 162,424 = 378,80 cm-1 A = 10,914 Energia das ligaes ( = 1192,78cm-1 = 1467,83 cm-1 = 804,28 cm-1 = 900,04 cm-1
-1
Sim. = 466 A
deg. = 1 Sim. = 127 A deg. = 1 Sim. = 612 A deg. = 1 Sim. = 115 A C O ) no I.V deg. = 1 Sim. = 314 A deg. = 1 Sim. = 451 A deg. = 4 Sim. = 205 A deg. = 1 Sim. = 212 A
AM1 Semi emprico (hyper NDO ) AM1 Semi emprico (hyper NDO ) AM1 Semi emprico NDO AM1 Semi emprico NDO AM1 Semi emprico NDO
AM1 Semi emprico NDO AM1 Semi emprico NDO AM1 Semi emprico NDO AM1 Semi emprico NDO
deg. = 16 Sim. = 235 A Estiramento Linear da ligao ( C-C ) dos grupo t-butila Deformao angular da ligao (C-C ) da cadeia aliftica lateral. Estiramento Linear assimtrico das ligaes ( C-H ) dos grupos t-butila Estiramento Linear simtrico da Ligao ( C-H ) da cadeia aliftica lateral. Estiramento Linear assimtrico da ligao ( C-H ) da cadeia aliftica lateral Deformao angular da estrutura de anis aromticos ( tipo batimento ) Vibrao do sistema na direo do eixo de simetria ( tipo batimento )
A = 0,045 deg. = 2 Sim. = 203 A A = 0,070 deg. = 42 Sim. = 521 A A = 3,909 deg. = 8 Sim. = 563 A
A = 2,657 deg. = 2 Sim. = 513 A A = 0,002 deg. = 2 Sim. = 1A A = 0,004 deg. = 1 Sim. = 24 A
Dimero - Calix[4]resorcinareno - grupo t-butil ( por Ligao de Hidrognio ) Parmetro Valor Calculado Mtodo
Volume Massa Energia Total Momento dipolar Energia de ligao Calor de formao ( Hf ) Energia Eletrnica Energia Nuclear Orbital HOMO (-) Nvel : 0 Sim. : 280 A LUMO (+) Nvel : 0 Sim.: 281 A | (H-L) Gap |
| ( H-L )GAP | referente as ligaes de hidrognio
Dimetro aproximado do circulo circunscrito aos radicais t-butila Dimetro aproximado do circulo circunscrito as hidroxilas Altura (aprox.) Largura (aprox.)
No calculado corretamente ( provvel bug ) 1425,84 u.m.a. -413647,4063 Kcal /mol 3,941 D -22400,01758 Kcal / mol -573,3299561 Kcal / mol -8030253,5 Kcal / mol 7616606 Kcal / mol Energia ( e.V.) -8,4750490 0,003988023 8,479037023 0,169131123 14,02024 A 10,73396 A 13,0526 A 11.8714 A 4,54959 A 7,19336 Kcal / mol 0,89917 Kcal / mol
Mtodo
AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO)
( = 2)
Energia das hidroxilas no I.V. Tipo de Vibrao = 3466,98 cm-1 I = 31,109 Sim. = 641A deg.= 1 Estiramento linear ligao O-H ( O96 - H107) = 3463,72 cm = 3399,92 cm = 532,35 cm
-1
AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO)
I = 101,589 Sim. = 640 A deg.= 2 Estiramento linear ligao O-H ( O95 H106) I = 69,715 Sim. = 627 A deg.= 1 Estiramento Linear ligao O-H (O46-H103) I = 4,225 I = 9,877 I = 5,320 Sim. = 173 A deg.= 2 Sim. = 356 A deg.= 4 Sim. = 494 A deg.= 2 I.V. deg.= 1 deg.= 1 deg.= 4 Vibrao angular fora do plano ligao O-H
( O45 H105),(O95-H106),(O44-H108),(O96 H107), ( O96-H107),(O44-H108)
-1
-1
Vibrao angular no plano ligao O-H Vibrao angular no plano ligao O-H ( O98-H107) Vibrao de estiramento dos anis aromticos Tipo de Vibrao Vibrao angular no plano ligao C-O ( C15-O46),(C18-O47),(C24-O98) Estiramento linear ligao C-O ( C15-O40),(C24- O98),(C71-O98),(C18-O47) Estiramento Linear ligao C-O ( C9-O97),(C7-O99),(C22-O45) Tipo de Vibrao Vibrao angular ligao C-H aromtica ( C3-H100),(C6-H29) Vibrao angular ( type umbrella ) das ligaes C-H dos grupos CH3 pertencentes aos grupamentos t-butila ( C56-H78),(C56-H80),(C56-H74),(C55-H79),(C55H73),(C55-H76),(C20-H35) e outros. Estiramento linear ligao C-H das cadeias laterais alifticas ( C20-H35) Estiramento Linear da ligao C-H das cadeias alifticas ( C28-H39 ) Vibrao angular rotacional dos grupos t-butila Vibrao angular dos anis aromaticos
AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO)
AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO)
AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO)
deg.= 1
Valor Calculado
No calculado corretamente ( provvel bug ) 1089,20 u.m.a. -327535,1875 Kcal / mol 4,352 D -15769,66016 Kcal / mol -545,228677 Kcal / mol -5079278,0 Kcal / mol 4751742,5 Kcal / mol 11,0235 A 11,10474 A 3,70762 A 10,4335 A 3,6875 Kcal / mol 0,4609375 Kcal / mol Energia ( e.V.) -8,405101 0,03212565 8,43722665 3,687095 Kcal / mol 0,11473075 e.V.
Tipo de Vibrao
Mtodo
QSAR QSAR QSAR QSAR QSAR QSAR QSAR
Largura aproximada Energia das ligaes de hidrognio Energia de cada ligao de hidrognio Orbital HOMO ( - ) Nvel : 0 Simetria : 208 A LUMO ( + ) Nvel : 0 Simetria : 209 A | (H-L)gap | Calor de formao referente as ligaes de hidrognio
| ( H-L )GAP | referente as ligaes de hidrognio
Energia das ligaes ( O-H ) no I.V. = 3468,87 cm-1 A = 65,851 deg. = 1 Sim. = 426A = 659,51 cm-1 A = 36,364 = 1488,62 cm-1 Sim. = 140 A
Mtodo
AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO)
Mtodo
AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO) AM1 Semi emprico (hyper NDO)
= 1717,92 cm-1 A = 36,884 deg. = 1 Sim. = 346 A = 352,29 cm-1 = 199,50 cm-1 A = 15,636 deg. = 1 Sim. = 80 A
Estiramento Linear das ligaes C-H dos grupos CH3 Deformao angular das ligaes C-H dos grupos CH3
( umbrella )
Estiramento Linear das ligaes de hidrognio Deformao angular ligaes C(alif) C(arom )
( carbono aliftico carbono aromtico ( Bend ) ) ( scissoring )
= 183,51 cm-1 A = 4,650 deg. = 1 = 1400,48 cm-1 A = 15,416 deg. = 8 = 1426,28 cm-1 = 1267,80 cm-1 A = 31,74 A = 8,077 deg. = 2
Deformao angular das Ligaes C-H dos grupos CH3 Estiramento Linear da ligao C-C da cadeia aliftica Deformao angular das ligaes C-H dos carbonos aromticos da posio 1,4
Concluses
1. Observando-se o intervalo gap (H-L) calculados para os trs dmeros, verificamos que o dmero de calex[4]areno apresenta maior estabilidade , com um maior valor de (H-L) ,enquanto o dmero de calex[4]resorcinareno com grupo metil parece ser o menos estvel ,pois apresenta menor (H-L). Tanto o dmero com grupamentos tbutila quanto o que apresenta grupos metila apresentam um intervalo( H-L) muito prximo ,com uma diferena de apenas cerca de 0,042 eV, mostrando que a reatividade destes dois compostos so semelhantes. As ligaes de hidrognio estabilizam o sistema.Observando a diferena entre os (H-L)gap para as estruturas com e sem ligaes de hidrognio ,verificou-se que a diferena de (H-L)gap para o dmero de calex[4]areno e praticamente o dobro da observada para o dmero de Cales[4]resorcinareno com grupamentos metila, sugerindo a possibilidade da contribuio das ligaes de hidrognio para a estabilidade da estrutura ser maior no dmero de Calex[4]areno.
2. Observando-se as entalpias de formao vemos que o processo para o formao das estrutura so exotrmicos , o dmero de calex[4]areno apresentando a menor entalpia de formao ( Hf = -348,9185 Kcal/mol ) ,enquanto o dmero de Calex[4]resorcinareno com grupamentos t-butila apresenta a maior entalpia de formao ( -573,3299 Kcal / mol ) , como j era esperado.
3.
4. Foi observado que em menores freqncias (menores nmeros de onda ) toda a estrutura comea a vibrar, enquanto que em freqncias maiores temos as vibraes caracterstica das diferentes ligaes moleculares. 5. Os dmeros de calex[4]resorcinareno com t-butila e de calex[4]resorcinareno com metila podem servir como hospedeiros para espcies convidadas de maior volume molecular, o maior dimetro terico aproximado para o circulo circunscrito as hidroxilas foi obtido para o dmero de Calex[4]resorcinareno com grupos metila . 6. Quanto as ligaes de hidrognio intramoleculares nos monmeros, parece que no calex[4]areno no apresentam uma contribuio significativa para a sua estabilidade,j nos dois Calex[4]resorcinarenos estudados, esta contribuio parece ser mais significativa.