Cmo aprender a leer un artculo cientfico?

Alfredo Prieto Martn Professor in Immunology at Alcal University Coordinator of Post grade program in Immunology Consultant in the field of Problem Based Learning Administrator of: Web site on PBL http://www2.uah.es/problembasedlearning WebBlog site on PBL: http://www.e-pbl-es.tk Contact me at : alfredo.prieto@uah.es or http://www.alfredoprieto.tk
Unidad mixta

CSIC/UAH

Plan de la clase
1. Metodologa para la asimilacin de la informacin primaria Cmo comprender el significado de un texto cientfico. Proceso de lectura sistemtica Cmo leer para entender el significado de un texto complejo? Bsqueda orientada de informacin Qu informacin hay que buscar en cada seccin? Mtodo del parntesis ().

2. Comprender e interpretar la iconografa (resultados).

3. Escribir un esquema, redactar un resumen de cada seccin y una lista de dudas.

Mtodos de representacin grafica de ideas

I. Comprensin del texto: Principios de lectura sistemtica

1.

2.

3.

4.

Dividir la dificultad en partes y abordarlas sucesivamente. Localizar lo que no se entiende y aclararlo: Usar diccionario, libro de consulta e Internet para descifrarlo y comprenderlo. Registrar lo ms relevante: Apuntar los significados descifrados e ideas principales. Recapitular para integrar: Releer, resumir y esquematizar para integrar la informacin.

1. Prctica de la lectura sistemtica: leer , releer y volver a releer

lectura (descifrar palabras para comprender

Primera

oraciones): buscar (diccionario, google) y apuntar significado

palabras y hallar relacin entre ellas. Descifrado el significado

de los trminos se comprende el mensaje de la oracin.

Segunda lectura (recapitulacin oraciones para comprender

prrafo): relee y relaciona las oraciones y apuntar al margen el

tema principal de cada prrafo.

Tercera lectura (releer prrafos para comprender seccin): se

lee de un tirn para relacionar temas de distintos prrafos.

Elaboracin de listas de ideas principales y glosario.

I. Comprensin del texto: Bsqueda orientada de informacin

Estructura A + (I M R D) lgica del artculo

Cuestionario para lectura crtica del artculo Qu mensajes principales hay que buscar en cada seccin? Introduccin Por qu lo hicieron? Materiales y mtodos Qu hicieron? Resultados Qu encontraron? Discusin Qu significa? Abstract resumen de todo

El ttulo
El ttulo identifica la idea principal del artculo, informa de los nuevos hallazgos o conclusiones. Qu se mide? En qu modelo? Se descubre su causa?

Abstract: Un resumen breve

Background: Una oracin que introduce la cuestin principal. Es opcional
Cuestin: objetivos o propsito: Qu quiere contestar este trabajo? Esa es la cuestin. Qu mtodos utilizan? Qu experimentos hacen? Resultados: Qu han encontrado? Cules son los resultados y hallazgos ms importantes? Las respuestas: Cuales son las conclusiones del estudio.

A veces al final se sealan aplicaciones potenciales, implicaciones e incluso especulaciones.

Introduccin
Sita

el estado del conocimiento actual Define los conceptos clave y premisas asumidas. Justifica esas asunciones. Explica por qu los autores realizaron el estudio y define los objetivos del mismo. Establece la cuestin a la que responde el trabajo qu se pretende encontrar?

Establece hiptesis Proposicin afirmativa de la que se deducen predicciones que sern confirmadas o rechazadas por los resultados experimentales Se relaciona la cuestin con la aproximacin experimental y se establece esta A veces se anticipa la respuesta encontrada

La introduccin esta dirigida a una audiencia de especialistas

Material y Mtodos
Proporciona informacin (con detalles y referencias)

para que otro cientfico pueda evaluar o reproducir los experimentos.

-Para analizar crticamente un diseo experimental debes comprender su marco conceptual y descubrir en qu premisas o asunciones se basa. -Para comprender esta seccin dibuja esquemas de los protocolos explicados.
La revista ahorra en iconografa, tu no debes hacerlo en una presentacin

-El texto expone los resultados de los experimentos

Resultados

-Las tablas y figuras representan los resultados

principales.

-El orden del texto de los resultados es paralelo al de la

presentacin de datos en ilustraciones. -Cuando el texto te refiera a una tabla o figura haz un parntesis : ( ) (Con suma atencin lee el pie de la figura y tras ello intenta comprenderla)

Discusin
-Su funcin es responder
-A

Qu significan los resultados, qu trascendencia tienen?

Al principio se establece la
respuesta resaltando los

hallazgos relevantes y aspectos ms novedosos.

continuacin se defiende la validez de los hallazgos, usando los resultados del artculo y los publicados por otros autores. -Se explica: -Cmo los resultados soportan la respuesta a la cuestin? - Porqu la respuesta es razonable? - Cmo ajusta en el contexto del conocimiento actual (paradigmas y modelos actuales)?

Se destaca el valor de la respuesta

- Qu aade la respuesta al conocimiento existente? - Deducir aplicaciones o implicaciones de la respuesta Finaliza restableciendo la respuesta, -Recuerda que aade al conocimiento actual Establecen sus implicaciones. posibles aplicaciones e

2. Interpretar las ilustraciones

-Haz

un parntesis () al llegar: 1. -Lee el texto que se refiera a la ilustracin. 2. Lee el pie buscando el significado de las palabras y siglas que no entiendas. 3. -Anota sobre la ilustracin lo que significa cada curva cada smbolo o cada barra e intenta entender la figura. 4. Vuelve a empezar hasta que lo entiendas

ILUSTRACIONES
Las ilustraciones son expresiones grficas, transmiten visualmente mensajes clave difcilmente transmisibles mediante palabras. Slo hay dos tipos: tablas y figuras 1. Tablas
Representacin alfanumrica ordenada en filas y columnas con informacin

2. Figuras
Una ilustracin que no es una tabla

Tabla. 1#. Componentes de una tabla*

Marcador LLC -B quiescente (n=56) Clulas
CD3CD56+(%)

LLC -B no quiescente (n=56)

5.42.7

Controles (n=47)
8.63.4

12.54.7

Clulas
CD3+CD57+(%)

15.66.1

7.82.6

12.52.9

Este es el pie de la tabla. Se representan valores medios y desviaciones estndar de las poblaciones estudiadas. LLC-B leucemia linftica crnica de clulas B. # Nmero de la tabla (segn orden de citacin en texto). * Ttulo. Encabezamiento de la columna. Encabezamiento de la fila. Campo. Indica diferencia significativa con los controles (student t test).

Estructura tpica de un grfico numrico

Cada eje representa los valores de una variable.
Eje X variable independiente. Eje Y variable dependiente.
Healthy controls 200 r=0.36 p=0.05

150

Smbolos y lneas muestran como los cambios en la variable independiente (discreta o continua) afectan a los valores que toma la variable dependiente.

100 B-CLL patients r=0.48 p=0.001 50

10

20

30

40

50

60

% CD4+CD45RA+ cells

Ejercicio de interpretacin de figuras

Cuales son las conclusiones que se pueden extraer
de los resultados presentados en la figura?

Cual es el mensaje principal de la figura?

Relacin hipertextual entre texto, pie y figura

FIG. 1. Impact of the number of centrifugation-washing procedures on cell loss and viability of cultured cells. A: Representative dot plot analyses of viable fresh cells used to adjust the levels for 7-AAD and annexin V positivity. B,C: Analyses of cells cultured for 24 h in complete medium and acquired after one (B) or four wash procedures (C). The cell concen-tration (cells per milliliter) and the imprecision of replicated determina-tions (CV) are shown in each quadrant. The cell populations discrimi-nated in each quadrant are viable cells (annexin V negative/7-AAD negative) in the lower left quadrant, early apoptotic cells (annexin V positive/7-AAD negative) in the lower right quadrant, late apoptotic cells (annexin V positive/7-AAD positive) in the upper right quadrant, and early necrotic cells (annexin V negative/7-AAD positive) in the upper left quadrant. DG: Percentages of cells after annexin V and antibody-labeling procedures, which employ different numbers of cycles of washing-cen-trifugation (from 1 to 4). Viable cells (annexin V negative/7-AAD negative; open bars), early apoptotic cells (annexin V positive/7-AAD negative; very lightly shaded bars), late apoptotic cells (annexin V positive/7-AAD pos-itive; lightly shaded bars), and early necrotic cells (annexin V negative/ 7-AAD positive; dark gray bars). In panels E and G, the black bars represent the fraction of cells lost in the procedure. The PBMCs were cultured for 24 h in the presence (F,G) or absence (D,E) of cycloheximide (10 -3 M). Percentages of cells in relation to those that remain in the test tube (D,F) and in relation to the original number of cells in the sample (E,G). Data of one experiment representative of four are shown.
To assess whether cell loss and damage oc-curred under standard experimental conditions of an-nexin V binding (18), aliquots of cycloheximide-treated and untreated cells were exposed to varying wash cycles and analyzed by double-color stainings for annexin VFITC binding and membrane permeability to 7-AAD. Wash cycles caused significant cell loss (Fig. 1AC). This was cumulative (Fig. 1E,G) and affected the accuracy of the enumeration by decreasing the number of enumerated cells in both unstimulated and cycloheximide-treated cultures (P 0.001; Fig. 1E,G). The number of wash cycles also affected the precision of cell enumeration. The CV of the samples enumerated after four wash cycles was twice as high as that of samples washed only once (Fig. 1B,C). In addition, it should be noted that wash cycles not only caused cell loss but also affected the viability of the cells under analysis (Fig. 1). The increase in both the percentage of annexin V-positive and 7-AADpositive permeable cells caused by the wash cycles was detected by both the proposed (Fig. 1E,G) and the traditional annexin V staining method (Fig. 1D,F). Minimal washing (one cycle) keeps both

3. Escribir un esquema, redactar un resumen y una lista de dudas

-A partir del esquema se redacta un
resumen de cada seccin. -Hacer una lista de dudas.

Tcnicas para la relacin esquemtica de ideas:

Mapa conceptual
apoptosis involves Cell lessions S involves V Cell fragmentation O vanish Late apoptotic cells biasses Apoptotic cell quantification Requires Estimation of fragmented cells

Allow
Apoptotic cell Identification

Allow

Tcnicas para la relacin esquemtica de ideas: rbol temtico

Prognosis LLC-B
Sistemas de estadiaje Binet y Rai Baja Masa tumoral Prognosis variable Criterios de Monserrat LLC-B Quiescente Prognosis variable Fenotipo de las clulas leucmicas Alto CD25 CD38 Mala prognosis

Alta Masa tumoral Mala prognosis

LLC-B No quiescente Mala prognosis

Bajo CD25 CD38 Buena prognosis

Tcnicas para la relacin esquemtica de ideas:

Diagrama de agrupamiento de ideas

Diferenciacin celular Estdio Ciclo celular y apoptosis Aplicaciones

Marcaje con CSFE

Protocolo Experimental

Alicuotado
Marcaje

Sorting

analisis Cultivo

Sugerencias para la preparacin en equipo

Reparto de la lectura de secciones, intercambio de resmenes.
Puesta en comn de las dudas Unos resolveris las dudas de

otros.
Primera tutora: Se plantean y resuelven las dudas pertinaces.

Preparacin de la presentacin .
Segunda tutora: Revisin y Ensayo de presentacin (si queris) se resolvern las dudas pertinaces.

Habis aprendido
1. Cmo abordar la lectura de un artculo.

2. Qu buscar en cada lugar del articulo.

3. Cmo descifrar una ilustracin.

4. Distintas maneras informacin en esquemas.

de

representar

Bibliografa y webgrafa
McNeal, A (2000). How to read a scientific research paper. Home page Problem based Learning www2.uah.es/problembasedlearning/ www.alfredoprieto.tk Direccin donde te cuentan cmo hacer grficos cientficos de calidad: http://cpc.cadmus.com/da/

Ejercicio
Buscar en Internet: Cmo idear y realizar ilustraciones para publicaciones. Encontrareis una presentacin Sobre el tema Examinarlo y entregad las tres ideas mas interesantes que encontris

Ejercicio lectura
Introduccin de un artculo. Marquen palabras y busquen significado. Anoten ideas principales. Hagan un esquema de la introduccin.
Oracin Termino prrafo Oracin seccin prrafo