Filogenetik molekuler dan sejarah evolusi ikan lele ariid Ditinjau kembali: sampling yang komprehensif abstrak Latar

Belakang: Ariids atau ikan lele laut adalah salah satu dari dua keluarga ikan otophysan (dari sekitar 67 keluarga di empat ordo) yang menghuni perairan laut dan payau pada umumnya (meskipun beberapa spesies secara ketat muncul di perairan tawar). Kelompok ini mencakup lebih dari 150 spesies ditempatkan di ~ 29 genus dan dua subfamilies (Galeichthyinae dan Ariinae). Meskipun distribusi global mereka, sebagian besar ariids dibatasi pada rak kontinental karena sebagian perilaku khusus reproduksi mereka (yaitu, inkubasi oral). Jadi, di antara ikan laut, ariids menawarkan kesempatan yang sangat baik untuk menyimpulkan skenario biogeografi sejarah. Hipotesis filogenetik tersedia untuk ariids telah difokuskan pada wilayah geografis yang terbatas dan filogeni komprehensif masih hilang. Penelitian ini disimpulkan filogenetik hipotesis untuk 123 spesies ariid di 28 genus dari berbagai provinsi biogeografi yang berbeda menggunakan keduanya mitokondria dan rangkaian nuklir (sampai ~ 4 kb). Hasil: Meskipun mendukung topologi diperoleh monophyly kelompok basal, sampai sepuluh genus divalidasi dalam studi morfologi sebelumnya tidak sesuai dengan topologi molekul. Baru Dunia ariines yang pulih seperti ariines paraphyletic Dunia dan Lama dikelompokkan ke dalam klade didukung yang selanjutnya dibagi menjadi subklades pada umumnya terbatas pada daratan Gondwanan utama. Sebuah cladogram area umum berasal dari daerah cladograms ariines dan tiga kelompok ikan lainnya sebagian besar sama dan sebangun dengan cladogram wilayah geologi Gondwana. Meskipun demikian, estimasi jam molekuler memberikan hasil variabel pada waktu diversifikasi ariine (~ 105-41 mya). Kesimpulan: Studi ini memberikan filogeni paling komprehensif laut ikan lele terbaru dan menyoroti kebutuhan untuk penilaian ulang klasifikasi mereka. Sementara dari sudut pandang topologi sejarah evolusi ariines sebagian besar sama dan sebangun dengan vikariansi terkait dengan urutan kejadian selama fragmentasi Gondwanan, estimasi waktu divergensi ambigu menghambat menilai hipotesis vicariant pada kerangka temporal. Pemeriksaan lebih lanjut mungkin fosil ariid memberikan dasar bagi kesimpulan yang lebih akurat pada waktu diversifikasi ariine. Siluriformes lele orde kelompok alam yang sangat beragam yang terjadi terutama di air tawar. Ikan lele tersebar luas dan distribusi mereka mencakup semua benua, bahkan Antartika, sebagaimana dibuktikan oleh EosenOligosen fosil [1]. Urutan mencakup 36 keluarga yang masih ada dan lebih dari 3000 spesies yang valid plus ~ diperkirakan 1500 spesies yang belum dideskripsikan [2,3]. Studi morfologi dan molekuler Beberapa telah membahas hubungan antara keluarga lele [misalnya, [4-6]] dan bukti terbaru mengindikasikan bahwa Klade basal besar dibatasi untuk massa benua tertentu, menunjukkan sejarah panjang isolasi antarbenua [6]. Dengan demikian, ikan lele menawarkan kesempatan yang luar biasa untuk mempelajari evolusi dan tren biogeografi. Catatan fosil Siluriformes relatif terwakili dan termasuk bahan dari setiap benua [7]. Meskipun fosil paling awal dimulai pada Campanian Akhir-

Awal Maastrichtian (ca. 68-73 mya), jam molekuler memprediksi asal jauh lebih tua untuk Siluriformes (yaitu, 175-130 mya [8 - 10]). Sementara ikan lele sebagian besar menghuni air tawar, hanya dua keluarga diwakili dengan baik di lingkungan laut: yang Plotosidae dari Indo-Pasifik Barat dan Ariidae. Para Ariidae, atau ikan lele laut, adalah kelompok siluriform hanya dengan distribusi global yang mencakup lebih dari 150 spesies yang terjadi dalam hangat-temperate hingga daerah tropis. Meskipun sebagian besar anggota keluarga hidup di perairan payau dan laut, beberapa spesies terjadi di air tawar juga. Laut distribusi lele termasuk margin kontinental di Pasifik Timur dan Atlantik Barat (Dunia Baru), Atlantik Timur (Afrika Barat), dan Indo-Pasifik Barat (Afrika Timur, Madagaskar, India-Asia Tenggara, dan Australia-New Guinea ; Gambar 1). Ariids memainkan peran penting dalam perikanan tropis, dengan banyak spesies memiliki nilai ekonomi tinggi karena ukurannya yang besar, kelimpahan lokal, dan kualitas daging. Beberapa spesies telah baru-baru terdaftar sebagai rentan di dalam daftar merah IUCN [11] Anggota Ariidae menunjukkan modus reproduksi khusus: Anggota Ariidae menunjukkan modus reproduksi khusus: mouthbrooding laki-laki telur dan embrio. Kondisi ini tidak ada dalam hampir semua ikan lele lainnya, satu-satunya pengecualian menjadi mouthbrooding biparental claroteid Phyllonemus typus [12]. Inkubasi oral berarti ariids memiliki kemampuan penyebaran yang terbatas dan tingkat endemisme yang tinggi berikutnya dari spesies, yang pada akhirnya mengakibatkan distribusi continentally dibatasi. Bahkan, ariids yang absen dari lempeng Pasifik [13], bagian nonmarginal dari Antilles, dan pulau-pulau samudera lainnya asal gunung berapi [14]. Pembatasan spesies yang paling pada rak kontinental membuat ariids ikan laut yang luar biasa untuk kelompok menyimpulkan skenario biogeografi sejarah (meskipun lihat [14] untuk bukti penyebaran melintasi samudra terbaru dalam Galeichthys). Studi tersebut membutuhkan kerangka konseptual yang berasal dari hipotesis filogenetik yang kuat. Terakhir interfamilial filogeni didasarkan pada morfologi [15,16]