CAPITULO 3

Nucletidos, cidos Nucleicos, e Informacin Gentica

El DNA recuperado de estos fragmentos de huesos de Neandertal arrojo datos de secuencias de nucletidos que sugieren contrariamente a conclusiones anteriores- que los neandertales y los humanos modernos se entrecruzan en una extensin limitada. Esto probablemente ocurri poco despus de los humanos modernos emigraron de frica y antes de que los neandertales se extinguieran unos 30.000 aos atrs. A pesar de las apariencias obvias en el estilo de vida y la apariencia macroscpica, los organismos presentan una similitud sorprendente a nivel molecular. Las estructuras y las actividades metablicas de todas las clulas se basan en un grupo comn de molculas entre las que se incluyen los aminocidos, los hidratos de carbono, los lpidos y los nucletidos, as como sus formas polimricas. Cada tipo de compuesto puede describirse a partir de su composicin qumica, sus interacciones con otras molculas y sus funciones fisiolgicas. Comenzamos nuestra revisin de las biomolculas con la presentacin de los nucletidos y sus polmeros, los cidos nucleicos. Los nucletidos estn involucrados en casi todas las facetas de la vida celular. Especficamente, participan en las reacciones de oxido reduccin, transferencia de energa, seales intracelulares y reacciones de biosntesis. Sus polmeros, los cidos nucleicos DNA y RNA, son los actores principales en el almacenamiento y la decodificacin de la informacin gentica. Los nucletidos y los cidos nucleicos tambin tienen papeles estructurales y catalticos en la clula. Ningn otro tipo de molcula participa en funciones tan variadas o en tantas funciones que sean esenciales para la vida. Los evolucionistas postulan que la apariencia de los nucletidos permiti la evolucin de los organismos que podan obtener y almacenar energa de sus entornos y, ms importante, podan hacer copias de si mismos. Aunque los detalles qumicos y biolgicos de las formas de vida tempranas son tema de especulaciones, es indiscutible que la vida tal como la conocemos esta ntimamente ligada a la qumica de los nucletidos y los cidos nucleicos. En este capitulo examinaremos brevemente las estructuras de los nucletidos y los cidos nucleicos DNA y RNA. Tambin consideraremos como la qumica de estas molculas les permite llevar la informacin biolgica en forma de secuencias de nucletidos. Esta informacin se expresa mediante la transcripcin de un segmento de DNA para obtener RNA, que luego se traduce parea obtener protenas. Dado que la estructura y funcin de una clula en ltima instancia dependen de su constitucin gentica, describiremos como las secuencias de DNA en el genoma nos brindan informacin sobre la evolucin, el metabolismo y la enfermedad. Finalmente, consideraremos algunas de las tcnicas utilizadas en la manipulacin del DNA en el laboratorio. En captulos posteriores examinaremos con mayor detalle la participacin de los nucletidos y los cidos nucleicos en el metabolismo. El capitulo 24 incluye informacin adicional acerca de la estructura de los cidos nucleicos, interacciones del DNA con protenas, y el empaquetamiento del DNA en las clulas, como un preludio a muchos captulos en que se discutir los roles del acido nucleico en el almacenaje y expresin de la informacin gentica.

1. Nucletidos
Conceptos Clave Las bases nitrogenadas de los nucletidos incluyen dos tipos de purinas y tres tipos de pirimidinas. Un nucletido consiste en una base nitrogenada, una azcar ribosa o desoxirribosa, y uno u muchos grupos fosfato. El DNA contiene desoxirribonucletidos adenina, guanina, citosina y timina, mientras el RNA contiene ribonucletidos adenina, guanina, citosina, y uracilo. Los nucletidos son molculas ubicuas con una diversidad estructural considerable. Hay ocho variedades de nucletidos comunes, cada una formada por una base nitrogenada unida a un azcar al que se une tambin al menos un grupo fosfato. Las bases de los nucletidos son molculas planas, aromticas, heterocclicas, que se derivan estructuralmente de la purina o la pirimidina (aunque in vivo no se sintetizan a partir de ninguno de estos compuestos orgnicos).

Las purinas mas comunes son adenina (A) y guanina (G), y las pirimidinas principales son citosina (C), uracilo (U) y timina (T). Las purinas forman enlaces con un azcar de cinco carbonos (una pentosa) mediante sus tomos N9, mientras que las pirimidinas lo hacen por sus tomos N1 (cuadro 3-1). En los ribonucletidos la pentosa es ribosa, mientras que en los desoxirribonucletidos (o simplemente desoxinucletidos) el azcar es 2-desoxirribosa (esto es, al carbono de la posicin 2 le falta un grupo hidroxilo).

Ntese que los nmeros marcados como prima se refieren a los tomos de la pentosa; los que no estn marcados corresponden a los tomos de la base nitrogenada. En un ribonucletido o en un desoxirribonucletido, se unen uno o mas grupos fosfato al tomo C3 o al tomo C5 de la pentosa para formar 3-nucleotido o un 5-nucleotido, respectivamente (fig. 3-1). Cuando el grupo fosfato esta ausente, el compuesto se conoce como nuclesido. Un 5-nucleotido puede entonces llamarse tambin nuclesido-5-fosfato. Los nucletidos mas frecuentes contienen uno a tres grupos fosfato en la posicin 5 y se llaman monofosfatos, difosfatos o trifosfatos de nuclesidos.

Figura 3-1 Estructura qumica de los nucletidos. (a) Un 5-ribonucleotido y (b) un 3-desoxinucletido. La base de purina o pirimidina se une al C1 de la pentosa y tambin se encuentra unido al menos a un grupo fosfato (rojo). Un nuclesido esta formado solo por una base y una pentosa.

Cuadro 3-1 Nombres y abreviaturas de las bases de los cidos nucleicos, los nucletidos y los nuclesidos.

La presencia de una unidad de 2-desoxirribosa en lugar de una ribosa, como se observa en el DNA, se indica con el prefijo desoxi o d, por ejemplo, el desoxinuclesido de la adenina es la desoxiadenosina o dA. Sin embargo, para los residuos que contienen timina, que casi no aparecen en el RNA, el prefijo es redundante y puede omitirse. La presencia de una unidad de ribosa puede impl icarse usando el prefijo ribo. La posicin del grupo fosfato de un nucletido puede especificarse como, por ejemplo, en 3-AMP y 5-GMP.

Sin mirar la tabla, dar el nombre de cada base y el nuclesido correspondiente. Las estructuras, los nombres y las abreviaturas de las bases comunes, los nuclesidos y los nucletidos se muestran en el cuadro 3-1. Los ribonucletidos se encuentran en el RNA (acido ribonucleico, por sus siglas en ingles), mientras que los desoxinucletidos se encuentran en el DNA (cido desoxirribonucleico). La adenina, la guanina y la citosina se encuentran tanto en los ribonucletidos como en los desoxinucletidos (y forman as seis de los ocho nucletidos comunes), pero el uracilo se encuentra en mayor medida como ribonucletido y la timina como desoxinucletido. Los nucletidos libres, que son aninicos, se encuentran generalmente en las clulas asociados con el contrain Mg2+. Los nucletidos participan en reacciones metabolicas. La mayora de los nucletidos en cualquier clula se encuentra en formas polimricas, como DNA o como RNA, cuyas funciones principales son el almacenamiento y la transferencia de informacin. Sin embargo, los nucletidos libres y los derivados de los nucletidos pueden llevar a cabo una variedad enorme de funciones metablicas no relacionadas en el manejo de la informacin gentica. Tal ves el nucletido mas conocido sea la adenosintrifosfato (ATP), un nucletido que contiene adenina, ribosa y un grupo fosfato. El ATP a menudo se menciona por error como una molcula de almacenamiento de energa, pero se le considera ms precisamente como un transportador de energa o un agente de transferencia de ella. El proceso de fotosntesis o la degradacin de combustibles metablicos como los carbohidratos o los cidos grasos conduce a la formacin de ATP a partir de adenosindifosfato (ADP):

El ATP se difunde por la clula para brindar energa a otras funciones celulares, como las reacciones de biosntesis, el transporte de iones y el movimiento celular. La energa qumica potencial del ATP se hace disponible cuando este transfiere uno (o dos) de sus grupos fosfato a otra molcula. Este proceso puede representarse como la inversa de la reaccin anterior, esto es, la hidrolisis de ATP a ADP. (Como veremos en captulos posteriores, la interconversin entre el ATP y el ADP en la clula no es reversible libremente, y rara vez se separan grupos fosfato libres en forma directa del ATP). El grado en el que el ATP participa en las actividades de rutina de las clulas se ilustra en clculos que indican que mientras que la concentracin de ATP celular es relativamente moderada (~5 mM). El cuerpo humano en promedio recicla su propio peso en ATP cada da. Los derivados de los nucletidos participan en una amplia variedad de procesos metablicos. Por ejemplo, la sntesis del almidn en las plantas se realiza mediante la adicin repetida de unidades de glucosa donadas por ADP-glucosa (figura 3-2). Otros derivados de nucletidos, como veremos en captulos posteriores, transportan grupos que sufren reacciones de oxidacin y reduccin. El grupo unido, que puede ser una molcula pequea como la glucosa (figura 3-2) o incluso otro nucletido, se une tpicamente al nucletido por medio de un grupo monofosfato o difosfato.

Figura 3-2 ADP-glucosa. En este derivado de nucletido, la glucosa (azul) se une a la adenosina (negro) mediante un grupo difosfato (rojo). Punto de control Identifica las purinas y pirimidinas comnmente encontradas en los cido nucleicos. Practica dibujando las estructuras de la adenina, adenosina y el adenilato. Describa la diferencia qumica entre un ribonuclesido trifosfato y un desoxirribonuclesido monofosfato.

2. Introduccin a la estructura de los cidos nucleicos

Conceptos clave Enlaces fosfodister unen residuos de nucletidos en DNA y RNA. En el DNA de doble hlice, dos hebras antiparalelas de polinucletidos se enrollan alrededor de la otra, interactuando por los puentes de hidrogeno entre bases en hebras opuestas. Las molculas de RNA son usualmente de una sola hebra y puede formar pares de bases intramoleculares.

Los nucletidos pueden unirse unos a otros para formar los polmeros que conocemos como RNA y DNA. En esta seccin, describiremos las caractersticas generales de estos cidos nucleicos. Las estructuras de los cidos nucleicos es considerada mas adelante en el capitulo 24.

A. Los cidos nucleicos son polmeros de nucletidos

Los cidos nucleicos son cadenas de nucletidos cuyos fosfatos unen las posiciones 3 y 5 de unidades de ribosa vecinas (figura 3.3). Los fosfatos de estos polinucletidos son cidos, por lo tanto, a pH fisiolgico los cidos nucleicos son polianiones. La unin entre nucletidos individuales se conoce como enlace fosfodister, llamado as por que el fosfato esta esterificado con dos unidades de ribosa. Cada nucletido que se incorporo con el polinucletido se conoce como residuo nucleotdico. El residuo terminal cuyo residuo C5 no esta unido a otro nucletido se conoce como extremo 5, el residuo terminal cuyo C3 no esta unido a otro nucletido se llama extremo 3. Por convencin, la secuencia de residuos nucleotdicos en un cido nucleico se escribe, de izquierda a derecha, desde el extremo 5 hasta el 3.

Figura 3-3 Estructura qumica de un acido nucleico. (a) Se muestra el tetrarribonucletido adenilil-3,5-uridiril-3,5-citidilil-3,5guanilato. Los atamos de azcar se marcan como primas para distinguirlos de los de las bases. Por convencin, una secuencia de polinucletidos se describe con el extremo 5 a la izquierda y el extremo 3 a la derecha. As, leyendo de izquierda a derecha, el enlace fosfodister une residuos vecinos de ribosa en direccin 53. La secuencia que aqu se muestra puede abreviarse pApUpCpG o simplemente pAUCG (la p a la izquierda del smbolo del nuclesido indica un grupo 5 fosforilo). El desoxitetranucletido correspondiente, en el cual los grupos 2-OH estn remplazados por H y el uracilo (U) esta remplazado por la timina (T), se abrevia d (pApTpCpG) o d (pATCG). (b) Esquema de pAUGC. La lneas verticales representan los residuos de ribosa, la base unida esta indicada con una sola letra, y la letra diagonal que rodea una p opcional es el enlace fosfodister. Los nmeros de los tomos de la ribosa pueden omitirse. La representacin equivalente para d (pATCG) difiere solo por la ausencia del grupo 2-OH y el remplazo de U por T.

Figura 3.4 Formas tautomercas de las bases. Aqu se muestran algunas de las formas tautomercas posibles de (a) la timina y (b) la guanina. La citosina y la adenina pueden sufrir desplazamientos de protones similares. Las propiedades de un polmero como un cido nucleico pueden ser muy diferentes de las unidades individuales, o monmeros, antes de la polimerizacin. A medida que el tamao de los polmeros aumenta de dmero, trmero, tetrmero y sucesivamente hasta oligmero (del griego: oligo, pocos), las propiedades fsicas como la carga y la solubilidad pueden cambiar. Adems, un polmero de residuos no idnticos tiene una propiedad que los monmeros que contienen no presentan; esto es, contiene informacin en forma de secuencia de residuos. Las reglas de Chargaff describen la composicin de bases del DNA. Aunque aparentemente no hay leyes que rijan la composicin de las molculas de RNA tpicas, el DNA tiene nmeros iguales de residuos de adenina y timina (A = T), y nmeros iguales de residuos de guanina y citosina (G=C). Estas relaciones, conocidas como las reglas de Chargaff, fueron descubiertas a finales del a dcada de 1940 por Erwin Chargaff, quien ideo los primeros mtodos cuantitativos confiables para el anlisis de la composicin del DNA. La composicin de bases del DNA cambia ampliamente entre organismos diferentes. Varia desde ~25 hasta 75 mol % G + C en distintas especies de bacterias. Sin embargo, es mas o menos constante entre especies relacionadas; por ejemplo, en los mamferos G + C varia desde el 39 hasta el 46%. La importancia de las reglas de Chargaff no se apreci de inmediato pero en el presente se sabe que la base estructural para estas reglas deriva de la naturaleza de doble cadena del DNA.

B. En DNA forma una doble hlice

A menudo se afirma que la determinacin de la estructura del DNA por parte de James Watson y Francis Crick en 1953 marco el nacimiento de la biologa molecular moderna. La estructura de Watson y Crick del DNA no solo brindo un modelo de lo que es posiblemente la molcula central de la vida, sino que tambin dio un indicio del mecanismo molecular de la herencia. El logro de Watson y Crick, que se considera uno delos avances intelectuales mas importantes de la ciencia, se baso en parte en dos evidencias a dems de las reglas de Chargaff las formas tautomercas correctas de las bases y los indicios de que el DNA es una molcula helicoidal. Las bases puricas y pirimidicas de los cidos nucleicos pueden asumir diferentes formas tautomercas (los tautmeros son ismeros que se convierten fcilmente y difieren solo en la posicin de los hidrgenos; figura 3-4). Las investigaciones mediante difraccin de rayos-x, resonancia magntica nuclear (RMN) y espectroscopia permitieron establecer con firmeza que las bases de lo cidos nucleicos estn principalmente en las formas tautomercas cetnicas que se muestran en la figura 3-3. Sin embargo, en 1953, esto en general no se apreciaba. La informacin sobre las formas tautomercas dominantes fue provista por Jerrly Donohue, un colega de Watson y Crick, y experto en estructuras por difraccin de rayos-x de molculas orgnicas pequeas. La evidencia de que el DNA es una molcula helicoidal surgi de una fotografa del patrn de difraccin de rayos-x de la fibra de DNA tomada por Rosalind Franklin (figura 3-5). La fotografa permiti que Crick, entrenado en cristalografa de rayos-x, dedujera a) que el DNA es una molcula helicoidal y b) que sus bases aromticas planas forman una pila paralela al eje de la fibra.

Figura 3-5. Fotografa de la difraccin de rayos-X de una fibra de DNA orientada verticalmente. Esta fotografa, tomada por Rosalind Franklin, brindo la evidencia clave para la dilucidacin de la estructura de Watson y Crick. La estructura central en forma d e X indica una hlice, mientras que los arcos oscuros en las partes superior e inferior muestran el espaciamiento de las bases apiladas (3,4 ).

Figura 3-6 Estructura tridimensional del DNA. La hlice repetida se basa en la estructura del dodecamero autocomplementario d (CGCGAATTCGCG) determinada por Richard Dickerson y Horace Drew. La vista en este modelo de esferas y palillos es perpendicular al eje de la hlice. El esqueleto de azucares y fosfatos (azul, remarcado con una cinta verde) se enrolla en la periferia de la molcula. Las bases (rojo) forman pares unidos por puentes de hidrogeno que ocupan el centro. Los tomos de H se omitieron para tener un esquema mas claro. Las dos cadenas corren en sentidos opuestos. La informacin estructural limitada, junto con las reglas de Chargaff, brindo apenas unas pocas pistas sobre la estructura del DNA; el modelo de Watson y Crick surgi principalmente de su imaginacin y de estudios de construccin de modelos. Sin embargo, una vez que se publico, su simplicidad bsica combinada con su importancia biolgica obvia llev a su rpida aceptacin. En investigaciones posteriores se confirmo la exactitud general del modelo de Watson y Crick, aunque se modificaron algunos detalles.

El modelo de Watson y Crick tiene las caractersticas principales siguientes: 1. 2. Las dos cadenas de polinucletidos se enrollan alrededor de un eje comn para formar una doble hlice (figura 3-6). Las dos cadenas de DNA son antiparalelas (corren en sentidos opuestos), pero cada una forma una hlice dextrgira. (la diferencia entre una hlice dextrgira y una levgira se muestra en la figura 3.7)

Figura 3-7 Diagrama de hlices levgira y dextrgira. En cada caso, mientras el pulgar apunta hacia donde la hlice avanza, los dems dedos se curvan en la direccin de giro de la hlice. Ntese que esto se mantiene cuando las hlices se colocan al revs.

Figura 3-8 Bases complementarias apareadas en el DNA. La adenina en una hebra se aparea con timina en la otra hebra formando un puente de hidrogeno especifico (lneas punteadas). Similarmente, la guanina se aparea con citosina. Este apareamiento de bases entre cadenas de polinucletidos es responsable de la naturaleza del DNA de doble hebra.

Indica la secuencia 53 de la hebra que podra ser complementaria al cido nucleico mostrado en la figura 3-3a. 3. Las bases ocupan el centro de la hlice y las cadenas de azucares y fosfatos corren en la periferia, lo que vuelve mnimas las repulsiones entre los grupos fosfatos cargados. La superficie de la doble hlice contiene dos hendiduras de ancho desigual: las ranuras mayor y menor. Cada base esta unida por puentes de hidrogeno a una base de la hebra opuesta para formar un par de bases plano. La estructura de Watson y Crick puede acomodar solo dos tipos de pares de bases. Cada residuo de adenina debe formar un par con un residuo de timina y viceversa, y cada residuo de guanina debe formar un par con un residuo de citosina y viceversa (figura 3-8). Estas interacciones por puentes de hidrogeno, un fenmeno que se conoce como apareamiento de bases complementarias, da como resultado la asociacin especifica de las dos cadenas de la doble hlice.

4.

La estructura de Watson y Crick puede acomodar cualquier secuencia de bases de una cadena de polinucletidos si la cadena opuesta tiene la secuencia de bases complementarias. Esto de inmediato explica las reglas de Chargaff. Mas importante, sugiere que cada hebra de DNA puede actuar como molde para la sntesis de su cadena complementaria y, por lo tanto, que la informacin hereditaria esta codificada en la secuencia de bases de cualquiera de las cadenas. La mayora de las molculas de DNA son largas. El tamao extremadamente largo de las molculas de DNA de acuerdo con su papel como depsito de la informacin gentica de la clula. Por supuesto, el genoma de un organismo, su contenido nico de DNA, puede ubicarse en varios cromosomas (del griego: cromos, color + soma cuerpo), cada uno de los cuales tiene una molcula separada de DNA. Ntese que muchos organismos son diploides, esto es, contienen dos grupos equivalentes de cromosomas, uno de cada uno de sus padres. Su contenido de DNA nico (haploide) es la mitad de su DNA total. Por ejemplo, los seres humanos son organismos diploides que llevan 46 cromosomas en cada clula; el nmero haploide es, por ende, 23. Debido a su gran longitud, las molculas de DNA se describen en trminos de su nmero de pares de bases (pb) o miles de pares de bases (kilo pares de bases) kpb (kb). El DNA en la naturaleza tiene una longitud que varia entre ~5 kpb en pequeos virus de DNA hasta ms de 250000 kpb en los cromosomas de los mamferos ms grandes. Aunque las molculas de DNA son largas y relativamente duras, no son rgidas por completo. Ms adelante veremos en el capitulo 24 que la doble hlice de DNA forma espirales y bucles cuando se empaqueta dentro de la clula. Adems, segn su secuencia de nucletidos, el DNA puede adoptar conformaciones helicoidales ligeramente distintas. Por ltimo, en presencia de otros componentes celulares, el DNA puede doblarse o las dos hebras desenrollarse parcialmente.

Figura 3-9 Formacin de una estructura de tallo-bucle. El apareamiento de bases entre secuencias complementarias dentro de una misma cadena de RNA permite que el polinucletido se doble entre s. Punto de Control Usando como gua la figura 3-3a, dibuja la estructura completa de un nuclesido trifosfato antes y despus de incorporarse en una cadena de polinucletidos. Dibuje la estructura que podra resultar si el nuevo enlace fosfodister formado fuere hidrolizado. Explicar el fundamento estructural de las reglas de Chargaff. Usando un modelo 3D por computadora de una molcula de DNA (como es mostrado en el ejercicio interactivo 1), identifica cada uno de los siguientes caractersticas estructurales: el extremo 3 y 5 de cada hebra, los tomos que forman el esqueleto del azcar fosfato, los surcos mayor y menor, las bases en distintas pares de bases, y los tomos que participan en los puentes de hidrogeno en los pares de bases A-T y G-C.

C. El RNA es un cido nucleico de cadena simple

El DNA de cadena simple es raro y aparece en mayor medida como material hereditario de ciertos virus. Por el contrario, el RNA existe principalmente como cadena simple, que en general forma estructuras compactas ms que cadenas sueltes y extendidas (el RNA de cadena doble es el material hereditario de ciertos virus). Una cadena de RNA que es idntica a una de DNA, excepto por la presencia de grupos 2-OH y la sustitucin de la Timina por el Uracilo- puede aparear sus bases con una cadena complementaria de RNA o DNA. Como es de esperar, la A se aparea con U (o con T en el DNA), y la G con C. El apareamiento de bases a menudo se produce dentro de la misma molcula, lo que origina estructuras de tallo-bucle (figura 3-9) o, cuando los bucles interactan entre s, a estructuras ms complejas. Las estructuras intrincadas que puede adoptar una molcula de cadena simple de RNA brindan evidencias adicionales de que el RNA puede hacer ms que solo almacenar y transmitir informacin gentica. En numerosas investigaciones se observ que ciertas molculas de RNA pueden unirse de manera especfica a molculas orgnicas pequeas y pueden catalizar reacciones que involucran a estas. Estos

hallazgos brindan apoyo importante a las teoras de que muchos de los procesos esenciales para la vida comenzaron por medio de la versatilidad qumica de los polinucletidos pequeos (una situacin que se conoce como el mundo del RNA). Exploraremos con ms detalle la estructura y la funcin del RNA en la Seccin 24-2C.

3. Aspectos generales de la funcin de los cidos nucleicos

Conceptos Claves El DNA transporta la informacin gentica en la forma de su secuencia de nucletidos. La secuencia de nucletidos de DNA es transcrita a la secuencia de nucletidos de RNA mensajero, quien es luego traducido a una protena, una secuencia de aminocidos. El DNA es el portador de la informacin gentica en todas las clulas y en muchos virus. Aun as, transcurrieron ms de 75 aos desde que las leyes de la herencia fueran descubiertas por Gregor Mendel hasta que se dilucid el papel biolgico del DNA. En el presente, muchos detalles de como se expresa y transmite la informacin gentica a las generaciones futuras todava estn poco claros.

Figura 3-10 Neumococo transformado. Las colonias grandes son neumococos virulentos que surgieron a partir de la transformacin del neumococo no patgeno (colonias ms pequeas) con DNA obtenido de las cepas virulentas. En el presente se sabe que este DNA contena un gen que no estaba presente en la capa no patgena. El trabajo de Mendel con los guisantes le permiti postular que una planta individual contiene un par de factores (que en la actualidad llamamos genes), uno heredado de cada uno de los padres; no obstante la teora de Mendel de la herencia, informada en 1866, fue ignorada casi universalmente por sus contemporneos, cuyo conocimiento de la anatoma y la fisiologa no daba una base para su comprensin. Finalmente, se formul la hiptesis de que los genes forman parte de los cromosomas, y el curso de la investigacin gentica se aceler de manera importante.

A. El DNA lleva la informacin gentica

Hasta la dcada de 1940 se crea en general que los genes estaban formados por protenas, dado que estas eran las nicas entidades bioqumicas que es esa poca, parecan lo suficientemente complejas como para actuar de agentes de la herencia. Se crea que los cidos nucleicos, aislados en 1869 por Friedrich Miescher, tenan secuencias de nucletidos que se repetan en forma montona y, por lo tanto, eran candidatos poco probables para transmitir la informacin gentica. Hicieron falta los esfuerzos de Oswald Avery, Colin McLeod y Maclyn McCarty para demostrar que el DNA lleva la informacin gentica. Sus experimentos, completados en 1944, mostraron que el DNA no las protenas- extradas de una cepa virulenta (patgeno) de la bacteria diplococcus pneumoniae era la sustancia que transformaba (cambiaba de manera permanente) una cepa no patgena del organismo en otra virulenta (Figura 3-10). El descubrimiento de Avery primero fue recibido con escepticismo, pero influy en Erwin Chargaff, cuyas reglas (Seccin 3-2A) condujeron a los modelos posteriores de la estructura y la funcin del DNA. La naturaleza bicatenaria o dplex del DNA facilita su replicacin. Cuando una clula se divide, cada hebra de DNA acta como molde para el ensamble de su hebra complementaria (Figura 3-11). En consecuencia, cada clula de la progenie contiene una molcula de DNA completa (o un conjunto de molculas de DNA en los organismos cuyos genomas contiene ms de un cromosoma). Cada molcula de DNA est formada por una hebra madre y otra hija. Las hebras hijas estn sintetizadas mediante la polimerizacin paso a paso de los nucletidos que aparecen de manera especfica con las bases de las hebras madre. El mecanismo de replicacin, aunque en principio es simple, es excesivamente complejo en la clula, y se necesitan muchos factores celulares para que se produzca con fidelidad y eficiencia, como veremos en el Captulo 25.

Figura 3-11 Replicacin del DNA. Cada cadena de DNA madre (azul) acta como molde para la sntesis de una cadena hija complementaria (rojo). As, las molculas de doble cadena resultantes son idnticas.

B. Los genes dirigen la sntesis de protenas

Tomo cierto tiempo responder la pregunta de como las secuencias de nucletidos controlan las caractersticas de los organismos. En experimentos con el moho neurospora crassa en la dcada de 1940, George Beadle y Edward Tatum hallaron que hay una conexin especfica entre los genes y las enzimas, la teora de un gen, una enzima. Beadle y Tatum demostraron que las variedades mutantes de neurospora que se generaba por irradiacin de rayos-x requeran nutrientes adicionales para crecer. Probablemente los descendientes de las clulas daadas por la radiacin carecan de enzimas especficas necesarias para sintetizar esos nutrientes. El vinculo entre el DNA y las enzimas (casi todas las cuales son protenas) es el RNA. El DNA de un gen se transcribe para producir una molcula de RNA que es complementaria con el DNA. La secuencia de RNA es entonces traducida a la secuencia correspondiente de aminocidos para formar una protena (figura 3-12). Esta transferencia de informacin biolgica se resume en el llamado dogma centra de la biologa molecular formulado por Crick en 1958.

En este diagrama, las flechas representan la transferencia de informacin que se produce cuando el DNA dirige su propia replicacin para producir molculas nuevas de DNA; el DNA se transcribe en el RNA; y el RNA se traduce en la sntesis de una protena.

Figura 3-12 Transcripcin y traduccin. Una cadena de DNA dirige la sntesis de RNA mensajero (mRNA). La secuencia de bases de RNA transcrito es complementaria con la cadena de DNA. El mensaje se traduce cuando las molculas de RNA de transferencia (tRNA) se alinean con el mRNA mediante el apareamiento de bases complementaras en grupos de tres nucletidos llamados codones. Cada tRNA transporta un aminocido especfico. Estos se unen covalentemente para formar una protena. As, la secuencia de bases en el DNA determina la secuencia de aminocidos de la protena.

Que podra suceder si una mutacin cambia uno de los nucletidos en el DNA? As como las cadenas hijas del DNA se sintetizan a partir de desoxinuclesidos trifosfatos libres que se aparean con las bases de la cadena madre de DNA, las hebras de RNA se sintetizan a partir de ribonuclesidos trifosfatos libres que se aparean con las bases complementarias de una cadena de DNA de un gen (la transcripcin se describe con mas detalle en le capitulo 26). El RNA que corresponde a un gen que codifica una protena (llamado RNA mensajero o mRNA) se dirige hacia un ribosoma, un orgnulo formado a su vez principalmente por RNA (RNA ribosmico o rRNA). En el ribosoma, cada grupo de tres nucletidos del mRNA se aparea con tres nucletidos complementarios de una molcula pequea llamada tRNA un RNA de transferencia o tRNA- (figura 3-13). Unido a cada tRNA se encuentra el aminocido correspondiente. El ribosoma cataliza la unin de los aminocidos que son las unidades monomricas de las protenas (la sntesis de protenas se describe en detalle en le capitulo 27). Los aminocidos se adicionan a la cadena proteica en crecimiento de acuerdo con el orden en el que las molculas de tRNA se unen al mRNA. Dado que la secuencia de nucletidos de mRNA refleja a su vez la secuencia de nucletidos del gen, el DNA dirige la sntesis de las protenas. En consecuencia, las alteraciones del material gentico de un organismo (mutaciones) pueden manifestarse como protenas con estructuras y funciones alteradas.

Figura 3-13 Traduccin. Las molculas de tRNA con su aminocido unido se unen a una secuencia complementarias de 3 nucletidos (codones) del mRNA. El ribosoma facilita la alineacin del tRNA y el mRNA, y cataliza la unin de los aminocidos para producir la cadena proteica. Cuando se suma un aminocido nuevo, el tRNA anterior se libera y el ribosoma avanza a lo largo del mRNA.

Usando tcnicas que son descritas en las siguientes secciones y en otras partes de este libro, las investigaciones por compilar un catalogo de toda la informacin codificada en el DNA de un organismo. El estudio del tamao del genoma, la organizacin, y el contenido gentico es conocido como genmica. Por analoga, la transcriptmica se refiere al estudio de la expresin gnica, la cual se centra en el conjunto de molculas de mRNA, o transcriptoma, que es transcrito desde el DNA bajo cualquier conjunto particular de circunstancias. Finalmente, la protemica es el estudio de las protenas (la proteoma) producida como resultado de la transcripcin y la traduccin. Aunque el genoma de un organismo permanece esencialmente sin cambios durante toda su vida, su transcriptoma y proteoma puede variar significativamente entre diferentes tipos de tejidos, etapas de desarrollo y condiciones ambientales. Punto de Control Explica por qu la naturaleza del DNA de doble cadena es relevante para la copia y la transmisin de la informacin gentica cuando una clula se divide. Resuma los pasos del dogma central. Que rol juega el RNA en todo.

Universidad De Pamplona -ColombiaDepartamento De Medicina Biologa Molecular Mdica Tema I: Nucletidos, cidos nucleicos, y informacin gentica Bibliografa: Fundamentals of Biochemistry. Voet D, Voet J G and Pratt C. John Wiley and Sons. Fourth Edition. 2013 -Pamplona, Agosto de 2012-