UNIVERSIDAD AUTNOMA DE CIUDAD JUREZ INSTITUTO DE CIENCIAS BIOMDICAS DEPARTAMENTO DE CIENCIAS QUMICO-BIOLGICAS PROGRAMA DE BIOLOGA

MANUAL DE PRCTICAS SISTEMTICA Y TAXONOMA

MANUAL DE PRCTICAS DE SISTEMATICA Y TAXONOMIA COMPILADORES: Principal: Dr. Pablo Lavin Murcio Colaboradores: Dr. Pablo Lavin Murcio Revisado por: Academia de Biologa 2011

Ciudad Jurez, Chihuahua Universidad Autnoma de Ciudad Jurez 2011 p. 8

M. en C. Emilio Clarke Crespo Coordinador de la Academia de Biologa

D. Ph. Antonio de la Mora Covarrubias Coordinador del Programa de Biologa

Dr. Alejandro Martnez Martnez Jefe del Departamento de Ciencias Qumico-Biolgicas

M.C. Hugo Staines Orozco Director del Instituto de Ciencias Biomdicas

Aprobados por la Academia de Biologa, 2011

MANUAL DE PRCTICAS DE SISTEMTICA Y TAXONOMA

Prctica 1. Reconocimiento de la diversidad biolgica a travs de las colecciones cientficas. Prctica 2. Caracteres taxonmicos y Claves Dicotmicas. Prctica 3. Bsqueda de informacin taxonmica Prctica 4. Revisin de una diagnosis y la descripcin de un taxn. Prctica 5. Observacin y registro de caracteres de importancia taxonmica. Prctica 6. Taxonoma numrica Prctica 7. Anlisis cladista.

Prctica 1. Reconocimiento de la Diversidad Biolgica a travs de las colecciones cientficas.

Introduccin: La funcin de las colecciones cientficas es la de documentar la diversidad de especies y grupos taxonmicos, reconociendo adems la riqueza en las diferentes escalas geogrficas mediante la coleccin, identificacin y preservacin de especmenes. Todo sistema de clasificacin tiene dos funciones principales: facilitar la recuperacin de informacin y servir de base para estudios comparativos. La clasificacin es la clave del sistema de almacenamiento de informacin en todos los campos. En biologa, este sistema de almacenamiento de informacin est formado por las colecciones de los museos y la vasta literatura cientfica contenida en libros, revistas y otras publicaciones Objetivos: 1) Identificar de forma general el proceso de coleccin, tratamiento e identificacin de especmenes biolgicos. 2) Reconocer los distintos grupos taxonmicos.

Metodologa: Se realizar una visita a distintas colecciones cientficas de la Universidad (y/o la regin o el pas) para familiarizarse con los distintos grupos biolgicos, as como de las tcnicas de captura, identificacin y conservacin de especmenes.

Observaciones:

Prctica 2. Caracteres taxonmicos y Claves Dicotmicas.

Introduccin: Las claves dicotmicas de identificacin permiten ubicar a los organismos con base en sus caractersticas en un determinado taxn. Estos caracteres, principalmente de ndole morfolgica pueden ser categorizados de acuerdo a su origen y condicin. Por ejemplo, un carcter puede ser discreto o continuo y puede presentar varios estados. Cuando stos se comparan entre organismos filogenticamente relacionados, puede ser definida su polaridad y ordenacin. En otras palabras, se puede, al menos tericamente, definir los estados ancestrales y derivados de estos caracteres y as agrupar mas naturalmente a los organismos. Objetivo: Conocer los caracteres de importancia taxonmica de distintos grupos biolgicos mediante la utilizacin de claves dicotmicas. Metodologa: Se har uso de claves dicotmicas para la identificacin de diversos organismos que sern facilitados por el instructor.

Observaciones:

Prctica 3. Bsqueda de informacin taxonmica.

Introduccin: La informacin disponible con aplicaciones en la Sistemtica y la Taxonoma est dispersa y requiere de ser ubicada. Gracias a la tecnologa mucha de esa bsqueda se facilita en amplitud y precisin. La localizacin de bases de datos, colecciones y sociedades cientficas es un recurso indispensable para el conocimiento y estudio de la biodiversidad. Objetivo: Bsqueda de informacin taxonmica en Internet sobre colecciones de especimenes y sociedades cientficas dedicadas a la Sistemtica de distintos grupos. Metodologa: Se realizar una bsqueda educada de informacin para ubicar sociedades cientficas y diferentes grupos taxonmicos: http://www.ucmp.berkeley.edu/help/taxaform.html http://tolweb.org/tree/phylogeny.html

Observaciones:

Prctica 4. Revisin de una diagnosis y la descripcin de un taxn

Introduccin: Se conocen alrededor de 1.5 millones de especies descritas por la ciencia. Sin embargo, se calcula que falta por descubrir ms de 20 millones ms, aproximadamente. El proceso de identificar y declarar a un taxn como nuevo requiere de un proceso metdico y dictado por los distintos cdigos de nomenclatura. Objetivo: Familiarizarse con la realizacin de diagnosis y descripcin de distintos taxa. Metodologa: Se revisar distintos artculos cientficos para reconocer el proceso de escritura de la diagnosis y descripcin de taxa nuevos para la ciencia.

Observaciones:

Prctica 5. Observacin y registro de caracteres de importancia taxonmica.

Introduccin: Los taxnomos han examinado cada vez ms de cerca los organismos al tiempo que aumenta su conocimiento y, lo que es ms importante, el poder de su instrumentacin. La Taxonoma moderna seria le debe mucho al microscopio ptico y al electrnico, a la qumica y a la biologa molecular, y a los mtodos de la fsica nuclear que permiten datacin precisa de fsiles. Los datos que consideramos "caracteres" se han basado (aproximadamente en orden histrico de aparicin) en la estructura macroscpica o morfologa; en la estructura detallada, o ultraestructura; en el estudio del desarrollo, o embriologa; en la evidencia fsil, o paleontologa; en los estudios de comportamiento, que en general son etologa; en la qumica somtica, o bioqumica; y, finalmente en el estudio del ADN que conforman los genes, o biologa molecular. El primer paso para cualquier anlisis taxonmico es conocer, seleccionar y priorizar (pesar) los caracteres de importancia. Existen numerosos criterios reconocidos por las 3 Escuelas Taxonmicas para dar dicha valoracin a los caracteres. Objetivo: Conocer y seleccionar caracteres para realizar anlisis taxonmicos. Metodologa: Se observarn macro y microscpicamente diversos organismos para conocer y describir su morfologa. Posteriormente se utilizarn los distintos criterios para seleccionar aquellos caracteres que sern utilizados en los anlisis de las prcticas 6 y 7.

Observaciones:

Prctica 6. Taxonoma Numrica Introduccin: La taxonoma fentica o numrica se basa en el reconocimiento de la cantidad de similitud fenotpica, que incluye caractersticas morfolgicas, fisiolgicas, bioqumicas o etlogicas (Sokal y Sneath, 1966). Su metodologa en general ha sido desarrollada para aplicarse a cualquier nivel taxonmico, el cual una vez definido recibe el nombre de unidad taxonmica operacional (OTU, por sus siglas en ingls). Una vez definidas estas unidades, el segundo paso consiste en elegir una serie de caracteres fenticos, recomendndose un nmero no menor de 60, con los cuales se describir cada OTU. El tercer paso es formar la matriz de OTU vs carcter y comparar cada OTU con los otros y finalmente determinar los grupos o clusters de unidades taxonmicas operacionales.

Objetivo: Conocer e interpretar un anlisis de mxima similitud con los caracteres seleccionados en la prctica 5.

Metodologa: Utilizar los distintos paquetes estadsticos disponibles para llevar a cabo el ejercicio.

Observaciones:

Prctica 7. Anlisis Cladista. Introduccin: La escuela cladista o filogentica ha postulado que las relaciones que permiten la cohesin de organismos y especies, vivientes o extintas, son relaciones genealgicas (Hennig, 1966). De acuerdo con esto, la identificacin de las unidades taxonmicas se basa en el reconocimiento de grupos monofilticos que deben estar constitudos por la especie ancestral y todas las descendientes directas que comparten una serie de caracteres derivados (sinapomorfias). Para establecer estas relaciones genealgicas, el mtodo cladista postula al menos tres posibles tcnicas: la comparacin con un grupo externo, el recurrir a datos embriolgicos y utilizar el registro paleontolgico. La primera es la principal. Objetivo: Realizar un anlisis filogentico con los datos morfolgicos y anatmicos obtenidos en las prctica 5 e interpretar los cladogramas obtenidos.

Metodologa: Utilizar los distintos paquetes estadsticos disponibles para llevar a cabo el ejercicio: PAUP (http://paup.csit.fsu.edu/ ) Phylip (free, http://evolution.gs.washington.edu) MEGA (free, http://www.megasoftware.net)

Observaciones: