Curso de Qumica Biolgica

Prof. Asociado a cargo Dr. Pablo Cetica

Gua de estudio Cmo estudiar una va metablica?

Autores: Dra. Mariana Crdoba Dr. Pablo Cetica

2013

COMO ESTUDIAR UNA VIA METABOLICA?

CONTENIDOS :
-Definicin de va metablica. -Clasificacin de las vas metablicas. -Funcin biolgica: Homeostasis.

OBJETIVOS :
Que el alumno : -Identifique los puntos claves que definen a las vas metablicas. -Aprenda la funcin biolgica de las diferentes vas metablicas. -Integre todas las vas para comprender la necesidad biolgica de la homeostasis celular.

INTRODUCCION :
La Qumica Biolgica es la ciencia que explica los procesos vitales a nivel molecular; un importante tpico se dedica al estudio del metabolismo. Se entiende por metabolismo al conjunto de reacciones qumicas intracelulares cuya funcin es mantener la homeostasis en los seres vivos. Este conjunto de reacciones no se da en forma desordenada o al azar sino organizada en secuencias de reacciones, en las cuales el producto de una es el sustrato de la siguiente, constituyendo lo que se conoce como va metablica. Hemos confeccionado esta gua de estudios para ayudar al alumno a extractar los puntos relevantes de una va metablica, par adquirir una idea ntegra de la importancia de la regulacin del metabolismo intracelular en el mantenimiento de la vida. Generalmente los alumnos estudian en forma memorstica esta secuencia de reacciones sin llegar a comprender la esencia de una va, tal vez se debe a la falta de claridad en los libros de texto al respecto.

DEFINICION :
Se entiende por va metablica a un conjunto de reacciones qumicas sucesivas, catalizadas por enzimas y ordenadas en una secuencia definida que llevan a la conversin de un sustrato inicial a un determinado producto final. Es importante destacar las diferencias entre metabolismo y digestin. Los procesos metablicos tienen ubicacin intracelular, intervienen todos los tipos enzimticos (oxidoreductasas, liasas, hidrolasas, transferasas, isomerasas y ligasas), constituyendo vas degradativas o de sntesis. Los procesos digestivos son extracelulares (en la luz del tracto digestivo en animales superiores), slo intervienen hidrolasas y son de tipo degradativos.

CLASIFICACION DE LAS VIAS METABOLICAS :

1) Segn el ordenamiento de las reacciones qumicas que la componen : a) Lineal :

Si

Pf

Un sustrato inicial (Si), bajo la accin de una enzima especfica se convierte en un producto A, que sirve como sustrato a otra enzima que cataliza la reaccin siguiente y as sucesivamente hasta llegar al producto final (Pf). Ej.: gluclisis.

b) Ramificada :

C Si A B Y

D Z

Pf1 Pf2

Son vas ms complejas que incluyen puntos de ramificacin. El producto B puede seguir dos vas alternativas para dar dos productos finales (Pf1 y Pf2). Ej.: va de las pentosas. .

c) Cclica :

Si

C B A H G F D E

Pf

En algunos casos las transformaciones moleculares ocurren en forma cclica en las clulas. Un ciclo comprende un conjunto de reacciones qumicas sucesivas con la particularidad de regenerar al final del proceso la misma sustancia que inici la va. Ej.: ciclo de Krebs. 2) Segn su funcin biolgica : a) Catablica o degradativa:

Estas vas utilizan sustratos iniciales semireducidos de alto peso molecular para dar productos finales semioxidados de menor peso molecular que suelen ser metabolitos intermediarios de otras vas metablicas. Su principal funcin es la produccin de energa para la clula (ATP) . Para su funcionamiento requieren coenzimas oxidadas y ADP. Ej.: gluclisis. b) Anablica o de sntesis:

Estas vas utilizan sustratos iniciales semioxidados de bajo peso molecular para dar productos finales semireducidos de mayor peso molecular, que pueden ser metabolitos intermediarios de otras vas metablicas. Su principal funcin es la de producir compuestos necesarios para la propia clula o el organismo. Para su funcionamiento requieren coenzimas reducidas y energa (ATP). Ej.: gluconeognesis.

ESQUEMA GENERAL DEL FUNCIONAMIENTO DE LAS VIAS METABOLICAS CATABOLICAS Y ANABOLICAS

Molcula grande semireducida Disparador celular NAD, NADP, FAD ADP Disparador celular

NADH, NADPH, FADH2 ANABOLISMO ATP Molcula pequea semioxidada CATABOLISMO

HOMEOSTASIS CELULAR

PUNTOS CLAVES PARA EL ESTUDIO DE UNA VIA METABOLICA 1) Clasificar la va metablica segn el ordenamiento de sus reacciones qumicas y su funcin
biolgica.

2) Identificar el o los sustratos que inician la va metablica y sus diversos orgenes. 3) Identificar el o los productos finales de la va metablica y sus diversos destinos. 4) Determinar el objetivo biolgico de la va metablica. 5) Ubicacin celular de la va metablica. 6) Tejidos en los que se produce la va metablica. 7) Enzimas reguladoras de la va metablica y su tipo de regulacin.

Como ejemplo seleccionamos dos vas metablicas opuestas, una catablica y otra anablica para desglosar estos puntos claves :

- GLUCOLISIS :
La glucolisis es una va metablica catablica lineal (1). La glucosa proveniente de la circulacin sangunea o de la degradacin del glucgeno (2) es transformada en piruvato, el cual derivar a la formacin de lactato, aminocidos o se oxida totalmente hasta CO2 + H2O (3). El objetivo de la va es producir energa (2 ATP por molcula de glucosa) y metabolitos intermedios de otras vas metablicas (4). Se produce en el citosol (5) de todas las clulas del organismo (6). Las enzimas reguladoras de la va son la hexoquinasa (alostrica), fosfofructoquinasa I (alostrica) y la piruvato quinasa (alostrica en todos los tejidos y adems por modificacin covalente slo en hgado) (7). Figura 1.

- GLUCONEOGENESIS :
La gluconeognesis es una va metablica anablica lineal (1). El piruvato proveniente del lactato y aminocidos glucognicos, al igual que otros precursores no glucdicos (ej. glicerol) (2) son transformados en glucosa que pasar a la circulacin sangunea (3). El objetivo de la va es producir glucosa para mantener el nivel de glucemia constante (4). Las primeras reacciones se producen en la mitocondria, el resto en el citosol y la ltima en el retculo endoplasmtico (glucosa-6-fosfatasa) (5) del hepatocito principalmente y tambin en el rin e intestino (6). Las enzimas reguladoras de la va son la glucosa-6-fosfatasa (dependiente de alta concentracin de glucosa-6-fosfato), fructosa-1-6-bisfosfatasa (alostrica) y piruvato carboxilasa (alostrica) (7). Figura 2. A continuacin se muestra como podemos hacer nuestros propios esquemas resumidos, identificando los puntos claves antes mencionados :

Figura 1 : GLUCOLISIS

Sangre

Glucosa sangunea

Glucgeno Glucosa ADP ATP NAD+ NADH + H+

Citosol Todos los tejidos

Piruvato

Aminocidos

Oxidacin total (CO2 + H2O)

Lactato

Figura 2 : GLUCONEOGENESIS

Sangre

Glucosa sangunea

Glucosa

Retculo endoplasmtico
ADP ATP NAD+ NADH + H+

Citosol Hgado Rin Intestino

Mitocondria

Piruvato

Glicerol

Aminocidos glucognicos

Lactato

Para facilitar el estudio de la vas metablicas se confeccion el siguiente cuadro para completar a medida que se traten los distintos temas :
VIAS METABOLICAS
GLUCOLISIS GLUCONEOGENESIS VIA DE LAS PENTOSAS GLUCOGENOLISIS GLUCOGENOGENESIS CICLO DE KREBS CADENA RESPIRATORIA -OXIDACIN DE AG DEGRADACION DE TAG SINTESIS DE AG SINTESIS DE TAG SINTESIS DE PL SINTESIS DE COLESTEROL TRANSAMINACIONES DESAMINACION OXIDATIVA CICLO DE LA UREA

CLASIFICACION

SUSTRATOS INICIALES

PRODUCTOS FINALES

OBJETIVO

UBICACIN CELULAR

TEJIDOS

ENZIMAS REGULADORAS

BIBLIOGRAFIA

1. Blanco A., Qumica Biolgica Ed. El Ateneo (2006). 2. Clarenburg R., Physiological Chemistry of Domestic Animals Ed. Mosby Year Book (1992). 3. Lehninger A., Principios de Bioqumica. Ed Omega (2006). 4. Murray R., Granner D., Mayes P., Rodwell V., Bioqumica de Harper. Ed. El Manual Moderno (2004). 5. Mathews C., Van Holde K., Ahern K., Bioqumica Ed. Pearson Educacin (2003). 6. Stryer L., Berg J., Tymoczko J., Bioqumica. Ed Revert (2008).

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