UNIDADE I

Estrutura e Funo das Protenas

Aminocidos

1
A
Aminocido livre
Comuns a todos os -aminocidos das protenas

I. VISO GERAL
As protenas so as molculas mais abundantes e com maior diversidade de funes nos sistemas vivos. Praticamente todos os processos vitais dependem dessa classe de molculas. Por exemplo, enzimas e hormnios polipeptdicos controlam e regulam o metabolismo corporal, enquanto protenas contrteis no msculo permitem a realizao dos movimentos. Nos ossos, a protena colgeno forma uma estrutura para a deposio de cristais de fosfato de clcio, atuando como as barras de ao no concreto armado. Na corrente sangunea, protenas como a hemoglobina e a albumina plasmtica transportam molculas essenciais para a vida, enquanto as imunoglobulinas combatem bactrias e vrus causadores potenciais de infeces. Em suma, as protenas apresentam uma diversidade incrvel de funes; todavia, todas tm em comum a caracterstica estrutural de serem polmeros lineares de aminocidos. Este captulo descreve as propriedades dos aminocidos; o Captulo 2 mostra como esses blocos constitutivos simples so unidos para formar protenas com estruturas tridimensionais singulares, tornando-as capazes de desempenhar funes biolgicas especficas.

COOH CO C OH
+H N 3
Grupo amino

C H R
Grupo carboxila

A cadeia lateral distinta para cada aminocido.

O carbono encontra-se entre os grupos carboxila e amino.

Aminocidos combinados em ligaes peptdicas

II. ESTRUTURA DOS AMINOCIDOS

NH-CH-CO-NH-CH-CO
Embora mais de 300 diferentes aminocidos tenham sido descritos na natureza, apenas 20 deles so usualmente encontrados como constituintes de protenas em mamferos. (Nota: esses so os nicos aminocidos codificados pelo DNA, o material gentico da clula [veja a p. 395].) Cada aminocido (exceto a prolina, que possui um grupo amino secundrio) apresenta um grupo carboxila, um grupo amino primrio e uma cadeia lateral que o distingue dos demais (o grupo R) ligados ao tomo de carbono (Figura 1.1A). Em pH fisiolgico (aproximadamente 7,4), o grupo carboxila encontra-se dissociado, formando o on carboxilato, carregado negativamente (COO), e o grupo amino encontra-se protonado (NH3+). Nas protenas, quase todos esses grupos carboxila e amino esto combinados nas ligaes peptdicas e, em geral, no esto disponveis para reaes

As cadeias laterais determinam as propriedades das protenas.

Figura 1.1 Caractersticas estruturais dos aminocidos (mostrados em sua forma completamente protonada).

2 Harvey & Ferrier qumicas, exceto pela possibilidade de formao de ligaes de hidrognio (Figura 1.1B). Portanto, em ltima anlise, a natureza dessas cadeias laterais que determina o papel do aminocido na protena. Por isso, til classific-los de acordo com as propriedades de suas cadeias laterais ou seja, se so apolares (apresentam distribuio homognea de eltrons) ou polares (apresentam distribuio desigual de eltrons, como no caso de cidos e bases; Figuras 1.2 e 1.3).

A. Aminocidos com cadeias laterais apolares

Cada um desses aminocidos possui uma cadeia lateral apolar, que incapaz de receber ou doar prtons, de participar em ligaes inicas ou de hidrognio (Figura 1.2). As cadeias laterais desses aminocidos podem ser vistas como oleosas, ou semelhantes a lipdeos, uma propriedade que promove interaes hidrofbicas (veja a Figura 2.10, p. 19). 1. Localizao dos aminocidos apolares nas protenas. Nas protenas encontradas em solues aquosas um ambiente polar , as

Cadeias laterais apolares

COOH
+H N 3

pK1 = 2,3
+H N 3

COOH C CH3 H3C H

+H N 3

COOH C H

C H

pK2 = 9,6

CH CH3

Glicina

Alanina

Valina

COOH
+H N 3

COOH
+H 3N

COOH
+H N 3

C C

H CH3

CH2 H3C CH CH3

CH2

CH2 CH3 Isoleucina Fenilalanina

Leucina

COOH
+

COOH
+H N 3

H3N C H
CH2 C N H CH

H
+H N 2

COOH C CH2 H

CH2 CH2 S CH3

H2C

CH2

Triptofano

Metionina

Prolina

Figura 1.2 A classificao dos 20 aminocidos comumente encontrados nas protenas, de acordo com a carga e a polaridade de suas cadeias laterais em pH cido, mostrada aqui e continua na Figura 1.3. Cada aminocido mostrado em sua forma completamente protonada, com os ons hidrognio dissociveis representados em vermelho. Os valores de pK para os grupos -carboxila e -amino dos aminocidos apolares so semelhantes queles mostrados para a glicina (continua na Figura 1.3).

Bioqumica Ilustrada

Cadeias laterais polares desprovidas de carga

COOH
+

pK1 = 2,2

H3N

C CH2

COOH
+H N 3

COOH
+H 3N

C C H

H OH

C C

H OH

pK2 = 9,1

CH3 Treonina COOH

+ H3N

OH Tirosina

pK3 = 10,1

Serina COOH
+ H3N

H
+H N 3

COOH C H

pK1 = 1,7

CH2 C O NH2 O Asparagina

CH2 CH2 C NH2 Glutamina

CH2 pK3 = 10,8 SH Cistena pK2 = 8,3

Cadeias laterais cidas

pK1 = 2,1 COOH pK3 = 9,8
+H N 3

COOH pK3 = 9,7

+H N 3

CH2 C O OH pK2 = 3,9 O cido asprtico

CH2 CH2 C OH pK2 = 4,3

cido glutmico

Cadeias laterais bsicas

pK1 = 1,8 pK3 = 9,2 COOH
+H N 3

pK1 = 2,2 pK2 = 9,2 COOH

+H 3N

pK2 = 9,0
+H 3N

COOH C CH2 CH2 CH2 N H NH2+ pK3 = 12,5 H

C CH2 C

C CH2

CH C H NH

CH2 CH2 CH2 NH3+ pK3 = 10,5

+HN

pK2 = 6,0

NH2 Histidina Lisina Arginina

Figura 1.3 A classificao dos 20 aminocidos comumente encontrados nas protenas, de acordo com a carga e a polaridade de suas cadeias laterais em pH cido (continuao da Figura 1.2).

4 Harvey & Ferrier cadeias laterais apolares dos aminocidos tendem a agrupar-se no interior da protena (Figura 1.4). Esse fenmeno, conhecido como efeito hidrofbico, o resultado da hidrofobicidade dos grupos R apolares, que atuam como gotculas de leo coalescendo em ambiente aquoso. Desse modo, os grupos R apolares preenchem o interior da protena medida que ela se dobra e ajudam a estabelecer sua forma tridimensional. Entretanto, nas protenas localizadas em ambiente hidrofbico, como o interior de uma membrana, os grupos R apolares so encontrados na superfcie da protena, interagindo com o ambiente lipdico (veja a Figura 1.4). A importncia dessas interaes hidrofbicas para a estabilizao da estrutura proteica discutida na p. 19.

Aminocidos apolares ( ) agrupados no interior de protenas solveis.

Aminocidos apolares ( ) agrupados na superfcie de protenas de membrana.

Membrana celular

Aminocidos polares ( ) agrupados na superfcie de protenas solveis.

Protena solvel

Protena de membrana

Figura 1.4 Localizao dos aminocidos apolares em protenas solveis e de membrana.

A anemia falciforme, uma doena caracterizada pela forma em foice dos eritrcitos do paciente, resultante da substituio do glutamato, um aminocido com grupo R polar, pelo aminocido valina, com grupo R apolar, na posio 6 da subunidade da hemoglobina (veja na p. 36).

Grupo amino secundrio COOH

+H N 2

Grupo amino primrio

COOH
+

C CH2

H 3N C CH3

H2C

CH2

Prolina

Alanina

2. Prolina. A cadeia lateral da prolina e seu N -amnico formam uma estrutura rgida em anel, com 5 tomos, de modo que esse aminocido difere dos demais (Figura 1.5). A prolina, portanto, apresenta um grupo amino secundrio, e no primrio, sendo frequentemente denominada de iminocido. A geometria sem igual da molcula da prolina contribui para a formao da estrutura fibrosa do colgeno (veja a p. 45) e, com frequncia, interrompe as hlices encontradas em protenas globulares (veja a p. 26).

Figura 1.5 Comparao entre o grupo amino secundrio encontrado na prolina e o grupo amino primrio encontrado em outros aminocidos, como a alanina.

B. Aminocidos com cadeias laterais polares, desprovidas de carga eltrica

Esses aminocidos apresentam carga lquida igual a zero em pH neutro, embora as cadeias laterais da cistena e da tirosina possam perder um prton em pH alcalino (Figura 1.3). Cada um dos aminocidos serina, treonina e tirosina, contm um grupo hidroxila polar que pode participar da formao de ligaes de hidrognio (Figura 1.6). Cada cadeia lateral da asparagina e da glutamina contm um grupo carbonila e um grupo amida, que podem tambm participar de ligaes de hidrognio. 1. Ligao dissulfeto. A cadeia lateral da cistena contm um grupo sulfidrila (SH), componente importante do stio ativo de muitas enzimas. Nas protenas, os grupos SH de duas cistenas podem oxidar-se e formar um dmero, a cistina, que contm uma ligao cruzada denominada ponte dissulfeto (SS) (para discusso sobre a formao da ligao dissulfeto; veja a p. 19).

+H N 3

COOH C H CH2 Tirosina O H Ligao de hidrognio

Grupo carbonila C

Figura 1.6 Ligao de hidrognio entre o grupo hidroxila fenlico da tirosina e outra molcula contendo um grupo carbonila.

Muitas protenas extracelulares so estabilizadas por ligaes dissulfeto. Um exemplo a albumina, uma protena do plasma sanguneo que funciona como transportadora de uma grande variedade de molculas.

Bioqumica Ilustrada

2. Cadeias laterais como stios de ligao para outros compostos. O grupo hidroxila polar da serina, da treonina e, mais raramente, da tirosina pode servir como stio de ligao para estruturas, como o grupo fosfato. Alm disso, o grupo amida da asparagina e os grupos hidroxila da serina e da treonina podem servir como stio de ligao para cadeias de oligossacardeos nas glicoprotenas (veja a p. 165).

Primeira letra nica:

= = = = = = Cys His Ile Met Ser Val = = = = = =

Cistena Histidina
Isoleucina Metionina Serina

C H I
M

S
V

C. Aminocidos com cadeias laterais cidas

Os aminocidos cido asprtico e cido glutmico so doadores de prtons. Em pH fisiolgico, as cadeias laterais desses aminocidos esto completamente ionizadas, com um grupo carboxilato carregado negativamente (COO). Esses aminocidos so, portanto, denominados aspartato e glutamato, para enfatizar o fato de estarem carregados negativamente em pH fisiolgico (Figura 1.3).

Valina

Os aminocidos de ocorrncia mais frequente tm prioridade

= = = = = Ala Gly Leu Pro Thr = = = = = A G L P T

Alanina Glicina Leucina Prolina Treonina

D. Aminocidos com cadeias laterais bsicas

As cadeias laterais dos aminocidos bsicos so aceptoras de prtons (Figura 1.3). Em pH fisiolgico, as cadeias laterais da lisina e da arginina esto completamente ionizadas, com carga positiva. Em contraste, a histidina fracamente bsica, e, em geral, o aminocido livre no apresenta carga eltrica em pH fisiolgico. Entretanto, quando a histidina encontra-se incorporada em uma protena, sua cadeia lateral pode apresentar carga positiva ou neutra, dependendo do ambiente inico fornecido pelas cadeias polipeptdicas da protena. Essa uma propriedade importante da histidina e contribui para o papel que esse aminocido desempenha no funcionamento de protenas, como a hemoglobina (veja a p. 31).

Nomes com sons semelhantes

= = = = = = = = Arg Asn Asp Glu Gln Phe Tyr Trp = = = = = = = = R (aRginine) N (contm N) D ("asparDic") E ("glutEmate") Q (Q-tamine) F (Fenilalanina) Y (tYrosine) W (duplo anel na molcula)

Arginina Asparagina Aspartato Glutamato Glutamina Fenilalanina Tirosina Triptofano

Letra prxima letra inicial

Asx = B (prxima do A) Glx = Z Lys = K (prxima do L) X

E. Abreviaturas e smbolos para os aminocidos de ocorrncia mais frequente

O nome de cada aminocido possui uma abreviatura associada de trs letras e um smbolo de uma letra (Figura 1.7). Os cdigos de uma letra so determinados pelas seguintes regras: 1. Primeira letra nica. Se apenas um aminocido comea com determinada letra, ento aquela letra utilizada como seu smbolo. Por exemplo, I = isoleucina. 2. Os aminocidos de ocorrncia mais frequente tm prioridade. Se mais de um aminocido comeam com determinada letra, o aminocido de ocorrncia mais frequente recebe aquela letra como smbolo. Por exemplo, a glicina mais frequente que o glutamato, ento G = glicina. 3. Nomes com sons semelhantes. Alguns smbolos de uma letra soam, em ingls, de forma semelhante ao incio do nome do aminocido que representam. Por exemplo, F = fenilalanina, ou W = triptofano (twyptophan, como diria Elmer Fudd). 4. Letra prxima letra inicial. Para os demais aminocidos, atribudo um smbolo de uma letra, to prxima quanto possvel no alfabeto letra inicial do nome daquele aminocido. Por exemplo, K = lisina. Alm disso, a letra B atribuda ao Asx, significando tanto cido asprtico quanto asparagina; o Z atribudo ao Glx, significando tanto cido glutmico quanto glutamina; e o X atribudo a um aminocido no identificado.

Aspartato ou = asparagina Glutamato ou = glutamina Lisina = Aminocido = indeterminado

Figura 1.7 Abreviaturas e smbolos para os aminocidos de ocorrncia mais frequente.

OH CO H C +H3N CH3
L- A lan ina

HO OC H C

H C 3
D-A

NH
ina

+ 3

lan

Figura 1.8 As formas D e L da alanina so imagens especulares (imagens no espelho).

6 Harvey & Ferrier

F. Propriedades pticas dos aminocidos

O carbono de cada aminocido est ligado a quatro grupos qumicos diferentes e, portanto, um tomo de carbono quiral ou opticamente ativo. A glicina a exceo, pois seu carbono apresenta dois tomos de hidrognio como substituintes e, assim, opticamente inativa. Os aminocidos que apresentam um centro assimtrico em seu carbono podem existir em duas formas, designadas D e L, que so imagens especulares uma da outra (Figura 1.8). As duas formas, em cada par, so denominadas estereoismeros, ismeros pticos ou enantimeros. Todos os aminocidos encontrados nas protenas apresentam a configurao L. Os D-aminocidos, no entanto, so encontrados em alguns antibiticos e em paredes celulares de plantas e bactrias (veja, na p. 253, uma discusso acerca do metabolismo de D-aminocidos).

III. PROPRIEDADES ACIDOBSICAS DOS AMINOCIDOS

OH CH3COOH
FORMA I (cido actico, HA)

H20
CH3COO

H+

FORMA II (acetato, A )

Regio de tamponamento

Equivalentes de OH adicionados

[II] > [I]

1,0

[I] = [II]
0,5

pKa = 4,8

Em soluo aquosa, os aminocidos contm grupos -carboxila fracamente cidos e grupos -amino fracamente bsicos. Alm disso, cada aminocido cido e cada aminocido bsico contm um grupo ionizvel na cadeia lateral. Assim, tanto os aminocidos livres quanto alguns aminocidos combinados por meio de ligaes peptdicas podem atuar como tampes. Lembre-se que os cidos podem ser definidos como doadores de prtons e as bases como aceptoras de prtons. cidos (ou bases) so descritos como fracos quando ionizam em proporo limitada. A concentrao de prtons em soluo aquosa expressa como pH, onde pH = log 1/[H+] ou log[H+]. A relao quantitativa entre o pH da soluo e a concentrao de um cido fraco (HA) e sua base conjugada (A) descrita pela equao de Henderson-Hasselbalch.

A. Derivao da equao
[I] > [II]
0 0 3 4 pH 5 6 7

Considere a liberao de um prton por um cido fraco, representado por HA: HA cido fraco H prton
+

Figura 1.9 Curva de titulao do cido actico.

A forma salina ou base conjugada

O sal ou base conjugada, A, a forma ionizada de um cido fraco. Por definio, a constante de dissociao do cido, Ka,

(Nota: quanto maior o Ka, mais forte o cido, pois indica que a maior parte de HA dissociou-se em H+ e A. Por sua vez, quanto menor o Ka, menos cido foi dissociado e, portanto, mais fraco o cido.) Se isolarmos [H+] na equao anterior, tomando o logaritmo de ambos os lados da equao, multiplicando ambos os lados por 1 e substituindo pH = log [H+] e pKa = log Ka, obteremos a equao de Henderson-Hasselbalch:

Bioqumica Ilustrada

OH COOH +H N C H 3 CH3 FORMA I Alanina em soluo cida (pH menor que 2) Carga lquida = +1

H20

OH COO +H N C H 3 CH3 FORMA II Alanina em soluo neutra (pH aproximadamente 6) Carga lquida = 0 (forma isoeltrica)

H20

COO H2N C H CH3 FORMA III Alanina em soluo bsica (pH maior que 10) Carga lquida = -1

H+
pK1 = 2,3

H+
pK2 = 9,1

Figura 1.10 Formas inicas da alanina em solues cida, neutra e bsica.

B. Tampes
Um tampo uma soluo que resiste a mudanas de pH quando se adicionam pequenas quantidades de cido ou base. O tampo pode ser produzido pela mistura de um cido fraco (HA) com sua base conjugada (A). Se um cido, como o HCl, for adicionado a tal soluo, pode ser neutralizado pelo A, que no processo convertido em HA. Se uma base for adicionada, o HA pode neutraliz-la, sendo convertido em A nesse processo. A capacidade tamponante mxima ocorre quando o pH for igual ao pKa, mas um par conjugado cido/base ainda pode servir como tampo efetivo quando o pH da soluo estiver at 1 unidade de pH afastado do pKa. Se as quantidades de HA e A forem iguais, o pH igual ao pKa. Como mostrado na Figura 1.9, uma soluo contendo cido actico (HA = CH3COOH) e acetato (A = CH3COO), com pKa de 4,8, resiste a mudanas no pH entre os pHs 3,8 e 5,8, com capacidade tamponante mxima no pH 4,8. Em pHs abaixo do pKa, a forma cida protonada [CH3COOH] a forma predominante. Em pHs acima do pKa, a forma bsica no protonada [CH3COO] a forma predominante na soluo.

C. Titulao de um aminocido
1. Dissociao do grupo carboxila. A curva de titulao de um aminocido pode ser analisada como descrito anteriormente para o cido actico. Considere a alanina, por exemplo. Esse aminocido contm um grupo -carboxila e um grupo -amino. Em pHs baixos (cidos), os dois grupos encontram-se protonados (como mostrado na Figura 1.10). medida que o pH da soluo aumentado, o grupo COOH da Forma I pode dissociar-se, doando um prton ao meio. A liberao do prton resulta na formao do grupo carboxilato, COO. Essa estrutura mostrada como a Forma II (a forma dipolar da molcula, est ilustrada na Figura 1.10). Tambm denominada zwitterion, essa a forma isoeltrica da alanina, ou seja, possui carga lquida igual a zero. 2. Aplicao da equao de Henderson-Hasselbalch. A constante de dissociao do grupo carboxila de um aminocido denominada K1, e no Ka, pois a molcula contm um segundo grupo titulvel. A equao de Henderson-Hasselbalch pode ser utilizada para analisar a dissociao do grupo carboxila da alanina, do mesmo modo descrito para o cido actico:

8 Harvey & Ferrier onde I a forma completamente protonada da alanina e II a forma isoeltrica da alanina (Figura 1.10). Essa equao pode ser rearranjada e convertida em sua forma logartmica para dar:

3. Dissociao do grupo amino. O segundo grupo titulvel da alanina o grupo amino (NH3+), mostrado na Figura 1.10. um cido muito mais fraco que o grupo COOH; portanto, apresenta constante de dissociao muito menor, K2. (Nota: seu pKa, portanto, maior.) A liberao de um prton pelo grupo amino protonado da Forma II resulta na forma completamente desprotonada da alanina, a Forma III (Figura 1.10).
COO H2N C H CH3 FORMA III Regio de tamponamento Regio de tamponamento [II] = [III]

4. pKs da alanina. A dissociao sequencial de prtons dos grupos carboxila e amino da alanina est resumida na Figura 1.10. Cada grupo titulvel apresenta um pKa numericamente igual ao pH no qual exatamente metade dos prtons foram removidos daquele grupo. O pKa para o grupo mais acdico (COOH) o pK1, enquanto o pKa para o grupo acdico seguinte (NH3+) o pK2. 5. Curva de titulao da alanina. Pela aplicao da equao de Henderson-Hasselbalch a cada grupo acdico dissocivel, possvel calcular a curva de titulao completa de um cido fraco. A Figura 1.11 mostra a variao no pH que ocorre durante a adio de base forma completamente protonada da alanina (I), at produzir a forma completamente desprotonada (III). Observe o seguinte: a. Pares tampes. O par COOH/COO pode servir como tam+ po na regio de pH ao redor do pK1, e o par NH3 /NH2 pode tamponar na regio ao redor do pK2. b. Quando pH = pK. Quando o pH igual ao pK1 (2,3), existem na soluo quantidades iguais das Formas I e II da alanina. Quando o pH igual ao pK2 (9,1), esto presentes na soluo quantidades iguais das Formas II e III. c. Ponto isoeltrico. Em pH neutro, a alanina existe predominantemente como a Forma dipolar II, em que os grupos amino e carboxila esto ionizados, mas a carga lquida zero. O ponto isoeltrico (pI) o pH no qual um aminocido eletricamente neutro, ou seja, a soma das cargas positivas igual soma das cargas negativas. Para um aminocido como a alanina, por exemplo, que apresenta apenas dois hidrognios dissociveis (um do grupo -carboxila e um do grupo -amino), o pI a mdia entre pK1 e pK2 (pI = [2,3 + 9,1]/2 = 5,7, Figura 1.11). Assim, o pI est a meio caminho entre o pK1 (2,3) e o pK2 (9,1). Ele corresponde ao pH em que predomina a Forma II (com carga lquida igual a zero) e em que h tambm quantidades iguais das Formas I (carga lquida +1) e III (carga lquida 1).

Equivalentes de OH adicionados

2,0 1,5 [I] = [II]

pI = 5,7

1,0 0,5 0

pK p K2 = 9, 9,1 pK1 = 2,3

4 p pH

10

COOH +H N C H 3 CH3 FORMA I

+H N 3

COO C H CH3

FORMA II

Figura 1.11 Curva de titulao da alanina.

Bioqumica Ilustrada

A separao de protenas plasmticas por meio de cargas eltricas realizada tipicamente em pH acima do ponto isoeltrico (pI) das principais protenas, de modo que a carga dessas protenas negativa. Em um campo eltrico, as protenas movem-se no sentido do eletrodo positivo, a uma velocidade determinada por sua carga negativa lquida. Variaes nos padres de mobilidade so indcios de certas doenas.

Bicarbonato como um tampo

pH = pK + log [HCO3 ] [CO2]

Um aumento no on bicarbonato HCO3 faz com que o pH aumente. Obstruo pulmonar provoca aumento no dixido de carbono e causa a reduo do pH, resultando em acidose respiratria.

6. Carga lquida dos aminocidos em pH neutro. Em pH fisiolgico, todos os aminocidos apresentam um grupo carregado negativamente (COO) e um grupo carregado positivamente (NH3+), ambos ligados ao carbono . (Nota: os aminocidos glutamato, aspartato, histidina, arginina e lisina apresentam, alm desses, outros grupos potencialmente carregados em suas cadeias laterais.) Substncias como os aminocidos, que podem atuar como cidos ou bases, so classificadas como anfotricas e chamadas de anflitos (eletrlitos anfotricos).

Alvolos pulmonares

CO2 + H2O

H2CO3

H+ + HCO3-

Absoro de frmacos
pH = pK + log

[Frmaco ] [Frmaco-H]

D. Outras aplicaes da equao de Henderson-Hasselbalch

A equao de Henderson-Hasselbalch pode ser utilizada para calcular de que maneira o pH de uma soluo fisiolgica responde a mudanas na concentrao de um cido fraco e/ou de sua correspondente forma de sal. Por exemplo, no sistema tampo do bicarbonato, a equao de Henderson-Hasselbalch prev de que modo mudanas na concentrao do on bicarbonato [HCO3] e na pCO2 influenciam o pH (Figura 1.12A). A equao til tambm para calcular as quantidades das formas inicas de drogas com caractersticas cidas e bsicas. Por exemplo, muitos frmacos so cidos fracos ou bases fracas (Figura 1.12B). Frmacos cidos (HA) liberam um prton (H+), determinando a formao de um nion carregado (A).

No pH do estmago (1,5), um frmaco como a Aspirina (cido fraco, pK = 3,5) estar predominantemente protonado (COOH) e, portanto, desprovido de carga. Frmacos desprovidos de carga eltrica geralmente atravessam membranas mais rapidamente do que molculas com carga.

Estmago

Membrana lipdica

H+

AH+

Bases fracas (BH+) tambm podem liberar um H+. A forma protonada dos frmacos bsicos, no entanto, normalmente possui carga eltrica, e a perda de um prton produz a base desprovida de carga (B).

HA

H+

AH+

HA

Um frmaco passa atravs de membranas com mais facilidade quando no apresenta carga eltrica. Assim, para um cido fraco como a aspirina, a forma desprovida de carga HA consegue permear atravs das membranas, enquanto A no consegue. Para uma base fraca como a morfina, por exemplo, a forma desprovida de carga, B, atravessa membranas celulares, enquanto BH+ no o faz. Portanto, a concentrao efetiva da forma permevel de cada frmaco em seu stio de absoro determinada pelas concentraes relativas das formas carregada e desprovida de carga. A razo entre as duas formas , por sua vez, determinada pelo pH no stio de absoro e pela fora do cido fraco ou da base fraca, representada pelo pKa do grupo ionizvel. A equao de Henderson-Hasselbalch til para a determinao da quantidade de frmaco encontrada em cada lado de uma membrana entre dois compartimentos com diferena de pH, por exemplo, o estmago (pH 1,0 a 1,5) e o plasma sanguneo (pH 7,4).

Lmen do estmago

Sangue

Figura 1.12 A equao de Henderson-Hasselbalch utilizada para prever: (A) variaes no pH, medida que as concentraes de HCO3 ou CO2 so alteradas; ou (B) as formas inicas das substncias.

10 Harvey & Ferrier

Quadros de conceitos vinculados Aminocidos

(completamente protonados)

IV. MAPAS CONCEITUAIS

Os estudantes s vezes encaram a Bioqumica como uma srie nebulosa de fatos ou equaes a serem memorizadas, e no como um conjunto de conceitos a serem compreendidos. Detalhes fornecidos com a finalidade de enriquecer a compreenso desses conceitos tornam-se, inadvertidamente, fontes de distrao. Parece estar faltando um mapa do caminho, um guia que fornea aos estudantes uma compreenso intuitiva de como vrios tpicos encaixam-se para fazer sentido. Pensando assim, os autores criaram uma srie de mapas de conceitos-chave bioqumicos, que ilustram graficamente as relaes entre as ideias apresentadas no captulo e mostram como a informao pode ser agrupada ou organizada. O mapa conceitual , portanto, uma ferramenta para visualizar as conexes entre os conceitos. O material apresentado de maneira hierrquica, com os conceitos mais gerais e inclusivos no topo do mapa e os conceitos mais especficos e menos gerais abaixo. De modo ideal, os mapas conceituais funcionam como matrizes ou guias para organizar as informaes, de forma que os estudantes possam encontrar com facilidade as melhores maneiras de integrar as novas informaes ao conhecimento j consolidado.

podem Liberar H+

Conceitos vinculados dentro de um mapa

Degradao das protenas teciduais

produzido pela

Conjunto de aminocidos

Sntese e degradao simultneas

leva

Renovao das protenas

Sntese das protenas corporais

consumido pela

Conjunto de aminocidos

A. Como construdo um mapa de conceitos-chave?

1. Quadros de conceitos vinculados. Os educadores definem conceitos como regularidades percebidas em eventos ou objetos. Em nossos mapas bioqumicos, os conceitos incluem abstraes (p. ex., energia livre), processos (p. ex., fosforilao oxidativa) e compostos (p. ex., glicose-6-fosfato). Os conceitos de definio mais ampla so priorizados, com a ideia central posicionada no topo da pgina. Os conceitos que seguem a partir dessa ideia central so delineados em quadros (Figura 1.13A). O tamanho da letra indica a importncia relativa de cada ideia. Linhas so desenhadas entre os quadros dos conceitos para mostrar quais esto relacionados. A legenda na linha define a relao entre dois conceitos, de modo que se l uma afirmao vlida, ou seja, a conexo passa a ter sentido. As setas nas linhas indicam em que sentido a conexo deve ser lida (Figura 1.14). 2. Vnculos cruzados. Ao contrrio dos padres ou diagramas de fluxo linear, os mapas de conceitos-chave podem conter vnculos cruzados, que permitem ao leitor visualizar relaes complexas entre as ideias representadas em diferentes partes do mapa (Figura 1.13B) ou entre o mapa e os outros captulos deste livro ou em outros livros desta srie (Figura 1.13C). Vnculos cruzados podem assim identificar conceitos centrais para mais de uma disciplina, oferecendo aos estudantes mais eficincia em situaes clnicas ou em outros exames com caractersticas multidisciplinares. Os estudantes aprendem a perceber visualmente relaes no lineares entre os fatos, em contraste com referncias cruzadas em textos lineares.

Conceitos com vnculos cruzados com outros captulos e outros livros nesta srie

...como a protena se dobra em sua conformao nativa

...como o dobramento incorreto das protenas pode levar doena do pron, por exemplo, a doena de Creutzfeldt-Jakob

Estrutura das protenas

Lippincott's Illustrated Reviews

ia og l a io ad b tr us o l I r ic M
Figura 1.13 Smbolos utilizados nos mapas de conceitos-chave.

Bioqumica Ilustrada

11

Aminocidos
so compostos por quando protonados, podem

Grupo -carboxila (COOH) est

Grupo -amino (NH2) est

+ protonado (NH3 ) em pH fisiolgico

Cadeias laterais de 20 tipos diferentes

+ Liberar H

e atuam como

desprotonado (COO) em pH fisiolgico

compostas por

cidos fracos

conforme descrito pela

Equao de Henderson-Hasselbalck: [A] pH = pKa + log [HA] Cadeias laterais apolares Alanina Glicina Isoleucina Leucina Metionina Fenilalanina Prolina Triptofano Valina Cadeias laterais polares, desprovidas de carga Asparagina Cistena Glutamina Serina Treonina Tirosina Cadeias laterais cidas cido asprtico cido glutmico Cadeias laterais bsicas Arginina Histidina Lisina

que prev

A capacidade tamponante

caracterizadas por
Cadeias laterais que se dissociam ( COO) em pH fisiolgico

caracterizadas por
A cadeia lateral protonada e geralmente tem carga positiva em pH fisiolgico

que prev que

O tamponamento ocorre 1 unidade de pH a partir do pKa

que prev encontradas encontradas encontradas encontradas

Mxima capacidade tamponante quando pH = pKa

Na superfcie de protenas que atuam em ambiente aquoso e no interior de protenas associadas a membranas

que prev que

No interior de protenas que atuam em um ambiente aquoso e na superfcie de protenas (como as protenas de membrana) que interagem com lipdeos

pH = pKa quando [HA] = [A]

Estrutura das Protenas Nas protenas, a maior parte dos grupos -COO e -NH3+ dos aminocidos est combinada, formando ligaes peptdicas. Portanto, esses grupos no esto disponveis para reaes qumicas. Desse modo, a natureza qumica da deia lateral determina o papel que o aminocido desempenha em determinada protena, em especial... ...como a protena se dobra para assumir sua conformao nativa.

Figura 1.14 Mapa de conceitos-chave para aminocidos.

12 Harvey & Ferrier

V. RESUMO DO CAPTULO
Cada aminocido apresenta um grupo -carboxila e um grupo -amino primrio (exceto a prolina, que possui um grupo amino secundrio). Em pH fisiolgico, o grupo -carboxila est dissociado, formando o on carboxilato ( COO), carregado negativamente, e o grupo -amino est protonado (NH3+). Cada aminocido tambm apresenta uma cadeia lateral (so 20 cadeias laterais diferentes, para os 20 aminocidos) ligada ao tomo de carbono . A natureza qumica dessa cadeia lateral determina a funo de um aminocido em uma protena e fornece a base para a classificao dos aminocidos em apolares, polares desprovidos de carga, cidos e bsicos. Todos os aminocidos livres, assim como os aminocidos que apresentam carga quando ligados s cadeias peptdicas, podem servir como tampes. A relao quantitativa entre o pH de uma soluo e a concentrao de um cido fraco (HA) e sua base conjugada (A) descrita pela equao de Henderson-Hasselbalch. O tamponamento ocorre na faixa do pKa 1 unidade de pH e mximo quando pH = pKa, situao na qual [A] = [HA]. O carbono de cada aminocido (com exceo da glicina) est ligado a quatro diferentes grupos qumicos e , portanto, um tomo de carbono quiral ou opticamente ativo. Apenas a forma L dos aminocidos encontrada nas protenas sintetizadas pelo corpo humano.

Questes para estudo

Escolha a NICA resposta correta. 1.1 As letras de A a E designam certas regies na curva de titulao para a glicina (mostrada abaixo). Qual das seguintes afirmativas a respeito dessa curva est correta?
2,0 E D Resposta correta = C. C representa o ponto isoeltrico, ou pI, e, como tal, fica a meio caminho entre pK1 e pK2 para este cido monocarboxlico e monoamnico. A glicina est completamente protonada no ponto A. O ponto B representa uma regio de mxima capacidade tamponante, assim como o ponto D. O ponto E representa a regio em que a glicina est completamente desprotonada.

Equivalentes de OH adicionados

1,5 1,0 0,5 A 0 0 2 4 pH 6 8 B C

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A. O ponto A representa a regio em que a glicina est desprotonada. B. O ponto B representa uma regio de mnima capacidade tamponante. C. O ponto C representa a regio em que a carga lquida da glicina zero. D. O ponto D representa o pK do grupo carboxlico da glicina. E. O ponto E representa o pI para a glicina. 1.2 Qual das seguintes afirmativas a respeito do peptdeo mostrado abaixo est correta? Gly-Cys-Glu-Ser-Asp-Arg-Cys A. O peptdeo contm glutamina. B. O peptdeo contm uma cadeia lateral que forma um grupo amino secundrio ao ligar-se ao N do carbono . C. A maioria dos aminocidos contidos nesse peptdeo apresenta cadeias laterais que estariam carregadas positivamente em pH 7. D. O peptdeo capaz de formar uma ligao dissulfeto interna. 1.3 Sabendo-se que o pI para a glicina 6,1, para qual eletrodo, positivo ou negativo, a glicina migrar quando submetida a um campo eltrico em pH 2? Explique.
Resposta correta = D. Os dois resduos de cistena podem, em condies oxidantes, formar uma ligao dissulfeto. A abreviatura de trs letras para a glutamina Gln. A prolina (Pro) contm um grupo amino secundrio. Apenas um (Arg), dos sete resduos de aminocidos, apresentaria cadeia lateral com carga eltrica positiva em pH 7.

Resposta correta = eletrodo negativo. Quando o pH menor do que o pI, a carga da glicina positiva, pois o grupo -amino est completamente protonado. (Lembre que a glicina apresenta um tomo de H como seu grupo R).