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Amino Amino cidos e cidos e


Pept Pept deos deos
cio /. o.nio[v cio /. o.nio[v cio /. o.nio[v cio /. o.nio[v
I. AMINO I. AMINO CIDOS E PROTE CIDOS E PROTE NAS NAS
Amino Amino cidos cidos
Amino Amino cido: cido: um composto orgnico que contm ambos
um grupo amino e um cido:
- -Amino Amino cido cido: : um aminocido no qual o amino grupo
adjacente ao grupo carboxila;
no entanto -aminocidos so escritos geralmente na
forma no ionizada, podem tambm ser escritos na
forma de zwitterion zwitterion (sal interno)
R-CH-COH
NH
2
R-CH-CO
-
NH
3
+
unionized
form
zwitterion
O O
Propriedades dos Amino Propriedades dos Amino cidos cidos
Ponto de fuso: Ponto de fuso: baixo em comparao aos sais
inorgnicos, geralmente ocorre decomposio do a.a.
antes da sua fuso;
Solubilidade Solubilidade: solveis em gua, dependendo da sua
cadeia lateral;
Reatividade: Reatividade: reagem normalmente como os grupos
funcionais dos cidos carboxlicos e amnicos
primrios ou secundrios, existem ainda os grupos
laterias;
Isomeria Isomeria tica e desvio do ngulo de luz polarizada. tica e desvio do ngulo de luz polarizada.
Quiralidade Quiralidade dos Amino dos Amino cidos cidos
Com exceo da glicina, todos outros aminocidos
derivados de protenas tm no mnimo um centro
assimtrico (carbono ) que so quirais:
uma vasta maioria dos - aminocidos possuem carbono
na configurao L
H NH
3
+
COO
-
CH
3
+
H
3
N H
COO
-
CH
3
D-Alanine L-Alanine
(Fischer projections)
Quiralidade Quiralidade dos Amino dos Amino cidos cidos
Comparao da estereoqumica da alanina e
gliceraldedo (frmulas de projeo de Fischer)
H NH
3
+
COO
-
CH
3
+
H
3
N H
COO
-
CH
3
D-Alanine L-Alanine
H OH
CHO
CH
2
OH
HO H
CHO
CH
2
OH
D-Glyceraldehyde L-Glyceraldehyde
the naturally
occurring form
the naturally
occurring form
20 AA derivados de Prote 20 AA derivados de Prote nas nas
Nonpolar side chains (predominant form at pH 7.0)
H-
CH
3
-
CH
3
CH
2
CH( CH
3
) -
( CH
3
)
2
CHCH
2
-
CH
3
SCH
2
CH
2
-
N
H
( CH
3
)
2
CH
glycine (gly, G)
alanine (ala, A)
valine (val, V)
leucine (leu, L)
isoleucine (ile, I)
methionine (met, M)
phenylalanine (phe, F)
tryptophan (trp, W)
N
H H
+
proline (Pro, P)
2
20 AA derivados de Prote 20 AA derivados de Prote nas nas
Basic side chains (predominant format pH 7.0)
arginine (arg, R)
histidine (his, H)
lysine (lys, K)
H
2
N CN HCH
2
CH
2
CH
2
-
N H
2
+
H
3
N CH
2
CH
2
CH
2
CH
2
-
N
N
H
CH
2
-
+
20 AA derivados de Prote 20 AA derivados de Prote nas nas
Polar side chains (predominant format pH 7.0)
asparagine (asn, N)
glutamine (glu, G)
serine (ser, S)
threonine (thr, T)
H2 NCCH2-
O
H
2
NCCH
2
CH
2
-
O
HOCH2 -
CH
3
CH-
OH
Acidic side chains (predominant format pH 7.0)
aspartic acid (asp, D) glutamic acid (glu, E)
cysteine (cys, C) tyrosine (tyr, Y)
-
OCCH
2
-
HS CH 2 -
-
OCCH
2
CH
2
-
HO CH
2
-
O O
20 AA derivados de Prote 20 AA derivados de Prote nas nas
Note as caractersticas destas estruturas:
1. Todos os 20 so -aminocidos;
2. Para 19 dos 20, o -amino grupo primrio; para prolina
secundrio;
3. Com exceo da glicina, o carbono de cada um um centro
assimtrico;
4. Isoleucina e treonina contm um segundo centro assimtrico;
5. O grupo sulfidrila (pK
a
8,3) da cistena, o grupo imidazol (pK
a
6,0) da histidina e a hidroxila fenlica (pK
a
10,1) da fenilalanina
so parcialmente ionizados pH 7,0, mas a forma inica no a
principal forma neste pH.
Amino Amino cidos Incomuns cidos Incomuns
Cada exemplo derivado de um aminocido comum pela
modificao mostrada colorida:
hidroxilisina e hidroxiprolina so encontradas somente
em poucos tecidos conectivos tais como o colgeno;
tiroxina encontrada somente na glndula tireide
+
H
3
N
NH
3
+
COO
-
OH
Hydroxylysine
N COO
-
HO
H H
Hydroxyproline
NH
3
+
COO
-
O
I I
I
HO
I
Thyroxine
+
Prolina um amino Prolina um amino cido muito cido muito especial especial
Quantificao de protenas por
expectrofotometria no UV
3
Ioniza Ioniza o de Amino o de Amino cidos cidos
+
H
3
N COOH
pK
a
= 2.34
+
H
3
N COO
-
H
2
N COO
-
pK
a
= 9.69
+1 charge 0 charge -1 charge
Isoelectric zwitterion
+
H3 N COOH
+2 charge
N
NH
H
pK a = 1.82
+
H
3
N COO
-
+1 charge
N
N H
H
pK
a
= 6.04
+
H
3
N COO
-
0 charge
N
N H
pK
a
= 9.17
H
2
N COO
-
-1 charge
N
N H
Isoelectric zwitterion
+
+
Titula Titula o da o da alanina alanina com NaOH com NaOH
Acidez: Grupos Acidez: Grupos - -COOH COOH
O valor mdio de pK
a
de um grupo -carboxlico de
2,19, que o faz ento mais cido do que o cido actico
(pK
a
4,75)
a maior acidez do grupo carboxlico de aminocido
devido ao efeito indutivo retirante de eltrons do grupo
-NH
3
+
Este on amnio tem
efeito indutivo de
retirar eltrons
+
pK
a
= 2,19
NH
3
+
NH
3
+
RCHCOO
-
RCHCOOH H
3
O
+
H
2
O +
Acidez: Grupos Acidez: Grupos - -NH NH
3 3
+ +
O valor mdio de pK
a
para um grupo -NH
3
+
9,47,
comparado com o valor de 10,76 para um on
alquilamnio secundrio
+
pK
a
= 9.47
NH
3
+
NH
2
RCHCOO
-
RCHCOO
-
+ H
2
O H
3
O
+
pK
a
= 10.76
NH
3
+
NH
2
CH
3
CHCH
3
CH
3
CHCH
3
+ H
3
O
+
+ H
2
O
Basicidade Basicidade: Grupo : Grupo Guanidino Guanidino
A cadeia lateral da arginina uma base consideravelmente
mais forte do que uma amina aliftica:
basicidade do grupo guanidnico atribudo a grande
estabilizao de ressonncia da forma protonada
relativa a forma neutra:
+
pK
a
= 12.48
C
NH
2
+
C RNH
NH
2
+
NH
2
NH
2
RNH C RNH
NH
2
NH
2
C RN
NH
2
NH
2
+ H
3
O
+
H
2
O :
:
:
: :
:
:
:
Basicidade Basicidade: Grupo : Grupo Imidazol Imidazol
O grupo imidazol na cadeia lateral uma amina
aromtica heterocclica:
+
Este par sozinho no faz
parte o sexteto
aromtico; um
receptor de prton
pK
a
6,04
N
H
NH3
+
N
H
CH2 CHCOO
-
NH3
+
N
H
CH2 CHCOO
-
N
+ H
3
O
+
H
2
O
N
N
H
H
+
CH2 CHCOO
-
NH3
+
:
:
:
:
4
Ioniza Ioniza o o vs vs pH pH
Dado o valor de pKa de cada grupo funcional, ns podemos
calcular a proporo de cada cido ao seu conjugado como
funo do pH
Consideremos a ionizao de um -COOH:
escrevendo a constante de ionizao e rearranjando os
termos temos:
[ -COOH]
[ -COO
-
]
K
a
=
[ H
3
O
+
]
=
K
a
[ -COOH]
[ -COO
-
]
[ H
3
O
+
]
or
pK
a
= 2.00
COO
-
COOH + H
3
O
+
+ H
2
O
Ioniza Ioniza o o vs vs pH pH
Substituindo o valor de K
a
(1 x 10
-2
) para a concentrao
on hidrognio a pH 7,0 (1.0 x 10
-7
) temos:
pH 7,0, o grupo carboxlico est virtualmente 100% na
forma ionizada ou base conjugada e tem uma carga total de
-1;
podemos repetir este clculo em qualquer pH e determinar
a proporo de [ -COO
-
] ao [ -COOH] e a carga total no -
carboxlico naquele pH. Podemos tambm calcular a
proporo do cido base conjugada do grupo -NH
3
+
,
para este clculo, assumimos o valor de 10.0 para pK
a:
=
K
a
[ -COO H]
[ -COO
-
]
[ H
3
O
+
]
= 1.00 x 10
5
1.00 x 10
-7
1.00 x 10
-2
=
Ioniza Ioniza o o vs vs pH pH
escrevendo a constante de ionizao e rearranjando temos:
[ -NH
2
]
[ -NH
3
+
]
K
a
=
[H
3
O
+
]
+
pK
a
= 10.00
NH
2 NH
3
+
H
3
O
+
+ H
2
O
Substituindo os valores de K
a
de um grupo -NH
3
+
e a
concentrao do on hidrognio a pH 7,0 temos:
a pH7,0, a proporo de -NH
2
ao -NH
3
+

aproximadamente 1 para 1000;


neste pH, um grupo -amino est 99,9% na forma cida
ou protonada e tem uma carga de +1.
[ -NH
2
]
[ -NH
3
+
]
K
a
=
[H
3
O
+
]
=
1.00 x 10
-10
1.00 x 10
-7
= 1.00 x 10
-3
Henderson Henderson- -Hasselbalch Hasselbalch
Podemos calcular a proporo do cido e a sua base
conjugada para um grupo -carboxlico e um grupo -
amino pH 7,0 ou para qualquer cido fraco e sua base
conjugada qualquer pH usando a equao de Henderson-
Hasselbalch
[weak acid]
[conjugate base]
log = pH
pK
a
+
Usando a equao de Henderson-Hasselbalch, podemos
calcular a percentual da forma carregada e neutra
presente e a carga total na serina a pH 3,0, 7,0 e 10,0
+ +
pH 3.0 pH 7.0 pH 10.0
Net charge +1 N et charge 0 N et charge -1
100% 86% 99% 100% 88% 100%
C H
2
O H C H 2 O H C H 2 O H
H
3
N - C H - C - O H H
3
N - C H - C - O
-
H
2
N - C H - C - O
-
O O O
pH Isoel pH Isoel trico trico
pH Isoel pH Isoel trico, pI: trico, pI: pH no qual a maioria das molculas de
um composto em soluo no possui carga:
o pI da glicina, por exemplo, fica entre os valores de
pK
a
dos grupos carboxlico e amino (dois grupos):
pI =
1
2
( pK
a
COOH + pK
a
NH
3
+
)
=
2
1
(2.35 + 9.78) = 6.06
pH Isoel pH Isoel trico trico
o pI do cido glutmico???
-COOH
K
a1
2,19
-COOH
NH
3
Glu
K
a2
4,25
Ka3
9,67
2,19 4,25
9,67
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

+ + + + + + + + + + + + + + +
1
+ + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pI = 2,19 + 4,25 = 3,5
2
pI
14
+
5
pKa, pI dos amino pKa, pI dos amino cidos neutros cidos neutros
-COOH
6,02
5,41
5,65
5,97
6,02
6,02
5,74
5,48
6,30
5,68
6,53
5,89
5,97
pKa do
pI
----
----
----
----
----
----
----
----
----
----
----
----
----
valina 2,32 9,62
triptofano 2,38 9,39
10,43 2,63 treonina
serina 2,21 9,15
10,60 1,99 prolina
fenilalanina 1,83 9,13
9,21 2,28 metionina
9,68 2,36 leucina
isoleucina 2,36 9,68
glicina 2,34 9,60
9,13 2,17 glutamina
8,80 2,02 asparagina
9,69 2,34 alanina
cadeia lateral
Cadeia lateral
polar e apolar
pKa do pKa da
-NH
3
+
pKa, pI dos amino pKa, pI dos amino cidos cidos cidos e b cidos e b sicos sicos
10,76
2,98
5,02
3,08
7,64
9,74
5,63
pI
10,07 9,11 2,20 tirosina
lisina 2,18 8,95 10,53
6,10 9,18 1,77 histidina
cido glutmico 2,10 9,47 4,07
8,00 10,25 2,05 cistena
cido asprtico
2,10 9,82 3,86
arginina 2,01 9,04 12,48
cidas
Cadeias Laterais
Bsicas pI
Cadeias Laterais
-COOH
pKa do pKa do
-NH
3
+
-COOH
pKa do pKa do
-NH
3
+
cadeia lateral
pKa da
cadeia lateral
pKa da
Polipept Polipept deos deos
Em 1902, Emil Fischer props que protenas so cadeias
longas de -aminocidos unidos por ligaes amdicas para
os quais ele deu o nome de ligaes peptdicas:
Liga Liga o pept o pept dica: dica: nome especial dado as ligaes
amdicas entre os grupos -carboxlico de um aminocido e
um -amino de outro aminocido.
Serilalanine Serilalanine (Ser (Ser- -Ala) Ala)
+
Alanine (Ala) Serine (Ser)
H
3
N
O
-
H HOH
2
C
O
H
3
N
O
-
H CH
3
O
H
3
N
N
H HOH
2
C
O
H CH
3
O
O
-
H
+
+
+
peptide
bond
Serylalanine (Ser-Ala)
Pept Pept deos deos
pept pept deo deo: o nome dado para um pequeno polmero de
aminocidos unidos por ligaes peptdicas:
dipept dipept deo deo: uma molcula contendo dois aminocidos
unidos pela ligao peptdica;
tripept tripept deo deo: uma molcula contendo trs aminocidos
unidos pelas ligaes peptdicas;
polipept polipept deo deo: uma molcula contendo muitos
aminocidos unidos pelas ligaes peptdicas
prote prote na na: uma macromolcula biolgica de massa
molecular de 5000 g/mol ou mais, consistindo de uma ou
mais cadeias polipeptdicas, com funo biolgica.
Escrevendo Pept Escrevendo Pept deos deos
Por conveno, os peptdeos so escritos da esquerda,
comeando com o grupo -NH
3
+
livre e terminando com o
grupo -COO
-
livre
o modelo repetido, comeando do N-terminal, N --->
-carbono ---> carbonila .... etc.
+
H
3
N
OH
N
H
O
H
N
O
-
O O
C-terminal
amino acid
N-terminal
amino acid
Ser-Met-Asn
O
NH
2
S
peptide
bonds
Alguns Pept Alguns Pept deos Pequenos deos Pequenos
-Alanyl-L-histidine
(Carnosine)
L-Aspartyl-L-phenylalanine
methyl ester
(Aspartame)
H
3
N-CH-C-NH-CH-C-OCH
3
O
CH
2
CH
2
C
6
H
5
COO
-
O
+
H
3
N-CH
2
-CH
2
-C-NH-CH-COO
-
O
CH
2
N
NH
+
Anti-envelhecimento muscular
6
Glutationa Glutationa (anti (anti- -oxidante oxidante natural) natural)
Glutathione, GSH
(reduced form)
Glutathione, GS-SG
(oxidized form)
2e
-
oxidation
2e
-
reduction
A disulfide
bond
O O
H
N
NH
3
+
-
O
SH
N
H
O
O
O
-
O O
H
N
NH
3
+
-
O
S
N
H
O
O
O
-
O O
N
H
NH
3
+
-
O
S
H
N
O
O
O
-
Encefalinas Encefalinas (inibidores de dor) (inibidores de dor)
Ty r-Gl y -Gl y -Phe-Le u = Y-G-G-F-L
Leucine enkephalin
Ty r-Gl y -Gl y -Phe-Met = Y-G-G-F-M
Methionine enkephalin
Oxitocina Oxitocina ( (estimulante estimulante na na produ produ o o de de leite leite) )
& & Vasopressina Vasopressina ( (reten reten o o de de gua gua nos nos rins rins) )
H
3
N - Cy s- Ty r - I l e
S Gln
S
Pr o- Le u- Gl y - C- NH
2
O
+
Oxytocin
Cy s- A sn
H
3
N - Cy s- Ty r - Phe
S
Gln
S
Pr o- A r g - Gl y- C- N H
2
O
+
Cy s- A sn
Vasopressin
Fenilceton Fenilceton ria ria (PKU) (PKU)
N H
3
+
COO
-
fenilalanina
O
COO
-
Fenilpiruvato
(fenilcetona)
transaminao
reduo
OH
COO
-
Fenilactato
COO
-
Descarboxilao
oxidativa
+ CO
2
Fenilacetate
N H
3
+
COO
-
Tirosina
HO
Oxidao
A deficincia da enzima
fenilalanina hidroxilase
(PAH) que catalisa esta
reao leva o acmulo da
fenilpiruvato
Derivados da fenilalanina acumula anormalmente no sangue e txico ao
crebro