Cours de Biochimie 2 Chapitre II : Biochimie Mtabolique

1. Rappel en Bionergtique Thermodynamique Aspect Enzymatique Oxydorduction 2. La chane respiratoire mithocondriale (CRM) Les diffrents complexes Thorie chimio-osmotique Bilans nergtiques 3. Le mtabolisme 3.1. Le mtabolisme des glucides

Voie dEmbden-Meyerhof : la glycolyse

Ractions Bilan nergtique Les sources de glucose Rgulation Devenir du pyruvate

La glycognognse
La noglucognognse 3.2. Le cycle de Krebs Les ractions Le bilan nergtique 3.3. Le mtabolisme des lipides La -oxydation des acides gras Activation Transport Etapes de la dgradation Bilans energtiques Cas particuliers La voie de Wakil Formation du palmitate Dsaturations Formation des Triglycrides 3.4. Le mtabolisme des protines Dgradation des acides amins Dsamination oxydative Transamination Cycle de lure Dgradation du squelette carbon Synthses de certains acides amins

Quelques sites : http://ww.snv.jussieu.fr/bmedia/ http://www.gwu.edu/~mpb/index.html http://fr.wikibooks.org/wiki/Les_principales_voies_du_m%C3%A9tabolisme#La_cha.C3.AEne_respira toire

BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

O H3C N NH

H3C

N CH2 CHOH CHOH CHOH CH2 O HO P O HO P O CH2 O O

NH2 N

O H3 C H N NH

H3 C

N CH2

N H

OH

OH

FAD

FADH2

CONH2 OH O P O CH2 N O

OH O NH2

OH

CH2
N N

P OH

CH2

CONH2
O

OH

O P OH O

N
OH OH

HO

NAD+

NADH + H+

NADP+ - NADPH + H+

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BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

OH O P O CH2

CH3 C CH3 CHOH CO NH CH2 CH2 CO NH CH2 CH2 SH

-mercaptothylamine
O NH2 N

acide panthothnique

N O P OH O CH2 O

O HO P OH O

OH

Co-enzyme A

NH2 N

O HO P OH O

O P OH O

O P OH O CH2

N O

OH

OH

AMP

ADP

ATP

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Les complexes de la chane respiratoire mitochondriale

Composition des complexes de la chane de transport dlectrons

Complexe
complexe I : NADH-coenzyme Q oxydorductase complexe II : succinate-coenzyme Q oxydorductase complexe III : coenzyme Q-cytochrome c oxydorductase complexe IV : cytochrome c oxydase

protomres
25

masse molaire (kDa)

800

Composants
1 FMN22 24 atomes Fe - S dans 5 8 centres 1 FAD7 8 atomes Fe - S dans 3 centrescytochrome b 2 centres Fe - Scytochrome b560cytochrome b566cytochrome c1

125

12

220

cytochrome acytochrome a32 ions cuivre

Complex I NADH + H+ NAD

+

FMN FMNH2

Fe2+S Fe S
3+

CoQ CoQH2

Complex II Succinate Fumarate Complex III CoQH2 CoQ Complex IV cyt c red cyt c ox

FAD FADH2

Fe2+S Fe3+S

CoQ CoQH2

cyt b ox cyt b red

Fe2+S Fe3+S

cyt c1 ox cyt c1 red

cyt c red cyt c ox

cyt a ox cyt a red

cyt a3 red cyt a3 ox

O2 2 H2O

ATPase (complexe V)

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La CRM : les complexes et les lments mobiles

Le gradient de protons

Les bilans nergtiques de la CRM

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Valeurs des enthalpies libres standards et physiologiques des ractions de la glycolyse

Raction 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 G0 G kJ.mol-1 -16,7 -33,5 +1,7 -2,5 -14,2 -22,2 +23,9 -1,3 +7,6 +2,5 +12,6 -3,4 -37,6 +2,6 +8,8 +1,6 +3,4 -6,6 -62,8 -33,4

Les ractions de la Glycolyse Bilans nergtiques de la glycolyse

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Fructose et Galactose : autres sources de glucose pour la glycolyse

Rgulation, de la phosphorylase Bilan de la glycognolyse

La glycognolyse

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Rgulation de la glycolyse

Fermentation lactique et son bilan nergtique

Fermentation alcoolique

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Dcarboxylation oxydative du pyruvate

Rgulation de la PDH

Les navettes

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Rgulation de la glucognognse

Glucognognse

Noglucognognse

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Valeurs des enthalpies libres standards des ractions du cycle de Krebs

Raction 1 2 3 4 5 6 7 8 G0 kJ.mol-1 -32,2 +6,3 -20,9 -33,5 -2,9 0,0 -3,8 +29,7

Les ractions du cycle de Krebs

Description de la raction 4 du cycle de Krebs

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BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

Bilan nergtique du cycle de Krebs

Bilan nergtique de la Glycolyse et du Cycle de Krebs

Rgulation du cycle de Krebs

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Activation des acides gras

Transport Carnitine

Hlice de Lynen

Bilan nergtique de la -oxydation des acides gras

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Navette citrate

Etapes de la synthse des acides gras

Bilan de la synthse du palmitate

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BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

Dgradation du groupement amine des acides amins

Cycle de lUre

Elimination de lure

Dgradation du squelette carbon

Schma des voies de synthse des acides amins

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