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Estrutura dos cidos

nucleicos, replicao, transcrio e traduo

Cada clula contm cromossomos, e os cromossomos contm os genes

Organismo

Um corpo composto de trilhes de clulas

Cada ncleo das clulas contm um complemento idntico de cromossomos em duas cpias. Cada cpia um genoma

Um par de cromossomos especfico

Cada cromossomo uma longa molcula de DNA, e genes so regies funcionais desse DNA

DNA uma dupla hlice

James Watson e Francis Crick


Nature (1953): We wish to suggest a structure for the salt of deoxyribose nucleic acid (DNA). This structure has novel features which are of considerable biological interest.

A estrutura do DNA deveria compreender os seguintes


requerimentos: Habilidade de armazenar informao Habilidade de replicar Habilidade de mutar

Bases purinas
Guanina, G Adenina, A

Bases pirimidinas
Citosina, C Timina, T

A estrutura do DNA

DNA contendo muito pares G-C mais estvel do que DNA contendo pares A-T

Tm = temp. de fuso (temp. na qual metade das bases de uma amostra desnaturada)

Transcrio (ncleo)

Traduo (citoplasma)

Replicao

Transcrio

Traduo

A replicao do DNA semiconservativa dCTP dCTP dATP dATP dTTP dTTP dCTP dATP dGTP

dGTP

Polimerase
dTTP

dCTP

dTTP
dTTP dGTP dATP dGTP dCTP dATP dCTP

DNA Polimerase

Isolada de E. coli em 1959 (pol I) (Arthur Kornberg) Adiciona deoxiribonucleotdeos ao final 3da cadeia de DNA (a replicao se d do sentido 5 3)

Usa como molde a cadeia nica de DNA que foi exposta na dupla hlice

Usa a forma trifosfato dos deoxiribonucleotdeos como substrato


Mafalda, s vezes me pergunto: Qual o sentido da vida? na direo 5-- > 3, Felipe!!!

DNA Polimerase

Hoje so conhecidas 5 polimerases em E. coli


Pol I: trs atividades, localizadas em partes diferentes da molcula
Polimerase: catalisa o crescimento da cadeia na direo 5- 3
Exonuclease: remove bases no-emparelhadas na direo 3- 5 Exonuclease: degrada o DNA dupla-fita na direo 5- 3

Acredita-se que a pol III catalize a sntese de DNA

DNA Polimerase pode extender uma cadeia mas no iniciar uma cadeia Primer (iniciador)
1. Primase sintetiza um oligonucleotdeo de RNA (primer) copiado do DNA 3. DNA polimerase I remove o RNA da ponta 5 e completa os intervalos com DNA

2. DNA polimerase III elonga os primers de RNA com novo DNA

4. DNA ligase conecta os fragmentos adjacentes

O replisoma tem 13 componentes em E. coli e pelo menos 27 em mamferos

Transcrio

Sntese de RNA a partir de uma fita molde de DNA

Bases purinas
Adenina, A

Fita simples: maior flexibilidade

Guanina, G

Bases pirimidinas
Citosina, C Uracila, U

RNA

Mensageiro (RNAm)
Intermedirio para levar informaes do DNA para a protena (so traduzidos, expresso gnica)

Funcional
O prprio RNA o produto funcional

RNA funcional

Transportador (RNAt)
Responsvel por trazer o aminocido correto para o RNAm no processo de traduo

Ribossomal (RNAr)
Principais componentes dos ribossomos, que guiam
a unio da cadeia de aa pelos RNAm e RNAt

Small nuclear RNA (snRNA)


Remove introns

Transcrio (ncleo)

Traduo (citoplasma)

Transcrio

A transcrio assimtrica: somente a fita de DNA 3- 5 usada na

transcrio, e o RNA sintetizado na direo 5 3.

Transcrio e traduo em Procariotos e Eucariotos

Procariotos

Eucariotos

Expressed regions

Intervening regions

Ocorre antes do RNAm ir para o citoplasma

Splicing

poliadenilao

Protena

introns

Traduo

Uma aminoacil-tRNA sintetase liga um aminocido ao seu tRNA

Stio de ligao para tRNAAla

Stio de ligao para alanina

Aminoacil-tRNA sintetase especfica para alanina

Protena e molculas de RNA compe as duas subunidades de um ribossomo

Cdigo gentico do mtDNA

Cdigo Gentico universal


A maquinaria de transcrio e traduo uniforme Permite a engenharia gentica de plantas de interesse agrcola com genes de bactrias que codificam

inseticidas naturais

Estes 4 aa so os
principais responsveis pela carga das protenas + -

Nveis de estruturas de protenas

Estrutura primria

Nveis de estruturas de protenas

Estrutura secundria

Nveis de estruturas de protenas Estrutura terciria

Nveis de estruturas de protenas Estrutura quaternria

Alinhamento das sequncias de quimiotripsinas de Spodoptera frugiperda


10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 ....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|

SFCHY3 SFCHY4 SFCHY5 SFCHY7 SFCHY9 SFCHY11 SFCHY12

IVGGQASSLGQFPYQAGLLADFS--LGQGVCGGSLVRANRVLTAAHCWFDGQNQAWRFTVVLGSIRLFTGGTRVQTTNVVMHGSWTPNLIRNDVAVIKLS IVGGAPAQLGQFPYQAGLIIILP--FWSSACGGSLLNTRKVITAAHCWFDGQSQAISFTVVLGSINLYSGGTRVSSSNVVMHPNWTPSLVRNDVAMITLP IVGGVPAGQGQYPYQAGLLISIIGFDGSGVCGGSLISAARVVTAAHCWFDGMHQAWRVTVVLGSTTLFTGGTRIETSVMAMHPDWSPALIRNDVGVLYLP IVGGSPSSAGQFPYQAGLLASYAGISGTGVCGGSLISANRVVTAAHCWFDGINQAWLFNVVLGSTTLFSGGTRIQTSAVMVHPNWVPVLVRNDVAVIYLP IVGGSLASLGQFPYQAGLLLNYP--TRTGYASASLISHNRILTAAHNINDGFSNVPTVTVVLGTTTIMTGGVRQTTGNYVIHENYDISIVRSDIAIINLP IVGGQASSLGQFPYQAGLLADFS--AGQGVCGGSLVRANRVLTAAHCWFDGQNQAWRFTVVLGSIRLFSGGTRVQTSNVVMHGSWNPSNIRNDVAMIRLN IVGGQASSLGQFPYQAGLLADFS--AGQGVCGGSLVRANRVLTAAHCWFDGQNQAWRFTVVLGSIRLFSGGTRVQTSNVVMHGSWNPSNIRNDVAMIRLN


110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 ....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|

SFCHY3 SFCHY4 SFCHY5 SFCHY7 SFCHY9 SFCHY11 SFCHY12

SNVALSDTIAVIALPSGSQLNENFAGENAVASGFGRTVDGAG--ITVNQFLSHVTLPVITNIACRASFPLIVQDSNICTSGAGGRSTCQGDSGGPLVVTR NAVSTSNNLSPIALPSGNELNNNFAGFTGTASGFGYTRDGGS----VSPTLNHVDLPVITNAVCSNSLFWYVQDSNVCTSGAGGRSVCHGDSGGPLVVTS QAVQLSANIQPIAIATGS---SDFVGVSAIASGYGLTSSEGS--ISANQVLSHVRLNVIANSACSYAFPLVVQPSNL-TSGIGGVGTCSGDSGGPLVASQ TPVPFSDTIKPIALPSGDQLNNDFVGATAIASGFGLTNDGGS--ISTNQFLSHVSLNVISNSVCSYAFPLILHSTNVCTSGLGGSSTCNGDSGGPLAVTI SSVQFSNILAPIALPSGSQLGENFVGQVAIASGYGFNPGIGG--MLANQPFSFVDLPIITNNQCAGTYGSFIYNGIICTGSVPGKNICSGDSGGPLAINR SNVGLSNTIALIALPSGSQLNENFAGENAVASGFGRTSDGAGGAITTNQFLSHVTLPVITNAVCRSSFPLIIQDSNICTSGAGGRSTCQGDSGGPLVVTR SNVGLSNTIALIALPSGSQLNENFAGENAVASGFGRTSDGAGGGITTNQFLSHVTLPVITNAVCRSSFPLIVQDSNICTSGAGGRSTCQGDSGGPLVVTR


210 220 230 240 ....|....|....|....|....|....|....|....|....|.

SFCHY3 SFCHY4 SFCHY5 SFCHY7 SFCHY9 SFCHY11 SFCHY12

NNSPLLIGVTSFGSARGCQV----GSP-AAFARVTSFISWINSQLNNRRILIGVTSFGHWDGCQS----GNP-AAFARVTSFISWINQNLNGQDVLICISSFGSAFGCQITCHQSSPCTSLVVLSQPIFSVLQQLP NNEPVLIGVTSFGSALGCEA----SLP-AAFARVTSYVDFFNQHLNGNYILIGVVSFGRG-GCEG----NSP-SGYARVTHYINWINQRLSGRPLLIGITSFGSARGCQV----GSP-AAFARVTSFMSWINGQLSGRPLLIGVTSFGSARGCQV----GSP-AAFARVTSFMSWINGQL-

Alinhamento das estruturas

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