Termodinmica de los seres vivos La termodinmica en general se puede aplicar a distintos procesos y distintas reas.

En esta clase la enfocaremos a la clula. Qu es la termodinmica? Es una rama de la fisicoqumica que estudia los movimientos de calor o ms correcto, manifestaciones de energa. Termo->Calor y dinmica->movimiento Tipos de energa: mejor dicho manifestaciones de energa, qumica, potencial, radiante, etc. Estudia los cambios de estado de un sistema, basada en propiedades macroscpicas, que se puede medir como temperatura, presin nmeros de moles, etc. El estudio de la termodinmica nos va a permitir: caracterizar ciertos procesos, predecir si un proceso ocurrir de manera espontnea, si es favorable y en qu estado es favorable este proceso, pero no nos dice cundo ocurrir. Por ejemplo la combustin de la glucosa tiene un muy negativo, lo que sugiere que es un proceso espontneo, sin embargo si ponemos 1 kilo de glucosa aqu lo ms probable es que no veremos que se queme. Somos entidades que nos regimos por las leyes de la fisicoqumica, dentro de la clula estn ocurriendo procesos fisicoqumicos. Analizaremos el establecimiento del potencial electroqumico de la mitocondria, estudiaremos componente energtico, y la mantencin de este potencial, que es un proceso importante para la obtencin de intermediarios de alta energa. Por otro lado sabemos que la mantencin de los potenciales electroqumicos a nivel de la membrana estn comandados por transporte activo: donde el ATP se encargara de realizar el trabajo para mantener los gradientes necesarios. Y en el transporte transepitelial ocurre lo mismo, ya que para el transporte de glucosa se acopla a un gradiente, en este caso el sodio. En resumen: el potencial electroqumico comanda, rige todos los procesos en la clula. Lo que deben saber al terminar la clase es: Qu tipo de sistema es una clula? Cmo persiste en el tiempo? Cmo obtiene la energa para persistir? En termodinmica clsica lo primero es definir el sistema: la parte del universo que se estudiar, en este caso nuestro sistema ser la clula, cuyo lmite ser la membrana plasmtica.

Tipos de sistemas: depende de la permeabilidad del lmite, en este caso de la membrana plasmtica. Abierto: Existe intercambio de materia y energa Cerrado: Intercambio slo de energa Aislado: no existe intercambio Qu tipo de sistema es la clula? Todos los seres vivos somos sistemas abiertos, que intercambiamos materia y energa con el ambiente. Energa interna (E): es la capacidad potencial de realizar un trabajo, lo que podramos ocupar. Sus componentes son: La energa cintica: se relaciona con el movimiento, en directa relacin con la temperatura. *Experimento de joule: si aumento la temperatura, aumento la energa interna del sistema. Energa potencial: se relaciona con la interaccin de molculas y tomos, es decir las fuerzas de repulsin y de atraccin en los enlaces qumicos.

*No se puede medir la cantidad de energa interna de un sistema, pero si la variacin de sta entre dos estados de un sistema. Cmo podemos variar la energa de un sistema? La batera se puede descargar (alcanza el equilibrio) de dos formas: 1: Disipando calor 2: Al conectarla a un motor: Realizando un trabajo. Primera ley de la termodinmica: En un sistema aislado la energa del universo es constante: Vara con respecto al calor (transferencia de energa por variacin de temperatura) y al trabajo.

Esta ley nos habla de la conservacin de la energa, pero no nos predice si el proceso ocurre o no, ni la direccin. Entalpa (H): en palabras simples es el calor a presin constante (isobrico), en este caso se considera la clula como un sistema isobrico:

As se define una nueva funcin de estado: La Entalpa, que es el calor disipado en un proceso a presin constante.

En la clula la variacin del volumen se mantiene constante, por lo tanto se dice que Energa libre de Gibbs(G): Energa efectiva para realizar un trabajo, es decir el trabajo til de un sistema a temperatura y presin constantes. Dado que no toda la energa de un sistema puede convertirse en trabajo: Entropa(S): Se relaciona con el grado de desorden o dispersin de un sistema. Este grado de desorden se relaciona con los nmeros de micro estados, o sea como se puede combinar el sistema.

* En este caso, el estado final tiene mayor entropa. Segunda ley de la termodinmica: Sostiene que la entropa del universo va en aumento Todo proceso espontneo resulta en un incremento neto de la entropa, del sistema ms sus alrededores: Proceso espontneo:

Proceso en equilibrio:

La energa libre de Gibbs, es una funcin de estado muy completa que nos permite determinar: cul es la cantidad de trabajo til del sistema y el criterio de espontaneidad de un proceso a temperatura y presin constante.

*Cando la variacin de energa libre es cero, no le podemos sacar trabajo til.

Sistema en equilibrio v/s Estado estacionario:

-concentraciones en ambos Compartimientos es igual. -No hay posibilidad de Realizar trabajo. -No se mantiene la vida.
Cmo es el sistema de la clula? Sistema abierto en estado estacionario.

-La velocidad de ingreso y de salida es constante: se regulan los flujos, la concentracin a lo largo del tiempo es constante. -No es un sistema en equilibrio: Sistema si posee trabajo til. -Mantiene la vida.

Qu pasa si un sistema vivo llega al equilibrio? Se muere. En el caso de la clula, que pasa con la segunda ley de la termodinmica? La clula es un sistema abierto muy ordenado que posee baja entropa, Esto significa que viola la segunda ley?, NO. No se viola la segunda ley, ya que cuando la clula se organiza (Endergnico) la clula disminuye su entropa, pero desordena el entorno, aumentando la entropa del entorno. Esto puede ocurrir disipando calor o liberando residuos del metabolismo. La clula para mantener su orden debe invertir energa, parte de un estado de entropa alta (monmeros, subunidades, desorden), pero cuando se comienza a organizar comienza a pagar un cierto costo, y comienza a utilizar el trabajo til por ejemplo en la polarizacin. Y as contribuye a la entropa del universo desordenando el entorno. Por ejemplo en los ribosomas: esto parte desde la conformacin de los azucares, nucletidos, aminocidos que formaran las protenas que forman este ribo complejo por medio de enlaces covalentes, se forman macromolculas, luego viene un plegamiento ordenado, el ribosoma es ordenado, sus protenas son ordenas. En la clula ocurre lo mismo, aqu se ven tres ejemplos: fibroblasto que est migando, clula epitelial y una neurona. Cuando se induce la migracin, El fibroblasto se polariza, en un frente de avanzada v/s el frente de retraccin, y esos frentes tienen distintas organizaciones en su citoesqueleto de microtbulos y de actina, el aparato de Golgi esta polarizado, el ncleo se dispone una forma definida, etc.

La clula epitelial esta polarizada en un dominio apical y basolateral, tiene uniones celulares. La neurona es altamente polarizada: dominio somatodendrtico, y un dominio axonal que estn bien diferenciados. Cmo se organiza la clula?, en qu tiene que usar su trabajo til La clula utiliza la energa para produccin de un trabajo biolgico: -Biosntesis: Anabolismo -Trabajo mecnico: Contraccin muscular -Gradientes osmticos: transporte contra gradiente o activo -Trabajo elctrico: Transmisin del impulso nervioso De dnde proviene esta energa? Auttrofos: Emplean energa proveniente de la luz solar, gracias a los cloroplastos que son especializados en captar esta energa. Esta energa se fija y la utilizan en la biosntesis de sus propias macromolculas. Hetertrofo: Adquirimos energa a partir de nutrientes y macromolculas de otros organismos, oxidamos (agregamos oxigeno o quitamos H, quitamos electrones) y por medio de la respiracin generamos agua y dixido de carbono y almacenamos la energa. Cmo fluye la energa, cmo la utilizamos?

Resumen: movimiento de energa en la clula

Ejemplo: Combustin u oxidacin de la glucosa. Tiene un delta G muy bajo, lo que dice que es un proceso muy favorable y espontneo. (-2878 Kj/mol) Variacin Entalpa: -2800kj/mol, su componente es un gran porcentaje de la energa total lo que hara pensar que gran parte de la energa se disipa como calor. Variacin Entropa (T S): 72kj/mol, es un bajo porcentaje de la energa total. La gran mayora de la energa contenida en la glucosa se disipa como calor, sin embargo no ardemos.

Cmo lo hace la clula para no arder? Lo que hace la clula es dividir la cada energtica (el proceso) en mltiples pasos almacenando la energa por medio de intermediarios, adems la energa de activacin disminuye por accin de enzimas. Sin embargo un porcentaje de energa sigue disipndose. Si bajramos de golpe toda la energa se disipara completamente. Los intermediarios son: NADH, nicotinamida adenina y nucletido (dador de electrones), ATP adenosin trifosfato (transferencia del Grupo fosforilo), entre otro. Permiten coordinar reacciones, almacenan la energa til. Metabolismo Suma de todas las reacciones qumicas que ocurren en la clula. Tienen lugar en una serie de reacciones catalizadas llamadas rutas metablicas Catabolismo: Fase degradadora. -Liberan energa (Exergnica) -> proceso espontneo

-Estructuras complejas-> Estructuras simples Anabolismo: Sntesis. -Acumula energa (Endergnica) -> no espontnea

-Estructuras simples-> Estructuras complejas Acoplamiento de las reacciones:

Lo que hace la clula es acoplar reacciones de tal manera que la reaccin final sea exergnica (favorable). Y Esto lo hace empleando reacciones oxidantes en reacciones de sntesis o reductoras por medio de un intermediario comn (B). En el fondo la reaccin exergnica le entrega energa a la reaccin enedergnica.

ATP moneda energtica Bsicamente lo que hace el ATP, es la transferencia de un grupo fosforilo gama (negativo) a otras molculas ( grupos hidroxilos) por ejemplo en la sntesis de ADN o fosforilacin de residuos como serina, treonina por ataque nucleoflico. *El fosfato genera un intermediario de alta energa por medio de la repulsin de carga.

La clula se ordena fosforilando molculas, por lo tanto la sntesis de macromolculas implica un trabajo. As se podra representar una etapa de inicio (monmeros) y de trmino (macromolculas) en la clula:

*Energa potencial: dada por enlace Ejemplo: Mantencin del potencial electroqumico en la clula

El impulso nervioso se genera por el ingreso de sodio a la clula, sabiendo que existe un gradiente desde el exterior de la clula hacia el interior de la clula, lo que implica un trabajo Est comandado por gradiente electroqumico, posee dos componentes: -Concentracin (por ejemplo la del sodio) -Potencial de membrana ZEVm, fuerza electro motriz de me membrana. Para mantener este gradiente electroqumico se necesita trabajo, este gradiente se mantiene por la bomba de sodio y potasio ATPasa, que funciona con ATP. La Bomba lo que hace es sacar de la clula el sodio e ingresar potasio, todo esto en contra del gradiente regenerando un potencial.

La ATPasa expone en el citosol su sitio activo que une 3 sodios ocasionando un cambio conformacional, exponiendo ciertos dominios (tiene tres: N,P,A) La unin del sodio, estimula a la autofosforilacin de una enzima a un residuo de aspartato (Este detalle se nombra ya que esto es una excepcin, los eucariontes nos fosforilamos a serina, treonina y tirosina) Fosforilo induce un cambio conformacional, cuando se liberan los sodios se unen dos potasios que llevan a la desfosforilacin de la ATPasa por medio de otro cambio conformacional. Regenerando as el gradiente.

NADH En el anillo nicotnico va a ganar hidruros, se reduce. Sin embargo el NADH tiene una gran capacidad para oxidarse. Lo que aqu define el potencial redox es la relacin entre la concentracin del aceptor de electrones y el donante. Se saca trabajo til a travs de una celda electroqumica. Mantiene el gradiente de protones en la mitocondria. La siguiente imagen muestra el potencial de reduccin, si se reemplaza en la frmula da un mas favorable en sentido contrario, osea que este intermediario se oxide. , la reaccin es