Cours de Biologie Cellulaire

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CHAPITRE V : ETUDE DES ORGANITES CELLULAIRES

VI LES MITOCHONDRIES ET LA RESPIRATION CELLULAIRE INTRODUCTION La cellule fait du travail continuellement afin de survivre. Elle construit des macromolcules, elle transporte des substances travers des membranes, elle se dplace, elle croit et elle se reproduit. Pour accomplir ces tches et bien d'autres, la cellule a besoin de l'nergie qu'elle doit puiser de son environnement. La lumire est la source d'nergie pour les organismes photosynthtiques tels que les plantes et certaines bactries. Ces organismes, dits autotrophes, produisent leur propre nergie chimique partir de la lumire. Les animaux ne sont pas photosynthtiques et donc ils doivent ingrer leurs sources d'nergie. Les animaux se nourrissent de vgtaux ou d'autres animaux. Les organismes qui doivent ingrer leurs sources d'nergie (qui ne peuvent la produire) sont dits htrotrophes. Ces organismes utilisent les molcules organiques contenues dans leur nourriture pour obtenir l'nergie et pour crotre et faire tout le travail requis par la cellule. Il y a une relation importante entre les autotrophes et les htrotrophes. Les mitochondries utilisent les molcules organiques et l'oxygne produits par la photosynthse pour la respiration cellulaire. La respiration cellulaire extrait l'nergie des molcules organiques pour produire de l'ATP, la molcule nergtique essentielle au travail cellulaire. Les dchets de la respiration cellulaire sont l'eau et le dioxyde de carbone (CO2). Les chloroplastes utilisent ces molcules dans le processus de photosynthse. Ce cycle est rsum dans la figure adjacente. L'nergie qui est entrepose dans les molcules organiques doit tre extraite afin que la cellule puisse s'en servir. La cellule va, grce ces enzymes, dgrader les molcules complexes contenant beaucoup d'nergie potentielle en produits plus simple contenant moins d'nergie. L'nergie tire de cette dgradation et utilise pour faire le travail, mais une partie est aussi perdue sous forme de chaleur. La respiration cellulaire arobie est la voie catabolique la plus efficace pour la cellule. Elle requiert de l'oxygne, des molcules organiques et une chane de transport d'lectrons. La respiration cellulaire anarobie est moins efficace, elle se fait en absence d'oxygne et ne requiert pas de chane de transport d'lectrons. C'est dans la mitochondrie que se font la plupart des ractions chimiques impliques dans la respiration cellulaire. Nous appelons donc la mitochondrie l'usine des la cellule. Le but de la respiration cellulaire est donc d'extraire l'nergie des molcules complexes comme le glucose, et la convertir en ATP. L'ATP est l'intermdiaire nergtique qui fait le travail de la cellule. La respiration cellulaire comprend une srie de ractions chimiques assez complexes. Pour faciliter la comprhension la respiration cellulaire sera prsente en 3 tapes. Mais avant de voir ces dtails, faisons une petite rvision de l'ATP.

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I : lADENOSINE-TRIPHOSPHATE (ATP)
Cette molcule est l'unit nergtique principale de la cellule. L'nergie est entrepose dans ses trois groupements phosphates instables. La cellule utilise cette nergie en transfrant, l'aide d'enzymes, de groupements phosphates (surtout le dernier) de l'ATP d'autres molcules qui sont ainsi phosphoryles. La phosphorylation amorce un changement dans la molcule ce qui produit un travail. Durant ce travail la molcule perd son groupement phosphate. L'ATP est donc convertit en ADP plus un phosphate inorganique (Pi), des molcules qui ont moins d'nergie. Pour que la cellule puisse faire d'autre travail, elle doit rgnrer son ADP en ATP. C'est la respiration cellulaire qui va faire ceci.

A : Structure de l'ATP :

L'ATP est une molcule constitue d'adnine lie un ribose qui, lui, est attach une chane de trois groupements phosphate.

B : Comment l'ATP produit de l'nergie :

Le mcanisme consiste au transfert d'un groupement phosphate sur une autre molcule et l'ATP devient alors l'adnosinediphopshate (ADP).

En rsum, nous pouvons dire que nos cellules contiennent des batteries dnergie, lATP (Adnosine tri-phosphate). Cest en arrachant un groupement phosphate cette molcule quon libre de lnergie et que cette nergie peut tre investie dans une activit cellulaire spcifique

ATP

ADP + P + ENERGIE TRAVAIL CELLULE

La batterie na donc plus dnergie.. Pour la recharger , lADP et le groupement phosphate arrach reviennent donc la mitochondrie, o ils se refixeront ensemble : pour fixer le groupement phosphate lADP, il faut de lnergie qui provient de loxydation de nos aliments.

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ADP + P + ENERGIE OXYDATION ALIMENTS

ATP

Dans la chane respiratoire, nos nutriments (du glucose par exemple) et de loxygne sont constamment achemins. La molcule de glucose se fait rduire grce loxygne. En brisant les liens de la molcule de glucose, il y a libration dlectrons. Ceux-ci circulent dans deux chanes de transfert des lectrons, parallles la chane de rduction du glucose. Les lectrons circulent grce des mtallo-enzymes : Ces enzymes (lubiquinone -ou Coenzyme Q- et les cytochromes) sont en effet lis des atomes de mtaux, comme par exemple du fer. Ils schangent un un les lectrons et cest de cette faon que les lectrons peuvent se dplacer dans la chane de transfert des lectrons. Lorsque les lectrons arrivent la fin de la chane, ils se lient aux atomes de carbone, dhydrogne et doxygne. Les atomes de carbone, dhydrogne et doxygne tablissent alors des liens entre eux, pour former des molcules de CO2 et de H2O. La formation de ces nouvelles molcules libre une grande quantit dnergie, qui est investie pour fixer le groupement phosphate lADP ; la batterie est maintenant recharge.

II : STRUCTURE DE LA MITOCHONDRIE Le mot mitochondrie drive du grec mitos, filament , et chondros, graine en raison de l'aspect de cet organite au microscope optique (et lectronique). Par exemple dans les cellules laboratrices d'hormones strodiennes (corticosurrnales et gonades) les mitochondries sont filamenteuses, alors que dans les hpatocytes (foie), elles sont granulaires. Les mitochondries ont un diamtre denviron 1m. Les cellules en contiennent de nombreuses : nombre estim 1000 dans un hpatocyte de rat. Les mitochondries ne sont pas des organites statiques : elles se scindent ou, au contraire, fusionnent couramment ce qui explique leur polymorphisme au sein d'une mme cellule

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La mitochondrie est limite par une enveloppe forme de deux membranes : membrane externe et membrane interne. Elles sont trs diffrentes dans leur composition et leurs fonctions. Ces deux membranes dlimitent trois milieux: lespace extra mitochondrial qui est le cytoplasme de la cellule, lespace inter membranaire et la matrice.

La membrane externe est permable toutes les molcules de 5 kDa ou moins grce la prsence de porines. Elle contient aussi des translocases, transporteurs protiques, impliques dans l'import des protines. La membrane interne se replie pour former de nombreuses crtes, ce qui a pour consquence d'augmenter sa surface totale. La base d'une crte est souvent constitue par une structure tubulaire troite appele tube de jonction de crte qui tablit une communication entre l'espace intrieur de la crte et l'espace inter membranaire priphrique de la mitochondrie. La composition lipidique de la membrane interne est particulire : elle contient une majorit de phosphatidylcholine et de cardiolipine. Dans cette membrane on trouve la chane respiratoire de transporteurs d'lectrons, l'ATP synthase et de nombreux transporteurs qui assurent le passage d'lments tels que pyruvate, acide gras, ATP, ADP et H2 PO4-, composs ncessaires la production d'ATP. La membrane interne contient aussi des translocases, impliques dans l'import des protines Dans l'espace matriciel on trouve un mlange trs concentr de nombreuses enzymes, dont celles qui sont ncessaires l'oxydation du pyruvate et des acides gras (en actyl-CoA) et au cycle de l'acide citrique. Il renferme galement plusieurs copies identiques d'ADN (gnome mitochondrial) et les protines ncessaires sa transcription puis la traduction de l'ARNm en protines. La protosynthse mitochondriale ne concerne cependant qu'un nombre restreint de protines (13), la grande majorit des protines mitochondriales (environ 300 protines diffrentes) tant importe partir du cytoplasme.

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III : RESPIRATION CELLULAIRE La respiration cellulaire comprend une srie de ractions chimiques assez complexes qui consistent l'extraire l'nergie des molcules complexes comme le glucose, et la convertir en ATP. Elle sera prsente en 3 tapes. La respiration comprend trois stades qui permettent de librer l'nergie emmagasine dans le glucose : 1. la glycolyse qui a lieu dans le cytosol 2. le cycle de Krebs qui a lieu dans la matrice de la mitochondrie 3. la phosphorylation oxydative qui a lieu dans la membrane de la mitochondrie.

A : LA GLYCOLYSE OU VOIE D'EMBDEN-MEYERHOL

On dfinit ce processus mtabolique comme l'oxydation mnage - car inacheve - d'une molcule de glucose en 2 molcules de pyruvate, dont l'quation bilan est la suivante:

C6H12O6 + 2 NAD+ + 2 ADP + 2Pi --> 2CH3CO COOH + 2NADH + 2H+ + ATP

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La dgradation initiale du glucose se fait dans le cytosol et comprend une srie de 10 tapes chacune catalyses par une enzyme spcifique Le glucose (un sucre 6 carbones) se fait dgrader pour produire 2 molcules 3 carbones chaque, le pyruvate. Cette dgradation se fait en deux phases : 1) La premire phase utilise l'nergie de l'ATP (2 ATP) pour dstabiliser le glucose, une molcule trs stable qui autrement ne pourrait se faire dgrader. C'est la phase d'investissement d'nergie. 2) La deuxime tape voit la libration de l'nergie partir des molcules organiques, donc 4 ATP et 2 NADH + 2 H+ sont produits. La molcule de glucose a t convertie en 2 molcules de pyruvate.

Les produits nets de la glycolyse sont donc o 2 ATP (phosphorylation au niveau du substrat) o 2 NADH o 2 pyruvates (molcules 3 carbones)

L'nergie est donc obtenue sous deux formes : de l'ATP et du NADH. Ces deux produits interviennent dans diffrents types de ractions cellulaires, l'ATP apportant l'nergie des ractions endothermiques et le NADH, molcule transporteur d'lectrons, pour les ractions d'oxydorduction. Le sous produit final, l'acide pyruvique comporte encore beaucoup d'nergie. Toutefois la cellule ne sait pas l'extraire directement, les plus simple choisiront alors de s'en dbarrasser dans les ractions de fermentation anarobies, le rendement n'est alors que de 2% de la totalit de l'nergie du glucose. Une certain nombre de cellules ont cependant dvelopp des moyens de rcuprer la totalit de cette nergie disponible en la catabolisant dans le cycle de Krebs puis la chaine respiratoire, voies complexes n'existant que dans quelques cellules volues utilisant l'oxygne; le rendement monte alors presque 40%, soit prs de 20 fois plus que prcdemment. Malgr la simplicit de la formule brute, la voie est plus complexe, la cellule ne procde pas en une tape, mais en une dizaine dont seules les dernires produisent de l'nergie (4 ATP), les premires en consomment au contraire (2 ATP). Comme plus d'nergie est produite que consomme, le bilan est positif.
La glycolyse a lieu dans le cytoplasme. La cellule dgrade d'abord le glucose en 2 molcules de PGAL (phosphoglycraldhyde). Durant cette phase, la cellule doit utiliser 2 ATP (qu'elle possde dj); on dit donc que c'est la phase d'investissement d'nergie. Puis, les 2 PGAL sont transforms en 2 molcules de pyruvate. Durant cette deuxime phase, les ractions librent de l'nergie qui sert former de l'ATP. Comme l'ATP est form directement durant ces ractions et non par une chane de transporteurs d'lectrons, on nomme ce phnomne phosphorylation au niveau du substrat.

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B : LE CYCLE DE KREBS

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Le cycle de Krebs comprend 8 tapes qui termine la travail de la glycolyse en dgradant un driv de l'acide pyruvique (l'actyl-CoA) en dioxyde de carbone (CO2) et en produisant de l'ATP.

Les molcules de pyruvates produites par la glycolyse contiennent encore beaucoup d'nergie qui doit tre extraite. Si l'oxygne est prsent, le pyruvate rentre dans la mitochondrie pour tre oxyd et relcher l'nergie. Elles seront d'abord transformes en actyl-CoA (raction intermdiaire), engendrant la formation de NADH + H+. 1) Avant que le cycle de Krebs puisse commencer un groupement carboxyle est enlev du pyruvate et est relch dans le cytosol sous forme de CO2. 2) La molcule 2 carbones qui reste forme l'actate aprs la rduction du NAD+ en NADH. 3) Le coenzyme A est attach l'actate par une liaison instable pour produire l'actyl-CoA. Le cycle de Krebs a huit tapes, chacune catalyse par une enzyme spcifique dans la matrice mitochondriale.

Le fragment actyle du actyl-CoA est li l'oxaloactate (molcule 4 carbones) pour produire le citrate (molcule 6 carbones). Le citrate est ensuite progressivement dcompos jusqu'en oxaloactate. Pour chaque tour du cycle, o 2 carbones entrent sous la forme rduite de l'actyl-CoA ; o deux carbones ressortent compltement oxyds sous la forme du CO2 ; o trois molcules de NAD+ sont rduites en NADH + H+ et une molcule de FAD est rduite en FADH2 ; o une molcule d'ATP est produite par la phosphorylation au niveau du substrat.

(Note : le FAD est une molcule qui ressemble au NAD, elle se fait rduire en FADH2 en captant 2 lectrons et 2 protons. Cette molcule entrepose moins d'nergie que le NADH.) Le cycle de Krebs est rsum la figure ci-dessous. Il y a deux tours du cycle pour chaque molcule de glucose oxyde. Bilan nergtique du cycle de Krebs (pour les 2 molcules de pyruvates) 6 NADH + 6 H+ 2 FADH2 + 2 H+ 2 ATP par phosphorylation au niveau du substrat + 4CO2 7

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C : LA CHAINE RESPIRATOIRE La phosporylation oxydative produit prs de 90% de l'ATP engendre par la respiration. Il s'agit donc de la production d'ATP par l'ajout d'un groupement phosphate l'ADP grce l'nergie libre lors du transport d'lectrons le long d'une chane de molcules (ractions d'oxydo-rduction). Les molcules de NADH + H+ et de FADH2 se dirigent donc vers une chane de transporteurs d'lectrons enchsse dans la membrane interne de la mitochondrie. Chaque NADH + H+ cde 2 lectrons au premier transporteur qui les cde au suivant, etc. La dernire molcule de la chane de transport doit cder son tour les lectrons. Comme il n'y a aucune autre molcule sa suite, c'est un transporteur mobile, l'oxygne, qui vient prendre les deux lectrons. Il se combine ensuite 2 H+ pour former de l'eau. Le FADH2 fait de mme mais il cde ses lectrons la troisime molcule de la chane. Lorsque les lectrons circulent dans la chane, certains transporteurs retirent des H+ de la matrice et les envoient dans l'espace intermembranaire o ils s'accumulent. Comme la concentration en H+ augmente dans l'espace intermembranaire, les protons diffusent vers la matrice en passant par l'ATP synthtase; c'est la chimiosmose. Se faisant, ils entranent la formation d'ATP par phosphorylation oxydative. Chaque NADH + H+ et FADH2 provenant du cycle de Krebs servent former 3 ATP et 2 ATP respectivement. Les NADH + H+ provenant de la glycolyse ne peuvent entrer dans la mitochondrie. Ils doivent donc cder leurs lectrons des navettes qui peuvent tre soit le NAD+ ou le FAD+. Selon la navette, les NADH + H+ de la glycolyse forment 2 ou 3 ATP chacun.

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D : LE BILAN EN NERGETIQ QUE

Si on add ditionne tous s les ATP for rms par pho osphorylation n au niveau du d substrat ceux forms s par la phospho orylation oxy ydative, la res spiration cell lulaire arobie donne, au mieux, entre e 36 et 38 AT TP par glucose.

partir r d'une mol cule de glu ucose (6 carb bones) : 9

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Phosphorylation au niveau du substrat = 6 ATP

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4 par la glycolyse 2 par le cycle de Krebs

Synthse chimiosmotique = 32 ATP

3 ATP pour chacun des 8 NADH produit dans la mitochondrie (24 ATP) 2 ATP pour chacun des 2 FADH2 du cycle de Krebs et chacun des 2 NADH produits par la glycolyse. (8 ATP)

Moins les 2 ATP investis pour la glycolyse :

Total = 36 ATP pour une cellule eucaryote (avec mitochondrie) Total = 38 ATP pour une cellule procaryote (sans mitochondrie), les NADH de la glycolyse n'ont pas de membrane traverser alors donnent 3 ATP chacun.

L'efficacit de la respiration cellulaire dans sa conversion nergtique est de 63%

Il y a la production de 36 ATP qui ont chacun environ 50 Kj d'nergie. Le delta G de la dgradation du glucose est de -2871 kj/mol. 50 x 36/2871 *100 = 63% Une partie de l'nergie entrepose dans le glucose est perdue sous forme de chaleur.

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IV : FERMENTATION

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A partir du pyruvate, plusieurs types de ractions vont pouvoir se produire. Les premire sont les fermentations, qui aboutissent l'alcool ou l'acide lactique, ne produisent pas d'avantage d'nergie, mais de plus elles consomment le NADH produit, rduisant le bilan global de la raction. Les principaux inconvnients des fermentations, outre leur faible rendement, est la toxicit des produit finaux. L'acide lactique entraine une acidification du cytoplasme qui devra tre compense et l'alcool est toxique par lui mme.

La fermentation alcoolique est plutt le fait des microorganismes alors que la lactique se produit chez les animaux. L'acide lactique produit par cette fermentation est responsable de la fatigue musculaire quand son alimentation en oxygne devient insuffisante pour l'effort fourni et qu'il ne peux plus utiliser la voie arobie. Chez les vgtaux, c'est galement la fermentation alcoolique qui se produit, toutefois, en cas d'hypoxie, ils commencent par la voie de l'acide lactique qui acidifie le cytoplasme. Cette acidification est responsable d'une part de l'inhibition de la voie lactique et de l'activation de la voie alcoolique. Le bilan de la fermentation alcoolique est : CH3CO COOH --> CH3CHO + CO2 CH3CHO + 2NADH + 2H+ --> CH3CH2OH

Celui de la fermentation lactique est le suivant :

CH3CO COOH + 2NADH + 2H+ --> CH3CHOH COOH + 2 NAD+ Supposons que la cellule arobie se trouve momentanment sans oxygne. Ses besoins en ATP ne diminuent pas pour autant. Il faut donc qu'elle continue de fabriquer de l'ATP. Toutefois, en absence d'oxygne, la chane de transporteurs d'lectrons est bloque. Les NADH + H+ ainsi que les FADH2 ne peuvent plus cder leurs lectrons aux transporteurs. Comme ils prennent habituellement des lectrons du cycle de Krebs pour les apporter la chane de transport, le cycle de Krebs s'en trouvera paralys lui aussi. La seule faon, pour ces cellules, d'obtenir de l'ATP est de faire la glycolyse. Toutefois, lors de la glycolyse, les NAD+ du cytoplasme sont rduits en NADH + H+. Pour que la glycolyse continue se faire, il faut oxyder les NADH + H+ en NAD+. C'est l qu'intervient la fermentation. Elle transforme les pyruvates en divers composs, selon les enzymes prsentes dans la cellule. Ces ractions ont besoin d'lectrons que la cellule ira chercher dans le NADH + H+, librant le NAD+ qui pourra nouveau tre utilis dans la glycolyse.

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Fermentation alcoolique S'il n'y a pas d'oxygne :

Fermentation lactique

la cellule doit trouver un autre accepteur d'lectron afin de pouvoir recycler des NAD. Il y a un nombre limit de NAD+ dans une cellule. le NADH restera sous cette forme rduite et il n'y aura pas l'oxydation du NADH pour produire le NAD+ qui capte les lectrons. il n'y aura pas de cycle de Krebs ni de chane de transport d'lectrons. seulement la glycolyse se fera : o Produit 2 ATP (nette) o Produit 2 NADH o Produit 2 pyruvates

Dans ce processus anarobie de la fermentation les lectrons des NADH produits lors de la glycolyse seront donns un autre accepteur.

Dans la fermentation alcoolique le pyruvate est convertit en actaldhyde (2 carbones) et le CO2 est libr. L'actaldhyde est ensuite rduit par le NADH pour produire l'alcool. La fermentation alcoolique de la levure est utilise dans le brassage de la bire et dans la production du vin. Dans la fermentation lactique le pyruvate est directement rduit par le NADH pour produire l'acide lactique et recycler le NAD+. Aucun CO2 n'est libr. L'industrie laitire utilise la fermentation lactique de certains champignons et bactrie dans la production de fromage et de yogourt. Les cellules des muscles produisent l'ATP par fermentation lactique lors de l'exercice vigoureux quand la demande d'nergie est haute et le montant d'oxygne disponible est faible.

La fermentation produit seulement deux molcules d'ATP pour chaque molcule de glucose dgrade par la glycolyse. Cette synthse d'ATP se fait au niveau de la phosphorylation au niveau du substrat. La fermentation, bien qu'un processus moins efficace, permet la cellule de produire un peu d'ATP dans une situation o elle ne pourrait autrement pas en produire.

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