Preguntas BCH General

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Preguntas de Control para Bioqumica General

Curso: FB 206 4. Ciclo, Carrera QFB Creditos: 11 Prerrequisito: Fisiologa II (FB 203) recomendable: Qumica Orgnica II (QM 212)

Bases de Bioqumica
Bases de Bioqumica - Dibuje grupos funcionales: acilo, acetilo, alcohol, aldehdo, amino, carbonilo, carboxilo, cetona, hidroxilo, metilo, tiol, sulfhidrilo; oxidaciones de alcoholes - Dibuje y explique (como se forman) enlaces: amido, anhdrido, disulfuro, ster, ter, glucosdico, peptdico, tioster, tioter - Define: cido, agente oxidante, base, carbono cido (CH-acido), electronegatividad, enlace covalente, oxidacin, pH, potencial redox, reactivo nuclefilo, reduccin - Explique interacciones dbiles: Fuerza van der Waals, puente de hidrgeno (H-puente), interacciones inicas, efecto hidrofbico - Agua como solvente: por qu agua puede solver sustancias hidrfilas pero no hidrfobas? - Qu son anfipticos? Qu estructuras se forman en agua? - Qu son cidos/bases dbiles? Cmo se comportan cidos poliprticos? - Qu son bufferes? Para qu sirve la ecuacin Henderson-Hasselbalch? - Qu son anflitos? Cmo se puede calcular el pI para un aminocido? Qu efecto tiene el pI sobre la solubilidad de protenas? Bioenergtica - Qu signfica (breve!): entalpa (!H), entropa (!S), energa libre (!F), entalpa libre (!G) - Explique el equilibrio qumico y la ley de accin de masas. Qu dice el Principio de Le Chatelier? - Cmo el equilibrio y la entalpa libre son conectados? Qu significa "termodinmicamente favorecida" o espontaneidad? - Qu significa potencial de transferencia de fosfato? - Dibuje los enlaces de energa elevada - Por qu la clula utiliza ATP como "moneda" de "energa"? Por qu la hidrlisis de ATP es muy exergnica? - Define AEC (Adenylate Energy Charge). Para qu eso es importante? La clula - Explique las diferencias celulares de eucariontes, eubacterias y archaebacterias - Qu ventaja tiene la compartimentacin de los eucariontes? - Dibuje y explique las funciones los orgnulos (subcelulares): ncleo, mitocondria (mito), retculo endoplasmtico (ER), aparato de Golgi (TGN), endosomas, lisosoma, peroxisoma, citosol - De qu se compone la membrana celular - y para que es necesario? Qu significa "Modelo mosaico fluido"? - Qu sistemas de transporte a travs de las membranas existen (general)?
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- Qu significa smosis? De qu depende la presin osmtica? Qu son aguaporinas? - De qu se compone el citoesqueleto? - Cmo se puede separar los orgnulos - y comprobar su pureza? - Cules son los pasos principales de la expresin de genes y dnde los ocurren? Enzimas - Dibuje un L-aminocido, qu significa aminocido proteingeno? - Cmo se puede clasificar los aminocidos qumicamente? Para qu sirven sus grupos funcionales de su cadena lateral? - Cules son las caractersticas de un enlace peptdico? - Qu significa estructura primaria de una protena? - Qu significa estructura secundaria de una protena? Cules fuerzas estabilizan esta estructura? Cuales motivos se forman? - Qu significa estructura terciaria de una protena? Cules fuerzas estabilizan esta estructura? - Qu significa estructura cuaternaria de una protena? Cules fuerzas estabilizan esta estructura? - Cmo se puede desnaturalizar una protena? Sobre cules fuerzas actua este efecto? - Qu son protenas globulares y qu fibrosas? Qu efecto tiene eso sobre su solubilidad en agua? - Qu diferencia hay entre un catalizador qumico y biolgico (= enzima?) - Que clase de enzimas existen (segn IUB)? Qu tipo de reacciones catalizan aminotransferasa, anhidrasa, carboxilasa, descarboxilasa, deshidratasa, deshidrogenasa, epimerasa, esterasa, fosfatasa, glucosidasa, hidratasa, hidroxilasa, isomerasa, lipasa, mutasa, nucleasa, oxidasa, oxigenasa, peptidasa, proteasa, quinasa, reductasa, sintasa, sintetasa - Explique la termodinmica de la catlisis enzimtica. Qu significa entalpa de activacin (!G " )? - Explique los modelos "llave y cerradura" y "adjuste inducido". Cmo estos modelos pueden explicar la especifidad de enzimas? - Cmo la temperatura y el pH influyen la actividad enzimtica? Qu factores ms pueden influir esa actividad? - Explique la ecuacin de Michaelis-Menten y sus componentes. Dibuje la grfica de Michaelis-Menten - Calcule la KM para v = 90% de vmax - Compara las ventajas/desventajas entre Michaelis-Menten y Lineweaver-Burk - Dibuje la grfica de ;Lineweaver-Burk y explique su ecuacin - Qu significa inhibicin competitiva? Dibuje las grficas de Michaelis-Menten y Lineweaver-Burk para esa inhibicin - Qu significa inhibicin no competitiva? Dibuje las grficas de Michaelis-Menten y Lineweaver-Burk para esa inhibicin - Qu significa inhibicin incompetitiva? Dibuje las grficas de Michaelis-Menten y Lineweaver-Burk para esa inhibicin - Qu significa inhibicin mixta? Dibuje las grficas de Michaelis-Menten y Lineweaver-Burk para esa inhibicin - Explique el efecto por una inhibicin irreversible. De un ejemplo - Explique las diferentes niveles de regulacin enzimtica. Generalmente, cules enzimas se puede regular, en qu posiciones de las rutas se puede encontrarlas? - Qu significa: centro cataltico, centro alostrico, cooperatividad, estado T (tense), estado R (relaxed), efector - Cmo un efector puede influir la cintica enzimtica? Explique el tipo v y el tipo K. - Explique el modelo "simtrico" (Monod, Wyman, Changeux: MWC) y el modelo "secuencial" (Koshland, Nemethy, Filmer: KNF) - Defina: apoenzima, cofactor, holoenzima, coenzima, grupo prosttico - Explique las funciones de las siguientes coenzimas/cofactores - para qu tipo de reacciones son
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necesarios? NAD+ , NADP+ , FMN, FAD, CoQ, hem, Fd (ferredoxina y Fe/S-cluster), GSH (glutatin), LA (lipoato), TPP (tiamina-pirofosfato), PLP (piridoxalfosfato), CoA, BTN (biotina) - Explique los siguientes mecanismos de catlisis con un ejemplo: cido-base, covalente, con iones metlicos, Redox

Metabolismo de Carbohidratos
Carbohidratos - Qu son cetosas, aldosas, diasteremeros, enantimeros, epmeros, anmeros? De un ejemplo. Qu significa mutarrotacin? - Explique la formacin de un hemiacetal y hemicetal. Qu son furanosas y piranosas? - Cmo se transpone un azcar de la proyeccin Fischer a la proyeccin Haworth? - Explique las reacciones Redox para azcares: alditol, cido aldnico, cido urnico, cido aldrido. Dibuje cada estructura para Glc. Qu es una lactona? - Qu son aminoazcares? - Explique el enlace glucosdoco. De un ejemplo para un enlace O-glucosdico y N-glucosdico. - Explique la basis de la reaccin de Fehling Gluclisis - Escribe la ecuacin de la gluclisis en general - Qu es el objetivo de la gluclisis? Cmo la gluclisis es conectado a otras rutas metablicas? - Explique la(s) reaccion(es) de oxidacin de la gluclisis: enzima, mecanismo de reaccin, coenzimas - Cmo se puede reoxidar los equivalentes de reduccin reducidas: bajo condiciones aerbicas y anaerbicas - Explique la(s) reaccion(es) de transferencia de fosfato de la gluclisis: enzima, mecanismo de reaccin, coenzimas - Qu enzimas de la gluclisis son reguladas y por qu esas? Cmo funciona su regulacin? Cmo el AEC puede influir la gluclisis? - Qu significa fosforilacin a nivel de sustrato? Explique con un ejemplo - Explique el mecanismo de reaccin de la aldolasa, GA-3-Pi-DH, PyrK, LDH. Por qu la reaccin de la PyrK es tan exergnica? - Explique las consecuencias de la desviacin de la gluclisis (2,3-P2 -Gri mutasa, 2,3-P2 -Gri fosfatasa) en los eritrocitos PDH y Ciclo de Krebs - Dnde son la PDH y el TCA ubicadas? De dndo provienen los sustratos y cmo llegan por all? - Explique la reaccin de la PDH: descarboxilacin, transacetilacin, oxidacin. Explique las funciones de las coenzimas - Cmo la PDH es regulada? Qu ventaja tienen complejos multienzimticos contra varios enzimas libres? - Qu es el objetivo del TCA? Qu significa anfibolismo? Cmo el TCA es concetado a otras rutas metablicas? - Escribe la ecuacin del TCA en general - Por qu la reaccin de la Cit-sintasa es tan exergnica? Explique por el mecanismo y por el punto de vista gobal - Explique la(s) reaccion(es) de oxidacin del TCA: enzima, mecanismo de reaccin, coenzimas - Cmo se puede reoxidar los equivalentes de reduccin reducidas
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- Explique la(s) reaccion(es) de descarboxilacin del TCA: enzima, mecanismo de reaccin, coenzimas - De dnde provienen los C-tomos del CO 2 ? - Explique la(s) reaccion(es) de transferencia de fosfato de la gluclisis: enzima, mecanismo de reaccin, coenzimas - Qu enzimas del TCA son reguladas y por qu esas? Cmo funciona su regulacin? - Para qu sirven las secuencias anaplerticas? De un ejemplo - Explique el mecanismo de reaccin de la Ict-DH, SuccCoA-sintetasa, Pyr-carboxilasa - Qu sustrato puede oxidar una enzima mediante FAD vs NAD+ ? Qu es la difenencia metabolicamente entre NAD+ y NADP+ ? Respiracin - Explique los mecanismos de transporte de NADH del citosol a la matriz mitocondrial - Cules son las condiciones ( sine qua non) para la cadena respiratoria y fosforilacin oxidativa se lleve a cabo? Qu dice la hiptesis qumico-osmtico? - De qu componentes se constituye el "potencial de la membrana" = PMF (a qu membrana se refiere)? - Dibuje la cad. resp. con sus 4 complejos y el flujo de electrones y de una explicacin breve. Dnde es la cad. resp. ubicada? - Cul es la funcin de la cad. resp.? Cmo el TCA, la cad. resp. y la fosforil. oxid. son acoplados? - Explique la funcin y el funcionamiento de la fosforil. oxid. (ATP-sintasa). Cunta energa es necesaria la ATP-sintasa en regenerar 1 ATP? - Cuntos H+ se bombea con la reoxidacin de un NADH vs. FADH2 ? Cuntos ATP se puede regenerar con eso? - Calcule, cuantos ATP se puede regenerar por la oxidacin completa de Glc vs. su fermentacin. Mencione las enzimas involucradas. - Cules sustancias inhiben el complejo I, III y IV, respectivamente? Qu sera el efecto (consumo de O2 )? - Cules sustancias inhiben los procesos del transporte importantes para la respiracin/fosforilacin oxidativa? Cules sustancias hacen transportes inoportunos? - Qu significa "ROS"? A cules sustancias se refierren con "ROS"? De dnde provienen los ROS? Qu tipo de dao hacen los "ROS"? - Qu intoxicaciones y enfermedades son relacionados con pertubaciones de la cadena respiratoria/fosforilacin oxidativa? Gluconeognesis - Para qu la gluconeognesis es importante? Cules rganos pueden realizarla? - Cules son las reacciones claves para la gluconeognesis? Explique su mecanismo. En cul orgnulo se encuentra? - Cmo la clula puede distinguir, que un Pyr proviene de un Lac o de una Ala para realizar gluconeognesis? - Cunta energa cuesta la gluconeognesis? De dnde proviene esa energa? - Cmo la clula regula entre gluclisis y gluconeognesis? - Explique el ciclo de Cori. Para qu lo sirve? Glucgeno - Qu es glucgeno? Por qu la clula almacena glucgeno y no Glc? - Cules rganos pueden sintetizar glucgeno? Qu es el objetivo para cada rgano? - Explique los mecanismos de las reacciones de la sntesis del glucgeno. Qu es "Glc activada"? - Cmo el msculo vs. el hgado degrada glucgeno? Explique los mecanismos de reacciones
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- Cunta energa gana el msculo por degradar glucgeno? Cunta energa cuesta la sntesis de glucgeno? - Cmo la clula regula la degradacin de glucgeno? - Explique la causa de una enfermedad relacionado al metabolismo del glucgeno Ruta de Pentosa-fosfato - Qu es el objetivo de la ruta de PenPi? - Dibuje la(s) reaccion(es) de oxidacin de la ruta de PenPi - Explique las diferentes fases de la ruta de PenPi - Cmo es la ruta de PenPi regulada? - Explique la causa de una enfermedad relacionado a la ruta de PenPi Sacridos - Dibuje los disacridos maltosa, sacarosa, lactos, celubiosa, trehalosa. Dnde se puede encontrarlas? - Cmo es la antotacin de poli/di-sacridos? Qu significa "azcar no reductor"? - Explique la degradacin de lactosa, Gal (galactosa), sacarosa, Fru - Explique la intolerancia a fructosa y la galactosemia

Metabolismo de Lpidos
Lpidos - Nombre los diferentes tipos/clases de lpidos y dibuje sus estructuras - Cules caractersticas qumicas tienen los cidos grasos libres (FFA)? - Cules funciones tienen los triacilglicridos (TAG)? - Para qu se requiere fosfolpidos? - Qu son espingolpidos? De que partes se compone? Para qu son necesarios? - Qu son isoprenoides? De 5 ejemplos. - De qu se compone la membrana celular? - A qu se refiere con "las membranas son asimtricas"? - Qu significa "Fluid mosaic modell"? - Qu son "rafts"? Para qu son necesarios? - Qu sistemas de transporte a travs de las membranas existen (general)? Degradacin de Lpidos - Para que sirven lpidos (TAG) Por qu se puede regenerar ms ATP por la oxidacin de c. grasos que de carbohidratos? - Explique la reaccin de la TAG-lipasa y su regulacin. Qu ocurre con el glicerol? - Explique la reaccin de la acilCoA-sintetasa (estructuras) - Explique el transporte de acilCoA a la matriz mitocondrial. Cmo funciona la regulacin? Qu enfermedades son realcionadas a este transporte? - Explique detalladamente las reacciones de la #-oxidacin (estructuras). Compara la #-oxidacin con las ltimas reacciones del TCA. - Compara el rendimiento de la oxidacin completa de 3 Glc vs. 1 estearato. Mencione las enzimas involucradas. - Compara la #-oxidacin mitocondrial con la de los peroxisomas. Para qu existe la #-oxidacin peroxisomal? Compara el rendimiento entre ambas rutas. - Explique la degradacin de c. grasos impares (estructuras). De dnde provienen c. grasos impares?
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- Explique la degradacin de c. grasos insaturados (estructuras). - Explique la $-oxidacin - Cules son las consecuencias de la enfermedad Refsum? Sntesis de Lpidos - Explique el transporte del AcCoA al citosol (estructuras) - Explique la reaccin de la citrato-liasa, de la enzima mlica y de la AcCoA-carboxilasa (estructuras) Qu funcin tienen esas enzimas? - Explique las reacciones de la c. graso sintasa - Elabore un balance energtico para la sntesis vs. la degradacin de c. grasos (AcCoA -> estearato -> AcCoA). Compare las reacciones de la sntesis y de la degradacin de c. grasos. - Explique la regulacin celular para la sntesis y degradacin de c. grasos - De dnde proviene el NADPH necesario para la sntesis de c. grasos? Mencione las enzimas involucradas - Explique la elongacin de c. grasos (> C16) y la sntesis de c. grasos insaturados - De dnde proviene el glicerol para la sntesis de TAG? - De dnde provienen los c. grasos para la sntesis de TAG y fosfolpidos? Cuerpos cetnicos - Qu es la funcin de cuerpos cetnicos? Cul(es) tejido(s) puede(n) sintetizarlos y cules degradar? - Cules sustancias se consideran como "cuerpos cetnicos"? (estructuras) - Explique las reacciones de la cetognesis. - Explique las reacciones de la degradacin de cuerpos cetnicos. Por qu el hgado no puede degradar cuerpos cetnicos? - A partir de cules metabolitos se sintetiza cuerpos cetnicos? Explique la necesidad para el hgado de sintetizar cuerpos cetnicos. - Qu efecto tiene diabetes mellitus sobre el metabolismo de cuerpos cetnicos? Qu seran las consecuencias? Fosfolpidos - Qu es la funcin de fosfolpidos? Dibuje PC, PE, PG, PS. Qu cargas netas tienen estos fosfolpidos? - Cules son los pasos principales para la sntesis de fosfolpidos ( de novo )? Qu es fosfatidato? - Cules reacciones existen, para no sintetizar los fosfolpidos siempre de novo ? - Cmo se puede degradar fosfolpidos? Esfingolpidos y Plasmalgeno - Para qu se necesita esfingolpidos? - Explique la sntesis de esfingolpidos - Qu es esfingomielina y qu son glucoesfingolpidos (cerebrsidos, gangliosidos)? - Explique la sntesis de esfingomielina - Explique las funciones de esfingosina-1-Pi - Explique la sntesis de plasmalgeno de EtN - En qu se diferencian los plasmalgenos de los otros lpidos? - Para que se necesita plasmalgenos? - Dibuje un plasmalgeno Colesterol - Para qu el ser humano necesita colesterol? Explique se efectos sobre la membrana celular - Explique los pasos principales de la sntesis de colesterol - Dnde ocurre la sntesis de colesterol: rgano y orgnulo(s)?
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- Explique los diferentes niveles de regulacin de la sntesis de colesterol - Mencione otros isoprenoides a parte de los esteroles - y sus funciones - Cmo se almacena colesterol? Qu enzima(s) son necesarias? - Cmo se elimina colesterol? Explique el ciclo enteroheptico - Qu son c. biliares primarios, secundarios y qu son sales biliares? - Cmo se forma cristales de colesterol/clculos biliares? Lipoprotenas - Explique la readsorcin de lpidos y su transporte hasta al hgado - Explique la funcin de quilomicrones (Chym), VLDL, IDL, LDL, HDL - Explique la funcin de la lipoprotena-lipasa (LPL) - Explique, cmo una clula no hepatica puede recibir colesterol - Qu enfermedades pueden ser relacionados con el transporte de colesterol. Explique sus causas bioqumicamente - Explique el retransporte del colesterol al hgado. Qu hace/puede hacer el hgado con este colesterol? Eicosanoides - Expique la sntesis de araquidonato. Por qu es un cido graso semi-esencial? - Explique la reaccin de la COX (ciclo-oxigenasa). Qu es la diferencia entre COX I y COX II? - Qu son prostaglandinas, tromboxanos y leucotrienos? - Explique el modo de accin de Aspirina y sus efectosd (deseables y indesables)

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