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rvore da vida: os trs domnios

Diversidade
Todos os organismos existentes hoje vem de um mesmo ancestral (grupo de clulas primordiais) Por que existem tantos organismos diferentes? Modificaes ao longo do tempo resultaram na diversidade que conhecemos hoje

Mutaes (DNA) + Regulao Gnica

Mutao: Origem da variabilidade


mudana na seqncia dos nucleotdeos do material gentico (erros na replicao do DNA) de um organismo
Griffiths et al. Modern Genetic Analysis (1999)

pode ser causada por erros de cpia do material durante a diviso celular, por exposio a radiao ultravioleta ou ionizante, mutagnicos qumicos, ou vrus.

Complexidade e idade evolutiva dos organismos


No h organismos superiores ou inferiores - Apresentam diferentes graus de complexidade - Podem ser mais antigos ou mais recentes Todos podem estar bem adaptados ao seu ambiente

As bactrias, por exemplo, apresentam grande diversidade e capacidade de adaptao a diferentes ambientes

Relaes evolutivas
Relaes de ancestralidade entre os organismos

Por que estudar estas relaes?

Classificao
Classificao: processo de ordenao dos organismos em grupos taxonmicos (ou taxa) Atualmente classifica-se os organismos com base nas suas relaes de parentesco
Classificao em 5 reinos NO reflete as relaes evolutivas entre os organismos

Identificao de espcies
* Identificao: alocao de organismos desconhecidos em taxa j descritos Microrganismos encontrados em amostras ambientais ou associadas a plantas e animais (mtodos independentes de cultivo) Atualmente h mais de 50 filos de bactrias identificados, a maioria composto por organismos no cultivados

Classificao: Aplicaes em Medicina


Identificar patgenos Determinar padres de disseminao da doena Identificar espcies que atuam com vetores e reservatrios naturais

Classificao: Aplicaes em Conservao de espcies


Identificar novas espcies Entender os padres de distribuio de espcies

Apoiar e orientar os programas de manejo e conservao da diversidade gentica

Morfologia

Dados moleculares

Incio na dcada de 1970 Comparao de seqncias de nucleotdeos do DNA ou seqncias de aminocidos de protenas Grande quantidade de informaes (cada aminocido de uma protena ou nucleotdeo de uma seqncia de DNA uma evidncia filogentica) Possibilita a comparao entre organismos distantes evolutivamente Possibilita o estudo de microorganismos que no podem ser cultivados

Comparao entre seqncias nucleotdicas

Comparao entre seqncias nucleotdicas

11 espcies de primatas (camundongo como grupo externo)

rvore filogentica
Representao grfica das relaes de ancestralidade entre os organismos (com base na comparao das seqncias nucleotdicas)

Como comparar todos os organismos existentes? Quais dados so usados nas anlises? Qual regio do DNA ou qual protena?

Ribossomos e RNA ribossomal


Ribossomos so compostos por RNA e protenas RNA ribossomal (rRNA) Presente em todos os organismos Taxa de mudana (mutaes) do gene suficientemente lenta para permitir a comparao entre organismos de grupos distantes

Griffiths et al. Introduction to the Genetic Analysis (2000)

RNA ribossomal e Bioinformtica


Sequncias de rRNA dos diversos organismos podem ser comparadas

Grande quantidade de informaes

Importncia de mtodos computacionais (Bioinformtica) para armazenar e gerenciar a (bio)informao (ex. software BLAST; Basic Local Alignment Search Tool)

Os trs domnios (Woese et al. 1990)

Ancestral comum a todos os organismos

Os trs domnios (Woese et al. 1990)


Eukarya: clulas eucariticas (ncleo definido e protegido pelo envoltrio nuclear); membrana celular lipdica (predominantemente disteres de cido graxo e glicerol); ribossomos contendo um tipo de RNAr eucarioto Bacteria: clulas procariticas; membrana celular lipdica (predominantemente disteres de diacilglicerol); ribossomos contendo um tipo de RNAr (eu)bacteriano Archaea: clulas procariticas; membrana celular lipdica (predominantemente disteres de glicerol isoprenide ou tetrateres de glicerol; ribossomos contendo um tipo de RNAr arqueano

3 Domnios: Quantos reinos?

6?

3 Domnios!

3 Domnios

Os trs domnios
Nenhum domnio se desenvolveu a partir do outro: os 3 domnios evoluram por vias diferentes a partir de um ancestral comum Archaea e Eucarya tm um ancestral comum * Apesar do nome, Archaea no o grupo mais antigo

3 Domnios

Eukarya
Eucariotos Organismos com clulas nucleadas (ncleo envolvido por membrana)

Eukarya

Eukarya

http://www.tolweb.org/Eukaryotes/3

Eukarya

Baldauf. 2003. Science 300:1703-1706.

Eukarya

Sanderson. 2008. Science 321:121-123.

Bacteria
Procariotos Parede celular com peptideoglicano Genoma geralmente organizado em um nico cromossomo circular Grande diversidade de habitats

Bacteria

Bacteria

http://www.tolweb.org/Eubacteria/2

Bacteria

http://www.bacterialphylogeny.info /bacteria.html

Archaea
Geralmente encontrados em ambientes extremos, p.ex. altas temperaturas, baixo pH, alta salinidade

Archaea em fenda vulcnica na ilha de Kyushu, Japo (o tapete laranja so as archaeas. As bordas amarelas so resduos de enxofre)

Conhecimento das Archaea


Em 1970 vrios organismos procariticos foram isolados a partir de uma srie de ambientes considerados inspitos, quase que

incompatveis com a presena de seres vivos.

Temperaturas elevadas (prximas a 100C) Extrema acidez ou alcalinidade (pH 2 e 10) Altas salinidades (at 32%, 5,5 M NaCl) *** Salinidade mdia de oceanos cerca de 3,5%. Muitas vezes, ausncia completa de oxignio

Organismos primitivos????

Archaea
Geralmente encontrados em ambientes extremos, p.ex. altas concentraes salinas

ARCHAEA: Habitats
Ambientes
aquticos frios (podem corresponder a 34% da biomassa procaritica das guas costeiras superficiais da Antrtida)

Sistema digestrio do homem e outros animais Pntanos Aterros sanitrios Tecidos vegetais Metanognicas endossimbiontes em protozorios

OBS: Podem ser encontradas nos mais diversos ecossistemas.

Archaea
Morfologicamente e metabolicamente similares a bactrias Seqncia e organizao da informao gentica semelhante a eucariotos - DNA associado a histonas - Genes envolvidos nos processos de transcrio e traduo so similares a eucariotos
http://www.tolweb.org/Archaea/4

Archaea

Archaea

Gribaldo & BrochierArmanet. 2006. Phil. Trans. R. Soc. B 361:10071022

Crenarchaeota:
- hipertermfilos, como Thermoproteus, Pyrolobus e Pyrodictium; - Maioria: quimioautotrficos; - Neste filo h tambm organismos isolados (mas ainda no cultivados em laboratrio) de ambientes frios, tais como guas ocenicas.

Yellowstone National Park courtesy of Dr. Ken Stedman

Lagoa quente, rica em enxofre, que convertido a cido sulfrico por espcies de archaea

Sulfolobus, exemplo de uma archaea do filo Crenarchaeota, habitante da lagoa ilustrada ao lado

(Adaptado de Madigan et al., 2003 - Brock Biology of Microorganisms)

Euryarchaeota
1) Metanognicas ANAERBIAS. Ex: Methanococcus, Methanobacterium e Methanosarcina 2) Haloflicas - AERBIAS. Ex: Halobacterium e Halococcus. Coramse como Gram negativas, no apresentam esporos e, em sua maioria, so imveis. Geralmente possuem grandes plasmdeos (25 a 30% do DNA da clula)

Lago hipersalino no Egito, rico em carbonato de sdio. O pH destas guas encontra-se na faixa de 10, sendo habitado por archaea halfilas extremas, tais como Halobacterium salinarum

Thermoplasma, uma archaea desprovida de parede celular

Pilha de refugo da minerao de carvo, que muitas vezes sofre auto-combusto. Hbitat da archaea Thermoplasma

ARCHAEA E BIOTECNOLOGIA
Produo de energia (biogs e lcool) Produo de cidos orgnicos, antibiticos, aa Tratamento de efluentes PCR Enzimas extremfilas, biocatlise industrial Polmeros biodegradveis (PHB) Minerao (cobre, ouro, urnio) Plantas transgnicas (genes de halfilas) ...

Complexidade o objetivo da evoluo?

A maior parte da diversidade existente no planeta representada por microorganismos

Gould. A imprevisvel e fortuita evoluo da vida. Scientific American Brasil.

Projeto Tree of life


Objetivo: reunir informaes sobre todos os organismos existentes e as relaes evolutivas entre eles Participao de pesquisadores de diversos pases Informaes sobre cada grupo de organismos esto dispostas em websites organizados hierarquicamente, formando uma rvore

http://www.tolweb.org/tree/

Projeto Tree of life

http://www.tolweb.org/tree/

Projeto Tree of life: buscando o gnero Homo

Search (busca)

Pesquisando as relaes filogenticas de Homo: Famlia Hominidae

Projeto Tree of life: as relaes filogenticas de Homo


Famlia

Projeto Tree of life: as relaes filogenticas de Homo


Classe

Infraclasse

Domnio: Eukarya Reino: Animalia Subreino: Metazoa Filo: Chordata Classe: Mammalia Ordem: Primates

rvore da Vida x Rede da Vida


Foram identificados genes nucleares eucariotos semelhantes a genes de bactrias Archaea tambm apresentam genes bacterianos

Material gentico pode ser transmitido no s verticalmente (para a gerao seguinte), mas tambm horizontalmente (entre organismos de espcies diferentes!!!)
Transferncia horizontal (ou lateral)

Rede da Vida

Sugesto de Leitura: Doolittle, F. Scientific American, fev. 2000

3 perguntas rpidas
1. Qual so os domnios da rvore da vida?

Archaea Bacteria Eukarya

3 perguntas rpidas
2. O que diferencia os domnios?
Eukarya: clulas eucariticas; membrana celular lipdica caracterstica e ribossomos com RNAr eucarioto Bacteria: clulas procariticas; membrana celular lipdica caracterstica e ribossomos com RNAr bacteriano Archaea: clulas procariticas; membrana celular lipdica caracterstica e ribossomos com RNAr OU arqueano
O tipo de clula, o tipo de membrana celular e o tipo de RNA ribossmico

3 perguntas rpidas
3. Com base nos trabalhos mais recentes, qual o domnio mais prximo filogeneticamente do domnio onde o gnero Homo est inserido?

Archaea

Onde estudar ...

Purves et al. Vida. Captulos 26 (tem na biblioteca) Doolittle. Uprooting the Tree of Life. Scientic American, fevereiro de 2000 (est no website) Woese et al. 1990. Towards a natural system of organisms: Proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya. Proc. Nati. Acad. Sci. USA 87: 4576-4579. (est no website)

Contato: Profa. Simone R. Freitas


Email: simone.freitas@ufabc.edu.br Website:
http://origemdavida-ufabc.blogspot.com/