Paraf Asisten

LAPORAN PRAKTIKUM KIMIA ORGANIK Judul Tujuan Percobaan : Penggunaan Software Kimia Dalam Penggambaran Struktur Molekul : Mempelajari dan mengaplikasikan pengetahuan dan keterampilan

menggambar struktur molekul senyawa kimia menggunakan software ChemSketch. Pendahuluan Era modern ini merupakan era dimana terjadinya kemajuan teknologi didunia. Kemajuan teknologi tersebut terjadi diberbagai bidang yaitu elektronik, kedokteran, pertanian, sains dan lain-lain. Kemajuan ini juga berpengaruh terhadap ilmu kimia baik peralatannya yang canggih maupun software yang digunakan. Software kimia diciptakan untuk mempermudah dalam mempelajari ilmu kimia. ChemSketch adalah salah satu contoh software kimia yang sangat bermanfaat bagi siswa ataupun mahasiswa yang menekuni ilmu kimia karena pada dasarnya pembelajaran secara langsung atau praktek lebih mudah dimengerti dan dipahami daripada penjelasan dengan lisan. Praktek-praktek di laboratorium kimia saat ini akan menghadapi kendala ketersediaan bahan kimia yang relatif mahal yaitu tidak semua laboratorium kimia di Indonesia dapat menyediakan fasilitas laboratorium kimia yang memadai untuk keperluan tersebut. Sekolah tidak mampu menyelenggarakan kegiatan praktek dilaboratorium kimia secara representatif. Sekolah-sekolah sebagian besar memiliki fasilitas untuk praktek komputer bagi para siswa. Fasilitas komputer yang ada tersebut dapat dimanfaatkan sebagai alternatif untuk keperluan praktek pembelajaran ilmu kimia. Contohnya adalah pembahasan tentang ukuran atom dan perioditasnya, bentuk geometri dari struktur molekul, stereokimia dan lain-lain. Struktur molekul tersebut dapat divisualisasikan dengan software ChemSketch. Pengenalan dan penggunaan software ini diperlukan untuk meningkatkan pemahaman terhadap struktur molekul (Tahir, 2003). Model molekul pada mulanya diajarkan dengan menggunakan model tiga dimensional yaitu dengan menggunakan alat peraga yang berbentuk bola-bola dari bahan plastik atau kayu. Perkembangan teknologi komputer pada saat ini baik dari segi perangkat keras maupun perangkat lunak memungkinkan untuk pemodelan molekul dengan menggunakan komputer. Perangkat lunak yang tersedia di pasaran saat ini dapat digunakan untuk keperluaan

visualisasi model molekul (Tahir, 2003). Chemsketch adalah software yang digunakan untuk menggambarkan dan memodelkan struktur molekul kimia. Software chemsketch dapat menggambarkan struktur kimia dalam bentuk 2D dan 3D. Software ini sangat mudah digunakan hanya dengan mengklik dan mendrag tool-tool yang tersedia untuk menggambar struktur yang diinginkan. Program ini juga menyediakan struktur asam amino, alkaloid, karbohidrat, asam nukleat, DNA/RNA, peralatan laboratorium yang berupa gelas, orbital, steroid, terpen dan lain-lain yang tersimpan dalam menu templates. Software ini juga menyediakan penggambaran kurva dan grafik. Chemsketch dikeluarkan oleh ACD/Labs.com yang dapat diunduh secara gratis (Anonim, 2008). Cara menjalankan software ChemSketch serupa dengan menjalankan program-program lain pada komputer, akan tetapi terlebih dahulu harus menginstall sofware ChemSketch. Cara memulai program ChemSketch yang telah terinstall yaitu dari menu windows klik start, lalu klik program, pilih ACDLABS 11.0 dan kemudian pilih ChemSketch maka jendela program ChemSketch akan terbuka (Martoprawiro, 2008). Menggambar bentuk molekul dalam bentuk 3D (misalkan molekul CH4) dapat dilakukan rotasi untuk memberikan gambaran yang utuh dapat dilakukan dengan cara berikut: 1. Buka aplikasi Chemsketch yang telah terinstall 3. Klik Atom C pada Mode Structure yang ada di tool kiri dan klik sekali pada area kerja hingga menghasilkan rumus molekul CH4. Add explicite hydrogen dari menu Tools untuk membuat bentangan rumus struktur, seleksi rumus struktur, klik menu Tools dan pilih Strucutre Properties maka akan muncul menu pop up dan pada tab Common beri centang All Show Carbons 4. Optimisasi struktur 3D dengan cara klik menu Tools kemudian klik 3D structure optimization, jika ada pilihan (klik yes untuk menghilangkan atom H saat optimisasi 3Dnya), setelah itu buka 3D Viewer Acd Lab dari Start menu 5. Kembali ke Chemsketch 2D untuk mengkopi 2D ke 3D 6. Merotasi untuk dapat menunjukkan berbagai properties bentuk molekul seperti panjang ikatan dan sudut yang dibentuk oleh 3 buah atom dengan ChemSketch ini (Martoprawiro, 2008).

Prinsip Kerja Prinsip kerja program chemsketch yaitu membuat dan menggambar struktur molekul kimia dalam bentuk 2D maupun 3D dengan menyediakan berbagai macam warna yang dapat digunakan untuk memudahkan memahami struktur molekul yang akan digambar. Alat Laptop atau PC dan aplikasi ACD ChemSketch Bahan Prosedur Kerja Hasil A. Target praktikum chemsketch mengambar struktur molekul 1. Menggambar struktur sederhana
H3C 3 CH3 CH3
F
F F F CH3

a.

(CH 2)3Ph

b.

menjadi
CH2 CH3 N N

H3C

N N CH3

H2C

c.

2. Menggambar struktur yang lebih kompleks

HO O HO O O OH O OH O OH O OH

3. Memberi muatan
H3C NH2
+

CH3

4. Stereodescriptor
Z CH3 S CH3 Cl

5. Membuat ikatan terkoordinasi

O O Li O CH3 CH3

6. Ikatan dan muatan terdelokalisasi

Br H3C
+

CH3 CH3

CH3

7. Markush bond
CH3

Br

8. Menggambar peptide siklik: Try-Ala-Trp

HO O NH O H3C N H O N H NH

B. Gambar Struktur Senyawa Kimia No. 1. Nama Senyawa Eugenol Gambar Struktur Senyawa
HO H3C

O
CH3 N N H3C O
O

CH2
N N CH3 O

2.

Kafein

3.

Piperin
O O

4.

Trimiristin
O

(CH 2)12CH 3 O O (CH 2)12CH 3 O

O O (CH 2)12CH 3

5.

Atsiri

OH OH HO O

OH O

6.

Alkana (metana) Alkena (etilena) Alkuna (butuna)

H3C

H H C H H

7.

H C H C

H H

8.

CH3

C. Gambar peralatan percobaan menggunakan feature Open Template Window pada ChemSketch No. 1. Nama Alat Praktikum 1 set alat destilasi Gambar Alat Praktikum

2.

Labu ukur

3.

Pemanas listrik
5 4 3 2 1 11 6 7 8 9 3 2 1 10 5 4 6 7 8 9

4.

Beaker glass

5.

Erlenmeyer

6.

Funnel atau corong

7.

Mortar dan alu

8.

Termometer

9.

Corong buncher

10.

Lagu alas bulat

Referensi Anonim. 2008. Drawing chemical structures and graphical images. ACD/Lab Chemistry Development Inc: The United states. Martoprawiro, Muhamad. 2008. Chemsketch :Membuat Molekul di Windows. (www.elearning.unej.ac.id). Diakses pada 19 Februari 2014. Tahir, Iqmal. 2003. Pemanfaatan Software Kimia Komputasi Untuk Pembelajaran Ilmu Kimia Tingkat Menengah Melalui Visualisasi Model Molekul. Universitas Gadjah Mada: Yogyakarta. Nama Praktikan Dewi Adriana Putri 121810301053