U2. Sintesis de Proteinas

Divisin de Ciencias de la Salud, Biolgicas y Ambientales | Ingeniera en Biotecnologa
Biologa molecular I
Unidad 2. Sntesis de protenas

Ingeniera en
Biotecnologa

Octavo cuatrimestre

Asignatura:
Biologa molecular I

Clave:
190930831

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico

Divisin de Ciencias de la Salud, Biolgicas y Ambientales | Ingeniera en Biotecnologa 2

Biologa molecular I
ndice
Unidad II. Sntesis de protenas ......................................................................................... 3
Presentacin de la unidad ................................................................................................. 3
Propsitos .......................................................................................................................... 3
Competencia especfica ..................................................................................................... 4
2.1 Importancia de la sntesis de protenas ........................................................................ 4
2.1.1 Procesos involucrados en la sntesis de protenas ................................................ 5
2.1.2 Importancia celular ................................................................................................ 6
2.2 Transcripcin ............................................................................................................... 7
2.2.1 Tipos de ARN ........................................................................................................ 8
2.2.2 Pasos de la transcripcin .................................................................................... 13
2.2.3 Procesos post-transcripcionales en eucariotas .................................................... 24
2.3 Traduccin ................................................................................................................. 33
2.3.1 Pasos de la traduccin ........................................................................................ 34
Actividad 1: Qu protena corresponde a este gen? ...................................................... 38
Actividad 2. Procesos involucrados en la sntesis proteica de procariotas y eucariotas ... 46
2.3.2 Procesos post-traduccionales .............................................................................. 47
Actividad 3: Importancia de la transcripcin y traduccin en la Ingeniera Gentica ..... 53
2.4 Regulacin gentica .................................................................................................. 54
2.4.1 Regulacin en procariotas: los operones ............................................................. 56
2.4.2 Regulacin en eucariotas .................................................................................... 59
Autoevaluacin ................................................................................................................ 62
Evidencia de aprendizaje. Cul es el marco de lectura abierto del gen de inters? ....... 63
Autorreflexiones ............................................................................................................... 65
Cierre de la unidad .......................................................................................................... 65
Para saber ms ............................................................................................................... 66
Fuentes de consulta ........................................................................................................ 68


Biologa molecular I
Unidad II. Sntesis de protenas

En la Unidad I aprendiste cmo ocurre el proceso de divisin celular, para lo cual es
necesario replicar el ADN, y cmo influye en la evolucin de los organismos. En esta
unidad vas a tratar el tema de la sntesis de protenas tanto en clulas procariotas como
en clulas eucariotas as como su regulacin. Finalmente, realizaras las actividades que
tenemos programadas para ti, te interesa?

Presentacin de la unidad

En esta segunda unidad vas a analizar un proceso clave para la vida celular: la sntesis
de protenas. Para ello, a partir del ADN se produce la transcripcin para dar lugar al
ARN, y a partir de esta molcula, ocurre la traduccin que dar la protena.

Conocers adems, las diferencias que existen entre los procesos que ocurren en
procariotas y eucariotas y cmo se regula la cantidad de protenas presentes en la clula,
porque recuerda: tener mucho es malo pero poco tambin, siempre tiene que existir la
cantidad exacta de protena para vivir en un ambiente determinado, cmo se logra? Con
una correcta regulacin de la protenas, como veras en esta unidad.

Finalmente, los Ingenieros en Biotecnologa utilizan las clulas para obtener un beneficio
y las protenas son muy importantes industrialmente, por ello, conocer la regulacin te
permitir manipular las condiciones ambientales (temperatura, oxigenacin, composicin
de medio de cultivo, entre otras.) para que la clula produzca mayor cantidad de protena.

Otra opcin es la ingeniera gentica, en la que se utilizan los conocimientos de la
gentica molecular para producir enzimas de inters industrial por lo que debes conocer
los procesos involucrados para tal fin.

Propsitos

El propsito de esta unidad es que comprendas cmo ocurre el proceso de sntesis de
protenas (transcripcin y traduccin), las diferencias de estos procesos entre procariotas
y eucariotas y cmo se regula la cantidad de protena presente en la clula en cada
momento. Por ello, se propone que alcances los siguientes logros:

1. Deduzcas la secuencia protica a partir de un gen.
2. Compares el proceso de sntesis protica entre procariotas y eucariotas.
3. Analices la importancia de la transcripcin y traduccin en la ingeniera gentica.
4. Utilices software libre para deducir la secuencia protica de un gen.


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Competencia especfica

Utilizar el cdigo gentico para deducir la secuencia de una protena a partir de su
secuencia gentica, a travs de los procesos de transcripcin y traduccin.

2.1 Importancia de la sntesis de protenas

Las protenas son las molculas que le dan vida a una clula, lo recuerdas? Cuando
fallecemos, nuestro cadver queda, eso quiere decir que las clulas siguen ah y en ellas
estarn presentes los carbohidratos, los lpidos, los cidos nucleicos y las protenas. Lo
que ocurre es que, una parte de estas ltimas molculas, las que realizan los procesos
bioqumicos (es decir, las enzimas) dejan de actuar. De esta manera, no ocurre el
metabolismo y por lo tanto la clula no puede hacer su funcin. Adems, la presencia de
determinadas enzimas har que una clula se pueda desarrollar en determinados
ambientes, por ejemplo, una clula que produzca amilasas podr alimentarse del almidn
presente en las plantas.

En la materia de Bioqumica analizaste detalladamente el papel de las protenas en la vida
celular. Aprendiste que estaban formadas por aminocidos y que la diferencia entre las
diferentes protenas es la secuencia de dichos monmeros. Para entender mejor este
proceso revisa la siguiente analoga: Cuntas letras forman el abecedario? Cuntas
palabras se pueden escribir con esas 27 letras? La diferencia entre una palabra y otra es
el acomodo de sus letras y la extensin de las mismas. Algo parecido ocurre en las
protenas, y el conjunto de todas ellas definir qu puede hacer una clula, igual que el
conjunto de todas las palabras pueden escribir un libro. Tan importante son las enzimas
(como se indic anteriormente) como las protenas estructurales, las encargadas del
transporte celular, de la defensa del organismo, etctera. Para obtener la secuencia
correcta de estas protenas es necesario realizar correctamente su sntesis, y como veras
en esta unidad, sta se lleva a cabo utilizando la informacin que contiene la secuencia
de ADN a travs de dos procesos: la transcripcin y la traduccin.

Y, en este momento te preguntars, para qu es importante este proceso para un
Ingeniero en Biotecnologa? Y ms especficamente, para un Bilogo Molecular? Una
clave de la Ingeniera Gentica es la posibilidad que existe de poder obtener protenas de
organismos que anteriormente no podan hacerlo. Por ejemplo, existen los organismos
transgnicos como el maz capaz de resistir a herbicidas o tenemos el caso de la insulina
humana, que actualmente es producida por una bacteria (Escherichia coli). En ambos
casos, se introduce la secuencia del ADN que tiene la informacin para la sntesis de la
protena (es decir, el gen) y por ello, es importante conocer cmo ocurren los procesos
para su sntesis y as realizar el transgnico de la manera correcta.


Biologa molecular I
Espero que con estos ejemplos, te haya quedado claro cul es la importancia de las
protenas por lo que pasaremos a revisar cmo ocurre la sntesis de las mismas, es decir,
cmo hace la clula para escribirlas y leerlas.

2.1.1 Procesos involucrados en la sntesis de protenas

Para llevar a cabo la sntesis de las protenas estn involucrados dos procesos que se
revisarn durante esta unidad.

El primero es la transcripcin, donde la informacin contenida en el ADN, en las
secuencias denominadas genes (como vers ms adelante) es leda por una enzima
especfica para la sntesis de ARN o RNA (por sus siglas en ingls). La segunda es la
traduccin, donde la informacin contenida en el ARN es leda y se sintetiza una
cadena de aminocidos para formar una protena (Curtis y col., 2008). Cada uno de estos
procesos se vern detalladamente ms adelante.

Con esto, se llega, al Dogma de Biologa Molecular, como se observa en la figura, que
fue establecido por Francis Crick en 1957, durante una conferencia en la Symp. Soc. Exp.
Biol. XII y publicado en la revista Nature en 1970, este Dogma establece que en las
clulas no es posible hacer los procesos de manera inversa, es decir, no se puede
sintetizar ARN a partir de una protena, igual que no se puede sinterizar ADN a partir de
una molcula de ARN (Curtis y col., 2008).

Dogma Central de la Biologa Molecular. Propuesta original de Crick. Fuente: Curtis y
col, 2008.

Actualmente, se han realizado algunas modificaciones a este Dogma ya que existen virus
(retrovirus) capaces de sintetizar ADN a partir de una molcula de ARN utilizando una
enzima especfica denominada transcriptasa reversa que como vers en la materia de
Biologa Molecular 2 tiene un amplia aplicacin en la Ingeniera Gentica, especficamente
en el estudio de los genes que se expresan en una clula, en una condicin determinada.
Adems otro tipo de virus, tambin es capaz de replicar molculas de ARN, aunque estas
acciones no contradicen el Dogma establecido por Crick ya que recuerda que los virus no
se consideran clulas porque carecen de membrana plasmtica.


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Dogma Central de la Biologa Molecular. Propuesta actual Fuente: Curtis y Col., 2008.

Por otra parte, en referencia a las protenas, en 1982, Stanley B. Prusiner, acu el
trmino de prin a unas protenas que tienen alterada su estructura secundaria capaces
de producir enfermedades como las vacas locas (cuyo nombre cientfico es
encefalopata espongiforme bovina), que afecta al sistema nervioso central de manera
crnica e irreversible. Esta ha sido otra modificacin al Dogma Central de la Biologa
Molecular original, ya que una caracterstica importante de estas molculas es que son
capaces de auto-duplicarse.

Actualmente, se sigue manteniendo la unilateralidad del proceso de traduccin ya que no
es posible determinar la secuencia del ARN a partir de una protena, como notars
posteriormente cuando se hable del Cdigo Gentico. El ARN tiene varios cdigos
diferentes para aadir un aminocido, es decir, cada 3 ribonucletidos (triplete o codn)
se tiene la informacin para la adicin de un aminocido especfico pero el mismo
aminocido puede ser aadido con tripletes diferentes. Por poner un ejemplo, los tripletes
UUU y UUC tienen la informacin para la adicin de una fenilalanina, de manera que si se
sabe la secuencia de ARN se podr saber la secuencia de la protena que se est
sintetizando, pero si tienes la secuencia de la protena y contiene una fenilalanina, cmo
saber cul de los dos tripletes se utiliz?

2.1.2 Importancia celular

Cuando comenz el tema se mencion la importancia de la sntesis de protenas y
espero que te haya quedado claro, ya que, especficamente, las enzimas son las que dan
vida a las clulas.

Adems, no todas las clulas pueden hacer lo mismo, has odo hablar de que los
humanos no pueden metabolizar algunos carbohidratos como la celulosa presente en la
pared celular de todos los vegetales? Para ello, se tiene el apoyo de las bacterias
simbiontes que habitan en el intestino que s pueden hacer esta funcin. Cul es la
diferencia? La respuesta es muy simple, los humanos, en nuestro genoma, no tenemos la


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informacin para la sntesis de la enzimas que degradan estos polmeros, es decir, las
celulasas y las bacterias s pueden hacerlo. As se pueden mencionar muchos ejemplos, y
es por ello, que una de las tareas como ingenieros en Biotecnologa, es buscar
organismos con la capacidad de realizar las funciones que nos interesan ya que no existe
una clula todloga.

Por otra parte, aunque se tenga la informacin gentica para la sntesis de una protena
determinada no siempre se est produciendo. Para que te quede claro, revisa los
siguientes dos ejemplos, el primero relacionado con el ser humano y el segundo con un
microorganismo. Te habrs dado cuenta de que no todas las clulas de tu cuerpo son
iguales, una clula de ojo no es igual a una clula de corazn y no tienen la misma
funcin pero la informacin gentica de todas ellas es exactamente la misma, qu
ocurre? Que no todas las protenas se producen al mismo tiempo y la clula de ojo slo
sintetizar aquellas protenas para que la clula tenga la funcin de ojo, y lo mismo
ocurrir con la informacin gentica que se exprese en las clulas de corazn.

As mismo, siguiendo con el segundo ejemplo, existen microorganismos (como las
bacterias) capaces de sintetizar muchas enzimas, por poner, un ejemplo la celulasa.
Cundo crees que el microorganismo la sintetice? Si el microorganismo tiene como
fuente de carbono glucosa, que es un azcar fcilmente metabolizable, necesitar
sintetizar la celulasa? La respuesta es obvia, no, en este caso no necesita la enzima.

En cambio, si tiene como nica fuente de carbono celulosa, entonces s necesita la
enzima celulasa para degradar el polmero en glucosa y utilizarlo para obtener energa
para poder vivir. Con todo ello, es necesario hacerte ver que la regulacin en la sntesis
de las protenas es muy importante; por esta razn conocers cmo ocurre este proceso
en las clulas, as como las diferencias entre procariotas y eucariotas.

2.2 Transcripcin

Como ya se mencion, la transcripcin se puede definir como el proceso enzimtico
mediante el que la informacin gentica contenida en una hebra de ADN se utiliza para
especificar una secuencia de bases complementaria en una cadena de ARN (Lehninger,
2009). De esta manera es posible sacar copias de la informacin y producir varios ARN
a partir de una nica secuencia de ADN y por lo tanto sintetizar varias protenas al mismo
tiempo.

Para ello, ocurre un proceso similar al que estudiaste durante la replicacin, ya que
tomando como molde la secuencia de ADN, especficamente, del gen (molcula de ADN
que tiene informacin para sntesis de un ARN), la enzima ARN polimerasa sintetiza la
molcula de ARN aadiendo los ribonucletidos complementarios.


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El proceso de transcripcin ocurre de manera diferencial en clulas eucariotas respecto a
las clulas procariotas, ya que las primeras tienen un ncleo celular donde se tiene
almacenado el material gentico y las segundas tienen su cromosoma en el citoplasma.
Por ello, en el primer caso, la transcripcin ocurre en el ncleo, pero el ARN producido
debe viajar al citoplasma donde ocurre la segunda fase de la sntesis de protenas (la
traduccin) por lo que debe ser protegido en sus extremos para evitar una degradacin
temprana del material, esto ocurre con las denominadas modificaciones post-
transcripcionales como comentaremos a lo largo de este tema. Por su parte, en los
procariotas, la transcripcin ocurre en el citoplasma e inmediatamente se produce la
traduccin de las secuencias de ARN y por lo tanto la sntesis de protenas de manera
que no es necesario proteger los extremos del ARN por lo que no existen modificaciones
posteriores a la transcripcin.

La diferencia en estos procesos es fundamental como Ingenieros en Biotecnologa, ya
que si se desea obtener un organismos transgnico, ser necesario saber si el gen
proviene de una clula procariota u eucariota y si son necesarias las modificaciones post-
transcripcionales para que la protena se traduzca correctamente.

Para hablar de este proceso se iniciar explicando los tipos de ARN que se pueden
producir para despus analizar los pasos que se llevan a cabo para que se produzca este
proceso.

2.2.1 Tipos de ARN

En Bioqumica analizaste esta biomolcula as que recuerda que el ARN es un cido
nuclico formado por ribonucletidos unidos por enlaces fosfodister. Cada ribonucletido
contiene un azcar (ribosa), un fosfato y una base nitrogenada (adenina, uracilo, guanina
y citosina). El ARN es de cadena simple a diferencia de la doble cadena de ADN y existen
diferentes tipos de ARN presentes en las clulas, recuerdas? Existen ms de 10
molculas con diferentes funciones (sntesis de protenas, reguladoras y con actividad
cataltica) y un resumen se puede observar en la siguiente tabla:

Clasificacin de los ARN
Funcin celular Tipo de ARN
Sntesis de protenas
Mensajero ARNm
de transferencia ARNt
Ribosmico ARNr
Reguladores
De interferencia
Micro ARN
Interferente pequeo
Asociados a Piwi
Antisentido
Largo no codificante


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Riboswitch

Con actividad cataltica
Ribozima
Espliceosoma (RNPsn)
Pequeo nuclear ARNsn
Fuente: PQBio, s.f.

En este momento, vas a analizar los ARN involucrados en la sntesis de protenas, es
decir, el ARN mensajero, el ARN de transferencia y el ARN ribosomal:

1.- ARN mensajero (ARNm): es una molcula lineal cuya funcin ser llevar la
informacin gentica y ser la molcula que se usa como molde para la traduccin. Es
por ello, que como vers ms adelante, esta molcula es leda en los ribosomas de
manera que cada 3 bases (codn) se tiene informacin para la adicin de un aminocido
utilizando el denominado cdigo gentico. Cuando se mencionen las diferencias entre
procariotas y eucariotas vers que en estos ltimos, el ARNm tiene que tener su extremos
5 y 3 protegidos para evitar su pronta degradacin, por ello, en el extremos 5 se
encuentran una serie de modificaciones y protenas que forman el denominado CAP
(caperuza o casquete que se refiere a un nucletido modificado de guanina, la 7-
metilguanosina, que se aade al extremo 5 del ARNm para su proteccin) una extensin
en el extremo 3 con la adicin de Adeninas formando la cola de poliA (cadena de
adeninas que se aaden al extremo 3 del ARNm para su proteccin, como se analizar
detalladamente en el apartado 2.2.3 (Lehninger, 2009). En la siguiente imagen puedes
observar la estructura del ARN mensajero de una clula eucariota.

Estructura del ARNm presente en una clula eucariota. Fuente: INMEGEN, 2012.

2.- ARN de transferencia (ARNt): sta molcula adopta una estructura tridimensional
caracterstica, gracias a los puentes de hidrgenos que se forman en las bases presentes
en su secuencia. Su funcin es reconocer los codones del ARN a travs de la
complementacin de bases entre la secuencia de ste con la secuencia de las tres bases
que forman el anticodn presente en la molcula del ARNt. Esta complementacin de
bases se refiere a los puentes de hidrgeno que se forman entre A y U as como entre G y


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C. Por otro lado, ARNt tiene, en su extremo 3 unido un aminocido que ser el que forme
la cadena de aminocidos durante el proceso de traduccin. (Lehninger, 2009).

Estructura de un ARNt. Observa que en el extremo 3 tiene unido el aminocido y en
la parte inferior hay tres bases que forman el denominado anticodn. Fuente:
Sntesis proteica, 2010.
La adicin del aminocido es un paso importante y muy especfico, ya que segn sea el
anticodn presente ser el aminocido que debe tener unido. Para ello, se utiliza una
enzima denominada Aminoacil-ARNt-sintetasa. En la siguiente figura, podemos
observar la accin de esta enzima tomando como ejemplo un ARNt que tiene como
anticodn GCC al que se le debe unir el aminocido valina.

Primero ocurre la unin del aminocido a la enzima utilizando la energa proporcionada
por una molcula de ATP para posteriormente unirlo al ARNt de manera que la enzima
vuelve a su estado original. En las clulas, debe existir por lo menos una Aminoacil-ARNt-
sintetasa especfica para cada anticodn que une un aminocido especfico. Los ARNt
que tiene unido el aminocido especfico que le corresponde se denominan aminoaci-
ARNt
AA
donde AA corresponde al aminocido que se une, en este ejemplo el resultado
de la actividad enzimtica sera Valinil-ARNt
Val
de ah el nombre de la enzima (de Robertis
y Hib, 2005).


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Funcin de la Aminoacil-ARNt-sintetasa. Fuente: Galen.com Hispavista, s.f.
3.- ARN ribosomal (ARNr): Esta molcula constituye alrededor del 80% del ARN total de
una clula y es por ello, que en la zona del ncleo donde se transcribe se acumula una
alta cantidad de protenas y ARN que hace que se vea ms oscuro cuando se visualiza a
travs de una microscopa y forma el nuclolo del que ya se habl anteriormente. Existen
diferentes tipos de ARNr y la unin de los mismos junto con algunas protenas formar los
ribosomas celulares, lugar donde ocurre la sntesis de protenas.

En el caso de las clulas procariotas se pueden encontrar los ARNr 5S, 16S y 23S
mientras que para los eucariotas, los ARNr presentes son 5S, 5,8S, 18S y 28S. 12En
ambos casos, los ribosomas estn formados por 2 subunidades; la subunidad grande
(50S para procariotas y 60S para eucariotas, formados los ARNr 5S y 23S y 5S, 28S y
5,8S respectivamente) y la subunidad pequea (30S y 40S formando por el ARNr 16S y
18S respectivamente). De esta manera, cuando se unen durante el proceso de traduccin
se forman los ribosomas 70S (procariotas) y 80S (eucariotas). Es importante aclarar que
la unidad S o svedberg se refiere al coeficiente de sedimentacin durante una
ultracentrifugacin que depende de una combinacin de tamao y forma, por eso,
tomando como ejemplo la clula procariota, la unin de la subunidad de 50S con la 30S
da como resultado el ribosoma de 70S (y no 80S como cabra esperar si las unidades se
sumaran). As mismo, debes recordar que en las mitocondrias y cloroplastos eucariotas,
tambin existe el proceso de sntesis de protenas ya que cada uno de estos organelos


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tiene su propio ADN, y los ribosomas presentes son similares a los procariotas, es decir,
70S (Lehninger, 2009).

ARNr presente en las clulas procariotas (as como mitocondriales y cloroplsticos)
y eucariotas Fuente: Lodish y col, 2009.

Antes de pasar a ver cmo ocurre la sntesis de estas molculas, es decir la transcripcin,
es necesario que reconozcas la relacin entre los ARNr y la identificacin molecular de un
organismo y los estudios de relaciones filogenticas. Para realizar esta tcnica, se
necesita una molcula de ADN que est lo suficientemente conservada en la evolucin
para poder realizar su amplificacin (utilizando la tcnica de PCR que se analizar en la
materia de Biologa Molecular 2) pero a su vez, tenga secuencias lo suficientemente
variables para que podamos distinguir entre la diferentes especies. Esto se consigue
estudiando los genes que tienen la informacin para la sntesis de los ARNr, es decir, los
genes ribosomales.

En procariotas, el gen 16S (Rodicio, M. R. y Mendoza, M.C.) es el ms utilizado para este
fin ya que en su secuencia se encuentran regiones variables que son analizadas para la
identificacin de bacterias.

En eucariotas se utilizan las secuencias ITS (por sus siglas en ingls Internal Transcribed
Spacer, o Espaciadores Internos Transcritos) (Peteira y col., 2008), que son las


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secuencias presentes entre los genes 23 S y 5,8 S (ITS 1) y 5,8S y 28 S (ITS 2) Como se
muestra en la siguiente figura.

Estructura de los genes ribosmicos en eucariotas donde podemos observar los
Espaciadores Internos Transcritos (ITS) utilizados en la identificacin de
organismos eucariotas. Fuente: Michele A. Mansfield & Seogchan Kang. S.f.
Una vez analizados los diferentes ARN que se deben producir ahora vas revisar como
ocurre el proceso de Transcripcin que en el siguiente subtema.

2.2.2 Pasos de la transcripcin

El proceso de transcripcin se puede definir como la sntesis de molculas de ARN
sobre la base de moldes de ADN (de Robertis y Hib, 2005). Este proceso ocurrir
mediante complementacin de bases de una manera similar a la que ocurra en el
proceso de replicacin de manera que cuando la secuencia de ADN tenga una A se unir
una U, cuando tenga una T, se unir una A, con una G se unir una C y viceversa
producindose enlaces fosfodister entre los ribonucletidos y siempre en direccin 5 3
como ya se analiz en la unidad anterior. Para ello, se necesita la accin cataltica de una
enzima especfica, que en este caso se conoce como ARN-polimerasa.


Biologa molecular I

Unin fosfodister entre los nucletidos del ARN durante el proceso de
transcripcin del ADN por complementacin de bases. Fuente: De Robertis y Hib,
2005.
Las ARN-polimerasas estn formadas por varias subunidades (2, 1 , 1 y 1 ) y su
funcin ser reconocer el ADN y unir los ribonucletidos complementarios mediante
enlaces fosfodister en direccin 53 (las subunidades B actan como una garra que se
une al ADN para utilizarlo como molde en la transcripcin).


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ARN-Polimerasa bacteriana A. Subunidades que forman la enzima, a la derecha se
observan las subunidades beta en rosa y amarillo y el Mg
2+
que forma parte del
centro activo. B. Proceso de transcripcin. Fuente: Basado en Berg y Col., 2007.
En las clulas procariotas, solo existe una ARN-polimerasas, en cambio, de acuerdo con
de Robertis y Hib, (2005), las ARN-polimerasas de las clulas eucariotas se clasifican
en:

- ARN-polimerasa I que sintetiza los ARNr 28S, 5,8S y 18S.
- ARN-polimerasa II que sintetiza ARNm y ciertos ARNs pequeos nucleares.
- ARN-polimerasa III que sintetiza ARNr 5S; los ARNt y algunos ARNs pequeos
nucleares y citoslicos.
- ARN-polimerasa mitocondrial que sintetiza los ARN de los genes presentes en el
cromosoma de este organel.
- ARN-polimerasa cloroplstico, ya que (como en el caso anterior) este organelo cuenta
con su propio ADN circular.

Ahora que conoces las enzimas implicadas en este proceso, el siguiente paso es ver
como ocurre este proceso. Para ello, es importante definir que un gen es la secuencia de
ADN que tiene la informacin para la sntesis de una molcula de ARN. Durante mucho
A
B


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tiempo se defini como la secuencia de ADN que tiene la informacin para la sntesis de
una protena, pero este concepto queda corto ya que excluye a los ARNr y ARNt. Por lo
tanto, la ARN polimerasa necesita reconocer el sitio de inicio y finalizacin del gen para
sintetizar la cadena de ARN correspondiente (Berg y col., 2007).

El promotor es la secuencia de ADN que es reconocida por la ARN-polimerasa para
comenzar la transcripcin (que inicia en la base +1). Segn el tipo de organismo, esta
secuencia tiene ligeras diferencias. En la siguiente figura puedes ver las secuencias
consenso de los promotores ms comunes en procariotas y eucariotas. En los procariotas
se encuentra una secuencia denominada Pribnow en posicin -10 (es decir, 10 bases
adyacentes por el lado 5 al inicio de la transcripcin) y la regin -35. Por su lado, en las
clulas eucariotas, se encuentra la caja TATA (por su secuencia rica en A y T) en
posicin -25 y la secuencia CAAT en posicin -75. Esta informacin es muy importante a
la hora de analizar secuencias para estudiar algn gen o algn promotor interesante para
su aplicacin en Ingeniera Gentica ya que para definir dnde empieza el gen, se analiza
la existencia de las cajas anteriormente mencionadas en las posiciones mencionadas.

Secuencias consenso de los promotores de clulas procariotas (a) y clulas
eucariotas (b). El primer nucletido que se transcribe recibe el nmero +1 y el
adyacente por el lado 5 se seala como -1. Observa que en la secuencia CAAT
aparece un nucletido como N, eso quiere decir que puede ser cualquier de los
existentes, es decir, A, T, G o C Fuente: Berg y col., 2007.


Biologa molecular I
El concepto de secuencias consenso se refiere a la secuencia presente en la mayora
de los organismos y para ejemplificarlo observa la siguiente figura. Aunque hay ligeras
diferencias en las secuencias, se eligen aquellas que aparecen en la mayora de los
casos.

Concepto de secuencias consenso. Observa cmo se eligen las bases que se
repiten en la mayora de los casos Fuente: Lehninger, 2009.
Volviendo al tema ahora vas a analizar cmo ocurre la transcripcin de los 3 ARN ms
importantes en los procesos de sntesis de protenas.

Los diferentes ARNr se transcriben de diferentes genes: los ARNr 18S, 5,8S y 28S se
procesan a partir del gen 45S (presente en el nuclolo) sintetizado gracias a la ARN-
polimerasa I. Por su parte, el ARNr 5S (situado fuera del nuclolo) se transcribe por la
accin de la ARN polimerasa III.

La ARN-polimerasa I se activa gracias a la existencia de factores de transcripcin
como las protenas UBF y SL1. Esto lo puedes ver en la figura Transcripcin del ARNr 45,
B. de manera que se transcribe un gen 45S que posteriormente ser procesado para
producir los ARNr 18S, 5,8S y 28S. En el genoma se encuentran varias copias de este
gen en tndem (es decir una detrs de otra) como puedes observar en la figura
mencionada.


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Transcripcin del ARNr 45 S. A. Los factores de transcripcin UBF y SL1 se unen al
promotor del gen para activar la ARN-polimerasa I. B. En primer lugar se transcribe
un ARN 45S que posteriormente ser procesado para producir los ARNr 18S, 5,8S y
28S Fuente: de Robertis y Hib, 2005.
Por otro lado, es necesario transcribir el gen 5S (que se encuentra fuera del nuclolo) por
lo que este proceso ocurre gracias a la ARN-polimerasa III que se activa por la accin de
factores de transcripcin proticos como TFIIA, TFIIB y TFIIC.

A
B


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Transcripcin del gen 5S por la accin de la ARN-polimerasa III activada gracias a
los factores de transcripcin TFIIA, TFIIB y TFIIC. Fuente: de Robertis y Hib, 2005.
Esta enzima, tambin es la responsable de transcribir los ARN de transferencia con la
diferencia que se activa con factores de transcripcin diferentes, en este caso son las
protenas TFIIIB y TFIIIC, como se muestra en la imagen. En los tres casos (ARNr 45S,
ARN 5S y ARNt), la terminacin de los genes ocurre por la existencia de varias timinas en
el extremo 3 del gen que reconocen las ARN-polimerasas y cesan la trascripcin.

Transcripcin de los ARNt por la accin de la ARN polimerasa III que se activa
gracias a la accin de los factores de transcripcin TFIIIB y TFIIIC. Fuente: de
Robertis y Hib, 2005.
La accin de la ARN-polimerasa II, que sintetiza los ARN mensajeros, es un poco ms
compleja porque estos genes deben estar regulados para que, como se mencion
anteriormente, se produzca la cantidad de protena necesaria en cada momento, ni ms ni
menos. Para ello, se apoyan de complejos proteicos denominados factores de
transcripcin que puede ser de dos naturalezas (de Robertis y Hib, 2005):

- Factores de transcripcin especficos que interactan en el regulador del gen y
pueden ser activadores o represores como analizars en la regulacin.
- Factores de transcripcin basales, que son requeridos para reconocer el promotor ya
que se unen a la secuencia TATA o Pribnow. Los ms conocidos son los factores TBP
(protena de unin a TATA por sus siglas en ingls) y TFII (factores de transcripcin tipo
II) para eucariotas y el factor sigma en procariotas.

De esta manera, se reconoce el promotor y comienza la transcripcin en la posicin +1.
La terminacin de la transcripcin puede darse por diferentes mecanismos que involucran
secuencia de ADN denominadas terminadores de la transcripcin.

En el caso de Escherichia coli se puede dar por dos mecanismos, por la existencia de una
regin rica en pares GC seguida de una serie de 6 o ms adeninas, como se muestra en
la imagen Terminadores de la transcripcin, en el inciso A), o terminacin dependiente de
la actuacin del factor proteico Rho, en este ltimo caso esta protena reconoce una
secuencia especfica del ARN denominada secuencia Rut, mostrado en el inciso B).


Biologa molecular I

Terminadores de la transcripcin. A. Regin rica de GC, B. terminacin mediada por
la protena Rho. Fuente: UMC, s. f.
En la Figura: Etapas de la transcripcin. Se presenta un resumen grfico, del proceso de
transcripcin comenzando por el reconocimiento del promotor (poniendo como ejemplo
una bacteria ya que se presenta el factor sigma), la sntesis como tal del ARN y la
terminacin.
B)
A)


Biologa molecular I

Etapas de la transcripcin. Fuente: Martinki, 2009.
Es importante, notar que slo se transcribe una molcula de ADN, aquella que tiene
direccin 35 para que la sntesis del ARN sea en direccin 53, observa este proceso en
la siguiente figura.


Biologa molecular I

La transcripcin toma como molde una nica hebra de ADN y se realiza en
direccin 53. Fuente: Curtis y col., 2008.

As mismo, la transcripcin ocurre simultneamente, es decir, cundo una ARN-
polimerasa II reconoce el promotor (con la participacin de los factores de transcripcin
que hemos analizado) y empieza la transcripcin, inmediatamente otra ARN-polimerasa
har la misma funcin y se sintetizarn numerosos ARNm a la vez.


Biologa molecular I

Micrografa electrnica que muestra un gen transcribindose. Fuentes: de Robertis y
Hib, 2005.
La transcripcin de la clulas procariotas prcticamente termina con la presente
explicacin, en cambio, en clulas eucariotas ocurren procesos post-transcripcionales
que es importante analizar como vers en el siguiente tema. Pero antes, en el siguiente
esquema se presentan las principales diferencias entre la transcripcin de las clulas
procariotas y las eucariotas.


Biologa molecular I
Diferencias entre transcripcin de clulas procariotas y eucariotas. Fuente:
Storage.canalblog, s. f.

2.2.3 Procesos post-transcripcionales en eucariotas

Las clulas eucariotas, como ya sabes, tienen varias diferencias con las clulas
procariotas y entre ellas est la existencia del ncleo con su membrana que protege el
material gentico que est en su interior. En l, ocurre la transcripcin y el ARNm
producido debe transportarse al citoplasma para su traduccin.

Por otro lado, recuerda que las clulas necesitan tener la cantidad de protena necesaria
para poder vivir, ni ms ni menos. Es por ello, que en todas las clulas (procariotas y
eucariotas) existen ribonucleasas (abreviadas como ARNasas) que se encargan de
degradar el ARNm producido para que se traduzca slo la cantidad necesaria de protena
y as poder regular su produccin. Como se mencion en el ejemplo inicial, las bacterias
que producen celulasas, necesitan la enzima slo cundo en el medio de cultivo exista
celulosa como fuente de carbono. Si, aadimos glucosa entonces la enzima no ser
necesaria y se dejar de producir. De esta manera, si el ARNm no fuera degradado, una
vez producido no dejara de traducirse y no se podra detener la sntesis de protena. Esta


Biologa molecular I
es la importancia de las ARNasas en la regulacin celular. Esta enzimas son
exonucleasas, es decir, liberan ribonucletidos desde los extremos, ya sea 3 o 5.
(Lehninger, 2009)

Las ARNasas rompen los enlaces fosfodister de los ribonucletidos terminales de
las molculas de ARN. Fuente: Worthington, Biochemical Corporation, s. f.
En las clulas procariotas, tanto la transcripcin como la traduccin ocurren en el
citoplasma, y da tiempo para que la traduccin tenga lugar antes de que el ARNm sea
degradado. De hecho, ambos procesos son simultneos, antes de que termine la
transcripcin comienza la traduccin.


Biologa molecular I

En clulas procariotas la transcripcin y la traduccin ocurren manera simultnea.
Fuente: UCM, s. f.
En cambio, como ya se ha comentado, en las clulas eucariotas es necesario transportar
esta molcula al citoplasma y por ello, es necesario proteger al ARN antes de su
degradacin y esto ocurre con los procesos post-transcripcionales. El ARN que se
transcribe se denomina transcrito primario y una vez que es procesado pasa a ser un
ARNm maduro. Los tres procesos que ocurren son: adicin del CAP, splicing y
poliadenilacin. A continuacin se describen detalladamente:

a) Adicin del CAP.

En primer lugar, se aade el CAP (capuchn) en el momento en el que el transcrito
primario empieza a transcribirse. El primer extremo que aparece es el 3 y su
ribonucletido contiene 3 fosfatos ya que recuerda que los ribonucletidos que se unen a
la cadena son trifosfato. En este momento, una enzima especfica denominada
Guaniltransferasa incorpora un GTP al extremo 5 del transcrito primario con tres
caractersticas (de Robertis y Hib, 2005):

1. El nucletido se agrega al extremo 5.

2. Entre los nucletidos se establece una unin trifosfato (uno de los fosfatos lo aporta el
GTP y otros 2 fosfatos corresponden al ribonucletido del transcrito.

3. La unin trifosfato liga el carbono 5 de la pentosa del GTP con el carbono 5 del
ribonucletido del transcrito primario y no es una unin 5 3 como las que hemos
analizado. De esta manera queda el nucletido del CAP invertido convirtindose en
otro extremo 3.


Biologa molecular I

A continuacin, una Metiltransferasa toma dos grupos metilos de una molcula
denominada S-adenosilmetionina y los transfiere: uno a la guanina del CAP y otro al que
ha pasado a ser el 2 ribonucletido del transcrito primario. De esta manera, el CAP evita
la degradacin del extremo 5 protegindolo de la accin de las ARNasas que analizamos
anteriormente. La estructura final se puede observar en la siguiente figura.

Formacin del CAP. Obsrvese que la unin es por un enlace trifosfato entre los
carbonos 5 de manera que el extremo se convierte en 3. As mismo, tanto la
guanina terminal como la base del que se transforma en el 2 ribonucletido se
metilan por accin de la metiltransferasa. Fuente: de Robertis y Hib, 2005.
b) Splicing

El segundo procesamiento del ARNm que ocurre es la eliminacin de los intrones. Los
genes eucariotas estn formados por exones e intrones, los primeros contienen la
informacin gentica para la sntesis de la protenas pero para que esto ocurra, primero
hay que eliminar las secuencias intrnicas tal y como puedes ver en la siguiente figura.
Este proceso se denomina splicing, este concepto no tiene una traduccin en espaol
aunque se puede encontrar como corte y empalme o ajuste.


Biologa molecular I

Los genes eucariotas cuentan con exones e intrones, los cuales son eliminados de
manera que los exones se unen para formar el ARNm maduro. Fuente: Modificado
Mazenett, R. y Zarante, I., 2012.
El splicing se lleva a cabo, principalmente, por dos mtodos: con la ayuda de un
espliceosoma y mediante autoprocesamiento.

El complejo denominado espliceosoma est formado por RNPsn (por sus siglas en
ingls snRNP small nuclear ribonucleoprotein particles), es decir, partcula
ribonocleoproticas nucleares pequeas. Este proceso tiene que ser muy especfico y
para ello se reconoce una secuencia caracterstica. En el extremo 5: AGGT y en el
extremo 3 (C, U) AGG. Otra secuencia importante es el llamado punto de ramificacin
cuya secuencia es menos conservada pero siempre contiene una A, como se observa en
la figura Splicing con el apoyo de un espliceosoma, en el inciso a). En primer lugar, el 2-
OH de este ribonucletido ataca el extremo 5 del intrn y lo hidroliza, (inciso b)),
simultneamente se forma una especie de lazo (llamado lariat) al formarse un enlace 2-
5 dentro del intrn (Inciso c)). Finalmente, el grupo 3-OH libre ataca el enlace A-G en el


Biologa molecular I
extremo 3 del intrn, de manera que se empalman los exones y se elimina el intrn an
en forma de lazo (Inciso c)).

Splicing con el apoyo de un espliceosoma. Fuente: Modificado de UAM, s.f.
El autoprocesamiento ocurre cuando los intrones se eliminan sin necesidad de ayuda de
protenas u otros ARNs, y existen dos tipos. En los intrones del grupo I, el proceso
autocatlico requiere de una guanosina y carece de secuencias consenso en los puntos de
empalme; en cambio, los del grupo II (figura, Autoprocesamiento de un intrn del grupo
II.), el proceso requiere de una adenina y durante el empalme se forman estructuras
caractersticas en forma de lazo.

A del punto de ramificacin


Biologa molecular I

Autoprocesamiento de un intrn del grupo II. Fuente: Procesos Genticos de sntesis
de protenas: la transcripcin, s. f.
Los intrones tienen una funcin importante en la regulacin. Adems, este proceso
permite que un mismo gen pueda producir protenas totalmente diferentes mediante el
splicing alternativo, es decir, segn el tipo celular se eliminan intrones diferentes. Un
ejemplo tpico es lo que sucede en la tiroides y el hipotlamo donde el mismo transcrito
primario se procesa diferente dando lugar a la hormona de calcitonina en la tiroides y el
pptido CGRP en el hipotlamo con secuencia y funcin diferente, como se observa en la
siguiente figura.

Ejemplo de splicing alternativo. El transcrito primario (ARNhn) se procesa de
manera diferencial en la tiroides (procesamiento 1) y en el hipotlamo
(procesamiento 2) produciendo protenas diferentes. Fuente: Porto, A. s.f.


Biologa molecular I
c) Poliadenilacin

Finalmente, es necesario proteger el extremo 3 y esto ocurre con la adicin de
aproximadamente 250 adeninas, formando el denominado poliA. Antes de que la ARN-
polimerasa II alcance la secuencia de terminacin del gen, unos factores proticos
denominados CPSF, CSTP, CFI y CFII reconocen la secuencia llamada seal de
poliadenilacin (AAUAAA) y cortan el transcrito primario aproximadamente 20
nucletidos despus de esta secuencia. Curiosamente, el gen se transcribe hasta que la
ARN-polimerasa II reconoce las seales de terminacin y el tramo adicional es degradado
por las ARNasas al carecer de un CAP en el extremo 5 que lo proteja. Al transcrito
primario liberado se le aaden las adeninas mediante la accin de la poli-A-polimerasa
para lo cual es necesaria la presencia del CPSF y otro factor, el PABII. Esta cola de poliA
adems de proteger el extremo 5 tambin colabora con la salida del ARNm al citoplasma
a travs de los poros nucleares presentes en la membrana nuclear, este proceso ocurre
por interaccin entre protenas del poro con las protenas que se unen al ARNm
producido. Las nucleoporinas (o protenas del poro) son protenas que conforman el poro
nuclear cuya funcin es el transporte selectivo y direccional de las molculas entre el
ncleo y el citoplasma. Una vez que el ARNm atraviesa el poro nuclear, las protenas
nucleares que estaban unidas a l se separan para regresar al ncleo y se unen protenas
citoplasmticas. (Lodish y col., 2005).

Salida del ARNm al citoplasma. A. Esquema del proceso, B. Microscopa electrnica
que muestra la salida del ARN unido a protenas. Fuente: Basado en Lodish y col.,
2005.


Biologa molecular I
Un resumen de los procesos post-transcripcionales se presenta en la siguiente figura.
Primero la adicin de CAP, a continuacin el splicing para finalizar con la adicin de la
cola de poliA todo ello a la vez que el ARN se est transcribiendo.

Procesos post-transcripcionales. Fuente: Basado en Plano, A. y Leone, M. J., s. f.
Todo el anlisis que se ha realizado, adems de tener importancia para que entiendas
cmo ocurre el proceso de transcripcin, te permite tener conocimientos bsicos para
poder desempearte en la Ingeniera Gentica. Particularmente, se quieren resaltar dos
caractersticas importantes. La primera es que si, en algn momento, quieres expresar
una protena en cualquier tipo de clula, no puedes olvidar que la ARN-polimerasa II
necesita un promotor para poder comenzar la transcripcin por lo que en tu construccin
gentica debers introducir una secuencia de este tipo. Por otro lado, has observado
cmo el transcrito primario se diferencia del ARNm maduro en que el primero contiene
intrones que se deben procesar y no todas las clulas lo hacen de la misma manera. Es
por ello, que en Ingeniera Gentica se utiliza el ADN complementario (ADNc), es decir,
se extrae el ARN total de la clula, se purifica el ARNm (gracias a la secuencia poliA que
contiene) y se realizar una retrotranscripcin utilizando una transcriptasa reversa vrica.
De esta manera, el ADNc contiene nicamente los exones que tienen la informacin para
Adicin del CAP
Splicing
Poliadenilacin


Biologa molecular I
la sntesis de protenas. Todos los detalles de estas tcnicas se analizarn en Biologa
Molecular 2, te parece interesante?

2.3 Traduccin

En la materia de Bioqumica se vio que las protenas estn formadas por 20
aminocidos (aa) pero qu diferencia una protena de otra? Cmo pueden tener
caractersticas diferentes? La respuesta est en su tamao y el orden de los aa; la
informacin est en el gen que una vez transcrito pasa a ARNm. Como viste
anteriormente, necesitamos escribir nuestra propia palabra para lo cual es necesario
sintetizar la protena con el orden correcto de aminocidos.

Para ello, se lee la molcula de ARNm que fue transcrita mediante el proceso de
traduccin, que se puede definir como proceso en el que la informacin gentica
presente en una molcula de ARNm especifica la secuencia de aminocido durante la
sntesis de protenas (Lehninger, 2009). Este proceso ocurre en tres pasos importantes:
iniciacin (donde el ARNm y el ARNt se unirn junto con los ribosomas para comenzar el
proceso), elongacin (donde los codones del ARNm sern ledos por el ARNt y se irn
uniendo los aminocidos de manera correcta para formar la protena) y terminacin
(donde el ribosoma se desprender del ARNm y la protena ser liberada para su
posterior plegamiento). Por lo que adems del ARNm, interviene el ARNt que ser quien
lee el mensaje del ARNm y el ARNr que forman los ribosomas dnde ocurrir este
proceso. Posteriormente, la protena ser plegada y modificada para que tenga la
conformacin correcta para ser funcional como veras en el apartado 2.3.2.

La traduccin es similar en procariotas y eucariotas con la diferencia en la composicin de
los ribosomas (como vimos anteriormente) y en algunas protenas involucradas en el
proceso. En cambio, una vez producida la protena s vemos diferencias entre ambos
tipos celulares debido a la complejidad de las clulas eucariotas. A qu me refiero?
Cuando se produce una protena en las clulas procariotas, su funcin tendr lugar en el
citoplasma, membrana o pared celular por lo que su transporte no es muy complicado. En
cambio, en las clulas eucariotas, existen varios organelos y la funcin de los mismos es
muy diferentes por lo que el transporte debe realizarse de manera correcta, qu ocurrira
si una enzima hidroltica de los lisosomas queda en el citoplasma? Podra destruir la
clula completa. Por ello, existen seales en las protenas que las direccionan al organelo
donde debe realizar su funcin y slo cuando est libre de cualquier seal, la protena
queda en el citoplasma. Las seales ms importantes para los Ingenieros en
Biotecnologa son aquellas que secretarn a la protena al exterior, porque as ser ms
fcil su recuperacin y la produccin de la protena a nivel comercial ser ms barata.
Esta seal viene dada por el pptido seal que har que la protena entre la Retculo
Endoplsmico Rugoso, de ah ser transportado a travs de vesculas al Aparato de Golgi
para terminar en el exterior celular por exocitosis que puede definirse como la fusin de


Biologa molecular I
una vescula intracelular con la membrana plasmtica con liberacin de los contenidos de
la vescula al espacio extracelular (Lehninger, 2009).

As mismo, una vez que la protena es sintetizada es necesario que se pliegue
correctamente para ser funcional. Por ello, existen las modificaciones post-traduccionales
donde la protena se glicosila, fosforila, adicin de grupos prostticos (in metlico o
compuesto orgnico, diferentes a un aminocido, que est unido covalentemente a una
protena siendo esencial para su actividad).

2.3.1 Pasos de la traduccin

Auqne ya se ha hablado de ello, es importante recordar que en el proceso de traduccin
van a intervenir tres tipos de ARN:

1. El ARNm que lleva la informacin (en sus codones) para que se unan los aa
correctos.
2. El ARNt que mediante la secuencia de su anticodn reconoce el codn del ARNm
e incorpora el aa que lleva unido en el extremo 3'.
3. El ARNr que formar los ribosomas donde ocurre el proceso de traduccin.

Antes de mencionar los pasos de la traduccin se tiene que hablar sobre el cdigo
gentico (que anteriormente ya se ha nombrado). Bsicamente es una especie de
diccionario que establece una equivalencia entre los ribonucletidos y los aminocidos.
Los codones (tambin llamados tripletes) del ARNm son reconocidos por los
anticodones del ARNt que tiene unidos un aa determinado. Por ejemplo, y observando la
Tabla: El cdigo gentico, podemos ver que si el codn del ARNm es un AUG, entonces
ser reconocido por un ARNt (con anticodn UAC) que tendr unido una metionina; si el
codn es CUG entonces el anticodn ser GAC y se unir leucina y as sucesivamente.

El cdigo gentico
Primera
posicin
(extremo 5)
Segunda posicin Tercera posicin
(extremo 3)
U
U C A G
U
C
A
G

Phe
Phe
Leu
Leu
Ser
Ser
Ser
Ser
Tyr
Tyr
Stop
Stop
Cys
Cys
Stop
Trp
C
Leu
Leu
Leu
Leu

Pro
Pro
Pro
Pro
His
His
Gln
Gln
Arg
Arg
Arg
Arg

U
C
A
G


Biologa molecular I
A
Ile
Ile
Ile
Met
Thr
Thr
Thr
Thr

Asn
Asn
Lysd
lys
Ser
Ser
Arg
Arg

U
C
A
G
G
Val
Val
Val
Val

Ala
Ala
Ala
Ala

Asp
Asp
Glu
glu
Gly
Gly
Gly
Gly
U
C
A
G

Nota: Esta tabla identifica el aminocido codificado por cada triplete. Por ejemplo, el
codn 5 AUG 3 del mRNA especfica metionina, mientras que CAU especfica
histidina. UAA, UAG y UGA son seales de terminacin 8stop9. AUG es parte de la
seal de iniciacin, adems de codificar las metioninas interiores.

Fuente: UNCOMA, s.f.

Este cdigo gentico contiene 61 codones que tienen informacin para un aa y 3 codones
que actan como seales para la terminacin de la traduccin que se conocen como
codones de paro o stop. En la figura, tienes un ejemplo de la unin de codn del ARNm y
el anticodn del ARNt de 2 de los 6 codones que codifican para la leucina.

Unin del ARNm con el ARNt de 2 de los 6 codones que codifican para el
aminocido leucina. Fuente: de Robertis y Hib, 2005.
El cdigo gentico posee una serie de caractersticas importantes (Mc Cormack, 2007):


Biologa molecular I
1. Es universal, es decir, lo utilizan todos los seres vivos conocidos excepto algunos
casos excepcionales en pocos tripletes de bacterias. Aunque es importante sealar
que no todos los codones estn presentes en todas las clulas.

2. No es ambiguo ya que cada triplete tiene informacin para 1 aa.

3. Todos los codones tienen sentido, o bien codifican para un aa o bien indican la
terminacin de la traduccin.

4. Est degenerado, pues hay varios codones que tiene la informacin para un mismo
aa. Es una de las razones principales de que el Dogma de la Biologa Molecular sea
unidireccional, lo recuerdas? De la secuencia de ARN se puede deducir la secuencia
de la protena pero no viceversa. Por ejemplo, si tienes como secuencia UUU, el
aminocido sera leucina, pero si el aminocido es leucina, cul de los 6 codones
aparece en el secuencia de ARN? Eso no lo podramos saber.

5. Carecen de solapamiento, es decir los codones no comparten bases nitrogenadas.

6. Es unidireccional ya que los codones se leen en direccin 5 3.

Como vers un poco ms adelante, en todos los seres vivos se comparte el mismo codn
de inicio (AUG) que tiene la informacin para adicionar una metionina (en las clulas
eucariotas) y N-formamilmetionina (en caso de procariotas). Adems todos los genes
tienen lo que se denomina marco de lectura abierto ORF (por sus siglas en ingls Open
Reading Frame), el cual, bsicamente, es la secuencia de ADN comprendida entre un
codn de inicio (AUG) y un codn de terminacin. Estos ORF estn flanqueados por
regiones que no se traducen y que se denominan UTR (del ingls untranslated regin o
untranslated triler y generalmente posee un 5-UTR y un 3-UTR, como se observa en la
siguiente imagen.

comienzo de la transcripcin seal de poliA
5ca
p
5UTR ORF 3UTR 3 poli A

codn de inicio codn de stop

Protena


Biologa molecular I
Regiones UTR y ORF de un gen. Solo el ORF tiene la informacin para su
traduccin en una protena. Fuente: Basado en UMBIO, s.f.
En este momento ya estas preparado para deducir la secuencia proteica de un gen segn
lo que has aprendido sobre transcripcin y el cdigo gentico. En la Figura Deduccin de
una secuencia gentica, A tenemos la secuencia hipottica de un ADN donde se indica el
inicio de la transcripcin (+1) y las direcciones de las hebras. En la misma figura B, se
presenta la deduccin de la secuencia de ARN teniendo en cuenta que siempre ocurre en
direccin 5 3, que se aade la base complementaria y que en el ARN no existe T si no U.
Finalmente, en la C, aparece la secuencia de protena correspondiente teniendo en
cuenta que la traduccin comienza en un AUG y termina en un codn de stop. Para
facilitar este anlisis, se presenta la cadena de ADN que se transcribe y los codones del
ORF en negrita.

Es muy importante que entiendas este proceso y si tienes dudas, por favor, ponte en
contacto con tu facilitador ya que como vers al finalizar este desarrollo, una de las
actividades contempladas en esta Unidad es la deduccin manual de una secuencia
proteica a partir de la secuencia gentica. As mismo, encontrars las instrucciones para
realizar la deduccin de la secuencia utilizando software libre presente en pginas de
internet como el ExPaSy (Bioinformatics Resource Portal), con ello podrs realizar la
actividad integradora.

Deduccin de una secuencia gentica. A. ADN (en negrita se presenta la secuencia
que se transcribe), B. ARN (en negrita se presenta el ORF), C. Protena

Pero, Qu ocurre si el promotor est del lado derecho? Entonces, la secuencia que se
transcribe ser la de abajo porque es la que producira un ARNm en direccin 53.


Biologa molecular I
Analiza la siguiente figura donde se describe un ejemplo con este caso, observa que, de
todos modos, la secuencia de ARN se indica en direccin 5 3.

Deduccin de una secuencia gentica. En este caso, el promotor est en direccin
contraria por lo que se transcribe la otra cadena de ADN (en comparacin con la
Figura anterior).

Antes de conocer cmo ocurre este proceso de traduccin, paso por paso, vas a realizar
la siguiente actividad.

Actividad 1: Qu protena corresponde a este gen?

En esta Unidad II has aprendido los procesos involucrados en la sntesis de las protenas
y analizado cmo deducir una secuencia proteica a partir de la secuencia de una
molcula de ADN.

En esta primera actividad vas a reforzar dicho conocimiento, es por ello, que se solicita,
atentamente, que repases este proceso y tengas presente el cdigo gentico para poder
realizar la deduccin de la secuencia de ADN que se te propone:

Para ello:

1. Revisa la siguiente secuencia de ADN e identifica el punto de inicio y final de la
transcripcin, el promotor y la cadena que se transcribir, indicando claramente
cada uno de ellos.


Biologa molecular I

2. A continuacin, transcribe el ADN anterior y deduce la secuencia de ARNm.
Indica, claramente, dnde se incorporara el CAP, la cola de poliA as como el
ORF y las UTRs 5 y 3.

3. Finalmente, traduce el ARNm y deduce la secuencia de los aminocidos que
formarn la protena. Indica, claramente, qu aminocido tendr el amino-
terminal y cual tendr el carboxi-terminal.

4. Elabora tu trabajo en un archivo .doc, si decides realizar la tarea en la
computadora pero si te es ms fcil, tambin tienes la opcin de realizarla a mano
y escanear el documento; gurdalo con la siguiente nomenclatura:
BBM1_U2_A2_XXYZ.

5. Sube tu trabajo al espacio de tareas para recibir la retroalimentacin de tu
Facilitador(a).

6. Revisa los criterios de evaluacin para que tomes en cuenta los elementos que
evaluaran.

*No olvides que el documento no debe pesar ms de 4 MB.

Ahora para continuar vas a revisar cmo ocurre el proceso de traduccin, pero primero
tienes que conocer un poco mejor a los ribosomas. Como ya se mencion estn
compuestos de ARNr y un conjunto de protenas cuya unin producen las subunidades
40S y 60S si ponemos como ejemplo una clula eucariota. La unin de ambos, durante la
fase de iniciacin de la traduccin formar el ribosoma 80S. La subunidad pequea
(40S) tiene forma irregular.

En la cara que se relaciona con la subunidad grande (60S) existe un canal donde por el
que se desliza el ARNm y junto a l se observan tres reas excavadas continuas: el sitio
A (por aminoacil), sitio P (por peptidil) y el sitio E (por exit o salida). As mismo, la
subunidad grande tiene un forma muy irregular y en la cara que se relaciona con el canal
y los sitios A, P y E de la subunidad pequea nace un tnel por donde la protena sale del
ribosoma segn se va traduciendo como se observa en siguiente figura. (de Robertis y
Hib, 2005).


Biologa molecular I

Los ribosomas cuentan el sitio E (exit), P (peptidil) y A (aminoacil). Fuente:
Basado en Bilogo calentano, 2013.
El proceso de traduccin bsicamente ocurre en tres pasos: iniciacin, elongacin y
terminacin.

1. Etapa de Iniciacin
Esta etapa est regulada por protenas citoplasmticas denominadas factores de
iniciacin (IF) que provocan dos hechos separados: por un lado, el CAP del ARNm es
reconocido por el factor IF-4 y por otro lado el metionil-ARNt
Met
se coloca en el sitio P de
la subunidad pequea del ribosoma con la ayuda del IF-2 (que obtiene la energa de una
molcula de GTP). Una vez que ocurren ambos acontecimientos, el factor IF-3 con ayuda
del IF-4 coloca el ARNm sobre la cara de la subunidad pequea que posee los sitios E, P
y A. De inmediato, la subunidad grande se desliza por el ARNm hasta que detecta el
codn de inicio (AUG) que se coloca en el sitio P, de manera que el segundo codn del
ARNm queda en el sitio A. Entre tanto, el metionil-ARNt
Met
ubicado en el sitio P se une al
codn AUG y concluye la etapa de iniciacin acoplando la subunidad pequea con la
subunidad grande (de Robertis y Hib, 2005). En la siguiente figura se observa el proceso
de forma grfica.

B


Biologa molecular I

Etapa de iniciacin de la traduccin. Observa como el Metionil-ARNt
Met
se une en el
sitio P de ribosoma dejando el 2 codn en el sitio A. Fuente: Lehninger, 2009.
2. Etapa de elongacin
Esta etapa est regulada por factores de elongacin (EF) y comienza con el ingreso de un
aminoacil-ARNt
AA
cuyo anticodn sea complementario al segundo condn del ARNm que
se est traduciendo. Esta entrada ocurrir por el sitio A (de ah su nombre de aminoacil)
mediada por el factor EF-1 que suministra la energa por la hidrlisis de un GTP. La


Biologa molecular I
proximidad de los dos aminoacil-ARNt
AA
produce la unin de ambos mediante un enlace
peptdico y el ribosoma se recorrer tres nucletidos en direccin al extremo 3 del
ARNm; esta reaccin se lleva a cabo gracias a la accin del EF-2 que consume una
nueva molcula de GTP. As, el codn AUG quedar en el sito E y el sitio P quedar
ocupado por el 2 codn que tendr su aminocido unido a la metionina inicial. Como
hemos indicado anteriormente, el sitio E recibe su nombre de exit o salida ya que es el
lugar por el que el primer ARNt sale del ribosoma. As termina el primer ciclo de
elongacin y da paso al ciclo siguiente ya que el sitio A est libre y puede acceder un
nuevo aminoacil-ARNt
AA
, como se observa en la figura.

Fase de elongacin de la traduccin A. Primer paso de la elongacin; B. Segundo
paso de la elongacin. Fuente: Lehninger, 2009.
Este proceso es muy costoso energticamente hablado ya que por cada aa incorporado
se gasta una molcula de ATP (cuando el aa se une al ARNt) y dos molculas de GTP
(como acabas de ver). Se calcula que la velocidad de este procesos es de
aproximadamente 50 aa por segundo (de Robertis y Hib, 2005).

Como se ha mencionado, cuando se produce el enlace peptdico el ribosoma se desliza
tres bases hacia la direccin 3 del ARNm por lo que cada vez se aleja ms del extremo
5. Cuando se han incorporado unos 30 aa, el codn de iniciacin es abordado por un
A
B


Biologa molecular I
nuevo ribosoma y comienza la traduccin de manera simultnea (A) y se forma el
polisoma que puede ser visualizado utilizando un microscopio electrnico (B).

Traduccin A. Un nico ARNm es traducido simultneamente por varios ribosomas
B. Micrografa de un polisoma. Fuentes: Martinki, 2009 y Wolfe, s.f.
3. Fase de terminacin.
Esta ltima etapa est regulada por factores de terminacin (RF por sus siglas en ingls
releasing factor) y tiene lugar cuando el codn de terminacin (UAA, UGA o UAG) llega
al sitio A del ribosoma. Debido a que no hay ningn aminoacil-ARNt
AA
en el sitio A, entra
el RF-1 que es capaz de reconocer cualquiera de los tres codones de stop. Ante la
ausencia de un nuevo aminoacil-ARNt
AA
, la protena del peptidil-ARNt ubicado en el sitio P
se desliga del nuevo ARNt y se independiza del ARNm y del ribosoma proceso que
involucra al factor eRF-3 que consume una nueva molcula de GTP. Inmediatamente, se
separan las subunidades grande y pequea del ribosoma. Al finalizar la traduccin
tendremos una protena cuyo primer aminocido es la metionina que usualmente es
removida de manera que el 2 aminocido pasa a estar en la primera posicin teniendo su
extremo amino libre; de esta manera, el ltimo aa tendr el extremo carboxilo libre ya que
el enlace peptdico ocurre entre el grupo carboxilo aportado por el ltimo aa de la cadena
en crecimiento y el grupo amino cedido por el aa del aminoacil-ARNt
AA
(de Robertis y Hib,
2005).

A B


Biologa molecular I

Fase de terminacin de la traduccin. Fuente: Lehninger, 2009.
La vida media del ARNm depende del tipo celular. Recordemos que el ARNm de las
clulas procariotas no tiene modificaciones post-transcripcionales que protejan los
extremos de la accin de las ARNasas por lo que su vida media es de, aproximadamente,
2 minutos. En cambio, el ARNm de las clulas eucariotas cuentan con una cola de poliA
en el extremo 5 de manera que las ARNasas comienzan a eliminar adeninas de este
extremo pero tardan en llegar a la secuencia del ORF por lo que la vida media del ARNm
vara entre 4 y 24 horas. El extremo 3 est protegido gracias a la modificacin qumica
que produce el CAP (Lewin, 2008).

Para finalizar este tema, se presenta un resumen del proceso de sntesis de protenas.
Observa como los genes de ADN (a la derecha) son transcritos (tanto los ARNr como los
ARNt y ARNm). Por su parte, el ARNt ser modificada por la Aminoacil-ARNt-sintetasa
aadiendo el aa correspondiente a su anticodn y produciendo los aminoacil-ARNt
AA


Biologa molecular I
(parte superior). Se irn acoplando los ribosomas (parte inferior) que recorrern el ARNm
hacia su extremos 5 dejando libre el inicio para la entrada de un nuevo ribosoma
formando as el polisoma. Cuando, el sitio A llegue a un codn de terminacin, la protena
traducida ser liberada y las subunidades de los ribosomas se desprendern para
comenzar una nueva traduccin.

Resumen del proceso de sntesis de protenas. Fuente: Curtis y col., 2008.
Como puedes apreciar, la secuencia de ADN determina la secuencia de protenas y si
existe alguna modificacin (o mutacin) se puede afectar su estructura y por lo tanto su
actividad como se analizar en la 3 unidad de esta materia. Por otro lado, cuando quieras
hacer la expresin de una protena, debes asegurarte que el gen contiene el ORF
completo para que pueda producir la protena correcta.

En el siguiente tema vas a analizar qu pasa con las protenas producidas ya que
recuerda (como viste en Bioqumica) que las protenas necesitan tener una conformacin
espacial correcta para poder estar activas y por lo tanto necesitan plegarse. Adems,
existen protenas (que siempre estn glucosiladas) que se secretan al exterior de las
clulas Cmo ocurren estos procesos?, A de responder esta pregunta con el siguiente
tema, realiza la siguiente activad.


Biologa molecular I

Actividad 2. Procesos involucrados en la sntesis proteica de
procariotas y eucariotas

En todas las clulas, la sntesis de protenas, ocurre a travs de procesos similares de
transcripcin y traduccin pero existen diferencias entre procariotas y eucariotas y es lo
que vas a analizar en esta actividad. Para ello, se te recomienda que revises bien el
desarrollo de la unidad y busques informacin bibliogrfica si es necesario. Adems de
esto debers seguir las indicaciones de tu Facilitador(a), con respecto a la actividad.

Para iniciar:

1. Observa detalladamente la siguiente imagen:

2. Con base en la imagen, realiza un anlisis sobre las similitudes y diferencias en
la sntesis proteica de las clulas procariotas y eucariotas, haciendo nfasis los
siguientes elementos:

Una clula corresponde a un organismos procariota y otra a un organismo
eucariota, desde el punto de biologa molecular, qu diferencias
estructurales estn relacionadas con la sntesis de protenas?
A continuacin, analiza la transcripcin (incluyendo las modificaciones post-
transcripciones) y realiza una tabla indicando las similitudes y las diferencias
entre ambos tipos de clulas.
Realiza el mismo ejercicio en otra tabla adicional donde analices las
similitudes y las diferencias durante el proceso de traduccin
Para finalizar elabora una tercera tabla donde expliques las similitudes y
diferencias en los procesos de regulacin de la expresin gentica.


Biologa molecular I

3. Elabora un documento en el que incluyas el problema planteado y la solucin.

4. Guarda tu documento, con la siguiente nomenclatura: BBM1_U2_A2_XXYZ.

5. Sube tu trabajo al espacio de tareas para recibir la retroalimentacin de tu
Facilitador(a).

6. Revisa la escala de evaluacin antes de iniciar la actividad para que conozcas los
criterios bajo los cuales se evaluar tu trabajo.

*No olvides que el documento debe pesar menos de 4 MB.

Suerte!

2.3.2 Procesos post-traduccionales

La traduccin tiene como resultado la sntesis de una protena lineal pero para que sta
sea activa necesita tener una conformacin tridimensional determinada. As mismo, en
muchas protenas es necesario realizar algunas modificaciones que se denominan post-
traduccionales como (Lehninger, 2009):

Modificaciones amino-terminales y carboxilo-terminales ya que como hemos
comentado la metionina inicial (eucariotas) y N-formamilmetionina (procariotas), y
hasta el 50% de las protenas eucariotas el amino-terminal es acetilado.
Modificacin de aminocidos concretos como los residuos de serina, treonina o
tirosina pueden ser fosforilados o se pueden aadir grupos carboxilos a aa como
asprtico y glutmico.
Unin de cadenas laterales de glcidos o glucosilacin en residuos de serina o
treonina (O-glucosilacin) o en residuos como asparragina (N-glucosilacin).
Adicin de grupos isoprenilos a residuos de cistena en la protena. Esta accin
sirve para anclar la protena en la matriz nuclear.
Adicin de grupos prostticos que son requeridos para la actividad enzimtica
como el grupo hemo del citocromo c.
Modificacin proteoltica ya que en algunos casos como, por ejemplo, la
insulina, se sintetiza en forma de precursores que necesita ser recortado
proteolticamente para dar su forma activa.

En este listado, faltan dos modificaciones, que analizars ms a detalle: el plegamiento y
la secrecin ya que tienen una gran importancia para los Ingenieros en Biotecnologa. El
plegamiento definir la conformacin de la protena que ser necesaria para ser activa y
la secrecin viene determinada por una secuencia que dirige a la protena al interior del


Biologa molecular I
Retculo Endoplsmico Rugoso. De esta manera, cuando se realiza Ingeniera Gentica
para obtener protenas heterlogas (produccin de la biomolcula en un organismos
diferente al original) es necesario tener en cuenta ambos conceptos para hacer una
correcta planeacin. Ahora, analiza una por una:

Plegamiento de protenas
Recuerda que las protenas activas necesitan una conformacin espacial determinada y
que la secuencia de los aa ser la clave para que tengan el plegamiento correcto por ello
se distinguen diferentes niveles de organizacin donde se incluyen las siguientes
estructuras:

a. Primaria que se refiere a la secuencia lineal de aminocidos tal y como se
traducen
b. Secundaria donde se forman las -hlices y las -plegadas
c. Terciaria donde se forman los dominios proticos
d. Cuaternaria cuando se asocian varios monmeros


Biologa molecular I
Nivel de organizacin de las protenas. Fuente: Temas de bioqumica, 2008.
El plegamiento comienza durante la traduccin y las protenas adoptan espontneamente
la conformacin mnima de energa en base a la secuencia de aminocidos de manera
que los residuos hidrofbicos se entierran en el ncleo interior. Las fuerzas que
estabilizan las conformacin de la protena incluye interacciones no covalentes
(puentes de hidrgeno, interacciones electrostticas, fuerzas de Van de Waals e
interacciones hidrofbicas) e interacciones covalentes por la formacin de puentes


Biologa molecular I
disulfuro formados entre residuos de cistenas. En ocasiones, la protena no puede
plegarse per se y necesita de la ayuda de un complejo proteico denominado proteosoma
formado por protenas HSP presente en clulas eucariotas, arqueas y muy pocas
enzimas, como se observa en la siguiente figura.

Accin de las chaperonas en el plegamiento de las protenas. Fuente: Sabbatino, V.,
Lassalle, A., Gladys Glvez, G. y Mrquez, S., s.f.
Esta necesidad de plegar correctamente las protenas es importante para tu formacin
como Ingeniero en Biotecnologa porque no todas las clulas son capaces de hacerlo
correctamente. Por ejemplo, si la protena necesita del proteosoma para su plegamiento y
realizas una expresin de un gen eucariota en una bacteria que no posee este complejo
no podrs obtener una protena activa ya que no podr plegarse correctamente. En este
caso, ser necesario realizar un plegamiento fuera de la clula lo que puede aumentar los
costos de produccin.

Secrecin de protenas
En las clulas eucariotas, las protenas pueden ser secretadas al exterior de la clula
gracias a la entrada de la protena al Retculo Endoplsmico Rugoso (RER) donde se
empaqueta en una vescula que es transportada al Aparato de Golgi para salir al exterior
por exocitosis. Este proceso lo puedes observar de forma grfica en el siguiente
esquema.


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Proceso de secrecin de protenas. Fuente: Curso de fisiologa, s.f.
Pero, Cmo ocurre la entrada de la protena al RER? Todos los ARNm comienzan a
traducirse en el citoplasma ya que la entrada al RER viene determinado por una
secuencia de aminocidos denominado secuencia seal o pptido seal. Cuando esta
secuencia aparece en la protena que se est traduciendo es reconocida por una protena
llamada SRP (por sus siglas en ingls: partcula de reconocimiento de la seal). A
continuacin este complejo es reconocido por una protena situada en la cara externa de
la membrana del RER denominada Receptor del SRP y cuando se unen abre un complejo
proteico membranal que permite que el ribosoma se acople y la protena se sintetiza de
manera que se introduce en el lumen del RER. Una vez dentro, el pptido seal se
elimina y la protena ser plegada, glucosilada y transportada al exterior. Observa elproces
en la siguiente imagen. (Lehninger, 2009).


Biologa molecular I

Entrada de las protenas al RER. 1. La traduccin comienza en citoplasma o citosol,
2. Se traduce la secuencia seal o el pptido seal. 3. Esta secuencia de aa es
reconocida por la protena SRP. 4. El complejo se une al receptor del SRP que abre
un complejo proteico y la protena SRP se separa. 5. El SRP puede unirse con otro
pptido seal recientemente traducido. 6. El ribosoma se acopla al complejo
proteico abierto y la traduccin de la protena hace que sta entre en el lumen del
RER. 7. Finalmente el pptido seal es eliminado. Fuente: Lehninger, 2009.
De una manera similar se producen las protenas transmembranales y lisosmicas pero el
tema se ha centrado en las protenas extracelulares por su importancia para los
Ingenieros en Biotecnologa, por qu este inters? Si se quiere producir una protena a
nivel industrial, una opcin es realizar su expresin (como ya se ha comentado) y para su
venta, en la mayora de los casos, ser necesaria su purificacin. Si esta protena es
extracelular tenemos varias ventajas: ser ms fcil de purificar ya que el nmero de
protenas extracelulares siempre es mucho menos que las protenas intracelulares; ser
ms fcil de obtener ya que no requerimos de ruptura celular y podemos realizar una
fermentacin en continuo de manera que obtengamos el extracto extracelular y las clulas
intactas pueden seguir produciendo la protena con un medio de cultivo fresco. As que si
ests interesado, por favor, no olvides el pptido seal para que pueda ser transportada al
exterior.

As mismo, industrialmente, los hongos son los organismos ms utilizados en la
produccin de enzimas y esta cualidad se debe a su nutricin extracelular ya que
producen enzimas digestivas que secretan al exterior donde metabolizarn los polmeros


Biologa molecular I
(protenas, polisacridos, etc.) y absorbern los monmeros (aminocidos,
monosacridos, etc.). Como se acaba de mencionar esta caracterstica es ventajosa
industrialmente hablando y por ello las amilasas, proteasas, peptidasas, etc., se producen
en este tipo de organismos.

Para ampliar la informacin sobre este tema se recomienda leer el
artculo Produccin y aplicacin de enzimas industriales, de
Carrera, J. E. (2003), que puedes consultar en el Material de
apoyo.

A continuacin, se recomienda que realices la tercera actividad para que identifiques la
aplicacin de los procesos que has aprendido hasta este momento en la Ingeniera
Gentica.

Actividad 3: Importancia de la transcripcin y traduccin en la
Ingeniera Gentica

En esta unidad hemos hablado de la importancia de los conocimientos adquiridos para la
Ingeniera Gentica y por ello, te invito a discutir sobre este tema.
Para iniciar la actividad:

1. Lee el artculo de Arana y colaboradores (2010) titulado Deslignificacin de pasta
kraft de Pinus radiata con una levadura genticamente modificada para producir
lacasa. Que puedes ubicar en la seccin Material de apoyo.

2. Con base en la lectura reflexiona en torno a las siguiente preguntas:

Cul es el objetivo de expresar el gen lacasa en la levadura en lugar de utilizar
directamente el hongo C. gallica?
Por qu utilizan plsmidos para realizar la expresin del gen en K. lactis?
Si observas las construcciones genticas de los plsmidos y lees atentamente el
texto, qu elementos estudiados en la presente unidad reconoces y cul ser
su funcin?
Finalmente, emite tu opinin acerca de las ventajas y/o desventajas de que los
Ingenieros en Biotecnologa utilicen esta tecnologa.

3. Ingresa al foro: Actividad 3. Importancia de la trascripcin y traduccin en la
ingeniera gentica. Y responde las preguntas planteadas.

4. Comenta al menos a dos de tus compaeros y responde a los cuestionamientos


Biologa molecular I
que ellos y tu Facilitador(a), te hagan.

5. Consulta la Rbrica de participacin general en foros que se encuentra en la
seccin Material de apoyo.

Recomendaciones:

a) Recuerda ser respetuoso y profesional.
b) Evita el plagio de los comentarios de tus compaeros
c) Procura que tu participacin sea original y pertinente de acuerdo al tema.
d) No olvides leer las participaciones de tus compaeros y realizar la
retroalimentacin correspondiente para que todos sean partcipes de tus ideas.

2.4 Regulacin gentica

Finalmente has llegado al ltimo tema de la unidad: la regulacin gentica, la cual se
refiere a los eventos para controlar la expresin de la informacin gentica y de ese
modo la cantidad de protenas presentes en la clula en un momento dado (Martinki,
2009). Ya que se analiz anteriormente, que no tener suficiente protena con una funcin
determinada puede conllevar a la muerte de la clula, pero producir en exceso es un
gasto muy alto de energa (1 molcula de ATP para unir el aminocido al ARNt y dos
molculas de GTP durante la traduccin). En este tema vas a estudiar cmo ocurre esta
regulacin en clulas procariotas y eucariotas centrndote en la regulacin de la
transcripcin. Pero antes, debes tener claro que esta regulacin gentica no es la nica
forma de regular la cantidad de protenas presente en la clula.

En primer lugar se puede regular la transcripcin del gen, de manera que si no existe no
podremos tener la protena. A continuacin podemos regular los procesos post-
transcripciones que se llevan a cabo as como la traduccin. Finalmente podemos regular
la protena una vez sintetizada de manera que se active o se desactiva rpidamente. En
este sentido, la fosforilacin y defosforilacin suelen ser los mecanismos ms utilizados
(Lehninger, 2009).


Biologa molecular I

Niveles de regulacin de la cantidad de protena activa. Fuente: Lehninger, 2009.
En referencia a su regulacin podemos encontrar genes constitutivos, inducibles y
reprimibles. Los primeros se caracterizan porque siempre se producen en la misma
cantidad sin importar las condiciones ambientales o el medio de cultivo. Algunos ejemplos
seran genes ribosomales o la produccin de actina o miosina ya que siempre se
necesitan en la clula. Los genes inducibles son aquellos que se empiezan a transcribir
cuando se le aade un compuesto (denominado inductor) a diferencia de los genes
reprimibles que se producen cuando se elimina un compuesto denominado represor,
como se observa en el siguiente esquema. (Lehninger, 2009).


Biologa molecular I

Regulacin de la transcripcin. A. Induccin, la expresin comienza cuando se
aade un inductor (en este caso lactosa). B. Represin, la expresin comienza
cuando se elimina el represor (en este caso el triptfano). Fuente: Curtis y col., 2008.
La regulacin de la expresin gentica ocurre de manera diferente en clulas procariotas
y en clulas eucariotas ya que, como vers a continuacin, los genes se acomodan de
manera diferente. En procariotas, un mismo promotor regula la expresin de varios genes
cosa que no ocurre en las clulas eucariotas. Por ello, realizars el anlisis por separado.

2.4.1 Regulacin en procariotas: los operones

En los procariotas es comn la existencia de operones, un grupo de genes que se
encuentran muy prximos y son regulados por un operador y un promotor (de Robertis y
Hib, 2005). Una imagen de su estructura se puede apreciar en la siguiente figura.

Estructura de opern bacteriano. Conjunto de genes que estn regulados por el
mismo operador y un mismo promotor. Fuente: Lehninger, 2009.
Para explicar cmo ocurre la regulacin de estos operones analizars un opern inducible
(el opern lac) y un opern reprimible (opern trp).


Biologa molecular I
Se iniciar con el opern lac, que est constituido por un promotor, un operador y 3
genes denominados lacZ, lacY y lacA. El gen lacZ codifica para la enzima -galactosidasa
que cataliza la reaccin de hidrlisis de la lactosa en glucosa y galactosa. El gen y que
codifica para la protena galactsido permeasa cuya funcin es facilitar el transporte de la
galactosa al interior de la bacterias y el gen a que codifica para una transferasa cuya
funcin no est relacionada con el metabolismo de la lactosa aunque se regulan del
mismo modo.

Cuando la clula est creciendo en un medio sin lactosa, no es necesaria la sntesis de
estas protenas por lo que su expresin es mnima (expresin basal) y el regulador est
ocupado por un represor que impide que la ARN-polimerasa pueda transcribir los genes.
En cambio, cuando la lactosa est presente en el medio de cultivo, sta se introduce al
interior celular (gracias a la expresin basal de la galactsido permeasa) y la
-galactosidasa (tambin por la expresin basal) metaboliza la lactosa en alolactosa que
se une al represor desactivndolo. De esta manera, la ARN-polimerasa est libre para
transcribir lo genes necesarios para la degradacin de este azcar y conseguir los
azcares (glucosa y galactosa) y obtener energa de su catabolismo,como se observa a
continuacin. (de Robertis y Hib, 2005).


Biologa molecular I

Regulacin del opern lac. A. Estructura del opern. B. Cuando no existe alolactosa
el represor est activo y no se produce la transcripcin de los genes. C. Cuando
existe alolactosa en el medio se une al represor de manera que se desactiva y la
transcripcin tiene lugar. Fuente: Proyecto Biosfera, s.f.
Ahora el siguiente es el opern reprimible trp. En este caso el operador regula la
expresin de genes involucrados en la sntesis de este aminocido y la situacin cambia
respecto al ejemplo anterior. Si la clula est creciendo en presencia de triptfano, no
necesita producir el aminocido. En cambio, cuando ste est ausente es necesaria su
sntesis para poder producir las protenas. De esta manera, cuando la clula crece en
presencia de triptfano, ste acta como co-represor unindose al represor activndolo de
manera que se impide la transcripcin. Cuando el aminocido est ausente, no existe co-


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represor de manera que el represor se desactiva y la transcripcin tiene lugar (de Robertis
y Hib, 2005).

Regulacin del opern reprimible Trp. Fuente: Basado en Figueroa, P., s.f.
Para finalizar conocers el mismo proceso de la regulacin pero ahora en las clulas
eucariotas.
2.4.2 Regulacin en eucariotas

En las clulas eucariotas los genes cuentan con su propio promotor. Los genes
constitutivos nicamente se activan con los factores de transcripcin basales (como lo
viste anteriormente) en cambio en los genes reprimibles o inducibles, lo factores de
transcripcin especficos tendrn un papel fundamental, (como se aprecia en la figura).
Su unin propiciar que se la ARN-polimerasa II reconozca (induccin) o no (represin) al
promotor (de Robertis y Hib, 2005).

Ausencia del triptfano
Represor inactivo
Sntesis de 5 protenas
Presencia del triptfano
Represor
Trp
(co-represor)
No hay transcripcin


Biologa molecular I

Accin de un factor de transcripcin especfico. Cuando se transcribe el regulador,
ste se une al promotor permitiendo el reconocimiento de la ARN-polimerasa II que
comienza la transcripcin. Fuente: de Robertis y Hib, 2005.
Aunque existen numerosos factores de transcripcin, stos comparten dominios con
estructuras secundarias y terciarias que nos permiten su clasificacin en un nmero
limitado de familias (de Robertis y Hib, 2005):

a. Hlice-vuelta-hlice. Esta estructura consta de dos cadenas de aminocidos con
forma de hlice separadas por una vuelta o cadena ms corta. Una de las hlices
se unen al regulador del gen y la otra mantiene la hlice en la posicin adecuada.
Comnmente esta protena est acompaada por otra simtrica formando
dmeros.

Dominio con forma de hlice-vuelta-hlice (en rojo) unida una molcula de
ADN (en morado). Fuente: Robertis y Hib, 2005.

b. Cremallera de leucina. Consta de dos cadenas polipptidicas en paralelo que
forman una hlice. Cada cadena posee dos sectores, uno que se une al ADN y
otro que lo hace con su homlogo para formar el dmero. Los sectores unidos
entre s presenta, cada 7 aa (que corresponden a dos vueltas de la hlice) una
leucina que da al interior.


Biologa molecular I

Dominio con forma de cremallera de leucina (en rojo) unida una molcula de

c. Dedos de zinc. Cada dominio est compuesto por una secuencia corta de
aminocidos y un tomo de zinc el cual se liga tetradricamente a cuatro cistenas
o dos cistenas y dos histidinas. Estas son las estructuras entre los factores de
transcripcin.

Dominio con forma de dedos de zinc (en rojo) unida una molcula de ADN
(en morado). Fuente: Robertis y Hib, 2005.

d. Hlice-bucle-hlice. Esta estructura (Figura 50) tiene una configuracin parecida
a la cremallera de leucina, con dos cadenas polipptidicas con dos sectores
funcionales cada una: el especfico rico en aminocidos bsicos (que se une al
ADN) y el responsable de la polimerizacin. Se diferencia de la cremallera de
leucina porque sus partes dimerizadas no se encastran.


Biologa molecular I
Dominio con forma de hlice-bucle-hlice (en rojo) unida una molcula de
Anteriormente se analiz la condensacin del ADN y viste que cuando est altamente
condensado (heterocromatina) parece que la transcripcin no tiene lugar, a diferencia de
la eucromatina donde el ADN se encuentra menos enrollado y la transcripcin tiene lugar.

Si recurdas, las histonas son protenas claves en el empaquetamiento del ADN y parece
que la acetilacin de las mismas (especficamente H3 y H4) disminuye el enrollamiento
de la cromatina lo que favorece la unin de los factores de transcripcin.

Por otro lado, hay otro mecanismo de regulacin gentica denominado metilacin de la
citosina (metilcitosina o mC) la cual ocurre en secuencias CG, de manera que en una
cadena de ADN est presente mC-G y en la cadena complementaria aparecer G-mC.
Cuando esta modificacin est presente en un promotor, la transcripcin se inhibe pero
cuando est presente en el gen, parece que no afecta a la sntesis de ARNm (de Robertis
y Hib, 2005).

Como ves, hay mltiples formas de regular la expresin gentica ya que es necesario
tener la cantidad exacta: si tienes poco puedes morir por falta de la protena que sintetice;
por ejemplo, si es clave en el catabolismo no podrs tener la energa que necesitas para
realizar tus funciones; o si est implicada en la estructura de algn organelo ste no
realizar su funcin correctamente. As mismo, tener una cantidad excesiva de la protena
en cuestin tambin es contraproducente, recuerdas cunta energa se gasta en la
sntesis de las protenas? Es por ello, que la regulacin es la clave del bienestar celular.

Si se conoce bien este proceso es posible manipular el medio o las condiciones de cultivo
para que nuestro organismo de estudio produzca la protena de inters. Por poner un
ejemplo, anteriormente se ha mencionado del inters industrial de enzimas como las
amilasas, cuya funcin es degradar el almidn liberando monmeros de glucosa. Este gen
est reprimido por glucosa (cuando est presente no se transcribe, en cambio cuando
est ausente la transcripcin tiene lugar). De esta manera, si queremos producir amilasas
en altas concentraciones es necesario eliminar la glucosa del medio de cultivo o nunca
podremos producirla y eso slo lo sabremos si conocemos cmo se regula el gen.

Con esto llegamos al final del desarrollo de esta unidad, ahora se te invita a realizar las
actividades que se prepararon para ti, te animas?

Autoevaluacin

Ahora para finalizar esta segunda unidad y con el propsito de apoyarte a identificar
aquellas reas de oportunidad, te proponemos que lleves a cabo tu autoevaluacin:


Biologa molecular I

1. Ingresa en el aula y selecciona la autoevaluacin de la Unidad 2.
2. Lee cuidadosamente las instrucciones para que formules tus respuestas.
3. Verifica tus respuestas y en los casos necesarios, repasa los temas que
necesites fortalecer.

El asimilar estos temas te permitirn entender los que se expone en la siguiente unidad
adems de brindarte elementos que complementan tu formacin profesional.

Evidencia de aprendizaje. Cul es el marco de lectura abierto del gen
de inters?

El propsito de esta actividad es deducir una secuencia proteica de un gen determinado,
tal como lo hiciste en la actividad 1, pero esta vez lo hars utilizando el software Translate
Tool; ya que cuando el gen tiene 2 o 3 kb la deduccin manual puede ser muy
complicada.

Para ello, realiza las siguientes acciones:

1 Revisa, el tutorial Translate Tool que se encuentra disponible en el Material de apoyo.

2 Ingresa a la pgina de ExPaSy. Disponible en: http://web.expasy.org/translate

3 Realiza la traduccin de la siguiente secuencia de ADN que corresponde a una
proteasa Amanita muscaria (con 1403 pb):

CCTTGGGTTGCAAGAATCGGCACGAGCTCACATGTCCAACAAACTTGCTCTGCTGGT
CAGTGTGGCACTTTCACTCCTTGTCATCGCCGCTCCCCTTCCCGAATCGGGTGTCGC
CGTACCCATCCGTAAACGTGCCTGTCGTTTGACCGACGCAAACGGCGTGTTCGATCA
TGACAAAGCCGTAAGGGCGACCGTTCTTCTGAAGAACAAGCATCGCCAGAACCTGAT
CAACCTTCGGAACAATCGAGGCCTTGACGCCTTCTCCAAGGGCGCTCGGATTCTACC
CATTGCACGGCTACCCCGCCTCGTCAACACACGATTGCAACGACGCCAATCTGAACC
TCTCACCGACCAAAACGGTGATACTGAATGGACAGGAACGATCTCAATAGGCACACC
TGGTACAGAGTTCTTGATCGACTTTGATACCGGCTCTTCCGATCTCTGGGTACCATCC
GCAGCTTGCTCCAGCTCAATTTGCGAGCCCAAGCACAAGTACGATCCTACTGCCTCC
AGCACCTCTCAACTGCAGAATGGAACATTCACTATCCAATATGGCGACAAGTCAACCG
TTTCGGGCCCAGTGTACACTGATGCAGTCAATGTTGCTGGTGTCCAGGTGACAGGTC
AATATCTCTCTCCGGTCACAAATCTTTCATCGACCTTTGGTACCGATCCTATCGACGG
GCTTCTCGGCCTGGCCTTCCCTGCGATCTCAAACATGAAACAAAGCCCATTCTTCAAC
ACCGCCATCGCACAAGGCAGCGTGTCAAAACCCAGCTTTGGTTTTAAACTCGCCAAA
AACGATTCAGAACTTTACCTGGGCGGTGCCAAATGCAAGCTTTACACCGGGGCCATT
GAATCGCACAGCCTTTCTTCCACCACTGGGTACTGGCAAATTGGCAACGCCTCCATTT
CCGTAGGCGGACAAACCCCAGTATTTCAGTTTGAAACCATTATCGATTTTGGCACAAC
TGTTATTTACGGGCCCGCTGACGGTGTCCAGCAACTTTACGGGTCAGTACCTGGAGC
TACTTTGTTTGATTCATCGAACGGGTTTTATTCGTTCCCGTGTGACTCTGTTCCCTCTG


Biologa molecular I
TTTCGTTCAACTGGGGTGGTCAGGATTGGCCTATTACATCGGACAACTTCAATATGGG
AGAAACGACAAAGGGATTTGGTCAATGGGTTGGCGCTATCGCTGCTCAAAATTTTGGT
TTAGGCAGTAAAGTTTGGGTTTTTGGCGACAGCTTTATTAAAAACGTTTACAGTGGTTT
TGACTTTGGGTCAAATTCAGTTGGGTTTGCTACTTTGGCATAACGAGGGAAGGTTAAT
TTACGTTTGTTGGACCTTTTGAGTGGACAAAAATTTCACTGTTTGGTGGGATCTGCTTT
CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

El software te arrojar como resultado 6 secuencias de protenas. Con esta informacin
realiza el siguiente trabajo:

4 Antes de realizar tu secuencia utilizando el software, recuerda cada proceso
elaborando un mapa conceptual de una clula eucariota.
5 Indica la secuencia de protena que consideres que corresponde a la traduccin del
gen en estudio. Recuerda que los genes cuentan con ORF y UTRs 5 y 3 y el software
traduce la secuencia completa. Justifica tu respuesta.

6 El software arroja 6 secuencias de protenas, por qu crees que realiza esta accin?
Recuerda incluir en el trabajo que significa el resaltado en rojo, ya que el texto est en
ingls. Justifica tu respuesta.

7 Finalmente, este proceso ocurre porque el software realiza la transcripcin y la
traduccin terica de la secuencia. Realiza un mapa conceptual de cada proceso en
una clula eucariota.

Recuerda utilizar un vocabulario amplio, redactar correctamente cada prrafo
y no cometer faltas de ortografa.
Incluye la bibliografa que has utilizado en formato APA.

8 Anexa al final del trabajo una impresin de pantalla con las seis secuencias
resultantes.

9 Guarda tu trabajo con la siguiente nomenclatura: BBM1_U2_EA_XXYZ.

10 Sube tu evidencia de aprendizaje al portafolio para recibir la retroalimentacin por
parte de tu Facilitador(a).

11 Atiende los comentarios de tu Facilitador(a) y en caso de ser necesario, enva una
nueva versin.

12 Consulta la escala de evaluacin para que conozcas los criterios bajo los cuales se
evaluar tu evidencia.

*Tu documento no debe pesar ms de 4 MB.


Biologa molecular I
Autorreflexiones

Adems de enviar tu trabajo de la Evidencia de aprendizaje, ingresa al foro Preguntas de
Autorreflexin y consulta las preguntas que tu Facilitador(a) presente, a partir de ellas
elabora tu Autorreflexin en un archivo de texto llamado BBM2_U2_ATR_XXYZ.

Posteriormente enva tu archivo mediante la herramienta Autorreflexiones.

Cierre de la unidad

Durante el desarrollo de esta unidad tuviste oportunidad de conocer que la sntesis de
protenas es un proceso clave para la vida celular y ste ocurre a travs de varios
procesos: la transcripcin (seguida de las modificaciones post-transcripcionales en
las clulas eucariotas), la traduccin y las modificaciones post-traduccionales.

As mismo, advertiste que la regulacin es igual o ms importante que el mismo proceso
de sntesis de protenas ya que recuerda que tener poco nos puede llevar a la muerte
pero sintetizar de ms es realizar un gasto de energa muy alto que podra ser utilizado en
otros procesos como la reproduccin. Todo ello, lo has ido analizando a travs de los
diferentes ejemplos y actividades que te permitieron aplicar los conocimientos adquiridos.

As mismo, este conocimiento te permite como Ingeniero en Biotecnologa manipular las
condiciones ambientales o la composicin del medio de cultivo para que el organismo de
inters produzca una mayor concentracin de la protena de inters. As como elegir
correctamente los elementos genticos que se deben utilizar para poder expresar un gen
ya sea en el mismo organismo (expresin homloga) o en otro microorganismo
(expresin heterloga) utilizando tcnicas de Ingeniera Gentica.


Biologa molecular I

Para saber ms

Para comprender mejor los temas que se han expuesto en esta unidad se te recomienda
revisar las siguientes fuentes:

1 Curtis, E., Barnes, S.N., Schnek, A. (2008) Biologa (7 ed.). Argentina: Mdica
Panamericana. Revisa los captulos 13, 14 y 17. Es un libro bsico de biologa pero
para un primer acercamiento acerca de los procesos de sntesis de protenas, puede
ser de gran ayuda.
2 De Robertis, E., Hib, J. (2005) Fundamentos de Biologa Celular y Molecular (4 ed.).
Argentina: El Ateneo. Este libro se me hace muy interesante ya que la informacin
viene bastante resumida pero muy clara y completa adems de que las figuras apoyan
el texto para un mejor entendimiento. Particularmente, revisa los captulos 14, 15 y 16.
3 http://es.scribd.com/doc/23794366/Tips-de-arn En esta pgina encontrars
informacin sobre la estructura y los tipos de ARN presentes en las clulas.
4 http://www.inmegen.gob.mx/es/divulgacion/glosario-de-terminos Encontrars
definiciones sobre varios trminos utilizados en esta unidad como ARN, ARN,
mensajero, expresin gentica, transcripcion, traduccin, etc. Con videos sencillos que
nos ayudan a entender cada concepto.
5 http://sintesis-jmr.blogspot.mx/2010/11/arn-mensajero-arn-de-transferencia-html se
definen, muy brevemente, cada uno de los tres ARNs ms importantes involucrados
en la sntesis de protenas.
6 http://www.maph49.galeon.com/sinte/addaa.html se muestra el esquema y una breve
explicacin de la funcin de la enzima Aminoacil-ARNt-sintetasa en la unin del
aminocido al ARNt.
7 http://www.aulanets.net/WQ/transcripcion/lectura.html En esta pgina se hace un
anlisis breve de la transcripcin en las clulas procariotas.
8 http://acasti.webs.ull.es/docencia/Tercer%20parcial/lista%20de%20temas/tema27/tem
a27.pdf Esta pgina est bastante completa y habla de la transcripcin en clulas
procariotas.
9 http://docencia.izt.uam.mx/japg/RedVirtualJAP/CursoDRosado/5_BiologiaMolecular/3-
Transcripcion3enEucariotes.pdf Cambiando a la transcripcin de las clulas
eucariotas, no puedes dejar de visitar esta pgina ya que el proceso est muy
completo.
10 http://pendientedemigracion.ucm.es/info/genetica/grupod/Transcripcion/Transcripcion.
htm Esta pgina analiza la transcripcin con sus diferentes pasos y te explica los
diferentes mecanismos para finalizar el proceso.
11 http://storage.canalblog.com/29/38/269315/85665721.pdf En esta pgina, nicamente
aparece un esquema con las diferencias entre la transcripcin de las clulas
procariotas y eucariotas pero que es importante analizar.


Biologa molecular I
12 http://www.fbmc.fcen.uba.ar/materias/g1/genetica/teoricas/Regulacion-2do-2010-
parte2.pdf Aqu encontraras una presentacin muy completa que explica los procesos
post-transcripcionales (adicin de CAP, splicing y adicin de poliA).
13 http://docencia.izt.uam.mx/japg/RedVirtualJAP/CursoDRosado/5_BiologiaMolecular/4-
ProcesamientoRNAm.pdf Tambin encontrars una presentacin sobre el
procesamiento del ARNm muy interesante e incluso est mejor explicada que la
anterior.
14 http://genetica2012.wikispaces.com/intron Explica qu son los intrones y cmo se
eliminan por el proceso de splicing. Aunque est muy resumido considero que es
bastante claro.
15 http://www.bionova.org.es/biocast/tema19.htm Esta pgina de Alejandro Porto Andin
es muy completa y habla desde un poco de historia, algunos experimentos claves en
la Biologa Molecular, hasta la replicacin, expresin gentica y su regulacin. Por
favor, no dejes de revisar este documento tan interesantes, completo y bien explicado.
16 http://faciasweb.uncoma.edu.ar/academica/materias/morfo/ARCHIVOPDF6/PARTE8/D
UPLICACIoN3_codigo_genetico.pdf Aqu encontrars una explicacin del cdigo
gentico y sus caractersticas ms importantes.
17 http://biologocalentano.blogspot.mx/2012/05/722-estructura-ribosomal.html Si quieres
conocer un poco mejor la estructura de los ribosomas tanto procariotas como
eucariotas, no dudes en visitar esta pgina donde la informacin es bastante
completa.
18 http://mipaginapersonal.movistar.es/web3/mantmedina/flujo.htm Aunque la informacin
est muy resumida, aqu puedes encontrar definiciones sencillas de trasncripcin y
traduccin pero lo que es interesante son los videos que incluye ya que te ayudarn a
reforzar tus conocimientos.
19 http://temasdebioquimica.wordpress.com/2008/10/01/estructura-primaria-de-las-
proteinas/ Si no recuerdas bien la estructura de los aminocidos y cmo ocurren los
enlaces peptdicos, visita esta pgina, incluso tiene un video de cmo ocurre el enlace
entre el amino-terminal de una aminocido y el carboxilo-terminal del aminocido con
el que se va unir.
20 http://genomasur.com/lecturas/Guia11.htm Este es otra pgina que no puedes dejar
de visitar. Habla sobre la Naturaleza molecular del gen y del genoma y describe
desde la estructura del ADN hasta la sntesis de protenas, sin omitir la regulacin de
la expresin gnica y cmo ocurren los procesos post-traduccionales incluyendo el
plegamiento de las protenas.
21 http://212.128.130.23/eduCommons/ciencias-biosanitarias/bioquimica-biosintesis-de-
macromoleculas/contenidos/11.%20Plegamiento%20de%20Proteinas.pdf Tambin
una pgina interesante donde encontrars una presentacin donde se analiza el
plegamiento de las protenas.
22 http://www.iqb.es/cbasicas/fisio/cap04/cap4_1.htm Necesitas recordar cmo estn
constituidas las clulas eucariotas y cul es la funcin de cada organelo? Visita esta
pgina. Recuerda que la secrecin de protenas involucra el Retculo endoplasmtico


Biologa molecular I
Rugoso y el Aparato de Golgi por lo que tendrs que refrescar la informacin que se
analiz de ambos en la materia de Biologa Celular.
23 http://recursostic.educacion.es/ciencias/biosfera/web/alumno/2bachillerato/genetica/co
ntenido13.htm Si no te ha quedado claro cmo funcionan los operones bacterianos y
cmo se regulan, visita esta pgina, te ayudar.
24 http://pathmicro.med.sc.edu/spanish/chapter9.htm Esta pgina, al igual que la
anterior, explica cmo funcionan los operones bacterianos.
25 Lehninger, A. (2009). Bioqumica. Mxico: Omega. Aunque es un libro enfocado a
Bioqumica ms que a Biologa Molecular, se explican los procesos que hemos
analizado en esta unidad. Particularmente en los captulos 25, 26 y 27.
26 Lewin, B. (2008) Genes IX, Mxico: McGraw-Hill/Interamericana. Este es uno de los
libros ms completos que existen sobre Biologa Molecular, continuamente salen
nuevas versiones que incluyen los nuevos descubrimientos.
27 Lodish, H., Berk, A., Zipursky, S.L., Matsudaira, P., Baltimore, D., Darnell, J. (2005)
Biologa Celular y Molecular (5 ed.). Argentina: Mdica Panamericana. Si algn da
tiene oportunidad, este libro es muy bueno. La explicacin es clara y adems viene
acompaado de un CD con animaciones que te ayudan a entender cmo funciona una
clula.
28 Martinki, J. (2009) Brock Biologa de los Microorganismos. (12
a
ed.) EEUU: Addison-
Wesley. Con este libro, ocurre algo parecido a Curtis y colaboradores (2008); aunque
es de Microbiologa, los conceptos bsicos puede ser de utilidad. Revisa los captulos
7, 8 y 10.

29 Peteira, B., Rodrguez, M.G., Rosales, C. Salazar, E. (2008). Uso de tcnicas
moleculares en la identificacin de nematodos entomopatgenos y sus bacterias
simbiontes. INIA HOY 3: 1-16. Aunque la revisin est centrada en la identificacin de
nematodos, las tcnicas que se analizan en este texto se utilizan para la identificacin
de cualquier organismo eucariota.
30 Rodicio, M. R. y Mendoza, M. C. (s. f.) Identificacin bacteriana mediante
secuenciacin del ARNr 16S: fundamento, metodologa y aplicaciones en
microbiologa clnicas. En: Puesta al da en mtodos microbiolgicos para el
diagnstico clnico. Captulo 11, pp. 81-87. Recuperado de:
http://www.icb.uncu.edu.ar/upload/rodiciocap11.pdf . Este artculo es muy interesante
y te habla de la utilizacin de los genes ribosomales para la identificacin de las
bacterias.

Fuentes de consulta

Bsicas:

1. Alberts, B., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., Walter, P. (2010) Biologa
Molecular de la Clula, (5 ed.) EEUU: Garland Publishing. ISBN: 9788428215077.


Biologa molecular I
2. Curtis, E., Barnes, S.N., Schnek, A. y Massarini. (2008) Biologa. (7 ed.)
Argentina: Mdica Panamericana. ISBN: 9789500603348.
3. Berg, J.M., Tymoczko, J.L., Stryer, L. (2007) Bioqumica. Espaa: Revert. ISBN:
9788429176001.
4. de Robertis, E., Hib, J. (2005) Fundamentos de Biologa Celular y Molecular de
Robertis. (4 ed.). Argentina: El Ateneo. ISBN 9789500203845
5. Lehninger, A. L. (2009). Bioqumica. Mxico: Omega. ISBN: 9788428214865
6. Lewin, B. (2008) Genes IX. Mxico: McGraw-Hill/Interamericana. ISBN: 978-
0763740634.
7. Lodish, H., Berk, A., Zipursky, S.L., Matsudaira, P., Baltimore, D., Darnell, J. (2005)
Biologa Celular y Molecular. (5 Ed.), Argentina: Mdica Panamericana. ISBN
9789500613743.
8. Martinki, J. (2009) Brock Biologa de los Microorganismos. (12a Ed.). EEUU:
Addison-Wesley. ISBN: 9788478290970.

Complementarias:

1 ARN-Polimerasa bacteriana. [Imagen]. Modificada de:
http://www.aulanet.net/WQ/transcripcion/lectura.html
2 Bilogo calentano. (2012, Mayo 13). [Imagen sin ttulo de descripcin del trabajo].
Recuperado de: http://biologocalentano.blogspot.mx/2012/05/722-estructura-
ribosomal.html
3 Curso de fisiologa. (s.f.). Proceso de secrecin de protenas.
[Imagen].Recuperado de http://www.iqb.es/cbasicas/fisio/cap04/cap4_1.htm
4 Figueroa, P. (s.f.). Regulacin del opern reprimible Trp. [Imagen]. Recuperado de:
http://pathmicro.med.sc.edu/spanish/chapter9.htm
5 Galen.com, hispavista (s.f.). Funcin de la Aminoacil-ARNt-sintetasa. [Imagen].
Recuperado de: http://www.maph49.galeon.com/sinte/addaa.html
6 INMEGEN. (2012). Estructura del ARNm presente en una clula eucariota.
[Imagen]. Recuperado de: http://www.inmegen.gob.mx/es/divulgacion/glosario-de-
terminos
7 Mansfield, M. y Seogchan, K. (s.f). Estructura de los genes ribosmicos en
eucariotas. [Imagen]. Recuperado de:
http://www.phytophthoradb.org/protocols.php
8 Mazenett, R. y Zarante, I. (s.f.). [Imagen sin ttulo de descripcin del trabajo].
Recuperado de: http://genetica2012.wikispaces.com/intron
9 Plano, A. y Leone, M. J., (s. f.). Procesos post-transcripcionales. [Imagen].
Recuperado de: (http://aportes.educ.ar/biologia/nucleo-teorico/estado-del-
arte/como-se-encienden-y-apagan-los-genes-el-dogma-central-de-la-biologia-
paso-a-paso/transcripcion.php?page=2
10 Porto, A. (s.f.). Ejemplo de splicing alternativo. [Imagen]. Recuperado de:
http://www.bionova.org.es/biocast/tema19.htm


Biologa molecular I
11 PQbi. Por qu biotecnologa. (s.f.). Cuaderno 124. El ARN. [Imagen]. Programa
educativo de ArgenBio. Recuperado de:
http://www.porquebiotecnologia.com.ar/index.php?action=cuaderno&opt=5&tipo=1
&note=124
12 Proyecto Biosfera. (s.f.). El opern [Imagen]. Recuperado de:
http://recursostic.educacion.es/ciencias/biosfera/web/alumno/2bachillerato/genetic
a/contenido13.htm
13 Robert. (2010, Noviembre 26). Estructura de un ARNt. [Imagen]. En: Sntesis
proteica. (Blog). Recuperado de: http://sintesis-jmr.blogspot.mx/2010/11/arn-
mensajero-arn-de-transferencia.html
14 Sabbatino, V., Lassalle, A., Gladys Glvez, G. y Mrquez, S. (s.f.). Accin de las
chaperonas en el plegamiento de las protenas. [Imagen]. Recuperado de:
http://genomasur.com/lecturas/Guia11.htm
15 storage.canalblog. (s.f.). Diferencias entre transcripcin de clulas procariotas y
eucariotas. [Imagen]. Recuperado de:
http://storage.canalblog.com/29/38/269315/85665721.pdf
16 Temas de bioqumica. (2008, Octubre 1). Estructura primaria de las protenas.
[Imagen] en blog]. Recuperado de:
http://temasdebioquimica.wordpress.com/2008/10/01/estructura-primaria-de-las-
proteinas/
17 UCM. (s.f.). Esquema de la transcripcin y la traduccin en la bacteria E. coli.
[Imagen]. Recuperado de:
http://pendientedemigracion.ucm.es/info/genetica/grupod/Transcripcion/Transcripci
on.htm#Procesamiento
18 UCM. (s.f.). Secuencias terminadoras ricas en pares G-C que forman un lazo en
horquilla, seguidas de 6 a 8 uracilos. Y Terminacin dependiente de rho. [Imagen].
Recuperado de:
http://pendientedemigracion.ucm.es/info/genetica/grupod/Transcripcion/Transcripci
on.htm#Procesamiento
19 UCM. (s.f.). Autoprocesamiento de un intrn del grupo II. [Imagen]. Recuperado
de:http://pendientedemigracion.ucm.es/info/genetica/grupod/Transcripcion/Transcri
pcion.htm#Procesamiento
20 UMBIO. (s.f.). Regiones UTR y ORF de un gen. Recuperado de:
http://www.bio.miami.edu/dana/250/250S12_12.html
21 Wolfe. (s.f.). B. Micrografa de un polisoma. [Imagen]. Recuperado de:
http://web.usal.es/~rororo/pract3/paginas/nucleolo13.htm
22 Worthington, Biochemical Corporation. (s.f.). Las ARNasas rompen los enlaces
fosfodister de los ribonucletidos terminales de las molculas de ARN. [Imagen].
Recuperado de http://www.worthington-biochem.com/rnase/

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