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cido ribonucleico

ARN redirige aqu. Para otras acepciones, vase ARN (desambiguacin).


RNA redirige aqu. Para otras acepciones, vase RNA (desambiguacin).
El cido ribonucleico (ARN o RNA) es un cido nucleico formado por una cadena de ribonucletidos. Est presente tanto en las clulasprocariotas como en
las eucariotas, y es el nico material gentico de ciertos virus (virus ARN). El ARN celular es lineal y de hebra sencilla, pero en el genoma de algunos virus es de
doble hebra.En los organismos celulares desempea diversas funciones. Es la molcula que dirige las etapas intermedias de la sntesis proteica; el ADN no puede
actuar solo, y se vale del ARN para transferir esta informacin vital durante la sntesis de protenas (produccin de las protenas que necesita la clula para sus
actividades y su desarrollo). Varios tipos de ARN regulan la expresin gnica, mientras que otros tienen actividadcataltica. El ARN es, pues, mucho ms verstil
que el ADN.
Descubrimiento e historia
Estructura qumica de un ribonucletido.
Los cidos nucleicos fueron descubiertos en 1868 por Friedrich Miescher, que los llam nuclena ya que los aisl del ncleo celular.
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Ms tarde, se comprob que
las clulas procariotas, que carecen de ncleo, tambin contenan cidos nucleicos. El papel del ARN en la sntesis de protenas fue sospechado en 1939.
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Severo
Ochoa gan el Premio Nobel de Medicina en 1959 tras descubrir cmo se sintetizaba el ARN.
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En 1965 Robert W. Holley hall la secuencia de 77 nucletidos de un ARN de transferencia de una levadura,
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con lo que obtuvo el Premio Nobel de Medicina
en 1968. En 1967, Carl Woese comprob las propiedades catalticas de algunos ARN y sugiri que las primeras formas de vida usaron ARN como portador de la
informacin gentica tanto como catalizador de sus reacciones metablicas (hiptesis del mundo de ARN).
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En 1976, Walter Fiers y sus colaboradores
determinaron la secuencia completa del ARN del genoma de un virus ARN (bacterifago MS2).
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En 1990 se descubri en Petunia que genes introducidos pueden silenciar genes similares de la misma planta, lo que condujo al descubrimiento del ARN
interferente.
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Aproximadamente al mismo tiempo se hallaron los micro ARN, pequeas molculas de 22 nucletidos que tenan algn papel en
el desarrollode Caenorhabditis elegans.
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El descubrimiento de ARN que regulan la expresin gnica ha permitido el desarrollo de medicamentos hechos de ARN,
como los ARN pequeos de interferencia que silencian genes.
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Estructura qumica
Comparativa entre ARN y ADN
Como el ADN, el ARN est formado por una cadena de monmeros repetitivos llamados nucletidos. Los nucletidos se unen uno tras otro mediante
enlaces fosfodister cargados negativamente.
Cada nucletido est formado por una molcula de monosacrido de cinco carbonos (pentosa) llamada ribosa(desoxirribosa en el ADN), un grupo fosfato, y uno
de cuatro posibles compuestos nitrogenados llamados bases: adenina, guanina, uracilo (timina en el ADN) y citosina.
Comparacin entre el ARN y el ADN

ARN ADN
Pentosa Ribosa Desoxirribosa
Purinas Adenina y Guanina Adenina y Guanina
Pirimidinas Citosina y Uracilo Citosina y Timina
Los carbonos de la ribosa se numeran de 1' a 5' en sentido horario. La base nitrogenada se une al carbono 1'; el grupo fosfato se une al carbono 5' y al carbono 3'
de la ribosa del siguiente nucletido. El pico tiene una carga negativa a pH fisiolgico lo que confiere al ARN carcter polianinico. Las bases pricas (adenina y
guanina) pueden formar puentes de hidrgeno con las pirimidnicas (uracilo y citosina) segn el esquema C=G y A=U.
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Adems, son posibles otras interacciones,
como el apilamiento de bases
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o tetrabucles con apareamientos G=A.
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Muchos ARN contienen adems de los nucletidos habituales, nucletidos modificados, que se originan por transformacin de los nucletidos tpicos; son
caractersticos de los ARN de transferencia (ARNt) y el ARN ribosmico (ARNr); tambin se encuentran nucletidos metilados en el ARN mensajero eucaritico.
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Estructura secundaria[editar]
A diferencia del ADN, las molculas de ARN son de cadena simple y no suelen formar dobles hlices extensas. No obstante, s se pliega como resultado de la
presencia de regiones cortas con apareamiento intramolecular de bases, es decir, pares de bases formados por secuencias complementarias ms o menos
distantes dentro de la misma hebra. El ARNt posee aproximadamente el 60% de bases apareadas en cuatro brazos con estructura de doble hlice.
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Una importante caracterstica estructural del ARN que lo distingue del ADN es la presencia de un grupo hidroxil en posicin 2' de la ribosa, que causa que las
dobles hlices de ARN adopten una conformacin A, en vez de la conformacin B que es la ms comn en el ADN.
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Esta hlice A tiene un surco mayor muy
profundo y estrecho y un surco menor amplio y superficial.
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Una segunda consecuencia de la presencia de dicho hidroxilo es que los enlaces fosfodister del
ARN de las regiones en que no se forma doble hlice son ms susceptibles de hidrlisis qumica que los del ADN; los enlaces fosfodister del ARN se hidrolizan
rpidamente en disolucin alcalina, mientras que los enlaces del ADN son estables.
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La vida media de las molculas de ARN es mucho ms corta que las del
ADN, de unos minutos en algunos ARN bacterianos o de unos das en los ARNt humanos.
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Estructura terciaria
Estructura terciaria de un ARNt
La estructura terciaria del ARN es el resultado del apilamiento de bases y de los enlaces por puente de hidrgeno entre diferentes partes de la molcula. Los
ARNt son un buen ejemplo; en disolucin, estn plegados en forma de "L" compacta estabilizada por apareamientos de Watson y Crick convencionales (A=U,
C=G) y por interacciones de bases entre dos o ms nucletidos, como tripletes de bases; las bases pueden donar tomos dehidrgeno para unirse al esqueleto
fosfodister; el OH del carbono 2' de la ribosa es tambin un importante dador y aceptor de hidrgenos.
Biosntesis[editar]
Artculo principal: Transcripcin gentica
La biosntesis de ARN est catalizada normalmente por la enzima ARN polimerasa que usa una hebra de ADN como molde, proceso conocido con el nombre
de transcripcin. Por tanto, todos los ARN celulares provienen de copias de genes presentes en el ADN.
La transcripcin comienza con el reconocimiento por parte de la enzima de un promotor, una secuencia caracterstica de nucletidos en el ADN situada antes del
segmento que va a transcribirse; la doble hlice del ADN es abierta por la actividad helicasa de la propia enzima. A continuacin, la ARN polimerasa progresa a lo
largo de la hebra de ADN en sentido 3' 5', sintetizando una molcula complementaria de ARN; este proceso se conoce como elongacin, y el crecimiento de la
molcula de ARN se produce en sentido 5' 3'. La secuencia de nucletidos del ADN determina tambin dnde acaba la sntesis del ARN, gracias a que posee
secuencias caractersticas que la ARN polimerasa reconoce como seales de terminacin.
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Tras la transcripcin, la mayora de los ARN son modificados por enzimas. Por ejemplo, al pre-ARN mensajero eucariota recin transcrito se le aade un
nucletido de guanina modificado (7-Metilguanosina) en el extremo 5' por medio de un puente de trifosfato formando un enlace 5' 5' nico, tambin
conocido como "capucha" o "caperuza", y una larga secuencia de nucletidos de adenina en el extremo 3' (cola poli-A); posteriormente se le eliminan
los intrones (segmentos no codificantes) en un proceso conocido como splicing.
En virus, hay tambin varias ARN polimerasas ARN-dependientes que usan ARN como molde para la sntesis de nuevas molculas de ARN. Por ejemplo, varios
virus ARN, como los poliovirus, usan este tipo de enzimas para replicar su genoma.
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Tipos de ARN[editar]
El ARN mensajero (ARNm) es el tipo de ARN que lleva la informacin del ADN a los ribosomas, el lugar de la sntesis de protenas. La secuencia de nucletidos del
ARNm determina la secuencia de aminocidos de la protena.
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Por ello, el ARNm es denominado ARN codificante.
No obstante, muchos ARN no codifican protenas, y reciben el nombre de ARN no codificantes; se originan a partir de genes propios (genes ARN), o son los
intrones rechazados durante el proceso de splicing. Son ARN no codificantes el ARN de transferencia (ARNt) y el ARN ribosmico (ARNr), que son elementos
fundamentales en el proceso de traduccin, y diversos tipos de ARN reguladores.
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Ciertos ARN no codificantes, denominados ribozimas, son capaces de catalizar reacciones qumicas como cortar y unir otras molculas de ARN,
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o
formar enlaces peptdicos entreaminocidos en el ribosoma durante la sntesis de protenas.
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ARN implicados en la sntesis de protenas[editar]
ARN mensajero[editar]
El ARN mensajero (ARNm o RNAm) lleva la informacin sobre la secuencia de aminocidos de la protena desde el ADN, lugar en que est inscrita, hasta
el ribosoma, lugar en que se sintetizan las protenas de la clula. Es, por tanto, una molcula intermediaria entre el ADN y la protena y apelativo de "mensajero"
es del todo descriptivo. En eucariotas, el ARNm se sintetiza en el nucleoplasma del ncleo celular y donde es procesado antes de acceder alcitosol, donde se
hallan los ribosomas, a travs de los poros de la envoltura nuclear.
ARN de transferencia[editar]
Los ARN de transferencia (ARNt o tRNA) son cortos polmeros de unos 80 nucletidos que transfiere un aminocido especfico al polipptido en crecimiento; se
unen a lugares especficos del ribosoma durante la traduccin. Tienen un sitio especfico para la fijacin del aminocido (extremo 3') y unanticodn formado por
un triplete de nucletidos que se une al codn complementario del ARNm mediante puentes de hidrgeno.
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ARN ribosmico o ribosomal[editar]
El ARN ribosomico o ribosomal (ARNr o RNAr) se halla combinado con protenas para formar los ribosomas, donde representa unas 2/3 partes de los mismos. En
procariotas, la subunidad mayor del ribosoma contiene dos molculas de ARNr y la subunidad menor, una. En los eucariotas, la subunidad mayor contiene tres
molculas de ARNr y la menor, una. En ambos casos, sobre el armazn constituido por los ARNr se asocian protenas especficas. El ARNr es muy abundante y
representa el 80% del ARN hallado en el citoplasma de las clulas eucariotas.
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Los ARN ribosmicos son el componente cataltico de los ribosomas; se encargan
de crear los enlaces peptdicos entre los aminocidos del polipptido en formacin durante la sntesis de protenas; actan, pues, como ribozimas.
ARN reguladores[editar]
Muchos tipos de ARN regulan la expresin gnica gracias a que son complementarios de regiones especficas del ARNm o de genes del ADN.
ARN de interferencia[editar]
Los ARN interferentes (ARNi o iRNA) son molculas de ARN que suprimen la expresin de genes especficos mediante mecanismos conocidos globalmente
como ribointerferencia o interferencia por ARN. Los ARN interferentes son molculas pequeas (de 20 a 25 nuclotidos) que se generan por fragmentacin de
precursores ms largos. Se pueden clasificar en tres grandes grupos:
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Micro ARN[editar]
Los micro ARN (miARN o RNAmi) son cadenas cortas de 21 22 nucletidos hallados en clulas eucariotas que se generan a partir de precursores especficos
codificados en el genoma. Al transcribirse, se pliegan en horquillas intramoleculares y luego se unen a enzimas formando un complejo efector que puede
bloquear la traduccin del ARNm o acelerar su degradacin comenzando por la eliminacin enzimtica de la cola poli A.
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ARN interferente pequeo[editar]
Los ARN interferentes pequeos (ARNip o siARN), formados por 20-25 nucletidos, se producen con frecuencia por rotura de ARN virales, pero pueden ser
tambin de origen endgeno.
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Tras la transcripcin se ensambla en un complejo proteico denominado RISC (RNA-induced silencing complex) que identifica el
ARNm complementario que es cortado en dos mitades que son degradadas por la maquinaria celular, bloquean as la expresin del gen.
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ARN asociados a Piwi[editar]
Los ARN asociados a Piwi
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son cadenas de 29-30 nucletidos, propias de animales; se generan a partir de precursores largos monocatenarios (formados por una
sola cadena), en un proceso que es independiente de Drosha y Dicer. Estos ARN pequeos se asocian con una subfamilia de las protenas "Argonauta"
denominada protenas Piwi. Son activos las clulas de la lnea germinal; se cree que son un sistema defensivo contra los transposones y que juegan algn papel
en la gametognesis.
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ARN antisentido[editar]
Un ARN antisentido es la hebra complementaria (no codificadora) de un hebra ARNm (codificadora). La mayora inhiben genes, pero unos pocos activan la
transcripcin.
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El ARN antisentido se aparea con su ARNm complementario formando una molcula de doble hebra que no puede traducirse y es degradada
enzimticamente.
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La introduccin de un transgen codificante para un ARNm antisentido es una tcnica usada para bloquear la expresin de un gen de inters.
Un mARN antisentido marcado radioactivamente puede usarse para mostrar el nivel de transcripcin de genes en varios tipos de clulas. Algunos tipos
estructurales antisentidos son experimentales, ya que se usan como terapia antisentido.
ARN largo no codificante[editar]
Muchos ARN largos no codificantes (ARNnc largo o long ncARN) regulan la expresin gnica en eucariotas;
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uno de ellos es el Xist que recubre uno de los
dos cromosomas X en las hembras de los mamferos inactivndolo (corpsculo de Barr).
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Riboswitch[editar]
Un riboswitch es una parte del ARNm (cido ribonucleico mensajero) al cual pueden unirse pequeas molculas que afectan la actividad del gen.
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Por tanto,
un ARNm que contenga un riboswitch est directamente implicado en la regulacin de su propia actividad que depende de la presencia o ausencia de la
molcula sealizadora. Tales riboswitchs se hallan en la regin no traducida 5' (5'-UTR), situada antes del codn de inicio (AUG), y/o en la regin no traducida 3'
(3'-UTR), tambin llamada secuencia de arrastre,
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situada entre el codn de terminacin (UAG, UAA o UGA) y la cola poli A.
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ARN con actividad cataltica[editar]
Ribozimas[editar]
El ARN puede actuar como biocatalizador. Ciertos ARN se asocian a protenas formando ribonucleoprotenas y se ha comprobado que es la subunidad de ARN la
que lleva a cabo las reacciones catalticas; estos ARN realizan las reacciones in vitro en ausencia de protena. Se conocen cinco tipos de ribozimas; tres de ellos
llevan a cabo reacciones de automodificacin, como eliminacin de intrones o autocorte, mientras que los otros (ribonucleasa P y ARN ribosmico) actan sobre
substratos distintos.
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As, la ribonucleasa P corta un ARN precursor en molculas de ARNt,
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mientras que el ARN ribosmico realiza el enlace peptdico durante
la sntesis proteica ribosomal.
Espliceosoma[editar]
Los intrones son separados del pre-ARNm durante el proceso conocido como splicing por los espliceosomas, que contienen numerosos ARN pequeos
nucleares (ARNpn o snRNA).
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En otros casos, los propios intrones actan como ribozimas y se separan a si mismos de los exones.
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ARN pequeo nucleolar[editar]
Los ARN pequeos nucleolares (ARNpno o snoRNA), hallados en el nuclolo y en los cuerpos de Cajal, dirigen la modificacin de nucletidos de otros ARN;
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el
proceso consiste en transformar alguna de las cuatro bases nitrogenadas tpicas (A, C, U, G) en otras. Los ARNpno se asocian con enzimas y los guan
aparendose con secuencias especficas del ARN al que modificarn. Los ARNr y los ARNt contienen muchos nucletidos modificados.
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ARN mitocondrial[editar]
La mitocondrias tienen su propio aparato de sntesis proteica, que incluye ARNr (en los ribosomas), ARNt y ARNm. Los ARN mitocondriales (ARNmt o mtARN)
representan el 4% del ARN celular total. Son transcritos por una ARN polimerasa mitocondrial especfica.
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Genomas de ARN[editar]
El ADN es la molcula portadora de la informacin gentica en todos los organismos celulares, pero, al igual que el ADN, el ARN puede guardar informacin
gentica. Los virus ARN carecen por completo de ADN y su genoma est formado por ARN, el cual codifica las protenas del virus, como las de la cpside y
algunos enzimas. Dichos enzimas realizan la replicacin del genoma vrico. Los viroides son otro tipo de patgenos que consisten exclusivamente en una
molcula de ARN que no codifica ninguna protena y que es replicado por la maquinaria de la clulahospedadora.
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Hiptesis del mundo de ARN[editar]
Artculo principal: Hiptesis del mundo de ARN
La hiptesis del mundo de ARN propone que el ARN fue la primera forma de vida en la Tierra, desarrollando posteriormente una membrana celular a su
alrededor y convirtindose as en la primera clula. Se basa en la comprobacin de que el ARN puede contener informacin gentica, de un modo anlogo a
como lo hace el ADN, y que algunos tipos son capaces de llevar a cabo reacciones metablicas, como autocorte o formacin de enlaces peptdicos.
Durante aos se especul en qu fue primero, el ADN o las enzimas, ya que las enzimas se sintetizan a partir del ADN y la sntesis de ADN es llevada a cabo por
enzimas. Si se supone que las primeras formas de vida usaron el ARN tanto para almacenar su informacin gentica como realizar su metabolismo, se supera
este escollo. Experimentos con los ribozimas bsicos, como elARN viral Q-beta, han demostrado que las estructuras de ARN autorreplicantes sencillas pueden
resistir incluso a fuertes presiones selectivas (como los terminadores de cadena de quiralidadopuesta).
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Problemas de nomenclatura[editar]
Aunque en todo el mundo hispano ARN significa "cido Ribonucleico", internacionalmente esas siglas significan "Adenosn RiboNucletido". Se debe tener en
cuenta que el mundo de la investigacin se mueve en ingls, y en ese idioma cualquiera que vea ARN entender Adenosn Ribonucletido, siendo el cido
ribonucleico RNA.
ARN mensajero
El ARN mensajero (ARNm o mRNA, este ltimo de su nombre en ingls) es el cido ribonucleico que contiene la informacin gentica (el cdigo gentico)
procedente del ADN del ncleo celular a un ribosoma en el citoplasma, es decir, el que determina el orden en que se unirn los aminocidos de una protena y
acta como plantilla o patrn para la sntesis de dicha protena.
1
Se trata de un cido nucleico monocatenario, al contrario del ADN, que es bicatenario (de doble
hebra helicoidal).
Todos los ARNm eucariticos son monocistrnicos, es decir, contienen informacin para una sola cadena polipeptdica, mientras que en los
organismos procariotas los ARNm son con frecuenciapolicistrnicos, es decir, codifican ms de una protena.
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El ARN mensajero obtenido despus de la transcripcin se conoce como ARN transcrito primario o ARN precursor o pre-ARN, que en la mayora de los casos no
se libera del complejo de transcripcin en forma totalmente activa, sino que ha de sufrir modificaciones antes de ejercer su funcin
(procesamiento o maduracin del ARN). Entre esas modificaciones se encuentran la eliminacin de fragmentos (splicing), la adicin de otros no codificados en el
ADN y la modificacin covalente de ciertas bases nitrogenadas. Concretamente, el procesamiento del ARN en eucariotas comprende diferentes fases:
1. Adicin al extremo 5' de la estructura denominada caperuza o casquete (o CAP, su nombre en ingls), que es un nucletido modificado deguanina,
la 7-metilguanosina trifosfato, que se aade al extremo 5' de la cadena del ARNm transcrito primario (ubicado an en el ncleo celular) mediante un
enlace 5'-fosfato 5'-fosfato, en lugar del enlace 3',5'-fosfodister habitual.
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Esta caperuza es necesaria para el proceso normal detraduccin del
ARN y para mantener su estabilidad; esto es fundamental para el reconocimiento y el acceso apropiado del ribosoma.
2. Poliadenilacin: es la adicin al extremo 3' de una cola poli-A, una secuencia larga de poliadenilato, es decir, un tramo de ARN cuyas bases son
todas adenina. Su adicin est mediada por una secuencia o seal de poliadenilacin (AAUAAA), situada unos 11-30 nucletidos antes del extremo 3'
original. Esta cola protege al ARNm frente a la degradacin, y aumenta su vida media en el citosol, de modo que se puede sintetizar mayor cantidad
de protena.
3. En la mayora de los casos, el ARN mensajero sufre la eliminacin de secuencias internas, no codificantes, llamadas intrones. Esto no ocurre en clulas
procariontes, ya que estas no poseen intrones en su ADN. El proceso de retirada de los intrones y conexin o empalme de losexones se
llama ayuste o corte y empalme (en ingls, splicing). A veces un mismo transcrito primario o pre-ARNm se puede ayustar de diversas maneras, y
permite que con un solo gen se obtengan varias protenas diferentes; a este fenmeno se le llama ayuste alternativo. Ciertas enzimas parecen estar
involucradas en la edicin del ARN antes de su exportacin fuera del ncleo, intercambiando o eliminando nucletidos errneos. Por esta razn, es
posible decir que el plegamiento que sufre el ARNm momentos antes de la eliminacin de los intrones le confiere una estructura secundaria que
perder, a su vez, en el momento en el que esos intrones sean eliminados.
4. El ARN mensajero maduro es trasladado al citosol de la clula, en el caso de los organismos eucariontes, a travs de poros de la membrana nuclear.
5. Una vez en el citoplasma, se acoplan al ARNm los ribosomas, que son la maquinaria encargada de la sntesis proteica. En procariontes, la unin de los
ribosomas ocurre mientras la cadena de ARNm est siendo sintetizada.
6. Despus de cierta cantidad de tiempo, el ARNm se degrada en sus nucletidos componentes, generalmente con la ayuda de ribonucleasas.
ARN mensajero en clulas procariotas[editar]
El proceso de transcripcin y el de traduccin se realizan de manera similar que en las clulas eucariotas. La diferencia fundamental est en que, en las
procariotas, el ARN mensajero no pasa por un proceso de maduracin y, por lo tanto, no se le aade caperuza ni cola ni se le quitan intrones. Adems, no tiene
que salir del ncleo como en las eucariotas, porque en las clulas procariotas no hay un ncleo definido.
ARN mensajeros monocistrnicos y policistrnicos[editar]
ARNm monocistrnico: solo tiene un codn de inicio AUG, que es reconocido por los ribosomas para iniciar la traduccin, por lo que solo da lugar a una
protena. Se dice que lleva la informacin de un nico gen. Es habitual en eucariotas.
ARNm policistrnico: tiene varios codones de inicio AUG (por lo que tambin harn falta varios codones de paro para detenerlos, a menos que tengan
solapado el cdigo de lectura y vayan de 3 en 3, en cuyo caso un solo codn de paro podra detenerlos todos), por lo que da lugar a varias protenas. Se
dice que lleva informacin de varios genes. Es habitual en procari