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INTRODUCCION A LA PROTEINAS

Las protenas son biomleculas formadas bsicamente por carbono, hidrgeno,


oxgeno y nitrgeno. Pueden adems contener azufre y en algunos tipos de protenas, fsforo,
hierro, magnesio y cobre entre otros elementos.
Las protenas proporcionan estructuras, catalizan reacciones celulares y llevan a cabo
multitud de tareas. Su papel central en la clula !ueda refle"ado en el hecho !ue la
informacin gentica se expresa en forma de protenas. #xiste para cada protena un segmento
de $%& !ue codifica la informacin !ue especifica su secuencia de aminocidos.
FUNCIONES
* Enzimas Protenas variadas y altamente especializadas, con actividad cataltica para las
reacciones !umicas de las biomolculas orgnicas en forma especfica.
* Transporte Protenas de transporte del plasma sanguneo !ue fi"an y transportan
molculas o iones especficos de un rgano a otro.
' Hemoglobina( en los eritrocitos fi"a el )* a medida !ue pasa la sangre pasa a travs de los
pulmones, lo transporta a los te"idos perifricos y all lo libera para !ue participe en la
oxidacin de los nutrientes para la produccin de energa.
- Lipoprotenas: en el plasma transportan lpidos desde el hgado a otros rganos.
- Protenas de Membrana: adaptadas para fi"ar glucosa, aminocidos u otras sustancias y
transportarlas a travs de la membrana.
+ Nutricin y Resera ! Ovoalbmina( protena de la clara de huevo.
- Casena( protena de la leche
- Ferritina( en bacterias y en te"idos animales y vegetales almacenan hierro.
* Estructura"es confieren la capacidad de moverse, contraerse, cambiar de forma.
' Actina y Miosina: sist. contrctil del m,sculo es!ueltico y otras clulas no musculares.
' Tblina( forma los microt,bulos y estos act,an con la !ineina de los flagelos y cilios.
-ilamentos de soporte, !ue confieren fuerza o proteccin a las estructuras biolgicas.
' Col"geno( componente de tendones y cartlagos, posee una resistencia elevada a la tensin
' #lastina: ligamentos, !ue se extienden en * dimensiones
' $eratina: pelo, u.as, plumas
+ De#ensa contra la invasin por otras especies o protegen contra las heridas.
' %nmnogloblinas- Anticerpos: fabricada por los linfocitos, pueden reconocer y precipitar o
neutralizar bacterias, virus o protenas invasoras.
' Fibrin&geno- Trombina /enzimas0( coagulacin, impiden perdida de sangre al da.o vascular.
+ Re$u"acin 1ormonas( regulan la actividad celular o fisiolgica.
' %nslina: regula metabolismo glucocdico
' Protenas ': fi"an 2%P y facilitan la respuesta a muchas se.ales hormonales
NO%ENCLATURA
Se suelen clasificar de acuerdo a los siguientes criterios(
+ Se$&n tama'o(
P(ptidos - Oligop(ptidos: / *'34 aminocidos0 #"( $spartamo /*aa0, )xitocina /5 aa0
' Polip(ptidos: )*+-*++ aa, #"( 2lucagn
Protenas: )*+++--+++ aa,
* Se$&n canti)a) )e ca)enas po"ipept*)icas(
Monom(ricas( constan de una sola cadena, como la mioglobina, citocromo 6
Oligom(ricas( constan de varias cadenas. Las distintas cadenas polipeptdicas se
llaman su+uni)a)es y se unen a travs de enlaces no covalentes, y pueden ser iguales o
distintas entre s. 7n e"emplo es la ,emo$"o+ina, formada por 8 subunidades.
+ Se$&n su #orma(
Fibrosas( Presentan cadenas polipeptdicas largas y una tpica estructura segundaria.
Son insolubles en agua y en soluciones acuosas. $lgunos e"emplos de estas son la !ueratina y
colgeno. Por lo general, tienen funciones estructurales.
'loblares( Se caracterizan por doblar apretadamente sus cadenas en una forma
esfrica apretada o compacta. #"emplo de stas son la mayora de las enzimas, anticuerpos,
algunas hormonas, protenas de transporte.
+ Se$&n su composicin -u*mica(
.imples holoprotenas( Su hidrlisis slo produce aminocidos. #"emplos de estas
son la insulina y el colgeno /fibrosas y globulares0.
Con/gadas o heteroprotenas( Su hidrlisis produce aminocidos y otras sustancias no
proteicas 92rupo prosttico: /slo globulares0.
OJO= segn las diapositivas las simples corresponden a las apoproteinas y las
holoproteinas serian las conjugadas.
PROTE.NAS CON/U0ADAS
6L$S# 2;7P) P;)S<=<>6) #?#@PL)
Lipoprotenas Lipidos A
3
'Lipoproteina de la sangre
2lucoprotenas 2l,cidos >g 2
-osfoprotenas 2rupo fosfatos 6aseina
1emoprotenas 1emo /-erroporfirina0 1emogobina
-lavoprotenas &ucleotidos de flavina Succinato deshidrogenasa
@etaloproteinas 1e'Bn'6a'@b'6u -erritina' 6almodulina
ESTRUCTURA 1ASICA DE LAS PROTE.NAS A%INOACIDOS
#xisten *4 aminocidos diferentes y todos ellos tienen una parte com,n en su molcula
!ue consisten en un grupo amino /&1C0 y un grupo cido /6))10, unidos al mismo tomo
de 6arbono /6D0 . Se pueden representar como &1
*
'61;'6))1, siendo ; un radical o
cadena lateral caracterstico de cada aminocido.
#xisten * enanti&meros /imagen especulares no superponibles, pero !ue tienen las
mismas propiedades fsicas y !umicas, excepto por la interaccin con el plano de la luz
polarizada0 posibles, pero solo la forma L, se encuentra presente en las protenas.

Neurotransmisores( 2$E$ /derivado de glutamina0' Serotonina /triptfano0
2ormonas ( <iroxina /tirosina0 ' $cido indol actico /triptfano0
Interme)iarios meta+"icos( 6itrulina' )rnitina
Se clasifican seg,n sus radicales ;. 1ay varios tipos(
ESTADO DE IONI3ACION
Los aminocidos pueden tener carga neta positiva, negativa o cero.
Portan por lo menos * grupos cidos dbiles ionizables F6))1 y F&1
C
G.
+ #l grupo carboxilo de los aa se comporta como cido(
6))1 6))
'
G 1
G
pHa
+ #l grupo amino, actua como base(
&1
C
G
&1
*
G 1
G
pHb
$ p1 del plasma y l!uido intracelular /I,8 y I,30, predominan las formas 6))
'
y &1
C
G
.
Se utilizan como
mensa"eros o
precursores o
mensa"eros metablicos
APOLARES
' 2licina
' $lanina
' Jalina
' Leucina
' @etionina
' >soleucina
ARO%ATICOS
' <irosina
' <riptofano
' -enilalanina
ACIDOS
' $c. $sprtico
' $c. 2lutmico
POLARES
' Serina
' <reonina
' 6isteina
' Prolina
' $paragina
' 2lutamina
1ASICOS
' $rginina
' 1istidina
' Lisina
$minocidos
proteicos
$minocidos no #stndar
$minocidos
$ceptores de protones(
6))
'
&1
*

Las fuerzas relativas de los cidos dbiles son expresadas en trminos de sus
constantes de disociacin de cidos pHa
pH3 /carboxilo0 *'C Si el p1 K *'C el grupo carboxilo estar protonado.
Si el p1 L *'C el grupo carboxilo estar desprotonado.
pH* /amino0 5'33 Si el p1 K 5'33 el grupo amino estar protonado.
Si el p1 L 5'33 el grupo amino estar desprotonado
PUNTO ISOEL4CTRICO 5PI6
#xiste un valor de p1 caracterstico para cada aa, en el cual la disociacin de cargas
positivas y negativas se iguala y por lo tanto, la carga total del aa es nula. $ este valor de p1
se le denomina punto isoelectrico /p>0 y el aa se encuentra en la forma de Zwitterion.
6orresponde al valor medio de los pHa !ue se encuentran a ambos lados de la especie
isoelctrica.
' Para aa neutros corresponde al valor medio de los pH3 y pH*. #xisten solo *
grupos disosiables
#"( p> para la $lanina Si pH3M *.CN y pH*M 5.O5
pI M *.CN G 5.O5 M O.4*
*
' Para aa cidos o bsicos, depende de cada caso. <omandose los valores ms
cercanos. #xisten ms de * grupos disosiables
#"( p> para el $c. $sprtico Si pH3M *.45, pHr M C.PO y PQ*M 5.P*
pI M *.45 G C.PO M *.5P
*
p2 +a7o, la mayor parte
de los grupos disociables estarn
protonados, y por lo tanto habr
un gran n,mero de car$as
positias en la protena

p2 e"ea)o, los grupos
disociables no estarn
protonados, con lo cual habr
mayor n,mero de car$as
ne$atias
&eutro

1o"a plegada
1o"a plegada
1lice alfa
1lice alfa
$minocidos
FOR%ACI8N DEL ENLACE PEPT.DICO
Los L'D'aminocidos se unen mediante enlaces peptdicos, para formar los pptidos.
La unin entre dos aminocidos, se establece
entre el grupo carboxilo /'6))10 de un
aminocido y el grupo amino /'&1*0 del
aminocido inmediato, con la prdida de una
molcula de agua.
#l enlace peptdico tiene un comportamiento
similar al de un enlace doble, es decir, presenta una
cierta rigidez !ue inmoviliza en un plano los tomos
!ue lo forman
6orresponde a una reacci&n de
condensaci&n0
P;)P>#%$%#S
R #s rgido y planar.
R <iene carcter parcial de doble enlace.
R #!uilibrio de estructuras resonantes.
R &o tiene libertad de giro.
R #s mas corto !ue otros enlaces 6'&.
R Se presenta normalmente en transformacin 9<rans:.
R Los grupos 6M) y &' 1 son polares y participan en la formacin de puentes de hidrgeno.
ESTRUCTURAS DE LAS PROTEINAS
La organizacin de una protena viene definida por cuatro niveles estructurales.
R #s la secuencia especfica y ordenada de aa !ue componen la cadena polipeptdica de una
protena.
R Los aa como ya vimos estn unidos por enlaces covalentes( enlace peptdico o amida.
-ormacin de un grupo amida.

paralela
R Las protenas homlogas tienen secuencias y funciones seme"antes.
R La comparacin de secuencias permite establecer relaciones evolutivas.
R Las mutaciones corresponden a variaciones en la secuencia(
S Los aa invariables son importantes para la funcin.
S Las mutaciones conservadoras son cambios entre aa !umicamente seme"antes.
S 1ay mutaciones !ue se relacionan con enfermedades a nivel molecular Patologa
molecular
R #s la disposicin de la secuencia de aminocidos en el espacio /Plegamiento0.
R Se logra gracias a la capacidad de giro de sus enlaces !ue van ad!uiriendo una disposicin
espacial estable
R #l carcter de doble unin parcial entre el grupo carbonilo al nitrgeno D de la unin
peptdica restringe de manera significativa las conformaciones posibles, debido a
impedimentos estricos entre los grupos F&1, '6) y ;.
R Lo rotacin slo puede darse alrededor de las uniones entre el 6D y el carbono carbonilo
/6o0 y al nitrgeno.
R Por lo tanto depende de los valores de T y U(
$ngulo alrededor de la unin 6D '& fi /T0
$ngulo alrededor de la unin 6D F 6o psi /U0
R #l Dia$rama )e Ramac,an)ran ilustra las conformaciones permitidas !ue caracterizan a
los dos tipos de estructura(
S hlice D
S lmina V antiparalela
R Las conformaciones ms favorables dependen de la secuencia de aa y se estabilizan por
enlaces no covalentes(
S Puentes de 1idrgeno existe en un n,mero muy elevado.
S >nteracciones 1idrfobas o van der Waals aa con cadenas laterales apolares.
S >nteracciones #lectroestticas o Puentes salinos grupos carboxilo y amino.
1lice D
R La cadena polipeptdica se enrolla en espiral sobre s misma debido a los giros producidos en
torno al carbono alfa de cada aminocido. Se mantiene gracias a los enlaces de hidrgeno
formados entre el grupo '&1 de un enlace peptdico y el grupo '6M) del cuarto aminoacido
!ue le sigue.
R #n las protenas no tienen lugar las hlices con giro hacia la iz!uierda.
R Las cadenas laterales se dirigen hacia fuera, lo !ue permite una mnima repulsin y posibles
interacciones entre ellas.
R 6asi todos los grupos peptdicos participan en los enlaces 1.
R #xisten algunos residuos !ue desestabilizan la hlice D(
S 2licina &o tiene ;, por lo tanto otorga demasiada flexibilidad
S Prolina restringe el giro de TX no tiene F&1 para formar puentes de 1.
S ;esiduos voluminosos <riptfano

R #n algunos casos existen enlaces covalentes(
S Puentes disulfuro
1o"a V
R 6onservan su estructura primaria en zigzag y se asocian estableciendo uniones mediante
enlaces de hidrgeno entre F6) y F&1 de cadenas adyecentes.
R Las cadenas laterales se disponen perpendicularmente a la ho"a.
R #s una conformacin simple formada por dos o ms cadenas polipeptdicas V (
S paralelas !ue corren en el mismo sentido
S antparalelas !ue corren en direcciones opuestas
R %isposicin de la estructura secundaria de un polipptido al plegarse sobre s misma
originando una conformacin globular, tridimensional
R Se mantiene por enlaces no covalentes(
S >nicos
S 1idrofbicos
S Puentes de 1idrgeno
S -uerzas de Jan der Waals

R #structura compacta !ue excluye las molculas de agua de su interior.
R #n el interior se agrupan residuos hidrofbicos y al exterior los grupos polares.
R La ausencia de agua facilita las interacciones inicas y los enlaces de hidrgeno.
R Las protenas grandes suelen presentar Dominios estructura"es(
S Son unidades estructuralmente independientes !ue presentan caractersticas y
funciones definidas como la unin con ligandos especficos.
S )tros e"emplos( @ano #- /configuracin hlice'vuelta'hlice0 se une a 6aGG
%edo de Bn en protenas !ue unen $%&.
R 7nin mediante enlaces dbiles /no covalentes0 de varias cadenas polipeptdicas con
estructura terciaria, para formar as un comple"o proteico. 6ada una de estas cadenas
polipeptdicas recibe el nombre de protmero.
R Las subunidades se organizan de manera simtrica.
R 8 protmeros por e"emplo forman la 1emoglobina /*D*V0
R Proporcionan mayor estabilidad y regulacin alostrica
R Se estabilizan a travs de las mismas fuerzas !ue la estructura terciaria.
DENATURACI8N DE PROTE.NAS
R 6onsiste en la prdida de la estructura terciaria, por romperse los puentes !ue forman dicha
estructura.
R 7na protena soluble en agua cuando se desnaturaliza se hace insoluble en agua y precipita.
R Se produce por agentes !ue interfieren en las fuerzas de estabilizacin( variacin de p1,
temperatura, detergentes /hidrofbicos0, @ercaptoetanol /enlace disulfuro0, agitacin.
R La estructura primaria se mantiene intacta.
R #n la estructura secundaria las protenas pierden todos los patrones de repeticin regulares
como las alfa'hlices y adoptan formas aleatorias.
R La mayora de las protenas biolgicas pierden su funcin biolgica, por e"emplo, las
enzimas pierden su actividad cataltica, por!ue los sustratos no pueden unirse ms al sitio
activo.
R #s un proceso !ue puede ser reversible
S La desnaturalizacin de cidos nucleicos como el $%& por altas temperaturas,
produce una separacin de la doble hlice, !ue ocurre por!ue los enlaces puente hidrgeno se
rompen. Los filamentos del cido nucleico vuelven a unirse una vez !ue las condiciones
YnormalesY se restauran, pero si las condiciones son restauradas demasiado rpidamente, las
cadenas pueden no alinearse correctamente.

SEPARACI8N 9 PURIFICACI8N DE PROTE.NAS PARA ANALISIS
Se utiliza la 6entrifugacin !ue es el mtodo ms com,n de separacin. #n este
mtodo, el tubo de centrfuga se llena con una mezcla uniforme problema. <ras la
centrifugacin se obtienen dos fracciones( un pellet !ue contiene el material sedimentado y un
sobrenadante con el material no sedimentado.
Luego se aprovechan las propiedades de las protenas en solucin para separar mezclas
de stas basndose en su(
<ama.o /peso0 molecular
Solubilidad
6arga elctrica
$finidad biolgica por otras molculas.
Las separaciones analticas se realizan fundamentalmente por(
Cromato$ra#*a( separa los componentes de una mezcla por su afinidad relativa a *
fases, una mvil y otra estacionaria
E"ectro#oresis( separa los componentes en base a sus caractersticas de carga yZo
tama.o.
Los cidos nucleicos ya disponen de una carga elctrica negativa, !ue los dirigir al
polo positivo, mientras !ue las protenas se cargan con sustancias como el S%S /detergente0
!ue incorpora cargas negativas de una manera dependiente del peso molecular. Para la
separacin se usa un gel de poliacrilamida. $l poner la mezcla de molculas y aplicar un
campo elctrico, stas se movern y debern ir pasando por la malla, por la !ue las pe!ue.as
se movern me"or, ms rpidamente. $s, las ms pe!ue.as avanzarn ms y las ms grandes
!uedarn cerca del lugar de partida
[ Di:"isis
Las protenas globulares se separan en disolucin utilizando una membrana
semipermeable para retener molculas de protena, permitiendo !ue las molculas pe!ue.as
de soluto y de agua las atraviesen.

[ U"tra#i"tracin
Se utiliza la presin de la fuerza centrfuga para hacer pasar por una membrana
semipermeable agua y molculas pe!ue.as, reteniendo a las protenas.
<ama.o
[ Centri#u$acin en $ra)iente )e )ensi)a);
Se usa una solucin de sacarosa cuya concentracin vara de *4 al O4\, se
puede separar una mezcla de protenas, !ue al centrifugar, se separaran en bandas, seg,n su
tama.o, forma y densidad.
[ Cromato$ra#*a )e e<c"usin mo"ecu"ar Fi"tracin en $e"
Se utiliza como matriz un gel con esferas !ue poseen poros en su interior, entonces las
molculas pe!ue.as penetran en los poros, en cambio las molculas grandes, incapaces de
penetrar por los poros, solo se mueven entre las bolas, donde la velocidad de solvente es
superior.
6omo consecuencia, las molculas de mayor peso, son eluidas antes.
[ Precipitacin con su"#ato )e amonio
Las sales neutras afectan la solubilidad de las protenas globulares(
$ K concentraciones, las salesL la solubilidad de las protenas ya !ue se induce la ionizacin
de los grupos ; disociables de la protena.
[ So"u+i"i)a) )i#erencia" por )i#erentes so"entes
$dicin de solventes orgnicos con el agua, como lo son el etanol y la acetona
disminuye la solubilidad de la mayor parte de las protenas globulares, de tal forma !ue
precipitan.

[ Cromato$ra#*a )e Intercam+io Inico
Se basa en la atraccin entre iones del soluto y puntos cargados !ue existen en la fase
estacionaria.
#n unas condiciones determinadas sern retenidas en la columna las protenas !ue
tengan una carga complementaria a la de la matriz del gel /las protenas cargadas
negativamente sern retenidas por una matriz cargada positivamente0, siendo eluidas las
restantes.
[ E"ectro#oresis se$&n En#o-ue Isoe"=ctrico
Se separan las protenas en un gel donde se ha establecido un gradiente de p1 y
al aplicar el campo elctrico, las protenas van a migrar hasta la zona del gel donde el p1 sea
igual a su punto isoelctrico y en ese punto se detendr
Solubilidad
6arga #lctrica

[ Cromato$ra#*a )e A#ini)a)
Los bolas del gel estan recubiertas de un ligando por el !ue tiene afinidad algunas de
las protenas a aislar. $l pasar la mezcla comple"a, sta protena es retenida en la superficie de
las bolas, fluyndose las demas.
%4TODOS PARA LAS DETER%INACIONES ESTRUCTURALES DE PROTE.NAS
%ifraccin de ;ayos'] /6ristalografia0 slidos, estructura tridimensional
#spectroscopia circular del dicrosmo #structura *ria
#spectroscopia determinacin de cantidades muy pe!ue.as
;esonancia magntica nuclear/&@;0 espectroscopia provee informacin acerca de los
tomos
RELACI8N ESTRUCTURA!FUNCI8N
Las protenas estn compuestas por cadenas de pptidos !ue para poder desempe.ar su
funcin biolgica deben plegarse de una determinada manera, adoptando una forma
tridimensional estable. 6uando una protena pierde su estructura tridimensional, por
denaturacin tambin pierde su funcin, provocando una P$<)L)2>$.
La concentracin de una protena es el resultado de un balance entre la velocidad de
sntesis y degradacin de la misma.
Transporte )e O<*$eno 1emoglobina /8 subunidades0 F @ioglobina /3 subunidad0
7na modificacin en la estructura de la hemoglobina, como alteraciones en la cadena
beta de la hemoglobina puede provocar la prdida de funcin de la misma.
Por e"emplo(
[ $nemia @editerrnea o <alasemia V( produccin defectuosa de hemoglobina !ue
lleva a una disminucin en la produccin y un aumento de la destruccin de los glbulos
ro"os.
$finidad
In#i"tracin en $e" Intercam+io
inico
Cromato$ra#*a por
a#ini)a)
[ $nemia -alciforme o 1emoglobina S( mutacin en donde el $cido 2lutmico es
sustituido por Jalina de la cadena E. 6uando la hemoglobina S se desoxigena disminuye su
solubilidad y precipita dentro del hemate y da lugar a la formacin de una red gelatinosa,
produciendo eritrocitos rgidos y en forma de hoz, con menor capacidad de transporte de )
*
)tro e"emplo de alteraciones estructurales es la Prote*na Prion
Su accin patgena consiste en ser una forma modificada de una protena natural
existente en el organismo !ue al entrar en contacto con las protenas originales las induce a
adoptar la forma del prin, !ue suele ser una forma anormal y disfuncional, todo ello en una
accin en cadena !ue acaba por destruir la operatividad de todas las protenas sensibles al
prin.
PROTE.NAS PLAS%>TICAS
Son todas a!uellas protenas !ue estn presentes en el plasma y !ue e"ercen presin
osmtica, con lo !ue son parte importante en la distribucin del agua entre el plasma y los
l!uidos titulares.
Para su anlisis hay !ue tener en cuenta(
Funcin Prote*na
<ransporte $lb,mina,
$polipoprotena,
transferan
>nmunidad >nmunoglobulinas
@anutencin P^ )smtica <odas, principalmente
$lb,mina
#nzimas ;enina,
-actores de 6oagulacin
>nhibidores de proteasas $ntitripsina D3
;egulacin del p1 /tampn0 <odas
[ 6oncentracin de protenas totales
Jelocidad de sntesis o degradacin proteica
6ambios en el volumen de distribucin
[ Solo la variacin de las protenas plasmticas mas abundantes /alb,mina' >g0
tendrn un efecto significativo