PLANO DE ESTUDOS DOUTORADO PLENO

PROGRAMA CINCIA SEM FRONTEIRAS CAPES/CNPQ

Modelagem de sensores biolgicos e desenvolvimento de circuitos eletrnicos para
neuroprteses

THIAGO LIMA LOUBACK
30/09/2013




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Sumrio
I. Introduo e Justificativa .................................................................................................. 3
II. Objetivos ........................................................................................................................... 5
III. Metodologia ...................................................................................................................... 7
IV. Indicao das instituies de destino no exterior ............................................................. 8
V. Cronograma do plano de atividades ............................................................................... 11
VI. Bibliografia de referncia ................................................................................................ 12


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I. Introduo e Justificativa
A rea de engenharia de reabilitao trabalha pesquisando e desenvolvendo
solues para repor parcialmente/totalmente funes perdidas por partes do corpo. Os
focos dessa rea de pesquisa so variados, desde biomateriais implantveis at
prteses de longo prazo de durao. A maior parte das inovaes advindas dessa
rea utiliza dispositivos conhecidos como interfaces crebro-mquina (ICMs).
ICMs so uma comunicao direta entre dispositivos eletrnico-computacionais
e redes neurais e so comumente utilizadas para assistir ou reparar funes cognitivas
ou motoras (Vallabhaneni et al. 2005). Os primeiros desenvolvimentos nessa rea
eram focados nas neuroprteses para audio, viso e movimento. Neuroprteses so
ligaes entre o crebro e um dispositivo capaz de substituir a funo de uma parte
danificada ou perdida do crebro, enquanto ICMs esto relacionadas, atualmente, s
ligaes entre o crebro e um sistema computadorizado, permitindo criar uma
interface com o sistema nervoso central. ICMs so usados tanto em humanos quanto
em animais e funcionam a partir da possibilidade de se captar os sinais eltricos
decorrentes da atividade do crebro (e.g. eletroencefalograma (EEG), potenciais de
campo local, potenciais evocados, multi-unitrio multi-eletrodo, etc.) (Vidal 1977).
A partir da aquisio de dados neurais, construo de ICMs para processar os
sinais externos e insero de eletrodos no crebro, pode-se estimular eletricamente
grupos especficos de neurnios, evocando processos sensoriais e mimetizando as
funes de sensores biolgicos. A estimulao eltrica (EE) cerebral consiste na
insero de um dipolo eltrico no parnquima cerebral no intuito de gerar potenciais de
ao nos neurnios subjacentes ao eletrodo. Por meio da passagem de uma corrente
eltrica pelo dipolo, controlada para minimizar leso ou dano das clulas cerebrais,
ocorre uma despolarizao do potencial transmembrnico dos neurnios resultando na
ativao de neurnios e fibras de passagem devido gerao dos potenciais de ao.
(Salzman et al 1990; Romo et al 1998; Graziano et al 2002; Cohen and Newsome
2004; Otto et al 2005; Afraz et al 2006; Pezaris and Reid 2007). Desta forma, a EE se
torna uma ferramenta extremamente til para viabilizar a produo de prteses com
sensores artificiais.
No desenvolvimento da monografia de graduao, trabalhei em um projeto cujo
objetivo era utilizar uma ICM em conjunto com um sistema de processamento de
sinais e estimulao eltrica ligada cabea de um rato para criar um sistema
sensorial artificial. Esse sistema foi utilizado para condicionar o comportamento motor
de ratos em um labirinto a partir da exposio dos animais a emissores de infra-
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vermelho presentes no labirinto. Em meu projeto de doutorado, gostaria de continuar
meu desenvolvimento nessa rea, focando na modelagem de sensores do corpo e na
construo de ICMs ou neuroprteses funcionais, com o objetivo de traduzir conceitos
cientficos em aplicaes prticas, colaborando com estudos clnicos e a indstria na
produo de prteses para humanos.
Estou especialmente interessado em projetos nessa rea devido possibilidade
real de desenvolver produtos capazes de auxiliar pessoas com perdas funcionais.
Apesar de existirem vrios produtos atualmente disponveis no mercado, voltados
principalmente para audio, muita pesquisa ainda pode ser feita para melhorar o
desempenho desses produtos e aumentar as chances de sucesso em pacientes. Parte
dos avanos precisa ser feita em determinar como os sensores do corpo funcionam
nos humanos, visto que grande parte das pesquisas realizada com animais. Outro
grande avano vem da construo de circuitos de microeletrnica para processamento
de sinal digital e sua integrao com sistemas neuronais existentes. O encontro destes
temas e a possibilidade de trabalhar unindo engenharia e biomedicina so o que mais
me atraem nos programas de doutorado da rea.

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II. Objetivos
Durante o desenvolvimento de tecnologias para implantes e prteses, a
compreenso do funcionamento dos complexos sistemas humanos uma das tarefas
mais rduas. Muitas pesquisas foram feitas desde as primeiras tentativas de produzir
prteses para reposio de membros, tanto em relao aos materiais utilizados quanto
em relao sua integrao com o corpo humano. No entanto, o caminho a ser
traado em direo obteno de dispositivos capazes de restaurar funes perdidas
em sua totalidade ainda longo (Vallabhaneni et al. 2005). Por esse motivo, o objetivo
deste estudo aprofundar o conhecimento em duas reas bastante especficas: o
entendimento do funcionamento de um sensor do corpo humano e o desenvolvimento
de circuitos microprocessados para implantes neurais.
A proposta do trabalho estudar o desenvolvimento de neuroprteses, incluindo
o projeto dos microcircuitos eletrnicos utilizados para construir as ICMs e sua
interao com o corpo humano. Durante o projeto pretende-se modelar um sensor
biolgico, construir uma ICM e realizar um teste clnico para validar o modelo projetado
(ver Captulo V). A partir disso, espera-se expandir o conhecimento nas reas de
design, projeto e implante de neuroprteses.
Considerando a finalidade proposta, alguns objetivos podem ser traados:
Modelar um sensor do corpo humano de acordo com a metodologia
proposta;
Estudar o funcionamento de redes neurais colaborativas;
Estudar os diferentes mtodos de aquisio de dados neurais (invasivos
e no invasivos);
Construir um circuito eletrnico para processamento de sinais
analgicos/digitais;
Avaliar as diferentes contribuies de frequncia, tempo e amplitude na
estimulao eltrica em implantes intra cranianos.
Por se tratar de um estudo de longo prazo, vrios outros objetivos podem ser
includos durante seu desenvolvimento, ao contribuir com projetos em conjunto com o
orientador da universidade de destino.

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Os objetivos apresentados neste captulo podem sofrer alteraes em
decorrncia do resultado final dos processos de aplicao, uma vez que os programas
aos quais estou aplicando possuem diferenas na estrutura de laboratrios, grade
curricular e orientadores com enfoques de pesquisa diversificados, ainda que todos
estejam alinhados com o tema central de investigao.
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III. Metodologia
A metodologia deste trabalho no poder ser detalhadamente descrita, pois
depende de vrias definies que sero discutidas com o orientador durante as
definies iniciais de escopo do projeto (tipo de sensor a ser modelado, a escolha do
mtodo de aquisio de dados, a ordem do modelo, etc.), mas a ideia geral da
metodologia segue de acordo com os objetivos citados.
Inicialmente, a escolha e modelagem de um sensor so primordiais para o
desenvolvimento da pesquisa. A escolha do sensor pode determinar se o modelo
utilizado ser de um sistema de malha com mltiplas entradas MISO (multiple-input
single-output) ou de um sistema SISO (single-input single-output). Tal deciso tambm
influenciar a escolha de se trabalhar com uma rede neural artificial para processar os
sinais adquiridos. Em qualquer um dos casos, a modelagem proposta de um sistema
do tipo caixa preta, realizando a aquisio de dados de entrada e sada (atravs dos
possveis meios descritos no Captulo IIntroduo e Justificativa) com diferentes
estimulaes externas, determinando a planta a partir da anlise dos dados coletados.
Esse modelo da planta ser aproximado de acordo com as necessidades de constante
de tempo, garantindo a mesma constante de ganho terica. A ordem da planta
importante, pois devemos evitar o overshoot da resposta da planta, considerando a EE
aps o processamento do sinal. Para validar o modelo do sistema ser construdo um
circuito microprocessado capaz de transduzir os estmulos externos em corrente
eltrica. Tal circuito deve processar os sinais analgicos medidos na entrada do
sistema e transformar em sinais digitais, que sero usados como entrada para o
sistema de estimulao propriamente dito. Aps essa etapa o prprio circuito de
estimulao deve ser projetado, levando em conta as variaes necessrias nos
padres de EE para que os resultados medidos sejam os mesmos projetados.
Por fim, todo o projeto ser validado com testes clnicos e os resultados do
monitoramento comparados ao longo do tempo com aqueles da coleta de dados
inicial.
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IV. Indicao das instituies de destino no exterior
Meu objetivo profissional me tornar um professor universitrio e pesquisador,
continuando a trabalhar com tpicos que aproximem a engenharia das aplicaes
mdicas. Depois que terminei minha graduao, trabalhei diretamente na iniciativa
privada com diferentes tecnologias e gostaria de redirecionar minha carreira para a
rea acadmica, onde posso contribuir mais para a rea de pesquisa alm de
proporcionar aos alunos de graduao e ps graduao uma nova viso a respeito de
uma rea de grande inovao tecnolgica. Acredito que o prximo passo em direo a
esse objetivo um doutorado.
Esse programa me permitir trabalhar em laboratrios de tecnologia de ponta,
onde os estudos mais avanados dessa rea so atualmente desenvolvidos, me
capacitando para desenvolver uma carreira acadmica e fortalecer a pesquisa
existente no Brasil. Com o conhecimento e a experincia adquiridos, poderei retornar e
coordenar pesquisas, fortalecendo a rea de engenharia biomdica. Acredito tambm
que o programa me dar diferentes vises a respeito dessa rea, seja estreitando
laos de cooperao com a indstria biomdica mas tambm pela experincia com
diferentes tecnologias. Nas universidades em que busco candidatura, a tradio de
investimento de larga escala em pesquisa universitria pela iniciativa privada faz com
que essa cooperao seja muito forte e possibilita aos laboratrios desenvolver
tecnologias inovadoras e investir em equipamentos e produtos voltados diretamente
para aplicao no mercado.
A proposta de realizar meu programa de doutorado no exterior, em especial nos
Estados Unidos, considera possibilidade de atuar nesses laboratrios e de ser
orientado por professores reconhecidos internacionalmente na rea de engenharia
biomdica. Tenho convico de que poderei me tornar um multiplicador do
conhecimento adquirido com esta experincia na ocasio de meu retorno ao Brasil.
Considerando o contexto apresentado, desejo continuar meus estudos em um
programa de doutorado em engenharia biomdica ou bioengenharia, que aborde
temas como: desenvolvimento, construo e implante de neuroprteses, modelagem
de sistemas neurais e sistemas sensoriais do corpo humano e aquisio, tratamento e
processamento de sinais. Apesar de ser um conjunto que abrange as mais diferentes
especialidades, existem vrios programas voltados diretamente para essa rea, com
pesquisas correntes de longo prazo e cujos professores trabalham com projetos
envolvendo esses temas em conjunto com laboratrios de medicina e engenharia. As
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instituies citadas so referncia na rea de engenharia biomdica e o processo para
escolha das mesmas partiu da excelncia em ensino, disponibilidade de laboratrios
alinhados com meu tema de interesse, verbas disponveis para projetos nessa rea e
contato com professores da rea que tenham interesse em orientar meu estudo. O
parecer final da candidatura ao qual esse plano de ensino se refere se dar entre os
meses de maro e maio de 2014, sendo que o plano pode sofrer pequenas alteraes,
devido aos acordos com o professor orientador e a universidade de destino.
Desta forma, as universidades s quais apresentei minha candidatura para o
programa de Doutorado so as seguintes:
University of California, Irvine (UCI) A UCI uma universidade jovem, com
menos de 50 anos, e de reconhecida competncia em ensino e pesquisa. A rea de
pesquisa em engenharia biomdica foi criada em 1998 e, desde ento, vem se
desenvolvendo rapidamente fazendo com que a UCI aparea liderando os rankings
nacionais em produo de artigos na rea. Caso eu seja aceito, minha inteno
trabalhar com o professor Zoran Nenadic, que conduz pesquisas de anlise e
modelagem de redes neurais biolgicas, interfaces crebro-mquina e processamento
de sinais biomdicos.
University of North Carolina at Chapel Hill (UNC) / North Carolina State
University (NCSU) A UNC uma universidade que oferece um programa inovador
em conjunto com a escola de medicina da NCSU. O doutorado desenvolvido em
conjunto em ambos campi e a colaborao das reas de engenharia e medicina
constante. Caso eu seja aceito, minha inteno trabalhar no laboratrio da
professora Helen Huang, focado na rea de engenharia de reabilitao, responsvel
por pesquisas com prteses e interfaces crebro-mquina.
University of Minnesota, Twin Cities (UMN) A UMN uma instituio
reconhecida pelo ensino na rea das cincias exatas e engenharia. O programa de
engenharia biomdica desenvolvido em conjunto com um centro acadmico de
sade, localizado adjacentemente a um hospital de ensino, onde os projetos
desenvolvidos no laboratrio so testados. Caso eu seja aceito, minha inteno
trabalhar no laboratrio do professor Hubert Lim, que conduz um laboratrio focado no
desenvolvimento e aplicao de interfaces crebro-mquina voltados para a rea de
prteses neurais e neuroplasticidade e que busca transformar conceitos tericos em
aplicaes prticas.

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University of Texas at Austin (UTA) A UTA uma instituio de ensino
respeitada nos Estados Unidos e reconhecida internacionalmente e oferece programas
de mestrado e doutorado na rea de engenharia biomdica desde 1969, sendo
pioneira nesta rea de ensino. Alm disso, aparece liderando rankings de instituies
de ensino superior e possui um corpo docente diversificado, vindos de vrios pases,
que busca estar frente em suas reas de pesquisa. Caso eu seja aceito, minha
inteno trabalhar no laboratrio da professora Lisa Griffin, que conduz pesquisas na
rea de sistemas de estimulao eltrica e de instrumentao biomdica.
Georgia Tech/Emory University (GATech) As universidades de Emory e
Georgia Tech oferecem um programa conjunto focado no desenvolvimento de
engenheiros biomdicos. A parceria foi criada com a escola de Medicina de Emory e a
escola de Engenharia de GATech, ambas com excelncia e reconhecimento
internacional em suas reas de pesquisa. O programa foi recentemente premiado com
o segundo lugar no ranking dos programas de engenharia biomdica. Caso eu seja
aceito, minha inteno trabalhar no laboratrio dos professores Garett Stanley e
Maysam Ghovanloo, do Departamento de Engenharia Biomdica, que desenvolvem
pesquisas em processamento de sinais neuronais, neuroprteses e dispositivos
microeletrnicos.
Os professores apontados acima como possveis orientadores so aqueles com
os quais foi feito contato antes do envio da candidatura do doutorado, sem
necessariamente implicar que os mesmos sero orientadores do projeto apresentado.
Algumas faculdades apresentam um esquema de job rotation durante o doutorado e
na maioria delas, a escolha do orientador se d normalmente durante o primeiro ano
do doutorado. No entanto, o orientador ser um professor da mesma rea e alinhado
com os objetivos apresentados neste plano de estudo.

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V. Cronograma do plano de atividades
O incio das atividades se dar no segundo semestre de 2014 (agosto ou
setembro). A data precisa depende dos processos de candidatura, da matrcula na
universidade de destino e do processo de retirada do visto estudantil. Considerando
esses fatores, o cronograma inicial previsto para este estudo :
Atividades Semestrais
Ano
2014 2015 2016 2017 2018
Semestre
2 1 2 1 2 1 2 1
Reviso bibliogrfica e redao da tese
Avaliao e validao da metodologia
Modelagem do sensor
Elaborao do projeto do circuito
Validao do modelo com ensaios no laboratrio
Construo do circuito
Testes do projeto
Concluso da elaborao da tese.
Defesa da tese de doutorado.









O cronograma do plano de atividades apresentado neste captulo pode sofrer
alteraes em decorrncia do resultado final dos processos de aplicao, sem no
entanto prejudicar os objetivos propostos e sem exceder o limite de 48 meses para
desenvolvimento do doutorado.
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VI. Bibliografia de referncia
[1] AFRAZ, S. R.; KIANI, R.; ESTEKY, H. (2006) Microstimulation of
inferotemporal cortex influences face categorization Nature 442:692 695
[2] BUTOVAS, S.; SCHWARZ, C. (2003) Spatiotemporal effects of
microstimulation in rat neocortex: a parametric study using multielectrode
recordings
[3] CHAPIN, John et al. (1999) Real-time control of a robot arm using
simultaneously recorded neurons in the motor cortex
[4] CHAPIN, John (2002) Using multi-neuron population recordings for neural
prosthetics
[5] CARMENA, Jose M. et al. (2003) Learning to Control a BrainMachine
Interface for Reaching and Grasping by Primates
[6] COHEN, M. R.; NEWSOME, W. T. (2004) What electrical microstimulation has
revealed about the neural basis of cognition. Current Opinion in Neurobiology,
vol. 14, no. 2, pp. 169177
[7] DAS, A. (2001) The brain decade in debate Sensory and motor - Brazilian
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[9] DOTY, R. W. (1969) Electrical stimulation of the brain in behavioral context
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Neurophysiology 19:401 415
[11] FITZSIMMONS, N. A.; DRAKE, W. et al. (2007) Primate Reaching Cued by
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[12] GRAZIANO, M. S.; TAYLOR, C. S.; MOORE, T. (2002) Complex movements
evoked by microstimulation of pre-central cortex Neuron vol. 34, no. 5, pp. 841
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[13] LAFUENTE, Victor de; ROMO, Ranulfo (2005) Neuronal correlates of
subjective sensory experience
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stimulation of septal area and other regions of rat brain
[15] OTTO, K. J. ROUSCHE, P. J.; KIPKE, D. R. (2005) Microstimulation in
auditory cortex provides a substrate for detailed behaviors J. Neural Eng., vol. 2,
no. 2, pp. 4251
13

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strategy in visual search Vision Res vol. 47, no.17, pp. 2272-2280
[17] PEZARIS, John S. ; REID, R. C. (2007) Demonstration of artificial visual
percepts generated through thalamic microstimulation Proc. Nat. Acad. Sci.
USA, vol. 104, no. 18, pp. 76707675
[18] PHILLIPS, M. H.; EDELMAN, J. A. (2008) The dependence of visual scanning
performance on saccade, fixation, and perceptual metrics Vision Research
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[20] SALZMAN, C. D. et al (1990) Cortical microstimulation influences perceptual
judgments of motion direction Nature vol. 346, no. 6280, pp. 174177
[21] VALLABHANENI, Anirudh; WANG, Tao; HE, Bin (2005) Brain-Computer
Interface Bioelectric Engineering, pp. 85-121
[22] VIDAL, Jacques J. (1977) Real-Time Detection of Brain Events in EEG
Procedings of the IEEE, Maio 1977
[23] WOLPAW, Jonathan R. (2000) BrainComputer Interface Technology: A
Review of the First International Meeting - IEEE TRANSACTIONS ON
REHABILITATION ENGINEERING, VOL. 8, NO. 2, Junho 2000








A bibliografia de referncia apresentada neste captulo pode sofrer alteraes
em decorrncia do resultado final dos processos de aplicao, visto que os programas
aos quais estou aplicando possuem diferenas na estrutura de laboratrios, grade
curricular e orientadores com enfoque de pesquisa diversificados, ainda que todos
estejam alinhados com o tema central do projeto.