Transcrio Mutao e Reparo 24/02/2014

Mateus Prazeres


Desaminaes espontneas: Perda de um agrupamento amina.
Se a citosina tem um NH2, ela pode ser desaminada e passa a ser uracila. Eu tenho uracila no
DNA? Tenho, mas ela fruto de uma desaminao da citosina. Toda vez que eu tenho uracila
no DNA, significa que ali antes era uma citosina. O sistema de reparo percebe que aquilo
uma desaminao e sabe que aquilo precisa ser corrigido. Porque seno, se essa uracila no
for retirada da dupla fita de DNA, eu tenho a transio de guanina pra adenina. (Antes: C > G /
Depois: U > A)
Por que isso acontece? Eu tenho um pareamento C - G normal no DNA, a eu ingiro algum
agente que causa desaminao, ento esse C - G vira U - G, s que esse pareamento no
possvel. Isso no um mau pareamento, mau pareamento s envolve as quatro bases(A,T,C e
G). um pareamento fruto de desaminao. H diferenas. Se a clula no corrigir aquela
uracila, na replicao eu vou ter UMA fita que no ter problema, que pode continuar sendo
replicada normalmente. O problema ser com a fita da uracila, pois eu terei a mudana de C -
G para T - A, terei mudana de citosina para timina, e guanina para adenina. Ento o
pareamento que se forma, erroneamente, no mais reconhecido pela clula, pois
teoricamente ele seria correto (existe T - A no DNA) s que no era o pareamento de que eu
precisava no momento, sendo isso caracterizado como mutao, Pois o C - G virar T - A.
Essa uracila eu caracterizo como pr-mutao. Por qu? Porque essa uracila, fruto da
desaminao, ainda pode ser removida, e eu posso recolocar uma citosina. Toda vez que a
clula encontra no DNA um pareamento U - G, ela pode retirar a uracila e colocar uma
citosina. Se a uracila permanecer, a mutao fixada, pois T - A um pareamento conhecido,
no existindo via de reparo para corrigi-la.

Eu no tenho uracila no DNA, pois a clula no saberia identificar se aquela uracila fruto de
uma desaminao ou se natural do DNA.

Obs: Para entender bem como a mudana ocorre, basta praticar a replicao separadamente
de uma fita normal com Citosina e outra com Uracila. Ao fim s comparar as bases que voc
deveria ter normalmente e as que voc encontrou com a citosina desaminada que virou uracila.


Depurinao:
Stio Apurnico nada mais do que uma regio do corrimo do DNA que est sem a base
nitrogenada. O Stio AP aparece quando o arcabouo ribose-fosfato est normal mas uma
base saiu, ela foi quebrada, danificada de alguma forma. O corrimo do DNA est completo,
mas falta uma base. Como acontece a formao de um Stio AP? Acontece espontaneamente
devido a diversas substancias carcinognicas. Existe Stio AP em todo o genoma, mas ele
precisa se corrigido.


Oxidao de bases nitrogenadas:
Uma guanina normal pode ser oxidada. Uma guanina oxidada pareia com citosina? Pareia, o
problema que ela pode sair de uma conformao chamada de anti, para uma conformao
chamada sim**, a uma guanina pareia com uma adenina, e isso vira um mau pareamento.
Ento oxidar o DNA leva a maus pareamentos que vo ser corrigidos pelo MMR ou uma outra
via.
**Nessa hora o udio estava muito ruim e no deu pra ter certeza absoluta se os nomes eram
realmente anti e sim.


BER: Reparo por Exciso de Bases
Que tipo de modificao na fita eu tenho quando ocorre desaminao, depurinao, ou
oxidao? A base. Ento eu tenho uma via chamada BER, que o reparo por exciso de bases.
O BER sempre vai comear quando encontrar uma base ausente (Stio AP), com defeito ou
uma Uracila. A primeira coisa que ocorre no BER aparecer uma enzima chamada de DNA
Glicosilase, ela remove uma base estragada, oxidada, ou uma uracila, mas deixa intacto o
arcabouo ribose-fosfato, gerando um Stio AP. Toda vez que eu tenho um Stio AP, seja este
gerado por quebra de ligao de bases ou DNA Glicosilase, ele reconhecido pela AP
Endonuclease, que atua tanto no DNA como em RNA, reconhecendo o Stio AP e cortando
aquela parte do arcabouo, gerando uma leso na fita. Depois, para reparar esse corte, eu
tenho a ao da Polimerase Beta (Pol), que vai remover o ribose-fosfato do Stio AP, que eu
vou chamar de atividade de desoxirribofosfatase, e, por ela ser uma polimerase, vai usar a
informao da fita molde e repor a base que deveria estar l. No entanto, ainda falta ligar a
base fita, pois ela s est no local sem estar ligada ao arcabouo, e quem faz isso a DNA
Ligase.
Portanto, na via do BER eu tenho quatro enzimas: DNA Glicosilase(retira a base), AP
Endonulease(faz o corte), Pol(remover o ribose-fosfato e colocar a base correta) e DNA
Ligase(refazer a ligao da base com o arcabouo); agindo todas de forma sequencial.


NER: Reparo por Exciso de Nucleotdeo
Acontece quando voc fica exposto ao sol por muito tempo. Corrige danos relacionados luz
UV. O que que a luz UV faz? Ela acarreta ligao de bases adjacentes na fita de DNA,
geralmente Timinas. Por que isso problemtico? Porque ele entorta o seu DNA, causando
perda da estrutura de dupla hlice, perdendo a estrutura, o DNA perde a sua funo, no
podendo mais replicar, transcrever...
Quando a RNA polimerase for criar o RNAm, ela no vai reconhecer as duas Timinas juntas,
pois ela s sabe reconhecer uma separadamente.
No BER, s sai a base, o arcabouo ficou intacto; mas no NER h o corte da dupla-fita, pois eu
preciso remover o nucleotdeo todo, removendo a ligao de bases adjacentes e outras bases
que esto flanqueando, isto , ao lado do local com erro, esquerda e direta. Criando a
necessidade de todo o trecho ser criado de novo, e no s uma nica base.
Quem no consegue efetuar a via do NER so indivduos que nasceram com mutaes nos
genes que codificam protenas do complexo XP, caracterizando uma doena chamada de
Xeroderma Pigmentosa, cujo fentipo uma apario exagerada de cnceres de pele, sendo o
indivduo privado de se expor ao sol em qualquer momento. Isso porque qualquer dmero de
timina ou foto-produto que aparecer, proveniente da luz UV, que aparecer, no haver
mecanismo para corrigir, gerando mutaes.
Cncer de pele no significa exatamente erro no NER, isso porque todo mecanismo possui uma
saturao, portanto, se h um grande acumulo de foto-produtos e dmeros de timina o NER
no vai conseguir reparar tudo.




Double-Strand Break (DSB): Leso causada por Raios-X e Radiao
Raios-X e Radiao so uma espcie de metralhadoras, que destroem o DNA em vrios
pontos, no dependendo de sequncia, gerando ou quebra simples ou quebra dupla. Quando
isso acontece, eu preciso colar uma ponta na outra de modo aleatrio, seno na hora do
DNA se replicar, e ele vai se replicar em pedaos, cada dupla fita de DNA em cada
cromossomo, tem apenas um centrmero que o responsvel por levar a fita filha pra uma
clula e a outra fita para outra, na hora da mitose ou da meiose. Se voc quebrar o seu
cromossomo, voc gera clulas sem determinados genes. a pior coisa que pode acontecer
com seu DNA.
Como eu reparo essa quebra? Atravs da via de reparo de quebras duplas. Quando eu tenho
uma quebra no DNA, a outra copia ainda est normal, pois somos haploides. Dessa forma, eu
utilizo a sequncia da outra fita de DNA para recompor o que eu perdi pela dupla da minha fita
de DNA. Portanto, toda vez que eu tenho quebra dupla eu tenho a informao gentica
recuperada no outro cromossomo homlogo.