SECUENCIACION DE EDMAN

Volviendo la mirada hacia las entradas del blog, me he dado cuenta de que hay algunas cosas
que asumo como que ya las conocis y puede ser que no sea as. Por eso hoy vamos a
explicar brevemente, o lo ms brevemente posible como fue el origen de la secuenciacin de
las protenas.
La secuenciacin de protenas fue (segn mi humilde opinin) uno de los hitos histricos a
tener en cuenta para las personas que trabajamos con las mismas ya que sin ella (y varias
cosas ms), probablemente no tendramos Protemica

Pehr Victor Edman
Todo comienza con la labor de un joven cientfico llamado Pehr Victor Edman. En aquellas
fechas se acababa de reconocer que las protenas eran entidades con una estructura, una
masa y una carga elctrica definidas. Este hombre, como muchos de nosotros, se encontraba
centrado en investigacin bsica en Estocolmo, en el Instituto Karolinska, haciendo su
trabajo para su tesis doctoral cuando se le cruz en medio una guerra. Era una poca muy
dura, y tras servir en el ejrcito sueco durante la Segunda Guerra Mundial continu sus
trabajos y en 1947 le concedieron un premio para ir al Rockefeller Institute of Medical
Research en la prestigiosa Universidad de Princeton donde realiz sus trabajos de
purificacin y caracterizacin de la Angiotensina de sangre bovina.
En aquellos aos colegas fsico-qumicos suecos haban descubierto que protenas de
diferentes tamaos moleculares posean estructuras qumicas especficas y ms que
probablemente individuales.Edman estaba muy interesado en la determinacin detallada de
la estructura de las protenas y con su mtodo consigui dar lugar a una explicacin
estructural de sus diversas actividades biolgicas.
Para su doctorado, Edman aisl de la sangre bovina una protena pequea que regula la
presin arterial (Angiotensina), pero pronto se dio cuenta de que las protenas estn
constituidas por pequeos bloques o ladrillos: los aminocidos. Para dar una
explicacin estructural a las diversas actividades biolgicas de las protenas deba encontrar
un mtodo que le permitiera una determinacin de la estructura de las mismas.
A Edman se le ocurri la fantstica idea de una serie de reacciones basadas en el
acoplamiento del fenilisotiocianato (PITC) con una protena purificada y el uso de hidrlisis
cida. Esta serie de reacciones le permitieron analizar las protenas de forma
secuencial,aminocido por aminocido, y as preservar la informacin lineal estructurales
necesarias para interpretar su actividad biolgica.
El procedimiento de la degradacin de Edman o secuenciacin de Edman marca y elimina
slo el residuo N-terminal de un polipptido, dejando el resto de enlaces peptdicos intactos.
Para ello, se hace reaccionar el pptido con PITC eliminndose el residuo N-terminal en
forma de derivado de fenilhidantona (PTH). Despus de la eliminacin e identificacin del
residuo N-terminal mediante HPLC, el nuevo residuo N-terminal puede ser marcado,
eliminado e identificado por repeticin de la misma serie de reacciones. Este procedimiento
se repite hasta que se ha determinado toda la secuencia.

Esquema de la Secuenciacin de Edman
Edman ide en la Universidad de Lund las condiciones de reaccin adecuadas para todos los
aminocidos y la gran mayora de las clases de protenas adems de minimizar el nmero de
reacciones secundarias no deseadas.
Debido a que se tienen que realizar muchos pasos de reaccin y muchas determinaciones,
normalmente hoy da ste mtodo se lleva a cabo mediante analizadores automticos o
secuenciadores que mezclan los reactivos en las proporciones adecuadas, separa los
productos, los identifica y registra los resultados. Visionario en su campo, Edman dise en
1961 un instrumento automtico llamado secuenciador de protena para
determinar la estructura de las protenas mediante el anlisis de la secuencia de
aminocidos, el primer secuenciador automatizado de protenas.
Edman continu hasta su muerte trabajando para mejorar este mtodo y as poder
determinar cadenas ms largas pero con menor material de partida.