Organismos extremfilos

Un organismo que se
desarrolla en
ambientes extremos se
denomina extremfilo.

Es un trmino relativo
ya que los ambientes
que pueden ser
extremos para un
organismo, pueden ser
esenciales para la
superviviencia del otro
organismo.
Thermoacidophiles
These bacteria live in very hot, acid habitats of 60-80 Co
and pH 2-4, like the photo of a "Hot springs" below, the red
stain on the rocks are the prokaryotic cells.

Tres dominios

Nature 427, 674-676 (19 February 2004)

En 1977 Carl Woese propuso una categora superior a reino: Dominio,

reconociendo tres linajes evolutivos; Archaea, Bacteria y Eukarya.
Las caractersticas para separar estos dominios son el tipo de clula,
compuestos que forman la membrana y estructura del ARN.

Dominio
Archaea.
rbol
filogentico de
los principales
Archaea
basado en la
comparacin de
secuencias de
16S rRNA

Nature Reviews Genetics 6, 58-73 (January 2005)

Phylum Euryarcheota
Halfilos extremos: habitan ambientes de extremada salinidad.
Crecimiento ptimo de 2-4 M. (Halobacterium, Haloferax y
Natronobacterium)

Halobacterium
salinarium

Haloferax
mediteranei

Natronobacterium
gregoryi

Phylum Euryarcheota
Metangenas: productoras de metano como parte integral de su
metabolismo a partir de CO2, de grupos metilo, acetato, piruvato.
(Methanobacterium, Methanococcus y Methanosarcina).

Methanobacterium
thermoautotrophicum

Methanococcus
jannaschii

Methanosarcina
barkeri

Phylum Euryarcheota
Termoplasmatales: Tres procariotas termfilos y acidfilos
extremos: Thermoplasma, Ferroplasma y Picrophilus. Los
organismos ms acidfilos de todos los procariotas, pueden
crecer hasta a un pH 0 o cercano.

Thermoplasma
acidophilum

Ferroplasma
acidophilum

Picrophilus torridus

Phylum Euryarcheota
Hipertermfilos: tienen temperaturas ptimas de crecimiento a
80C o mayores. (Thermococcus, Pyrococcus, Methanopyrus)

Thermococcus celer

Pyrococcus furiosus

Methanopyrus kandleri

Phylum Crenarchaeota
Psicrfilos: Crecen a muy bajas temperaturas, incluso se han
encontrado colonizando aguas antrticas.
Hipertermfilos de hbitat terrestres volcnicos: Los hbitats
volcnicos pueden tener temperaturas de hasta 100C por lo que
son aptos para el desarrollo de hipertermfilos. (Sulfolobus,
Acidianus y Thermoproteus)

Sulfolobus acidocaldarius

Acidianus spp.

Thermoproteus tenax

Phylum Crenarchaeota
Hipertermfilos de hbitat volcnicos submarinos: son los
organismos ms hipertermfilos de todos los Archaea.
(Pyrodictium, Pyrolobus, Ignicoccus y Staphylothermus)

Pyrodictium abyssi

Pyrolobus fumarii

Staphylothermus marinus

Phylum Nanoarchaeota
Contiene pequeas clulas parasitarias. Incluye los genomas
ms pequeos conocidos en los procariotes.

Nanoarchaeum equitans Cell of Ignicoccus spec.

(big) with cells of
Nanoarchaeum equitans
(tiny) attached to its
surface. Electron
micrograph. Ptcontrasting. Bar 1 m.

Phylum Korarchaeota
Formas slo conocidas a partir
de ARNr recogido en ambientes
naturales. Por la fuente de
obtencin, es probable que
sean termfilos: Parque
Yellowstone en los manantiales
termales. Tienen altas
concentraciones de hierro,
sulfuro de hidrgeno, hidrgeno
y dixido de carbono.

Ambientes de
microorganismos extremfilos

Termfilos y Psicrfilos.
Destruccin estructural debido a la formacin de hielo.

Desnaturalizacin de biomolculas.
Cambios en la disolucin de los gases (O2, CO2).
Temperaturas cercanas a los 100C desnaturalizan protenas y
cidos nucleicos e incrementa la fluidez de la membrana.
Ambientes de estas arqueas son los polos, chimeneas marinas,
geyser.

Temperatura de la vida.

Cmo lo hacen?
En el caso de las protenas se disminuyen el largo de los loops en la
superficie que conectan elementos de estructura secundaria, se
optimizan las interacciones hidrofbicas y electrostticas y se
intercambian aminocidos para incrementar la hidrofobicidad de
los residuos en las alfa hlices.
El DNA se desnaturaliza a los 70C. Sales mono y divalentes
potencian su estabilidad debido a que estas detectan las cargas
negativas de los grupos fosfato. El KCl y MgCl2 protegen al DNA de
la depurinizacin y por tanto de la hidrlisis.
En el caso de las bajas temperaturas la fluidez de la membrana
disminuye, las protenas se vuelven rgidas: en respuesta los psicrfilos
muestran disminucin en interacciones inicas y enlaces de
hidrgeno, poseen menos grupos hidrofbicos y ms grupos
cargados en la superficie. Debido a estas modificaciones los
psicrfilos pierden su rigidez y ganan flexibilidad estructural para la
realizacin de sus funciones.

Membranas
de arqueas
y bacterias

Nature Reviews Microbiology 5, 316-323 (April 2007)

Termfilos
Thermus aquaticus crece a temperaturas mayores de 70C y es
ampliamente utilizada en la industria para la tecnologa de PCR.

Clasificacin
Temperatura

Descripcin

Hipertermfilos

Su temperatura ptima de crecimiento est por

encima de los 80C y el mximo crecimiento de
cultivos puros se ha llegado a dar entre 110 y 113C.

Termfilos

Crece por encima de los 45C.

Mesfilos

Temperatura ptima alrededor de 37C.

Frecuentemente son capaces de crecer en rangos
alrededor de 25 a 45C.

Psicrfilos

Capaces de crecer por debajo de 5C y con

temperaturas mximas de 20C. Frecuentemente
son capaces de crecer en rangos alrededor de
10C.

Psicrfilos
facultativos

Temperatura ptima de 15C llegando a alcanzar

los 20C y tambin capaces de crecer hasta por
debajo de 0C.

Aplicaciones termfilos
Enzima

Aplicacin

Proteasas

Detergentes, alimentos,
elaboracin de cerveza y
panadera

Glicosil hidrolasas (amilasas,

pululanasas, gluocamilasas,
glucosidasas, celulasas, xilanasas)

Almidn, celulosa, quitina, pectina

y procesamiento de textiles

Quitinasas

Modificacin de alimentso y de
productos para la salud

Lipasas, esterasas

Detergentes, reacciones estereoespecficas (trans-esterificacin,

biosntesis orgnicas)

ADN polimerasa

Biologa molecular PCR

Deshidrogenasas

Reacciones de oxidacin

Aplicaciones psicrfilos
Enzima

Aplicacin

Proteasas

Detergentes, alimentos (productos lcteos)

Amilasas

Detergentes y panadera

Celulasas

Detergentes, alimentos y textiles

Deshidrogenasas

Biosensores

Lipasas

Detergentes, alimentos y cosmticos

Barfilos
Son aquellos que
requieren de
condiciones de
alta presin
(mayor a 1 atm)
para su desarrollo
y crecimiento.
Shewanella benthica

Un organismo que crece a presin elevada experimenta un

aumento en la concentracin de cidos grasos no saturados
presentes en la membrana plasmtica. La velocidad de
crecimiento realtivamente lenta, se debe, a los efectos de la
presin sobre los procesos celulares y a que estos organismo
crecen a bajas temperaturas, que causan disminucin en las
reacciones qumicas.

Barfilos
A altas presiones las membranas de estos organismos se
compacta y diminuye la fluidez. Algunos resuelven este
problema por un incremento en la proporcin de cidos grasos
insaturados en la membrana. En el caso del DNA se dice que
estos tienen sistemas de reparacin rpidos y eficientes.

Colwellia sp

Pyrococcus furiosus

Xerfilos
Son aquellos organismos que pueden sobrevivir a una extrema
desecacin incluso durante largos perodos de tiempo.
Mecanismo de muerte incluyen un cambio de fase irreversible en
los lpidos, protenas y cidos nucleicos como desnaturalizacin,
formacin de especies reactivas de oxigeno.

Xerfilos
Algunos organismos responden al incremento en la osmolaridad
(debida a la desecacin) por un incremento en la osmolaridad en
su citosol, el cual los protege de la deshidratacin y desecacin.
Emplean solutos compatibles como glicina betaina. Otros solutos
compatibles son glutamato, glutamina, prolina, glicina, sacarosa y
trehalosa, reteniendo agua y estabilizando a las protenas y
membranas.
La gnero Halobacteriaceae usa K+ como agente osmtico.
CH2

CH3
CH3

N CH2
CH3

Glicina-Betaina

CH2

COOCH3

N
Ectoina

COO-

Halfilos

Son aquellos organismos que requieren cierta concentracin de

NaCl para su desarrollo y crecimiento.
Los ambientes donde se desarrollan presentan alta salinidad, son
zonas secas y calientes, como los lagos salinos.
La estrategia que desarrollan los organismos ante estrs osmtico
se basa en la acumulacin masiva de compuestas en el
citoplasma para compensar la presin osmtica del medio
externo. Pueden ser inicos o no inicos.

Halfilos
Hay dos mecanismos de
acumulacin:
1. Salt in: Arqueas y
Haloanaerobiales (bacterias
halfilas moderadas anaerobias
estrictas), acumulas iones
inorgnicos como K+ y Cl-.
Aumentado la concentracin de
KCl en el citoplasma se da una
adaptacin de todas las
protenas y ribosomas.
2. Salt out: Bacterias halfilas como
no halfilas. Solutos compatibles.

Halobacterium sp.

Halfilos
Baha de San Francisco.
Tanques de evaporacin para
preparar sal comn. El color
prpura es debido a
bacteriorrodopsinas de
Halobacterium sp.

Halfilos
Halfilos

Concentraciones de NaCl

Halfilos extremos

Arriba de 20%

Halfilos moderados

Arriba de 10 a 20%

Halfilos dbiles

0.5 a 10%

Halotolerantes

Toleran la salinidad

El Mar Muerto es 5 veces ms salado

que el resto de los ocanos de la
Tierra. A medida que el agua se
evapora, la sal se sedimenta.
Cuando se alcanza el punto de
saturacin, la sal forma estos pilares.
Crdito: Universidad Purdue.

Halfilos
Microorganismo

Procedencia

Crecimiento
ptimo %NaCl

Actinopolyspora halophila

Contaminante en medio con

25% de NaCl. Canad.

10

Actinopolyspora mortivallis

Suelo salado. Valle de la

muerte, California

5 - 25

Actinopolyspora iraquiensis

Suelo salino. Iraq

10 - 15

Nocardiopsis lucentensis

Suelo salado. Alicante, Espaa

10

Nocardiopsis halophila

Suelo salino. Iraq

20

Nocardiopsis kunsanensis

Salinas de Kunsan. Corea

10

Nocardiopsis aquaticus

Lago salado Ekho. Antrtida

1-6

Friendmanniella lacustris

Lago salado Ekho. Antrtida

Streptimonospora salina

Lago salado. Oeste de China

15

Halfilos
Fuente

Aplicacin

Proteasas

Sntesis peptdica

Deshidrogenasas

Catlisis en medio orgnico

Nucleasas, amilasas

Agentes saborizantes

b-caroteno, cido linolico

y extractos celulares
(Spirulina y Dunaliella)

Alimentos naturales, complementos alimenticios, colorantes

para alimentos y alimento para ganado

Bacteriorrodopsina

Interruptores pticos y generadores fotnicos de corriente en

dispositivos bioelectrnicos

Polihidroxialcanoatos

Plsticos de uso en medicina

Polmeros reolgicos

Recuperacin de petrleo

Lpidos

Liposomas para liberacin de frmacos y cosmticos

Solutos compatibles

Protectores de protenas y clulas en una variedad de

aplicaciones industriales como congelacin y calentamiento

Glicerol

Productos farmacuticos

Membranas

Surfactantes para productos farmacuticos

Microorganismos

Salsas fermentadas y modificadores de sabor y textura en

alimentos. Transformacin y degradacin de desechos.

Alcalfilos
Se les denomina as a aquellos organismos que viven en ambientes
con pH por encima de 9.
Los alcalfilos requieren aislar el interior celular ya que algunas
molculas especialmente las hechas de RNA se rompen a pH
superior a 8.
En lugar del habitual gradiente de protones, es un gradiente de Na,
el que suministra energa para transporte y movilidad y genera una
FNaM para la sntesis respiratoria de ATP.
Las bacterias alcalfilas adems del peptidoglicano tienen en su
pared polmeros cargados negativamente, para reducir la densidad
de la carga en la superficie de la clula y estabilizar la membrana.

Alcalfilos

Acidfilos
Se les denomina as a aquellos
organismos que viven en ambientes
con pH menor de 5.
Los
ambientes
cidos
surgen
naturalmente de de actividades
geoqumicas. Como puede ser la
produccin de gases sulfurosos de
emanaciones volcnicas.
Los acidfilos emplean una gama de
mecanismos para combatir la
acidez, como una superficie de
membrana cargada positivamente,
una alta capacidad reguladora
interna y sistemas nicos de
transporte.

Acidfilos
La acidez y solubilidad del metal que producen las bacterias
acidfilas desempean una funcin benfica en minera.
La lixiviacin microbiana es un bioproceso industrial mediante el
cual se obtiene metales de las minas, especialmente aquellos
metales que se encuentran en formas poco solubles.
Bacterias como Thiobacillus sulfolobus acta como catalizador y
acelera la velocidad de oxidacin de los minerales que contienen
sulfuro, ayudando a la solubilizacin del metal.
Enzima

Aplicacin

Amilasas, glucoamilasas

Procesamiento del almidn

Proteasas, celulasas

Componentes alimenticios

Oxidasas

Desulfuracin de carbono

Temperature and pH requirements for

growth distinguish thermophilic
bacteria and archaea.
Zona en la
que las bacterias
estn mejor
adaptadas.
Zona en la
que las arqueas
estn mejor
adaptadas.
Zona en la
que ambas estn
bien adaptadas.
Nature Reviews Microbiology 5, 316-323 (April 2007)

Bibliografa.
1. Brock. Biologa de los microorganismos. 10 ed. Prentice Hall.
2. Extemophile microorganism. Ninfa Ramrez et al.
3. Life in extreme environments. Lynn J Rothschild and Rocco L.
Mancinelli. Nature. 2001.
4. Adaptations to energy stress dictate the ecology and
evolution of the Archaea.