BIOQUMICA MDICA

CLASE #1

L 30/06/14

Libro de Referencia: Bioqumica Harper (tlima edicin)

Otros: Para teora: Bioqumica Mdica - Baynes
Para seminarios: Bioqumica - Montgomery
Sugerencia: Repaso : Lippincotts Illustrated Biochesmitry

LECTURA(S) RECOMENDADA(S)
HOY: Lehninger & Baynes
Prxima Clase: Harper

Clase #1: Introduccin a la Bioqumica Mdica

AGENDA (repaso)
1. Fundamentos Fsicos
1.1 Bioenergtica
1.2 Reacciones Acopladas
2. Fundamentos Qumicos
2.1 Aminocidos
2.2 Pptidos
2.3 Protenas
3. Fundamentos Celulares
3.1 Membrana Celular
3.2 Transporte

1.1 FUNDAMENTOS FSICOS: Bioenergtica

Energa Libre de Gibbs (G)
Proceso es espontneo si G < 0
(liberacin de energa exergnico)

Entalpa
refleja #
y tipo de
enlace

1.2 FUNDAMENTOS FSICOS: Rxns Acopladas

2. FUNDAMENTOS QUMICOS: Generalidades

Principio de Universalidad: Lo que es cierto para E.Coli es cierto para el
elefante (Monod)
Qumica Orgnica / del carbono C,H,O,N (P,S)

2. FUNDAMENTOS QUMICOS: Generalidades

Quiralidad y Estereoqumica
Cuando un carbono tiene 4 sustituyentes
diferentes unidos, el carbono se convierte
en un carbono quiral.
Puede adquirir dos configuraciones
L/R
Entre s, estas estructuras se llaman
enantimeros

2.1 FUNDAMENTOS QUMICOS: aas y protenas

Importancia: Las protenas son los instrumentos moleculares mediante los que
se expresa la informacin gentica (20 aa)

Esqueleto de:
- Enzimas
- Hormonas
- Anticuerpos
- Transportadores
- Fibras musculares
- Antibiticos
- Venenos de Hongo

2.1 FUNDAMENTOS QUMICOS: aas - estructura

Predomina L por sitio activo

asimtrico en enzimas

2.1 FUNDAMENTOS QUMICOS: aas - clasificacin

2.1 FUNDAMENTOS QUMICOS: aas - clasificacin

Aminocidos Alifticos: Ala, Val, Leu, Ile
hidrofbicos
Aminocidos Aromticos: Phe, Tyr, Trp
Normalmente en centro proteco (hidrofbico)
OH tirosina fosforilable (va regulatoria)
Aminocidos Polares Neutrales : Ser, Thr (OH)
- Sitio activo cataltico
- Vas regulatorias
Asn, Gln (amida)
Anclaje para azucares en protenas
(Ser,Thr,Asp)
Aminocidos Acdicos: Asp, Glu
Aminocidos Bsicos: Lys, Arg, His
Aminocidos con Azufre (S): Cys, Met brindan estabilidad (puentes disulfuro)

2.1 FUNDAMENTOS QUMICOS: aas ionizacin

Cuando un aminocido sin grupo R ionizable se disuelve en agua a pH neutro, se
encuentra en una solucin en forma dipolar o zwiterrion

R-COOH R-COO- + H+

R-NH3+ R-NH2+ H+

Medio cido
[H3O+]>>>[OH-]

Hay una regla

pKa carboxilo: 2.2
pKa amino: 9.5

[H3O+]=[OH-]

Medio alcalino
[H3O+]<<<[OH-]

Cul es el cido?
Cul es la sal?

2.1 FUNDAMENTOS QUMICOS: aas titulacin

pI : punto isoelctrico
Donde la carga elctrica neta es 0.

2.1 FUNDAMENTOS QUMICOS: aas titulacin

2.1 FUNDAMENTOS QUMICOS: aas no protecos

Citrulina
Metabolito de L-arginina,
Producto de la NO-sintasa

Creatinina
Derivado de metabolismo muscular
Evala funcin renal

2.2 FUNDAMENTOS QUMICOS: pptidos

El enlace peptdico es
un tipo de reaccin de
condensacin
- Carboxilo de aa1
debe ser activado
para que el OH- sea
eliminado fcilmente
Estable
Vida media: 7 aos
Plano
Comportamiento cidobase depende de grupo
-amino y -carboxilo
libre y naturaleza de
Rs.

2.2 FUNDAMENTOS QUMICOS: pptidos

Glutatione (GSH)
Cys grupo tiol se oxida GSSG
Pptido ms presente en la clula
F(x): defensa antioxidante
Enzima: glutamil-transpeptidasa

2.3 FUNDAMENTOS QUMICOS: protenas - clasificacin

2.3 FUNDAMENTOS QUMICOS: protenas - estructura

2.3 FUNDAMENTOS QUMICOS: protenas estructura 1

La estructura primaria de una protena es la secuencia lineal de sus aminocidos
Los residuos determinan las propiedades fsicas y qumicas
R aliftico/aromtico Liposoluble
polar Hidrosoluble
R tambin determina la carga (Glu, Asp cido + / Lys,His,Arg base - )
Importancia: Capacidad buffer de protenas intracelulares.

2.3 FUNDAMENTOS QUMICOS: protenas estructura 2

La estructura secundaria de una protena se refiere a la estructura local de
la cadena polipeptdica
Causa: Puentes de Hidrgeno : C-O con H-N

2.3 FUNDAMENTOS QUMICOS: protenas estructura 2

Hay dos tipos:

-hlice
Cadena peptdica enroscada
Residuos salen del eje de la espiral
3.6 aa/giro de hlice
Dextrogiro (en sentido de las agujas
del reloj)
PdH paralelos al eje del giro.

Hoja plegada
Cuando los PdH se dan entre pptidos
de cadenas diferentes
Puede ser paralela o antiparalela por
estructura de carbono tetrahdrico
Giro B Cuando el polipeptido revierte
su dreccin abruptamente
Gly , Pro

2.3 FUNDAMENTOS QUMICOS: protenas estructura 2

Giros Aleatorios

Predominante en protenas globulares

Hlice Extendida

Queratina

Carboxipeptidasa

2.3 FUNDAMENTOS QUMICOS: protenas estructura 3

La estructura terciaria resulta del plegamiento de la cadena peptdica
Se estabiliza por:

Puente de Hidrgeno

Interacciones
Electrostticas

Interacciones
Hidrofbicas

Interaccin con
In Metlico

2.3 FUNDAMENTOS QUMICOS: protenas estructura 3

Enlaces Covalentes Puente Disulfuro (Cys). En insulina
Puente de Hidrgeno
Interacciones Electrostticas Entre aas con grupos R ionizados
cido-base
Interacciones Hidrofbicas En agua, grupos polares salen e
hidrofbicos permanecen en el centro.
Dbiles, pero se fortalecen por la gran
cantidad
Interacciones c/ Ion Metlico Ac.Glutmico + Mg(2+)

2.3 FUNDAMENTOS QUMICOS: protenas estructura 3

2.3 FUNDAMENTOS QUMICOS: protenas estructura 4

La estructura cuaternaria esta formada por interacciones ente cadenas
peptdicas
Cuando protena formada por ms de una cadena polipeptdica

2.3 FUNDAMENTOS QUMICOS: protenas estructura 4

Hemoglobina 2 cadena alfa (141 aa)
2 cadena beta (146 aa)

Grupo Prosttico:
Porcin de proteina que no
son aminocidos (Ej: Heme)

2.3 FUNDAMENTOS QUMICOS: protenas estructura 4

Colgeno Tropocolgeno (Triple Hlice) forma soluble del colgeno
Slo tejido conectivo joven o fetal
Cross-Linking envejecimiento enlaces covalentes entre
residuos de Lys

2.3 FUNDAMENTOS QUMICOS: protenas estructura 4

Protenas Integrales de Membrana
- 6-10 alfa-helices atravesando la membrana
- Barril beta De 8,12,16 o 18 hojas beta plegadas

2.3 FUNDAMENTOS QUMICOS: protenas plegamiento

Protenas ayudan protenas a

plegarse chaperonas:
- HSP (Heat Shock Proteins)
- Proteina disulfuro isomerasa
- etc

3.1 FUNDAMENTOS CELULARES: Membrana - Estructura

Mosaico Fluido (Singer&Nicolson 1970)

3.1 FUNDAMENTOS CELULARES: Membrana - Composicin

Lpidos de Membrana
- Glicerofosfolpidos
- Fosfatidilinositol
- Cardiolipina
Efecto de cido grasos insaturados:
- Esfingolpidos
Bajan el punto de congelamiento de los fosfolpidos
- Colesterol
Membrana ms fluida

3.1 FUNDAMENTOS CELULARES: Membrana - Composicin

Membrana Mitocondrial Interna

3.1 FUNDAMENTOS CELULARES: Membrana - Composicin

80% lpidos

3.1 FUNDAMENTOS CELULARES: Membrana - Funcin

Mantener la integridad estructural de clulas y organelas (Barrera)
Fosfolpidos regulan actividad de las membranas enzimticas
Fosfatidilcolina y Esfingomielina Cara Externa
Fosfatidiletanolamina y Fosfatidilserina Cara Interna
Si expuesta en cara externa Adhesin (macrfago)

3.2 FUNDAMENTOS CELULARES: Transporte

3.2 FUNDAMENTOS CELULARES: Transporte - Difusin

Molculas pequeas, no polares O2, CO2, N2
Molculas sin carga polares rea, etanol, cido orgnicos pequeos
Direccin: A favor de la gradiente de concentracin
Difusin de H2O: smosis

3.2 FUNDAMENTOS CELULARES: Transporte - Protenas

Sustancias: molculas polares , grandes (aas, azcares)
Protenas de Membrana : - Portadores
- Permeasas
- Translocasas
- Protenas Carriers (ionforas)
Difusin Facilitada o Transporte Activo

Saturacin y Especificidad
Tmax : Ecuacin de Michaelis-Menten
Alta especificidad (ej. GLUT-1

3.2 FUNDAMENTOS CELULARES: Transporte - Glucosa

Protenas transmembrana
500 aa
12 hlices transmembrana

GLUT1
En eritrocitos
Funcin en ayuno

3.2 FUNDAMENTOS CELULARES: Transporte - Glucosa

Estmulo: Ingesta de glu
[glu]plasmtica sube

3.2 FUNDAMENTOS CELULARES: Transporte Canales y Poros

Canal vs Poro: Canal es ms selectivo y especfico para iones
Poro selectivo por tamao de sustancia
No hay cambios conformacionales para el intercambio
Apertura o Cierre de canales por ligando o cambio de voltaje
Pasan mol < 1kDa
Mutacin en conexina 26 y 32
genera la enfermedad
Charcot-Marie-Tooth

Pasan protenas y cidos

nuclicos
Radio 9 nm

Poros en mitocondrias y
Aparato de Golgi

3.2 FUNDAMENTOS CELULARES: Transporte - Activo

Fuente de Energa: ATP
T. A Primario : Utiliza la energa de ATP directamente
T. A Secundario : Utiliza la gradiente de Na+ o H+
Aminocidos y Azcares

3.2 FUNDAMENTOS CELULARES: Transporte Ca2+

3.2 FUNDAMENTOS CELULARES: Transporte H+

3.2 FUNDAMENTOS CELULARES: Transporte H+