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FUNDAMENTOS

BIOQUMICOS

I.N.E.F.

INSTITUTO NACIONAL DE EDUCACIN FSICA

FUNDAMENTOS
BIOQUMICOS

UNIVERSIDAD POLITCNICA DE MADRID

Dimas Carrasco Bellido


David Carrasco Bellido

NDICE
INTRODUCCIN
TEMA 1
Concepto de bioqumica. Composicin molecular de los seres vivos. Organizacin
celular y compartimentacin. Homeostasis.

ESTRUCTURA DE LAS PROTENAS


TEMA 2
Aminocidos como constituyentes de las protenas. Estructura y propiedades de los
aminocidos. Aminocidos no protecos. Pptidos. El enlace peptdico: estructura y
propiedades. Pptidos naturales.

TEMA 3
Niveles estructurales de protenas. Estructura primaria y secundaria de protenas.
Estabilizacin de la estructura secundaria. Tipos de estructura secundaria: - hlice,
estructura . Estructura terciaria de protenas, dominios y estructura supersecundaria.
Estabilizacin de estas estructuras. Protenas globulares y fibrosas. Estructura cuaternaria
de protenas.

FUNCIN DE LAS PROTENAS


TEMA 4
Clasificacin de las protenas. Unin de ligandos como caracterstica de protenas
funcionales activas. Protenas transportadoras y almacenadoras. Hemoglobina y
mioglobina: comparacin de estructuras. Unin de oxgeno. Concepto de alosterismo.
Cooperatividad en el transporte de oxgeno por la hemoglobina. Protena con funcin
protectora: inmunoglobulinas. Naturaleza qumica y estructura. Clasificacin y funcin.

TEMA 5
Funcionalidad cataltica de protenas: enzimas. Especificidad enzimtica. Centro
activo. Cintica de reacciones enzimticas con un sustrato. Ecuacin de Michaelis
Menten. Inhibicin enzimtica; tipos. Efecto del ph y de la temperatura sobre la actividad
enzimtica. Cintica de las reacciones enzimticas con ms de un sustrato.
TEMA 6
Relaciones estructura funcin en protenas: actividad cataltica. Tipos de
interacciones enzima sustrato. Mecanismo de accin enzimtica. Importancia de grupos
prostticos, coenzima y coofactores en la actividad enzimtica. Criterios generales.
Regulacin alostrica. Modificacin covalente de enzimas: zimgenos. Isoenzimas.
Regulacin de las rutas metablicas.

INTRODUCCIN
1- Concepto de bioqumica
La Bioqumica es la ciencia que estudia las bases moleculares de la vida, en la que
se integra y relaciona los conocimientos de dos ciencias, una la Biologa ( ciencia que
estudia las interacciones de las clulas y el organismo ), y otra la Qumica ( ciencia que
estudia las interacciones entre los tomos y las molecular ).
El trmino Vida, no es sencillo de definir, ya que es imposible explicar la esencia de
la misma, por lo tanto nos debemos limitar a decir las caractersticas vitales que diferencian
a los seres vivos de los inertes: nutrirse, relacionarse con el medio, reproducirse,
diferenciarse y crecer.
Para Norman Hollowitz, el concepto de vida atribuye a los seres vivos la capacidad de
replicarse, catalizarse y la mutabilidad ( adaptarse al medio ambiente ).
* Generalidades aplicables a los seres vivos.
1- Hiptesis gentica: dice que la herencia en todos los seres vivos es necesaria para que un
organismo crezca y se reproduzca, y se produce por la replicacin del DNA.
2- Dogma central de la Biologa: dice que el flujo de informacin gentico dentro de un ser
vivo, va desde el DNA hasta el RNA, y de ste a protenas.
3- Hiptesis enzimtica: dice que casi todas las reacciones qumicas que ocurren a nivel
celular, estn catalizadas por enzimas que son siempre
4- Hiptesis energtica: dice que en la unidad bsica de vida ( clula ), el ATP es la unidad
cuntica de energa, la cual, se libera cuando los distintos nutrientes se metabolizan en el
interior de la clula. Cualquier reaccin metablica producida en la clula que necesite
energa va a ser aportada por medio de la molcula de ATP.

5- Hiptesis del autoensamblaje espontneo: en determinados orgnulos de las clulas se


van a producir uniones de corpsculo integrante del citoplasma de manera espontnea.
* Cuatro motivos por la que la Bioqumica ha evolucionado:
1FUNDAMENTOS BIOQUMICOS.
TEMA 1: INTODUCCIN.
Bioqumica es el estudio de la qumico de los seres vivos.
Vida: Los seres vivos tienen unas caractersticas comunes:
- Tienen la capacidad de extraer energa desde los nutrientes para derivarla
en sus funciones vitales.
- Tienen la capacidad de crecer, diferenciarse y a veces de reproducirse.
- Son capaces de responder activamente a los cambios del medio que nos
rodea.
Norman Orovitz: La vida atribuye a los seres vivos o animados la capacidad de
replicarse, catlisis y mutuabilidad.
La bioqumica estudia los niveles moleculares de la vida.
Integra y relaciona los conocimientos de la qumica (estructuras e interacciones
entre tomos y molculas) y la biologa (estructuras e interacciones ente clulas y
sistemas).
Todos los seres vivos responden a unas generalidades, leyes o hiptesis de la
vida:
1. Gentica: La herencia gentica en todos los seres vivos necesaria para que un
organismo crezca y se diferencie se transmiten a travs de las molculas de
DNA.
2. Dogma central: El flujo de la informacin gentica ve desde el DNA hasta el
RNA y se traduce en las protenas.
3. Hiptesis enzimtica: Casi todas las reacciones moleculares (qumicas), que
ocurren a nivel celular estn catalizadas por enzimas (protenas).
4. Hiptesis de la energa: En la clula (unidad bsica de la vida) el ATP es la
unidad cuntica de energa. Se libera cuando los distintos nutrientes son
metabolizados. Para formar estructuras o tejidos hace falta ATP. El ATP
constituye unos de los principios bsicos de la bioqumica.
5. Hiptesis del autoensamblaje automtico: Se refiere a que determinados
orgnulos de la clula van a formar sistemas complejos a base de una unin
espontnea. Los ribosomas se autoensamblan de manera espontnea.
6. Siguen las mismas leyes fsicas que las matemticos, fsica, qumica, etc.
En los ltimos tiempos, ltimo siglo, la bioqumica ha sufrido un notable
crecimiento, debido principalmente a:
- Se han descubierto muchos mecanismos que son comunes a los de la vida. Por
ejemplo la doble hlice del DNA, en el seguimiento de la informacin gentica
hasta las protenas, descubrimiento de algunas protenas tridimensionales y sus
mecanismos de interaccin, conocimiento de las principales rutas de metabolismo,
etc.

En los diferentes tipos de vida hay pautas semejantes leyes comunes... Se


utilizan las mismas biomolculas en todas las formas de vida.
- Influye poderosamente en la medicina, se han descubierto enfermedades
metablicas como la anemia, la fibrosis... que estn determinadas por un
fallo celular. Tambin ha sido utilizado para diagnstico clnicos en anlisis
de sangre. Actualmente se cultivan cepas de bacterias para obtener
insulina u hormonas de crecimiento..., que tienen gran importancia en la
agricultura.
- Tcnicas ms sofisticadas han favorecido a resolver problemas que eran
fundamentales en la medicina y en la bioqumica. Se avanzo al distinguir
varias enfermedades y procesos desconocidos hasta nuestros das.
COMPOSICIN CELULAR.
La molcula ms pequea con vida es la clula. Se puede distinguir entre
molculas orgnicas e inorgnicas.
. Molculas orgnicas:
- Lpidos.
- Hidratos de carbono.

- Protenas.
- Ac. Nucleicos.
. Molculas inorgnicas:
- H2O.
- Iones asociados a sales minerales: Cationes (+) y Aniones (-).
Escherichia Poli: E. Poli. Es una bacteria de nuestro estmago que se usa por
su tamao como ejemplo de organismo vivo. Es un procarionte, GRAM (-),
unicelular.
Esta bacteria revela que el componente ms abundante son las protenas, por
tanto las protenas son cuantitativamente y cualitativamente (muchos tipos de
protenas) las ms importantes.
Tamao: Las molculas de mayor tamao son los cidos nucleicos, en
concreto el DNA, adems lo es en todos los organismos.
El H2O Es siempre la sustancia que mayor nmero de molculas tienen los
organismos, alrededor del 75% es agua en cualquier tejido salvo en el tejido
seo y el adiposo (las grasas).
Composicin celular: Las protenas y los cidos nucleicos son necesarios en
cualquier clula.
La cantidad de lpidos, hidratos de carbono e incluso agua pueden modificarse.
FUNCIONES.
Las protenas son las ms variadas en funciones siempre.
- Los cidos nucleicos:
DNA: Almacenar la herencia gentica.
RNA: Transcribir la informacin gentica a las protenas.
- Lpidos o grasas:
Estructural.
Reguladora.
Reserva energtica.
- Protenas:
- Estructural.
- Cataltico (enzimas).
- Regulador.
- Defensa (inmunidad y anticuerpos).
- Hidratos de carbono:
- Estructurales.
- Reserva de energa (mucho tamao).
LAS SALES MINERALES.
CLASIFICACIN DE ANDERSEN:
Depende de las necesidades diarias de cada elemento:
- Esenciales: + de 100 mg da: Ca, P, K, Na, Cl, ...
. _ de 100 mg da: Fe, Co, ...
- No esenciales: No esenciales, Ni, estao, ...
Contaminantes: Pb, Hg, ... Se encuentran en el pescado y los
empates.

Ca Se consumen entre 800 y 1.000 mg da. Est dentro de una ingesta


recomendada, IR o RDA. Es necesario para muchos procesos necesarios de la
vida, como el movimiento, la coagulacin, etc.
P Se consume entre 800 y 1.000 mg da. Es tambin una sustancia
imprescindible para muchas funciones bsicas de la vida.
K Es el principal catin a nivel intracelular.
Na Es el principal catin a nivel extrecelular.
Cl Es el principal anin a nivel intracelular.
Fe Se puede encontrar como catin aislado, o bien asociado a protenas:
- Transferina: Protena transportadora de Fe en el plasma.
- Ferritina: Protena de almacenamiento de Fe en la clula.
- Hemosiderina: Agregado insoluble de la ferritina.
- Hemoglobina: Protena que permite el transporte de O2 en sangre.
Co Cobalto, sin el cual no es activa la vitamina B12, Cianocobaladina.
Fl, Cu, ...
CLASIFICACIN DE LOS SERES VIVOS.
- Unicelulares: Mnera: (I) Son procariotas y unicelulares. Son las bacterias.
Protistas: (II) Unicelulares, eucariota que derivan n 3 reinos.
- Pluricelulares: .Planta: (III)
. Animalia: (IV).
. Fungi: (V).

REINO
TIPO DE CLULA
(I) Mnera
Procariota
(II) Protstas
Eucariota
(III) Planta
Eucariota
(IV) Animalia
Eucariota
(V) Fungi
Eucariota

NUTRICIN
N DE CLULAS
Auttrofo o hetertrofo
Unicelular
Auttrofo o hetertrofo
Unicelular
Auttrofo
Pluricelular
Hetertrofo
Pluricelular
Auttrofo o hetertrofo Pluricelular

Auttrofos: Biosintetizan sus constituyentes moleculares a partir de molculas


sencillas como pueden ser NH3 (amoniaco), H2O (agua), H2S (Acido sulfdrico) y
CO2.
Esto se puede producir mediante variados procesos:
1. Quimiolitrofos Son capaces de obtener energa a travs de la oxidacin de
los compuestos inorgnicos. Utilizan el NH2, H2S, CO2, ...
2. Fofoauttrofos Obtienen energa de la fotosntesis, son capaces de generar
su energa gracias ala luz del sol (energa solar), transformando compuestos
inorgnicos en orgnicos.
CO2 + H2O (CH2O) n . Hidratos de carbono.
3. Forma primitiva de la fotosntesis La realizan las bacterias verdes y
prpuras. Son anaerobias, se encuentran en lugares de gran contaminacin
orgnica.
CO2 + n (H2S) (CH2O) n + H2O + n S .Hidratos de carbono.
4. Cianobacterias Son capaces de fijar el Nitrgeno libre y transformarlo en
materia orgnica. La confiere pocas necesidades alimenticias, solo necesitan
algunos minerales.

ANIMALIA.
Son hetertrofos, requieren compuestos orgnicos para producir energa.
Necesitan oxidar compuestos orgnicos.
MONERA Y PROCARIOTAS.
1-.Clasificacin: - Cianobacterias: Viven del aire.
- Otra bacterias: 19 tipos.
2-. Clasificacin: Dependiendo del tipo de pared celular que tengan:
- Microplasmas: Es el ser vivo ms pequeo que existe. 0,12 micras.
- Gram +: Bacteria gruesa. Se tie y queda definitivamente as.
- Gram -: Poco gruesa, no sigue teida perpetuamente tras haberla colorado.
3-. Clasificacin:
- Arqueobacterias:
. Acidfilas: Viven en altas temperaturas y bajos Ph, >2.
. Halobacterias: Viven en lugares de gran concentracin salina.
. Metalgenas: Obtiene metano por reduccin de CO2, son anaerobias.
CON + H CH4 + O2.
- Eubacterias o verdaderas:
- Eucariotas.
LA CLULA.
Es la entidad compleja y mnima unidad donde se produce la vida.
Se apoya en la teora celular:
1-.
Las clulas forman toda la materia viva.
2-.
Todas las clulas provienen de otras clulas (por replicacin).
3-.
La informacin gentica para que crezca y se desarrolle se transmite de
una clula a otra.
4-.
Todas las reacciones qumicas de la vida discurren a nivel celular, dentro
de las clulas.
LA CLULA PROCARIOTA.
Por definicin pro = anterior y cario = ncleo.
Las clulas procariotas pertenecen al reino mnera, seres unicelulares y
auttrofos o hetertrofos. Son los organismos ms numerosos y ms distribuidos
de la tierra. Tambin son los seres ms antiguos de la misma, su origen se
remonta a 3.500 millones de aos. Pueden sobrevivir en condiciones muy
adversas, con falta de O2, a altas temperaturas, ...
Generalmente este grupo se compone por bacterias, las cuales tienen la
posibilidad de crear o sintetizar esporas, que les sirven para ser ms resistentes
an.
Su tamao es menor que el de las clulas eucariotas, su tasa de reproduccin en
tres veces mayor, como mnimo, que las eucariotas.
Cuadro del sistema internacional de medidas: SI.
- 1mm : 10-3 m
- micra : 10-6 m
- nm (nanmetro) : 10-9 m
- (Amstrom) : 10-10 m

Grupos:

Segn su forma:

. Redondas: COCOS.
. Alargadas: BACILOS.
. Helicoidales: SPIRILLIUM.

CLULA PROCARIOTA.

Estructura:
. Apndices: Son proyecciones, los hay de tres tipos:
- Flagelos: Son distintos a los que tienen las clulas eucariotas, se componen
de una protena llamada flagelina y se encargan del movimiento.
- Pilis: Se le asocia con la transferencia de DNA en la conjugacin sexual.
- Fimbrias: Se utilizan para aderirse a superficies que son ajenas.
Las bacterias tienen una gran capacidad de movimiento, se mueven a 50 veces su
tamao en un segundo.
. Mb. Plasmtica: (con un grosor aproximado de 70 ), toda la bacteria est
rodeada por ella. Es una bicapa lipoproteca, sus protenas se encuentran como:
. Funcin estructural.
. Funcin cataltica, que sirve para comunicarlas con el exterior.
. Pared rgida: Con un espesor variable entre los 50 y 500 , es la encargada de
conferir proteccin mecnica y la capacidad de no incharse por osmosis.
Tambin le tiene capacidad antignica, de defensa, est constituida por polisacridos y
protenas.
. Cpsula: Solo la tienen algunas, es una capa con estructura gelatinosa,
compuesta por un gel de polisacridos. Su funcin es la misma que la pared
rgida, pero esta aumenta ms sus propiedades.
COMPARTIMENTOS INTERIORES:

. Mesosomas: La Mb plasmtica de los procariotas se caracteriza por replegarse


hacia el interior constituyendo los mesosomas, son trozos de membrana donde
tiene lugar la replicacin de DNA adems de alguna reaccin qumica propia de
los procariotas.
. Ribosomas: Orgnulos no membranosos que se encuentran a nmero de entre
10.000 y 15.000 unidades y que tienen un tamao de 250 . Son los encargados
de la sntesis de protenas, cada ribosoma crea una molcula de protena por
minuto.
. Citosol: Es el medio intra celular acuoso, no es de densidad constante, es decir,
no es homogneo. Se suspenden orgnulos que no se disuelven y otros que si
(las protenas). En el se encuentran los Ac. Nucleicos sin delimitar por ninguna
membrana (DNA y RNA).

. Nucleoide: Los Ac. Nucleicos se suelen localizar en las zonas centrales de la


clula, a las que llamamos nucleoide. Estos cidos son los encargados de
transferir la informacin codificada gentica. En todas las clulas hay DNA, pero el
RNA no necesariamente.
ESCHERECIA POLI: Es un husped normal de nuestro intestino, del colon de los
mamferos superiores, mide dos micras de largo y una de ancho, presenta
apndices que sobresalen de la clula, flagelos y pilis para dos cosas locomocin
y transferencia de DNA.
Cataliza entre 3.000 y 6.000 tipos de molculas diferentes, protenas, cidos
nucleicos, lpidos, glcidos, iones, pequeas molculas orgnicas...
Solo tiene una molcula de DNA que codifica la secuencia de unas 3.000
protenas de las que solos conocemos 1.000.
LA CLULA EUCARIOTA.
Por definicin eu : Verdadero, y cario : Ncleo.
Se caracteriza por que sus orgnulos van a estar separados por membranas.
Diferencias que existen entre eucariotas y procariotas:
- Son clulas de dimetro mucho ms grande (10 a 100 micras de dimetro).
- Son mucho ms complejas, tardan ms en reproducirse, se encuentran en
menor nmero habitando la tierra.
- Van a contener numerosos orgnulos delimitados por membranas.
Estructura de dentro a fuera:
Ncleo. Mide de 10 a 20 veces lo que una clula procariota, va a contener el 95%
del DNA de la clula.
- Nucleoplasma: Es el espacio delimitado por la membrana nuclear, en el se
puede distinguir dos zonas una clara (la cromatina- que tendr gran
importancia durante la replicacin celular-) y otra oscura, mucho ms
densa, que es donde se sintetiza el DNA.
- Nucleolo: En l se sintetiza el RNA, ensamblandose con las subunidades de
los ribosomas. En el nucleolo no hay DNA.
- Mb. Nuclear: Es doble, aportando as el doble de proteccin, limitando ms
al ncleo y dejndolo incomunicado. Hay una capa exterior y otra interior.
CLULA EUCAIOTA.

Citiplasma. En l se encuentran numerosos orgnulos:


- Mitocondrias: Orgnulos que se encuentran flotando en el citoplasma y que
tienen muchas caractersticas comunes con las clulas procariota, tamao,

aporte energtico, estructura,... Se acepta la teora que dice que el origen


de las mitocondrias es la fagocitacin de clulas procariotas con su
posterior adaptacin y colaboracin con la clula eucariota.
RUTAS METABLICAS.
A nivel de citoesqueleto:
1. Glucolisis: Consiste en conseguir ATP a partir de la sntesis de glucosa.
2. Glucognesis: Es la sntesis de glucosa no procedente de hidratos de carbono,
se produce en el hgado.
. A partir de aa (amino cidos), Glucosa alanina (se produce en ejercicio).
. A partir de Glicerol: El hgado libera glucosa a la vez que captura glicerol.
. Ac lctico: CICLO DE CORI. Transforma el lactato en glucosa (en ejercicio).
3. Glucogenolisis: Sntesis de glucgeno de reserva. Hay dos reservas:
. Msculo esqueltico: Requerimos energia para el trabajo fsico.
Modo anaerobio: Ac. Lctico.
Modo aerobio: H2O.
. Hgado: Se produce al necesitar glucosa sangunea o al bajar el nivel de la
misma.
4. Ruta de las pentosas: En realidad su funcin es el intercambio en los hidratos
de carbono de molcula de C (comprendidas entre C3 y C7). Tiene su
importancia en la formacin de los cidos nucleicos (permite la sntesis de un
C5 importante que es la ribosa-P que forma parte de los cidos nucleicos).
5. De Sntesis: Son los anabolizantes y consumen o degradan energa.
. Sntesis de ac grasos Importante si comes mucho.
. Sntesis de purinas y pirimidinas.
. Sntesis de esteroides Algunas hormonas (Mn SOD).
6. Oxidativas.
A nivel de lisosomas:
El aparato digestivo metaboliza las sustancias de desecho, sintetiza los
desperdicios o sustancias de desecho. Son los llamados enzimas lisosomales:
. Catepsina Hidroliza las protenas que no sirven.
. DNasa y Rnasa Degradacin del DNA y RNA ( -asa siempre =
degrada).
. Hidratos de carbono En la digestin. Se producen desde la toma de
alimentos hasta su transformacin en glucosa(hexosiminidasa A y
betaglucosilasa).
. Esfingomielasa: Es la encargada de acabar con la esfingomielina. Es un
lpido complejo componente de los axones de las neuronas.
A nivel mitocondrial:
En la mitocondria se concentra la funcin energtica de la clula. Es el lugar
prinpal de sntesis de ATP, en ella se localizan todos los procesos oxidativos
(aerobicos).
. Ciclo de krebs: Metabolismo de los cidos grasos, aa, y glucosa. Puede derivar
en la sntesis de grasa y en la formacin de ATP.
. Beta oxidacin de los cidos grasos:
PROTNAS

HIDRATOS DE CARBONO

CIDOS GRASOS


AMINOCIDOS

GLUCOSA

AEROBIA
ANAEROBIA

. LIBERA ATP

CIDO PIRBICO

CICLO DE KREBS

GLICEROL

CIDOS GRASOS

BETAOXIDACIN DE LOS CIDOS GRASOS

. Fosforilacin oxidativa.
. PDH Es el enzima que determina si el proceso oxidativo es aerobio o
anaerobio. Es irreversible, es el encargado de llevar cido pirbico a la
mitocondria. Su funcin est relacionada con la respiracin celular.
c. Pirbico PDH Acetil Co-A
(proceso irreversible)
(Citosol)
(CO2)
(Mitocondria)
A nivel del ncleo: Es el encargado de almacenar y expresar los genes.
. Replicacin de DNA.
. Sntesis o transcripcin de RNA.
. Traduccin de RNA a protenas.
A nivel de peroxisomas: El peroxido de hidrgeno es el agua oxigenada.
. Catarasa (libera O2) H2O2 H2O + O
. D y L Aminocido oxidasa 1 para cada aminocido.
A nivel de membrana nuclear: Llevan las relaciones entre el interior y el
exterior.
Son los enzimas relacionados con el transporte. El ms importante es el Na K ATPasa, que
se engarga de funcines de transporte, mantener el gradiente de presin y excitacin celular.
Adems libera el ATP (por lo tanto libera energa).
A nivel de receptores: Son las sustancias que reconocen a las hormonas, principalmente
al glucagn y a la insulina. Llevan a cabo la regulacin de los hidratos de carbono(LDL
light densitive lipity-).
. Translocasas de glucosa.
. GLUT Protenas transportadoras de glucosa, el subindice de estas protenas nos indica
el tipo de tejido (por ejemplo 4 sera tejido esqueltico).
A nivel de retculo endoplasmtico:
LISO.
Se encarga de la sntesis de lpidos complejos:
. Fosfolpidos.
. Hidroxilacin de los esteroides (meter OH).
. Actividad del citocromo P-450, se encuentra en el hgado y es el responsable del
metabolismo de sustancias estimulantes).
RUGOSO Y APARATO DE GOLGI.
Stesis de protenas membranales con funcin estructural y secrecin de protenas.
MTODOS DE LABORATORIO PARA EL ROMPIMIENTO Y SEPARACIN DE LOS
ORGNULOS.

Se necesita aislar el orgnulo. Primero se rompenlas clulas (lisar la clula) y luego se


separan los orgnulos (homogeneizado).
1-. Mtodos de lisar la clula:
a) Licuar.
b) Molimiento con sustancias abrasivas.
c) Vibraciones electromacnticas: (permite controlar la inrensidad).
d) Mtodos osmticos: Poner al tejido en una solucin muy concentrada, mediante lo cual
sale agua al exterior. Se aade agua posteriormente, la clula comienza a absorberla
hasta que estalla.
e) Lisocima: Se usa para las clulas bacterianas. Gracias a la lisocima se quedan sin pared
celular, convirtindose en cloroplastos siendo muy vulnerables al choque osmtico.
2-. Obtencin del homogeneizado:
Romper Obtener un lquido homogeneizado.
El mtodo que se usa es el centrifugado, los orgnulos tienen una sedimentacin diferencial
y progresiva.
. 1000 g en 5-10 minutos se sedimentan los ncleos.
. 10000 g en 10- 15 minutos se sedimentan las mitocondrias y los lisosomas.
. 100000 g en 1-2 horas se sedimentan los ribosomas y el retculo endoplasmtico.

LAS PROTENAS.
Por su significado etimolgico (protos es principal), sabemos que son necesarias, y que son
las sustancias principales por el gran nmero de funciones que realizan. Son los principales
causantes de todo lo que ocurre a nivel celular y corporal.
Las funciones de las protenas son:
Enzimticas: Catalizan casi todas las reacciones.
Receptoras: Se encuentran dentro de la clula (en el ncleo, dentro de orgnulos,...),
dentro de la membrana plasmtica, en la superficie de la membrana plasmtica, etc.
Estructural: Es la ms importante a nivel de membrana, muscular (constituye las
miofibrillas de miosina y actina), en los huesos y tejido conjuntivo (el colgeno es la
principal molcula estructural).
Transportadoras: El transporte de molculas apolares en sangre se realiza gracias a las
protenas. Las lipoprotenas transportan los lpidos, las albuminas transportan las
grasas, etc.
Anticuerpos: Funcin defensiva y protectora. Frenan y bloquean los efectos de los
antgenos (sustancia que nos invade) gracias aun anticuerpo (pretenas). Los receptores
de los linfocitos aseguran la defensa.
Las protenas estn compuestas por 20 aminocidos de 300 que existen, estos son los aa
codificados o estandar. Los genes tienen la suficiente informacin para saber el orden de la
secuencia de aa que forman una protena. Son secuencias de DNA que repiten tres tipos de
bases, son los codos o tripletes que se traducen por un aminocido.
DNA cada codon 1aa. Por este motivo se produce la herencia fsica.
Las protenas tienen un reciclamiento (turnover), mientras unas viejas y degradadas otras
nuevas se estn sintetizando.
La vida media de una protena tiene relacin con el turnover, es el tiempo que tardan las
protenas en ser cambiadas por otras de su mismo tipo. Este tiempo oscila entre unos
minutos y varias semanas.
AA COMO CONSTITUYENTES DE LAS PROTENAS.
Los aa que se encuentran en las protenas son alfa aminocidos (que son los mismos 20 que
se encuentran codificados, y se encuentran en su forma L (levgina).
Excepto para la glicina, tienen en comn un carbono asimtrico o quiral. El carbono tiene
cuatro valencias.
ESTRUCTURA GENERAL DE LOS AA.

H
NH2- C-
COOH
El alfa viene determinado por el grupo COOH.
La cadena lateral determina sus propiedades y caractersticas.
La cadena principal es la sucesin ms larga de C, quedando hacia fuera sus radicales.
Se clasifican en 7 grupos y con tres acepciones:
Alanina/Ala/A.
Cistena/Cis/C.
cido asprtico/Asp/D
cido glutamnico/Glu/E
Fenilalanina/Fen/F

Glicena/Gli/G
Histidina/His/H
Isoleucina/Ile/I
Leucina/Leu/L
Metionina/Met/M
Asparragina/Asn/N
GRUPOS DE AA:
Suscaractersticas comunes van a ser si son polares (buena relacin con el agua), o son
apolares (hidrfobos). Tambin se distingue segn la tabla alimenticia, es decir si son
esenciales (no los podemos sintetizar) o si son no esenciales. Tambin sabemos que todas
las protenas animales son ms ricas energticamente que las vegetales. Tambin podemos
encontrar algunas que solo son esenciales en algunos momentos de nuestra vida.
Consideranos tambin el grado de Ph, de esta forma encontraremos aa cidos (donadores de
protones), AA bsicos (receptores de protones, o neutros.
1-. ALIFTICOS: Su cadena lateral solo tiene hidrgenos y carbonos. Son apolares. Son
hidrfilos (rechazo por las molculas de H2O). Con la Glicina (2-C) cuyo radical es H,y la
Alanina (3-C) cuyo radical es CH3.
Tambin estn los ramificados, que adems son esenciales, es decir, necesitamos ingerirlos
porque somos incapaces de sintetizarlos dentro de nuestro organismo), estos son: Valina
(C-5), Isoleucina (C-6), Leucina(C-7).
2-. AROMTICOS: Se caracterizan porque tiene anillo aromtico, que es una estructura
cclica que tiene dos enlaces.
Fenilalanina, es apolar y esencial.
Tiroxina, es polar.
Triptfano, es esencial.
3-. AZUFRADOS O SULFURADOS: Son la cistena y na metionina.
- La cistena: Tiene como radical el CH2-SH, el grupo sulfihidrilo tiene la capacidad
de reaccionar con otro SH creando unos puentes disulfuro y originar un dipctido
llamado cistina. Es un grupo muy frecuente entre las protenas estructurales. Es
polar, levemente cido y no esencial.
- La Metionina: Su radical es CH2-CH2-S-CH3. Como el sulfuro est en medio es
neutro, apolar y esencial.
4-. CIDOS O DICARBOXLICOS (-COOH) Y SUS DERIVADOS:

Asprtico: .R: CH2-COOH


.Polar.
. cido.
. No esencial.

O
!!
(derivado) Asparragina:. R: CH2-C-NH2
. Polar.
. cido.
. No esencial.
O

Glutmico: .R: CH2-CH2-COOH


. Polar.
. cido.
. No esencial.

!!
(derivado) Glutamina: .R: CH2-CH2-C-NH2
. Polar.
. Neutro.
. No esencial.

5-.
BSICOS: Tienen tendencia a aceptar protones. El NH2 captura un protn para
convertirse en NH3+.
NH2
!!
Arginina: . R: (CH2)3-NH-C-NH2. Este es el grupo guaridina, que puede aceptar (H+).
. Polar.
. Bsico
. Esencial.
Histena: . R: Grupo inmidazol (anillo de 2N y 3C, dos dobles enlaces y aceptor de (+)).
. Esencial
. Polar.
. Bsico.
Lisina: . R: (CH2)4- NH3.
. Esencial.
. Polar.
. Bsico.
6-. HIDROXILADOS O CON GRUPO ALCOHOL:
Serina: . R: CH2-OH
. Polar.
. Neutro.
. No esencial.
Treonina: . R: CH-CH3

OH
. Polar.
. Neutro.
. Esencial.
7-. CCLICOS O AMNIDOS:
Prolina: . R: (CH 2)3-C@

NH2

. Apolar.
. Neutro.
. No esencial.
CARACTERSTICAS DE LOS AA.
1.
No tiene carbono asimtrico nicamente la Glicina o glicocola.
2.
Los aa treonina e isoleucina tienen dos carbonos asimtricos.
3.
La glicina y la pronina se encuentran amenudo en los pliegues o codos de las
protenas por culpa de su estructura.
4.
La glicina se encuentra cada cuatro residuos en el colgeno.
5.
La serina, treonina y la tiroxina (los hidroxilatos), pueden fosforilarse por su OH,
que interviene en muchos procesos de regulacin.
6.
La metionina y el triptfano estn codificados solo por un codon o triplete mientras
que las dems tienen dos o ms codones. Estos dos aa son los menos frecuentes en
las protenas.
7.
El aspartato y el glutamato (ambos con cargas negativas) son neurotransmisores
excitantes del cerebro, especialmente el ltimo.
8.
El triptfano es el encargado o precursor del 5-DH-TRIPTAMINA, es un
neurotransmisor que provoca el sueo.
9.
La metionina es el aa que inicia las protenas.
10.
La alginina y la lisina se encuentran cargadas negativamente a PH fisiolgico.
11.
La histidina (su anillo), est cargado positivamente a PH fisiolgico.
ENLACE PEPTDICO.
Para que los aa se unan dando lugar a protenas, es necesaria la obtencin de un enlace
peptdico. El carbono alfa - C@ - del AA1, por su grupo amino, reacciona con el grupo
carboxilo del AA2. Lleva consigo la aliminacin de una molcula de H2O.
Es un enlace plano y rgido, que imposibilita la rotacin entre el H y el C. Nos lo
encontramos entre cada residuo de la cadena de la protena. A la izquierda solo queda el
grupo amino, a la derecha queda el grupo carboxilo que es por donde crece (ambos
extremos estn libres).
AA1 + AA2 DIPPTIDO.
Residuo + residuo

Proceso que requiere un consumo de energa, es endotrmico (necesita color).


El proceso contrario se produce cuando se rompen los enlaces.

AA1 + AA2 + AA3 TRIPPTIDO.


AA1 + AA2 + AA3 + AA4 POLIPPTIDO. (As hasta decapptido).
* Residuo es al AA que compone una protena.

* El proceso de formacin de un polipeptido es endergnico, absorbe calor, mientras que la


ruptura del polipptido es un proceso exergnico, desprende calor.
LOS AA EN RELACIN CON EL PH.
Consideramos: 1 < PH < 6,9 CIDOS
PH =7 NEUTROS
7,1 < PH < 14 BSICOS
Dependiendo del PH las caractersticas de acided o basicidad van a cambiar.

El PH fisiolgico es 7,4 es neutro, ligeramente alcalino (bsico).


. A PH 1: Cualquier AA va a tener los grupos as:
R- C@ _ COOH
NH3+.
En los medios cidos el AA se comporta como bsico, captando H+.
. A PH Fisiolgico (7,4): Los grupos quedan:
R- C@ COONH3+.
Se comporta como una molcula bipolar.
. A PH 11: Cualquier AA se encuentra como:
R- C@ COONH2.
En un medio bsico los AA se comportan como cidos, sueltan protones.
Las funciones de los AA varan dependiendo del medio, se comportan como sustancias
tampones, es decir, amortigua los cambios del PH.
N DE AA EN LAS CADENAS POLIPEPTDICAS O PROTENAS.
Los Dalton o Kilodalton se utilizan para nombrar el peso de las protenas. Son la unidad
de masa atmica. Para averiguar el n de AA que componen una protena, partimos de que
el peso molecular de las mismas oscila entre 100 y 110 Dalton (cada residuo). Se suele
dividir el PM (peso molecular) de la protena entre el peso molecular de los residuos,
obteniendo aproximadamente el nmero de AA que componen esa protena.
PROPIEDADES ACIDO-BASE DE LOS AA.
Vamos a analizar el carcter de los AA desde el punto de vista fisiolgico (lo que hacen en
el organismo). Los AA se comportan como iones bipolares a PH 7,4.
Un cido cualquiera en disolucin: AH A- + H+
COOH COO- + H+
Cuanto ms fuerte sea el cido ms hacia la derecha estar. Para amortiguar los cidos
usamos las sales bsicas SA AUn cido fuerte tiene un PK alto, pero un Pka bajo. Ka es la constante en equilibrio. Pka de
un cido es el PH en el cual se encuentra dividido mitad y mitad.
AH A- + H+
PH(x) 50% PH (y) 50%
x =90, y =10
Ecuacin de Henderson- Haselbach.
La relacin entre el PH de una solucin y el Pka del grupo cido con el logaritmo de la base
conjugada del cido.
PH = PKA + LOG (Base conjugado) =/= 20.
(cido)
Relacione el PH del lquido corporal con el Pka del grupo cido a travs de los logaritmos
de las concentraciones, es decir, saber si dona o acepta H+.
El CO2 tambin funciona como tampon o bufer.
PH = 6,1 + LOG (CO3 H-)
.
(CO2) + (CO3H2)
DIOXIDO DE CARBONO

AC. CARBNICO

IN CARBONICO

CO2 + H2O
CO3 H2 COH- + H+
(A)
(B)
(C)
Se encuentran en A,B o C dependiendo de las necesidades del PH corporal.
ACIDOSIS FISIOLGICA.
Sera aquella situacin en la que el PH se menor de 7,35. (PH < 7,35)
Se puede producir en el ejercicio o por imposibilidad de eliminar sustancias cidas.
- Acidosis respiratoria: Se produce a causa de enfermedades obstructivas, consiste en
que no se puede expulsar el CO2. El PH aumenta porque el total de cido carbnico
aumenta. La ecuacin se traslada hacia B.
- Acidosis metablica: Es muy corriente en situacin fisiolgica de ejercicio. Se va a
producir un exceso en la proporcin de cidos no vortiles, por la produccin de
cido lctico que pasa a sangre desde los msculos, el cual no puede ser
neutralizado por el bicarbonato (que est disminuido). Esta acidosis metablica es
tambin frecuente (no en ejercicio fsico) entre los diabticos.
Las respuestas a la acidosis respiratoria es un aumento de los cidos en orina y la retencin
del bicarbonato.
La respuesta a la acidosis metablica es un aumento de NH4+ en orina y expulsin tambin
en orina del in fosfato (PO4H2-), se aumenta el CO2 expirado y se retiene el bicarbonato.
ALCALOSIS FISIOLGICA.
Cuando tenemos un PH superior a 7,45 estamos en esta situacin. Es producido por una
excesiva eliminacin de cidos o por una ingesta desmesurada de bicarbonato.
Podemos encontrar dos tipos de alcalosis en el organismo:
- Alcalosis respiratoria: Se produce por una excesiva eliminacin de CO2 que
responde a dos motivos, por ansiedad o por meningitis. El PH est aumentado
porque el CO2 y el CO3H2 estn disminuidos. Se neutraliza con una mayor
excrecin de bicarbonato y una retencin de cidos.
- Alcalosis metablica: Est relacionada con la manipulacin de la ingesta, se
produce por una sobrecarga de bicarbonato, para evitar vmitos o emesis durante el
ejercicio. Se neutraliza mediante la excrecin de bicarbonato, aumento de
bicarbonato en orina y se reduce la eliminacin de CO2 y CO3H2.
Los AA funcionan por tanto como neutralizadores o sustancias tampom porque su
estructura est determinada como bipolar:
2 GRUPOS CIDOS: . COOH COO- + H+ Es la molcula ms cida.
. NH3+ NH2 +H+
2 GRUPOS BSICOS: .COO- COOH
. NH2 NH3+ Es la sustancia ms bsica.

PEPTIDOS NATURALES.
Hasta 10 se pone la preposicin; bi, tri, ..., nona, deca.
A partir de 10 resduos se les conoce como polipptidos.
Tambin se consideran pptidos a aquellas cadenas que tienen menos de 50 AA.
La insulina est en el lmite (51 AA).
Loa pptidos naturales tienen funciones muy diferentes:
- Son agentes reductores (mutatin).

Hormonas, endocrinas porque son de naturaleza polipptida.


Neurotransmisores.
Antibiticos.

GLUTATIN.
Es untripeptido compuesto por tres residuos de AA. Se ha clasificado como 1 pptido no
proteco por dos razones:
- Su carbono es Beta y no alfa (se une por la cadena lateral).
- En su sntesis no intervienen los cromosomas (no sigue el mtodo normal:
cromosomas, RNAm , protenas, AA...).
Su concentracin es de 5 Molar en los humanos.
Sus grupos ms importantes son el tiol (SH), y el sulfhdrico, gracias a los cuales forma
enlaces entre ellos mismos dando lugar a puentes de hidrgeno.
Su ciclo glutmico:
1.

2.

AA: C. GLUTMICO + ATP BETA GLUTAMILCISTEINASA.


CISTEINA.
CISTEINA.
BETA GLUTAMILCISTEINASA + GLUCINA +ATP GLUTATIN SINTASA GLUTATION
BETA GLUTAMIL- CISTEINA GLICINA.

Funcin:
Capacidad de proteger a los lpidos.
Sirve de coenzima para algunas de las reacciones de reduccin, es uno de los procesos para
defender las membranas nucleares.
Sirve para la coagulacin sangunea: Se agrega por precursores de protenas.
HORMONAS.
La estructura qumica de las hormonas es en todas esteroideas, compuesta por AA,
tiroideas.
INSULINA:

Est compuesta por dos cadenas A (30 AA) y B (21) con un peso molecular de 6 KD.
La cadena A es la encargada de la actividad biolgica, es apolar en su parte central y en los
extremos (C terminal y N terminal) se encuentra su parte ms polar. La cadena B tiene una
funcin inmurolgica, aunque en los seres humanos no sea tan eficad como en otros seres.
Se puede asociar con sigo misma, dando lugar a dmeros, trmeros, etc. (sobre todo en
presencia de Zing Zn 2+-). Gracias al Zing, la liberacin es ms retardada, a la vez que es
ms resistente al enzima Proteasa, encargado de deshacer el enlace peptdico.
El gen que segrega la insulina se encuentra en el cromosoma 11 de los islotes Beta de
Langermans (clulas endocrinas), y en la digestin del jugo pancretico (clulas exocrinas).
Ambas se hayan en el pncreas. Estimula el almacenamiento (la biosntesis), de
macromolculas, como por ejemplo las grasas. Su aparicin est muy relacionada con la
dieta:
. Si hay alta concentracin de glucosa o AA, la concentracin de insulina sube (se produce
una biosntesis de macromolculas - es lipognica - y favorece la recuperacin de
glucgeno).

. Si se produce una bajada de glucosa o AA, la insulina tambin baja, bajando la biosntesis
de macromolculas y la recuperacin de glucgeno.
Su formacin se produce tras la trancripcin de cromosoma 11, dando lugar a la
preinsulina, posteriormente a la proinsulina, y por ltimo originando la insulina y un
pptido del que se desconoce su funcin llamado pptido P.
La vida media de la insulina es muy corta, porque la mitad de las molculas se utilizan a su
paso por el hgado. Para medir la insulina se analizan la cantidad de ptidos P, ya que
apenas se encuentra en las venas perifricas. Todos los tejidos, incluso el cerebro, requieren
insulina para por lo menos sintetizar pptidos. La insulina si llega al cerebro va activar el
CCK, inhibiendo la ingestin de alimento. Interviene directamente en la regulacin de
energa (hidratos de carbono).
GLUCAGN:
Se segrega en los islotes Alfa de Langerman en el pncreas o bin en las paredes del tubo
digestivo.
Se compone por una cadena con 29 residuos de AA. Tiene un peso molecular de 3,5 KD.
La actividad biolgica reside en el extremo N terminal AA de 1 al 6. El genresponsable de
su sntesis reside en el cromosoma 2 de las clulas alfa de los islotes de Langerman.
Tiene una corta vida media, porque es utilizada en su primer paso por el hgado. La
ingestin de protenas aumenta los AA en sangre, lo cual provoca su secrecin (se produce
un proceso indirecto, baja la concentracin de glucosa, pese a que los aminocidos
aumentan su concentracin). El glucagn es un aporte de energa que utilizamos al ayunar,
por stress, en procesos enfermales, durante el ejercicio, etc.
Su funcin principal es movilizar las reservas energticas, especialmente el glucgeno. Se
sintetiza como prehormona, prohormona y finalmente glucagn. Los factores alimenticios
son sus activadores.
En situacin de ejercicio aumenta la concentracin de glucagn y disminuye la de insulina,
sin embargo en recuperacin, aumenta la concentracin de insulina mientras que disminuye
la de glucagn.

EN EJERCICIO

[I],[G]

EN RECUPERACIN

[I],[G]

SOMATOSTATINA:

Su caracterstica es que se puede segregar en lugares difciles, se la conoce como STT del
pncreas. Se segrega en los islotes Delta de Langerman en el pncreas y en el hipotlamo
(como neurotransmisor). Es una hormona intestinal y pancretica. Tiene su actividad
biolgica en el AA 14 de la cadena. Se sintetiza en forma de pre, pro y hormona en un
fragmento muy largo.
Como neurotransmisor es inhibidor de otras hormonas, como la del crecimiento, tirotropa y
prolactina. Su segregacin se realiza a nivel pancretico e intestinal. En el AA 28 es
estimulada con un aumento de la [glucosa], [glucagn], [cidos grasos] o [hormonas
gstricas -CCK-]. Su funcin es reducir la velocidad de la digestin y reducir la velocidad
de absorcin de los nutrientes, especialmente glucosa, cidos grasos y AA que daraan lugar
a loshidratos de carbono, triacilglicridos y protenas respectivamente. Es un retroinhibidor
o feed-back.
STT

- - - + (en sentido contrario)


IINSULINA GLUCAGN

CALCITONINA: Intervienen en el metabolismo del calcio fosfrico (gran [] en elsalmn).


(en sentido contrario)

Es segregada por la glndula tiroidea, es un polipptido de 32 AA, con un peso molecular


de 3,4 KD. Est cerrada por un puente disulfuro, forma un bucle cerrado. La actividad
reside en la parte central.
PARAFOLICULAR: Se segrega en la glndula tiroidea, no es pancretica. La expresin del
gen es lo que determina la proximidad entre el sistema nervioso y endocrino.
TRANSCRIPCIN (RNA m) TRADUCCIN (AA)
CT (SON HORMONAS QUE VIAJAN POR SANGRE)

CGRP (NEUROTRANSMISOR
NEURONAS)
PARATHORMONA: (PT)
FOSFOCALCIO: Son hormonas peptdicas.

DE

LA

PERIFERIA

DE

LA

FUNDAMENTOS BIOQUMICOS.
TEMA 3: ESTRUCTURA DE LAS PROTENAS.
La estructura primaria la tienen todas las protenas, es el orden de su cadena .
La estructura secundaria es la ordenacin de los residuos que estn proximos a una cadena.
En esta estructura se dan enlaces no solo de tipo pectdico.
La estructura terciaria es el ordenamiento espacial de tramos alejados y se caracteriza por la
aparicin de enlaces disulfuro.
La estructura cuaternaria es la disposicin espacial de la protena con ms de una
subunidad, se dara entre una protena oligomtrica y una subunidad.
Las estructuras secundarias:
Agrupacin de las estructuras secundarias:
- Dominios: Consiste en que algunas cadenas se van a doblar, creando regiones
compactas, que a su vez este se va a unir a un segmento sencillo
polipectdico.
- B-alfa-B: Es un plegamiento por una zona concreta de un segmento sencillo de
polipectido.
En algunas podemos encontrar algn segmento en forma de hoja
plegada o B, esta a su vez est unido a otra protena que tambin est
plegada disponiendo una estructura alfahlice.
HOLOPROTENAS Y HETEROPROTENAS.
La holoprotenas se componen nicamente de AA. Se forman por hidrlisis o protolisis.
Las heteroprotenas estn formadas por una parte proteca (aa), ms un componente no
proteco, este ltimo recibe el nombre de grupo prosttico que resulta ser el encargado de la
capacidad funcional. Existe la posibilidad de poseer ms de un grupo prosttico, adems el
tipo de unin puede ser de naturaleza variable y de eleccin aleatoria con el grupo proteco.
Las heteroprotenas pueden ser:
. Cromoprotenas: Grupo proteco + Pigmento.
. Metaloprotenas: Grupo proteco + Metal.
. Lipoprotenas: Grupo proteco + Lpido.
. Glicoprotenas: Grupo proteco + Hidratos de carbono.
. Fosfoprotenas: Grupo proteco + H3PO4.
. Sulfuroproenas: Grupo proteco + H2SO4.
. Ncleoprotenas: Grupo proteco + Ac. Nucleco.
DOMINIOS:
La estructura secundaria es la ordenacin de los residuos que estn proximos a una cadena.
Tiene la caracterstica de la plegacin. Es el primer grado de plegacin de la cadena.
En este plegamiento se repite un patrn o esqueleto. Los enlaces son de tipo rgido (Se
forman entre el CO y el NH, miden 1,3 , los enlaces pueden ser covalente con un tamao
de 1,4 - o covalente doble con un tamao de 1,2 -).
El enlace tiene resonancia: Le confiere ms propiedades a la cadena. El HNO y C se
encuentran en el mismo plano. En el siguiente C ya no est en el plano.
La posicin total es TRANS; una detrs del plano y otra delante, generalmente los radicales
(-R) son cadenas de aa, por lo tanto se encuentran situados detrs y delante de las cadenas.

La cadena posee dos dipolos que se forman entre la unin del CO y el NH. Estos tienen una
direccin opuesta con respecto al enlace que entre el C y el N delanteros.
Adems, se producen angulaciones, quedando de la siguiente manera:
Estructura alfa.
N-C alfa Rota a la posicin Tsi.
El C alfa- C tambin rota y se coloca en posicin Psi. Tanto este como el anterior son
distintos de la estructura B.
El enlace peptdico entre C-N no rota.
ALFA HLICE:
Coloca (tiene) cadenas laterales hacia fuera. Hay una numerosa presencia de puentes de
hidrgeno. La rotacin es de tipo 1-4, y as prosigue hacia delante.
Esta estructura estabiliza la cadena. No son muy fuertes pero son muchos, se produce un
puente de hidrgeno cada 3 aa. La distancia que cubre esta estructura es de 5,4 . Adems
la distancia entre los residuos de los aa es de 1,5 .
Debido y derivadas de estas estructuras obtendremos las protenas de dos tipos: Fibrilares
(0% de estructuras B-alfa-B) y globulares(B-alfa-B% + alfahice%).
Se puede dar la presencia de metales. En la cadena de Prolina (la cual tena una cadena
lateral cclica) se producen giros y cambios de direccin debido al metal en las hlices.
Cuando actan metales aparecen fuerzas electrostticas.
La estructura primaria determina las caractersticas de la estructura secundaria y terciaria.
BETA LMINA:
Se unen de forma antiparalela, de forma extendida
MODELO BETA LMINA

NNNNNCCNN

\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\
CCCCCNNCC
NNNNNCCNN

\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\
CCCCCNNCC

La separacin entre residuos de aa es de 3,5 . La hebras son antiparalelas, es decir, son


paralelas antes de girarse.
Esto confiere a la protena la capacidad deplegarse, dando lugar a las protenas globulares.
Las protenas globulares tienen cambios de direccin, inversiones de los giros Beta, adems
de una estructura terciaria globular.

TIPOS DE ENLACES:
Enlaces inicos: Se producen entre un metal y un no metal, en el cual el no metal
funciona como ion negativo, mientras que el metal funciona como ion
positivo. El elemento metlico pierde los iones en beneficio del no
metal. Es un enlace fuerte debido a las atracciones electrotticas.
Enlace covalente: Se produce al compartir dos elementos dos pares de electrones. En
cada guin (forma de representarlo) se comparten dos electrones no
uno.
El carbono tiene valencias, una para cada enlace:
- Puede tener 4 enlaces simples.
- Puede tener dos enlaces simple y uno doble.
- Puede tener dos enlaces dobles.
Cuando los dos tomos tienen distinta capacidad de atraccin de
electrones, se da un fenmeno elctrico, dado que un estar cargado
positivamente y el otro negativamente con respecto al primero. Esto es
lo que ocurre frecuentemente entre el N y el O.
Puentes de hidrgeno: Se basa en la atraccin electrosttica que se produce entre un H
unido covalentemente a otro tomo y el oxgeno. Se puede dar en la misma cadena
(aislada) y entre cadenas. Este es un enlace dbil; es 1/20 del enlace covalente.
PROTENAS FIBROSAS MS IMPORTANTES:
) COLGENO Es una heteroprotena. Es el ejemplo de protena fibrosa, y tambin
porque en el ejercicio fsico es miembro de muchas estructuras. Se
requiere en muchos tejidos, como el colectivo, es resistente al
estiramiento mecnico. Tambin lo podemos encontrar el tejido seo, en
los dientes (donde deja los espacios que posteriormente son ocupados por
el fosfato clcico.
Es un componente esencial de la cornea donde aparece claro y translcido
(no como en los huesos o tendones que aparece de color veis claro). Por
tanto es una protena que dependiendo de donde se encuentre tiene una u
otra estructura.
En la piel se encuentra creando unas fibras que se entrecruzan sin
conectar unas con otras y se disponen en todas las direcciones.
En los vasos sanguneos tambin se encuentra el colgeno formando
helicoides , confirindoles la propiedad de elasticidad (vasodilatacin y
vasoconstriccin).
Sntesis: Se sintetiza en el retculo endoplasmtico rugoso.
- Sntesis: Se sintetizan las cadenas alfa que se localizan en el retculo
endoplsmatico y en los ribosomas. Hay dos tipos de cadenas precursoras del
colgeno, las Pro alfa 1 (con 100 residuos ms en el N terminal) y las Pro alfa 2
(con 300 residuos ms en el N terrminal).
- Composicin: El colgeno se compone de 1/3 de residuos de glicina y de Prolina.
- Modificacin: Se produce en el retculo endoplasmtico liso. Comienzan a aparecer
los derivado de aa, debido a una enzima que se encarga de la hidroxilacin. En este
proceso el colgeno (25%) reacciona con los enzimas y con la vitamina C, por eso
la falta de vitamina C se nota en la piel.

Glicosilacin: Consiste en la incorporacin de azcar. Se reliza en el retculo


endoplasmtico liso.
- Ensamblaje: Se realiza a travs de la formacin de enlaces de hidrgeno gracias a la
cistena. Esto ocurre en el aparato de golgi, en el se ensamblan tres cadenas, todas
ellas levginas individualmente pero la sper hlice triple gira hacia la derecha, es
detrgila.
- Ruptura de los extremos: Gracias al enzima tropocolgeno peptidasa se rompe el
enlace peptdico a nivel extracelular. Hay personas, como los contorsionistas, que
poseen un colgeno defectuoso, proporcionando a la persona de mayor elasticidad
(su colgeno es ms elstico pero menos resistente).
- Microfibra del colgeno: En cada vuelta de tropocolgeno hay tres residuos de aa.
La distancia de una vuelta de hlice es de 0,3 (nanmetros). La molcula de
colgeno tiene un dimetro de 1,5 y una longitud de 300 .
- Microscopio: El colgeno de divide en bandas claras y bandas oscuras:
. Bandas claras: 32 \ 67 se corresponde con una secuencia de 264 aa, va haber un desplazamiento
. Bandas oscuras: 35 /
de de la longitud total porque se coloca escalonadamente a la anterior.
Cuando se asocian las fibras aparecen enlaces covalentes (puentes de hidrgeno),
que le dan resistencia mecnica. Va a ser un precursor de la elastina.
) ELASTINA Es una protena muy importante pero menos extendida que el colgeno. Se
localiza en lo vasos sanguneos, piel, ... Confiere la propiedad de la
elasticidad.
Su PM (peso molecular) es 64 KD, Est formada por un alto porcentaje de
glicina y prolina, y muy poco porcentaje hidroprolina. No tiene
hidrosiglicina (0%). Las fibras se forman cuando las cadenas adyacentes se
cruzan de forma covalente. Esto puede ocurrir mediante dos procesos:
. 1-. Se oxida la lisina, pasando a ser hidroxilisina, se condensa el grupo aldeido de
la lisina, u se comunica con un grupo amino de otra lisina. Se forma una
Alisina, es decir dos lisinas unidas.
. 2-. Se condesan dos alisinas con un grupo delta amino delisina para dar lugar a la
desmosina.
La estructura confiere la capacidad de que la protena se extienda en forma
de red entre cuatro cadenas. De este modo casi el 100% de la estructura
secundaria es aleatoria. Se crean nudos entre las cadenas, se convierten en
los puntos de referencia. A nivel terciario es una protena fibrosa que
aparece con una estructura de red. La elastina confiere la propiedad de
elongacin en los tejidos que se encuent lugar que deba usar el oxgeno.
Por otra parte cuando se fija a la hemoglobina facilita la liberacin de O2.
En la actividad fsica antes de acumular el lactato, regula para que e
tengamos un receptor de LDL en la membrana de las clulas perifricas.

Receptores de LDL:
. Situacin: En una invaginaciones de las clulas de los tejidos perifricos. Son unas fosas
recubiertas que engloban a las LDL (mediante fogocitosis) y pasa a ser una vescula
recubierta mediante endocitosis. Una vez dentro se fusionan con los lisosomas, lugar donde
se lleva a cabo su degradacin.
PROTEASA APO AA libres
RECEPTORES DE LDL FOSA RECUBIERTA VESCULA
*2
*1
LIPASA AC.

TRIGLICRIDOS
STERES

ACILGLICRIDOS
COLESTEROL LIBRE
*1: En los tejidos perifricos tambin se unen las VLDL remanentes (las que quedan) y

tambin son degradadas. Si faltan molculas receptoras, en vez de unirse las VLDL se
transforman en LDL (aumentan las malas).
*2: No al exterior del lisosoma, un exceso de colesterol libre en el hgado puede bloquear la
enzima responsable la sntesis: HMG-GA REDUCTASA.
. Actan las proteasas sobre las APO.
. Las lipasas cidas actan sobre el grupo prosttico, rompen los triglicridos (resultando
AG + glicerol) y los steres de colesterol (AG + colesterol libre).
Defecto en los receptores:
- Les falta una parte proteca(exactamente lo que se tena que unir a las LDL.
- En algunos casos se encuentran mal situadas, dando lugar a una enfermedad
llamada Hipercolesteronemia.
Las HDL tienen tambin la APO C2, con la misma actividad, liberan los triglicridos a Q y
a las LDL. Van a traspasar el colesterol desde los tejidos perifricos hasta el hgado, donde
es catabolizado y eliminado por la bilis.
Con un gran nmero de HDL desciende el riesgo de enfermedades cardiovasculares, dado
que eliminan el colesterol en exceso de Q y de LDL. Se produce una mejora del perfil
emprico.

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