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Gentica Veterinaria
Manual de Laboratorio
INDICE
PRACTICA
PGINA
1 Uso de Excel1
2 Leyes de Mndel.12
3 Genetica de Poblaciones..27
4 Deriva Gnica.34
5 Factores de Ajuste..49
6 Heredabilidad ( Modelo de Regresin ).65
7 Heredabilidad ( Modelo de ANDEVA )70
8 Repetibilidad..78
9 Correlaciones Genticas y Fenotpicas..86
10 Interaccin G-A92
11 ndice de Seleccin...99
12 Uso del programa CowGame.107
13 Uso del programa Milk..118
PRACTICA 1
USO DE LA HERRAMIENTA ANALISIS DE DATOS DE EXCEL.
INTRODUCCIN
El enfoque cientfico es el mtodo ms avanzado de adquirir conocimientos
que haya logrado el hombre, ya que la investigacin cientfica posee capacidad de
autovaloracin.
La estadstica esta ligada con el mtodo cientfico; en la forma,
organizacin, recopilacin, presentacin y anlisis de datos, tanto para la
deduccin de conclusiones como para la toma de decisiones razonables con tal
anlisis.
Originalmente la estadstica estaba relacionada con cifras y datos recogidos
por los gobiernos con distintos propsitos, en el campo de la investigacin, el
anlisis estadstico genera informacin precisa y definida respecto a las
caractersticas de los datos de una forma que pueda ser comunicada con facilidad,
ya que reduce masa de datos a trminos descriptivos cmodos y extrae
inferencias de ellos.
Los trabajos que se publican en la mayora de las revistas cientficas del
rea de biomedicina de todo el mundo, as como la investigacin publicada en
foros tales como simposios, congresos, etc., se respaldan en anlisis estadstico
llevados a cabo en computadoras, y que se presentan, ya hoy en da con cuadros
y grficas elaboradas por paquetera computacional especializada.
El programa Excel del paquete Office de Microsoft en las versiones 95, 97,
98, 2000, Milenium, XP, etc. contiene una herramienta de anlisis estadstico. Por
lo que se ha considerado de gran ayuda esta utilera como apoyo en la materia de
Gentica, sobre todo en los clculos estadsticos de Varianzas, Covarianzas,
Regresiones, Correlaciones y Tabla de ANDEVA (Anlisis de Varianza).
OBJETIVO.
Usar la herramienta Anlisis de Datos del programa Excel en un conjunto de
datos numricos para calcular los principales estimadores estadsticos y sus
grficos ms comunes.
MATERIAL Y MTODO:
Se requiere una computadora bsica con las siguientes caractersticas
mnimas:
Metodologa a seguir:
PARTE I.
1. En la pantalla del Escritorio usar el ratn y activar INICIO.
2. Elegir PROGRAMAS y activar MICROSOFT EXCEL .
3. Cuando en pantalla aparezca el LIBRO DE EXCEL.
Figura 1.
4. Pasar los datos del ejercicio 1 a dicha hoja. Procurando que cada variable
quede en una columna. (Fig. 1)
5. Al terminar SALVAR los datos.
6. Activar la orden de HERRAMIENTAS, elegir ANLISIS DE DATOS. (Fig. 2)
Figura 2
Figura 3.
Figura 4.
Esta utilera nos permite obtener las medidas estadsticas que a continuacin se
listan:
Media
Error tpico
Mediana
Moda
Desviacin estndar
Varianza de la muestra
Curtosis
Coeficiente de asimetra
Rango
Mnimo
Mximo
Suma
Cuenta
PARTE II.
Figura 6.
3. ASIGNAR el titulo del grafico, del eje de categoras (X) y del eje de categoras
(Y). Dar clic en SIGUIENTE. (Fig. 7)
Figura 7.
Ejercicio 1. Los datos siguientes son algunas variables medidas en 100 cerdas
en produccin y son: Cerdas, Nmero de parto, Intervalo Entre Parto (das),
Lechones Nacidos Vivos, Lechones Destetados, Peso de la Camada Destetada a
los 21 Das) e ndice de Productividad de la Cerda.
Cerdas # de Parto IEP
1
1
147
2
4
143
3
2
149
4
1
136
5
7
161
6
3
149
7
2
148
8
5
167
9
6
138
10
2
145
11
6
149
12
3
144
13
3
137
14
7
150
15
6
162
16
4
146
17
5
139
18
3
158
19
4
163
20
5
143
21
2
149
22
3
142
23
2
157
24
2
150
25
5
139
26
6
149
27
6
149
28
2
148
29
4
136
30
3
139
31
2
160
32
6
138
33
4
154
34
2
144
35
3
157
36
5
145
37
3
160
38
6
156
39
2
153
LNV
8
11
8
6
8
8
11
8
7
9
5
9
10
9
9
10
11
9
9
8
8
6
8
11
10
10
8
8
9
8
9
5
10
9
9
5
9
9
8
LD
7
9
8
8
7
9
8
8
8
7
7
7
8
7
8
8
8
8
6
8
7
6
8
6
8
8
9
8
8
7
6
8
6
9
8
9
8
8
7
PCD21
56.3
56.4
53.4
56.3
55.6
55.1
57.5
56.0
57.4
57.1
54.4
51.9
54.6
57.4
58.5
57.3
55.7
50.5
53.1
58.1
56.9
63.0
54.3
50.0
56.3
52.2
52.1
58.4
56.5
57.0
56.9
55.9
54.8
54.7
53.8
56.4
56.8
57.5
59.7
IPC
106.1
95.1
100.2
98.9
101.7
95.9
87.2
102.3
100.6
105.0
104.3
93.9
103.3
95.1
99.1
100.1
99.3
96.1
102.4
97.9
102.9
89.3
107.4
84.7
93.0
101.7
98.7
98.7
103.3
99.8
97.5
101.3
104.0
102.0
113.2
108.7
105.2
94.8
112.0
10
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
1
4
2
2
7
7
6
4
6
2
2
4
5
6
7
2
3
4
4
6
7
5
3
7
3
5
5
5
3
2
3
6
2
2
5
6
3
4
2
6
6
4
4
2
1
152
157
141
149
176
147
139
149
153
161
139
139
152
163
149
159
136
154
137
137
138
138
145
145
148
152
153
155
158
158
160
170
149
142
145
150
149
146
155
145
152
155
148
139
146
9
9
9
9
9
9
9
10
11
8
10
9
8
9
8
6
10
7
11
9
9
8
11
7
6
8
8
11
9
9
7
10
10
8
8
10
11
6
10
8
9
8
7
9
7
7
8
8
7
7
7
9
8
8
7
8
8
8
8
8
7
8
7
8
8
9
7
8
8
8
8
9
8
8
8
8
9
8
8
8
8
8
8
8
7
8
8
9
8
8
57.8
55.8
57.0
54.1
60.6
54.8
56.1
57.1
57.9
55.8
60.9
55.5
53.5
55.1
54.0
57.7
56.8
55.8
62.5
55.1
51.3
56.7
50.2
63.0
60.5
53.9
53.5
57.0
55.8
51.3
54.0
52.6
52.8
50.8
46.9
56.1
48.4
56.7
57.4
54.6
57.6
58.9
53.3
51.0
60.3
96.3
90.0
103.4
114.0
101.7
100.1
101.6
107.3
102.6
101.8
102.2
89.4
105.9
96.7
101.7
93.2
104.3
106.2
104.3
107.0
94.9
102.8
96.4
113.8
101.2
104.3
91.9
100.2
98.6
89.8
111.5
98.3
97.8
91.3
103.4
89.7
102.4
104.2
101.8
98.8
101.3
93.5
110.3
100.3
97.6
11
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
7
3
3
7
5
3
6
6
5
5
3
7
2
4
6
6
154
150
148
145
161
153
154
143
145
156
161
158
138
163
138
144
8
8
10
9
10
8
7
7
8
9
8
10
9
9
10
8
7
9
8
9
6
8
6
8
7
8
8
9
7
8
8
8
53.4
55.8
62.3
56.1
56.4
52.1
62.0
57.4
56.8
56.0
52.2
53.2
57.5
53.9
59.5
58.0
94.7
99.8
97.9
100.1
100.2
99.6
102.2
95.4
95.2
107.3
104.4
93.5
106.0
90.3
106.2
100.5
12
PRACTICA 2.
LEYES DE MENDEL
INTRODUCCIN
Antes de las investigaciones del monje austriaco, los cientficos haban
realizado cruzamientos
con la finalidad de
determinar el fenmeno de la
un nmero de
13
14
15
OBJETIVO.
MATERIAL Y MTODO:
Se requiere una computadora bsica con las siguientes caractersticas
mnimas:
Programa Gregor.
El programa Office de Microsoft Ver. 6.0 o superior
Metodologa.
I Metodologa a seguir en la computadora:
16
Como primer paso hay que localizar el directorio donde se encuentra el programa
Gregor, buscar el archivo G2 y activarlo con un doble clic del botn izquierdo
del mouse. La pantalla que aparecer es la siguiente:
17
Recuerda que no
tienes que teclear las
comillas de los
comandos o datos
En esta pantalla se deber definir los parmetros de la poblacin de la manera siguiente: Las frases en ingles son las
preguntas del programa seguidas de la traduccin en espaol, seguidas por la respuesta entre comillas y Enter.
Please enter a name for this population = introducir nombre de nueva poblacin P1(Enter)
How many individuals would you like to define = Nmero de individuos: 1 (enter)
Enter an option for the random creation of genotypes = introduzca una opcin para la creacin al azar de genotipos
(seleccionar la opcin 3 solid alleles at every locus.)
Al terminar regresaras a la pantalla de mens anterior, donde de la misma manera se crear otra poblacin con el
nombre P2.
Como se muestra en la pantalla siguiente.
Nota: el nombre de las poblaciones puede ser elegido al gusto del usuario, recordando llevar un registro de cmo
se llama cada poblacin
Para la siguiente poblacin de nombre p2 se repetirn los mismos pasos que se siguieron para crear la poblacin
p1. El programa regresar al 1er submen. Elegir entonces la opcin 2.- Definicin de la poblacin Aparecer
una pantalla en la cual le preguntarn:
El nombre de la poblacin es: P2 (Enter)
Nmero de individuos: 1 (Enter)
El genotipo de este progenitor ser: indicar el 4 de sombreados (Enter) al terminar este paso el programa
regresar a la ventana de submens.
Como se puede ver en el cuadro de poblaciones se han creado dos poblaciones hasta el momento p1 y p2.
Nota: las letras pueden ser maysculas o minsculas.
18
UNIN DE PROGENITORES:
19
FORMACIN DE F1
Para la formacin de la generacin F1 partirn del 1er. Submen del men de poblaciones
elegir la opcin 1.- Manipulacin de poblaciones (Enter) y aparecer el 2 submen del cual
seleccionar la opcin 1.- Crossing men =men de cruzamientos (Enter) , aparecer entonces el 3er.
Submen; del cual elegir la opcin 1.-specific hybrids = Hbridos especficos (Enter)
esto
activar la ventana de seleccin de poblaciones en la cual elegirn la poblacin padres (Enter)
esto desplegar la pantalla que se muestra en la pagina siguiente
20
The individuals in padres will be intermated = Los individuos en padres sern cruzados.
A new population will be created = una nueva poblacin ser creada.
Please enter a name for this population = introduzca un nombre para la nueva poblacin
la
designarn f1 (Enter)
How many crosses do you want to make = Cuntas cruzas se realizarn? 12 (en monohbridismo),
32 (en dihbridismo) (Enter)
Which individual is the female parent for hybrid #1=Qu individuo es la madre del hibrido #1 ?
En este caso seleccionar 1 (Enter)
En
Which individual is the male parent for hybrid#1Qu individuo es el padre del hibrido #1?
este caso seleccionar 2 (enter)
Which individual is the female parent for hybrid #2=Qu individuo es la madre del hibrido #2 ?
En este caso seleccionar 1 (enter)
En
Which individual is the male parent for hybrid#2Qu individuo es el padre del hibrido #2?
este caso seleccionar 2 (enter)
Which individual is the female parent for hybrid #3=Qu individuo es la madre del hibrido #3 ?
En este caso seleccionar 1 (enter)
Which individual is the male parent for hybrid #3=Qu individuo es el padre del hibrido #3?
En este caso seleccionar 2 (enter)
Repetir este procedimiento hasta completar los doce cruzamientos (la cantidad de cruzamientos
depender de la cantidad de cruzas que se seleccionaron; para este caso fueron 12.
Al terminar de introducir los padres el programa regresa a la ventana de mens.
21
FORMACIN DE F2
Para la creacin de la generacin f2 desde el submen del men de cruzamientos (como se muestra en la
pantalla)
seleccionar la opcin 2 random matings = cruzamientos al azar(Enter)
al
activarse el cuadro de seleccin de poblacin en la parte superior derecha
seleccionar la poblacin
f1 (enter) (como se muestra en la pantalla)
esto desplegar la pantalla de cruzamientos al azar.
22
23
dotted)
Cromosoma 1 Locus 3
Slido - sombreado
Alelo
24
Cromosoma 1 Locus
Slido-sombreado
A
Cromosoma 2
Locus 9
sombreado - sombreado
b -
IV.- Ejercicio.
1.- Utilizando el programa Gregor obtenga los genotipos para el siguiente ejercicio
de monhbridismo:
25
b.- rojo
Gregor
1.3.4
Mcgill
27
PRACTICA 3.
GENTICA DE POBLACION.
INTRODUCCIN.
La gentica de poblaciones estudia el comportamiento de los genes en las
poblaciones. Una poblacin gentica se define como un grupo de individuos que
comparten un mismo grupo de genes. En consecuencia, entre dichos individuos
existen relaciones genticas que confieren a la poblacin caractersticas propias
que la hacen diferente .
Para definir una poblacin es necesario determinar en ella los genes, los
genotipos, los fenotipos y sus frecuencias.
La frecuencia genotpica
28
uno de los genotipos equivale al nmero real de individuos de las tres clases de
fenotipos si no hay dominancia, es decir, que cada genotipo sea fenotpicamente
distinguible.
P = frecuencia de AA
H = frecuencia de Aa
Q = frecuencia de aa
P+ 1 H
2
p=
N
29
Q+ 1 H
2
q=
N
( p + q )2 = p 2 + 2 pq + q 2
Donde:
P2 = AA
2pq = Aa
q2 = aa
Ley de Hardy-Weinberg
valores de
fA y fa las
30
Por otra parte esta misma ecuacin puede utilizarse cuando existe efecto de
dominancia y recesividad en un caracter, solo que, en esta situacin el Fenotipo
dominante est confundido y este puede tener dos arreglos genotpicos: P2 + 2pq
y el Fenotipo recesivo solo un arreglo gentico q2 es decir que tanto AA como
Aa expresan el mismo Fenotipo Dominante y aa el fenotipo recesivo. Por lo tanto
una forma de estimar la frecuencia gnica es obtener la raz cuadrada de q2 .
As:
q=
Y considerando que:
p + q = 1 entonces
p= 1q
OBJETIVOS:
Demostrar que en una poblacin de tamao grande las frecuencias gnicas se
mantienen constantes
31
MATERIAL Y MTODO:
Se requiere una computadora bsica con las siguientes caractersticas
mnimas:
El programa G1.
Metodologa:
P1, 1 individuo
Progenitor 2
P2, 1 individuo
32
Padres
F1
2 individuos
:
1 poblacin de 20 individuos
2.- A partir de esta F1, crear una nueva poblacin F2 (al azar)
A partir del submen de cruzamiento, elegir la opcin random asignndole 100
individuos a esta poblacin. Repetir el mismo procedimiento para F3 y F4, cada
una de 100 individuos.
4.-
Fenotipo
Sin cuerno
Aa
Sin cuerno
aa
Con cuerno
100 individuos
33
Cromosoma: 1 Locus 3
Alelos A.- (Slido solid) a.- (sombreado dotted)
Cromosoma 1
Locus 3
Slido - sombreado
Alelo
Gregor
1.3.4
Mcgill
34
PRACTICA 4.
DERIVA GNICA
INTRODUCCIN
La Ley de Hardy-Weinberg indica que los factores que pueden alterar la frecuencia
de genes en las poblaciones cerradas, sin que haya seleccin, mutacin o
migracin, es el tamao de la poblacin.
35
1. como una disminucin progresiva de la variabilidad gentica dentro de
muestras y un aumento progresivo de la misma entre muestras, y
2. como un aumento progresivo de la endogamia de los individuos dentro de
muestras y, una disminucin progresiva del grado de parentesco o aumento
del grado de diferenciacin entre los individuos de muestras diferentes.
El limite del proceso de deriva gnica para un gen dado, ocurre cuando uno de los
alelos es fijado en la poblacin, lo que significa que cualquiera de ellos, el alelo
dominante A o el alelo recesivo a, con frecuencias p y q respectivamente, toman el
valor de 1 (p = 1 o q =1).
36
Los N individuos de cada muestra representarn a su vez una muestra de 2N
genes tomados al azar de la poblacin base.
Objetivo:
Verificar que en poblaciones de tamao pequeo las frecuencias gnicas
fluctan generacin tras generacin hasta que hay un efecto de fijacin de
un gen.
METODOLOGA
Para comprobar la fluctuacin de las frecuencias gnicas, se trabajar con la
caracterstica de herencia del color en ganado Shorthon, en el cual se tienen tres
fenotipos: rojo, ruano y blanco. Dicha caracterstica es debida a un loci y dos
alelos R y r. El fenotipo rojo esta dado por el genotipo homocigoto dominante RR,
el fenotipo ruano al genotipo Rr y el fenotipo blanco al genotipo rr.
37
4. Al abrirse el siguiente men, seleccionar la opcin 2. DEFINE POPULATION
(Definir poblacin).
Se abrir la ventana :
"Define population"
(Definir poblacin)
y aparecer la leyenda :
"A new population will be created".
(Una nueva poblacin ser creada).
"Please enter a name for this population..."
(Por favor, de el nombre para sta poblacin...)
Usar el nombre "PADRE"
Aparecer la leyenda :
"You have room in memory for 16628 more individuals".
(usted tiene espacio en la memoria para 16628 individuos ms)
"How many individuals would you like to define ?..."
(Cuntos individuos desea definir?...)
Indicar 1. Se definir un individuo para la poblacin de PADRES.
Aparecer la leyenda :
"Enter an option for the random creation of genotypes".
(De una opcin para la creacin al azar de genotipos".
Aparecern seis opciones y en la parte inferior aparece
"Your choice..."
(Su eleccin...)
38
Elegir la opcin
"3. Solid alleles at every locus"
(3. Alelos de color slido en cada locus)
Reaparece la ventana principal y en el recuadro superior derecho
"Populations" (Poblaciones), quedar indicado : 1. PADRE....1. Lo que
significa que la poblacin 1 tiene por nombre PADRE y que consta de un
individuo.
5. Repetir los pasos realizados en el punto 4 con las siguientes diferencias :
El nombre de la poblacin ser "MADRE"
Aparecern seis opciones y en la parte inferior aparece
"Your choice..."
(Su eleccin...)
Elegir la opcin
3. "Dotted" alleles at every locus"
(3. Alelos de color sombreado en cada locus)
Reaparece la ventana principal y en el recuadro superior derecho
"Populations" (Poblaciones), quedar indicado : 2. MADRE....1. Lo que
significa que la poblacin 2 tiene por nombre MADRE y que consta de un
individuo.
6. Seleccionar la opcin 1. Manipulation menu, se abrir un tercer recuadro con
un nuevo men Crossing menu del cual se seleccionar la opcin 7. Merge
Populations (Mezcla de poblaciones). Al activarla aparece en la parte superior:
SELECT POPULATION # 1
39
(Seleccione la poblacin #1
se seleccionar la poblacin 1. PADRE. Aparecer en la parte superior:
SELECT POPULATION #2
(Seleccione la poblacin #2)
se seleccionar la poblacin 2. Madre.
Aparecer la ventana:
Merge Populations
Padre y Madre will be merged.
(Padre y Madre sern mezcladas)
A new population will be created.
(Una nueva poblacin ser creada)
Please enter a name for this population...
(Por favor, de el nombre para sta poblacin...)
usar el nombre: P1.
40
En la parte superior se indica el individuo 1, al activar la barra espaciadora
aparecern los cromosomas del individuo 2 en color amarillo. El color amarillo
se tomar como el gen de tipo recesivo (r).
Se trabajar nicamente con el cromosoma 1, locus 10 para todos los
genotipos de los individuos creados.
Al activar la barra especiadora se vuelve a la ventana inicial.
8. Del recuadro, se seleccionar la opcin 1. Manipulation menu. Del men que
aparece, se selecciona la opcin 1. Crossing menu, aparecer un men final.
Activar la opcin 1. Specific hybrids (Hbridos especficos).
En la parte superior aparecer la pregunta:
Which Population?
Seleccionar la poblacin 3. P1.
Aparecer una ventana que dice:
Specific hybrids
The individuals in P1 will be intermated
(Los individuos en P1 sern apareados)
A new population will be created
(Una nueva poblacin ser creada)
Please enter a name for this population
(Por favor, de el nombre para sta poblacin)
se dar el nombre de F1.
How many crosses do you want to make?...
(Cuntas cruzas desea realizar?...)
41
Se indicar que se desean hacer 5.
Aparecern las siguientes preguntas:
Which individual is the female parent for hybrid #1?
(Cul individuo es el progenitor femenino para el hbrido #1?...)
Se indicar el progenitor femenino con 1
Which individual is the male parent for hybrid #1?
(Cul individuo es el progenitor masculino para el hbrido #1?...)
y el masculino con 2
Las mismas preguntas aparecern para el resto de los hbridos y se dar las
mismas respuestas para los cinco hbridos.
9. Al solicitar en el men de manipulacin la opcin 7. Graphical genotypes, se
selccionar la poblacin 4. F1. En la pantalla aparecern los cromosomas. Un
homlogo en azul y el otro en amarillo, para los 5 individuos creados.
10. Del recuadro de men de manipulacin al ser seleccionado, activar la opcin
2. Random mating (Apareamientos al azar).
Aparecer en la parte superior:
Which Population?....
Seleccionar la poblacin 4. F1.
Aparecer la ventana:
Random mating
The individuals in F1 will be intermated
(Los individuos en F1 sern apareados)
A new population will be created
42
Please enter a name for this population
se indicar el nombre F2.
How many crosses do you want to make?
(Cuntas cruzas desea realizar?)
Indicar 30.
Reaparecer la pantalla principal.
11. Seleccionar la opcin 7. Graphical genotypes, de la poblacin 5. F2.
Aparecer en la pantalla el genotipo del individuo #1, y as sucesivamente hasta
el individuo 30.
12. Repetir los pasos 10 y 11 cuantas veces sea necesario, dando los nombres a
las poblaciones sucesivamente como: F3, F4, F5, ...Fn.
Ir tomando las frecuencias de cada poblacin y calcular de cada una de ellas
las frecuencias genotpicas y gnicas.
El ejercicio terminar cuando en los genotipos de los cromosomas solo
aparezca uno solo de los genes, ya sea el dominante o el recesivo. La
frecuencia genotpica para AA o aa ser de 1, y la freciencias gnica, segn sea
el caso, tambin ser de 1, ya sea del gen A (dominante) o del gen a (recesivo).
43
Nota: Al llegar a la poblacin nmero 8, se llega al mximo de poblaciones a
manejar, por lo tanto, ser necesario activar del men de manipulacin la opcin
5. Delete population (5. Eliminar poblacin). As se eliminaran las siete primeras
poblaciones para poder continuar creando las generaciones que sean necesarias
(aproximadamente 30), por lo cual, este paso ser necesario realizarlo varias
veces.
RESULTADOS
44
Generacin
Frecuencias absolutas
Frecuencias
Frecuencias gnicas
genotpicas
P1
F1
F2
F3
F4
F5
F6
F7
F8
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
45
F9
F10
F11
F12
F13
F14
F15
F16
F17
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
46
F18
F19
F20
F21
F22
F23
F24
F25
F26
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
47
F27
F28
F29
F30
F31
F32
F33
F34
F35
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
Rr =
H=
q=
rr =
Q=
RR =
P=
p=
48
Rr =
H=
rr =
Q=
q=
BIBLIOGRAFA
49
PRACTICA 5.
FACTORES DE AJUSTE
INTRODUCCIN
Los datos que se generan en una explotacin pueden ser tiles para
seleccionar y mejorar el ganado si se remueven los efectos de los ambientes
permanente y temporal que
se
animal, edad de la madre, tipo de nacimiento o cra, poca de parto, entre otros.
Lo anterior se logra mediante una manipulacin estadstica
de los datos en
comparar jvenes
50
51
por sexo, tipo de parto y madre madura. La ecuacin respuesta por Spide y et al.,
(1984), es la siguiente:
PA(120 D) =
Px120
xFA
E
Donde:
PA(120D) es, Peso Ajustado a 120 Das
P es el peso en kilogramos en la edad en das
FA significa Factor de Ajuste.
E edad en das
de la raza Suffolk
CORDERO PESO (KG) SEXO EDAD (DAS) TIPO
DE EDAD MADRE
PARTO
A
35
112
Sencillo
< 2 aos
36
114
Doble
2 aos
32
110
Triple
3 a 6 aos
38
118
Doble
> 6 aos
35 x120
x(1.22) = 45.7 Kg
112
52
Cuadro 2. Peso, sexo edad, tipo de parto y edad de la madre de cuatro corderos
de la raza Suffolk factores de ajuste y peso ajustado a 120 das.
CORDERO PESO SEXO EDAD
(KG)
(DAS)
TIPO DE EDAD
FACTOR PESO
PARTO
DE
MADRE
AJUSTAD
AJUSTE O
*
A
35
112
Sencillo
45.7
36
114
Doble
2 aos
1.09
41.3
32
110
Triple
6 1.22
42.6
42.1
aos
D
38
118
Doble
53
Cuadro3.
EN PRODUCCIN PRODUCCIN %
EDAD
DAS
(AOS)
PRODUCCIN DE
LECHE DE
(KG)
(KG)
DE
GRASA GRASA
300
7856
287
3.7
2.5
190
4434
159
3.6
295
7112
273
3.8
3.5
298
7285
277
3.8
301
8949
314
3.6
LCG(4%) =
54
FAL es el factor de ajuste para leche; FAG es el factor de ajuste para grasa y FAEM
es el factor de ajuste para equivalente maduro.
As para la vaca A, el valor de leche corregida de grasa al 4 %, 305 das,
dos ordeos y equivalente maduro sera:
LCG (4%) =
Cuadro4.
Das Prod.
(aos) en
de
Prod.
de
Grasa de
Ajuste Corregid
ajuste ajuste EM
Grasa 4%
(Kg)
(Kg)
Leche Grasa
(Kg)
300
7856
287
3.7
0.4
15
1.08
8177.2
2.5
190
4434
159
3.6
0.4
15
1.24
8277.8
295
7112
273
3.8
0.4
15
1.18
8466.6
3.5
298
7285
277
3.8
0.4
15
1.12
8103.3
301
8949
314
3.5
0.4
15
1.02
8567.8
*Lasley, (1970).
55
Los factores de ajuste sirven para remover los efectos ambientales que el criador
conoce y que pueden afectar la comparacin de registros entre animales. Los
mejores ajustes se logran cuando se remueven, precisamente esos efectos, lo que
implica un amplio conocimiento de todos los factores ambientales que influyen y
como lo hacen. Para ello debe contarse con una gran cantidad de informacin til;
de no existir esta informacin para desarrollar sus propios factores de ajuste, la
alternativa de usar los publicados por otros autores pueden ser de utilidad a
sabiendas que no son los mejores ajustes (1,2,3,).
Objetivo:
Metodologa
1.-, En este ejercicio se trabajar con el programa de Excel en el que se crear un
archivo con el formato regular Excel (.xls) para el anlisis de los datos, por ello en
el programa (Excel ) crear un archivo exclusivamente numrico con los datos
proporcionados en las siguiente tabla.
56
PROD. PA EP DIAS
TOTAL RT OC PROD.
EN PROD. PA EP DIAS EN
TOTAL RT OC PROD.
O
9191
340
287
9215
300
187
9244
369
241
9289
298
8530
223
9330
305
8558
219
8276
195
8578
193
8302
196
8614
225
8438
190
8701
262
8513
198
8736
190
8555
213
8796
193
8576
196
8863
159
8592
183
8954
237
8648
206
9017
243
8714
203
9058
325
8774
204
9156
330
8830
270
9203
288
8928
294
9241
281
8986
311
9284
317
9044
271
8255
185
8410
8417
8450
57
9329
339
9116
302
8263
333
9195
281
8289
290
9215
314
8418
184
9264
277
8471
201
9292
298
8542
196
9334
301
8559
195
8341
318
8582
182
8327
189
8617
201
8444
195
8708
225
8514
206
8737
211
8556
133
8813
193
8577
232
8909
272
8612
184
8963
305
8660
190
9029
287
8725
193
9073
295
8795
240
9179
308
8843
186
9207
293
8935
251
9244
310
9001
283
9287
287
9053
286
9330
300
9130
313
8361
306
9200
311
58
8588
184
9235
297
8420
201
9284
295
8498
194
9293
290
8552
202
9342
305
8567
189
8920
313
8591
191
8981
309
8640
196
9043
312
8710
182
9089
294
8761
187
8823
294
59
Esta columna
ser nuestro
variable Y
Herramientas
seleccionar el
seleccionar
anlisis de datos
regresin .
Una vez seleccionada aparecer el
siguiente cuadro de comandos.
60
Variable Y
Variable X
En opciones de salida seleccionar:
En una hoja nueva
61
5.-De los resultados mostrados por el programa copiar los correspondientes a los
coeficientes: Intercepcio, Variable X1, Variable X2 y Variable X3.
62
independiente)
Variable X2 = Coef. de regresin de la poca
(variable
independiente)
Variable X3 = Coef. de regresin de das en produccin (variable
independiente)
X1 = N de parto
X2 = N de poca
X3 = Das en produccin
63
y nmeros
de cada variable
Y ijkl =((( Coef. prod total) + (Coef. parto *1er celda colum.parto )+( Coef. poca *
1er celda colum poca) + (Coef. Das prod. *1er celda colum.dias prod.))/ 1er
celda colum.dias prod)*305
EJEMPLO:
=(((8214.333)+(192.6295*B1)+(-
50.58559*C1)+(0.6151198*D1))/D1)*305
64
65
PRACTICA 6.
HEREDABILIDAD
(MODELO DE REGRESIN LINEAL)
Introduccin
La continua variacin de las caractersticas cuantitativas depende del nmero de
genes que la determinan, as como los factores genticos y ambientales que
afectan la penetrancia y expresividad de estos genes. Uno de los objetivos del
anlisis cuantitativo es determinar cunto de la variacin fenotpica de un carcter
es el resultado de diferencias genticas entre individuos en una poblacin y cunto
es producto de las diferencias en el medio ambiente. La naturaleza gentica de los
caracteres puede poner de manifiesto efectos aditivos importantes que determinen
la variacin fenotpica del carcter en la poblacin, parmetro gentico conocido
como heredabilidad (3).
H2 =
2G
2F
representada
por
h2 =
2A
2F
fenotipos estn determinados por los genes transmitidos por los padres. Este
ltimo concepto de heredabilidad es el empleado en las investigaciones, ya que
66
determina la proporcin de la variacin del carcter que es ocasionada por efectos
aditivos de genes que determinan su expresin (2).
b y. x =
X Y
i =1
X
i =1
2
i
( X )( Y )
i
n
( X i )2
n
E.E (h 2 ) = Var (h 2 ) =
4 Var (Y )
by. x 2
n 2 Var ( X )
67
h 2 = bY . X
METODOLOGA
PARTE I
1.- En la pantalla del Escritorio usar el ratn y activar INICIO.
2.- Elegir PROGRAMAS y activar MICROSOFT EXCEL.
3.- Capturar los datos del ejercicio Nmero 1 en la hoja de Excel.
4.- Activar la orden de HERRAMIENTAS, elegir ANLISIS DE DATOS. De la
ventana anlisis de datos, seleccionar la opcin REGRESIN y dar aceptar.
5.- Indicar como rango Y de entrada la columna HIJOS y como rango X de entrada
la columna de padres. Sealar como rango de salida una columna en blanco y por
ltimo dar ACEPTAR para obtener los resultados finales.
Rango Y de en entrada
(Informacin de HIJOS)
Rango X de entrada
(informacin de PADRES)
68
PARTE II.
1.- Interprete los valores de heredabilidad obtenidos.
2.- Entregar reporte de prcticas.
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
PADRES
477
476
478
479
481
480
480
481
483
483
479
477
480
481
478
481
480
479
481
481
HIJOS
474
476
478
480
479
482
473
473
476
480
477
475
479
474
480
480
477
478
475
473
CARACTERSTICA LIMITADA A
UN SOLO SEXO
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
MADRE
5804
7366
7421
6548
6637
7933
7308
6762
8790
7033
6106
8757
8720
7817
7454
7604
8555
7424
6307
6091
HIJA
5191
7164
5816
5887
6701
6155
5996
6323
7344
7003
5435
7332
6454
6631
5527
6359
5639
6066
5286
6777
69
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
481
480
479
477
481
479
479
484
485
482
479
476
475
477
473
473
474
479
477
479
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
6664
8982
7027
8674
5899
7314
7469
7881
6100
8497
6558
8247
6283
6234
5524
7082
6588
6689
6359
6554
70
PRACTICA 7 .
HEREDABILIDAD
(MODELO DE ANDEVA)
INTRODUCCIN
La estimacin de la heredabilidad se calcula utilizando la similitud
observada en productividad de parientes y al comparar sta con la similitud que
esperamos porque ellos tienen algunos genes iguales. Un ejemplo sera medir la
productividad fenotpica de un semental y entonces medir cunto
de esta
i=1, 2,..., s
j=1,2,p
71
donde: Yij es la observacin de la j-sima progenie del i-simo macho, es la
Media poblacional,
S i es
Eij
representa el error
aleatorio.
Se realiza el anlisis de varianza por medio del cual la varianza fenotpica
se divide en componentes observables atribuibles a diferencias entre machos
y a diferencias entre la progenie, dentro de machos
( ) .
2
E
( )
2
S
En el cuadro 1 se
En
un
diseo
1
K=
N
s 1
desbalanceado
se
calcula
de
la
siguiente
manera.
(n. ) .
2
la
E .E ( h 2 ) = 4
2S =
CM S CM E
K
frmula
2(1 t ) 2 [1 + (r 1)t ]2
r (r 1)(s 1)
h2 =
4 2 S
cuyo
error
estndar
se
puede
calcular
siendo
t=
2S
2P
72
Objetivo:
Estimar el valor de heredabilidad de una caracterstica de importancia
econmica en una
METODOLOGA
PARTE I
1.- En la pantalla del Escritorio usar el ratn y activar INICIO.
2.- Elegir PROGRAMAS y activar MICROSOFT EXCEL.
3.- Capturar los datos del ejercicio Nmero 1 para un diseo balanceado.
4.- Activar la orden de HERRAMIENTAS, elegir ANLISIS DE DATOS. De la
ventana anlisis de datos, seleccionar la opcin ANLISIS DE VARIANZA DE
UN FACTOR y dar aceptar.
5.- Indicar como rango de entrada los datos de las 25 hijas de los 6 sementales.
En este ejercicio los datos estn capturados por columnas. Sealar como rango de
salida una columna en blanco y por ltimo dar ACEPTAR para obtener los
resultados finales.
6.- Obtener del anlisis de varianza los datos necesarios para estimar los
componentes de varianza y substituirlos en la frmula
valor de heredabilidad .
h2 =
4 2 S
, poder estimar el
73
7.- Efectuar las mismas instrucciones para obtener el valor de heredabilidad en el
Ejercicio 2, para un diseo desbalanceado.
PARTE II.
1.- Interprete los valores de heredabilidad obtenidos.
2.- Entregar reporte de prcticas.
74
Ejercicio 2. DISEO DESBALANCEADO
Peso a los 24 meses de edad (kg) de la progenie de 10 sementales
S1
S2
S3
S4
S5
S6
S7
S8
S9
S10
1
389.2 395.1 418.2 445.9 452.5 455.8 458.5 463.8 469.1 497.9
2
395.1 419.1 423.6 427.7 441.3 443.6 446.9 449.1 459.3 476.4
3
418.2 423.6 419.4 436.0 437.4 441.6 452.2 463.6 474.5 486.2
4
445.9 427.7 436.0 421.0 421.6 427.6 452.9 490.6 494.1 526.8
5
452.5 441.3 437.4 421.6 439.5 443.4 466.8 487.2 488.5 503.1
6
455.8 443.6 441.6 427.6 443.4 463.7 502.3 507.9 512.1 518.5
7
458.5 446.9 452.2 452.9 466.8 502.3 452.2 467.4 468.2 512.4
8
463.8 449.1 463.6 490.6 487.2 507.9 467.4 422.1 419.5 448.2
9
469.1 459.3 474.5 494.1 488.5 512.1 468.2 419.5 527.2 538.2
10 497.9 476.4 486.2 526.8 503.1 519.5 512.4 448.2 423.7 538.2
11 886.2 401.0 405.1 422.9 438.7 446.8 449.3 484.9 503.7 511.1
12 401.0 410.4 422.1 441.7 441.8 451.5 466.3 487.6 510.0 519.9
13 405.1 422.1 424.7 426.6 434.2 450.7 471.6 450.1 510.0 517.6
14 422.9 441.7 426.6 425.5 432.2 441.4 441.8 459.4 451.4 490.6
15 438.7 441.8 434.1 432.2 441.3 446.6 456.0 492.9 476.1 491.2
16 446.0 451.5 450.7 441.4 446.6 483.7 484.1 502.7 515.0 537.7
17 449.3 466.3 471.6 441.8 456.0 484.1 502.0 492.9 521.1 527.5
18 450.1 459.4 462.0 483.6 484.9 487.6 487.9 510.0 502.7 514.3
19 440.1 451.4 461.3 476.1 483.6 503.7 510.0 519.9 515.0 521.1
20 440.7 440.7 490.6 491.2 511.6 514.7 517.6 420.9 527.5 537.7
21 422.0 506.8 466.0 447.6 488.2 464.4 441.7 480.9 510.5 456.7
22 428.9 486.1 381.1 476.7 447.9 389.0 427.1 474.4 470.7 402.5
23 488.5 406.2 413.7 415.5 451.8 485.1 410.7 384.5 433.0 511.5
24 421.1 485.5 467.3 383.7 517.4 502.3 447.3 430.5 475.2 488.3
25 471.7 476.2 482.0 462.9 450.1 466.4 453.8 450.4 439.4 451.4
26 451.5
474.2
431.0 417.3 448.7 453.7 455.2 449.0
27 426.2
480.6
475.5 474.4 465.1 515.7
28 416.6
402.4
464.4 424.6 482.3 469.0
29 522.9
512.4
536.0 481.9 418.3 495.6
30 500.0
463.8
380.5 418.4 421.4 493.1
31 425.8
409.6
421.7
32
504.1
424.0
33
450.8
397.4
34
420.7
430.1
35
421.9
444.0
36
421.7
37
450.2
38
465.9
75
APLICACIONES DEL INDICE DE HERENCIA.
Los valores de la heredabilidad se pueden utilizar para estimar el progreso
esperado a partir de los apareamientos que se hayan efectuado. Por ejemplo, un
apareamiento en particular, puede llegar a mejorar cierto rasgo si los padres son
genticamente superiores, pero si son inferiores, puede causar un decremento en
la calidad de la progenie.
Objetivo: utilizar el ndice de herencia para estimar el progreso gentico en
la siguiente generacin.
RESPUESTA A LA SELECCIN.
Una aplicacin importante de los ndices de Herencia es para estimar la respuesta
a la seleccin, o sea, la ganancia esperada en la progenie, a partir del
apareamiento de animales seleccionados.
Vamos a suponer que tenemos un hato de ganado bovino productor de carne, que
tiene un promedio de ganancia diaria de peso de 1.100 Kg. cuyo ndice de
herencia es de 0.30. De este hato, seleccionamos machos que hayan tenido una
ganancia diaria de 1.300 Kg. y hembras con una ganancia diaria de peso de 1.250
Kg.
Cul ser la ganancia diaria de peso esperada de la progenie? Para responder a
esta pregunta, hacemos los clculos siguientes:
METODOLOGA.
1. Clculo del diferencial de seleccin (DS).
El diferencial de seleccin, es el promedio de los padres seleccionados
menos el promedio del hato.
Hembras: 1.250 1.100 = 0.150Kg.
Machos: 1.300 1.100 = 0.200Kg.
0.150 + 0.200
= 0.175 Kg
2
2. Clculo de la respuesta a la seleccin (RS).
La respuesta a la seleccin es el aumento que se espera tenga la progenie
con respecto a la poblacin original. En este caso, cul ser la diferencia
en cuanto a la ganancia diaria de peso que tendr la progenie, con
respecto a la poblacin original. Se obtiene multiplicando el diferencial de
seleccin por el ndice de herencia de la caracterstica en cuestin.
Diferencial de seleccin =
76
77
Bibliografa consultada para esta prctica
1.- Falconer, D.S., Mackay, T. 2001. Introduccin a la Gentica Cuantitativa. Ed.
Acribia S. A. Zaragoza.
2.- Herrera, H. J.1986. Introduccin al mejoramiento Gentico Animal. Colegio de
Postgraduados. Centro de Ganadera. Montecillo. Mxico.
3.-Lpez, B.2000. Apuntes de Mejoramiento Gentico Animal. Facultad de
Estudios Superiores Cuautitln. UNAM. Mxico.
4.-Spide, L.P., Rothschild, F.M., Wundor, W.W. 1981. Gentica Aplicada. Facultad
de Medicina Veterinaria y Zootecnia. UNAM. Mxico.
5.-Warwick, E; Legates,J. 1980. Cra y Mejora del ganado. 3 ed. Ed. Mc Graw Hill.
Mxico.
78
PRACTICA 8.
REPETIBILIDAD
INTRODUCCIN
El ndice de constancia o repetibilidad es la correlacin entre medidas
repetidas en la vida de un mismo animal. Este parmetro mide la tendencia de los
animales a producir lo mismo cuando se les permite repetir la caracterstica. Las
caractersticas que se pueden repetir incluyen produccin de lana, peso y tamao
de la camada, produccin de leche . La repetibilidad informa cmo un animal
repetir un carcter durante su vida. Se expresa en escala de 0 a 1 del 0 al
100% (1,3).
Es necesario considerar algunos aspectos sobre la variacin ambiental y su
subdivisin para comprender el significado de la repetibilidad. La variacin
ambiental es toda aquella de origen no gentico. Si se realiza ms de una
observacin sobre la misma caracterstica de un animal, una parte de la varianza
2
) en el sentido de que permanece igual durante la
ambiental es permanente ( Ap
vida del animal, afectando a todas las medidas de la misma manera. Otra parte de
2
) porque afecta a las medidas en forma
la varianza ambiental es temporal ( At
G2 + 2 Ap
2 A + 2 D + 2 E + 2 Ap
=
2 G + 2 Ap + 2 At 2 A + 2 D + 2 E + 2 Ap + 2 At
La Repetibilidad es por
79
Este parmetro puede expresarse en trminos de componentes de varianza
como:
IR =
2
G2 + Ap
2
2
G2 + Ap
+ AT
2
G2 + Ap
F2
2
es la varianza ambiental permanente,
donde: Ap
temporal,
G2
2
AT
es la varianza genotpica y
es la varianza ambiental
F2
representa la varianza
fenotpica.
Es decir, la repetibildad es la proporcin de la varianza total causada por
diferencias genticas ms diferencias ambientales permanentes.
Para obtener una estimacin de Repetibilidad de una caracterstica, se necesita
tener datos del comportamiento de un grupo de animales en diferentes momentos
de su vida en que expresaron la caracterstica en estudio. Este tipo de datos se
ajusta aun modelo lineal como el siguiente:
Yij = + H i + Eij
es la medida general;
Hi
Eij
representa el
error aleatorio.
La ecuacin anterior representa un diseo experimental totalmente
aleatorizado el cual puede descomponerse por anlisis de varianza en los efectos
principales que se muestra en el cuadro 1. El anlisis de varianza se realiza con
dos fuentes de variacin: entre animales (hembras) y dentro registros (hembras)
(2,4).
GRADOS DE
LIBERTAD
(G.L)
SUMA DE
CUADRADOS
(S.C)
CUADRADO
MEDIO
(C.M)
Entre animal
A-1
SCH
CMH
ESPERANZA
DE
CUADRADO
MEDIO
2
E + k 2 H
80
Dentro de
registros
(hembras)
(Error)
En
K=
un
N-A
diseo
1
N
s 1
SCE
desbalanceado
se
2E
CME
calcula
de
la
siguiente
manera.
(n. ) .
2
frmula
CM H CM E
K
IR =
2
+ 2 E . El valor de repetibilidad se efecta con la
y F2 = 2G + Ap
2
G2 + Ap
2
2
G2 + Ap
+ AT
siguiente ecuacin :
2
G2 + Ap
F2
81
n IR
(xi )
VMPP = +
1 + (n 1)IR
En donde:
= Promedio del hato
xi =
Promedio del animal bajo estudio
n = Nmero de observaciones (registros) del animal
IR = ndice de Repetibilidad de la caracterstica bajo estudio
La frmula anterior se puede crear en la hoja de clculo de Excel, para facilitar la
obtencin del resultado. El procedimiento es el siguiente:
1. Insertar los valores en la hoja de clculo. Vamos a suponer que se quiere
estimar el VMPP de la produccin de leche en Kg. y que se insertan las
cifras en las celdas de la hoja de la manera siguiente:
1
2
3
4
xi
n
IR
B
17
14
5
0.25
82
METODOLOGA
PARTE I
1.- En la pantalla del Escritorio usar el ratn y activar INICIO.
2.- Elegir PROGRAMAS y activar MICROSOFT EXCEL.
3.- Capturar los datos del ejercicio Nmero 1 para un diseo balanceado.
4.- Activar la orden de HERRAMIENTAS, elegir ANLISIS DE DATOS. De la
ventana anlisis de datos, seleccionar la opcin ANLISIS DE VARIANZA DE
UN FACTOR y dar aceptar.
5.- Indicar como rango de entrada las los datos de las 5 hijas de las 20 hembras.
En este ejercicio los datos estn capturados por filas. Sealar como rango de
salida una columna en blanco y por ltimo dar ACEPTAR para obtener los
resultados finales.
Datos de la
produccin de
leche de 5 das de
20 vacas
6.- Obtener del anlisis de varianza los datos necesarios para estimar los
componentes de varianza y estimar el valor del ndice de Repetibilidad .
7.- Efectuar las mismas instrucciones para obtener el valor de repetibilidad en el
Ejercicio 2 para un diseo desbalanceado.
8.- Obtener el Valor ms probable de produccin para las cerdas del ejercicio 2.
PARTE II.
1.- Interprete los valores de repetibilidad obtenidos.
2.- Entregar reporte de prctica
83
11
10
13
14
8
12
8
12
8
10
8
13
12
15
8
4
15
15
11
8
13
6
8
11
9
11
12
15
9
11
14
11
6
10
13
9
14
13
12
12
9
8
8
13
12
12
8
6
13
9
9
11
10
11
12
84
16
17
18
19
20
14
13
13
14
7
9
15
14
13
12
15
14
9
10
15
13
9
14
nh 2
VEG = +
(x i )
1 + (n + 1)IR
En donde:
= Promedio del hato
xi =
Promedio del animal bajo estudio
n = Nmero de observaciones (registros) del animal
IR = ndice de Repetibilidad de la caracterstica bajo estudio
H2 = ndice de Herencia de la caracterstica bajo estudio.
Los resultados obtenidos del Valor Estimado del Genotipo, tanto del padre como
de la madre, se promedian y el resultado indicar la probable produccin de sus
cras. Cada progenitor transmite una muestra de la mitad de sus genes y por lo
tanto la mitad de los efectos independientes de esos genes a su progenie. Debido
a que el valor reproductivo es la suma de los efectos independientes de todos los
genes de un individuo que afectan determinado rasgo, cada padre transmite, en
promedio, la mitad de su valor reproductivo a la progenie.
Al igual que en el caso del valor ms probable de produccin, se puede crear la
frmula en Excel, para facilitar los clculos. Suponiendo por ejemplo el peso a los
85
24 meses, vamos a suponer una heredabilidad de 0.40. Para no confundir las
referencias, colocaremos los valores en las columnas C y D:
1
2
3
4
5
xi
n
IR
H2
D
17
14
5
0.25
0.40
86
PRACTICA 9.
CORRELACIONES GENTICAS Y FENOTPICAS
Introduccin
Existen carcteres de inters econmico en los animales que guardan cierto
grado de relacin o asociacin entre ellos, a esta relacin se le conoce dentro el
contexto como correlacin pueden estar correlacionados positiva o negativamente.
El conocimiento del grado o direccin en que dichos carcteres mtricos estn
asociados, permiten al genetista definir los planes ptimos de mejoramiento
gentico y en particular de seleccin (1).
En los estudios genticos se distinguen dos causas de correlacin entre los
carcteres, la gentica y la ambiental. La causa gentica es principalmente la
pleiotropa, aunque el ligamiento es tambin una causa transitoria de correlacin.
La pleiotropa es la propiedad que tiene un gen de afectar
a dos o ms
87
ambientales
en
conjunto
con
desviaciones
genticas
no
aditivas(1,2,3,4).
Estimacin de correlaciones genticas y fenotpicas utilizando agrupaciones de
progenie y progenitores:
Considerando dos caractersticas X y Y medidas tanto en los padres (P)
como en los hijos (O), entonces la correlacin gentica se estimar a travs de la
siguiente frmula:
Corr Gen ==
Donde:
CovOyPx Cov
OxPy
CovOxPx
CovOyPy
Correlacin fenotpica:
88
Corr
Fen
Px
2
+ 2 Ox
Py
+
2
Oy
Correlacin ambiental:
Corr Amb =
Objetivos
Estimar la correlacin gentica, fenotpica y ambiental
de dos
Metodologa
1) Con los datos del siguiente cuadro crear un archivo en Excel que servir para
obtener las covarianzas
89
2) Obtener las Varianzas de las cuatro variables con las ordenes (Herramientas,
Analisis de Datos, Estadistica Descriptiva). Y las covarianzas con la orden
(Herramientas, Anlisis de Datos, Covarianza).
Datos de dos caractersticas en Madre e Hija en un harto de 30 vacas
Produccin de leche y protena en Kg. Ajustado a 305 das
Px
Py
Ox
Oy
MADRE
MADRE
HIJA
HIJA
Prod. leche
Protena
Prod. leche
Protena
6359
5639
6066
211.755
188.343
202.604
7604
8555
7424
272.984
307.980
268.006
5286
6777
6558
8247
6283
6234
5524
7082
6588
6689
6359
6554
5191
7164
5816
176.024
226.352
218.381
274.625
209.224
207.592
183.949
234.414
218.722
222.744
212.391
218.904
172.860
239.278
193.673
6307
6091
6664
8982
7027
8674
5899
7314
7469
7881
6100
8497
5804
7366
7421
227.052
219.276
239.238
321.556
251.567
309.662
210.004
261.110
268.137
282.928
219.600
306.742
208.944
265.176
266.414
5887
6701
6155
5996
6323
7344
7003
5435
7332
196.037
223.143
204.962
199.667
209.291
243.821
233.200
181.529
244.889
6548
6637
7933
7308
6762
8790
7033
6106
8757
234.418
237.605
283.208
260.165
241.403
315.561
252.485
219.816
316.128
90
6454
6631
5527
214.918
221.475
184.049
8720
7817
7454
313.920
281.412
267.599
3) Ya
gentica y fenotpica,
se estimar la correlacin
las respectivas
ecuaciones.
4) para calcular la correlacin ambiental se deber calcular la Heredabilidad a
travs del modelo de Regresin Lineal (Progenie Progenitor), como se
indica en la Practica 5 de este manual, donde las caractersticas X y Y
para a determinar h2x sern las caractersticas Px y Ox respectivamente y
para determinar h2y sern Py y Oy respectivamente. Una vez obtenidas las
h2x y h2y se sustituyen los estimadores en la ecuacin correspondiente.
5) Analizar resultados
6) Entregar reporte de la prctica .
91
92
PRACTICA 10
INTERACCIN GENOTIPO-AMBIENTE
INTRODUCCIN
Es comn que se considere el fenotipo de un animal en funcin de un modelo
aditivo que incluye el genotipo ms el ambiente; en el genotipo se incluyen los efectos de
herencia aditiva, herencia de dominancia y herencia episttica; en la componente
ambiental se consideran los efectos permanentes y temporales.
La suposicin anterior implicara que en cualesquier lugar del mundo pudiera
efectuarse mejoramiento gentico y que los animales seleccionados, ante igualdad de
circunstancias ambientales responderan expresando favorablemente y de la misma
manera, su comportamiento productivo. La realidad muestra que no existe tal plasticidad
en los seres vivos; un ejemplo de ello son los animales de la raza Holstein, los cuales han
sido seleccionados por su gran capacidad para la produccin lctea, pero tal seleccin se
efectu en regiones templadas o bien con ambientes controlados, cuando son trasladados
a regiones de trpico hmedo, los animales sufren el calrico, entonces su produccin de
leche es muy baja, sin embargo, algunos animales de esta raza no manifiestan con tal
severidad su reaccin ante las condiciones climticas, llegando incluso a ganar ms peso
que el promedio del hato compuesto por animales Bos taurus y Bos indicus adaptados a
esas zona geogrfica. El comportamiento anterior es atribuido al hecho de que esos
individuos, poseen genes que al interaccionar con el ambiente, les permite expresar la
caracterstica en forma diferente a sus demandas.
Existe una interaccin genotipo-ambiente cuando una diferencia especfica de
ambiente tiene diferente efecto sobre diferentes genotipos. Esta interaccin puede
adoptar diferentes formas, por ejemplo, una diferencia especfica de ambiente puede
tener un mayor efecto en algunos genotipos que en otros, o puede haber un cambio en el
orden con respecto al mrito en una serie de genotipos, cuando stos se miden en
diferentes ambientes. Esto significa , que el genotipo A puede ser superior al genotipo B
en el ambiente X, pero inferior en el ambiente Y.
Si se considera que el comportamiento fenotpico ( Fij ) es una relacin aditiva
entre los efectos genticos ( g i ) ms los efectos ambientales (e j ) adems de los efectos
de interaccin ( ij ) el modelo que puede utilizarse sera:
93
Fij = + g i + ij (e j )
donde:
gi
ij
ej
OBJETIVOS
Demostrar
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
1.8
1.5
0.7
1.5
1.0
2.5
1.0
1.0
1.5
1.8
1.8
1.0
1.5
1.5
2.5
2.0
1.2
2.0
2.0
3.0
2.1
2.0
2.4
2.5
2.3
1.7
1.8
2.2
2.7
2.5
1.2
1.5
2.2
3.4
2.5
2.7
2.0
2.4
1.6
2.0
1.9
2.6
1.8
2.0
1.0
1.6
2.5
3.2
2.3
2.4
2.0
2.5
1.7
2.0
2.0
2.0
1.4
2.1
0.9
1.5
1.8
3.0
2.3
1.9
1.8
2.0
1.4
1.5
2.0
2.0
1.5
1.7
0.8
1.2
1.5
2.5
2.0
2.0
1.8
1.8
1.3
1.7
2.0
1.6
1.5
1.5
0.8
1.5
1.7
2.9
1.9
1.8
1.5
1.5
1.7
1.8
1.6
1.2
1.2
1.5
0.8
1.0
1.5
2.7
1.8
1.6
1.2
1.8
1.5
2.1
1.2
1.1
MES 9
MES 10
1.2
1.5
0.6
1.0
1.0
1.7
1.6
1.4
1.0
1.2
1.5
1.4
1.2
1.0
1.2
0.8
0.8
1.0
0.9
1.2
1.4
1.3
0.8
1.0
1.2
1.0
1.0
0.6
94
2.-Determinar el promedio general considerando los 140 registros y las medias aritmticas
por mes ( e.j ) . Los parmetros estadsticos se obtienen activando el cono fx y siguiendo
las instrucciones de los cuadros de dilogo:
1
Activar en
el listado
la funcin
Estadsticas
2
El
listado
cambia
de
opciones,
buscar
3
Aceptar
2
Con el cursor marcar
tus valores en la hoja
de Excel
1 Colocarse en una
celda vacia
3 Aceptar
95
E . j / SE . j
Promedio
ambiental
1.436
2.121
2.229
e.j
Efecto ecolgico
-0.244
0.442
0.549
E.j
Efecto ecolgico
Estandarizado
-0.620
0.125
0.140
Obtener
desviacin
estndar
SE . j
E . j / SE . j
5.- Reacomodar el archivo colocando ahora como columnas los registros de cada cabra e
insertando en la primera columna el efecto ecolgico estandarizado:
Efecto ecolgico
Estandarizado
-0.62
1.125
1.397
C1
C2
C3
C4
C5
C6
MES
1.8
2.5
2.7
1.5
2.0
2.5
0.7
1.2
1.2
1.5
2.0
2.2
1.0
2.0
2.2
2.5
3.0
3.4
1
2
3
6.- Obtener los parmetros de regresin ( , ) para cada cabra, usando los valores
fenotpicos sobre los efectos ecolgicos estandarizados. Para calcular la regresin,
revisar la metodologa correspondiente a la prctica de Heredabilidad por regresin,
considerando que X = Efecto ecolgico estandarizado y Y= C1, C2, C3..C10 y de los
resultados obtenidos , = punto de interseccin de la recta (b) y = pendiente (m)
recordando que la ecuacin de la recta es Y = x +
X
MES
-0.604
Y1
Y2
Y3
C1
C2
C3
1.8
1.5
0.7
1.132
2.5
2.0
1.2
1.403
2.7
2.5
1.2
CABRA b (alfa)
m (beta)
1.680
0.427
1.710
0.430
0.880
0.171
Resultados de regresin
96
-1
Y = 0.427 ( X ( 0 ) + 1.680
DONDE
DESVEST
CABRA
(alfa)
(beta)
2S
1S
1S
2 S
0.395
1.680
0.429
1.341
1.510
1.680
1.850
2.019
0.395
1.710
0.430
1.370
1.540
1.710
1.880
2.050
0.395
0.880
0.171
0.745
0.813
0.880
0.947
1.015
2.200
2.000
1.800
Cabra 1
Cabra 2
1.600
1.400
1.200
1.000
2S
1S
1S
2S
97
AYRSHIRE (AY )
BROWN SWISS (BS )
GUERNSEY
(GU )
HOLSTEIN
(HO )
JERSEY
JE
Ao 1
204.033
240.283
195.626
257.504
208.960
Ao 2
206.745
240.374
194.541
260.894
211.039
Ao 3
211.400
244.577
198.609
267.539
218.000
Ao 4
214.112
246.928
201.682
271.562
221.932
Ao 5
218.045
251.809
206.022
278.116
226.949
Ao 6
218.361
252.487
205.298
281.551
230.882
Ao 7
222.972
262.160
210.677
288.240
237.933
Ao 8
221.977
262.431
207.965
287.201
239.108
Ao 9
221.435
267.629
210.632
291.721
242.769
Ao 10
234.498
281.777
225.729
308.852
254.069
Ao11
238.249
289.144
231.379
316.762
261.708
Ao12
246.611
301.529
239.018
328.378
273.731
Ao 2
Ao 3
Ao 4
Ao 5
Ao 6
Ao 7
Ao 8
Ao 9
Ao 10
Ao11
Ao12
251.312
269.663
273.460
289.054
304.332
314.095
268.036
281.686
287.562
320.061
348.221
354.594
277.709
302.930
310.886
BIBLIOGRAFA:
98
99
Prctica 11
Indices de Seleccin.
Cuando se pretende hacer mejoramiento en dos o ms caractersticas a la vez, es
necesario elaborar ndices de seleccin que hagan mxima la correlacin entre le
valor del ndice y el valor reproductivo del animal (Hazel, 1943), dado que los
caracteres en consideracin no son de igual importancia econmica, no tienen la
misma heredabilidad y no se puede esperar que la misma intensidad de seleccin,
de el mismo mejoramiento proporcional en cada una de ellas, considerando que
tambin pueden existir interrelaciones fenotpicas y genticas. (Warwik y Legates,
1990)
El clculo de los ndices de seleccin requiere utilizar los procedimientos de
regresin mltiple para resolver:
y = b1 ( x 1 ) + b 2 ( x 2 ) + L + bn ( x n )
100
Caso prctico:
En una unidad de produccin de la raza Hampshire se desea elaborar un ndice de
seleccin para las cerdas, que incluya las caractersticas: nmero de lechones
nacidos vivos y nmero de lechones destetados. Mediante alguno de los
procedimientos conocidos el especialista ha obtenido los siguientes datos:
Desviacin estndar del nmero de lechones nacidos vivos: 2.5 cerdos
Desviacin estndar del nmero de lechones destetados:
2.0 cerdos
Heredabilidad de la primer caracterstica:
0.15
Heredabilidad de la segunda caracterstica:
0.20
Correlacin fenotpica entre ellas:
0.46
Correlacin gentica entre las mismas:
0.49
Valor econmico de la primer caracterstica:
$ 300.00
Valor econmico de la segunda caracterstica:
$ 500.00
El valor de los coeficientes 1 y 2 se obtiene mediante lgebra de matrices, lo cual
implica resolver:
b
-1
2
p 1G
2
b1
b2
= 109.60
38.61
101
CovF12 2 G1
2 F2 CovG21
CovG12 $a1
2 G22 $a2
Es necesario conocer que las letras que se encuentran arriba de los parntesis
cuadrados (vectores o matrices) indican lo siguiente:
[b]
= Vector de valores del ndice que una vez obtenidos, sern
multiplicados por la variable correspondiente.
[P] 1 = Matriz de varianzas y covarianzas fenotpicas; el signo: -1, indica
que esta matriz deber ser invertida.
[G]
[a]
102
2 G1 = (h2 )1 (2 F1 )
Cov G 1,2 = Cov G 2,1 = Covarianza gentica entre ambas caractersticas.
Conociendo el valor de la correlacin gentica entre ellas, ste se multiplica
por el producto de las dos desviaciones estndar:
Cov = (rxy) (S1) (S2)
2 G2 = Varianza gentica de la segunda caracterstica, misma que
se obtiene multiplicando la heredabilidad de la segunda caracterstica por
su varianza fenotpica:
2 G2 = (h2 )2 (2 F2 )
El vector [a], contiene los valores econmicos de cada una de las dos
caractersticas.
El procedimiento manual para resolver el sistema de ecuaciones lineales y
obtener los valores de b1 y b2 se describe a continuacin:
Inversin de la matriz de varianzas y covarianzas fenotpicas, para obtener la
matriz [I]
Se obtiene el determinante (), de la matriz, multiplicando las varianzas
fenotpicas y restando al producto el cuadrado de la covarianza:
= [(2 F1 ) (2 F2 )] - (Cov F12)2
= [(6.25) (4.00)] - (2.30)2
= [(25.00) - (5.29)
= 19.71
Se cambia el signo de los elementos que contienen el valor de la covarianza
fenotpica y se permuta la colocacin de los elementos que contienen las varianzas
fenotpicas; despus se dividen todos los elementos de la matriz entre el
determinante:
P 1
2 F2
CovF21
CovF12
2 F1
103
P 1
4.000
2.300
2.300
6.250
0.2029 0.1167
0.1167 0.3171
G
C
0.2029 0.1167 0.9375 0.4244 C11 C12
=
0.1167 0.3171 0.4244 0.8000 C21 C22
104
2.30
4.00
105
de clik en el mismo y manteniendo apretado el botn derecho del ratn, seleccione la matrz:
vuelva a dar clik en el cuadro y pulse aceptar.
El resultado solamente le dar el primer elemento de la matrz, por lo que deber marcar el
nmero de filas y columnas que tiene la matrz inversa. Pulse F2 y despus mantenga
apretadas las teclas Control y Shif; de Intro, aparecern todos los elementos.
0.20294267
-0.11669203
-0.11669203
0.31709792
0.9375
1.4244
0.4244
0.8000
-0.00722476
0.20415424
300
500
3.60040589
204.759767
Finalmente usted resolvi el sistema de ecuaciones matriciales, que le permiten conocer el valor
de los coeficientes b1 y b2 utilizados en el ndice de seleccin.
106
Actividades complementarias
Elabore un ndice de seleccin para una empresa porccola, en donde pretenden
hacer seleccin simultanea en las caractersticas: nmero de lechones nacidos vivos
(NLNV) y das a 230 libras (D230L). Usted dispone de los siguientes datos:
desviacin estndar en ambas caractersticas (DE); heredabilidad de cada una (h2);
Correlacin fenotpica(Rf) y Correlacin gentica (Rg) entre ellas.
NLNV
D230L
DE
2.043
25.39
h2
0.3353
0.7115
Rf
0.4174
Rg
0.1829
107
PRACTICA 12.
USO DEL PROGRAMA COWGAME.
MEJORAMIENTO GENTICO DE UN HATO DE CARNE
Introduccin
El mejoramiento gentico de las especies se ha determinado por las
caractersticas del medio ambiente que las rodean y por las diferentes duraciones
de cada ciclo reproductivo de cada especie por lo que los mtodos de seleccin
hasta mediados del siglo pasado estaban restringidos por el tiempo de los ciclos a
mejorar es decir que si tenamos que mejorar una especie en el que su ciclo
reproductivo es muy largo se tenan que esperar varios aos para determinar si
era factible que la seleccin hecha ayudara a mejorar la raza o especie , sin
embargo este mtodo a pesar de ser una forma adecuada para su poca tenia
sus problemas, y una era que si despus de estos ciclos los animales no rendan
como se esperaba para entonces ya se haban perdido varios aos de
investigacin(12).
Gracias a los avances tecnolgicos en computacin el mejoramiento
gentico se ha desarrollado enormemente de manera que ahora el mejoramiento
animal se apoya de los programas de simulacin gentica que han surgido con
los avances de esta tecnologa(12).
Cowgame es un programa que crea modelos genticos simulados que
proporcionan informacin de un hato productor de carne a travs de la seleccin
de los mejores animales para incrementar el mejoramiento gentico en varias
generaciones(6).
108
Objetivo:
Incrementar el promedio de produccin del hato proporcionado por el
programa Cowgame, aplicando sus criterios de seleccin a travs de 5
generaciones de apareamiento.
Material y mtodo
Se utilizar el programa de simulacin Cowgame, para generar un hato de
bovinos de carne, el cual ser creado al azar, la misin del alumno es la de
aparear las vacas del hato con los sementales que considere que podran
incrementar el promedio de la o las caractersticas elegidas en la siguiente
generacin y as sucesivamente hasta completar 5 generaciones como mnimo.
109
110
111
Los datos asignados para poblacin de ganado en el programa Cowgame es como sigue:
Poblacin promedio
(libras)
Heredabilidad ()
Weaning weight
450
20
(peso al destete )
post-weaning daily gain
2.5
55
(ganancia diaria post-destete )
yearling weight
850
40
(peso al ao)
se supondr un porcentaje de perdidas del 10 %, esto incluye perdidas debido a baja
fertilidad , perdida de becerras y perdidas por muerte en general .
Las reglas para el cowgame son las siguientes :
Un mnimo de dos toros sern utilizados pero no mas de cinco (incluyendo A:I:
toros) podrn ser usados en cada juego de apareamientos .
Cada toro usado deber ser apareado con un mnimo de cinco hembras pero no mas
de 25 hembras ( en progenitores A.I: no mas de 15 hembras ).
Un mximo de dos toros A.I: podrn ser usados en cada juego de apareamientos .
Un mnimo de cuatro generaciones debern ser generadas . esto podr ser realizado en una
sesin del juego o bien en diferentes sesiones para tener tiempo de una completa
evaluacin de los resultados y hacer las decisiones de apareamientos. Cowgame deber
ser jugado por un grupo o por equipos de dos o tres jugadores por hato .
Presione (Enter) para continuar ? ( esto desplegar la pantalla con las funciones que se
pueden seleccionar para iniciar la simulacin).
112
Presionar el numero 2 (Enter), esto crear el hato base para iniciar las
seleccin del los mejores animales .
113
114
Hoja de trabajo
apareamientos
para
el
registro
de
115
116
Introduzca el numero
de toro a usar
117
Nota: en caso de que el programa envi la seal de error muchas veces, se recomienda
cerrar el programa y comenzar con la introduccin de los apareamientos otra vez ya que
el hato esta creado y no se borrar.
118
PRACTICA 13.
MEJORAMIENTO GENTICO DE UN HATO PRODUCTOR DE LECHE
Introduccin
La seleccin natural ha sido en la naturaleza el mtodo de mejoramiento
gentico que ha influido en el desarrollo de las especies que existen en el mundo,
as como el medio ambiente
ha determinado algunas
caractersticas de los
119
Objetivo:
Emplear el programa Milk para seleccionar a los mejores animales a travs de 5
ciclos reproductivos.
Material y mtodo
Para simular un hato lechero utilizarn el programa Milk. Este programa
gentico generar un hato productor de leche simulado as como sus datos de
produccin, promedios y ganancias de cada animal y en los cuales se basarn para
realizar la seleccin de los mejores animales, al igual que en la practica anterior,
este proceso se repetir hasta obtener 5 generaciones como mnimo.
120
Recordar que una vez que se ha creado el hato base para tu trabajo, la prxima vez que se
abra el programa y pregunte si se borra el hato base se deber teclear (Enter) para
continuar usando este hato, ya que cada vez que se cree una generacin se guardar
como el hato existente.
121
La siguiente pantalla desplegar el paso ulterior que es asignarle un nombre al hato enter the name
for your herd (Enter), ya que se ha creado el hato el programa mandar la impresin de
los resmenes del hato para iniciar la seleccin, en este caso sern cuatro hojas como las que
se muestran a continuacin en este manual. Despus de esto el programa regresa al men
principal donde seleccionarn el numero 2 que es el comando enter matings
(introduzca los apareamientos) por lo que se desplegar la pantalla para este paso (pantalla
siguiente).
122
Resumen de vacas
123
124
cuantos toros
125
Reporte. Usted deber reportar lo que pasa en sus 5 generaciones usando como
criterio los promedios obtenidos en la o las variables seleccionadas. De preferencia
grafiquelas y discutalas.