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Infecciones
Fngicas del
Gnero
Fusarium en
Maz
Esteban Lpez Tavera
Rosa Desiree Ochoa Martnez
Proyecto Final
A01064766
A01063250
Introduccin
El rpido y correcto diagnstico de enfermedades vegetales es un componente
crucial en cualquier sistema de manejo de cultivos. Las enfermedades vegetales
pueden ser manejadas ms efectivamente si las medidas de control se introducen
en etapas tempranas del desarrollo de la enfermedad. Una bsqueda de sntomas
puede no ser un diagnstico muy confiable, pues la enfermedad puede estar
presente desde mucho antes de que los sntomas aparezcan y la expresin de
estos puede ser muy variable [1]. Dentro de los patgenos vegetales, uno de los
ms frecuentemente encontrados, aunque se le dio poca importancia hasta la
dcada de los sesenta, son los hongos, que son capaces de afectar a cualquier
cultivo y de diferentes formas. Uno de los gneros ms comunes de hongos es el
Fusarium, que como con otros hongos, los primeros pasos tomados para su
investigacin requieren de una correcta identificacin, desafortunadamente esto
presenta ciertas dificultades, principalmente debido a que las tcnicas para su
deteccin consumen mucho tiempo, son laboriosas y aquellas ms sencillas y
especficas no estn a disposicin de todos [2].
El gnero Fusarium fue primeramente elucidado en 1809 por el cientfico alemn
Link. Se trata de una especie ampliamente distribuida a lo largo del mundo tanto
en suelos como en sustratos orgnicos, se ha encontrado en suelos congelados
en el rtico y en las arenas del desierto del Sahara; abundan en suelos de cultivos
tanto en temperaturas templadas como en regiones tropicales. Uno de los factores
que contribuyen a su distribucin es el hecho de que tienen una gran capacidad
para cambiar rpidamente su morfologa y su fisiologa, adaptndose a ambientes
nuevos [2].
Los hongos de este gnero estn involucrados en el desarrollo de enfermedades
humanas y animales, pueden contaminar los alimentos destinados para animales
y para humanos al generar podredumbre en cultivos y producir micotoxinas. Las
micotoxinas son productos naturalmente producidos por los hongos que pueden
evocar una respuesta txica cuando se introducen en bajas concentraciones a
vertebrados complejos a travs de una ruta natural. Algunas micotoxinas pueden
Justificacin
La mayor parte de las enfermedades que afectan al maz tienen que ver con el
deterioro de su raz, tallos, mazorca o granos, y estos son afectados
principalmente por hongos. Dentro de estas enfermedades, el pudrimiento de la
mazorca es la ms importante en pases en los que este cereal se cultiva, afecta
de manera adversa las cualidades fsicas, fisiolgicas y fitosanitarias de la
cosecha. Los agentes causales reportados como responsables de este
padecimiento son los hongos del gnero Fusarium, que son capaces de sobrevivir
en el suelo, en los restos de la planta infectada, dentro de semillas aparentemente
sanas y puede incluso afectar al embrin sin que se muestren sntomas aparentes.
Estos hongos son patgenos de diferentes plantas de cereales y pueden estar
presentes en todas las etapas de su desarrollo, desde las primeras horas de la
germinacin al tiempo de cosecha, incluyendo el periodo de post-cosecha de los
granos [4].
El maz es uno de los componentes bsicos de la alimentacin mundial, y al
mismo tiempo es el cultivo que toma el primer lugar en la produccin. En pases
desarrollados la mayor parte del maz producido se destina a la alimentacin de
ganado o usos industriales diferentes a la elaboracin de alimentos para humanos;
en pases en vas de desarrollo como Mxico, el maz es la principal fuente de
como que no son muy especficas, la identificacin de una especie debe realizarse
por un experto en la materia y es muy susceptible a errores, adems de que este
tipo de tcnicas toman mucho tiempo en completarse, y esto puede ser perjudicial
si lo que se quiere es un diagnstico oportuno.
Avances recientes en sistemas moleculares de hongos proveen informacin de
secuencias de ADN que resulta muy til
ADN para generar curvas estndar para el PCR-RT. La extraccin del material
gentico de estos micelios se realiz siguiendo un protocolo descrito por Fredlund
et al. utilizando un kit comercial para su extraccin (DNeasy Plant Mini Kit),
despus se hizo una cuantificacin utilizando un equipo de Nanodrop incorporado
a un espectrofotmetro. La extraccin de material gentico proveniente de
muestras vegetales se realiz de la misma manera que la de los micelios, pero
primero las muestras se mezclaron con buffer, se sometieron a sonicacin y se
adicion adems soluciones de RNAasa y proteinasa. Los primers y sondas
especficas para la deteccin de cada especie de Fusarium utilizaron diferentes
marcajes, algunas de ellas eran detectadas por tecnologa SYBRGreen,
mientras que otras por medio de sondas tipo TaqMan , pero todas ellas estaban
marcadas en su extremo 5 con 6-carboxy-fluoresceina (FAM). La reaccin de PCR
se llev a cabo en un termociclador, despus de aadirse en el vial la muestra de
ADN (estndar o de material vegetal), mezcla de reaccin de PCR, mezcla master
universal TaqMan o SYBRGreen y los primers o sondas marcadas con FAM.
Las condiciones dentro del termociclador fueron las siguientes: 2 minutos a 50C,
10 minutos a 95 C, 40 ciclos a 95 C por 15 segundos y 1 minuto a 60 C. En este
estudio tambin se incluy un anlisis de micotoxinas sobre las muestras de
material vegetal utilizando un sistema de HPLC/Ionisacin ElectrosprayEspectrometra de Masas en Tandem [8]. Un estudio diferente, esta vez realizado
en Mxico, llev a cabo un anlisis filogentico de diferentes especies de
Fusarium que afectan drsticamente a los cultivos de maz dentro del pas, para
esto tambin se utiliz PCR pero para amplificar regiones ITS (Espaciador
Transcrito Interno o Internal Transcribed Spacer). Diversos granos de maz
infectados con Fusarium fueron colocados en medio selectivo para cultivar
micelios, se extrajo ADN de estos y se hizo la amplificacin con PCR, usando una
mezcla que contena buffer, MgCl 2, dNTPs, primers especficos para la regin, Taq
polimerasa y ADN en un termociclador con las siguientes condiciones: 2 minutos a
95 C, 30 ciclos a 95 C por 1 minuto, 30 segundos a 50 C, 2 minutos a 72 C y
10 minutos finales a 72 C. Los productos de PCR despus fueron purificados
utilizando un kit comercial (QIAquick kit) y fueron corridos por medio de
electroforesis en un gel de agarosa, despus este fue teido con bromuro de etidio
y pudo ser visualizado para el anlisis de los productos amplificados [4].
De acuerdo a los materiales que se utilizaron en ambos estudios, se dedujo que
para una deteccin por medio de PCR de especies del gnero Fusarium, se
debera contar con lo siguiente:
Producto
Medio de cultivo selectivo (500 g)
Oligonucletidos (10-79 bases)
Mezcla de PCR-RT (500 RX)
Mezcla
de
tincin
(universal
Precio (MXN)
$875.00
$20,716.00
$10,759.00
$4,298.00-17,220.00
SYBRGreen o TaqMan)
Agarosa (500 g)
$12,766.00
Bromuro de etidio (25 g)
$7,030.00
Kit de extraccin de ADN (250)
$8,804.00
Total
$708,170.00
Los precios de todos los productos fueron consultados en diferentes casas
comerciales y distribuidoras de reactivos analticos como Sigma-Aldrich, Phytotech
Laboratories, Custom Arrays y Life Technologies.
Aunado a esto, se debe considerar que para realizar un anlisis se deber contar
con equipo como un termociclador, Nanodrop, electrodos y soporte para
electroforesis, como mnimo, adems de que posiblemente se deber disponer de
algn homogeneizador para las muestras (molino por ejemplo), incubadora, baos
de agua, congeladores, entre otros.
Existe una estructura formada de tomos de carbono que consiste en hojas de
grafeno enrolladas y altamente ordenadas, que pueden ser de pared sencilla o
mltiple [10]. Estas estructuras son llamadas nanotubos de carbono (CNT) o
nanotubos de fulereno y tienen dimetros que van desde uno hasta decenas de
nanmetros y su longitud puede ser desde unos pocos micrmetros hasta cientos
de micrmetros o ms [10]. Dependiendo de la manera en que estn enrollados,
tienen propiedades similares tanto a metales como semiconductores [10].
Gracias a lo anterior, los CNTs han sido usados como componentes de elementos
de circuitos electrnicos [10]. Adems, ha habido muchos reportes que describen
Diseo y Protocolo
El mtodo que se presenta requiere de la produccin de los sensores que se
utilizarn para detectar y cuantificar las micotoxinas de Fusarium en la muestra. El
proceso puede dividirse en dos grandes etapas: la produccin de los anticuerpos y
la inmovilizacin de una mezcla de estos con CNTs en un soporte slido.
Los materiales requeridos en la primera etapa son: Agua desionizada nanopura,
ovalbmina (OVA), albmina de suero bovino (BSA), polivinil alcohol (PVA), 1-1carbonildiimidazol (CDI) y 1[3-(dimetilamino)propil]-3-etil-carbodiimida hidrocloruro
segunda dosis pre-fusin se administra dos das despus con fusin esplenoctica
tres das despus de la inyeccin final.
Los ratones con anticuerpos reactivos a FU presentes en el suero se sacrifican y
se
esplenectomizan
aspticamente
[15].
Los
esplenocitos
se
fusionan
Cantidad
10 mg
1g
500 g
1L
Costo (pesos)
8, 524
11, 214
1, 953
918
Papel Whatman
OVA
Medio GYAM
Anyuvante
completo
Freund
Adyuvante
1 paquete
2 mL
250 g
10 mL
incompleto 10 mL
439
2, 522
1, 200
350
310
Freund
Los precios de todos los productos fueron consultados en diferentes casas
comerciales y distribuidoras de reactivos analticos como Sigma-Aldrich, Phytotech
Laboratories, Custom Arrays y Life Technologies.
Resultados Esperados
El sensor detectar cambios en alguna propiedad elctrica como resistencia o
potencial elctrico del sensor una vez que los anticuerpos presentes en este
hayan reaccionado con la micotoxina presente en la muestra. Estos cambios sern
correlacionados con la concentracin de la micotoxina presente en la muestra.
Se espera que el mtodo permita obtener resultados en solo 5 minutos despus
de aplicar la muestra al sensor y tenga un lmite de deteccin de alrededor de
0.005 ng/mL [12]. Los resultados reportados hasta ahora en sensores similares por
Jack Andraka han reflejado un lmite de deteccin de 0.156 ng/mL para Mesotelina
en sangre [12].
Comentarios Generales
Los mtodos de diagnstico disponibles para la identificacin de especies de
hongos del gnero Fusarium son utilizados ampliamente alrededor del mundo
debido a que afectan a muchos cultivos importantes, y aunque cumplen con el
propsito de deteccin, siempre hay lugar para mejoras en todas las tcnicas. El
mtodo propuesto en este proyecto, incorpora tcnicas y conocimientos ya
planteados para la deteccin y diagnstico de esta y otras patologas. Es gracias a
una combinacin de tcnicas de diferentes reas (como Medicina, Microbiologa,
Agricultura, Diagnstico Molecular, entre otras) que se pudo plantear la creacin
Referencias
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[12]
Andraka
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Nmero
de
patente
PCT/US2012/068589.
WIPO
Patentscope.
[13] Maragos, C. M., Busman, M., & Plattner, R. D. (2008). Development of
monoclonal
antibodies
for
the
fusarin
mycotoxins. Food
additives
and