Ciclo de las pentosas

Ciclo de Krebs
Ciclo del glioxilato

Ciclo de las pentosas (va del fosfogluconato)

En tejido adiposo, glndula mamaria, corteza adrenal e hgado
Genera poder reductor y ribosas, de acuerdo a necesidades

La etapa oxidativa

Esta ltima reaccin es normalmente

considerada en la etapa no oxidativa

La primera reaccin (G6PDH) es la comprometida y por lo tanto es regulada.

Se activa cuando baja la conc. de NADPH y deja de ser inhibida por l. Es
decir, el que G6P vaya a glicolisis o al ciclo de las pentosas depende de la conc.
de NADPH.

G' = -17.6 Kj/mol

Hasta ribulosa5P se han producido 2NADPH + 2H+. Si el objetivo es solo este

poder reductor, las pentosas producidas vuelven a hexosas a travs de la etapa
no oxidativa del ciclo de las pentosas: interconversin de azcares

aldosa

phosphohexose
isomerase

cetosa Ribulose 5-P

Esquema de la interconversin de azcares (bis)

Reaccin de la transladolasa

Las dos reacciones catalizadas

por transcetolasa

El ciclo de las pentosas segn el Voet & Voet

TPP

TPP

El contexto metablico en condiciones aerbicas

(cuando no hay fermentacin)

Recordar mencin del efecto Pasteur

Pero como hemos insistido,

no solo los carbonos de los
azcares van al TCA

Paths of pyruvate.

Pyruvate can either passively

diffuse across the
mitochondrial inner membrane
or be transported by the
mitochondrial pyruvate carrier
(MPC); both processes are
driven by pH. MCT,
monocarboxylate
transporter; GLUT, glucose
transporter; TCA, tricarboxylic
acid; CHC, cinnamic acids.

Reaccin catalizada por la piruvato deshidrogensa en la matriz mitocondrial

Composicin de la enzima y cofactores involucrados

La PDH de E. coli pesa 4.5 x 106 Da; la eucaritica pesa 7.8 x 106 Da

La enzima de rin bovino: el centro son 20 trmeros de E2

(verde). El dominio lipoil de E2 (azul) se extiende hasta el
sitio activo de E1 y como gira puede alcanzar tambin a E3
Esta disposicin estructural permite que los intermediarios
nunca salgan del complejo hacia el medio.

E1: decarboxilacin y oxidacin

del HE-TPP. Los dos electrones
son usados para reducir el -S-S-

E2: transesterificacin dejando

dihidrolipoamida.
E3: tiene a su vez dos cis
vecinas que estn formando un
S-S. Se reducen oxidando a la
dihidrolipoamida. Luego los SH
son reoxidados por el FAD y
ste ltimo lo es por el NAD+.

Ciclo cataltico de la dihidrolipoil deshidrogenasa.

The catalytic center is surrounded by protein so that
the NAD and dihydrolipoamide binding sites are in
deep pockets. The catalytic cycle consists of six
steps:
(1) The oxidized enzyme, E, which contains a
disulfide bond between Cys 43 and Cys 48, binds
dihydrolipoamide, LH2, to form an enzyme
substrate complex, ELH2.
(2) A substrate S atom nucleophilically attacks S43
to yield a disulfide bond and release S48 as a thiolate
ion. The proton on the substrates second thiol group
is abstracted by His 451 to yield a second thiolate
ion, ESSLS-.
(3) The substrate thiolate ion nucleophilically
displaces S43 aided by general acid catalysis by His
451 to yield the enzymes lipoamide product in its
complex with the stable reduced enzyme, EH2L, in
which S48 forms a charge-transfer complex with the
flavin ring (dotted red line to the red flavin ring).
(4) The lipoamide product is released, yielding
EH2.The phenol side chain of Tyr 181 continues to
block access to the flavin ring of FAD, so as to
prevent the enzymes oxidation by O2.
(5) The enzymes second substrate, NAD, binds to
EH2 to form EH2NAD. The phenol side chain of
Tyr 181 is pushed aside by the nicotinamide ring of
NAD.
(6) The catalytic cycle is then closed by the
reduction of the NAD by EH2 to reform the oxidized
enzyme E and yield NADH.

Control de la PDH
Como es irreversible, es un buen sitio de regulacin

Inhibida por ATP, c. grasos, NADH y AcCoA

Activada por AMP, NAD+, CoA y en el msculo por Ca2+

Adems, solo en eucariotes, se regula por fosforilacin:

ATP, NADH y AcCoA activan a la PDHK, la que fosforila
la E1 inactivndola. Piruvato y ADP inhiben a la PDHK

Ciclo de Krebs (TCA)

8 reacciones en las que destaca:

- se pierde CO2 en las reacciones
catalizadas por isocitratoDH y
aKGDH.
- reducciones con NAD+ por
isocitratoDH, aKGDH y
malatoDH.
- reduccin con FAD por
succinatoDH
- fosforilacin a nivel de sustrato
en la reaccin catalizada por la
succinilCoA sintetasa.
-destino de los C del acetato:
dado que succinato y fumarato
son simtricos, ya no se puede
saber su destino exacto.

Citrato sintetasa

El metil del acetil se une al

carbonilo del OAA, siendo
citroilCoA un intermediario
transiente. La ruptura del
tioster empuja la reaccin.
Regulada alostricamente por
ATP, ADP, NADH y otros.

Aconitasa

pro R

Los grupos iguales se llaman ProR o ProS

cuando al ser sustitudos por uno de mayor
jerarqua dan quiralidades R o S, respectiv.

Ctrico a isoctrico
pasando por cisacontico que no se
disocia de la enzima.
El Ges positivo,
pero la remocin del
producto empuja el
ciclo.

Dado que el citrato no es quiral, uno esperara los productos de las reacciones 1 y 2
de abajo y que la siguiente reaccin de tambin aKG marcado de dos maneras. Pero
se obtuvo un solo tipo de marca en el aKG. Ello obedece a que la aconitasa
distingue: remueve el H del grupo CH2 proR (el que estaba en el OAA ; el proS es el
que entr en el AcCoA). Por otra parte, adicin de agua a cis-aconitato podra dar 4
estereoismeros, pero la aconitasa da solo 2R3S isocitrato.

En 1948 Alexander Ogston propuso que una molcula aquiral como el citrato podra
actuar como si fuese quiral en la medida que se uniera especficamente a tres puntos en
el sitio activo de la enzima:

Hoy sabemos que en el sitio activo de la

aconitasa contiene un grupo prosttico
4Fe-4S que permite esta unin especfica
del citrato.

Esta distincin que pueden hacer las enzimas de grupos idnticos unidos a un carbono
proquiral se explica por el hecho que estos grupos ocupan distintos lugares en el espacio
tridimensional. Otro ejemplo muy importante de este fenmeno se encuentra en el
catabolismo de los cidos grasos. En este caso, la acil-CoA deshidrogenasa remueve los
dos hidrgenos proR utilizando FAD como cofactor.

Isocitrato deshidrogenasa

Primera oxidacin y decarboxilacin, pasando por oxalosuccinato.

G= -20.9 Kj/mol.

a-cetoglutarato deshidrogenasa (aKGDH)

Segunda oxidacin y decarboxilacin. Virtualmente idntica a PDH,

con E1 muy distintas, E2 similares y E3 idnticas.

Ciclo de Krebs (TCA)

SuccinilCoA sintetasa

Fosforilacin a nivel de sustrato. Plantas

y bacterias funcionan con ADP.

El tioster pasa a un acil-P.

Este P es cedido a una his de
la enzima, el que luego pasa
al GDP.

Las cargas positivas en los

extremos de las hlices
estabilizan el his-P

Hasta el momento se han perdido los 2 C que entraron, se han producido 2NADH + H+ y un ATP.
Luego:

Funciona con FAD. El succinato es simtrico, por lo que perdemos la pista a los 2 C que haban
entrado como AcCoA. Est unida a membrana. La volveremos a ver porque participa tambin
en la fosforilacin oxidativa. El malonato, con un C menos que el succinato, inhibe
fuertemente la reaccin.

Fumarasa
H2O
Solo hidrata el trans. Al
revs, solo funciona
con L malato, no con D.

Malato DH
Cuarta reduccin en el TCA.
El Ges positivo, pero
despus el oxalato es
removido en una reaccin
muy exergnica.

Resumen de los eventos principales del ciclo

Tener presente que los 2 C que salen no son los que entraron como AcCoA
Si calculamos rendimiento desde la glucosa, tenemos 4 ATP, 10 NADH y 2 FADH2.

El TCA parece muy complicado para simplemente oxidar acetato.

Pero esa no es su nica funcin. El TCA es anfiblico

En rojo estn las reacciones anaplerticas, las que rellenan al TCA cuando salen
intermediarios para las distintas vas

Transaminaciones

Mediante este tipo de reaccin se producen interconversiones glu-aKG, OAA-ala y ala-pir

PLP es el cofactor piridoxal fosfato

Debido a su accin, la concentracin de compuestos del TCA se mantiene ms o menos constante.

Recordar que la piruvato carboxilasa es activada alostricamente por AcCoA.
PEP carboxilasa y enzima mlica son inportantes en plantas C4.
La PEP carboxilasa es activada por F-1,6-bifostato. De este modo se refuerza el funcionamiento
del ciclo para recibir al piruvato que entregar la glicolisis.
La enzima mlica tambin es importante en la produccin de NADPH en tejido adiposo.

Regulacin del
ciclo de Krebs

(ya vista)

Repaso de la regulacin de
la glicolisis y del TCA

Se puede sintetizar glucosa a partir de AcCoA en trminos netos?

No en los vertebrados: aunque la PEPCK (OAA + GTP

PEP + GDP + CO2) canaliza C del OAA para la
gluconeognesis, cuando el AcCoA que entra al ciclo
llega a OAA ya se han perdido los 2 C.
Pero en otros organismos:

El ciclo del glioxilato

(plantas, microorganismos, invertebrados, hongos)
Por cada vuelta del ciclo
entran 2 AcCoA y se forma
un succinato, el que por
TCA llega a OAA.

enzima
nueva
enzima
nueva

Sobreposicin de los ciclos de Krebs y del glioxilato

Pero ambos ciclos no ocurren en el mismo organelo

Relacin entre el ciclo del

glioxilato y el TCA:
Sntesis de sacarosa a partir de
lpidos en semillas germinando

Isoenzimas del
ciclo de Krebs

glioxisoma

En plantas, los glioxisomas, se

encuentran en solo algunos tejidos
(semillas por ej). Las hojas pueden
hacer carbohidratos por fotosntesis.
En bacterias, las enzimas estn
mezcladas en el citosol.
Adems de los flujos del succinato y malato
mostrados, el OAA sale tambin de la
mitocondria como asp, el que va al
glioxisoma para volver a OAA y recibir
AcCoA de los c. grasos

mitocondria

Regulacin coordinada
de ambos ciclos

A nivel del destino del isocitrato,

que es el intermediario clave. La
IDH quinasa y la fosfatasa son la
misma enzima. Los mismos
metabolitos que activan la IDHP
son inhibidores alostricos de la
isocitrato liasa.

Variantes del ciclo de Krebs (1): cianobacterias

Por muchas dcadas su ciclo pareci incompleto, ya que carece de a-KGDH. Se acaban de
descubrir dos enzimas que cierran el ciclo: a-cetoglutarato decarboxilasa y semialdehido
succnico DH, que usa NAD+. Ntese que no hay fosforilacin a nivel de sustrato. Estas enzimas
se descubrieron en Synechococus, pero estn presentes en muchas especies analizadas.

Variantes del ciclo de Krebs (2): el ciclo reverso

Presente en algunas bacterias, ha sido propuesto por Wchtershuser y Morowitz como la va
primitiva para fijar CO2. Varias reacciones del ciclo pueden ser catalizadas por ZnS + UV.

Enzimas propias son: citrato liasa, fumarato reductasa y carboxilaciones de succCoA a aKT y de AcCoA a pir, que
requieren ferredoxina y son sensibles al oxgeno. Presente en green sulfur bacteria (anaerbicas estrictas y fotoautotrficas, aunque algunas pueden hacer fotoheterotropa. En este caso el ciclo funciona en la direccin oxidativa).
Dador de e- es H2S, produciendo S y SO4-2. Tambin est en el gnero Sulfolobus (Archea, quemolitoaut-trofo
que oxida H2S o S a SO4-2 y en Aquifex, aerobio, quemolitoauttrofo e hipertermfilo que oxida H2, S o S2O3-2.