1.

Respecto a los aminocidos:

a. Cuntos aminocidos presentes en la naturaleza se han reportado
hasta el momento?
Se han reportado hasta el momento 20 aminocidos presentes en la
naturaleza:
cido Asprtico (Asp)
D
cido Glutmico
(Glu)E
Alanina (Ala) A
Arginina (Arg) R
Asparagina (Asn) N

Cisterna Cys) C

Isoleucina (IIe) I

Serina (Ser) S

Fenilalanina (Phe) F

Leucina (Leu) L

Tirosina (Tyr) Y

Glicina (Gly) G
Glutamina (Glu) Q
Histidina (His) H

Lisina (Lys) K
Metionina (Met) M
Prolina (Pro) P

Treonina (Thr) T
Triptfano (Trp) W
Valina (Val) V

b. Cuntos y cules aminocidos forman parte de las protenas?, qu

caractersticas tienen en comn?
Son 20 aminocidos que forman parte de las protenas son: Serina (Ser,S), Treonina
(Thr,T), Cistena (Cys,C), Asparagina (Asn,N), Glutamina (Gln,Q) y Tirosina (Tyr,Y),
Glicina (Gly,G), Alanina (Ala,A), Valina (Val,V), Leucina (Leu,L), Isoleucina (Ile,I),
Metionina (Met,M), Prolina (Pro,P), Fenilalanina (Phe,F) y Triptfano (Trp,W), cido
asprtico (Asp,D) y cido glutmico (Glu,E), Lisina (Lys,K), Arginina (Arg,R) e Histidina
(His,H)

Todos los aminocidos componentes de las protenas son alfa-aminocidos, lo que indica
que el grupo amino est unido al carbono alfa, es decir, al carbono contiguo al grupo
carboxilo. Por lo tanto, estn formados por un carbono alfa unido a un grupo carboxilo, a
un grupo amino, a un hidrgeno y a una cadena (habitualmente denominada R) de
estructura variable, que determina la identidad y las propiedades de los diferentes
aminocidos; existen cientos de cadenas R por lo que se conocen cientos de aminocidos
diferentes, pero slo entre 20 forman parte de las protenas y tienen codones especficos
en el cdigo gentico.
c. Cmo se clasifican los aminocidos segn:
- el tipo de cadena lateral
Aminocidos alifticos

En este grupo se encuentran los aminocidos cuya cadena lateral es aliftica, es decir una cadena
hidrocarbonada.

Glicina, Gly, G

Alanina, Ala, A

Valina, Val, V

Leucina, Leu, L

Isoleucina, Ile, I

Aminocidos aromticos

La prolina tambin tiene una

cadena lateral de naturaleza
aliftica, pero difiere de los
dems aminocidos en que su
cadena lateral est unida tanto
al carbono alfa como al
nitrgeno del grupo amino.

En esta grupo se encuadran los aminocidos cuya cadera lateral posee

un anillo aromtico. La fenilalanina es una alanina que lleva unida un
grupo fenlico. La tirosina es como la fenilalanina con un hidroxilo en su
anillo aromtico, lo que lo hace menos hidrofbico y ms reactivo. El
triptfano tiene un grupo indol.

Prolina, Pro, P

Fenilalanina,

Triptfano, Trp, W

Phe, F

Tirosina, Tyr, Y

Aminocidos azufrados

Aminocidos hidroxilados

Hay dos aminocidos cuyas cadenas laterales

poseen tomos de azufre, son la cistena, que
posee un grupo sulfhidrilo, y la metionina, que
posee un enlace tioster.

Otros dos aminocidos tienen cadenas alifticas

hidroxiladas, la serina y la treonina. El grupo
hidroxilo hace de estos aminocidos mucha ms
hidroflicos y reactivos.

Cisteina, Cys, C

Serina, Ser, S

Treonina, Thr, T

Metionina, Met, M

Aminocidos bsicos

Dentro de los aminocidos con cadenas laterales muy polares encontramos tres aminocidos bsicos:
lisina, arginina e histidina.

Lisina, Lys, K

Histidina, His, H
Arginina, Arg, R

Aminocidos cidos y sus amidas

En este grupo encontramos dos aminocidos con cadenas laterales de naturaleza cida y sus amidas
correspondientes. Estos son el cido asprtico y el cido glutmico (a estos aminocidos se les denomina
normalmente aspartato y glutamato para resaltar que sus cadenas laterales estn cargadas negativamente
a pH fisiolgico). Los derivados sin carga de estos dos aminocidos son la asparagina y la glutamina que
contienen un grupo amida terminal en lugar del carboxilo libre.

cido asprtico, Asp, D

Asparragina, Asn, N

cido glutmico, Glu, E

Glutamina, Gln, Q

- las propiedades de la cadena lateral

Los aminocidos se clasifican habitualmente segn las propiedades
de su cadena lateral:
- Neutros polares, polares o hidrfilos : serina (Ser, S),
treonina (Thr, T), cistena (Cys, C), glutamina (Gln, Q),
asparagina (Asn, N) , tirosina (Tyr, Y) y glicina (Gly, G).
- Neutros no polares, apolares o hidrfobos: alanina (Ala, A),
valina (Val, V), leucina (Leu, L), isoleucina (Ile, I), metionina
(Met, M), prolina (Pro, P), fenilalanina (Phe, F) y triptfano
(Trp, W).
- Con carga negativa o cidos: cido asprtico (Asp, D) y
cido glutmico (Glu, E).
- Con carga positiva o bsicos: lisina (Lys, K), arginina (Arg,
R) e histidina (His, H).
- Aromticos: fenilalanina (Phe, F), tirosina (Tyr, Y) y triptfano
(Trp, W) (ya incluidos en los grupos neutros polares y
neutros no polares).
- la capacidad de sntesis del organismo

2. Respecto a niveles de organizacin de las protenas:

a. Qu estructuras puede presentar una protena? Explique cada una

de ellas.

b. Qu fuerzas estabilizan la estructura tridimensional de una protena?

Las fuerzas ms importantes que estabilizan la estructura tridimensional
son interacciones no covalentes.
Interacciones hidrfobas, fuerzas de van der Waals, puentes de hidrgeno,
interacciones inicas.
3. Qu condiciones afectan el plegamiento correcto de las protenas?
En condiciones de calor, determinadas sustancias qumicas, cambios bruscos de
pH, etc. Afectan el plegamiento correcto de las protenas.
Por el contrario, en condiciones fisiolgicas, el proceso de plegamiento de una
protena globular est claramente favorecido termodinmicamente, esto es, el
incremento de energa libre global del proceso debe ser negativo (aunque alguno
de sus pasos puede ser positivo). Este cambio se consigue equilibrando una serie
de factores termodinmicos como la entropa conformacional, las interacciones
carga-carga, los puentes de hidrgeno internos, las interacciones hidrofbicas y
las interacciones de van der Waals.
Bibliografa:

- Clasificacin de Aminocidos, Universidad del Pas Vasco. Espaa. [En lnea] [Fecha
de Consulta 26 Junio] Disponible en: http://www.ehu.es/biomoleculas/aa/aa3.htm
- Factores que afectan la estabilidad estructural de las protenas, Universidad Nacional
de Colombia. Bogot - Colombia [En lnea] [Fecha de Consulta 26 Junio] Disponible
en:
http://www.virtual.unal.edu.co/cursos/ciencias/2000024/lecciones/cap01/01_01_15.htm
- Protenas, Instituto Nacional de Tecnologas Educativas y de Formacin del
Profesorado. Gobierno de Espaa [En lnea] [Fecha de Consulta 27 Junio] Disponible
en: http://encina.pntic.mec.es/~esarment/web%20maluque/imagenes/Bio%202%20UD
%205%20Proteinas.pdf
- Aminocidos y Pptidos. Ayudas al aprendizaje de bioqumica, biotecnologa y biologa
molecular. BioROM. Madrid Espaa. [En lnea] [Fecha de Consulta 27 Junio]
Disponible en: http://www.biorom.uma.es/contenido/av_biomo/Mat2.html