Loreto Andrade Takeda

16 marzo 2015
BIOMOLECULAS I
Las protenas de generan por traduccin a base de aminocidos
Transcripcin: de ADN a ARN y las protenas que transcriben son la ARN
polimeraza
Traduccin: sntesis de proteinas
Las bacterias, que son procariontes, tienen 1 sola ARN polimeraza
En los eucariontes son 3, una que sintetiza proteinas pequeas, otras
medianas y otras grandes.
Los tomos se juntan para formar molculas y las molculas se juntan
para formar macromolculas como protenas, lpidos, cidos nucleicos,
etc.
Los tomos de cualquier elemento estn formados por un ncleo que
tiene electrones rbitando a su alrededor en dos componentes
llamados, protn (positivo) y neutron (no tiene carga, solo aporta masa y
el electron es al revs, o sea aporta carga y no masa).

Nmero atmico: nro de protones = cantidad

de electrones
Peso atmico: nmero de protones + nro de
neutrones (electrones son despreciables)
Ej: tomo de nitrgeno (N)
Nro atmico: 7 (nro de protones)
Peso atmico: 14
Cada vez que un tomo se junte con otro y
genere una unin qumica podr generar molculas por ejemplo 2
tomos de H dan 1 molculas de hidrgeno
Y 1 tomo de oxgeno y dos tomos de H --> h2o
Por lo tanto si un tomo tiene peso atmico, una molcula tambin va a
tener un peso molecular y ese peso corresponder a la suma del peso
atmico de todos los tomos que componen esa molcula

Loreto Andrade Takeda

MOLES
1 mol de una sustancia es la cantidad en gramos
equivalente a su peso molecular. Ej:
Hidrgeno molecular: PM = 2 --> 1 mol = 2gramos
(1mol de molcula de H en 2 gramos)
Agua: PM= 18 --> 1mol =18 gramos
1 mol de CUALQUIER sustancia contiene 6x10
elevado23 molculas de esa sustancia (nro de avogadro)

Moles y soluciones molares

Una solucin molar contiene 1 mol de una sustancia por cada litro de
solucin:

Tpica pregunta de control es cuantos gramos de azcar hay que pesar

para hacer una solucin de 500ml de glucosa 0,5 M. Esto significa que
tengo 0,5 moles de glucosa en 1 litro de agua.
Las molculas se forman gracias a interacciones denominadas ENLACES
(covalentes y no covalentes (ionicos, puentes hidrgeno, fuerzas de van
del walls)
El enlace covalentes son los mas fuertes. Las macromolculas se
enlazan entre ellas en enlaces Covalentes de tipo:

Loreto Andrade Takeda

Enlace peptidico: une protenas
Enlace glucosidico: une azcares
Enlace fosfodiester: une cidos nucleicos
El metabolismo se forma de dos etapas: biosntesis (anabolismo) y
degradacin (catabolismo). Anabolismo es la biosntesis de
macromolculas usando enlaces covalentes. Qumicamente el proceso
de formacin de enlaces covalentes es la unin de macromolculas y se
conoce como el proceso de condensacin y dentro de este proceso
ocurre liberacin de agua, (como el del agua al condensarse)
El catabolismo rompe enlaces covalentes y desarma macromolculas.
Qumicamente es llamado hidrolisis

ENLACES COVALENTES
Es el ms resistente por que los electrones son la clave ya que se
comparten en el enlace. En ionicos o hidrgeno o van del waals no se
comparten equitativamente y queda de un
extremo muy fuertemente agarrado y al
otro lado no.
Entonces en el enlace Covalente los
electrones del tomo tienen que
mantenerse en la distancia adecuada y
justa para que sea la distancia precisa y de
reparticin equitativa de electrones.nla
distancia entre electrones en un enlace
Covalente es de 0,74 mm y va a variar en
funcin al tamao del ncleo de cada
tomo ya que la repulsin vara segn
tamao
Ejemplos de enlaces covalentes de
molculas: oxigeno, agua, metano, etano,
etc
Definicin Enlace covalente: los tomos que participan van a aportar
entregando un electron y los orbitales de las capas de Valencia de
ambos tomos se combinan para formar uno solo que contiene a los dos
electrones.

Loreto Andrade Takeda

La electronegatividad de un tomo es la capacidad que tiene un tomo
de atraer electrones a su rbita. Un ejemplo de un tomo muy
electronegativos es el O del agua, que atrae a los H que son poco
electronegativos y se genera una molecula polar. La molecula como tal
tiene carga 0, tiene mismo nmero de electrones que protones, pero sus
electrones estn mucho ms tiempo pasando por la rbita del O que por
los H.
Cuando se genera un enlace con tomos que son igual de poco
electronegativos se genera un enlace Covalente no polar, en donde los
electrones estarn la misma cantidad de tiempo en las rbitas de ambos
tomos (como el H con el C).
Entonces los enlaces covalentes son:
- Polar: interactuar con molculas polares
- No polar: interactuar con molculas apolares
Con respecto a los enlaces no covalentes, aqu nadie imparte nada, sino
que el mas electronegativo abarca todos los electrones y los menos
electronegativos ceden sus electrones.
Carcteristicas enlaces covalentes:
- Es muy fuerte y se rompe con dificultad
- Si la diferencia de electrones atuvieses entre los dos tomos es
marcada, tenemos un enlace polar y se favorecer la solubilidad
de la sustancia en solventes polares, ejemplo: un enlace O-H

Loreto Andrade Takeda

En el caso los electro positivos es como decir que son muy poco
electronegativos entonces cuando hablamos de los enlaces covalentes
es la capacidad del tomo de atraer electrones. Otro tema
Enlaces covalentes hay de dos tipos: polares y no polares.
Enlace no covalentes: tipos ionico, puentes de h, fuerzas de van der
walls

ENLACES NO COVALENTES
Enlace ionico
En este enlace uno de los tomo toma un
electron de la capa de Valencia del otro,
quedando el primero con carga negativa por
el electron adicional y el segundo con carga
positiva al perderlo
Caracteristicas enlace ionico:
-

se disuelven muy fcilmente

Casi todos los elementos que se
han descrito son solubles en
solutos polares como el agua

Enlaces puente de hidrgeno

Loreto Andrade Takeda

Son enlaces muy dbiles que dependen de los tomos

de la molecula que se esta formando y que se forman
cuando un tomo de hidrgeno queda entre dos
tomos que atraen electrones (generalmente oxigeno
y nitrgeno)
Son mas fuertes cuando los tres tomos estn
alineados
Debido a que estn polarizadas dos molculas
adyacentes de h2o pueden formar un enlace puente
de hidrgeno. Estos enlace son mas fuertes cuando
los tres tomos se encuentra en lnea recta
Quiere tener los electrones siempre cerca de el

Enlaces fuerzas de van der waals

Se producen a distancias muy cortas, dos tomos muestran una fuerza
de interaccin dbil debida a sus cargas elctricas fluctuantes. Esto lo
tienen todas las molculas o sustancias que tienen capacidad de fluctuar
(min 47)

Loreto Andrade Takeda

Los enlaces no covalentes son muy dbiles pero son tantos que igual
generan estabilidad a las macromolculas.
En la imagen se ve el ncleo de un tomos en donde rbitan electrones
y donde hay electrones hay delta menos (carga negativa), por lo tanto
en las zonas donde no hay electrones, hay delta mas (carga positiva) y
si los dos tomos se juntan en las zonas donde hay delta menos se vana
repeler, sin embargo, cuando tienen los delta menos junto a los delta
mas, se unirn, fluctuando debido a la posicin de sus cargas.
Si uno compara la cantidad de energa en kilocalorias que necesito para
separar un mol con enlaces covalentes o no covalentes, al vaco (tcnica
experimental ya que naturalmente no se desarrollan al vaco) se ve que
los enlaces covalentes necesitan muchas mas kilocalorias para poder
separar esos enlaces en comparacin a las molculas unidas por enlaces
no covalentes.

Estructura cristalina del agua:

El agua es una molcula polar, en donde es diPolo ya que tiene una
regin positiva y una negativa y sus Molculas estam nidas por enlaces
puente de hidrgeno, los cuales al ser dbiles permitirn que el agua
tome muchas formas diferentes. Y al juntar molculas de agua formarn
todos los enlaces puentes de hidrgenos posible ya que es un diPolo,
entonces podr interactuar con elementos electronegativos y va a forzar
a los otros (por ejemplo a los aceites) a que se alejen de las molculas
de agua.
Por lo tanto la estructura de agua que permite que al derramarse quede
como una gota gigante (tensin superficial) es debido a los enlaces
puente de hidrgeno y ser este mismo enlace el que permitir dar las
diferentes formas al agua en sus diferentes estados (hielo, liquido, gas,
etc). Cuando el agua se calienta y evapora se rompen sus enlaces.

Loreto Andrade Takeda

Esto permite que se

genere la caracterstica
de que el hielo flote en
el agua, ya que la
conformacin slida es
mucho menos densa
que la liquida. Si el
agua esta puesta en el
60-70% en el planeta y
en nuestro cuerpo,
todos los elementos
qumicos, exceptuando
algunos ejemplos de
procesos de sntesis y
degradacin que
pueden prescindir del agua, la gran mayora de procesos moleculares
acta en un medio acuoso.
Se forman diferentes interacciones con el resto de las molculas en
donde hay molculas de dos tipos: hidrofilicas (afin con el agua) y las
hidrofobicas (no afin con el agua).

Molculas hidrofilicas
Las molculas hidrofilicas son sustancias
polares que se unen a las molculas de agua
en dos opciones de enlaces: ionicos, o puentes
de hidrgeno. Mientras quede un hidrgeno
entre dos elementos electronegativos, se
generar un enlace puente de hidrgeno.
La otra forma en la que se puede comportar
una molecula hidrofilicas como por ejemplo la
sal, se hidroliza esa molecula y la carga positiva interacta con la region
negativa del agua (Oxigeno) y la carga negativa (cloruro) interactua con
la zona positiva (hidrgeno), todas las molculas hidrofilicas van a ser
capaces de interactuar con el agua irnicamente o generar puentes de
hidrgeno.
Los Iones o molculas polares que se disuelven fcilmente en agua, su
carga elctrica atrae las molculas de agua, las que forman capas de
solvatacion alrededor de esa molecula polar (que no es el agua). (Que se
formen capas de solvatacion significa que un elemento se rodea de
agua)

Loreto Andrade Takeda

El agua adems participa como un reactivo mas de la reaccin qumica,
ya que por ejemplo en un enlace peptidico que une aminocidos, cuando
se unen se forma un enlace peptidico y se libera agua (condensacin).
Para romper la proteina sacando uno a uno los aminocidos debo incluir
agua, la cual separara este enlace por hidrolisis. Esta interaccin
ocurrir hasta cuando existan molculas de agua disponibles
Un ejemplo de sustancia polar que reacciona con el agua es la urea, la
cual formar enlaces or te de hidrgeno con las molculas de agua que
la rodea.

Los enlaces ionicos en

solucin acuosa son dbiles
ya que al adicionar agua en el
enlace se genera hidrolisis y
ese enlace se rompe. Tambin
hay otros iones en solucin
que pueden agregarse
alrededor de grupos cargados
y debilitar aun mas los
enlaces ionicos.

Molculas hidrofobicas
Todas las molculas de agua interactan entre s misma con enlaces
puentes de hidrgeno. En cambio las molculas hidrofobicas (no polares)
no tendrn interaccin ni ionica ni puentes de hidrgeno, generando
que todas las partculas que son hidrofobicas se unan generando islas
que repelen esta agua donde se encuentran, sin producirse interaccin
con el agua. Es el agua la que est forzando a que eso ocurra ya que es
ella la que se mantiene en la conformacin mas estable posible
mediante la mayor cantidad de enlaces puente de hidrgeno posible.
Agua como solvente

Loreto Andrade Takeda

El agua tiene una capacidad innata como solvente universal como un
elemento que participa de las interacciones qumicas de condensacin e
hidrolisis ya que a su vez las molculas estn ionizadas, de forma que el
agua estar formando puentes de hidrgeno consigo misma y adems
va a funcionar como un hidrxilo (o hidronio), y se va a generar dentro
de cada una de nuestras clulas, interacciones con diferentes
concentraciones de potasio, magnesio, azufre, fosfato, etc. Por lo tanto
esto est asociado a movimientos de solutos desde y hacia una celula
pasando por la membrana Plasmatica y que tienen que ver con
mantener este equilibrio funcional o fisiolgico (no es igual a equilibrio
qumico). Si se genera interaccin con compuestos ionicos, se genera la
funcin de solvente del agua ya que si el agua puede formar en,caes
puente de hidrgeno con ese soluto, tambin lo va a disolver. Solo se
escapan los elementos que no oye dejan formar ni puentes de hidrgeno
ni enlaces ionicos con el agua.

ACIDOS
Son sustancias que liberan iones hidrgeno
(protones) en solucin. Los cidos fuertes se
ionizan o disocian completamente en solucin.

Loreto Andrade Takeda

Muchos de los cidos presentes en

la celula de disocian parcialmente,
por lo que son cidos dbiles, por
ejemplo el grupo carbonizo
(COOH) se disocia dando un ion
hidrgeno en solucin.

BASES
Son sustancias que reducen el nmero de iones hidrgeno de la
solucin. Algunas bases como el amonio se combinan directamente con
los iones hidrgeno. Estas son capaces
de captar protones, y de entregar ion
hidrxilo, bajando de esta forma la
acidez de su ambiente.

Otras bases como el hidrxido

de sodio, reducen el nmero
de iones H indirectamente al generar iones OH que se combinan con los
iones H formando H2O.
Muchas de las bases que estn en la celula se disocian parcialmente por
lo que se denominan bases dbiles. As dulce de con los compuestos que
tiene un grupo amonio (NH2) que acepta
dbil y reversiblemente un ion H del agua,
aumentando los iones OH libres
(aumentando lo bsico)
El agua ionizada puede funcionar como cido o base y aunque no tenga
amonio ni cido clorhidrico puede hacer el trabajo de regular el pH
ejerciendo la funcin tampon, como agua sola sin relacionarse con otros
tomos.

Loreto Andrade Takeda