Escolar Documentos
Profissional Documentos
Cultura Documentos
Baja California
Facultad de Ciencias Marinas
Universidad Autnoma de
Baja California
Facultad de Ciencias Marinas
Directorio
ndice
Introduccin........................................................................................................................1
Encuadre del Sistema de Prcticas.....................................................................................2
Introduccin.....................................................................................................................2
Competencias a las que contribuye.................................................................................3
Niveles de Desempeo.................................................................................................3
Ubicacin dentro del mapa curricular..............................................................................4
Programa del Sistema de Prcticas..................................................................................5
1. BIOMOLECULAS.............................................................................................................6
1.1.
1.2.
1.3.
1.4.
1.5.
1.6.
1.7.
1.8.
1.9.
Determinacin de fosfoglicridos.......................................................................41
1.10.
2. METABOLISMO.............................................................................................................51
2.1.
2.2.
2.3.
Anexos..............................................................................................................................67
Normas Generales de Seguridad e Higiene...................................................................67
Medidas Generales en Caso de Accidente.....................................................................69
Pgina
1
Introduccin
Este manual est estructurado como material didctico de apoyo para
actividades de laboratorio de estudiantes que cursan la asignatura de
Bioqumica, de la carrera de Oceanologa de la Facultad de Ciencias Marinas
de la Universidad Autnoma de Baja California. El contenido del manual
tambin podr ser utilizado por estudiantes en carreras afines y en cursos de
bioqumica general con las adecuaciones que cada actividad de aprendizaje
requiera para coadyuvar en su formacin disciplinaria.
Pgina
2
Pgina
3
Pgina
4
HC= Horas Clase; HL= Horas Laboratorio; HT= Horas Taller; HPC= Horas Practicas Campo; HE= Horas Ejercicios;
CR=Crditos
Pgina
5
Tema
INTRODUCCIN
UNIDAD I:
BIOMOLCULAS
mbito de
desarrollo
Duracin*
Laboratorio
3 horas
Semana 1
Laboratorio
3 horas
Semana
3 horas
Semana
3 horas
Semana
3 horas
Semana
Laboratorio
Laboratorio
Laboratorio
Laboratorio
Laboratorio
Laboratorio
Laboratorio
Laboratorio
3 horas
Semana
3 horas
Semana
3 horas
Semana
3 horas
Semana
6 horas
Semana
11
3 horas
Semana
2
3
4
5
6
7
8
9
10 y
12
13
14
15 y
1. BIOMOLECULAS
1.1.
Pgina
7
1.1.1.
Introduccin.
Pgina
8
de
esta
tcnica
en
1.1.2.
Competencia.
1.1.3.
Material.
Pgina
9
1.1.3.1.
Materiales.
Tubos de ensayo, pipetas graduadas 5 mL, pipetero, vaso
precipitado, termmetro, celdas para espectrofotmetro, gradilla,
piseta.
1.1.3.2.
Instrumental.
Agitador de tubos, plancha de calentamiento, espectrofotmetro.
1.1.3.3.
Reactivos.
Solucin estndar de albumina (10 mg/mL), reactivo de Biuret
(3.75 g CuSO4.5H2O + 1.51 g NaKC4H4O6.4H2O + 7.50 g NaOH en
250 mL de agua destilada), solucin problema.
1.1.4.
Desarrollo.
1.1.5.
Resultados a reportar.
Pgina
10
1.1.6.
Mtodo de Evaluacin.
1.1.7.
Bibliografa.
Holtzhauer, M., 2006. Basic Methods for the Biochemical Lab. 5th
edition. Chapter 1: Quantitative Methods. Springer-Verlag, Berlin, p. 121.
Jacques-Silva, M.C., Rocha, J.B.T., 2000. Protein measurement at
practical classes for students of pharmacy: a student-centered
approach. Biochemistry and Molecular Biology Education 28, 327-329.
Prats, M., 1989. Tools in spectrophotometry and
spectrophotometry. Biochemical Education 17(3), 151-153.
differential
1.2.
1.2.1.
Introduccin.
Complejo de biuret
1.2.2.
Competencia.
1.2.3.
Materiales y reactivos.
1.2.3.1.
Materiales.
Instrumental.
Reactivos.
1.2.4.
Metodologa.
1.2.5.
Resultados a reportar.
1.2.6.
Mtodo de evaluacin.
1.2.7.
Bibliografa.
Introduccin.
Fuente: http://depa.fquim.unam.mx/proteinas/
1.3.2.
Competencia.
1.3.3.
Materiales y reactivos.
1.3.3.1.
Materiales.
Instrumental.
Potencimetro
1.3.3.3.
Reactivos.
1.3.4.
Metodologa.
REACTIVO (mL)
Casena
5% en
acetato de sodio 1
0.1N
Agua destilada
8.4
CH3-COOH 0.01N
0.6
CH3-COOH 0.1N
CH3-COOH 1.0N
-
7.8
1.2
-
8.8
0.2
-
8.5
0.5
-
TUBO
5
8.0
1.0
-
7.0
2.0
-
5.0
4.0
-
1.0
8.0
-
7.4
1.6
el
pH
de
cada
tubo
mediante
el
uso
de
un
1.3.5.
Resultados a reportar.
1.3.6.
Mtodo de evaluacin.
1.3.7.
Bibliografa.
Introduccin.
1.4.2.
Competencia.
1.4.3.
Materiales y reactivos.
1.4.3.1.
Materiales.
Instrumental.
Planchas de calentamiento.
1.4.3.3.
Reactivos.
1.4.4.
Metodologa.
I) Ensayo enzimtico.
1) Preparar y correr una serie de tubos de acuerdo a lo establecido en
la siguiente tabla, mezclar perfectamente al aadir cada reactivo.
2) El tubo 1 ser el testigo negativo por lo que antes de aadir la
enzima, se adicionara 1 mL de cido 3,5-dinitrosaliclico como
inhibidor enzimtico.
1.4.5.
Resultados a reportar.
1.4.6.
Mtodo de evaluacin.
1.4.7.
Bibliografa.
Daniel, R.M., Danson, M.J., Eisenthal, R., Lee, C.K., Peterson, M.E., 2008.
The effect of temperature on enzyme activity: new insights and their
implications. Extremophiles 12 (1), 51-59.
Daniel, R.M., Peterson, M.E, Danson, M.J., Price, N.C., Kelly, S.M., Monk,
C.R., Weinberg, C.S., Oudshoorn, M.L., Lee,C.K., 2010. The molecular
basis of the effect of temperature on enzyme activity. Biochemical
Journal 425, 353360.
Instituto Politcnico Nacional, 2013. Manual de Laboratorio de
Bioqumica Mdica I. Escuela Superior de Medicina, Departamento de
Formacin Bsica Disciplinaria. Academia de Bioqumica Mdica I.
Cintica enzimtica. Mxico, pp. 30-31, 56.
Somero, G.N., 2004. Adaptation of enzymes to temperature: searching
for basic strategies. Comparative Biochemistry and Physiology, Part
B 139, 321333.
Introduccin.
1.5.2.
de la cintica de
Competencia.
1.5.3.
Materiales y reactivos.
1.5.3.1.
Materiales.
1.5.3.2.
Instrumental.
1.5.3.3.
Reactivos.
Urea 0.01 M, solucin de ureasa (2.5 mg/mL), CuCl2 2%, HCl 0.01M,
solucin de fenolftalena 1%.
1.5.4.
Metodologa.
Urea
0.01M
(ml)
0
5
10
12.5
15
17.5
20
22.5
24
Agua
(ml)
24
19
14
11.5
9
6.5
4
1.5
0
1.5.5.
Resultados a reportar.
Grfica de Michaelis-Menten.
Grfica de Lineweaver-Burk.
Valores de Km y Vmax de la enzima.
1.5.6.
Mtodo de evaluacin.
1.5.7.
Bibliografa.
1.6.
1.6.1.
Introduccin.
1.6.2.
Competencia.
1.6.3.
Materiales y reactivos.
1.6.3.1.
Materiales.
Instrumental.
Reactivos.
1.6.4.
Metodologa.
1.6.5.
Resultados a reportar.
1.6.6.
Mtodo de evaluacin.
1.6.7.
Bibliografa.
Dubois, M., Gilles, K. A., Hamilton, J. K., Rebers, P. A., Smith, F., 1956.
Colorimetric method for determination of sugars and related
substances. Analytical Chemistry 28(3), 350-356.
Fournier, E., 2001. Colorimetric quantification of carbohydrates.
Current Protocols in Food Analytical Chemistry E1.1.1-E1.1.3.
Kochert, G., 1978. Carbohydrate determination by the phenol-sulfuric
acid method. En: Hellebust. J.A., Craigie, J.S., (eds.), Handbook of
Phycological Methods. Physiological & Biochemical Methods.
Cambridge University Press, New York, pp. 95-97.
Masuoka, T., Minami, A., Iwasaki, N., Majima, T., Nishimura, S.I., Lee,
Y.C., 2005. Carbohydrate analysis by a phenol-sulfuric acid method in
microplate format. Analytical Biochemistry 339, 69-72.
1.7.
1.7.1.
Introduccin.
1.7.2.
Competencia.
1.7.3.
Materiales y reactivos.
1.7.3.1.
Materiales.
Instrumental.
Reactivos.
1.7.4.
Metodologa.
1.7.5.
Resultados a reportar.
1.7.6.
Mtodo de evaluacin.
1.7.7.
Bibliografa.
1.8.
1.8.1.
Introduccin.
Triacilglicrido
Fosfolpido
R1, R2, R3: cidos grasos; X: hidrgeno o radical (p.ej. etanolamina,
colina, serina, glicerol, mio-inositol)
Los lpidos pueden ser utilizados por los organismos animales como
una fuente de energa, a travs del metabolismo oxidativo de cidos
grasos, de igual forma pueden aportar cidos grasos esenciales. Por
presentar un estado de oxidacin ms reducido con relacin a
Dr. Eduardo Durazo Beltrn
1.8.2.
Competencia.
1.8.3.
Materiales y reactivos.
1.8.3.1.
Materiales.
Instrumental.
Reactivos.
1.8.4.
Metodologa.
1.8.5.
Resultados a reportar.
1.8.6.
Mtodo de evaluacin.
1.8.7.
Bibliografa.
1.9.
Determinacin de fosfoglicridos.
1.9.1.
Introduccin.
Fosfatidilcolina (PC)
Fosfatidiletanolamina (PE)
Fosfatidilserina (PS)
Fosfatidilinositol (PI)
Fosfatidilglicerol (PG)
Fosfatidildiglicerol (DPG)
Los fosfoglicridos ms abundantes en las membranas de las clulas
de animales y de plantas superiores son la fosfatidiletanolamina y la
fosfatidilcolina, mientras que el fosfatidilglicerol y el difosfatidilglicerol
son ms frecuentes en membranas bacterianas.
Un mtodo utilizado con frecuencia para el anlisis de fosfolpidos es la
cromatografa de capa fina, en la cual es posible separarlos mediante
la participacin de estos entre la fase estacionaria polar y la fase mvil
de baja polaridad del solvente. El tipo de sistema de solventes utilizado
determina el patrn de separacin de los lpidos bajo estudio.
1.9.2.
Competencia.
1.9.3.
Materiales y reactivos.
1.9.3.1.
Materiales.
Instrumental.
Reactivos.
1.9.4.
Metodologa.
Rf
1.9.5.
Resultados a reportar.
Valores de Rf
cromatografa.
1.9.6.
Mtodo de evaluacin.
1.9.7.
Bibliografa.
Fried, B., 2003. Lipids. En: Sherma, J. Fried, B. (eds.), Handbook of ThinLayer Chromatography. 3rd edition. Marcel Dekker, Inc., New York, pp.
826-875.
Holub, B., Skeaff, C.M., 1987. Nutritional regulation of cellular
phosphatidylinositol. En: Conn, P.M., Means, A.R. (eds.), Methods in
Enzymology, Volume 141. Academic Press, Orlando, pp. 234-244.
Mucio Hidalgo, C. A., Smano Njera, J.B., 2008. Manual de prcticas
de bioqumica metablica.
Universidad Autnoma del Estado de
Mxico, Facultad de Qumica. Prctica No 2: Separacin de fosfolpidos
por cromatografa en capa fina. Mxico, pp. 17-19.
Parker, F., Peterson, N. F., 1965. Quantitative analysis of phospholipids
and phospholipid fatty acids from silica gel thin-layer chromatograms.
Journal of Lipid Research 65, 455-460.
Peterson, B.L., Cummings, B.S., 2006. A review of chromatographic
methods for the assessment of phospholipids in biological samples.
Biomedical Chromatography 20, 227243.
Introduccin.
Estructura de la clorofila a y b
Los carotenoides, por su parte, pueden dividirse en dos grupos: (a)
Carotenoides sin oxgeno como los -carotenos; (b) Carotenoides que
contienen oxgeno, denominados xantofilas. Entre las xantofilas se
encuentran la violaxantina, anteraxantina, zeaxantina, entre otras.
Dr. Eduardo Durazo Beltrn
1.10.2.
Competencia.
1.10.3.
Materiales y reactivos.
1.10.3.1. Materiales.
Estuche de diseccin, esptula, mortero, pipetas graduadas de 5 y
10 mL, tubos de ensaye con tapn, pipetas Pasteur, placa de vidrio,
micropipetas, cuba cromatogrfica, regla.
1.10.3.2. Instrumental.
Balanza analtica, centrifuga, estufa de conveccin.
1.10.3.3. Reactivos.
Mezcla de cloroformo-metanol-cido clorhdrico (20:10:0.1 v/v), HCl
1N, cloroformo, silica gel, mezcla de cloroformo-metanol-cido
actico-H2O (50:37.5:3.5:2 v/v), cristales de yodo.
1.10.4.
Metodologa.
1.10.5.
Resultados a reportar.
1.10.6.
Mtodo de evaluacin.
1.10.7.
Bibliografa.
Dawes, C.J., 1991. Botnica Marina. Editorial Limusa, Mexico, D.F., pp.
421-429.
Dunn, J.L., Turnbull, J.D., Robinson, S.A., 2004. Comparison of solvent
regimes for the extraction of photosynthetic pigments from leaves of
higher plants. Functional Plant Biology 31, 195-202.
Hagerthey, S.E., Louda, J.W., Mongkronsri, P., 2006. Evaluation of
pigment extraction methods and a recommended protocol for
periphyton chlorophyll a determination and chemotaxonomic
assessment. Journal of Phycology 42, 1125-1136.
Schagerl, M., Knzl ,G., 2007. Chlorophyll a extraction from freshwater
algae a reevaluation. Biologia 62(3), 270-275.
Vicente, E., De Hoyos, C., Snchez, P., Cambra, J., 2005. Protocolos
para el muestreo y anlisis para fitoplancton. Ministerio de Medio
Ambiente, Confederacin Hidrogrfica del Ebro, Zaragoza, pp. 25-27.
Dr. Eduardo Durazo Beltrn
2. METABOLISMO
Pgina
53
Introduccin.
Pgina
54
2.1.2.
Pgina
55
Competencia.
2.1.3.
Materiales y reactivos.
2.1.3.1.
Materiales.
Instrumental.
Balanza analtica,
espectrofotmetro.
plancha
de
calentamiento,
centrifuga,
2.1.3.3.Reactivos.
Buffer de fosfatos 0.1M (pH 7.4), succinato de sodio 0.01M (en
buffer de fosfatos), malonato de sodio 0.01M (en buffer de
fosfatos), cianuro de potasio 0.01M, ferrocianuro de potasio
0.01M, cido tricloroactico 10%.
2.1.4.
Desarrollo
Pgina
56
Serie 1
Serie 2
Serie 3
3 mL
2 mL
1.9 mL
1 mL
1 mL
0.1 mL
1 mL
1 mL
1 mL
1 gota (0.06
1 gota (0.06
1 gota (0.06
Cianuro de potasio
mL)
mL)
mL)
6. Colocar los tubos en un bao de agua a 37 C por 5 minutos.
7. Aadir a cada tubo 1 mL de ferrocianuro de potasio 0.01 M y reposar
por 10 minutos.
8. Adicionar 5 mL de cido tricloroactico a cada tubo y mezclar en
forma homognea.
9. Centrifugar los tubos a 2000 rpm por 5 minutos y separar el
sobrenadante obtenido.
10. Leer la absorbencia de las soluciones a 420 nm. Ajustar la
absorbencia del aparato a cero con un blanco que contenga
nicamente solucin buffer.
11. Calculo del contenido de micromoles de ferrocianuro contenidas en
cada serie de reaccin:
M Ferrocianuro = A/E*L= A/(1x10-3 mol-1 cm-1)*1 cm
A: absorbencia; E: coeficiente de extincin molar del ferrocianuro; L:
longitud de la celda de lectura.
2.1.5.
Resultados a reportar.
2.1.6.
Pgina
57
Mtodo de Evaluacin
2.1.7.
Bibliografa
2.2.
2.2.1.
Introduccin
Lactato + NAD+
2.2.2.
Competencia.
2.2.3.
Materiales y reactivos.
2.2.3.1.Materiales.
Estuche de diseccin, esptula, homogeneizador manual, pipetas
graduadas de 5 y 1 mL, tubos de ensaye, micropipetas,
pipeteros,
gradilla,
tubos
de
centrifuga,
celdas
para
espectrofotmetro.
2.2.3.2.Instrumental.
Balanza analtica, centrifuga refrigerada, espectrofotmetro.
2.2.3.3.Reactivos.
Sacarosa 0.25M, buffer de fosfatos 0.1M (pH 7.4), NADH 3.5 mM,
piruvato de sodio 21 mM.
Dr. Eduardo Durazo Beltrn
2.2.4.
Desarrollo.
2.2.5.
Resultados a reportar.
2.2.6.
Mtodo de Evaluacin
2.2.7.
Bibliografa
Introduccin
2.3.2.
Competencia
2.3.3.
Material
2.3.3.1.
Materiales
Instrumental
Reactivos
2.3.4.
etanol
10%,
dimetil-para-
Desarrollo
I) Separacin de fracciones.
1) Disecar peces recin sacrificados y remover el hgado y el corazn.
2) Pesar los rganos extrados y mantenerlos en bao de hielo.
3) Picar finamente las muestras y preparar un homogeneizado por
tejido con 9 mL de KCl 0.15M frio por gramo de tejido.
4) Centrifugar el homogeneizado en frio, a 500 rpm por 15 minutos.
Dr. Eduardo Durazo Beltrn
Reactivos
-Naftol 0.15% en etanol 10%
Dimetil-para-fenilendiamina
0.15%
Agua destilada
Mezclar y calentar en bao de
KCN 0.01%
Sobrenadante o suspensin
del tejido
1
0.5
0.5
2
0.5
Tubo
3
0.5
4
0.5
0.5
5
0.5
0.5
1
1.5
1.5
0.5
2
agua a 37C por 10 minutos
0.5
1
1
1
1
Caractersticas de reaccin
Dr. Eduardo Durazo Beltrn
Color
Oxidacin de la dimetil-para-fenilendiamina e
interaccin con el -naftol para formar azul de
indofenol
Oxidacin de la dimetil-para-fenilendiamina,
ausencia de -naftol
Sustrato en forma reducida y presencia de naftol
Inhibicin de la reaccin de oxidacin
2.3.5.
esperado
Morado
Caf
Violeta
Lila
Resultados a reportar.
2.3.6.
Mtodo de Evaluacin
2.3.7.
Bibliografa
Pgina
68
Anexos
Normas Generales de Seguridad e Higiene
1. El uso de bata es obligatorio.
2. Antes de empezar el trabajo en el laboratorio tienes que familiarizarte con
los elementos de seguridad disponibles.
3. Es necesario localizar las salidas principales y de emergencia por si se
diese el caso de una evacuacin por fuego o por cualquier otro incidente,
as como conocer la localizacin exacta de extintores, duchas de
seguridad y duchas de ojos.
4. Es obligatorio usar gafas de seguridad siempre que se est en el
laboratorio.
5. No usar lentes de contacto en el laboratorio, ya que en caso de accidente
las salpicaduras de productos qumicos o sus vapores pueden pasar
detrs de las lentes y provocar lesiones en los ojos antes de poder retirar
las lentes. En estos casos es recomendable el uso de gafas graduadas o
de gafas de seguridad cerradas.
6. S un producto qumico te salpica los ojos, utiliza inmediatamente una
ducha de ojos y lava completamente el ojo afectado durante 15 minutos
sin interrupcin. Acta siempre con urgencia, en menos de 10 segundos.
No dirijas una corriente de alta presin de agua de un grifo directamente
al ojo porque podras lesionarlo. Informa al encargado del laboratorio de lo
que ha sucedido y si es necesario pide asistencia mdica.
7. 7. El uso de bata (preferentemente de algodn) es obligatorio, ya que por
mucho cuidado que se tenga al trabajar, las salpicaduras de productos
qumicos son inevitables.
8. 8. As mismo se recomienda llevar zapatos cerrados y no sandalias.
9. 9. No comer ni beber en el laboratorio, ya que hay la posibilidad de que
los alimentos o bebidas se hayan contaminado con productos qumicos.
10. Los recipientes del laboratorio nunca deben utilizarse para el consumo
y conservacin de alimentos y bebidas; tampoco las neveras u otras
instalaciones destinadas al empleo en los laboratorios.
11. Lavarse siempre las manos despus de hacer cualquier anlisis y antes
de salir del laboratorio.
12. Procure quitarse la bata hasta que salga del laboratorio.
13. Est prohibido fumar en el laboratorio por razones higinicas y de
seguridad.
Pgina
69
Pgina
70
Pgina
71
Dar la alarma.
Ponerse a salvo.
Ayudar a las personas.
Luchar contra el fuego.
Avisar al responsable del departamento.
Evacuacin del edificio en caso necesario.
Avisar a ambulancias, bomberos.
Fuego en el laboratorio
Evacuar el laboratorio, por pequeo que sea el fuego, por la salida principal o
por la salida de emergencia, s la principal est bloqueada.
Avisar a todos los compaeros de trabajo sin que se extienda el pnico y
conservando siempre la calma.
Fuego en el cuerpo
Pgina
72
Quemaduras
Cortes
Los productos qumicos que se hayan vertido sobre la piel han de ser
lavados inmediatamente con agua corriente abundantemente, como
mnimo durante 15 minutos.
Las duchas de seguridad instaladas en los laboratorios sern utilizadas en
aquellos casos en que la zona afectada del cuerpo sea grande y no sea
suficiente el lavado en una pila.
Es necesario sacar toda la ropa contaminada de la persona afectada lo
antes posible mientras est bajo la ducha.
Recuerda que la rapidez en el lavado es muy importante para reducir la
gravedad y la extensin de la herida.
Proporcionar asistencia mdica a la persona afectada.
Pgina
73