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A Bioqumica e a Qumica Orgnica Rui Fontes e Nuno Alada

A Bioqumica e a Qumica Orgnica


Sendo a Bioqumica um ramo interdisciplinar da cincia que utiliza princpios e mtodos da Qumica
na investigao da composio e das transformaes que ocorrem nos seres vivos, compreende-se que
algumas noes de Qumica Orgnica (estudo da composio qumica, das propriedades e reaces de
compostos que contm cadeias de carbono) sejam imprescindveis para o trabalho em Bioqumica. Com o
texto que a seguir se apresenta pretende-se rever algumas noes de Qumica Orgnica de importncia
fundamental para o estudo da Bioqumica.
ndice
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.

Os hidrocarbonetos alifticos saturados e insaturados (isomeria cis-trans) .............................................................. 1


Os hidrocarbonetos aromticos ................................................................................................................................. 3
Os lcoois e os teres. ............................................................................................................................................... 4
Os grupos que contm enxofre: os tiis, os sulfuretos e os dissulfuretos.................................................................. 5
Os aldedos e as cetonas............................................................................................................................................ 6
Os semiacetais e os acetais........................................................................................................................................ 7
Os cidos carboxlicos, os steres, as lactonas e os tiosteres................................................................................... 9
Os grupos fosfato, sulfato e as ligaes fosfoster, fosfodister e sulfoster .......................................................... 12
Os anidridos e os fosfoanidridos ............................................................................................................................. 14
Os grupos azotados: as aminas, as amidas, o grupo guanidina e os sais de amnio substitudo ............................. 14
Os heterociclos ........................................................................................................................................................ 18
A isomeria ptica (ou quiral) .................................................................................................................................. 19

1. Os hidrocarbonetos alifticos saturados e insaturados (isomeria cis-trans)


Os compostos orgnicos mais simples so os hidrocarbonetos: os hidrocarbonetos so constitudos
apenas por carbono e hidrognio.
O hidrocarboneto mais simples o metano (CH4; ver Fig. 1): a sua molcula contm um nico tomo
de carbono ligado a 4 tomos de hidrognio. O etano (CH3CH3), o propano (CH3CH2CH3), o butano
(CH3CH2CH2CH3), o pentano (CH3CH2CH2CH2CH3) e o hexano (CH3CH2CH2CH2CH2CH3) tambm so
hidrocarbonetos. Nestes casos, os compostos so constitudos por cadeias alifticas (no aromticas; ver
Captulo 2) saturadas (s ligaes simples) e tm o nome colectivo de alcanos. Os alcanos acima referidos
so todos no ramificados mas quando tm mais de 3 carbonos podem ser ramificados: um tomo de carbono
pode ligar-se a 3 (ou 4) tomos de carbono.

Fig. 1: Modelos tridimensionais e representaes do metano, de uma cadeia aliftica linear saturada com 14 carbonos e
de duas insaturadas tambm com 14 carbonos (em baixo). Uma destas um ismero trans ( esquerda) e outra cis (
direita).

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As cadeias alifticas saturadas podem ser cclicas como no caso do ciclopentano, cuja frmula
molecular C5H10; no ciclopentano cada tomo de carbono est ligado por ligaes simples a outros dois
H
H

carbonos e a dois hidrognios. (

C
H

H
C

H)

C
H

Quando, num hidrocarboneto, h uma ou mais ligaes duplas (ligando tomos de carbono) os
compostos em questo dizem-se alcenos: so exemplos o eteno (H2C CH2), o propeno (H2C CH CH3), o 1buteno (H2C CH CH2 CH3), o 1-penteno (H2C CH CH2 CH2 CH3) e o 1-hexeno (H2C CH CH2 CH2 CH2 CH3). (Nos
alcenos, os carbonos so numerados de forma a que os carbonos que contm duplas ligaes tenham o
nmero mais baixo possvel). Nestes casos as cadeias dizem-se insaturadas porque podem, aceitando tomos
de hidrognio (ou seja, sofrendo reduo), converter-se em alcanos.
Na Fig. 2 representam-se as frmulas estruturais do eteno e de dois ismeros1 do 2-buteno. De notar
que o 2-buteno pode ser descrito como um eteno em que dois dos hidrognios (um em cada carbono) foram
substitudos por grupos metilo (-CH3). Ao contrrio do que acontece nas ligaes simples, quando h
ligaes duplas deixa de haver rotao em torno das ligaes: assim os compostos 2-cis-buteno e 2-transbuteno so compostos distintos (so um par de ismeros cis-trans; ver Fig. 2). Na Fig. 2, o buteno da
esquerda diz-se cis porque ambos os substituintes do hidrognio (neste caso, os metilos) esto voltados para
o mesmo lado; o da direita diz-se trans porque os substituintes do hidrognio esto voltados para lados
opostos. Dois ismeros cis-trans diferem entre si nas posies dos tomos relativamente a um plano
especfico que contm os tomos considerados em posies rgidas. Para este tipo de isomeria devem existir,
pelo menos, dois tomos (ou grupos de tomos) iguais de cada lado da ligao dupla2 no caso dos
isobutenos em anlise existem dois pares iguais (um H e um CH3 de cada lado da ligao dupla).

H3C

CH3

CH3

H
H
H
H
H3C
H
Fig. 2: Modelos tridimensionais e frmulas estruturais do eteno, do 2-cis-buteno e do 2-trans-buteno. Na linha de baixo
e direita est representado o 2-trans-buteno numa maneira que muito comum em Qumica Orgnica e em
Bioqumica: foram omitidos os hidrognios e as suas ligaes; os carbonos esto representados como os extremos das
linhas que representam ligaes simples ou duplas.

Nos alcanos no ramificados cada tomo de carbono est ligado por ligaes simples a hidrognios e
(exceptuando o caso do metano) a, pelo menos, um tomo de carbono. Se considerarmos um qualquer tomo
de carbono como estando no centro de um tetraedro, os outros tomos a ele ligados ocupam os vrtices do
tetraedro: os ngulos entre as diferentes ligaes so, em todos os casos, de 109,5 (ver Fig. 1). Por isso
comum representar-se uma cadeia aliftica que s contm ligaes simples como uma linha quebrada como a
mostrada na Fig. 1. Quando h ligaes duplas, os trs tomos ligados ao carbono que contm a ligao
dupla esto no mesmo plano e os ngulos entre as 3 ligaes (a dupla e as duas simples) so de 120. Os
ismeros de tipo cis ( direita e em baixo na Fig. 1) so estruturalmente muito diferentes dos alcanos que tm
1

Ismeros so compostos que, tendo a mesma frmula molecular, no tm a mesma estrutura. Por exemplo, o n-butano
(cadeia aliftica linear saturada com 4 carbonos) um ismero (ismero de cadeia) do isobutano (ou 2-metilpropano;
propano com um grupo metilo no carbono 2). Em ambos os casos a frmula molecular C4H10.
2
Quando tal no ocorre pode usar-se outra nomenclatura (Z-E) que ignorada no presente texto.

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o mesmo nmero de carbonos; pelo contrrio, no caso dos ismeros trans ( esquerda e em baixo na Fig. 1) a
diferena estrutural relativamente aos hidrocarbonetos saturados correspondentes no to marcada.
Os grupos qumicos derivados dos alcanos por perda de um tomo de hidrognio chamam-se,
genericamente, grupos alquilo (-CnHn*2+1). O grupo metilo (-CH3) o grupo alquilo mais simples. O grupo
qumico derivado do eteno designa-se de vinilo ( CH CH2).
O isopreno um hidrocarboneto ramificado no saturado com cinco carbonos ( um butadieno
metilado no carbono 2; ver Fig. 3). Muitos compostos de origem animal e vegetal contm na sua constituio
polmeros do isopreno (terpenos) ou de unidades isopreno que foram reduzidas, no contendo, por isso,
duplas ligaes. So exemplos de compostos que contm unidades isopreno ou os seus derivados saturados
a vitamina A, os carotenides, a vitamina K, a vitamina E, a ubiquinona e os precursores do colesterol.
Unidades repetidas de isoprenos so tambm encontradas ligadas a muitas protenas membranares
(denominadas de protenas preniladas). A presena de polmeros do isopreno confere propriedades
hidrofbicas s substncias que os contm.
O
CH3
H2C

CH2

CH3

H2
C

H3C

CH3

CH3

CH3

H3CO
OH

C
C
H

CH3

CH2

H3CO
CH3

H
O

CH3
6-10

Fig. 3: Estruturas do isopreno (a unidade isoprenide que habitualmente aparece repetida) e de substncias que contm
polmeros de isopreno (terpenos): uma forma de vitamina A, o retinol e a ubiquinona.

2. Os hidrocarbonetos aromticos
O hidrocarboneto aromtico mais simples o benzeno (ver Fig. 4): tem 6 tomos de carbono e 3
duplas ligaes conjugadas (intervaladas de ligaes simples). Por razes que tm que ver com a forma de
partilha dos electres das ligaes duplas do benzeno (e doutras estruturas aromticas) costume
representar-se o benzeno como um hexgono que tem inscrita uma circunferncia (ver Fig. 4). O grupo
qumico correspondente ao benzeno o grupo fenilo. Na Fig. 4 mostram-se as estruturas de dois
aminocidos: direita, a da alanina e ao seu lado esquerdo a da fenilalanina. A fenilalanina pode ser
entendida como a alanina em que um dos hidrognios do carbono 3 foi substitudo por um grupo fenilo.

Fig. 4: Trs formas frequentes de representar o benzeno ( esquerda) e estruturas dos aminocidos fenilalanina e
alanina.

Um outro composto aromtico , por exemplo, o fenantreno (ver Fig. 5). Na Fig. 5, para alm da
estrutura do fenantreno, est tambm representada a estrutura do colesterol. As estruturas dos compostos
com relevncia biolgica so, muitas vezes, complexas e, por isso, frequente no se usarem as regras da
nomenclatura sistemtica nem na sua nomeao nem na numerao dos seus carbonos. O colesterol, por
exemplo, normalmente descrito como sendo constitudo por um ncleo de ciclopentanoperhidrofenantreno
contendo um grupo hidroxilo no carbono 3, uma ligao dupla no carbono 5 (quer dizer, entre o 5 e o 6), dois
grupos metilo (carbonos 18 e 19) ligados nos carbonos 13 e 10 e uma cadeia aliftica ramificada com 8
carbonos (grupo alquilo) ligada no carbono 17. A designao do ncleo ciclopentanoperhidrofenantreno
resulta do facto de este ncleo poder ser entendido como um ciclopentano ligado a um fenantreno saturado
(perhidrofenantreno). Para alm do colesterol, existem muitos outros compostos que esto presentes nos
seres vivos e que contm o ncleo ciclopentanoperhidrofenantreno. Tal como no caso do colesterol o ncleo
pode estar parcialmente insaturado e a denominao genrica destes compostos a de esterides. Quando os
esterides possuem pelo menos um grupo hidroxilo (como tambm acontece com o colesterol) denominamse esteris.

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21

18

HC
20

CH3

12
19

11

24

26

HC
25

23

CH3

17

27

16
14

9
10

15

7
5

HO

CH2

13

H3C
2

22

CH3

CH2

CH2

H3C

Fig. 5: Ao lado esquerdo est representado o fenantreno e, ao lado direito, a estrutura de uma substncia muito
importante em Bioqumica: o colesterol.

3. Os lcoois e os teres.
O colesterol (ver Fig. 5) um lcool porque tem um grupo hidroxilo (-OH) no carbono 3. Os lcoois
so compostos orgnicos com um ou mais grupos hidroxilo. Os lcoois mais simples so o metanol (um
carbono) e o etanol (dois carbonos; ver Fig. 6). Como norma, quando um lcool tem apenas um grupo
hidroxilo os carbonos so numerados de tal forma que o carbono ligado ao grupo hidroxilo tenha o nmero
mais baixo possvel. No caso do etanol, por exemplo, o carbono 1 o que est ligado ao hidroxilo e o
carbono 2 do grupo metilo.

H
H

H
O

H
O

H
H
H
H
H
Fig. 6: Modelos tridimensionais e frmulas estruturais do metanol, do etanol e do etilenoglicol.

H
O

O etilenoglicol (ou 1,2-etanodiol) o polilcool mais simples (ver Fig. 6). Um dos polilcoois com
maior importncia em Bioqumica o glicerol (1,2,3-propanotriol): contm 3 carbonos e 3 grupos hidroxilo
sendo que dois deles so primrios (os das extremidades) e o outro secundrio (ver Fig. 7). Outros
polilcoois com alguma importncia em Bioqumica so o inositol e o sorbitol (ver Fig. 7).

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Fig. 7: Frmulas estruturais do glicerol, do inositol e do sorbitol. O glicerol um polilcool com 3 grupos hidroxilo. Os
grupos hidroxilo das extremidades dizem-se primrios porque o carbono a que esto ligados contm apenas uma ligao
C-C. O grupo hidroxilo do carbono 2 diz-se secundrio porque o carbono a que est ligado contm duas ligaes C-C.
A estrutura do inositol pode ser descrita como um ciclo-hexano em que cada um dos 6 carbonos est ligado a um grupo
hidroxilo (todos secundrios). O sorbitol tambm um polilcool com 6 carbonos mas a sua estrutura linear: 2 dos
grupos hidroxilo so primrios e 4 so secundrios.

Quando duas molculas de um lcool reagem entre si com libertao de uma molcula de gua formase um ter (ver Fig. 8). Um ter pode ser descrito como contendo a estrutura R-O-R, sendo R e R grupos
alquilo (ou fenilo). Os epxidos so teres intramoleculares: ou seja, o tomo de oxignio um dos tomos
de um anel em que os restantes tomos so carbonos; eventualmente, pode haver mais que uma ligao
epxido no mesmo anel e nestes casos haver mais de um tomo de oxignio no anel. Um exemplo o 2,3epoxiesqualeno, um composto que se forma durante a sntese endgena do colesterol (ver Fig. 8).

H2O

H
H2O

Fig. 8: Reaco de desidratao do etanol com formao do ter dietlico ( esquerda) e frmula estrutural do 2,3epoxiesqualeno ( direita). O 2,3-epoxiesqualeno contm um grupo epxido (ter intramolecular) e forma-se durante a
sntese do colesterol.

4. Os grupos que contm enxofre: os tiis, os sulfuretos e os dissulfuretos


Algumas substncias importantes em biologia tm grupos tiol (-SH) que podem ser entendidos como
grupos hidroxilo em que o oxignio foi substitudo por enxofre (da a denominao tio tiol ou tioalcool).
Dois exemplos so a coenzima A (CoA) e o aminocido cistena (ver Fig. 9). Frequentemente, para pr em
evidncia a existncia de um grupo tiol na molcula da coenzima A, escreve-se: CoASH.
Quando o hidrognio de um grupo tiol est substitudo por um grupo alquilo estamos em presena de
um sulfureto orgnico: o caso do aminocido (ou cido aminado) metionina que contm um metilo ligado
por uma ligao sulfureto (R-S-R) restante molcula (ver Fig. 9).
Duas molculas de cistena podem reagir entre si formando uma de cistina (ver Fig. 9): o processo
envolve uma oxidao formando-se uma ligao dissulfureto (R-S-S-R). Nalgumas protenas existem
ligaes dissulfureto dentro da mesma cadeia aminoacdica ou ligando cadeias aminoacdicas distintas: estas
ligaes dissulfureto resultam da oxidao (e ligao) catalisada enzimicamente de dois resduos de cistena
e ocorre aps a traduo. O mesmo acontece no caso do glutatio, um peptdeo que contm um resduo de
cistena.

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NH2

N
N
COO
CH2

O
O

COO

O
H

H3N
COO

H
+

H3N

H
O

OH
P

O
O
H2C
H3C

H3N

CH3

CH2
CH2

CH2

CH2

SH

S
S
CH2
H

CH3

NH3

COO

SH

C
O

HO

Fig. 9: Por ordem esto representadas a coenzima A e os aminocidos cistena, metionina e cistina. Os dois primeiros
contm grupos tiol. O aminocido metionina contm um grupo sulfureto em que um tomo de enxofre serve de ponte
entre um grupo metilo e a restante molcula. A cistina formada pela ligao e oxidao (perda de dois electres e dois
protes, ou seja, perda de H2) simultnea de duas cistenas e contm um grupo dissulfureto.

5. Os aldedos e as cetonas
Quando um grupo hidroxilo primrio oxidado (ver Fig. 10) perdendo dois electres (e dois protes,
H

ou seja, dois tomos de hidrognio) d origem a um grupo aldedo (-CHO ou

). No caso de ser um

C
O

grupo hidroxilo secundrio forma-se uma cetona (

O ).

Um dos aldedos mais simples3 o etanal

(tambm chamado de acetaldedo ou aldedo actico; CH3CHO), um composto que se forma no organismo
durante a oxidao do etanol da dieta (ver Fig. 10). A cetona mais simples a acetona (CH3COCH3; ver Fig.
10). Os grupos aldedo e cetnicos so colectivamente designados de grupos carbonilo.

H
O

H
NAD

NADH + H

O
C

Fig. 10: A oxidao do etanol pelo NAD (que o oxidante) leva formao do etanal (ou acetaldedo) que contm um
grupo aldedo (lado esquerdo). A acetona (lado direito) contm um grupo cetnico.

Os monossacardeos (tambm designados de oses) so, frequentemente, definidos como derivados


aldedicos ou cetnicos de polilcoois. Na Fig. 11 mostra-se a estrutura de diferentes oses. O gliceraldedo
(uma triose), a eritrose (uma tetrose), a ribose (uma pentose) e a glicose (uma hexose) so aldoses porque
contm um grupo aldedo; a di-hidroxiacetona (triose) e a frutose (hexose) so cetoses porque contm um
grupo cetnico. No caso das aldoses o carbono 1 o que contm o grupo aldedo. No caso das cetoses
naturais o grupo cetona est sempre no carbono 2.
A di-hidroxiacetona e o gliceraldedo tm a mesma frmula molecular (C3H6O3) mas as suas estruturas
moleculares so diferentes so ismeros (ver Fig. 11). No ser por isso de estranhar que, baseando-se a
interaco das molculas nos seres vivos (nomeadamente a ligao especfica a enzimas ou a receptores de
membrana) na complementaridade estrutural, a di-hidroxiacetona e o gliceraldedo sejam reconhecidos como
substncias diferentes pelos seres vivos. Neste caso, porque a diferena se deve diferente posio que um
grupo carbonilo e um grupo hidroxilo ocupam na estrutura molecular, o gliceraldedo e a di-hidroxiacetona

O aldedo mais simples o metanal (CH2O) tambm designado de formol (ou formaldedo), um conservante usado
para preservar cadveres ou material biolgico obtido por biopsia em estudos de Anatomia, Histologia e
Anatomopatologia.

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dizem-se ismeros de posio. Tambm so exemplos de ismeros de posio a glicose e a frutose (ver Fig.
11).
H
H
O

H
C
C

OH

OH

OH

C
H

H
H

OH

OH

OH

OH

OH

OH

HO

OH

OH

OH

OH

OH

H
OH

H
H

OH

HO

OH

OH

OH

Fig. 11: Estrutura de diferentes monossacardeos (ou oses). Por ordem esto representados o gliceraldedo, a dihidroxiacetona, a eritrose, a ribose, a glicose e a frutose. A di-hidroxiacetona e a frutose so cetoses enquanto as
restantes so aldoses. O gliceraldedo e a di-hidroxiacetona assim como a glicose e a frutose so ismeros de posio.

6. Os semiacetais e os acetais
Os monossacardeos (ou oses) com nmero de carbonos superior a 4 so mais estveis quando formam
estruturas cclicas que nas formas lineares representadas na Fig. 11. O processo de ciclizao envolve um
rearranjo molecular em que o grupo carbonilo reage com um grupo hidroxilo formando-se uma ligao
semiacetal (ver Fig. 12). Um semiacetal facilmente identificado tendo em conta que temos um carbono
com um grupo hidroxilo ligado a outro carbono atravs de um tomo de oxignio (ver Fig. 12 e Fig. 13).
H
H

O
R

HO

R1

R1

H
H

Fig. 12: Representao esquemtica da formao de uma ligao semiacetal. Os oxignios e o hidrognio envolvidos no
processo esto representados a cores para se perceberem melhor as modificaes estruturais ocorridas durante o
processo. R e R1 representam o resto da molcula.

Na Fig. 13 mostra-se como pode ser compreendido o processo de ciclizao da glicose. O carbono 1
da glicose, que na forma linear contm o grupo aldedo, na forma cclica contm um grupo hidroxilo ligado
atravs de um tomo de oxignio a um outro tomo de carbono (mais frequentemente o carbono 5). O
carbono que constitui o grupo carbonilo nas formas lineares das oses (o 1, no caso das aldoses, ou o 2, no
caso das cetoses) passa a designar-se de carbono anomrico quando falamos das estruturas cclicas (o
carbono ligado a dois tomos de oxignio no semiacetal).
H

O
C

OH
C

OH

1
6

HO

OH

HO

OH

OH

OH
H

OH
HO

OH
3

H
2

OH

H
CH2OH

H
4

OH

CH2OH
6

Fig. 13: A glicose na sua representao linear de acordo com a conveno de Fischer ( esquerda; ver Captulo 12). A
mesma glicose representada na forma cclica de acordo com a conveno de Fischer modificada (no centro) e na forma
como habitualmente representada nos livros de texto de Bioqumica (conveno de Haworth; direita). A formao
da forma cclica envolve a formao de um semiacetal. O carbono que, na forma linear, constitui o grupo carbonilo
chama-se, na forma cclica, carbono anomrico.

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Os acetais podem ser compreendidos como resultando da reaco entre um semiacetal e um lcool
com perda de gua4 (ver Fig. 14; podemos entender os acetais como estruturas do tipo R1-O-CHR2-O-R3).
H

H
C
H
R1

C
H

H
O

R3

OH

H
H

OH

R1

H
O

C
O

R3

H2O

R2

H
R2
Fig. 14: Uma ligao acetal pode ser entendida (ver nota de rodap n 4) como resultando da ligao entre um grupo
semiacetal e um grupo hidroxilo com perda de H2O.

Os dissacardeos (como a maltose; ver Fig. 15) so formados por dois resduos5 de oses (no caso da
maltose por dois resduos de glicose). No caso dos dissacardeos, o tomo de carbono ligado a dois tomos
de oxignio o carbono anomrico da ose que contribuiu para a ligao acetal com o grupo semiacetal. No
contexto do estudo dos glicdeos, a ligao acetal tambm se designa de glicosdica de tipo O. Nas ligaes
glicosdicas de tipo O existe um tomo de oxignio a ligar o carbono anomrico de uma ose com um outro
resduo; no caso da maltose este outro resduo tambm um resduo de glicose (ver Fig. 15). Como
estudaremos frente, as ligaes glicosdicas de tipo O, envolvendo sempre o carbono anomrico de uma
ose, podem ligar esta ose a um grupo fosfato (ver Captulo 8). As ligaes glicosdicas tambm podem ser de
tipo N e o seu estudo ser feito no Captulo 10. As relaes entre as ligaes glicosdicas e a isomeria ptica
dos glicdeos sero sumariamente abordadas no Captulo 12.
As ligaes glicosdicas podem sofrer hidrlise (rotura por reaco com a gua) libertando como
produtos a ose que contribua com o semiacetal para a ligao e a outra substncia a ela ligada. No caso da
hidrlise da maltose geram-se, como produtos, glicose + glicose (a reaco inversa da indicada na Fig. 15).
OH

OH
O H

O H

H
H

H
OH

H
OH

HO
H

OH

OH

OH

H2O

OH
O H

OH
HO

OH
O H

OH

OH

HO

OH

OH

OH

Fig. 15: Representao esquemtica (no real; ver nota de rodap n 4) da formao da maltose. Quando um
monossacardeo se liga a outro envolvendo na ligao o carbono anomrico do primeiro, os dois resduos ficam, no
dissacardeo resultante, ligados por uma ligao acetal. Esta ligao , em Bioqumica, designada como ligao
glicosdica de tipo O.

De facto, a reaco de formao de acetais com perda de gua , termodinamicamente, muito desfavorecida e o que
termodinamicamente possvel nas condies habituais nos seres vivos a reaco inversa: a hidrlise do grupo acetal.
Uma situao semelhante acontece nos casos das ligaes ster, tioster, anidrido, amina e amida que sero tratadas
noutros Captulos deste texto.
5
Quando se fala de polmeros as partes constituintes dizem-se resduos. Por exemplo, a maltose constituda por dois
resduos de glicose, uma protena constituda por resduos de aminocidos, etc.

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7. Os cidos carboxlicos, os steres, as lactonas e os tiosteres


O

A oxidao de grupos aldedo origina grupos carboxilo (-COOH ou

). As substncias com
OH

grupos carboxilo so cidos fracos e a libertao do proto origina a base (ou sal6) correspondente. O cido
carboxlico mais simples o cido frmico (HCOOH). Outros cidos monocarboxlicos (s com um grupo
carboxlico) com relevncia biolgica e que contm cadeias alifticas saturadas lineares so o actico
(CH3COOH), o propinico (CH3CH2COOH), o butrico (CH3CH2CH2COOH), o mirstico
(CH3(CH2)12COOH), o palmtico (CH3(CH2)14COOH) e o esterico (CH3(CH2)16COOH). As formas
ionizadas (as bases ou sais respectivos) designam-se, respectivamente, como formato, acetato, propionato,
butirato, miristato, palmitato e estearato.
Em Bioqumica, usam-se frequentemente as expresses que designam as formas salinas para incluir
colectivamente as formas cidas no ionizadas e as formas ionizadas (as formas com o proto desligado).
Assim, tambm comum usar a expresso grupo carboxilato (-COO- ou

) quer para designar o grupo

carboxlico ionizado quer as duas formas (ionizada e no ionizada) no seu conjunto. Este facto no de
estranhar j que, tendo em conta o pKa dos cidos carboxlicos (cerca de 3 a 5) e o pH das clulas e do meio
extracelular (prximo de 7), a maioria das molculas dos cidos carboxlicos encontra-se, no meio interno,
desligada do proto7. No entanto, tambm no infrequente usar, por exemplo, a expresso cidos gordos
para incluir colectivamente os cidos gordos e os respectivos sais. S o contexto poder indicar-nos se a
expresso palmitato se refere ao conjunto cido palmtico+palmitato (a esmagadora maioria das vezes) ou
ao sal dissociado do proto (quando se discutem reaces cido-base). Tambm s o contexto nos permitir
distinguir se, por exemplo, as expresses grupo carboxlico e cido palmtico se referem ao conjunto das
formas dissociadas e no dissociadas ou s formas cidas no dissociadas do proto. Ao contrrio do que
acontece na maioria das reaces que ocorrem nos seres vivos as reaces de protlise e de ligao a protes
(reaces cido-base) no so catalisadas enzimicamente mas so muito rpidas e as formas cidas e bsicas
encontram-se em equilbrio dinmico.
Com a excepo do cido frmico, todos os cidos (e respectivos sais) referidos no primeiro pargrafo
deste Captulo podem ser entendidos como uma cadeia aliftica no ramificada ligada a um grupo
carboxlico por uma ligao C-C simples (ver Fig. 16). Os cidos gordos tm uma enorme importncia em
biologia e so assim designados porque a cadeia aliftica hidrofbica. O grupo carboxlico (ou carboxilato)
, pelo contrrio, hidroflico o que confere propriedades anfipticas8 a estes cidos. Quando a cadeia aliftica
muito curta (como no cido actico e no propinico) o adjectivo gordo poder ser considerado, em
termos estritos, inadequado mas no infrequente incluir estes cidos no conjunto dos cidos gordos.
O

2
1

4
3

6
5

8
7

10
9

14

12

16

11

13

15

5 4

3 2

CH3

O
Fig. 16: A estrutura do palmitato mostrando o grupo carboxilato ligado a uma cadeia aliftica linear saturada com 15
carbonos. Mais frequentemente os carbonos so numerados de tal maneira que o carbono do grupo carboxlico o 1.
Uma forma tambm frequente designar por (alfa) o carbono da cadeia aliftica que se liga directamente ao carbono
do grupo carboxlico, por (beta) o seguinte e por (mega) o ltimo. No contexto do estudo dos cidos gordos
insaturados frequente nomearem-se os carbonos por ordem inversa: neste caso o ltimo carbono ser o 1 e os
seguintes, 2, 3, etc. Nos cidos gordos 3 a ltima dupla ligao entre os carbonos 3 e 4; nos 6 a ltima dupla
ligao entre os carbonos 6 e 7.
6

Embora a libertao do proto dos cidos carboxlicos origine bases, a sua afinidade para os protes pode, em muitos
contextos, no ter relevncia sendo, por isso, frequentemente, designados de sais. frequente dizer-se que o palmitato
, por exemplo, o sal resultante da protlise do cido palmtico: CH3(CH2)14COOH CH3(CH2)14COO- + H+. Os sais
dos cidos gordos designam-se de sabes: o palmitato um sabo.
7
Quando um determinado cido AH que tem um pKa de valor X est num meio aquoso em que o pH X significa que
metade das molculas do cido esto ionizadas (forma salina; A-) e metade esto no ionizadas (forma cida; AH):
quando o pH do meio coincide com o pKa de um cido este encontra-se hemidissociado. Quando o pH<pKa, a maioria
das molculas encontra-se na forma no ionizada (AH). Se, como acontece aos cidos carboxlicos no meio interno,
pH>pKa, a maioria das molculas encontra-se na forma ionizada (A-).
8
Dizem-se anfipticas as substncias que contm, simultaneamente, regies hidroflicas e regies hidrofbicas na sua
estrutura molecular.

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A Bioqumica e a Qumica Orgnica Rui Fontes e Nuno Alada

Para alm dos cidos referidos acima tambm so cidos gordos com enorme importncia biolgica os
cidos gordos que contm duplas ligaes na cadeia aliftica. Na Fig. 17 mostra-se a estrutura de trs cidos
gordos insaturados naturais. Na esmagadora maioria dos cidos gordos insaturados naturais os ismeros so
de tipo cis de tal forma que a cadeia aliftica tem uma estrutura muito diferente da dos cidos gordos
saturados (ver Fig. 17 e Fig. 1). Porque existe um maior nmero de ligaes intermoleculares
(frequentemente designadas, em Bioqumica, de hidrofbicas) entre as diferentes molculas de um cido
gordo saturado (devido a um empacotamento mais extenso) que as ligaes entre as estruturas mais
desordenadas dos cidos gordos insaturados naturais, os cidos insaturados tm pontos de fuso mais baixos
que os saturados com igual nmero de carbonos. Por exemplo, enquanto o cido esterico (18:0) um slido
temperatura ambiente, o oleico (18:1;9) um lquido quando acima dos 7 C.

Fig. 17: O oleato, o linoleato e o -linolenato (de cima para baixo na figura) so os sais dos cidos oleico, linoleico e linolnico. Todos tm 18 carbonos mas ao contrrio do cido esterico (18:0) que saturado, estes tm duplas ligaes
(so insaturados). O cido oleico (18:1;9) tem uma dupla ligao no carbono 9 (ou, tambm se pode dizer, no 9). O
cido linoleico (18:2;9,12) tem duas ligaes duplas, uma no carbono 9 e outra no 12 (ou nos carbonos 9 e 6). O
cido -linolnico (18:3:9,12,15) tem trs duplas ligaes, nos carbonos 9, 12 e 15 (ou nos carbonos 9, 6 e 3).

Muitas substncias com enorme importncia biolgica contm grupos carboxlicos. Na Fig. 18 esto
representados alguns destes compostos (ou, mais propriamente, os respectivos sais). Dois deles j foram
referidos acima: o acetato (2:0) e o propionato (3:0). O lactato e o piruvato so produtos da gliclise. O
acetoacetato uma substncia que se forma no fgado durante o jejum. O succinato, o fumarato, o malato, o
oxalacetato, o -ceto-glutarato (ou -oxo-glutarato uma vez que, por vezes, em vez de ceto usa-se o termo
oxo), o citrato e o isocitrato so intermedirios do ciclo de Krebs e o glutamato um aminocido que faz
parte das protenas e um metabolito em variadas vias metablicas. De facto, como ser discutido no
Captulo 10, todos os aminocidos contm, pelo menos, um grupo carboxlico.
COO

COO

H
CH3

COO

HO

COO
C

COO

COO

CH2

OH

C
CH3

COO

CH3

COO

CH2

C
H

CH2
COO
COO
C

CH2
COO

COO
C

COO

COO

COO

COO

CH2
COO

CH2
-

CH2
HO

CH2

COO

CH3

CH2

CH2
-

HO

COO
H3N

COO

CH2

CH2

COO

CH2OH

CH3

COO

COO

HO

COO

Fig. 18: Estrutura de sais de cidos carboxlicos com grande importncia biolgica. Na linha de cima representam-se
sais de cidos monocarboxlicos. Por ordem: acetato, propionato, lactato, piruvato, glicerato e acetoacetato. Na linha do
meio esto quatro sais de cidos dicarboxlicos: succinato, fumarato, malato e oxalacetato. Na linha de baixo mais dois
sais de cidos dicarboxlicos (-ceto-glutarato e glutamato) e dois sais de cidos tricarboxlicos (citrato e isocitrato). De
notar que o citrato e isocitrato so ismeros de posio.

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Os steres podem ser entendidos como resultando da reaco entre um lcool e um cido com perda de
gua. Na Fig. 19 est representado o ster do cido palmtico com o colesterol (um colesterdeo) e na Fig. 20
o glicerol esterificado com trs estearatos (o triestearil-glicerol, que um triacilglicerol ou, tambm se pode
dizer, um triglicerdeo). Quando a formao de uma ligao pode ser entendida como resultando da reaco
de um tiol com um cido diz-se que estamos em presena de um tioster: na Fig. 21 est representada uma
substncia que contm coenzima A e acetato ligados por uma ligao tioster: a acetil-coenzima A (acetilCoA).
Ao contrrio dos grupos carboxilo que tm a capacidade de libertar protes (so cidos) os grupos
ster e tioster so aprtidos, ou seja, no funcionam nem como cidos nem como bases.
H3C
CH3

CH3

CH3

O
H3C

H3C
HO

OH

H3C
CH3

H2O
CH3
O
H3C

CH3
H3C

Fig. 19: Representao esquemtica (no real; ver nota de rodap n 4) da formao do palmitil-colesterol, um ster de
colesterol (ou colesterdeo).

Fig. 20: Representao esquemtica (no real; ver nota de rodap n 4) da formao do triestearil-glicerol, um trister de
glicerol com 3 estearatos. Os tristeres de glicerol designam-se, genericamente, de triacilgliceris (ou triglicerdeos).

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NH2
N
O
O

O
O

HO
SH

H3C
CH3 H

OH

H
H

HO
N

H
H

O
CH3

O
O

HO

OH

O
-

NH2

H3C

S
CH3 H

O
C

O
CH3

H2O

Fig. 21: Representao esquemtica (no real; ver nota de rodap n 4) da formao do acetil-coenzima A, um tioster
de acetato e coenzima A.

Os resduos correspondentes aos cidos carboxlicos nos steres e tiosteres chamam-se,


genericamente, acilos. Um acil-colesterol e um acil-CoA so, respectivamente, steres de colesterol e CoA
em que no se especifica a natureza do cido ligado ao lcool ou ao tiol. Uma situao semelhante acontece
no caso dos triacilgliceris (tambm chamados de triglicerdeos). Quando se quer especificar o cido
envolvido substitui-se a terminao -ico do cido (ou -ato do sal correspondente) por -il. Assim, por
exemplo, diz-se acetil-CoA, propionil-CoA, 1-butiril-2-linolel-3-palmitil-glicerol (um triacilglicerol em que
os resduos acilo derivam do butirato, do linoleato e do palmitato).
A hidrlise das ligaes ster (reaces inversas s representadas na Fig. 19 e na Fig. 20) gera como
produtos os cidos e os lcoois; no caso das ligaes tioster os produtos so cidos e tiis (reaco inversa
representada na Fig. 21).
Os grupos hidroxilo e os grupos carboxilo tm natureza polar e conferem molcula algum grau de
hidrossolubilidade, mas quando se formam as ligaes steres esta natureza polar desaparece na quase
totalidade: por isso os triacilgliceris e os steres de colesterol so muitssimo mais hidrofbicos que os
cidos e os lcoois de onde derivam.
Na Fig. 22 est representado, esquerda, um cido carboxlico que deriva da glicose por oxidao do
grupo aldedo: o cido glicnico. As lactonas so steres intramoleculares, resultando (pelo menos
teoricamente) da reaco entre um grupo carboxlico e um grupo hidroxlico da mesma molcula. Na mesma
Fig. 22 est representada, direita, a gliconolactona.
O

HO
C
H

OH

HO

OH

OH

CH2OH

H2C

OH
O

H
H
H2O

OH

OH

HO

Fig. 22: Representao esquemtica (no real; ver nota de rodap n 4) da formao da gliconolactona, um ster interno
derivado do cido glicnico.

8. Os grupos fosfato, sulfato e as ligaes fosfoster, fosfodister e sulfoster


O cido sulfrico (H2SO4) forma-se no metabolismo dos mamferos mas sendo um cido forte, existe,
no meio interno, na sua forma totalmente dissociada (salina), ou seja, na forma de sulfato (SO42-). Uma
situao com algumas semelhanas acontece no caso do cido fosfrico (H3PO4) mas, neste caso, as formas
predominantes no meio interno so as formas mono- e di-dissociadas (H2PO4- e HPO42-; o di- e o monohidrogenofosfato, respectivamente) que se designam, colectivamente, por fosfato inorgnico (Pi).
Nos sistemas biolgicos, existem muitos compostos orgnicos que esto ligados atravs dos seus
grupos hidroxilo a grupos fosfato ou sulfato e essas ligaes so de tipo ster. Porque o cido envolvido na
ligao o fosfrico ou o sulfrico, as ligaes designam-se de fosfoster ou de sulfoster, respectivamente.
Na Fig. 23 esto representadas a glicose-6-fosfato (linha de cima) e a glicose-3-sulfato (linha de baixo) que

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contm, respectivamente, ligaes fosfoster e sulfoster tpicas. Na linha do meio da mesma Fig. 23 est
representada a glicose-1-fosfato que, de acordo com a nomenclatura, contm uma ligao fosfoster; neste
caso o grupo semiacetal da glicose que est ligado ao cido fosfrico e esta ligao, em Bioqumica, diz-se
glicosdica de tipo O.
Na coenzima A (ver Fig. 9), um resduo de ribose liga-se por ligaes fosfoster a dois resduos de
fosfato: um est ligado no carbono 3 e outro no carbono 5 da ribose. A ligao de um outro fosfato ao grupo
hidroxilo do cido pantotnico (constituinte da coenzima A) tambm de tipo fosfoster (ver Fig. 9).
O
O
HO
OH

HO
OH

H2O

OH

OH

O
HO

OH

OH

OH
O

OH

O OH

HO

HO

O O

H
H

OH

OH
H

HO
H

O
HO

H2O

H
H2O

OH

OH

OH

HO

OH

OH

O OH

H
OH

P
OH

HO

OH

OH
H

OH

O OH

H
OH

OH

OH
O OH

P
O

HO

HO
O S OH H
O
H

O OH

OH

Fig. 23: Representao esquemtica (no real; ver nota de rodap n 4) da formao da glicose-6-fosfato (linha de
cima), da glicose-1-fosfato (linha do meio) e da glicose-3-sulfato (linha de baixo). Os cidos fosfrico e sulfrico
tambm se podem ligar a grupos hidroxilo formando ligaes ster que, nestes casos, se designam de fosfoster ou
sulfoster, respectivamente. No caso da glicose-1-fosfato est envolvido o grupo semiacetal da glicose (o carbono
anomrico) e a ligao glicosdica de tipo O. Ao contrrio do que est representado nesta figura, nos livros de
Bioqumica representam-se as formas ionizadas do cido fosfrico e do cido sulfrico quer quando esto isolados quer
quando esterificados.

Em alguns casos, como nos cidos nucleicos e nos fosfolipdeos, o cido fosfrico serve como ponte
entre dois resduos que continham grupos hidroxilo e a ligao sempre de tipo fosfoster (ver Fig. 24).
Nestes casos costume dizer-se que existe uma ligao fosfodister.
+

NH2
O
O

NH3
HOH2C

COO

O
N

O
NH2

O
O

OH

O
H

O
N

O
O

H3C

O O

OH
H3C

H2C

O
-

NH3

CH2

COO

Fig. 24: Nos cidos nucleicos ( esquerda) cada grupo fosfato est ligado, simultaneamente, a dois resduos de ribose
por duas ligaes ster e, por isso, costume designar-se esta ligao como fosfodister. Nos glicerofosfolipdeos
(lipdeos contendo resduos de glicerol, de fosfato e de cidos gordos) acontece uma situao semelhante; por exemplo,
na fosfatidilserina ( direita e em baixo) o fosfato liga-se aos resduos de glicerol e de serina ( direita e em cima) por
ligaes fosfoster.

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9. Os anidridos e os fosfoanidridos
As ligaes que podem ser entendidas como resultando da reaco entre dois cidos (ou sais) com
perda de gua designam-se de ligaes anidrido. Na Fig. 25 so apresentados vrios exemplos: a ligao
entre o fosfato e o carbono 1 do 3-fosfoglicerato no 1,3-bisfosfoglicerato, a ligao entre os resduos de
fosfato no ATP (adenosino-trifosfato) e a ligao entre o resduo de sulfato e um dos fosfatos do PAPS (3fosfo-adenosil-5-fosfossulfato). Na coenzima A (ver Fig. 9) a ligao entre os dois fosfatos tambm ,
obviamente, de tipo anidrido. Quando esto envolvidos dois resduos de fosfato (casos do ATP e da
coenzima A) a ligao diz-se fosfoanidrido.

Fig. 25: O 1,3-bisfosfoglicerato ( esquerda, em baixo) pode ser entendido como formado pela reaco entre o 3fosfoglicerato (em cima esquerda, com uma ligao fosfoster no carbono 3) e o fosfato com perda de gua. Na
ligao intervm um cido carboxlico e o cido fosfrico e, por isso, o anidrido misto. No ATP (em cima, direita)
as ligaes entre os vrios resduos de fosfato so de tipo fosfoanidrido ao contrrio da ligao entre o primeiro fosfato
e a ribose que de tipo ster (entre um cido, no caso o fosfato, e um lcool, o hidroxilo da ribose). Tambm a ligao
entre os dois resduos de fosfato no pirofosfato (PPi) de tipo fosfoanidrido. No 3-fosfo-adenosil-5-fosfossulfato (
direita, em baixo) a ligao entre o resduo de sulfato e o de fosfato ligado no carbono 5 da ribose de tipo anidrido. As
ligaes anidrido so, termodinamicamente, instveis e, na presena de hidrlases adequadas sofrem hidrlise.

10. Os grupos azotados: as aminas, as amidas, o grupo guanidina e os sais de amnio


substitudo
O amonaco (NH3) uma base que, aceitando um proto, origina o io amnio (NH4+). Porque o pKa
do amnio (cerca de 9,3) muito superior aos pHs que podem ser observados nas clulas e no lquido
extracelular a maior parte das molculas est, nos seres vivos, na forma protonada (ou seja, na forma NH4+).
Pode dizer-se que as aminas resultam da substituio de um ou mais hidrognios do amonaco por
cadeias carbonadas; dependendo do nmero de tomos de hidrognio substitudos dizem-se aminas
primrias, secundrias ou tercirias.
Algumas molculas com relevncia biolgica contm grupos amina (-NH2) que, tal como no caso do
amonaco esto no meio interno maioritariamente na forma protonada (-NH3+). Na Fig. 26 esto
representadas trs substncias que contm grupos amina no carbono 2: a glicosamina, o glutamato e a
glutamina. Nesta Fig., ao contrrio do que costume, quer os grupos amina quer os grupos carboxlicos esto
representados na forma no ionizada. Na Fig. 27 estes mesmos grupos qumicos esto representados na
forma como so normalmente representados nos livros de texto de Bioqumica, ou seja nas suas formas
ionizadas (grupos carboxlicos sem o proto e grupos amina protonados). Os aminocidos que fazem parte
das protenas tm todos um grupo amina no carbono 2 (ou da a denominao -aminocido) e um grupo
carboxlico que contm o carbono 1 (ver Fig. 27). A lisina, para alm deste grupo amina, contm outro grupo
amina no carbono 6 (ver Fig. 27). Quando o tomo de azoto do grupo amina se liga a apenas um tomo de
carbono diz-se que uma amina primria e quando se liga a dois diz-se secundria: com excepo da prolina
(amina secundria) todos os grupos -amina dos aminocidos que fazem parte das protenas so grupos
amina primrios (ver Fig. 27).

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O

OH
C

H2N

CH2

OH

O OH

H2N

C
O

H
OH

OH

H
H

C
CH2

HO

OH
C

CH2

CH2

NH3

OH

H2O

NH2

H2O

OH
O OH

H
H
OH

HO

H
H

CH3

HO

NH2

H2O

OH
O OH

H
H
OH

HO

H
H

CH3

HN
O

Fig. 26: Representao esquemtica (no real; ver nota de rodap n 4) da formao da glicosamina (ao centro) a partir
de glicose e amonaco, da N-acetil-glicosamina (em baixo) a partir de glicosamina e cido actico e da glutamina (em
cima, direita) a partir de amonaco e glutamato. O glutamato e a glutamina tm um grupo amina no carbono 2 (ou )
mas s a glutamina tem um grupo amida no carbono 5.

Fig. 27: Exemplos de aminocidos que fazem parte das protenas. Na linha de cima esto representados a glicina, a
treonina, a leucina, a isoleucina e a lisina. Na de baixo a prolina, o aspartato, a asparagina, o glutamato e a glutamina.
De notar que a leucina e a isoleucina so ismeros de cadeia.

Os grupos amina podem ser entendidos como resultando (pelo menos teoricamente; ver nota de rodap
n 4) da reaco entre o amonaco e grupos hidroxilo com perda de gua (ver Fig. 26). Pelo contrrio, os
grupos amida resultam (pelo menos teoricamente) da reaco entre um cido e o amonaco ou entre um cido
e um grupo amina com perda de gua. Na Fig. 26 e na Fig. 27 mostra-se que, enquanto o glutamato contm

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O

um grupo carboxlico no carbono 5, a glutamina contm um grupo amida (-CONH2 ou

) no mesmo

C
NH2

carbono. Uma situao semelhante, neste caso relativa ao carbono 4, acontece nos casos do aspartato e da
asparagina (ver Fig. 27).
Quando um cido (como o cido actico; ver na Fig. 26 a representao esquemtica da formao da
N-acetil-glicosamina) se liga a um grupo amina diz-se que a ligao de tipo amida. Nos esfingolipdeos
(como a esfingomielina; ver Fig. 28) os cidos gordos tambm se ligam ao esfingol (um lcool com 18
carbonos, dois grupos hidroxlicos nos carbonos 1 e 3 e um grupo amina no carbono 2) por uma ligao
amida.

Fig. 28: Estruturas do esfingol (ou esfingosina; em cima e esquerda), da colina (em cima e direita) e de uma
esfingomielina (em baixo) que contm palmitato ligado ao esfingol por uma ligao amida (assinalada com uma seta).

Uma situao semelhante acontece no caso das protenas e dos peptdeos em que os resduos
aminoacdicos se ligam entre si por ligaes que envolvem os grupos carboxlicos (carbonos 1) e os grupos
-amina e que os qumicos designam por ligaes amida. Em Bioqumica , contudo, mais frequente
designar as ligaes amida que envolvem os grupos -amina e carboxlicos dos resduos aminoacdicos das
protenas e peptdeos como peptdicas. A hidrlise das ligaes peptdicas leva libertao dos aminocidos
constituintes (ver Fig. 29).
Ao contrrio dos grupos carboxlicos (que tm carcter cido) e dos grupos amina (que tm carcter
bsico) de onde derivam, os grupos amida (tal como os ster) so aprtidos.

Fig. 29: A hidrlise de ligaes amida leva formao de cidos e aminas. A hidrlise das ligaes peptdicas do
pentapeptdeo glicil-leucil-lisil-glutamil-prolina leva formao dos aminocidos glicina, leucina, lisina, glutamina e
prolina.

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Quando o grupo semiacetal de uma ose se liga a um tomo de azoto a ligao diz-se glicosdica de tipo
N. Um exemplo deste tipo de ligao est representado na Fig. 30 onde a parte glicdica de uma
glicoprotena se liga parte proteica atravs de uma ligao glicosdica que envolve o carbono anomrico da
N-acetil-glicosamina e o grupo amida da asparagina. Na Fig. 9, na Fig. 24 e na Fig. 25 mostram-se outras
ligaes glicosdicas de tipo N envolvendo em todos os casos o carbono anomrico da ribose e um tomo de
azoto de bases azotadas pricas ou pirimdicas.
O
C

OH
O H

O OH

H
H

OH

CH3

NH

NH C

CH3

HN

OH

H
H

C
H2C

O
HN

NH
C

CH2
C

H2N

O
O
C
O

NH

C
H2O

NH

H2C

OH

C
H
NH C

CH2

OH

C
O H

O NH

H
H

OH

H
H

O
CH3

HN
O

CH3

HN
O

Fig. 30: Representao esquemtica (no real; ver nota de rodap n 4) da formao de uma ligao glicosdica de tipo
N numa glicoprotena. Neste tipo de ligao um resduo de N-acetil-glicosamina (ligado ao resto da cadeia glicdica por
uma ligao glicosdica de tipo O) liga-se ao grupo amida de um resduo de asparagina da parte proteica por uma
ligao glicosdica de tipo N. O grupo semiacetal (e o carbono anomrico) da N-acetil-glicosamina est envolvido na
ligao.

Nalgumas substncias os trs tomos de hidrognio e o proto que fazem parte do io amnio esto
substitudos. O exemplo mais relevante em Bioqumica a colina, uma amina quaternria. Como se mostra
na Fig. 28, a colina pode ser vista como um io amnio (NH4+) em que os hidrognios e o proto foram
substitudos por 3 grupos metilo e por um etanol (da a denominao destes compostos como sais de amnio
quaternrio).
Um dos aminocidos que fazem parte das protenas, a arginina, contm ligado no seu carbono 5 um
grupo complexo que se denomina guanidina (ver Fig. 31). O grupo guanidina pode ser visto como um grupo
imina (-C=NH ou C=NH2+) em que o carbono se liga a dois grupos amina (um primrio e o outro
secundrio). O mesmo grupo guanidina tambm existe na creatina e na fosfocreatina9. Na fosfocreatina
existe uma ligao fosfamida: um grupo fosfato ligado amina terminal do grupo guanidina.

A creatina e a fosfocreatina so aminocidos que, no fazendo parte da estrutura das protenas, tm um papel
importante no metabolismo energtico muscular.

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O

O
C

H3N

HO
H

CH2

H3C

CH2

NH2

NH

NH2

+
NH2

H3C
+

NH
C

CH2

CH2

C
CH2

O
-

NH2

H2O

NH2

Fig. 31: Estruturas do aminocido arginina, da creatina e da fosfocreatina. A fosfocreatina contm uma ligao amida
em que o cido envolvido na ligao o cido fosfrico e por isso se designa de fosfamida. A ligao fosfamida pode
ser vista como resultando da reaco entre um fosfato e uma amina com perda de gua.

11. Os heterociclos
Heterociclos so cadeias cclicas que contm, para alm de tomos de carbono, outros tomos como o
oxignio e o azoto. Nas linhas superior e inferior da Fig. 32 esto representados heterociclos com
importncia biolgica.
Os anis furano e pirano contm um tomo de oxignio; o primeiro pentagonal e o segundo
hexagonal. Olhando para estas estruturas pode entender-se porque se designa de piransica a estrutura cclica
da glicose em que o semiacetal envolve os carbonos 1 e 5 (ver Fig. 13) e de furansica a estrutura da ribose
em que o semiacetal envolve os carbonos 1 e 4 (ver, por exemplo, a Fig. 9, a Fig. 24 e a Fig. 25).
O anel imidazol contm 3 carbonos e dois azotos e faz parte da estrutura do aminocido histidina (ver
Fig. 32). O anel indol pode ser compreendido como sendo constitudo por um anel benznico ligado a um
anel pirrol (ou pirrole ou pirrolo) e faz parte da estrutura do triptofano (ver Fig. 32).
O anel pirimidina (ver Fig. 32) hexagonal e contm dois tomos de azoto e faz parte da estrutura das
bases pirimdicas como, por exemplo, a citosina (ver Fig. 24, em cima e esquerda). O anel purina (ver Fig.
32) pode ser compreendido como sendo constitudo por um anel pirimidina ligado a um anel imidazol. As
bases pricas (como, por exemplo, a adenina; ver Fig. 9 e Fig. 25) contm um anel purina.
H
N

N
H

COO
H
N
COO
N

NH3

NH3

N
H
N

N
N

H
N

N
H

Fig. 32: Na linha de cima ento representados os anis furano, pirano, imidazol e indol; na do meio os aminocidos
histidina e triptofano e, na de baixo, os anis pirimidina, purina e pirrol. Em todos os compostos representados os anis
tm carcter aromtico (so heterociclos aromticos) e poderiam, tal como no caso do benzeno (ver Fig. 4), ser
representados omitindo as duplas ligaes e inscrevendo um crculo dentro dos anis.

O anel pirrol um anel pentagonal que contm um tomo de azoto (ver Fig. 32). Na Fig. 33 est
representado o heme que contm quatro anis pirrlicos ligados entre si por pontes metenilo (-CH2=). O
heme o grupo prosttico de protenas hemnicas como, por exemplo, a hemoglobina.

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COO

H3C

COO

CH3

IV

III

2+

Fe
N

II

I
CH3

H2C

CH3

CH2

Fig. 33: Estrutura do heme. O heme o grupo prosttico da hemoglobina e contm quatro anis pirrol (I a IV) ligados
entre si por pontes metenilo (-CH2=). Cada anel pirrol est ligado a dois grupos que substituem tomos de hidrognio.
Nos anis I e II esses substituintes so grupos metilo e vinilo; nos anis III e IV so grupos metilo e propionilo. Um
tomo de ferro liga-se aos 4 azotos dos anis pirrol.

12. A isomeria ptica (ou quiral)


Como j referido, dois compostos orgnicos so ismeros quando tm a mesma frmula molecular e
diferentes frmulas estruturais (ver nota de rodap com o n 1). Para alm do n-butano (CH3CH2CH2CH3) e
do isobutano (2-metil-propano) so tambm ismeros os casos do cis-buteno e do trans-buteno (ver Fig. 2),
do gliceraldedo e da di-hidroxiacetona, da glicose e da frutose (ver Fig. 11), do citrato e do isocitrato (ver
Fig. 18) assim como da leucina e da isoleucina (ver Fig. 27).
Os casos apontados nos pargrafos anteriores distribuem-se entre trs tipos de isomeria de fcil
apreenso: isomeria de cadeia, cis-trans e de posio. O tipo de isomeria que ser objecto de anlise sumria
neste captulo a isomeria ptica: de compreenso mais difcil porque implica a visualizao das
molculas no espao tridimensional. Tal como nos outros casos de isomeria, compreender que, por exemplo,
o gliceraldedo-D e o gliceraldedo-L so substncias diferentes (ver Fig. 34 e Fig. 35) relevante para um
estudante de Bioqumica porque quando uma enzima (ou uma outra qualquer protena) capaz de interagir
com uma das estruturas pode no ser capaz de interagir com a outra10.
Uma molcula diz-se quiral quando a sua imagem num espelho plano no sobreponvel consigo
prpria mesmo se a rodarmos e fizermos rodar as ligaes simples. Quiral significa relativo s mos: a
imagem no espelho da mo esquerda sobreponvel com a mo direita mas no com a mo esquerda e o
mesmo acontece com os casos do gliceraldedo-D e L (ver Fig. 34). Em todas as molculas quirais existe,
pelo menos, um carbono assimtrico: um ou mais dos carbonos est ligado a quatro substituintes distintos.
Os gliceraldedos-D e L so molculas quirais com um nico carbono assimtrico, o carbono 2 (ver Fig. 34).
De acordo com a conveno de Fischer, quando se representam no plano do papel estruturas com
carbonos assimtricos, os carbonos alinham-se por ordem numrica na vertical11 e os carbonos a ele ligados
esto, na estrutura tridimensional, atrs do plano do papel. Obviamente que, dada a geometria tetradrica das
ligaes (ver Fig. 1 e Fig. 34), os outros dois grupos ligados ao carbono assimtrico se encontram para c do
plano do papel. No caso do gliceraldedo-D, quando se coloca o carbono assimtrico (o 2) no plano do papel,
o carbono 1 fica acima e atrs do papel, o 3 fica abaixo e atrs do papel, o grupo hidroxilo direita e para c
do papel e o hidrognio esquerda e para c do papel (ver Fig. 34). Por conveno, a posio do substituinte
do hidrognio (neste caso, o hidroxilo) no ltimo carbono assimtrico (neste caso, o 2) indica-nos se o
ismero D (hidroxilo direita) ou L (hidroxilo esquerda).

10

Algumas enzimas, denominadas isomrases, so capazes de interagir com dois ismeros catalisando a sua
interconverso.
11
Nas aldoses os carbonos so numerados de forma a que o carbono do grupo aldedo o 1; nas cetoses, numeram-se de
forma a que o carbono do grupo cetnico tenha o nmero mais baixo possvel (nas cetoses naturais acaba sempre por
ficar com nmero 2). Nos aminocidos o carbono 1 o grupo carboxlico que fica mais perto do grupo -amina.

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O
C

HO

OH

HO

HO

Fig. 34: O carbono 2 do gliceraldedo um carbono que se diz assimtrico porque est ligado a 4 grupos diferentes que
ocupam os 4 vrtices do tetraedro. Num dos vrtices do tetraedro est o carbono 1 com o grupo aldedo (-CHO), noutro
um hidroxilo, noutro um hidrognio e no quarto um grupo metanol (-CH2OH). O mesmo no acontece no caso do
carbono 1 (que tem apenas trs grupos ligados nos vrtices de um tringulo) e no caso do carbono 3 em que duas
posies do tetraedro so ocupadas por hidrognios: os carbonos 1 e 3 no so carbonos assimtricos.

Fig. 35: Na imagem da esquerda representam-se os locais de ligao de uma protena para o gliceraldedo-D. No
centro mostra-se que no possvel encaixar simultaneamente os grupos aldedo do carbono 1, o grupo hidroxilo do
carbono 2 e o grupo metanol (carbono 3) do gliceraldedo-L. Na imagem da direita mostra-se que, no caso do
gliceraldedo-D, esse encaixe possvel.

Quando dois compostos quirais se distinguem entre si por terem, em todos os carbonos assimtricos,
os substituintes em posies invertidas dizem-se enantimeros e so a imagem em espelho um do outro. So,
obviamente, enantimeros o gliceraldedo-D e o gliceraldedo-L mas tambm so enantimeros a glicose-D e
a glicose-L, o lactato-L e o lactato-D assim como a alanina-L e a alanina-D (Fig. 36). O facto de, geralmente,
as enzimas envolvidas na sntese das substncias s poderem encaixar uma das formas permite
compreender que na esmagadora maioria dos casos s exista na natureza um dos enantimeros de uma
determinada substncia. Por isso, num contexto bioqumico, desnecessrio dizer glicose-D, lactato-L ou
alanina-L; nos seres vivos toda a glicose D assim como todo o lactato ou toda a alanina (e a esmagadora
maioria dos aminocidos) so de tipo L12.

12

Para alm da sua importncia em Bioqumica, tambm poder ter interesse saber que as molculas quirais podem ser
submetidas a estudos analticos especficos porque, ao contrrio das no quirais, rodam o plano da luz polarizada.
Embora no se compreenda o porqu, um facto que, se o enantimero-D de uma determinada substncia roda o plano
da luz polarizada para a esquerda (diz-se que levgira ou -) podemos estar certos que o seu enantimero-L o roda para
a direita ( dextrgira ou +). No caso da glicose o enantimero-D (a glicose-D) que dextrgira e, por isso, a glicose
natural (a glicose-D) tambm se denomina dextrose. J a frutose-D levgira e, por isso, tambm denominada
levulose. sacarose (o acar comum) hidrolisada tambm se chama acar invertido; esta denominao resulta do

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C
H

OH

HO

OH

OH

HO

OH

HO

HO

HO

CH2OH

CH3

OH

H3N

CH3

C
CH3

C
H

NH3

CH3

CH2OH

Fig. 36: Representao, respeitando a conveno de Fischer, dos enantimeros glicose-D e glicose-L, lactato-L e
lactato-D e tambm alanina-L e alanina-D. Na natureza apenas existem as formas D da glicose e as formas L do lactato
e da alanina; as formas L da glicose e as formas D do lactato e da alanina s existem porque podem ser obtidas por
sntese qumica. A maioria das oses da natureza existe na forma D (uma excepo , por exemplo, a fucose-L). Com a
excepo da glicina (CH2NH2COOH) que no tem carbonos assimtricos (no quiral), todos os aminocidos que
fazem parte das protenas so de tipo L: quando representados de acordo com a conveno de Fischer o grupo -amina
fica do lado esquerdo.

Quando dois compostos quirais diferem entre si na posio dos substituintes de apenas um dos
carbonos assimtricos esses compostos dizem-se epmeros; so epmeros a galactose e a glicose assim como
a glicose e a manose (ver Fig. 37). Embora se possam chamar epmeros a dois enantimeros que s tm um
carbono assimtrico (casos da alanina-L e D assim como o lactato-L e D) habitualmente reserva-se a
expresso para os pares de compostos que tm mais de um carbono assimtrico. A palavra
diasteroismeros tem um significado muito abrangente: so diasteroismeros ismeros pticos que no so
enantimeros (no diferem em todos os carbonos, logo no esto um para o outro como o objecto e sua
imagem no espelho) o que inclu os epmeros galactose e glicose assim como glicose e manose. Contudo, a
palavra usa-se mais vezes nos casos de ismeros pticos que no so nem epmeros nem enantimeros: a
galactose e a manose so, por exemplo, diasteroismeros (ver Fig. 37).
H

O
C

OH

HO

HO

O
C

C2

OH

HO

HO

HO

OH

OH

OH

OH

OH

CH2OH

C4

CH2OH

CH2OH

Fig. 37: Representao, respeitando a conveno de Fischer, da galactose-D, da glicose-D e da manose-D. A galactose e
a glicose so epmeros; tambm so epmeros a glicose e a manose. A galactose e a manose dizem-se diasteroismeros.

Quando a molcula de glicose (ou outra qualquer ose) sofre ciclizao (ver Fig. 13) o carbono que, na
forma linear continha o grupo carbonilo e no era assimtrico, passa a ser assimtrico e, como j referido,
passa a denominar-se anomrico (ver Fig. 38). No caso das aldo-hexoses (como a glicose) o carbono
anomrico est ligado a um hidroxilo, a um hidrognio, ao oxignio do anel e ao carbono 2 do anel. Havendo
mais um carbono assimtrico passam a poder existir dois ismeros pticos distintos que no existiam na
forma linear. Esses ismeros chamam-se anmeros sendo que um deles o (aquele em que o hidroxilo do
carbono anomrico fica voltado para o lado oposto do ltimo carbono) e outro o (ver Fig. 38). De notar
que, porque apenas se distinguem na configurao de um carbono assimtrico, os dois anmeros e so
tambm epmeros entre si. Embora seja impossvel representar no plano as molculas das oses, as
representaes dos anmeros e mais frequentemente utilizadas espelham o que se passa na estrutura
molecular (ver Fig. 38).

facto de a sacarose ser dextrgira e de o produto da sua hidrlise (uma mistura em partes iguais de glicose e frutose) ser
levgiro.

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Fig. 38: Modelos tridimensionais e representao (de Haworth) dos anmeros glicose- e glicose-. O carbono
anomrico um carbono assimtrico nas formas cclicas dos glicdeos; na forma linear corresponde ao carbono do
grupo carbonilo. Nas formas como so habitualmente representadas, na molcula de glicose-, o hidroxilo ligado ao
carbono anomrico (o 1) fica voltado para o mesmo lado do carbono 6 (em geral, os dois para cima); no caso do
glicose- o hidroxilo do carbono anomrico fica voltado para o lado contrrio do carbono 6 (em geral, o carbono 6 para
cima e o hidroxilo para baixo). Na glicose em soluo, as formas , e linear esto em equilbrio qumico, sendo as
formas cclicas muito mais abundantes que a linear.

Na natureza existem as duas formas anomricas (a e a ) que, via desciclizao e ciclizao no


enzmicas, esto em equilbrio qumico entre si (e com a forma linear). No entanto, quando se forma uma
ligao glicosdica, o processo de desciclizao e ciclizao no enzmicas do carbono anomrico envolvido
na ligao deixa de existir. Assim, por exemplo, a maltose constituda por dois resduos de glicose que se
ligam atravs de uma ligao glicosdica que se diz (14): diz-se porque a glicose que se liga atravs do
carbono anomrico (o carbono 1) com o outro resduo de glicose (envolvendo o hidroxilo do carbono 4) est
estabilizada na forma (ver Fig. 15 e Fig. 39). A celobiose (ver Fig. 39) , como a maltose, um dissacardeo
constitudo por dois resduos de glicose mas a ligao glicosdica (14). No tubo digestivo humano
existem enzimas capazes de catalisar a hidrlise da maltose (gerando glicose que absorvida) mas no
existem enzimas capazes de catalisar a hidrlise da celobiose; se ingerirmos celobiose, esta perde-se nas
fezes.

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OH

OH
O H

H
H
OH

HO

O H

H
1

OH

OH

OH

OH

HO

O H

H
OH

OH
O

O
H

OH

H
OH

H
H

OH

OH
H

OH

Fig. 39: Modelos tridimensionais e frmulas estruturais da maltose e celobiose. Na maltose o resduo de glicose que
participa na ligao glicosdica a glicose e a ligao glicosdica (14); na celobiose o resduo de glicose que
participa na ligao glicosdica a glicose e a ligao glicosdica (14). Embora, em ambos os casos, os resduos
de glicose que participam na ligao com o hidroxilo do carbono 4 estejam representados na forma , na verdade
sofrem desciclizao e ciclizao no enzmica podendo estar nas formas ou .

Bibliografia consultada
1. Chang, R. (1994) Qumica, 5 edn, McGraw-Hill, Lisboa.
2. Meisenberg, G. & Simmons, W. H. (1998) Principles of Medical Biochemistry, Mosby, St. Louis.
3. Murray, R. K., Granner, D. K. & Rodwell, V. W. (2006) Harper's Illustrated Biochemistry, 27th edn, Lange, Boston.
4. Vargas, J. J. & Macarulla, J. (1979) Fisiquimica fisiologica, 5 edn, Interamerica, Madrid.
5. Morrison, R. & Boyd, R. (1992) Qumica Orgnica, 13 edn, Fundao Caloust Gulbenkian, Lisboa.
Agosto de 2010; os autores (Rui Fontes e Manuel Nuno Alada) agradecem as crticas e sugestes das professoras
Isabel Azevedo, Raquel Soares e Maria Joo Martins.
(rui.fontes@mail.telepac.pt e nunoalca@med.up.pt )

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