Los microsatlites son secuencias de ADN altamente variables en el genoma1, en
contraste con los Los microsatlites se encuentran entre los tipos ms variables de secuencia de ADN en el genoma .En Contraste con nico ADN, los polimorfismos de microsatlites se derivan principalmente de la variabilidad en la longitud en lugar de en la secuencia primaria de ADN. Por otra parte , la variacin gentica
en
muchos
loci
de
microsatlites
se
caracteriza
por
alta
HETEROZIGOSIDAD y la presencia de mltiples alelos , que est en agudo
contraste con ADN nico. Cuando se establece un marcador neutro se establece una relacin directamente proporcional entre el grado de polimorfismo y la tasa subyacente de mutacin, estableciendo que en base en la extensin del polimorfismo microsatelite dichas mutaciones deben ocurrir con frecuencia2 Para un marcador neutro , el grado de polimorfismo es proporcional a la tasa subyacente de mutacin. Dada la extensa polimorfismo de los microsatlites , se deduce que las mutaciones deben ocurrir con frecuencia. Los microsatelites son utilizados como modelos tericos para la estimacin de la distancia gentica as como la medicin de la cantidad de flujo gentico entre poblaciones entre poblaciones utilizando como factores bsicos la tasa y la direccin de las mutaciones microsatelite3 La tasa y la direccin de mutaciones constituyen dos factores bsicos en la estimacin de la distancia gentica sobre la base de datos de microsatlites . Mediante la aplicacin de los modelos tericos de la evolucin de microsatlites de 1 Weber, J. L. Informativeness of human (dC-dA)n (dG-dT)n polymorphisms. Genomics 7, 524530 (1990). 2 Weber, J. L. & Wong, C. Mutation of human short tandem repeats. Hum. Mol. Genet. 2, 11231128 (1993). 3 Ellegren H. Microsatellites: simple sequences with complex evolution. Nature rev. Gen. 2004 5(6); 435-445
datos empricos , los genetistas de poblaciones intentan , por ejemplo, determinan
cunto tiempo hace dos poblaciones divergentes , o efecta la medicin de la cantidad de flujo gentico entre poblaciones.
Repeticiones en tndem se producen en forma de iteraciones de unidades de
repeticin de casi cualquier cosa desde un nico par de bases a miles de pares de bases. Mono-, di-, tri- y tetranucleotide repeticiones son los principales tipos de microsatlites , pero repeticiones de cinco ( penta ) o seis ( hexa ) nucletidos se clasifican generalmente como microsatlites tambin. El grueso de repeticiones simples estn incrustados en el ADN no codificante , ya sea en la secuencia intergnica o en los intrones . Los microsatlites que se utilizan como marcadores genticos son generalmente de este tipo y se supone generalmente que evolucionar neutral . Por consiguiente, su frecuencia y distribucin deben reflejar el proceso de mutacin subyacente. En el ADN de codificacin , la seleccin en contra de mutaciones en el marco de deslizamiento impide eficazmente la expansin de todo lo que no repeticiones de trinucletidos , para los que puede haber otras limitaciones de longitud relacionados con la protena function. Trinucleotide repeticiones asociados con la enfermedad humana comprenden una clase especial de microsatlites en el ADN de codificacin . Estos loci se someten a extensas expansiones de repeticin , el mecanismo mutacional de que se cree que diferir de la de la mayora de los microsatlites en el genoma. Por ejemplo , el establecimiento de estructuras de horquilla con una cantidad relativamente alta de pares de bases complementarios podra estabilizar bucles que se generan durante las repeticiones deslizamiento de replicacin asociados con la enfermedad humana comprenden una clase especial de microsatlites en ADN que codifica
Modelos de mutacin.
Se necesita un modelo de mutacin de la evolucin de microsatlites si los datos
de frecuencia de los alelos de dos grupos de individuos (por ejemplo , poblaciones o especies) se van a utilizar para estimar la distancia gentica entre ellos. Se ha presentado una amplia gama de modelos de la dinmica evolutiva de los microsatlites , la mayora de los cuales se derivan del modelo de mutacin gradual ( SMM ) Adoptado por microsatlites, el SMM originales postula que una mutacin altera la longitud de una serie repetitiva a travs de la adicin o eliminacin de una unidad de repeticin a una tasa fija (un paseo aleatorio con visin hacia atrs simtrica que es independiente de la longitud de repeticin). Sin embargo, pronto se hizo evidente que una sencilla SMM no conduce a distribuciones de microsatlites de longitud fijas. Por ejemplo, el hecho de que los microsatlites parecen mostrar un lmite de tamao superior es incompatible con el SMM. Por lo tanto, las extensiones de la SMM han introducido un lmite superior en tamaos de alelos, o un sesgo mutacional de tal manera que grandes alelos mutan preferentemente a alelos de tamaos ms pequeos. Otros enfoques han comprendido modelos por etapas ms complejas. Los parmetros de los modelos matemticos son probados contra las medidas de variabilidad (heterocigosidad, varianza de recuento de repeticiones, asimetra) que se observan dentro de las poblaciones, as como, ms recientemente, en contra de las distribuciones de microsatlites en los conjuntos de datos genmicos. Un modelo atractivo de la evolucin de microsatlites sostiene que una distribucin de todo el genoma de microsatlites repetir longitud que est en los resultados de equilibrio de un equilibrio entre las mutaciones de longitud y punto. De acuerdo a este modelo, dos fuerzas opuestas operan mutaciones en las secuencias de microsatlites. Mutaciones de cuerpo entero, cuya tasa aumenta con el aumento de nmero de repeticiones, favorecen loci para alcanzar valores arbitrariamente altas, mientras que las mutaciones puntuales rompen matrices repetidas largas en unidades ms pequeas. En el equilibrio, habr una distribucin de estado estacionario de longitudes de repeticin que se rigen por la tasa de mutacin
longitud y la tasa de mutacin puntual. Este modelo, o derivados de los mismos,
ha sido bien recibido en los ltimos aos, ya que puede explicar las diferencias en microsatlites