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Cdigos de abreviacin
Existen 20 aminocidos diferentes de que forman parte de las protenas. Todos ellos son aminocidos y constan de un grupo amino, un grupo carboxilo, un hidrgeno y un grupo distintivo
llamado R unidos a un mismo carbono denominado carbono-. El carbono- recibe este nombre por
ser el carbono adyacente al carbono del grupo carboxilo, y el grupo diferenciador de los distintos
aminocidos (R) se denominacadena lateral.
Dado que los diferentes aminocidos difieren unos de otros por su cadena lateral, podemos clasificarlos segn el tipo de cadena lateral que
posean.
Aminocidos alifticos
En esta grupo se encuadran los aminocidos cuya cadela lateral es aliftica, es decir una cadena hidrocarbonada.
Glicina, Gly, G
Alanina, Ala, A
Valina, Val, V
Leucina, Leu, L
Isoleucina, Ile, I
Aminocidos aromticos
Prolina, Pro, P
En esta grupo se encuadran los aminocidos cuya cadela lateral posee un anillo aromtico. La
fenialalanina es una alanina que lleva unida un grupo fenlico. La tirosina es como la
fenilalanina con un hidroxila en su anillo aromtico, lo que lo hace menos hidrofbico y mas
reactivo. El triptfano tiene un grupo indol.
Fenilalanina, Phe, F
Tirosina, Tyr, Y
Triptfano, Trp, W
Aminocidos azufrados
Aminocidos hidroxilados
Cisteina, Cys, C
Serina, Ser, S
Treonina, Thr, T
Metionina, Met, M
Aminocidos bsicos
Dentro de los aminocidos con cadenas laterales muy polares encontramos tres aminocidos bsicos: lisina,arginina e histidina.
Lisina, Lys, K
Histidina, His, H
Arginina, Arg, R
En este grupo encontramos dos aminocidos con cadenas laterales de naturaleza cida y sus amidas correspondientes. Estos son el
cido asprtico y el cido glutmico (a estos aminocidos se les denomina normalmente aspartato y glutamato par resaltar que sus
cadenas laterales estn cargadas negativamente a pH fisiolgico). Los derivados sin carga de estos dos aminocidos son la asparragina y
la glutamina que contienen un grupo amida terminal en lugar del carboxilo libre.
Asparragina, Asn, N
Glutamina, Gln, Q