TEMA 1. CARACTERSTICAS BSICAS DE LOS GENOMAS. GENOMA HUMANO
La Genmica tiene como objetivo comprender el contenido, la organizacin, la funcin y la evolucin de la informacin contenida en genomas completos. Al iniciarse el Proyecto Genoma Humano se consider de inters la secuenciacin de los genomas de varios organismos modelo, como proyectos piloto para desarrollar y poner a prueba los mtodos aplicables a la secuenciacin del propio genoma humano, sirviendo adems para contar con genomas secuenciados con los que comparar la organizacin y estructura del genoma humano. Algunos de tales organismos modelo son la bacteria Escherichia coli, la levadura Saccharomyces cerevisiae, la mosca Drosophila melanogaster, el nematodo Caenorhabditis elegans o la planta Arabidopsis thaliana. A estos proyectos se han ido sumando otros encaminados a obtener la secuencia de organismos de inters clnico (patgenos de animales y plantas), comercial (organismos utilizados en agricultura o ganadera), etc. Actualmente, se conoce la secuencia completa del genoma de ms de 3000 organismos distintos y cada da aumenta el nmero de genomas secuenciados. El conocimiento y caracterizacin de la secuencia de DNA de genomas completos abre la puerta a una serie de anlisis que van a permitir predecir los genes (Genmica Estructural) y determinar la variacin gentica existente entre poblaciones de una especie o entre distintas especies, para comprender cmo se han reestructurado los genomas en el curso de la evolucin (Genmica Comparada). En trminos prcticos, la Genmica progresa mediante niveles crecientes de resolucin analtica: 1) asignacin de genes y marcadores moleculares a cromosomas especficos; 2) mapas cromosmicos de alta resolucin; 3) mapas fsicos y 4) secuenciacin genmica. Una alternativa a este planteamiento jerarquizado fue planteada por C. Venter para la secuenciacin de genomas sencillos, aunque posteriormente se ha utilizado tambin para la secuenciacin de genomas complejos, como el humano. La estrategia de Venter consiste en la secuenciacin aleatoria de todo el genoma sin llevar a cabo una cartografa fsica previa. Posteriormente, poderosos programas informticos solapan la informacin de todos los fragmentos para obtener la secuencia completa del genoma correspondiente. En el ao 2001 se public el anlisis del borrador del Genoma Humano y en el 2004 se public la secuencia definitiva. El genoma humano contiene unas 3200 Mb, aunque poco ms del 1% est dedicado a la sntesis de protenas y aproximadamente el 50% del genoma humano consiste en DNA repetitivo, cuya funcin (si la tiene) se desconoce. El anlisis de los elementos funcionales del Genoma Humano (Proyecto ENCODE) ha permitido identificar unos 20.000 genes que cifran protenas y un nmero parecido de genes cuyo producto son RNAs funcionales no codificantes. Otros hallazgos interesantes son que un gran nmero de genes sufren procesamientos alternativos del RNA o la existencia de una gran variabilidad genmica entre individuos (Proyecto 1000 genomas).
BIBLIOGRAFA
Strachan, Goodship and Chinnery, Genetics and Genomics in Medicine Cap. 2 y 4.
Strachan and Read, Human Molecular Genetics 4 ed., cap. 8. Hartwell, y otros, Genetics, from genes to genomes 3 ed., cap. 10. Muy bien. Russell, iGenetics: a molecular approach 2 ed., cap. 10