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Pablo-CEU
Doctorado en Qumica Mdica
Relacin Estructura-Actividad
USP-CEU
BASF AG
Professor of Pharm Chem
University of Heidelberg
Relacin Estructura-Actividad
USP-CEU
Farmacforo:
El grupo farmacforo es el fragmento estructural mnimo necesario para que el
frmaco presente una actividad concreta, es decir, la parte de la estructura que
interacciona con la diana farmacolgica y que, por tanto, explica la accin
biolgica a nivel molecular
Farmacforo 3D:
Representa las posiciones relativas en el espacio de los grupos claves en la
interaccin frmaco-receptor, pasando por alto el esqueleto molecular que
coloca esos grupos en esas posiciones.
As, el farmacforo 3D para el sitio de unin de un determinado receptor
debera ser comn a todos los ligandos que se unen a l
Relacin Estructura-Actividad
USP-CEU
Cl
Grupo
hidrfobo
N
O
N
O
Aceptor de enlace de
hidrgeno
Relacin Estructura-Actividad
USP-CEU
Relacin Estructura-Actividad
USP-CEU
Establecimiento de la Relacin Estructura-Actividad (MC1.pdf)
Enlaces de Hidrgeno
Hidroxilos
Carbonilos
Amidas
Aminas 1, 2 y 3
Nitrgenos aromticos
cidos carboxlicos
teres
Nitrilos
Interacciones inicas
Aminas y cidos carboxlicos
Interacciones hidrofbicas
Anillos y cadenas
Tamao de los bolsillos hidrofbicos
Polaridad de los bolsillos hidrofbicos
Geometra de los ligandos
Enlace de hidrgeno
Buen aceptor
O
H
N
H3C
Aceptor dbil
O
CH 3
No aceptor
O
CH 3
H
No aceptor
Aceptor dbil
O
N
H
O
Aceptor dbil
O-
Aceptor dbil
dador
aceptor
H
N
N
H
dador
N
aceptor
H
H
N
H
N
N
N
H
Enlace de Halgeno:
un mundo paralelo al enlace de Hidrgeno
D H
D X
Enlace de Halgeno:
un mundo paralelo al enlace de Hidrgeno
D H
D X
Enlace de Halgeno:
un mundo paralelo al enlace de Hidrgeno
Cation- Interactions in Structural Biology
.One cation- interaction for every 77 amino acids
.Arginine preferred over lysine
.Over 25% of all tryptophans involved
in a cation- interaction
J. P. Gallivan and D. A. Dougherty, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96,
9459-9464.
Cation- Contributions to Protein-Ligand/Drug-Receptor
Interactions
Multidrug resistance protein and related transporters
(MDR/Pglycoprotein)
Antibody hypervariable regions
Factor XA (coagulation factor; serine protease)
Alkylamine dehydrogenases
Cationic polyene cyclization of terpene/steroid biosynthesis
Glutamate receptors
SH2 domains - bind phosphotyrosine
mRNA cap recognition (7-Me-G)
S-Adenosylmethionine (SAM, Ado-Met) reactions
G protein-coupled receptors for ACh, dopamine, epinephrine
.Cys-loop receptors binding ACh, serotonin, and GABA
Cl
Grupo
hidrfobo
N
O
N
O
Aceptor de enlace de
hidrgeno
Cl
Cl
HN
HN
O
S O
database mining
of Maybridge
Initial
Targets
O
NH
H-Bond
acceptor
NH
X
Cl
O
HN
New designed
compounds
NH
O
Evaluacin Biolgica
Ensayo radiomtrico para la determinacin de la actividad inhibitoria, usando una lnea celular
293-EBNA establemente transfectada con el gen de 17-HSD3 humana
Cl
Cl
O
Cl
Cl
Ph
CF 3
Cl
O
N
Cl
O
Cl
N
STX1623 64% @ 10 M
Ph
O
Cl
Ph
O
HN
O
STX1613 45% @ 10 M
O
STX1615 14% @ 10 M
Cl
O
O
HN
HN
N
Ph
O
O
STX1629 89% @ 10 M
Ph
Cl
HN
HN
N
O
STX1616 83% @ 10 M
STX1617 32% @ 10 M
HN
Cl
Cl
HN
O
STX1614 66% @ 10 M
O
STX1607 38% @ 10 M
N
HN
Cl
Cl
Cl
N
HN
O
STX1606 51% @ 10 M
O
Ph
HN
N
HN
O
STX1605 27% @ 10 M
O
STX1604 31% @ 10 M
HN
HN
Cl
Cl
CF3
STX1630 67% @ 10 M
IC50 = 750 nM
Selectivo frente a HSD1 y HSD2
N
O
STX1631 43% @ 10 M
Cl
Cl
HN
HN
Prueba de concepto
Efecto de STX2171 a 500 nM sobre el
crecimiento de clulas LNCaP[HSD3]
estimulado por Androstendiona
Ensayos in vivo:
STX2171 (25 mg/(kg da) inhibe en 81%
el crecimiento estimulado por
Androstendiona (100 g/da) en
tumores LNCaPwt xenoimplantados en
ratones castrados MF-1
STX2171